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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000612_pilon:24242..31896+ Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_018152 ID=XLOC_018152|Name=XLOC_018152|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7655bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000612_pilon:24242..31896+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GCTGAAGTCCTCCAGCAAGCACTCAgatatttgacaaaagataGCAATGG
GGATATGCAGAATTATCAAGCGGTTATTGACATTCACTGCAAATTAAGCT
TCGTTTACACGACCATGGGCCAGTAAGTAAAAATGAATGAAGATTTTGAT
TCTTTTGTAAAATAGAAACCAGGTCCCTTTTTAATATTGGTATCTTTACA
CTTGGTTCACATATGAAACTCTCATCAATATTTGGTGCACATTAAGCTTC
GTCCACTACCATAGATGGGACAGTAGTAAAGATAAAAGgagattttagtt
tttttgctaAATAAAAAGCAGATCCTTTTTGTATCATTACACATCTTGAT
TCACATCATGACATCACTCGGTAGAAATAAAGCTTGGTtcaaccctattc
gtactagggggggggggggctctttctgttcggaagtcaaactattggta
atagctcctgaaataatagagcttttgccgtgaaattttctgtaaattcc
taacatttattttgcttcaaaataaaaaaaaaaattgacacctaaatagt
ttcacaccttgagcatgatgacatttctgatagtaaggtgtcacaaaaat
tgacacttttccaatacaaatttatttttaatgtcaaatatatcgtttaa
actgtaatttattgaatatttaggataaaataagcattttaaactcaggc
aacttttttctaaagcctttgttagaatacaatagctatttataagaata
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caaatttcatccaaaaagaccgaCTAggtcaaaagttaaggggtggtaca
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TGTACTGTCCTTATTACAGGATGAAATTGATAACTTATTTCATCTAATAG
TGTGTTCCTTTATTTGCTCAAAAGTCAACCAATCCAGTCTAaaaatttta
ccaaattaaaCTGTTTTAGTTGATAAAAACTAAGTATTGAGATTCGTACT
GCTCCGCTACTTTTACCTAGTTTAATGTTCACAGAAAATTGGAAAGACAC
CCTAACTCATGTCTCATCGGACCACCAAAAGGCCAACATACTTACATTTA
ACTATATTTACCCAGCAGGgccacaacgttttttcaacgtccacaacgtt
cttttaacgtttatctaacgttcacaacttccatataacgttagatggac
gtttaAACAACGCTGTGTGCTTGCTGGgagagattcaaattatagtattt
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atgatatgcactattaaaatgtcttctgatattatatcacggacccaaca
gctgattgttggtaagtgacgtaaaatcagtcaatacgtcacttgcaacc
aatcagatgTTAGGTCCGTGAAAGAAATTACAATTGTGCAtatcatgata
tgcaccactacaatgacttcacgaaattattcAACTTtcctgtttttgtt
ccacccaaaacgtcactttttctattgtttaagtgacgtattgggtggaa
aatttcttagaagactctccagtggtgcatatcatgaatagaaaaatCCA
AATCttaaaagttcgaattagcgattgtccactttttctttcttctctta
GAAATGACAAAGCTGAAGCAATGCTGGAGAGAGCGCTCAACATCTATTTC
ACGGTAACTAGTTTCATTTGTATAAATGGTTAAAATTGATACCTTGCTTG
AAAAGATAAGTTTTTGGTATAATTTCTCTTGAAAGTATATCATTAAAATT
AATACCTTGCTTGAAAAGATAAATCTTTGATATAATTTCTCTTGGAATct
catctatatattaatacgctaaaacgtgtgcaacgttttgtaaaaagttt
tcgaaaacctaACAAAGCTCAACAAAGCCTCCTCGTTGAACCATCGTCTT
TTTGCACCTGATgtagatttcctaccactagacaaACTTTGAGACGCTAA
CATATAATATTCTATACAGAAACATTGGAGCTGGATgagttaaaatcaac
cttcttattcccaaataaaacttttcattttgaagaattcttaTTTAGAT
GCTCTTTAACCTATTCTGTTTATAGTGTGTTTATGCAAaagcggctccct
atcactttcaaaactttcacagtctttcaaagtcactcTCGAATGTCTAG
CCACAATGGCTAATAaagatctaaaatataattcttcTAAGCAATTTACT
TAATTGTGGTTAAAgattgcaatgcaatgttatcttttttctcctttatt
tcctaaaatcaaaatggtaTCATTATTTCAGCAGCTATCTTTCttgcttt
tttagagtttttataTGTATAGTTTTCCgctcatcatcatccttcgatct
AGGTCGGAAATAAACAATAGCCCTCCCTCCACAGTTCTCGATCAGCTATT
GAAGTACCCTTTTCCTTAATCTCTAGCCCTGTTTCCcgtttcaaaaaata
tcaagaaatgtgCACTTTCTCGAGCGCCTAGGGCCTGCAGGACACCAAAG
TAAACTTTCTGACACGATTTCGTTTTTCGCACGAAACAGTGACCCAAAAA
AGAGCCTGCTCGTCAAAACAGGGGAAATTCTTGGAAGTCCATGATAGATC
TCTTGAAGGGTTGGGTGGTTGCGCCAATCAAGGTTTGTATAACAGCCATC
AAGGCTCTTTAGCATGGTTTTTGTCATGGTCCAAGTCTCCGAGCCATATA
AAAGAATTGGCTCGACAAgacttttaaaagtttgaagtttgagAGCGTTA
GATAAATTAGAGTGCCATATCTTCTTTAATTTATTACAAGCTTTCTAATC
GACACCTTGCCTAATTCTAAAATCGTTTTCAGAGCTGTTAATATGAAAGC
TAAGATATTTGAAATCCTTCACAAGTTTGATATTGACACCATTCTTGGAA
GTTAAAGGGAGAACATTTCCTGAGGAGCTGATAAGTTTagtttttccagc
attgcaATAAAGACCGACTTGACTGGCCGAAGTTTCAAGTGAGTGAAGAA
GACCTTCAAGATTTTgaatgaggcccccccagcggaccctcaattcacgc
aatcacgcaattttttttcgaaattcacgcattcacgcaaattttcctca
agtttcacgcaataacccgattgttcagaaatcggaaaatttcttgggaa
aaatcggggaaacattggaaaatcgggcaAACTGCACATAGTCGGtggaa
aaagggaaattcacgtattcacgcacaaaatagcccagattcacgcattc
acgcaatcaaaaagtacattttcacgttcacgcaagttttttcaattcac
gcattcacgcaaattttttttaattttcacgcattcacgcaacagaaaat
gcccattcacgcaatcacgcaaaccgctgggggggccttgAATAGTCTCA
GAAGCTAAGGCAAGATCGTCAGAAAAGTCAAGATCGTCAGAAAAGTCAAG
ATCGGTCAGAAAAAGGCCGCGGTTACGCATTCGCAGGGGAGCTTTGATAT
TGATTCCCTTCTCATTAGATAAgtcaacagaaattcttaaaacataattt
aaaacaatgataaaaagaaagggagCTAAGGTGTCACCTTGTAGAACTCC
AGcataaatgtcaaaaatatcagtGTCTCCGTCGGCTGTAATGACCTTTG
CTTTGGTGGAGACATAAAGTGCCCTGATGGCTGAAATGAGTTTCTCTGGA
ATGCCGTAGAATTAAAGAAATTCCAACATTTTTACACGAGATATGGAatc
aaaggcttttttaaagtcaacaaagcaaataaaagcatCTTTGTTAAGTT
TTAAATACGCCTGATGGCTAAAATCTGTGTAAGAGTACTTCTTCCCTTCC
GAAAACCAAGGTCAAATCACCCTTTTTTGGAACTGGAGTGATACCGCTAG
TTAACCAAGATAATTGTCGTTGCGGGAGAGTTGGAACCCTTAAACACATC
CTCTCAAGTTGCCCATTTAGACACTTTTTGCGAATTGAGATTTTACGTTT
TACAAAAGAGCAACAGCAATGGAAAAGAGTTCTTGAATTCTCAAGTTAAT
TGATgacagaaaatcaattttttcaacgtGTTTCTCGAAGGGAaatctga
acatatttgtgCACTTTTCCAATTTaaattaaatagaaaaaaatatgtaa
caAATGCACGAATCCTTTGAAATAGGCTGATGAGGTTCTGAGGCCTTTGA
CGTCGCTCCTTAGTCATTTTTAAGGCATTTTCGAAGTCTACCATAATAAA
CGCTAAATTTTTTACGTAATAAACGCTAAAGGGAAAACGAGAACAAccaa
ttgtttaaaatttcaagcaaaaGTTTTTCGGTTTCGGTCATGATCAGTGA
TATAGATAGTTTGGGTCTTTGAGGGAATTAGACCGAACATGACTTCAGcc
ccctccccccTCTGGCCGTAGGAAGGGCTGAAAGGTTTAACCAAATTTGC
GTTATTGTGTGAATTGAATGttcgctgggggggggggggtggtaagGCTC
TATTATAGTAAATGTATGGAATTAAATAAACGCTTAAtttttttATCACC
TTTAACCTTCAGCTCAACCTTTTGGAGGATCCAAATCTCGCAACTGTAAT
TAATAGTTTGGTGAAACTCTACCGATCACAGGTAAAAACTATAATTAATG
GTGTTGTGAAAGTAAATTTATGTCGAcagtaaaatattttgttgtaaagt
cattttgactatatttgtcattgtaattttttgttttgaatcagGCTCAG
AAAAAAGCATCTCGAAAAACACGATGAGACAATTAAAGAAAACCTTTCCA
GGATTAACAGTTAATTCCTAGTCCTCGTATAAGTAACGtggtccatataa
cgttagatgaacgttgaaacaatgttgtctGCCAGCTTGTTTAACTTCAA
AGTGTTTTCTTTCATATATATAGAAACGAATGGACAGTTTGGAAAGACTT
CACAGGTAAAGTGTATTTTCCATTTTTGGTCTTCCTAGCATCTGGCCTTT
CATTTACATTTCCCTGTACTGTATATCCGTTTTTGAAGATGTAGCGCTTT
GTtcattcaagttcattttggaggAAACGGCGCCTTGTAACAATCACTAA
AAAGCGCTTTGCCAATTaaagtttattttgtaagaagcGGTGTCTTGTAG
CAATCGACCCCCGTTTCCTGTACTGTATATCCGTTTGTGAAGATGTAGCG
CTttgttcattttggaagaaacggcctcttgtatcaatcCTTAAGAAGTG
CACACATTGCGAACATATATCCGTCAGTTGCTATGTCCCTTCGACCtctt
gtttatatttttcaatcttATCCATTAGGATAAAATTCCGGTTCTtcaac
taaaaattaaaaaagttgctAATCTGGGGGTGCAATTGCAATGTCGAAGG
ATGTGAGTCAAGGGGCATTTTAAGCCTGACTGCCCAGAAGATACACTTAG
AAAACACAAGACGCGATTctctttaaaataaaagaaaatcttattattta
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ATGAAAGCGATGGAAAGATATTACGGAGTGGATGATACACGAGTGGCACA
TGTTATCAATGAATTGGCTGTTCACCTCAGTAAAATGGTAATTTACACAG
CTATTTGCACTTGTTATTGTACCTCGAACCCGATCATCGTTGCGACGACT
GTCGGCGTTTAACGTCCTTTTCTTCAAAGCtttttttttGTCGAATTGAT
CTCTTATTATGTGAACCTTTGTCGTCACCTTGTCTTCTAGTGATTCGAAT
AGACGAACTTACTTTGTTTGTTTATGGTCATTGAATGAAAGCCTTTACGT
CAAGGAAATGCTTTGTTGACGCCTAAATGTCCTAAATAACTTCTAAGATG
TCTGAAGTCTTACTTACCGCTAGTATTTCGGCATTTTGTTATTATGTTTC
GAAGCTCTTAAATTTACATCCATTTCTCACGAGAACTAATCTCGGGCTCA
GAtagtattttttcttcttcattcccGTTTTAGAACAAATTCGAGGAAGC
TATAGAGCTCTACGAACAAGCCATGAACGTTTACATAAACCAATTGGGAT
TTCAAGATGTTCATGTATCGGAAgttttgagtaatttggctcATTTATTC
TCTGAACAGGTAcgatacagtgtgtcccaaaaaaagtggacaaatttctc
aaaatgcatcatcttaaaggttttgtttctaAGTAAGAGTATTATCGTTT
GCtttatcatcaattttaattcaccacaagctttttcacattggattgac
atggatgtggtGCAAGATTGATCCgaaagaggaagagaaaaacattgttt
ttgcttatatcagcataatataacaataggtagacccTTGAtcttgatat
gaaatatgtgtctgatatgaaacggaaacatatatgtaaaataaaacctt
tagcTGGGCTTAGAATGATTGAGATAAGATTAAAATTCactgttcaatca
atagatatgctATGCCCAAGATGTTTGAATAgatttttgcgtgttttgaa
tATTAAGTATTCATGTCATAAGATTTCgcataaattatgaggattttatt
TCATATGAGAATTCGTctacttttttcgggacacgcTGCTTTTTCTCATT
TAGAGTTTGATGTTTAGGGTCCAAACCACTATCTTTTTCATATTAGTATA
CCCCGGGAGGGGGCAATGAGTCTACCAACAGACTGTATGTGCGGCGAACT
AATTTGCTTTAAAATCAATCCCTTAGTTACAGtgcaacaaaaaatatcaa
tgaaATCAATTCGCTTACAGTGTAGTTGtatcaaattttcaactttttta
gagccaaaaaataagaatttgcggtcaaaaaatatgaaatttctccttga
tttgctgaaatttctactcttacagtgcatttatcaaaagtccacccttt
tAGTGCATTTCTGCTATCTTGAAAAACATACTCTTAACCGTGGCACATGT
CTGTCGATCAATTTGCCCGTTTCCACCTTGGATATTACCAGGGCACAGTT
TCTCAGGCaagtcaaaatctttgatcagagttttttgaaagtggtactcT
AACGTTGGACTACTCATCTTCCACTTTCACGTCATGAaagatttctttga
attattaatTGACCAATGTTGAGTAAAGCTACCGTTGGGTaccaattttc
taaaaactctgatcaaagacaACAGATGTAGCTTGGTCTAGGGTATATTA
AGATCAGTGTTCACATTCATCTTTCAAGTGGTCCAGACTTCAAAAATCCT
AAATTAATAGGCTATCCACTTAGAAATAAAGACTCTACctttaaaaacaa
caattttccTCTTATTTATAGCGGCAAGGTGATTTAGCTGCACATTATCA
CAACTTGTCTGCCAATCCGAACCGAATCGTTGAAGATCTTTTACCCAAAC
AGTAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000612_pilon:24242..31896+ >XLOC_018152 ID=XLOC_018152|Name=XLOC_018152|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1158bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000612_pilon:24242..31896+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GCTGAAGTCCTCCAGCAAGCACTCAgatatttgacaaaagataGCAATGG
GGATATGCAGAATTATCAAGCGGTTATTGACATTCACTGCAAATTAAGCT
TCGTTTACACGACCATGGGCCAGCTGAAGTCCTCCAGCAAGCACTCAgat
atttgacaaaagataGCAATGGGGATATGCAGAATTATCAAGCGGTTATT
GACATTCACTGCAAATTAAGCTTCGTTTACACGACCATGGGCCAAAATGA
CAAAGCTGAAGCAATGCTGGAGAGAGCGCTCAACATCTATTTCACGAAAT
GACAAAGCTGAAGCAATGCTGGAGAGAGCGCTCAACATCTATTTCACGCT
CAACCTTTTGGAGGATCCAAATCTCGCAACTGTAATTAATAGTTTGGTGA
AACTCTACCGATCACAGCTCAACCTTTTGGAGGATCCAAATCTCGCAACT
GTAATTAATAGTTTGGTGAAACTCTACCGATCACAGAAACGAATGGACAG
TTTGGAAAGACTTCACAGAAACGAATGGACAGTTTGGAAAGACTTCACAG
ATCACACATGAAAGCGATGGAAAGATATTACGGAGTGGATGATACACGAG
TGGCACATGTTATCAATGAATTGGCTGTTCACCTCAGTAAAATGATCACA
CATGAAAGCGATGGAAAGATATTACGGAGTGGATGATACACGAGTGGCAC
ATGTTATCAATGAATTGGCTGTTCACCTCAGTAAAATGAACAAATTCGAG
GAAGCTATAGAGCTCTACGAACAAGCCATGAACGTTTACATAAACCAATT
GGGATTTCAAGATGTTCATGTATCGGAAgttttgagtaatttggctcATT
TATTCTCTGAACAGAACAAATTCGAGGAAGCTATAGAGCTCTACGAACAA
GCCATGAACGTTTACATAAACCAATTGGGATTTCAAGATGTTCATGTATC
GGAAgttttgagtaatttggctcATTTATTCTCTGAACAGCGGCAAGGTG
ATTTAGCTGCACATTATCACAACTTGTCTGCCAATCCGAACCGAATCGTT
GAAGATCTTTTACCCAAACAGTAACGGCAAGGTGATTTAGCTGCACATTA
TCACAACTTGTCTGCCAATCCGAACCGAATCGTTGAAGATCTTTTACCCA
AACAGTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000612_pilon | genome | sc0000612_pilon:24242..31896 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 496-579:7572 |
| Aaloc | 370-495:6234 |
| Aaloc | 277-369:5745 |
| Aaloc | 244-273:5124 |
| Aaloc | 175-243:4763 |
| Aaloc | 124-174:1803 |
| Aaloc | 1-120:1 |
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