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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000001_pilon:3412033..3417408- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_017998 ID=XLOC_017998|Name=XLOC_017998|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=5376bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000001_pilon:3412033..3417408- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGTGTCCTTCATTTCCAGTGACATCAAAGACATTTTCACCATCAAGTT
AAAAACACGTCAAGATGATTATACGGATCAATTTTCGCGTATCTTCATGG
TCAAAATGTTCATGGTGAGTGTTTTTCTTTCAAAAGTATTTTACTCGAAC
GTAAGTCAACTCGAACGTCTATTACTCAACTCAATCAAGTCTTGTTTCTT
GCTCGTTCAGTGAGTGAAAAATGCCTTGTAAATCACACTCTATTACTCGC
GCGAACAAATGTCAATTTCCCGTGCGTTTCCGAGCTCTGGAGACTCCAGT
GTACACGCTTTTTTTTTTATAAGAATACACTTTATAAGAATGTCCATGAT
GAAAATGGCCAAAAAATTAAGAACATGGTAAGAATATCACCATCATGGAA
TTTAGCAACTGAACCTAAGAATGCCATTTTTAATGCATTTTAACCTGTAG
ATTGCCAACTTCGATCTTAACATAAGAATACCGTAAGAATATTTTTGGAT
GATTTTCTCCAAAAAGTTAAGAATATCCATGATGAAATGAAAAAACACCA
TTCTTATAAAAAAAAAAGCGTGTAGTACTGTACTCCAATTTCGCTACGGG
ATTAGGGTCGAATTCACCAAAGCTCATATGGACTATTGTAGAATAGTGTT
TCGATTGATTTTCTGAGTCCACAGATAATCTAAGAACTGATCGAAACATT
AAAAAGAATGGTGATTCAATCCAGGAATTTATAGAGCTGACACCATAGAC
CACTTCTTTACAAGTCAGACGATCTTTTTTCATGTTTAGGTCTCCGCATT
AGTGATGGGTTTCGATTGGTTTCAAGATACTGTGAATTGTATGATTCCTG
ATATCGACCTTCACAAAGTTGGCGAAGATTTTGTTCATTCTGCTTGCTGG
ATACAAGGTGTGTGAAAACATTAATTTCTTTATTCGTGTGTTGTGGGGAC
TATCTTTATTGTGTAATCTCAATTCATTTTTGATTCTGTTTTTTGAATAT
AAGACGATCTCAGAACTTTTTTGTACAATCTTGGACAAAATATTTGAGAC
AAAAGGGATATCCCAGCGAAATTTTAAACACCACAAATGATTTTTAAGCG
CCTTAAACTACAATTGGAAAGTAGAGTTTTAACTCTGAGTTTTAGCATGA
GACTTAAGGGACCTTAGGATCTCAGGATTTTAAAGCTCAAATTTGCTCGA
ATAAGGCTTGGAATATAGCCTAGAAGCCACCGAACCCCTCTAAATTCGAA
ATATTCAATGAAAGAAAGCGGAGGTGCTAAAATAGCAATTCTCGCGCGGA
CTTTAGATTCTGAAAAACGTTAAAATACACTAAAATATCAATATATTTCG
ACCATAATTATAGAAAGTGGCAAAGTACAAACATAATATCTTTGAAGGCC
ACCTTTTCTTATTTTGTCTAAAAGAGATTAATTTTCATAAAAGTGGAATG
CGACGTAACGGTGTGGCCCATTGTTCTAATGGTATCGTGAGCAAGTGAGT
CGTTTATAATCCGTATAATACAGTGATATGGGTGCTATATGATAATACAG
TAATATGGGTGCTATATGATAATACAGTAATATGGGTGTTATATGATAAT
ACAGTGATATGGGTGCTATATGATAGTACAGTAATATGGGTGCTATATGA
TAGTACAGTAATATGGGTGCTATATGATAATACAGTGATATGGGTGCTAT
ATGATAATACAGTGATATGGGTGCTATATGATAACACAGTAATATGGGTG
CTATATGATAATACAGTAATATGGGTGCTATATGATAATACAGTGATATG
GGTGCTATATGATAATACAGTAATATGGGTGCTACATGATAATACAGTAA
TATGGGTGCTATATGATAATGCAGTAATATGGGTGCTATATGATAATACA
GTAATATGGGTGCTATATGATAATACAGTAATATGGGTGCTATATGATAA
TACAGTGATATGGGTGCTATATGATAGTACAGTAATATGGGTGCTATATG
ATAGTACAGTAATATGGGTGCTATATGATAATACAGTAATATGGGTGTTA
TATGATAATACAGTGATATGGGTGCTATATGATAGTACAGTAATATGGGT
GCTATATGATAGTACAGTAATATGGGTGCTATATGATAATACAGTGATAT
GGGTGATATCTATATGATATACAGTATATGGGTGCTATATGATAATACGT
ATATGGGTGCTATATGATGATAATACAGTAATATGGGTGCTATATGATAA
TACAGTGATATGAGTGCTATATGATAATACAGTAATATGGGTGCTACATG
ATAATACAGTAATATGGGTGCTATATGATAATGCAGTAATATGGGTGCTA
TATGATAATGCAGTAATATGGGTGCTATATGATAATACAGTAATATGGGT
GCTATATGATAATACAGTAATATGGGTGCTATATGATAATACAGTGATAT
ATGGGTGCTATATGATAATACATTAATATGGGTGCTATATGATAATACAG
TAATATGGGTGCTATATGATAATACAGTAATATGGGTGCTATATGATAAT
AGTAATATGGGATTTTCGACTGGCTTTTTATTAGAGAGGTTTCCCAGTTC
TGTATTGAGAGGTAGGATTCTTACGCTGTAACCTTACGCTTTACGCTGAA
ATTGTGAGACGCTGACACACTGACAGTTTTTAAATCGAGTGCGTTAATCC
GGCGTAAACCACTAAGGAATCAAGGCCAACCAAATTTCACCTCATCCACA
GTTTATTATGGAATCAATATCCAGCACATATATGATAATACGTCACTGGA
TGATAGTAGCTTGTACGATTGGTTTCTCACATTAAGTTTTGCTCAATTAA
GACTTTACAAATTCAAATAATTTTCACTTCTCTCTTCATACACAGGATTT
TACGTCTATCCTCAACTTTCCGAACTGATTGGCGAAACGAATTATTACGG
CATTCCCAAAGATATCTCCAAGAACGGCGTCAACGCCAAGGGTCAATTAT
GCGAGATGAAGCAAGGGCAATATGGTGAGTACGACGGTAAGACCCGCTTC
CATGATTTGTATGGCTACTTCCGTTGTTATGCCCGTTGTTTTACAGATTA
CTTAGTCTTATTTGTTCAAATTACAAGAGAGATTCGAATATTATGGAAAG
TTTTTCTAAAGGGTTTGTCCTTAACGCGGGACTGGAAAATTAGCTTAAAT
GATATAAAGATCTCGAATAAAAGAGAATCTTATGTAGTTTTTTTAAGAAA
GATAACAGAAAAGTTTGATAAAGATACGGCTTACAGTATGAACTGAATTA
AGTAAATGGCAAAGTTAATGGTTAAAAACTTCAACTTTTTAGTTGGGAAG
AAGTACAAGAGTGGTTTCTTTTTTTCTGGTTAAAACATCAAATTTTTTTA
GATGGAAAGAAATAGAAGAGTGGTTTTCATTCTTTCTTTCAGATTGTATG
GAGTTGAGACGTTTGTATTTCTTACAATATCAATGGATGCCTTTCTTCGT
AGCTAGTGCCGCCATTATTTATTATCTCCCATATATTATCTACCAAATAT
TCAACACTGATGTGCAAAGTTTGAAAGAAACCATCCAGAAAGAAAAGGTT
TGACACTTTCAAACATTACTGCCGTCTCCTCTTGCTATATTAGCGAGTTT
GTGTATTCGAGATAAATCGAGGGGGACGGTATAAAGCAAAGCTGACGTGT
CTCCAAAACCATCGTCCACTTTGCTCGACGACGGTAAAAACACCAAAATA
CCGTCGTCTGTTTAGGTGAGCAATGGCGATATAGAGCCGTACATCAACTA
TCGACTTTGTTTTGTATCATTTCACTTACCGTCGCTCTCGATATCCTCCG
ATACATCGCTATTACCGTATGACACGTATTATCGTATTATTAATGACTCC
AGTCTATTTTTTCCTCGTCAATTTTCTATTCGCTTTTACTTCGAAGATAA
AGTAATGTACCTAAAAAAACTTTTCCATAAATTCAATGTGAACACATGGA
CCACAGGGACACTTGCTGCTATAGTTGATCTCGTAACAAGACTATCCTTT
CGCGCATGCGTGGTGCTCTGCTTTAAAGGGATATGACAAATGTGCAAAAG
TAAATGTATTTGAAAATTCTTAAAAGGGCTATCCGCGAAAGTTTATGCTC
GCGAAAAATTCATGAAAGAATAGGAAGTCTGTAAAACTAGCGACCGTAGT
GCAGTGGTAGAGCATCCGGCTATGGTGCGCAAGGTTGTGGGTTCAGCCCC
CAGCCGGGTCATACCAAAGATTTCCAAAATGATACTTGATACCTCTCTGC
TTGATGCTCAGGAATTAAGTGAAGGATCAAGGGTAAGTGGAGTAATCCAG
GGAGAAATAGTGGCGCCCTCCCCTACATTCGGGTAGATAGCTATCGAAAG
AGGAGCCTTCGGGTCGCCTCCGACTGCGGTCGCAGACTTACTTACTACTA
CTGTAAAACTTCTCACTTAAAATAGAAGATAAGATTTACTAGCCTATATG
TCTCTATAAAAGACAAAAGTTTCACTCCAATTCAAGAAGCATTGGCCCAT
GTAAGCCATTACTTCTTGTGAAAATTTTCATTGTTATTGTCTTGATTCGT
CTAAAATAAATTTTGTTTCTTTCACTCTATAACAGGTCAACGGAGGAGAT
ATTGTGGAGAATTTCTTCAATTACGACATTAATACCATCTTCCAAATGCG
CTTCAATGTCCTTATGAATCTGGTGGTCAAAATCTTGTACCTTGCTGTCA
ACCTTGGTGTTTTCTATCTTACAGATCATCTGCTAAATGGTGGTTTCCAA
CTATACGGTAAGAACTGGTTGGATTGGGCTGCACTACCGAATCAAGAGTC
TTACGACTTTAAAACAGGGACATCAGTTAAACCTGGTGATGTGTTACTGC
CGACTTTTGGTTTTTGTGAAATTTACGAATCCAGCTCAACTAAAACTTTC
AAATATAACAATAAAAGTAAATTCATTTGTGAAATCTCCTTAAACGTGAT
GTATCAATACATTTTCATCATTCTTTGGTTCTTCATGCTTGCTGGAATCT
TCATTTCCGCATTCGGCATCTTACACAATATCGCCGGACATACCATTACG
GTCATCTATTTCATCCGGGAAAGCCCGTCCGCTAAAGCACTGTTCCGCTC
ATTATCATTCCGGGAATGCGAATACCTATCCGTTATTCGACACCAAGATA
GCCAACTCTACCATGACGTAATGGAAAGAATCCGTTTAAAACGACCGGAG
CTCGCCAAATTTAGCGTCAACGGAAAGATCAATGCCCCACCACTGTCAGC
ACTCAATTGCGATACTTATAAAGAAACTGCTTTCAAAGAAGGGTCCATAT
ACCACGGGAATCTAAACATGCTTTAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000001_pilon:3412033..3417408- >XLOC_017998 ID=XLOC_017998|Name=XLOC_017998|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2538bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000001_pilon:3412033..3417408- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGTGTCCTTCATTTCCAGTGACATCAAAGACATTTTCACCATCAAGTT
AAAAACACGTCAAGATGATTATACGGATCAATTTTCGCGTATCTTCATGG
TCAAAATGTTCATGATGGTGTCCTTCATTTCCAGTGACATCAAAGACATT
TTCACCATCAAGTTAAAAACACGTCAAGATGATTATACGGATCAATTTTC
GCGTATCTTCATGGTCAAAATGTTCATGGTCTCCGCATTAGTGATGGGTT
TCGATTGGTTTCAAGATACTGTGAATTGTATGATTCCTGATATCGACCTT
CACAAAGTTGGCGAAGATTTTGTTCATTCTGCTTGCTGGATACAAGGTCT
CCGCATTAGTGATGGGTTTCGATTGGTTTCAAGATACTGTGAATTGTATG
ATTCCTGATATCGACCTTCACAAAGTTGGCGAAGATTTTGTTCATTCTGC
TTGCTGGATACAAGGATTTTACGTCTATCCTCAACTTTCCGAACTGATTG
GCGAAACGAATTATTACGGCATTCCCAAAGATATCTCCAAGAACGGCGTC
AACGCCAAGGGTCAATTATGCGAGATGAAGCAAGGGCAATATGGTGAGTA
CGACGGATTTTACGTCTATCCTCAACTTTCCGAACTGATTGGCGAAACGA
ATTATTACGGCATTCCCAAAGATATCTCCAAGAACGGCGTCAACGCCAAG
GGTCAATTATGCGAGATGAAGCAAGGGCAATATGGTGAGTACGACGATTG
TATGGAGTTGAGACGTTTGTATTTCTTACAATATCAATGGATGCCTTTCT
TCGTAGCTAGTGCCGCCATTATTTATTATCTCCCATATATTATCTACCAA
ATATTCAACACTGATGTGCAAAGTTTGAAAGAAACCATCCAGAAAGAAAA
GATTGTATGGAGTTGAGACGTTTGTATTTCTTACAATATCAATGGATGCC
TTTCTTCGTAGCTAGTGCCGCCATTATTTATTATCTCCCATATATTATCT
ACCAAATATTCAACACTGATGTGCAAAGTTTGAAAGAAACCATCCAGAAA
GAAAAGGTCAACGGAGGAGATATTGTGGAGAATTTCTTCAATTACGACAT
TAATACCATCTTCCAAATGCGCTTCAATGTCCTTATGAATCTGGTGGTCA
AAATCTTGTACCTTGCTGTCAACCTTGGTGTTTTCTATCTTACAGATCAT
CTGCTAAATGGTGGTTTCCAACTATACGGTAAGAACTGGTTGGATTGGGC
TGCACTACCGAATCAAGAGTCTTACGACTTTAAAACAGGGACATCAGTTA
AACCTGGTGATGTGTTACTGCCGACTTTTGGTTTTTGTGAAATTTACGAA
TCCAGCTCAACTAAAACTTTCAAATATAACAATAAAAGTAAATTCATTTG
TGAAATCTCCTTAAACGTGATGTATCAATACATTTTCATCATTCTTTGGT
TCTTCATGCTTGCTGGAATCTTCATTTCCGCATTCGGCATCTTACACAAT
ATCGCCGGACATACCATTACGGTCATCTATTTCATCCGGGAAAGCCCGTC
CGCTAAAGCACTGTTCCGCTCATTATCATTCCGGGAATGCGAATACCTAT
CCGTTATTCGACACCAAGATAGCCAACTCTACCATGACGTAATGGAAAGA
ATCCGTTTAAAACGACCGGAGCTCGCCAAATTTAGCGTCAACGGAAAGAT
CAATGCCCCACCACTGTCAGCACTCAATTGCGATACTTATAAAGAAACTG
CTTTCAAAGAAGGGTCCATATACCACGGGAATCTAAACATGCTTTAAGTC
AACGGAGGAGATATTGTGGAGAATTTCTTCAATTACGACATTAATACCAT
CTTCCAAATGCGCTTCAATGTCCTTATGAATCTGGTGGTCAAAATCTTGT
ACCTTGCTGTCAACCTTGGTGTTTTCTATCTTACAGATCATCTGCTAAAT
GGTGGTTTCCAACTATACGGTAAGAACTGGTTGGATTGGGCTGCACTACC
GAATCAAGAGTCTTACGACTTTAAAACAGGGACATCAGTTAAACCTGGTG
ATGTGTTACTGCCGACTTTTGGTTTTTGTGAAATTTACGAATCCAGCTCA
ACTAAAACTTTCAAATATAACAATAAAAGTAAATTCATTTGTGAAATCTC
CTTAAACGTGATGTATCAATACATTTTCATCATTCTTTGGTTCTTCATGC
TTGCTGGAATCTTCATTTCCGCATTCGGCATCTTACACAATATCGCCGGA
CATACCATTACGGTCATCTATTTCATCCGGGAAAGCCCGTCCGCTAAAGC
ACTGTTCCGCTCATTATCATTCCGGGAATGCGAATACCTATCCGTTATTC
GACACCAAGATAGCCAACTCTACCATGACGTAATGGAAAGAATCCGTTTA
AAACGACCGGAGCTCGCCAAATTTAGCGTCAACGGAAAGATCAATGCCCC
ACCACTGTCAGCACTCAATTGCGATACTTATAAAGAAACTGCTTTCAAAG
AAGGGTCCATATACCACGGGAATCTAAACATGCTTTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000001_pilon | genome | sc0000001_pilon:3412033..3417408 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 529-1269:742 |
| Aaloc | 376-528:1933 |
| Aaloc | 235-372:2480 |
| Aaloc | 115-231:4588 |
| Aaloc | 1-114:5377 |
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