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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000045_pilon:1899831..1909276+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_017968 ID=XLOC_017968|Name=XLOC_017968|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=9446bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000045_pilon:1899831..1909276+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCTCCAGAAGCTAAGAGTAATGTTGGTGCCTTCAAAGACAAGGAAAA
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TTAGCGCAAATCGCCCATTCATTATTCCTACCTGGTGCTTCCAGTCTCCA
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AAATTACATGCGCGAAAATTCAAACGCGTTTGAGACGCGTCTAGAACGCG
AATTTCTAAAACGCCCTTGATCCCGCCCTCTGCTTaaaaaaaTGCCTTCC
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TATTAGcgaagatgttatttttgattcactttgagtgttttggatagctt
ggcacaggaaaagaagaaaataatgagtttttaagaaataatgaactttt
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aaattcccatcgcctaagttcctgaatagttttactatgttctgtgaaaa
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GGCTGatcaaaaaaaaactgaaaaataaaaagtccaaaataaacaaactt
cagtCTTTATACTTATTAccatttacagtcattatatcaaagctaaaaaa
acaatcaattgaaacctgtttagactgatatgtaccggggtattttctag
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AAAAAGGTGCCCAGTAGTTAAActtcaaattaaagaaaaaagtggctata
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TATTTGttagtggaatattatcaagcaaaaaatatgaaaaaagttatgat
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TCTGCCAGTTTCtgcaagaagttgattttttttctttttcatttttcatt
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GTCTcaactgcaaattattttgagacagactttaatagaccttttcataa
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GAAGCCCATTCCAATTTCTACAAGTTAACCAAAAATgaggattttttgtt
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ACAATCACCAATGATGGAGCAACTATTCTGAAACAAATCCAAGTCCTTCA
CCCTGTCGCCAAAATGGTAAAGATTAATAAATTTATACTCATGTCTCcag
attttaaaaaaaagcaagagtaaacttttttttggagtAAATTATTTCAA
ACATCATGATCATGTTTATTGTTGAAACTCCAGGatgattatatttttca
attctaCTTTACAGTTGGTTGAGTTGTCCAAAGCTCAAGATATTGAAGCT
GGTGACGGTACAACTTCAGTAGTTGTCATTGCTGGAAGTTTGTTATCTGC
TGCTCAAAAGCTATTAGAAAAAGGCATCCACCCAACCATCATTTCAGAAT
CGTTTCAAAAGGCTGCTGCCAAGTGTGTTGAGATTCTCACAGCCATGGCA
AAACCCATTGATTTGAATGACAGAGAAACCCTTATGAAAAGTGCAACAAC
CTCATTATCATCAAAGGTATGgaattattttgtaaataacCGGTGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000045_pilon:1899831..1909276+ >XLOC_017968 ID=XLOC_017968|Name=XLOC_017968|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1032bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000045_pilon:1899831..1909276+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCTCCAGAAGCTAAGAGTAATGTTGGTGCCTTCAAAGACAAGGAAAA
ACCAGTGCAAGTCCGTGCTAGTAACATAACGGCCGCAAAAGATGGCTCCA
GAAGCTAAGAGTAATGTTGGTGCCTTCAAAGACAAGGAAAAACCAGTGCA
AGTCCGTGCTAGTAACATAACGGCCGCAAAAGGAGTTGCAGATGCTATTC
GTACAAGTCTTGGTCCTAAAGGCATGGACAAAATGGAGTTGCAGATGCTA
TTCGTACAAGTCTTGGTCCTAAAGGCATGGACAAAATGATTAAAGCATCA
GATGGAAGTGTTACAATCACCAATGATGGAGCAACTATTCTGAAACAAAT
CCAAGTCCTTCACCCTGTCGCCAAAATGATTAAAGCATCAGATGGAAGTG
TTACAATCACCAATGATGGAGCAACTATTCTGAAACAAATCCAAGTCCTT
CACCCTGTCGCCAAAATGTTGGTTGAGTTGTCCAAAGCTCAAGATATTGA
AGCTGGTGACGGTACAACTTCAGTAGTTGTCATTGCTGGAAGTTTGTTAT
CTGCTGCTCAAAAGCTATTAGAAAAAGGCATCCACCCAACCATCATTTCA
GAATCGTTTCAAAAGGCTGCTGCCAAGTGTGTTGAGATTCTCACAGCCAT
GGCAAAACCCATTGATTTGAATGACAGAGAAACCCTTATGAAAAGTGCAA
CAACCTCATTATCATCAAAGGTATGgaattattttgtaaataacCGGTGA
TTGGTTGAGTTGTCCAAAGCTCAAGATATTGAAGCTGGTGACGGTACAAC
TTCAGTAGTTGTCATTGCTGGAAGTTTGTTATCTGCTGCTCAAAAGCTAT
TAGAAAAAGGCATCCACCCAACCATCATTTCAGAATCGTTTCAAAAGGCT
GCTGCCAAGTGTGTTGAGATTCTCACAGCCATGGCAAAACCCATTGATTT
GAATGACAGAGAAACCCTTATGAAAAGTGCAACAACCTCATTATCATCAA
AGGTATGgaattattttgtaaataacCGGTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000045_pilon | genome | sc0000045_pilon:1899831..1909276 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 235-516:9165 |
| Aaloc | 145-234:8927 |
| Aaloc | 94-144:7402 |
| Aaloc | 1-90:1 |
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