XLOC_017532 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_017532
Unique NameXLOC_017532
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000300_pilon:41312..52999-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_017532 ID=XLOC_017532|Name=XLOC_017532|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=11688bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000300_pilon:41312..52999- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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TTCTAATTTGGATTACTCAGTAAAAACCATTGACAAAATAAATTTAAGAC ATTTTTTTCTTAGTGTGTTCTCTTTTACGTATTTTTGGTCTATTTTTAGA AGATGGAGCTATGAATGATTTTGCAATCAATTTGGGTTCATGAAATATAC AAAGTCTATCAGTTTCTTTCCTCTTCTTAAAGGCTGTCCTAAACCATCAA TTTCATCTATTTATAAATCTCATTTTCCTTAATGACTTAATGACATGTTA GTAAATTCAAACATCTGAACTGCATAATTTTTGAGTCCCTCCCAAATGTT TAACTCAATTTTTTAAGTGTCCTTATTACTGAAATTGCTCTAAAATGAAA GTTAACAGCTTTCTTTCAAGATCTTTGGCCTCCAATAACTGAGACTAAGT AAATAAAAAAATCTCAGGTTCTCTCACAAGCAGAGGAGATTATGAACAAT TTAGGAGCTATACTGCAGTGCTCCCCACAGTGTGATAAATAACTGAAAGG CTCTTTTAGAGGCCATTTTCTAACCTTCCCAAGAGAAGTTGATGAAAATA GAATACCCTTTTTTGTTTTCTTATTCACGTTTCCAAACACATTTCAAATG TTAGGGATCTTCGACAAAAAACTTTCAAATTTTTTATCGGCATTGAGCCG ATAAGGGGGTGGGGGGTCCAACTACATACCGATAAAAAAACAAGTATTGA GACAAAAATCCTTTCAGCCAATTTCTTTCTGATTTCGTCCACAAACTCCA CTGAAAGCATATGATTTCACTTGCTTTCAGCTTTGCGCGCAAATTCGCAA CTTTAAAAGTACAGTTTTGAAATAGCTTTGATAAAAAACTCTTTTTTCAT TGGCCAGCGCGCTGCCTTTTCCTTCGAAATGTTGCGACTTCATCCCGTCA TTTTAACTTTCGTTTTGATTAACAATATCAATGCGGGTATGAACAAACTC CATGTTGGTGCACAAATAGACAAAAATTCAACGATGACGGTTGGGAAGGC GATGGCGGACAAGATTGGAGGAAATTGTGTTTTCGAAGATGTAAAAGTTG GATTTGAAAAATTTGGCCGATAAGAGCAAGGGGGGGGAGGGGGTCTGAAG CTTATCAGCCCAATGCCGATAAAAAATTCGAAAGTTTTTTGTCGAAGACC CAGGAAGACCCCTTACTTTCAATCCAGCATTTGAGCAAAACCCATTTCTA TGGCTATATCTCATCGGCTCCCTATTTTGATTTTAAAGATAACTATCGAT TTTATTAAATGTTAGTTTTCCTTAATACATATGATATGAACTGATCAAAG TCTTTCTCAATATACCGAGTTGTCCAGAAAAAACTTTGGACGTTTGTTGG CTTCTTGAGACGAAAAAATTCTTCAACAACCCTGAAAATACTTTTATTAG AGTTATAACTTTTTAAATTTGGTCGAGTCTTTTTACAGTTTTACAGTTAT AGCTTTTCAAAGTCAAAATTCACTTTTCGAAAAGTGGAAAAATACACCAA AAAAGGGGGATCAAAATAGGCTCTTTTCTTTGTTTTTATCTTGAAATTTT TTGGAATTTTTGGGAATTCTTTAAGTACTGCCAAATTTGTCAAGAAACTA TTCTGTTTAGAGCAAATAATTACTTAAAGCTTTAAATGATTAATTAGGTT GTAAAACTCATTAAATTGTCTCTTTTATTGGTTAATTGATGAAATTTAAT CCCCTCTTTTTTGACGTATTTTTGCACATTTTTAAAAGTGAATTTTGACC AGTTTTGACTTTGAAAAGCTACAATTCTAAAACTTCTCAACAAAATTATA AAAGTTAAACCTCAAAATCTAAGCTAGACTATCATCTATCTAATAAAAGT ATTTTGAAGAGTTTGTTCGGTCTCAAGAAGCCAACAAACGTCCGTTTATC AAAAAGATTGATAATTTTCACTCCTGATTATCTTTTCAACAAGCACAAAA CCACTATCCAACTTTTCCGAGTTTTACCAAAAGTATAGTCTTTTTGTTTC TGCTGCAGATTATATTGAGATAGATTTTAGAGAGTGCCGTTCAGTTTTGC TATTTTTAAAATAATTTTTCTTTTTTTGTTTCTTTATAGCCACTGTTACA TTTGTAAAAGCTGGGAAAAATGATATCAAAGAAGTTGGTGTATCAGACAC AAATGTTGTATTTAATTGGGACTTCAATCTCGATGACCCAGATGCCCTCA AAACAATCACTTTTGGCTTCTACAAGTCTGATGGAACTAAATTCTTTTTT GCTATCAAGGATAAAGGGAAAGATTACAGTATTCGAGATAAATTATCAGC TAGTGACAAGAATAATTTTATTGTTGACATCAATGATACTTCAACAGCAA GGCTGACATTAAAAGAGATTTTCTTGAATCAGAATAACAGAAAATTCTCT TGTATGGTAGAACTCCTGAATGGAAATAGTATCATTTCCAATGTGGTTTT AAAAGTTTACGGTAAGATTTGAATGATTACTTTATTAGTTCCTTACCACC ATTTTGGTCTGAAAAATTGAGTTTCAATGCAGCAGTGATATTAAATGTGG ACCACCATGGTTGGATGACAAAGAATTTTTTTGCCCTCTAAACGTCCTAA ATAGGTGGTGTTTTCATGCATCTTAGCCCAAAAATTTTCTCATTTCTCTA CTTTGCATTATTTAACATTTCTTTTTTTCACAAAATTGAGTTTGAAATCT CAATTTGAAATTGGGTTTTTGTCAACAAATATACAGTGATAGAAAAGTGC TTGAAAAATACCCTGTCTGGGACCGACCATGGTTAACCCTTACAAGTAGT ACAGTGTGTCCCAAAAAAAATTGGACAAATCTCTATAAAGTATAAAGAGA AAGCTTTCAAAAAGAATGTTCTGGGTTGAAAATTGAAAAAATAATTGGGC TATTCCAGAAAGAGTTTGTACTCCCTATGTTGAGGAGGTGTGACGTCCAG GGTGGTCTGGAAAATAAAAATTCCAGGGTGGTCTGGTTTTTTGAATGATA AAATCCAGGGTGGTCAGTAAAATCGGGTTGAAAATCCAGGGTGGTCAGTA TAAAGAGGTTGAAAATTCAGGGTGGTCAAAGAAGTGGGGGCCCAAGGGGG TCCTGAAAAATTTGCACAAAATCCAGGGTGTCACGGGTTGGTCTAAAAAG CAGGGTAGCCAATTGGGGTAGCCAATTGGGCTAGGTTATGGGGTACCTAA ATATTTTACAGACCAGAATAGAAATACCGAAAATGAATACATAGAACCAA ATTTTACTGACCAGGGAGTATGAATCTGATTGATACTTAGATTGATCATG TATGATTCCAAAGATAAACAAAGATATAAATTACCACGTGTTAATGCACG AGGAGTAAGAAATAGAGCTTCATTATAATAGAGCTATTTCAAAAGACTTT TTGTACCTATTATAAGCTGCCATATTTAAAAATTTTGAAAGGAATTAATT GTTTGAAACATCTAAACATGATTTAAATTAAACAATAGATTCAATAACAA AGGATTGTTAAGATATGACAAGATTAGAGATCATATGGCCCAAAGGCCAT TCCAAAGCTATTATCATCGAATTACAGCTTCACAGAAATAACAATTAAAA ACATAAATAAAATCTAAATCTAAATTATTAGAAACTGTTTTGTATATATT TTTTATTCGAGTCTGTAAATTTTCAAACAAAGCCAATAAGGAAGACAAAA TGGCGCCAGGTCTCTTGAGAAGTAACAAAGTTCAGTACCTTTGGAAAAAA GGCTATTGTGGTTGAAGTTCGAAAGGAATCTTAAATTTTATTACATGGAA TCATTAACAAGATGTTGTAATAGTTATTTCCACATGGAAACAGGTTTCAG ATTTCAAAAGTTTAGGCAAAAAGAAGTACCCCATAACCTAGCCCAATTGG CTACCCCATTGGCTACCCTGCTTTTTAGACCAACCCGGGTGTCACCTTTA AAAAAAAGATCTCCTCAACATAGGGGGTACAATTTATTTCTGGAATAACC CAATTAGAAAGTAGTCTATTTTCTACCAATATTTTTCTTTCAGTTCCTCC AACCATTATTCATAAAAGTGGAACGTTCAAATCATTGAAAGAAGGAGAAC CATTAATATTAGAATGTAAAGCTAGTGCTGAACCCAAAGCACTAATCCAG TGGAGATCAACTTCAAACAAAGTTTTGCCATATAACAATGCAACAGGAGA GCTGGAAATATTATCTGTCAGTCGGAATGATTCTGGAAATTATACATGCA CTGCATCAAATCTCGCTGGAAATGCAACAATCACAATTCAAATCCAAGTT CAGTGTAAGTGGAACAACAAAAATCAAATTCTATTATTCAAACCCCTGCT GGATTTCTAGAAAATTTTGAATTCTATAAACCTCTTTGTATTTTGGTCTT TAATTTCAGAGACTTTCATTGGAATAGGCCTATGAAAAAACAGTGAACTG CGAGCTTATGAGATGAAAAACCCATTTTTTTATTATATCCATTATATGCG GAATCTGTATTGAAGAACTTCAAAGCAGACCTCCAATGAGGGCAGATCTT CTTACAAGACTTGCATAATAACCAGGATCTACTCGGACTGGAATGTGGAC ATACACATACTATTTTCCCTAAACCAGCAATCTCTTCAGCTCTTTCTACC ATTTTTAGACACGGAATTAACCTCTTCCAGGCAAAGGTTTTGTTAGACAT AGTAATCACTGGAAAATATAAACACAGAGTTTACAGCCATACAGGCTAAT TTATAACTTTATTTGCTATGACCGTGAAATACCAAAGGTTTGGAGCTGGC CACCATAATGTCAGTACACAGAAAAAAAAATCAACAGCTATTTGTTTTGA ATGTATTTTACTTTTGCTCGTGTAGGACGCACCAGATATTTTGCCCATCT CAACGAAACGAATAGGGACCTACATGAAGAATCCTGATCCAATCTATTTG CGGTGTATTGTGGATGCGGTGCCGCCGGCTGTCTTCAAGTGGAGCGATCC TAAAGGCAACCAAGTCAGCGAAGAACCTACATATATTATACAAGACCCAG ACGAGGATAAATATTTTGGTACATACACATGTAGAGCTAGTAATATAGTT CATTTTAGCGATCACACTGTGGAGGTTATAAAAATTGGTAAGTGAAATTA AAACTAGTTTAGACTTTTCGCCCTTGCCTAATCTTACTGTAAATCTGTGA CCTGCGACCATACTGCATTGGTAGAGTATCCGGCTACGGTGCGCAAGGTT GTGGGTTCAAGTCGCAGCCGGGTCATATCAAAGATTCCCAAAATGGTCCT TGATGCCTCTCTACTTGATGCTCAGCAATTAAGAGAAGGATTAAGGGTAA GTAGAGCAATCCAGGGAGAAAGAGTGGCGCCCTCCCCTACCTGGGTAGAC AGCTAATGAATAAGGAGCCCCCGGGATCTTCATCAATACGATGTAGCAAA CCGTATTGATGCTTCGACAGGCTTTGGTAATGTTCGCTTTTTTTAGCGTA CGGTTATCAGACACTGCCCTCTACCAATGCAGTATGGTTGCTCTAAGCTA GGTACAAACTTCTAATGAATGAATTAAAAGAATTTAAGAATTTCGCAATT TTTTCTAAGGTAATCCTGAGCAAGTGACGTTAACAACAAAAACGGTCAAT GCAAGAACAGCCACCTTCGATATGAAAATTCCAACAGACACTGGCAAAAG TGAGCTAAAGGATACAATTAAGATTGTGTACCAAGACACCAAAACAGGTC TGATTCAACAGAAGGTTCTGATTGGTTTAGGGAGATCCACTATCCAATTG GACAAGTTGACACCTTATACAGATTATGATTTGAATGTAACCGTGGAAAA TGAATACTTCTCTAGCACTGGTCAGAAGTTAGCTTTCAAGACGCTTGAAG CTGGTAAGCATTGATATGCGTTTAAATTCTGTGTTGAAAGTTCTTTCTTC TAATCCTTTTCAGAGGGATTTCCTTCATCTCAGTGAAGTAAAACACAGTT GTCTTTCCGTCTTTCTAAACTCTGCATAAGATTCATCAAAATTTCAAGAA TTTATGGTGTGTGAAATCTATTTTCCATCTCGGATGAAAATCTTGCAATA GCATTCCGCAATCAGAAAGTCTGTACACAGACCCGATATCTACGACTATC TTATTACACAAATATTGCTAGGCAAGTATTCAACGGCCTTGAAGTTTTAA TTAAAGGGGTTTGAATTAATACGAATTTTTTTAGTTCGTGTTGATTACAT GACTACTTATTTTCGTGTAATAAGGTAATTTCAAAATTCAGTGCAGTAGA GAGTCTGTTGCTATTGTCTTTACTGACCTGAGATTTTCAATACGATCGCT GCGATGGAGTTTGGGTAAGAGAGAAGTGTTTCTATTTATAAAACATACTT CATCGCAGAGGTTTCCGTAGGGAGATTTTTTATCAAACAGACAATGCGCA CAGAGTGTACTACGAAACGATAAATGTGACATATACAGTAAATCCTCATA ATGTCATTCTCACTGTCCTCATTTAAATCTCTCTAATATTATCTTCTCTA GTGCCTGGTATACCTTCCAACATCACCATTGATAGCACCGTATCCTCAAT CACCATCAACTGGCAACCACCAACAAATCCTAACGGAGTTATCACCAAAT TCATTTATAAATTCTACAAGAACATTGACCCTATCAATGACACAGAAATC GAAGTCTCCTCTTCAGTTCTCAATAAGACATTCAATAACCTCGGCACAGC TTATCAACAATATGCTTTTCGCATCAGAGCTGTTAATAAAGCTGGAGAAG GGGATTGGACACCAGTTTTGACACGTTACACTGACCCTGAACGTGAGTAT TTTACTACAGTAGAATACACGTTTTTTATAAGAACATTCAAAATTTTTTG AAGCCTTTGGATGTTCTTAACTTTTTTAGTTTTAAGCCTAAAAATGTTCT TTAACATGTTCTTATTTTCAACATTTTGAAAGCATTTTTGCCCATTTTCT TTTTAGAAATTGAAAAAAAGGAAAAATGTACGTACGCATTGAGTTTCATG TATGAAATAAAGGTCCGAACCAAAATTTGAAATTTTCTTCAACCGAGGGG GAATGAAAAAGTACGTACTTACCAAGGGGGTATAGCCATTTGCGTACGCT TGGCGTACAGGGGGGAGGGGTTACTCGATTTTCGACATTTTAGTGCTTAC TTACTTTTTGGAGGAACCCCTAGTCCACCATTTCAGTCTCGAGCGACCGT AGTGTAGTGGTAGAGCATCCGCATACGGTGCGTAAGGTTGTGGGTTCAAC CCCCAGCCGGGTCATACCAAAGATTCTCAAAATGGTACTTGATGCCTCTC TGCTTGATGCTCAACAATTAAGAGAAGGATCAAGGGTAAGTGGAGCAATC CAGGGAGAAAGAGTGGCGCCCTCTCCTACCTTCGGGTAGACAGCTATCGA AAGAGGAGCCTTCGGGTCGCCTCCGACTGCGGTCGCAGACTTACTACTTA CAGTCTCTATAGAGAGTTTTTTTTAATTGTGCACCTTTCTTTTGTAGCTC CATCGTCACCCCGTAACCTGACTGTAACTACCTCCATCCAACTACAAAAA 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000300_pilon:41312..52999-

>XLOC_017532 ID=XLOC_017532|Name=XLOC_017532|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3858bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000300_pilon:41312..52999- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGATTGATACATGTCATCGACTACTGGATAACAGCAGAGGGATTAAGAA
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CTTCAATCTCGATGACCCAGATGCCCTCAAAACAATCACTTTTGGCTTCT
ACAAGTCTGATGGAACTAAATTCTTTTTTGCTATCAAGGATAAAGGGAAA
GATTACAGTATTCGAGATAAATTATCAGCTAGTGACAAGAATAATTTTAT
TGTTGACATCAATGATACTTCAACAGCAAGGCTGACATTAAAAGAGATTT
TCTTGAATCAGAATAACAGAAAATTCTCTTGTATGGTAGAACTCCTGAAT
GGAAATAGTATCATTTCCAATGTGGTTTTAAAAGTTTACGCCACTGTTAC
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CAAATGTTGTATTTAATTGGGACTTCAATCTCGATGACCCAGATGCCCTC
AAAACAATCACTTTTGGCTTCTACAAGTCTGATGGAACTAAATTCTTTTT
TGCTATCAAGGATAAAGGGAAAGATTACAGTATTCGAGATAAATTATCAG
CTAGTGACAAGAATAATTTTATTGTTGACATCAATGATACTTCAACAGCA
AGGCTGACATTAAAAGAGATTTTCTTGAATCAGAATAACAGAAAATTCTC
TTGTATGGTAGAACTCCTGAATGGAAATAGTATCATTTCCAATGTGGTTT
TAAAAGTTTACGTTCCTCCAACCATTATTCATAAAAGTGGAACGTTCAAA
TCATTGAAAGAAGGAGAACCATTAATATTAGAATGTAAAGCTAGTGCTGA
ACCCAAAGCACTAATCCAGTGGAGATCAACTTCAAACAAAGTTTTGCCAT
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TCTGGAAATTATACATGCACTGCATCAAATCTCGCTGGAAATGCAACAAT
CACAATTCAAATCCAAGTTCAGTTTCCTCCAACCATTATTCATAAAAGTG
GAACGTTCAAATCATTGAAAGAAGGAGAACCATTAATATTAGAATGTAAA
GCTAGTGCTGAACCCAAAGCACTAATCCAGTGGAGATCAACTTCAAACAA
AGTTTTGCCATATAACAATGCAACAGGAGAGCTGGAAATATTATCTGTCA
GTCGGAATGATTCTGGAAATTATACATGCACTGCATCAAATCTCGCTGGA
AATGCAACAATCACAATTCAAATCCAAGTTCAGTACGCACCAGATATTTT
GCCCATCTCAACGAAACGAATAGGGACCTACATGAAGAATCCTGATCCAA
TCTATTTGCGGTGTATTGTGGATGCGGTGCCGCCGGCTGTCTTCAAGTGG
AGCGATCCTAAAGGCAACCAAGTCAGCGAAGAACCTACATATATTATACA
AGACCCAGACGAGGATAAATATTTTGGTACATACACATGTAGAGCTAGTA
ATATAGTTCATTTTAGCGATCACACTGTGGAGGTTATAAAAATTGACGCA
CCAGATATTTTGCCCATCTCAACGAAACGAATAGGGACCTACATGAAGAA
TCCTGATCCAATCTATTTGCGGTGTATTGTGGATGCGGTGCCGCCGGCTG
TCTTCAAGTGGAGCGATCCTAAAGGCAACCAAGTCAGCGAAGAACCTACA
TATATTATACAAGACCCAGACGAGGATAAATATTTTGGTACATACACATG
TAGAGCTAGTAATATAGTTCATTTTAGCGATCACACTGTGGAGGTTATAA
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AGAACAGCCACCTTCGATATGAAAATTCCAACAGACACTGGCAAAAGTGA
GCTAAAGGATACAATTAAGATTGTGTACCAAGACACCAAAACAGGTCTGA
TTCAACAGAAGGTTCTGATTGGTTTAGGGAGATCCACTATCCAATTGGAC
AAGTTGACACCTTATACAGATTATGATTTGAATGTAACCGTGGAAAATGA
ATACTTCTCTAGCACTGGTCAGAAGTTAGCTTTCAAGACGCTTGAAGCTG
GTAATCCTGAGCAAGTGACGTTAACAACAAAAACGGTCAATGCAAGAACA
GCCACCTTCGATATGAAAATTCCAACAGACACTGGCAAAAGTGAGCTAAA
GGATACAATTAAGATTGTGTACCAAGACACCAAAACAGGTCTGATTCAAC
AGAAGGTTCTGATTGGTTTAGGGAGATCCACTATCCAATTGGACAAGTTG
ACACCTTATACAGATTATGATTTGAATGTAACCGTGGAAAATGAATACTT
CTCTAGCACTGGTCAGAAGTTAGCTTTCAAGACGCTTGAAGCTGTGCCTG
GTATACCTTCCAACATCACCATTGATAGCACCGTATCCTCAATCACCATC
AACTGGCAACCACCAACAAATCCTAACGGAGTTATCACCAAATTCATTTA
TAAATTCTACAAGAACATTGACCCTATCAATGACACAGAAATCGAAGTCT
CCTCTTCAGTTCTCAATAAGACATTCAATAACCTCGGCACAGCTTATCAA
CAATATGCTTTTCGCATCAGAGCTGTTAATAAAGCTGGAGAAGGGGATTG
GACACCAGTTTTGACACGTTACACTGACCCTGAACTGCCTGGTATACCTT
CCAACATCACCATTGATAGCACCGTATCCTCAATCACCATCAACTGGCAA
CCACCAACAAATCCTAACGGAGTTATCACCAAATTCATTTATAAATTCTA
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TTTCGCATCAGAGCTGTTAATAAAGCTGGAGAAGGGGATTGGACACCAGT
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CTGTAACTACCTCCATCCAACTACAAAAACACTACCTCAATATTAACTGG
AAACCACCGATCAAGGGAAGCAACACTATCACTAAATACGAAATCAAAAT
CAATACAACCTCTTTAGAAGATAATTCAAACCTTCAGCCTTTTACTCACA
CGGCAAACGCTAAGTCAATACCACAACGAAACTATAAGATTGCCACTAAG
CCATATTCGAAAGCTTTTGTTTGGGTTCGTGAAGGCGGTGGTGATAAACC
GGTTTGGGGATCGTTTGCAGGACCTTTTGAAGTGACCACGCCTCAAGGAG
GTAATTGTCAAGATTGACTCCATCGTCACCCCGTAACCTGACTGTAACTA
CCTCCATCCAACTACAAAAACACTACCTCAATATTAACTGGAAACCACCG
ATCAAGGGAAGCAACACTATCACTAAATACGAAATCAAAATCAATACAAC
CTCTTTAGAAGATAATTCAAACCTTCAGCCTTTTACTCACACGGCAAACG
CTAAGTCAATACCACAACGAAACTATAAGATTGCCACTAAGCCATATTCG
AAAGCTTTTGTTTGGGTTCGTGAAGGCGGTGGTGATAAACCGGTTTGGGG
ATCGTTTGCAGGACCTTTTGAAGTGACCACGCCTCAAGGAGGTAATTGTC
AAGATTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_017532XLOC_017532-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000300_pilongenomesc0000300_pilon:41312..52999 -
Properties
Property NameValue
Aaloc1591-1929:340
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