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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000221_pilon:434964..436472- Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_017325 ID=XLOC_017325|Name=XLOC_017325|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=1509bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000221_pilon:434964..436472- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTCAACAACAACAAATGACCAAGTTGCTATCATCAACAATGAACCACT
GTTTGATTGTGATCCAACTGATGGTGACCCAGCTCATTGCAATTCAAAAC
CAATCAAGCTACAAAGGAAGTTAGGTCGCCTTCATGGATTTTCACTTATA
ATTGGATTGATTTTGGGCAGCGGTGTTTTTGTATCTCCTGGATTAGTTGC
TAAAGACACAAGCTCTACTGGAATGCAACTGATCATGTGGGTAGCAGGTG
GGATCATTGCTCTTCTTGGCGCCCTTTGTTATTGTGAGATTGCTTGCATG
TTCAAAATGGCTGGTGGAAGCTATGCTAATATATTCAATATTTATGGTAG
CATGGCTGCTTTCCTAACAGCATGGGTGAATTGTCTTGTGATTGATCCCT
CAAGTATTGCCGCAACTGCTTTAACCATTGGAACTTATGTTGTTAAACCA
TTTTATGAAACTGATTCTAACGGAGAAAAAGTTGCCAAGCTTATTGCTTT
TGGGTTGATTGTACTGGTATTTATTATCAATAGCTCTTCTGCAAAAGTCA
CAAACATGATACAGAGGGTGCTATCAGTTATTCAAATATTATCAGTTGCT
TTTGTCATCATCATTGGAATATGGCAGCTGATTGAAAACAAGACAGGTAA
TTTTAATCACCCATTTTCTGGGACAGTTTTCAATAAACACAGCCCTTTAC
ATTTTGGTATTGCGTTATTTGGTGCTTTATGGTCTTATGATGGTTGGGCA
TCGATGACCAGTGTGGTTGAAGAACTGGATAACGTCGAACAAAACCTGGT
CCTCACTCTCATTACTGGTATTCCTTTCGTTATATTTTGCTACATCATGG
CTAATATTTCATTCTTGGCTGTATTATCTCACCAACAAATAGGTGCTACA
GACACAGTAGCCATTGATTTCATTGATAAGGTTCTGGGTGTGAAAACATC
TTACCTAATGATGGTACTTGTTGCATTATCAGCTTTTGGCAATCTTAATG
GTAGCTTCTTTACTGCTCCTAGAACAACAATGTCTGCTGGACGTGAGGGA
CATATGCCTTTCATTTTTTCGTTGCTTTATCATAAAAATGAACAGCCTAT
ACCAGCTTCTGTATTACTCATGGTCGTTTCTTCTTTGATGTTACTTCCTG
AAACAAGCAACCTTAACACATTGATTCTACTCTTCAGTCAAGCTCAATGG
ATCCTTTACACAGCTTCTACAATCGGTGTGATCATTTTACGATACCGTAG
ACCAGATATTGACAGACCATTCAAAGTTTTTCTCGGAATTCCTGTATTTT
TCTCAATCATTGGTGTTTATCTAGTGATCATACCATTCTTTCGTTATTTT
TGGCTGTCTATTGGAATGTTTGGTTTTATTGCTCTTGGAATGCCAATCTA
CTTATTATGTGTCAAGTACTTACCTTCATGTTGTTCAAACTTCATGGAGA
TATGTAATATGAAATTTCAAGTCTACTTTGGTTTTGTCCCATGCTCTAAG
GAAACTTGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000221_pilon:434964..436472- >XLOC_017325 ID=XLOC_017325|Name=XLOC_017325|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3018bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000221_pilon:434964..436472- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTCAACAACAACAAATGACCAAGTTGCTATCATCAACAATGAACCACT
GTTTGATTGTGATCCAACTGATGGTGACCCAGCTCATTGCAATTCAAAAC
CAATCAAGCTACAAAGGAAGTTAGGTCGCCTTCATGGATTTTCACTTATA
ATTGGATTGATTTTGGGCAGCGGTGTTTTTGTATCTCCTGGATTAGTTGC
TAAAGACACAAGCTCTACTGGAATGCAACTGATCATGTGGGTAGCAGGTG
GGATCATTGCTCTTCTTGGCGCCCTTTGTTATTGTGAGATTGCTTGCATG
TTCAAAATGGCTGGTGGAAGCTATGCTAATATATTCAATATTTATGGTAG
CATGGCTGCTTTCCTAACAGCATGGGTGAATTGTCTTGTGATTGATCCCT
CAAGTATTGCCGCAACTGCTTTAACCATTGGAACTTATGTTGTTAAACCA
TTTTATGAAACTGATTCTAACGGAGAAAAAGTTGCCAAGCTTATTGCTTT
TGGGTTGATTGTACTGGTATTTATTATCAATAGCTCTTCTGCAAAAGTCA
CAAACATGATACAGAGGGTGCTATCAGTTATTCAAATATTATCAGTTGCT
TTTGTCATCATCATTGGAATATGGCAGCTGATTGAAAACAAGACAGGTAA
TTTTAATCACCCATTTTCTGGGACAGTTTTCAATAAACACAGCCCTTTAC
ATTTTGGTATTGCGTTATTTGGTGCTTTATGGTCTTATGATGGTTGGGCA
TCGATGACCAGTGTGGTTGAAGAACTGGATAACGTCGAACAAAACCTGGT
CCTCACTCTCATTACTGGTATTCCTTTCGTTATATTTTGCTACATCATGG
CTAATATTTCATTCTTGGCTGTATTATCTCACCAACAAATAGGTGCTACA
GACACAGTAGCCATTGATTTCATTGATAAGGTTCTGGGTGTGAAAACATC
TTACCTAATGATGGTACTTGTTGCATTATCAGCTTTTGGCAATCTTAATG
GTAGCTTCTTTACTGCTCCTAGAACAACAATGTCTGCTGGACGTGAGGGA
CATATGCCTTTCATTTTTTCGTTGCTTTATCATAAAAATGAACAGCCTAT
ACCAGCTTCTGTATTACTCATGGTCGTTTCTTCTTTGATGTTACTTCCTG
AAACAAGCAACCTTAACACATTGATTCTACTCTTCAGTCAAGCTCAATGG
ATCCTTTACACAGCTTCTACAATCGGTGTGATCATTTTACGATACCGTAG
ACCAGATATTGACAGACCATTCAAAGTTTTTCTCGGAATTCCTGTATTTT
TCTCAATCATTGGTGTTTATCTAGTGATCATACCATTCTTTCGTTATTTT
TGGCTGTCTATTGGAATGTTTGGTTTTATTGCTCTTGGAATGCCAATCTA
CTTATTATGTGTCAAGTACTTACCTTCATGTTGTTCAAACTTCATGGAGA
TATGTAATATGAAATTTCAAGTCTACTTTGGTTTTGTCCCATGCTCTAAG
GAAACTTGAATGTCAACAACAACAAATGACCAAGTTGCTATCATCAACAA
TGAACCACTGTTTGATTGTGATCCAACTGATGGTGACCCAGCTCATTGCA
ATTCAAAACCAATCAAGCTACAAAGGAAGTTAGGTCGCCTTCATGGATTT
TCACTTATAATTGGATTGATTTTGGGCAGCGGTGTTTTTGTATCTCCTGG
ATTAGTTGCTAAAGACACAAGCTCTACTGGAATGCAACTGATCATGTGGG
TAGCAGGTGGGATCATTGCTCTTCTTGGCGCCCTTTGTTATTGTGAGATT
GCTTGCATGTTCAAAATGGCTGGTGGAAGCTATGCTAATATATTCAATAT
TTATGGTAGCATGGCTGCTTTCCTAACAGCATGGGTGAATTGTCTTGTGA
TTGATCCCTCAAGTATTGCCGCAACTGCTTTAACCATTGGAACTTATGTT
GTTAAACCATTTTATGAAACTGATTCTAACGGAGAAAAAGTTGCCAAGCT
TATTGCTTTTGGGTTGATTGTACTGGTATTTATTATCAATAGCTCTTCTG
CAAAAGTCACAAACATGATACAGAGGGTGCTATCAGTTATTCAAATATTA
TCAGTTGCTTTTGTCATCATCATTGGAATATGGCAGCTGATTGAAAACAA
GACAGGTAATTTTAATCACCCATTTTCTGGGACAGTTTTCAATAAACACA
GCCCTTTACATTTTGGTATTGCGTTATTTGGTGCTTTATGGTCTTATGAT
GGTTGGGCATCGATGACCAGTGTGGTTGAAGAACTGGATAACGTCGAACA
AAACCTGGTCCTCACTCTCATTACTGGTATTCCTTTCGTTATATTTTGCT
ACATCATGGCTAATATTTCATTCTTGGCTGTATTATCTCACCAACAAATA
GGTGCTACAGACACAGTAGCCATTGATTTCATTGATAAGGTTCTGGGTGT
GAAAACATCTTACCTAATGATGGTACTTGTTGCATTATCAGCTTTTGGCA
ATCTTAATGGTAGCTTCTTTACTGCTCCTAGAACAACAATGTCTGCTGGA
CGTGAGGGACATATGCCTTTCATTTTTTCGTTGCTTTATCATAAAAATGA
ACAGCCTATACCAGCTTCTGTATTACTCATGGTCGTTTCTTCTTTGATGT
TACTTCCTGAAACAAGCAACCTTAACACATTGATTCTACTCTTCAGTCAA
GCTCAATGGATCCTTTACACAGCTTCTACAATCGGTGTGATCATTTTACG
ATACCGTAGACCAGATATTGACAGACCATTCAAAGTTTTTCTCGGAATTC
CTGTATTTTTCTCAATCATTGGTGTTTATCTAGTGATCATACCATTCTTT
CGTTATTTTTGGCTGTCTATTGGAATGTTTGGTTTTATTGCTCTTGGAAT
GCCAATCTACTTATTATGTGTCAAGTACTTACCTTCATGTTGTTCAAACT
TCATGGAGATATGTAATATGAAATTTCAAGTCTACTTTGGTTTTGTCCCA
TGCTCTAAGGAAACTTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000221_pilon | genome | sc0000221_pilon:434964..436472 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1-1509:1510 |
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