XLOC_017278 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_017278
Unique NameXLOC_017278
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000272_pilon:368670..384314-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_017278 ID=XLOC_017278|Name=XLOC_017278|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=15645bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000272_pilon:368670..384314- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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TTAAAAAACCGTCAGAAAACCATCGCGCTCTTAAAAATAGGAATCTTCTT AGGTAACTACTTTCGGGTACATAATAGCGAGCTTAAGCAGCGGCGGCGGT GAGTAGAGGGAGGCGGTCGTAATTGAACACCGCCTTCAAACAACCACCCT CGTCCAAAATATGTTAAGCTTCGAAACATGGCAGAGCTTAAAAGAGGCGC GAAAAAACATAAACAAATATGGCAGAGTTCAATATTCGATTCACATCATA ACCATAATGCCAAGTTTTAGAGAGATTAGAGAAGCTCTTTTATTTGGTTA CTATGATAATATTTTAGATGATCAAGAATTTTTGTTGTTGTATGACTTAC ATAGATCAAGAAACCCAGATTTTCCATACTGGAGACATGCTGAATTTGAC TTGGATAAGCTAAATGAAGATGAATGTATTGCTAACTTCAGGTTCAAGAA AAATGACATTTATATTTTGAAAGAACTTTTTCAAATACCAGATGAAGTAG TTTGCTATAACAGATCAAAACTCGATGGTATTGAAGCGTTGTGTATTTTT TTGGGACGATATGCATATCCAGTAAGATATGGATCCATGATACCAATTTT TGGAAGGTCAGTTCCTGAGTTGTGCATGACTAATTATAACATTTTAAACC ATATTCATAATAACTATGGCAGACTTTTATCAGGATTTAATCATCCATGG ATGTCTCCTGCATCTCTTGAAGAGTATGCTCATGTCATCCATAATAAAGG TGGTGCTTTAGATTTTTGTTGGGGTTTTGTTGATGGTACGGTGAGACCAG TTAGTCGACCTGGACAAAATCAAAGAATTCTCTATAATGGACATAAACGT GTTCACAGCATTAAATTTCAAAGTGTCGTTATCCCAAATGGACTTATAGC AAATTTATTTGGACCAGTGGAAGGGAAGAGACATGATGCAGCTATGCTGG 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ACGTTCAAATTTTAGAACAACTGAAGTAAATGTCAACAATAAAGAATAAT TTCAACGCCAAGAAATTCCATTACAAAACCAACAATACAGTAATCTATTG GTTTTTTGTGTCTCTAGCCATCAATAATTGGAGCATTGTCTGATTTTGTC TTTGCTGCTGATCTAACAATTTTTGCAAGTTTTCTTCACGTTTCGCAGCA ATCTCAAGTTCTTTCTCCCTCAAAGTTTTATCTATATTCATTTTCTCTCT CATAAAACACAACGTATCATCTCCTGATCTTCTTGTTCGTTTCGTTTTTG AATTTGATTCCATTGCTGGTTCATCGCCTTTTCTTTTGGTCGTCTCTGAG TGAGTCTCAATGCATTGCCTTCGCATTTCAGTTGCAGTTTCGCGTTCTTT TTCTGCTGCCTGATTATTCTCTTCACGTTCTTTTAGTGTTAAAAGCTCAA TTTCTTCGAATTTTGATACAATGTCTTCCATTGCAACCTCAAAATCAGTT GGTTCTTCTGGAGCTATTCCAGTTGCTTTTTCCTCATCTGCTTTTTTGCG CTTGAAATTTTTTTCCATCAATCCATATCGTTCTCGTACAGCACGGTGAT TAACTGTAAACTTTGGGTCATCTAAAGTATTTAAAGTCTCTACAATCAAC TTCCACGACTCACCTCGCTGTGTGGTGCCACTCTTGTGATTGTAAGGTTC ATATGCATATATTTCTCGTATCAGAATCTCCTCGTGTTGGTGAGTCCAGA TCATGGGAGACCTAAGAATAGAATAAACCAGCCGAGGCTGGAAGGTCAGC CAATAGAGCTTAACTAGATAGCTTTAATAAGTGGGTTAACAGATGTAAGA GATGTACTGAAACAGAGTAGACTAATAATGTTGAATAGTAATGTACAAAA TGTGAAACATTTGATAACTTGATTTTTAAAATTATTTAAAACAAGCCTGA 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ATCGCCATTTATTCCATTCCATAATTCAGTCAAAACGTGCGCCAAGGTTA GAAAAGGTTAGAAAAACACAATCTGCGTCCGGAGCTGCGTGAAAAATAGT TTGATCAATTTCAACAAGAACTGTTTATATTAATATTAATATAATTGATC AAATTCCAAAGACCATTTGTCATAATTTTGCAAGTCCAATAATAGGAGAT GTGATGTCATCATTTGGTTCCCGTCATCTGACCGACCCTGATTTACGGTC AGGTAGAGTTGGAGAGTCGGAAAGCTTTTCGGCTGCTTTGCTGGATTTCC ACTGTCGACCTCTGCACGCTCTGTGTTTACAAGTTTTCAAATCGAAGTAG CGAGCCGCATGCTAATGGAGTAAACCGAAAACAAGTTTATCCACGGTTTC TCAATTTCTTAATTCGGATCAGTTCACACGGATTCCCTTTCAACAAGATG TAGCTGCTTCTTAAAAGAAAAATATTTTTGACCGACCGACCGAATGACCA CCACTTTTTAAAGTAGAAATGACGGGAGCCAAACAATTTTTTGCGATTCG CCTTATCAAACACGTCCAAACCAAGTCCAAAAAAGCACGATTGCATCCAG TCTTTATCAAATTTAGACAGTAGCTGTACTTTTGTAAACTTTATCAAATT CCAATAACATTATAACACCATCAATCCCACCTAGAGGCAAACAAGAAAAA TATGTTTTTATTGCAAAAACTAATAAAAAAAAAGCAGCAATAAAAAGTAT CAGAAAATTCAACATAAAAAAAAACTTGAGCAAAAGGCTTCAAACCTTCA AAAGATGTAGAAAAAGAATCCCCTTGATGAAAATCATGTGTTTGATTTGC CGAGTTAAAAAAATAAATGACAGAAATTGAAGCTTGCAACAGATTTACAC TGGAAATACTTTGGCACAACACCTATCACATCTGACTTACCGCTTGAGCC 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GAGCCTTTTGGACTCGCACACAATAACTTGATGTATGCTAAAGGCCAAGA AATCTATTTGCTCACTCATAGGATCAGCATTGGAGAAATCACTTTCGATT GGTCAAGATGGTGATCTGTTTGAAGAATGGCTGGAATTGCGCAATGGTTG TTTGTGCTGCTCTGTAAAAGACAATGGAATCAAAGCCATCGAAAACCTGA TGACGAAACGAGGCAAATTTGACTATATCCTCTTAGAGACAACTGGACTC GCTAACCCAGGTAATGTTTAAAATTGGCTCAATTAATTGATATTAAAGTA TAATATCATTTAGTTAATGCTAGCTCCTGAAAATGTAGATTAGGACTGTT TTGTTCAGAGTTGAAAAAAAAAAACAGGAATGTTACAGTAAACTGTGTTA AAATAGAAAATTGTGGTTATTGCTATTGGACATCTAGGTTGGAAATATAG AAAAAGGAAATTATTTTGTTGAAGAAATGTTTTCATTTGTAAAGGAAATT CTGAATTCCTTGGACTGCGAAGGTGAAAAAAAAATCAAATAAAGCGAAAA AACATTTTTTTTGAAAATTGTTGATTTGAATTTAAGCTTTTCAATTCTTT TTTAATGATGACCTCTCTAAGGACCTCTATCTAAGAGAGGAAGATACTGA AACGCATTGTAGGGCATCATTCCAATTAGCAAAAATGTCAAATGTATGTT TTGATATTACAGATATTCTTTCCAAAAATCTTATATGAATTTCGTCGTGT GACATTATAAGACCAAGTAATGCTCTATCTCTGTTTTGGCTTCTGGGCCT ACTATTCCAGGGTTTTAACTTTTGACGACACCACCAGTATTTCTTCTACA AATCAATGGTGTGCCCGTCTCAAGAAAATCTCAGCAAGTTTATTATGAAA AGTTATACAGATAGTACCAGAAGGTATAATGAAAGAGACGGATTTTTGAC 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000272_pilon:368670..384314-

>XLOC_017278 ID=XLOC_017278|Name=XLOC_017278|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1512bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000272_pilon:368670..384314- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCGGACTCTGACAGCGACGAGGACGTCCCAATTCTCGTTGACACACG
TGTCGAGGAAAATGAAGAAGAAAAGGAGCATTCAAAAGTTCCTGTCACTA
TCCTTACTGGTTTTTTAGGTGCTGGAAAAACAAGTTTACTGAATTATATT
TTAAACTTCCAGCAAGAGAAGAAGATAGCCGTGATTTTGAATGAGTTTGG
AGAAGATGGCGGACTCTGACAGCGACGAGGACGTCCCAATTCTCGTTGAC
ACACGTGTCGAGGAAAATGAAGAAGAAAAGGAGCATTCAAAAGTTCCTGT
CACTATCCTTACTGGTTTTTTAGGTGCTGGAAAAACAAGTTTACTGAATT
ATATTTTAAACTTCCAGCAAGAGAAGAAGATAGCCGTGATTTTGAATGAG
TTTGGAGAAGGATCAGCATTGGAGAAATCACTTTCGATTGGTCAAGATGG
TGATCTGTTTGAAGAATGGCTGGAATTGCGCAATGGTTGTTTGTGCTGCT
CTGTAAAAGACAATGGAATCAAAGCCATCGAAAACCTGATGACGAAACGA
GGCAAATTTGACTATATCCTCTTAGAGACAACTGGACTCGCTAACCCAGG
ATCAGCATTGGAGAAATCACTTTCGATTGGTCAAGATGGTGATCTGTTTG
AAGAATGGCTGGAATTGCGCAATGGTTGTTTGTGCTGCTCTGTAAAAGAC
AATGGAATCAAAGCCATCGAAAACCTGATGACGAAACGAGGCAAATTTGA
CTATATCCTCTTAGAGACAACTGGACTCGCTAACCCAGCGCCAATTGCTT
CGAGTTTTTGGTTGGACGACGCTCTTTGCAGTGACCTGTACCTTGACGGG
ATCATCACAGTGGTAGACAGCAAGTTCTGTGCCAAACAGATCACCAACGA
GAATAAAGAAGCGTCCACAAATTACGAGTTCTGCAACCAAATCGCATTGG
CTGATGTTATCCTCCTAAACAAAATAGACTTGATTAATGACAATGTGATT
GAGGATAGTTTGAAGCGTGTCAAAGGGATAAACGCCACAGCTAAAATACA
CAAAACCTCGTATGGGAAGGTAGACTTGAATGAGATTTTAGATTTGCATG
CTTACGACACAGGTAAAGTGAATTTCGAACGTGTTTTAGAAGTGACTGAG
CGCCAATTGCTTCGAGTTTTTGGTTGGACGACGCTCTTTGCAGTGACCTG
TACCTTGACGGGATCATCACAGTGGTAGACAGCAAGTTCTGTGCCAAACA
GATCACCAACGAGAATAAAGAAGCGTCCACAAATTACGAGTTCTGCAACC
AAATCGCATTGGCTGATGTTATCCTCCTAAACAAAATAGACTTGATTAAT
GACAATGTGATTGAGGATAGTTTGAAGCGTGTCAAAGGGATAAACGCCAC
AGCTAAAATACACAAAACCTCGTATGGGAAGGTAGACTTGAATGAGATTT
TAGATTTGCATGCTTACGACACAGGTAAAGTGAATTTCGAACGTGTTTTA
GAAGTGACTGAG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_017278XLOC_017278-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000272_pilongenomesc0000272_pilon:368670..384314 -
Properties
Property NameValue
Aaloc397-756:361
Aaloc208-393:1323
Aaloc1-204:15646