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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000515_pilon:7753..15044+ Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_017058 ID=XLOC_017058|Name=XLOC_017058|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7292bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000515_pilon:7753..15044+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGATGTTTTTCTTGtctttgttgatttttcatTCGATTTTATTAATTGA
AGCCTCTGGTCAAAAACAGAACACTAAttgtttgaaaacaagaaatgtGA
CCATAATTCTTGACTTCACCTTATTCGGATTCATCACAAAATATCGGTAC
GATATTGATCACTACGACCCGACCTACTTATACCAGCTTTCCTCACAGTT
GCTGCGAATACCATGTACAGATGTTTGGATGTATTCACGCCTCAGAAAAA
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ATGGCTGCAATGACAGAAATCGAGACAAGTGATTTTCTTGCATTTATATC
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ATGACAAGAGATAGTTCACGTTTACGAATGTTCACGACCATTCGGAGATC
ATTTCGATGGTATTTCAATGCTTTGGATTTGAACGGGTTGGTTACCTCTT
GGGCTTGGGCAGGCTGGTCATATGTGCCGAATGTGATGGTATCCATTTCA
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CATTGATTATGCGATAATAAATTCACCTGTTCTGGCAGAAAAAGGACATG
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ATCGATCAAATGAATATTGCTTTATGtggggaaaattgattttatgtAAA
ACTTTCTGTCACTTATTCGATGTCAAATTCATCTGTTTTGAAAGAGAAAA
GACATTATGAGACTGTTTATCTAACGAGGAGAACATAATTTATGGTTTGG
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GAATGTTGCTTTATGTGGGGAAAATTGATTTCTGTAAAACTTTCTGTTAT
TTATTCGATGTCAAATTCATCTGTTTTGAAAGAGAAAAGACATTATGAGA
CTGTTTATCTAACGAGGAGAACATATTTATGGTTTGAAAGAAGATTTGTT
TGATTCTTTGTTTTTTCGAATGATGGTCGATCAAATGAATATTGCTTTAT
GTGGGGAAAATTGATTTATGTAAAACTTTCTGTTATTTATTCGATGTCAA
ATTCACCTGTTTTGAAAGAGGAAAGACATTATGAGACTGTTTATCTAACG
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TTCGAATGATGGTCGATCAAATGAATATTGCTTTATGTGGGGAAAATTGA
TTTATGTAAAACTTTCTGTCATTGATTCGATGTCaaatttatggaaaatt
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tataagaacatgaagcttattttttggtaaaaacctaagaacaaaatTAA
GTAAGAACATCCCAGCCATAGATTTCAGAAATGGCTaaaaaaaGTTGACT
TTCCTTTTGCCTAGAAATTCGAGAAAACCAACTGAACTCGTGTTACCATT
AGGAAAAGCATGTTTTCGAATCTTCACTGAGTTTTTTGTActgtaaacaa
tagaattttaaacCCCCTGGACCTGTCACAATTGAGGCTTTTTCCATCTC
CATTGGCATTTAGCCAATCTTCCATTTGATCCAAACTGTGTCAAGAATTC
TAACGATTCATTGAGATAGAGGTCGGAAATTGAAATCAGCCCAGCGTTGT
CatttagatttaattttgattttaaaagttgatttaattttttgtaaCAG
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tgattttaaaagctgatttcattttttgtaacagCCCAGCGTTGTCATTT
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GTTGGGTCTTAATTCATGCTTTCctattaaaatcatttttctagTCTGTA
CAATAAATAGCTCCCCGGCTTTTATAGGTTTTACGCTCGAGAGAAACGCT
AGCTTTTttatatacagtatatggcccccaaaacggagacggccctcaaa
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tctagctcttTGGATAGTGAagataagttatgaaaatgggatataggaaa
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tttccaaactatggtcaaaattttgtattcatatcttaaagatattttga
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GGGAAATAAAGATGTTAtatagagatgttaaagtttttcatgcagcaaaa
atttttgtaaaacctcttttcctctcgatttgagaaaaactttaaatttg
atcgacgttttgggggccacatactgtaaaaagtttaaaattatttCCCC
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TATAATAACAGCTTAAACTCTATTATTGTTACAGACTTAACATAAACATG
CAATAcacttcaaaatggaaacacAAACACAAAAAGGTGATTTGACCCTA
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ACATGTGTGAAAGTAGGATCAGATTGCATGCTGAGGTTGTGATGGTTTCA
GCTCATCCATGACATTCTGTGGTAGCATTAGTATGTGAAAATTACACACA
ACTAGTCTGCCATCTTTTTGTCATCAATTACGTGAAAATCATACATAACT
GGGTCTGGTACTGGGAACATCAAGAAGCTAATCTTCATTACATACAAGAA
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AGGTGGGGATGAGCCAGTAGGGATGAAGATAACGGACTCAAACTCGATAG
GGAttaatattcccatatttttcatggctggggatttcaattcttttgtt
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ctgtggggacaaaaattgaaggctaattttccactggggacgatattttg
gccaatttttccagtgtgtctgtgagaagggggtgtttatttggTCTCTG
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TACTTAGCTAAACCAATACTTGACCACcgctctcaaaaaaaaaattattg
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CCGCCAttttctcgatcgggaagatacgttcgattttcaaggggaataga
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TCATAATGTTCTAAAGTCTCATAATGTTCtaaagtttgttctttaaaaaa
aacgtgttttcaaaaacattacaaAAGACTAAGAAGAAAATGCCATCtgg
atactctcgggtacctaatagccgtccccccccccgctaattaatttttc
aaaaaatttccacccaggacatttttattccaaacccccccccgcttatt
aagctttgagattttttccatccccccccccgcttattccaatcccccgg
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tatggattttttatcttttatttcttttatattgacattttagttgctaa
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TGAACAAGGTTTTCAAGAATAAATAATACGCGACTCTTGAAATCTCTTTG
ACGGTCATATTGAATCTTTTATGCCTTTAATTGTTTTCGGTTtggttgat
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aataattcttacagcattcttactGTTCTTAGGGACTTCTtaagttagga
tcctaattcagacttgatttaacatttagtacatgcGTCTCAAGCATAAA
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TCTAAATAAAACAGACTTTCCCCGAATCTTGCTCCAATCAAAACCTGAAA
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CTCATTGGTTACAGTTACGACCCGACCTACTTATACCAGCTTTCCTCACA
GTTACTGCGAATACCATGTACAGATGTTTGGATGTATTCACACCTTAGAA
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GAAATAGCTACGTTGACAAGTATCGAGATTAGTGATTTTCTTGCATTTAT
ATCAAGACTTCATTCAGGCAATGGGGCTATCAAACAAACTATCGTTTATC
TACACTACGACTTACTTGTGATGGCAGGCACTTATCGTGAGAGTATAAAT
GACGAGGAAAAGAGAGCAAATGCATTAGAAGAACTGCAGAATGAAAAACA
TTATAACATTATATTACATTGTAATGGAAAACGTACTCCTTACAGTACTA
TATCTCAAAGCTATTTTTGCTCACTTTTAAAAGCCTTTGTgccaaaacaa
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GTTTTAAACATCAGTGTTTGAATGATAATACcacattaaaaataattttt
acttcGAGAGATGTCTATACTGACACGATAATTAACCTTTTCACTAACGT
TGTGAACTCACTGCAATGGTGTTTCAATGCTGCTTTGGATTTGAACGGGT
TGATCACCACTTGGACAGACTGGTATGGTAATAATGTGTTGGTATCCATT
TCAAAAGCAAGTGCTCAGCGAATTATCACTTATAAGAGTGTCAGACTTTC
GGTCgctgattttgagataaaaaaatcaCCTGTTTTGAAAGAGGAAGGAC
ACGTTATGGTTTTTATAGAAGATTTGTATAATCCTTTGTTTTTTCGAATG
TTGATCGATCAAATGAATGTTGCTTTATGTGGGGAAAAATGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000515_pilon:7753..15044+ >XLOC_017058 ID=XLOC_017058|Name=XLOC_017058|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2166bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000515_pilon:7753..15044+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGATGTTTTTCTTGtctttgttgatttttcatTCGATTTTATTAATTGA
AGCCTCTGGTCAAAAACAGAACACTAAttgtttgaaaacaagaaatgtGA
CCATAATTCTTGACTTCACCTTATTCGGATTCATCACAAAATATCGGTAC
GATATTGATCACTACGACCCGACCTACTTATACCAGCTTTCCTCACAGTT
GCTGCGAATACCATGTACAGATGTTTGGATGTATTCACGCCTCAGAAAAA
GATCGATTCAACTCAAAGAGAATGACCTTGTGTTAGATTTGGAAAATGAA
ATGGCTGCAATGACAGAAATCGAGACAAGTGATTTTCTTGCATTTATATC
AAGACTTCATTCAGGCAATGGGGCTATCAAACAAACTATCGTATATCTGC
ACTACAACTTCTATAAGACAAGATATTATTTTGATAGTAAAGATGACGAG
AAAAAGAGAGCAAATGCATTAGAAGAACtgcaaaatgaaaaacattacaa
GATTTTAATACATTGTAATGGGTTACATAATCCTGACAGTATATCTGAAA
GATGATGTTTTTCTTGtctttgttgatttttcatTCGATTTTATTAATTG
AAGCCTCTGGTCAAAAACAGAACACTAAttgtttgaaaacaagaaatgtG
ACCATAATTCTTGACTTCACCTTATTCGGATTCATCACAAAATATCGGTA
CGATATTGATCACTACGACCCGACCTACTTATACCAGCTTTCCTCACAGT
TGCTGCGAATACCATGTACAGATGTTTGGATGTATTCACGCCTCAGAAAA
AGATCGATTCAACTCAAAGAGAATGACCTTGTGTTAGATTTGGAAAATGA
AATGGCTGCAATGACAGAAATCGAGACAAGTGATTTTCTTGCATTTATAT
CAAGACTTCATTCAGGCAATGGGGCTATCAAACAAACTATCGTATATCTG
CACTACAACTTCTATAAGACAAGATATTATTTTGATAGTAAAGATGACGA
GAAAAAGAGAGCAAATGCATTAGAAGAACtgcaaaatgaaaaacattaca
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AGCTATTTTTGCTCACTTTTAAAAGCCTTTGTgccaaaacaacaattttt
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AGATGTCTATACTGACACGATAATTAACCTTTTCACTAACGTTGTGAACT
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ACTTGGACAGACTGGTATGGTAATAATGTGTTGGTATCCATTTCAAAAGC
AAGTGCTCAGCGAATTATCACTTATAAGAGTGTCAGACTTTCGGTCgctg
attttgagataaaaaaatcaCCTGTTTTGAAAGAGGAAGGACACGTTATG
GTTTTTATAGAAGATTTGTATAATCCTTTGTTTTTTCGAATGTTGATCGA
TCAAATGAATGTTGCTTTATGTGGGGAAAAATGACTATTTTTGCTCACTT
TTAAAAGCCTTTGTgccaaaacaacaatttttacaCGCAAGGCTACTTTC
AAATAAATACCTAATGAAAGTCATGCTAGATTTGGTGAAAAATGTAAACT
ATAAAGAGATCGAATATTTCGGTCGTTTTAAACATCAGTGTTTGAATGAT
AATACcacattaaaaataatttttacttcGAGAGATGTCTATACTGACAC
GATAATTAACCTTTTCACTAACGTTGTGAACTCACTGCAATGGTGTTTCA
ATGCTGCTTTGGATTTGAACGGGTTGATCACCACTTGGACAGACTGGTAT
GGTAATAATGTGTTGGTATCCATTTCAAAAGCAAGTGCTCAGCGAATTAT
CACTTATAAGAGTGTCAGACTTTCGGTCgctgattttgagataaaaaaat
caCCTGTTTTGAAAGAGGAAGGACACGTTATGGTTTTTATAGAAGATTTG
TATAATCCTTTGTTTTTTCGAATGTTGATCGATCAAATGAATGTTGCTTT
ATGTGGGGAAAAATGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000515_pilon | genome | sc0000515_pilon:7753..15044 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 829-1089:7032 |
| Aaloc | 772-828:6972 |
| Aaloc | 553-762:6762 |
| Aaloc | 1-549:1 |
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