XLOC_016963 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_016963
Unique NameXLOC_016963
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000023_pilon:1993065..2007373+

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_016963 ID=XLOC_016963|Name=XLOC_016963|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=14309bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000023_pilon:1993065..2007373+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CCTTTACAGAAAAAGAGGTGTAAAAAGTTTGTGCCACAAAAATTTAATGC CGAAAATGCTTGTCGCACACCGGCGTTATCGGAACTACGGAATGGCCCGA TTCTAAACCGGACAGCACCATGCACATGCACACGGCCATTTTTCTCCTCC TCCAAAATGCCAAGATGTCGCAAGAGGCAAATAACCTTTGCCCAGAAACT CTGAAACAGATCACACAAGTATTGAACATTAAACGTATTTCCAATGATTG TATAAAGGTATAATATTTCATTGATCTTTGACCATTACTCCCTTTACTTT TATACGCTCTGGCGTTACGGATaagttatttatttattgatttatttatt tatttatttgttgacATCGGCTTGCTGGATTCGtttttttGGTTCCTATG CTGCCATGTGCtttttacatgatttttttttatgatttacaTTTAGGTAT ATCTTTAACTTGATTACAGGCTGGCCCATGCCTTTATTTCCAATGTGAAA GGGTCAAAGGTAAAAAGGAGGAGCTTCATAAAACACCCTAAGGAAGTTAT TTCTATTCCtttttttGcagaaatgttttgatttttctgcccgggggggg gggtacacttacagtcagggaaatccctcaattgcggtagtaatttctta ctgcaattgcggtataaacgtcacttttaaatttttcatataccgcaatt gcagtatattcaagaaacagaattcaagattcaaggagaaaacaggcaat ttttgtacataattgatcatatctttttaacgcacagacaaaatattttt tccgtagatcagattcttttaataaagaaaagctatcttctcgtacgatt ttttacagtcgatgtttgtttatctttgtcgaccagcactatatgtagct gttataagcctttgtaggctaatcacgaatgaaaactaccgcaattgcat tataccgcaattgagggatttccctgactgacttaggcaaatggagggta cggtatgtgatTGTGTGACggtttggatttccaaagtcctgcAGAAGggt tataaaaatcaaaaaatcaaatttcagtcccactaagggtaggaaaaatg ggaaaatttaaactttttaccccccagagccagaaagatcgaaatttagt caaaattggtcaaatttgtcccggtagGGTAAGGGTtgtaaatttcacaa aattttccttcgttttctcctttttagtcctggtaagggtccgagggttg AAAGTTGGGTGGCACCctcgtcagctcgcaaccctagtacccccccccgg gtttttcTGCCTCCTCCTATACTTCTACTTCAGTATACTtcagtttgatt tgatgatattcatCTGTCCAGCTCGTTGAGCCCAACACGTATTATTTGAT CGACAAGAGCATTTGATTCAGCCAATCTTGTTTGTCGCGACGTAGTGTGA GGTTCGTCGGGTATAGAGCACAGATATTTATCGAGTCGTTTCTTGAAGGA ATCTTTTGAACAGCCAGTGATATTTCGTATGTCAGAGGGAATACTGTTGA AGAGTTTTGGACCCTGTACAGCTAAGCTCTCGCAAATAAATTTGCGAAAG CTACTTCGTTCGATTGTTCGTAGTTTGCATTTTCGACCATGACGGCTTGT AGTTGAAGACGAGACACCACCTTTTACAGTGCCATCTCTCagtgtggctg aaatttggtactatACCCTCTAGTATCGACCAAATATAAATAATTCTGTA TCTCTCTCTCCTCCTTTGTAGAGAatacattttcaacattttcaattgtT CCCAATAATCGAAAGCGCTAAGTAAGgcctttgattttattgaagaagtt CTTTTGTACTGATTCAATCTGTTCAATTTGGTGGATGCTGTTTGGTGACC AAAGCTGAGAACAGTAGTCGAGGTGAGGGAGAACTAAGGATTTCCACAAC GTTATCATAACATCACTGCTTCTGTTGTTGAATGTTCTCAAAATCCAACT AGAAATGTCCTTAGCTTTTGCTATCATTTTATTGATGTGATCAGTGAATG AGCAGTCACTACTCATCCACACTCCAAGATCTTTGAcagagtttttgttt tcaattatagTTTTGTTATTAGTGAAATAGgttgataaactttttgattc agTATCTTTACCGTATTTCAAGTGTTCGAATTTACAACTATTTAGTTTCA TGTTATTGTTCTCAGTCCAATCATAAACTATGTTGAGATCATGTTGCAAC TTGAACGTGTCAATTATTCCTTGGATTTCTTTAAGCATTCTAGTATCGTC AGCAAAGCTTGCAAGGATTGAATACCTGATATTATCATCAATATCAGAAA TCATCAGAAGAAACAAAATTGGCCCAAGTACTGTTCCTTGAGGTACTCCT GATATGACAGGGGCACTTTCGGATTTGAAACCATTTACAACAACAGATTG TTTTCTGCCTTTCAAAAACGATTCAATCCATCGCAATAGCTTTCCTTTGA TCCCGAGCTGTGACAATTTGTGTAACAAAATTGCATGATCAACTTTGTCG AATGCCTTACTGAAGTCCAAATAAATTGTGTCGACATTAATACCTCTCTC AAGGTATGATAGTATTGTATCATAATGTTCAAGGAGTTGACTCAAACAAG ATCTACCTTGTCGAAAGCCATGTTGggagtcattaaaaatgttattctcT TCTAGATaattaacaatgttttttcgcACAAGTTTTTTCCTGTGCCATAA ACCAACTTTTTTCTTGGTGGTTCAGAAAGGCAGGTTTAATAAGGAGTTAA TAAGAATGTAAGGGGTCGTTGACAaacgactttccttttttttaacggcc tgaggccgttaaggttcagaccccctccccctacGTCTTAGCGGCCAAAa tcattcttcaaaagtaaatactttcactGGTCCATGGCTGCCATGTTCTT TTGattcgtaatcctcaaagttcttcttttcgcacggaataaacatgtgg ttttgagctgtgacctttcaattttgaaactccaaCCCCCGCAGCAAGTC AGGgcgggatgggtggagcaaggaATCAACTAAGGCAGACGGAAAAATTG CCGACTTTCGTCACGTGACCAGTCATTTTTCTCGTCGAAGCATTAATTGG TGATCGGAAATAATGTGAATGTCGTGTGGTTGCTTTGGTCTTAGCCTTTC TTcacatgtttctactttttggactggtgaaatttgtaagtgagactttc cctttttaaaaacttttttaacggcattgcaGTGACCCCCTCCCACGGCC ACGTCCagaagccgttaaaaaaaaggaaaatcgtttgtcgacggccccta agTGACAACCTTTGGCTTGTGTCAAAAGAGCAAATTTTCTCGTTAAGACC CCCTTGTTTGGACTAAAAACACTCTCGCTTGATAATGTATTTACACCACA AACGTTTTGTCTCTAGAATTGAATGagaaaatttggttggttggtaTTCT GGCTACTGCACGTTCTCAatcggtcattttgtctcattttaagttttcaa gttttatttaatgaattgtcttgggaacttgaacttgattcaggtgactc tcatccttgttgttgcaaatacatcctgaaGATGACTGAtgctttttttt ctgaaagcttgatttccgaGTGTGACTAACGGAAAGTATCAGGTGAAGCG TACACTTGCTAAAAATTCAACACCAagatattgaaaagttttttacaaCT GCTGACCCACCACATAAAGTCAGGTTGATATTTCACATTTCCTTTTGTGA AAATTTGGTTAAATAATATCGATCAATTTGATTTGAGTATGTTTCAAATG AGTGAGgaaaaatatattgattttGATTATCAATTGATAATATATATCCA ATAAGAATAATTGATTTAACTATTTTTATAGGATGATAAGAGGTATTATT GTTTGGAATGGGAGCCTTCTTGGATTGCtgagaaatttgtcaaaatattg aaacCATTATTAGTGGAAGAATATGAAAAGAAAGACAAGCCAAAGGTaag ttattttttcaatttattaaaattagaatGTTGCTCCTGACATCACCAGG GTAAAAATActattggtattattggtaaaTTGTTGCCTGCCTGGAAGATT GTCACAAAAGTAGTATGAATCTGCCATTAGCAGAATAGAAAAGTGTCTTT TtgcagaatgttagtgagataCAGTGATAGACTTATCCAGATGGTGAGTg aatgtataccgagtttatcgttctacatctgcaatttgagctttactaag ctcatttgacgtcaattgatACTTGGATTATCAGTCGGATTGAAAGAGAA TGACATGcaagtgaaggtagagagtctatcaccatatttccctaacactg tatctcactaacattctgccaattggtagtgtgaaggtttcgatcacaga ctttcaccgcaatggactgtgttcgaatcccaagctcttccaggcagggt gttagggaaatatggttaGAAGTAGATTCGAATTCCAAACCAATCATTTA TTACGTTATGTTTTCAAGTTGTAGGTTTCTAAAAACCATAATctttttac ctctaccattttttactattttgcttccttcacttatgttcttctttctt cattttcgaaatcTCTTTGAATGAAGTACACGAAATAGATTTGATTCATC TGCTACCTTGCTGATGTAAATAATCTTTTAATAAATAATCGAAATTCCTT GATTCTGCCCGCGTAAACCAGACTGTTAGCAATCGAGTtactaatattca acaaataaaaataaaacgaaaTTTGCCAGGCTAGTTTTAGTCGGTTCTTC ATCAGCCCTGGATTTATCCATAATATTGTGCTCataacaaaagagaaaat tgCAGGAAGCAACATAATACCAGAATAAACTTTAACCGTCAACCATATTA ATTTGTcagtctttttgttttgaatttgttgaTCATTTCCAAGGTTCAAA GAGTCACGTTGTTTGATGAGTCTCgatgttttgtatgtcaaaagAAAGAG GATGAGAAGCGGTATAACAACTAGAAAAGTGTTCGATAGAAAAATATCCC ATCCTaggtttttcagaaaatcttcAGGGACAGctgtttttctgaaaatg cctATCTTTCCCATAATACTACAGCTATCATCAACCATCGTCTTTGAGCT TTCAATGATAAAACTGATTGGTAATGGAAGCAAGACACATAATAAACATC CCAGATAGATGATTCTTTTCTTTGGTCGTGGTTGAAAAGGGTTGGCTAAT TGATAGTATCTTAATCCGACCATAAAACAGAGAATATTGCCAGAAGCAAT TGATAGACACAACCCAATATTGGTAGCATGATTGCAAAGAAATTCACCAA GATACCATTTTAGACCTGGATATATTTGTAATTTGAAAGGTATACCATAA AAGACAGTGTTATAAATGGTGGATAAAAGATCACTTGCTGCTAATGCTAT GATCAATATTCGATAgtttggttttgttgttttgtctttaaatttgaaaa ataagatgaTGAGTGTGTTCCCAGTGACgccgaagatgaaaaataaaccG AATAGGATTAGTGCGATTAAAGCGTTTATCTCCCCCATCGATGTTTATAA AATTCTTAGAGTGCGACGAGTGTTCTTTTCACTTAAATTACCACTGCCCT ATCAATTTTTTGTCTCATTTTCAACCTTCTCTTGTTACATATATAAATTA TTGACCTCAAGAAAGtactatttttttaataaaaatataatgCTCTCTAT ATAAAACTACACAGTTAATTGGGAAtgtcaataaaaaaaacagttttcat ttcttcaaaaaagtctATCATTGGCTTGATATTAAAAAATCTACTAAATA TTCACTTTGATTaaaaaaaGTActgattattttttagatttactGATATC AACTAAGTGGAGTTTTCATTTTCCTCACaatctcttttttttaatgaaaa aggaCATATTCATTAGAAAGATGATGTGATTTTTCTGATTACATTGGTTT GTTCTTTTGCATAAACGGTGAAAATTGGTTTTTGCTCGAGAACATATTTT TATGATTTAGTCGGACAATCTGAATCCACCAGGATGGTTGATATTACCAA TATTATCGCATTAATCCTattctgtttatttttcatcttcggtGTCACTG GAAACACACTCATTATCATATTCTTCAAATTTaaagacaaaataacaaaa CCAACTTATCGAATCTTGATCATAGCATTAGCAGCAAGTGATCTCTTATC CTCAATTTATAATTCTCTGTTTTATGGAATACCTTTTCAATTAGATTTTG TAGCGCCATGGTACCTTGGTGAAACTTTATGTGAATATTCAGGAGTCATC GGTCAAACTTTATCAGTAACCTCCAGTAATCTACTATGTTTGATGGTTGG CTTACGCTACCGTCAATTAGCCAACTCATTTTCTCAACCTTTAAAGAAAC GTTACATTTATGTAgcatgtttgttttgttttctcatAACACTAGCGATA AGCTTTTCGATTCAAGAACACAAGATAATCAAAGAGGGAGAATGCATCTG GATGTTTGAGAGTCAATCTTACGACAGAGATCGAACAGCTTTATCGATTC TCTTATCCAATATTTTACTGATCATCGTGCcgttatttatcattttattt ttgacgtaTAAAACATCGAAACTTATCAAAAGGCGAGATTCTTTAAACCT TGGTAATGCtcaacaaattcaaaacaaaaagactgATAAGTTGATTTGGT TGACTGTTAAAGTTTATTTCGGTATTGTATTACTGCCGGCAATCTTTTCG CTGGTACTAAGTATCATGTTTTGGTTATCCAATTCTTTCATTGATGAGAA TTTTCAAATTGCATGGGATAtttcgttttatttttatctgtTGACTTTGA GTAACTCGATCGCTAACGGTTTTCTATATGCTGGTCGGGTTAAAGAATTC AGACAGTTTGTTAAACGACTTTGCAAGTGATACTAGCTTGTGATATCATC TTTTCACGTGAATAGGAAGCATCAACTTTCTACTCAGCTCTGTCTTACAG TATTATATCTGACAACTTTAACCACACTTTAACCATGCAATTGCTACTGC ACTGGTCTTCTTGCATTCGACGCATAGCTTACATCAAAACTGTGGgggaa aaaagttgttaaatgACAAAGAACCGTGTATGAAAATCCAAATggctttt gtttttctttttaataccgattaccttaagggaagaaattttggcgaatt tggccgATTTatctgaaatccgccaaattaagttcccgctaaattaaatt ttatcagccatccgccaaattaaattcccgcctaaatttcttcccttaaa gtagTCTTATTTGTATACCACCGTGCTCAtcataaagatgaaaatttctt ttaaactgGTCTTGTAAACTAAGAACAAATATTTTACTTTGAACGCTAAA TGCGGAATGAGTAATTACTTAGGAAATTATTTGTggatacagtggaacct ctaattagtggacaccatcggggaaaggggttagtgtccgctaattagaa gtgtccgccttttagaaacttttgatctcggagctccaattttgaaatta ggccattccagggtgtcgaaaatacataATTGAGGTCTAAAGTaattatc tgcagacactaggccatagaagaacaagagaaaggttattaaaacgcaac aatttagtttttaacaaataaaagaaaatcagtgatttatgatttctttg gcccacctaaattcgttgaatgggtcaagggaaaactgcaaatttgtaga aataatttgagtaataagactaataagtgcttgaaataaaaatatctaaa ttttttttttcgattttggacgtctgtgacccgtttgatattcaatgtcc gctaattggagagctaaaataggggtttcggccatttcgtgcgaaaaaat ttgtccgctaatgagagggtccgctaattaagtgtccgccttttagaaac ttttttatgaggatttgactaggaaacggccggggaaaatgaaattgtcc gctaatcagaggtgtccgccttttagagtgtccgttaattagaggtttta ctgtatatCTCCCAGTAAAAACAAGTAGAAGGTATTAAAAATAGCAACTT CTAAAGTTATATACAGGGTAAAGGTAAACGAATtgagctttgaaaaaaaa aatattatcagGTCGAGTCAATTTTCATGCGTTTATTTTGTTGCGTTTAC GTAGTAAAACTGGTGTCGAATTTACTGATGTTTTATTGTAGCACTTGTAT TTAGAAACTGTATTTGATCTATCAAtccattttcttataaaaagatgaAG ATGTTTTTCTTAGAAATAATAAAAGGACGAGGAAAGTATTTGGTACTACT GTATTACATTCTTTCTATGTCATAAACACACATACTGTTAGTTTGGTTTT GTATACGTGTTTTAgatgagatttttttcataaagaaaGCGTCTCGACTC TGCaaactttgtttcaaaaatgttgtcagaaagtgaatttaattttaaaa ccgATGTCAATTCCGAGATATCGGTAACATTTTCTGTTCTTTCATCATTG GGGATTATTTCCATGATACTTCTAGCTTTTCATTATTCGAGGAAAGAGAA AATCTCATGGTTGAATCCTCAACGTTCAAGCATCATATTTATCTACGTTG GAATGTTAGCGTTGTTGAACACGTTACTTTATGAAGATGGTTACCGATAT GCTAACTTTGCGTCTACTATTTTAATGTTGGTTATTTCCATTGTGGTTAT CATCGCTGGCAGTTTTATGTTTTTCATCGAACCTACAACACCTGTCGAAG AAGAAAAACATGATTCGAATCTGGCACCTTTTATTGTCATCATAACTATC ATTATCATCCTATTAGAGCTTCTTATTGTTATCGGGTCAGCTTTTGATGG AAACTATATGAACTTTTTCCTCTTCATCTCTGGAACTATACAAAAAGCTG TTCAACTGTTCATCTACCATTGTCGGTTGTGTGAGTTTATTCCTAAGAGA GGTCGCTTATATGGTGCATCTTGGTATTACAAAACTATAGCGttaatcaa tttcattttgtgGGTTGAATCAATCGAAGTTACCAAAGATAGACAGACCA TATACATGGAGAAAATCTTGAAAGGTGGTTACAGCATTTTCGCCAAAGCA TACACTGCTTTGATCGTTGACTATCGCCTGATATGTTGCATTTTGTTTGT CGAACATGCTTTTGAAATTGATAAAACAATCAAGTCAGATGAAACTGAAA AGGAAAATCAACTTCGTCAAGATGCTACCACTCAAAGGAAACCCGAAACC GACGAGATCCATCACTCGTCTTTCGAAGAGTACCAAAAGTTCAAAAGCAA AGTCAAACTTTACAAAGGAGCAGGAGTAATATCTGGATTGGGTATTGTCT TTTTACAGACTTTCAATGCTATGGTCTACACTGGGAACAATATGGTTGGC CCATGGACTAACGTTATGGGGTGCGTGGCTGTCTGGTCTTTTTTCCTTGC TGGCATCTTGCTATTAAACAAGGTATTTTTTATTACTAACATACTCAAGA AACACGTTCTTACAAGATCAGCGCATGTTTATTCTTCAGTCTGCCAATCA AATCAAGAGGCCTCAAGAAGACAGTAAACATGTTTATCCATGAATTTCGA GTATCATTGTTAttttttggttgtttggtttttgatgaatttcatttCCG CTTCTAATCGTAACCTTTTTAATCAGTGTTCAAGCTATTCTTCTGGTGAA TTCTCCAAAGTCCCTTTTTGAATAAAACTTAAGTTCCTTACGAACTTCTC CCTCCTGCGTTTTACGATTATTTCCTAACCTCGTGAGATCTATcccactg tttttttttcacttttgaaaaggcgctgattcgtttatttattttgacct tttaatttttttttgcgggttctttatgaaattattttcactGTGGTTAC TGAATTGGAAGTTGTTCAAGGATATAATGACTATAATGACTAAACTTTTT GTCTAGGTTCATCAATCGAAGAAAGATGGTCATGTCGAGGAAAATCAAGA AAACCCTGGTATCGAATACCTGATGATAGCGATGGGCCTGTTCAGTACAA TGTTTTGGGTAGCCAAAACTGTGGCAATTAGTATGTGGGCTTACAGAGCG TATATCTCGGACAGTGAACTATCCTTGTATCTTATCTGGACAACAGTTAA GGATGTACATTTTCCATTCATCCAGATTTTTCAGATATACCTCTTTGTAA CCCTAGATGTGACCTCCACCAGAAAGGGAATATTCAAGAAAGAGTTAATA TCTTATTTCTTGACACCATTCTTAATGCTCGCAGCTCTGGCAATCTTTTT TAATCTGATCATTTGTGAATACACGTTTCATGTTGAGGAGCTTGCCAAAG ATGCTAACTTCACAACAGTGACTCAGATAGTATATGGGACAGGCTCACCA TTGGGTCTGGGTTTCAGTCTACACATTGTGCTCCATTTTTACACCATGTA TTGTCAGATGAAACACTATCAGAATCGCTATCCATCTATTGATAAAGACG ATAATCGAAATCTCGGTGACGGAAACAGACTTGACGAGAATGACGATAAT AAGCCATTAATCGAACAACAAAATGCATgagtttaaatttttaattgatg AACATATTTTCTttacacacatttttttaaaagaatatccaagatttttg aagccttcggagtgtcctaaaaatgttcttaacttgttcttaattttgtc attttgtcagtgtatttttctaagaagtatggtgttttagagtctgcaaa gccttaaaatgttcttaacttgttcataatattttggtcatcgaagcttt atgttcttacatagtttgttcttataaaaagcgttcATTATAACAATGGA CTGTTCAGGACAGCTGCGTGGTAGCAGGGGGGTGGTTCTTCCAGTTCTTC CTTTTTGAGGAGAGGCTTGCATCCCGCTTGCATtcgaaaaccaaaaaaac tcaAAGTTTCACTAGTCAATAttcttcttttgtattttttataatatatg CTATTTCTTGTCAATATCTGATTGtttcttttaaagttttcatATCATTT TTACATATCAAACCAggcttttcttttgttttagggTGTTCGTTTTTGTG CTGAAAAAATACAAATCTGAGGAAGGGGGCAAAACATCCCCCTATGACAC TATGCCGTTAGAACCATTGGCATTATCACAAGGGCCCGGCCCTACAAGCC TGTTTTGTGACTTAaacatttccagaaaaaaattgctaaatcAAATATAT AATATCTTTCGCACCACTCAACCACTCAACTCAAGTCGGGCACAATTTGT GAGAAATCCTgtgaaaattattgaaagtttttttttctctcatcaTTAGA TTGAATTGGTGGCCTGTACTCAGAGTAAGGACGACGAAGGTTATGATTTC TTGGTATTGAAGGTGCCAAAAACATTGGAGACAGGTATTCTATCGAATGG CGATGTTTCCATCAACGGACGACATGGGTTATCTCTGCATCAAGACTTAT GCCAGGTACGGTATGTTTCTCCAATAGATCAAGTTATATTTAGTTGAGAA TGTATTGCAGTaccctttttcaatttttacaaaaataggACTTAACTCAA TATTATGGATTTTTCTATTACGATTTTTAGTTCAGCTGCATACTAATTGA AATTTAGCCTTAATCCTGGGATCATTATTAGAAGATCAGCCCTGAGATGA TTATATGCATATTATTTTTAATCCCCTAACCAAAATTGTAACTTAAGATT CCCttatcacacccctgtctcaatgccccggtggcatgatttcagtacat gatttttttcagtacatggtttcagtacatgattttttcctacgtcactg cagtaatcaaatttttattgcactcatttgtAATCATCCTAAATGGCTTG GGAATTCAAGAACTGTTTTTTATTGTCGCTGTCTTTATTCAATTTATATC TCAATTCacaaatgagtgcaataaaaatttgattactgcagtgacgtagg aaaaaatcatgtactgaaaccatgtactgaaaaaaatcatgtactaaaat catgccaccggggcactgagacaggggtgtcttatcTACAAAGAGAACAT TCCTATTTCAAATGTTTTAGTGacttaacacccctgtgtcacagacgcac tagtgtggtcgtgttacaaaatacaggctgtttgtaggaaaaaaataagc tctagctgaaactttctcctaAAATctcactggtggaacatccctttttt gggcaatttctattttccccaggcaaaatcctaagggcgaaattgtttaa aaatttcaaacttatttccagacaatatcatgtataccatttaaaagctt tcaaaaaactatatagaagacttttaaacggttatagccgatttccttac ctaactcgcaagttccacttttcgccacattttggactaaaattgaccat aaatagcatcttctgcgtgaaatatcttgagttaggtaatgaaatcggct atacccgtttaaaagtttctatatagtttttcgagagctttcgaatggta tacttgataatgtctgaaattgagtttgaaattttcaaaatatttcgccc ttagggttttgcctggggaaaaaagaaatgtcccaaaaaagggatgttcc accggtgggattttaggagattttttccggaggcataaccatcctataga gaaggtctggagaaagtttcagctagatcttatttttttcccgtaaatta tgctaaatgACCCCACttcactgggaccccagcccttCTAGAAAatctga caaaaatttcgttcccggtaggaaaatacACCACTGGGAAATTGTGttat atttcatccccattcgaaattaaatgtttaagaattgcactccaaaacca tccccactggttttttaacctttgaacaatagaataccCCCATTGGGATA TCAATAGGaatctttatccccactgaggaaaaaagttcgaccggggctgt gagacatggGTGTACTGTAACATTCGAGGATTGAAATGACGCATTAATtg tgcttttccagaaaatgtttttacccccactgttgaagATATTGagtttt tcgaagtatcgaaccccctggatatcctacttgattagtttagaccccct ggatatccactcttaaaaatatgttcaaccccctaaatatcgtatttttt gcttgaaaaacccttgatatccgctcccttgtagatatttaaccccttgg atatccacttttgaacaaaaatcgttagccccctggatatccgatatcct caacagactatttctggaaaagcccattctttcatcaaacttttctgttt gttttcagTTGAAAGAGGAAAAACAAGGTGAAAATCACACTGGACAAAAC GataaagatgacgtcatcacattCCCTCCACTAGAAGGTACCAACGAATT CGAAGAATCATTAATCATAGAAACCAGTCCTGCACAAAATACCACGCATC AAACAATACCTGGTTCCCATATAAAAAACGAAGACACTGCAACAAAGTCG TGTAATCTTTACACGGAAAACTTTCACGATTCGATAGGAATAACTACAAG CCAACGAAAAGTAAAATGTACTCCGCGACGCTCGAGACAAGATATTCATC AACTTTTCGACTGTGAATTTTGCGGCGCTCAATTTGTTCACAAAACACAT TTACGAATTCATACTAGATCTCATACGGGCGAAAAACCGCATAAATGCAC ATTTTGCGGTCGTGGTTTCGCGCAAAAAGGGAATTTACGAGTTCACGAGA AAATACATACTGGTGAGAAAGAATATGCTTGTCAGTTCTGCAACAAAAGG TTTATCACCAATGCGCAACTTTTAGTTCATATTAGGACTCATACAAACCC AAACAAAAAACGCCCATTCTCTGTTGGCGGTGGTGGTTATAAAGATGCTG ATACCAGGGACAAAGTAATAAAACAAGGACCTGGAAATTCATCTAACAAA GACAGTGCAGCCATTCTAACTGGCTCAAACAAAAATGCTATTCTTAATTC AGAATTCACAAGTAAAGACAGCATTACAGACAGCATGAATAAACTTTTGG GACAACTCGTGTCTAACGGACAGAACAATAAACGGACACTTAACGAACCG GAAAGTATA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000023_pilon:1993065..2007373+

>XLOC_016963 ID=XLOC_016963|Name=XLOC_016963|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2656bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000023_pilon:1993065..2007373+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CCTTTACAGAAAAAGAGGTGTAAAAAGTTTGTGCCACAAAAATTTAATGC
CGAAAATGCTTGTCGCACACCGGCGTTATCGGAACTACGGAATGGCCCGA
TTCTAAACCGGACAGCACCATGCACATGCACACGGCCATTTTTCTCCTCC
TCCAAAATGCCAAGATGTCGCAAGAGGCAAATAACCTTTGCCCAGAAACT
CTGAAACAGATCACACAAGTATTGAACATTAAACGTATTTCCAATGATTG
TATAAAGCCTTTACAGAAAAAGAGGTGTAAAAAGTTTGTGCCACAAAAAT
TTAATGCCGAAAATGCTTGTCGCACACCGGCGTTATCGGAACTACGGAAT
GGCCCGATTCTAAACCGGACAGCACCATGCACATGCACACGGCCATTTTT
CTCCTCCTCCAAAATGCCAAGATGTCGCAAGAGGCAAATAACCTTTGCCC
AGAAACTCTGAAACAGATCACACAAGTATTGAACATTAAACGTATTTCCA
ATGATTGTATAAAGGATGATAAGAGGTATTATTGTTTGGAATGGGAGCCT
TCTTGGATTGCtgagaaatttgtcaaaatattgaaacCATTATTAGTGGA
AGAATATGAAAAGAAAGACAAGCCAAAGGATGATAAGAGGTATTATTGTT
TGGAATGGGAGCCTTCTTGGATTGCtgagaaatttgtcaaaatattgaaa
cCATTATTAGTGGAAGAATATGAAAAGAAAGACAAGCCAAAGATTGAATT
GGTGGCCTGTACTCAGAGTAAGGACGACGAAGGTTATGATTTCTTGGTAT
TGAAGGTGCCAAAAACATTGGAGACAGGTATTCTATCGAATGGCGATGTT
TCCATCAACGGACGACATGGGTTATCTCTGCATCAAGACTTATGCCAGAT
TGAATTGGTGGCCTGTACTCAGAGTAAGGACGACGAAGGTTATGATTTCT
TGGTATTGAAGGTGCCAAAAACATTGGAGACAGGTATTCTATCGAATGGC
GATGTTTCCATCAACGGACGACATGGGTTATCTCTGCATCAAGACTTATG
CCAGTTGAAAGAGGAAAAACAAGGTGAAAATCACACTGGACAAAACGata
aagatgacgtcatcacattCCCTCCACTAGAAGGTACCAACGAATTCGAA
GAATCATTAATCATAGAAACCAGTCCTGCACAAAATACCACGCATCAAAC
AATACCTGGTTCCCATATAAAAAACGAAGACACTGCAACAAAGTCGTGTA
ATCTTTACACGGAAAACTTTCACGATTCGATAGGAATAACTACAAGCCAA
CGAAAAGTAAAATGTACTCCGCGACGCTCGAGACAAGATATTCATCAACT
TTTCGACTGTGAATTTTGCGGCGCTCAATTTGTTCACAAAACACATTTAC
GAATTCATACTAGATCTCATACGGGCGAAAAACCGCATAAATGCACATTT
TGCGGTCGTGGTTTCGCGCAAAAAGGGAATTTACGAGTTCACGAGAAAAT
ACATACTGGTGAGAAAGAATATGCTTGTCAGTTCTGCAACAAAAGGTTTA
TCACCAATGCGCAACTTTTAGTTCATATTAGGACTCATACAAACCCAAAC
AAAAAACGCCCATTCTCTGTTGGCGGTGGTGGTTATAAAGATGCTGATAC
CAGGGACAAAGTAATAAAACAAGGACCTGGAAATTCATCTAACAAAGACA
GTGCAGCCATTCTAACTGGCTCAAACAAAAATGCTATTCTTAATTCAGAA
TTCACAAGTAAAGACAGCATTACAGACAGCATGAATAAACTTTTGGGACA
ACTCGTGTCTAACGGACAGAACAATAAACGGACACTTAACGAACCGGAAA
GTATATTGAAAGAGGAAAAACAAGGTGAAAATCACACTGGACAAAACGat
aaagatgacgtcatcacattCCCTCCACTAGAAGGTACCAACGAATTCGA
AGAATCATTAATCATAGAAACCAGTCCTGCACAAAATACCACGCATCAAA
CAATACCTGGTTCCCATATAAAAAACGAAGACACTGCAACAAAGTCGTGT
AATCTTTACACGGAAAACTTTCACGATTCGATAGGAATAACTACAAGCCA
ACGAAAAGTAAAATGTACTCCGCGACGCTCGAGACAAGATATTCATCAAC
TTTTCGACTGTGAATTTTGCGGCGCTCAATTTGTTCACAAAACACATTTA
CGAATTCATACTAGATCTCATACGGGCGAAAAACCGCATAAATGCACATT
TTGCGGTCGTGGTTTCGCGCAAAAAGGGAATTTACGAGTTCACGAGAAAA
TACATACTGGTGAGAAAGAATATGCTTGTCAGTTCTGCAACAAAAGGTTT
ATCACCAATGCGCAACTTTTAGTTCATATTAGGACTCATACAAACCCAAA
CAAAAAACGCCCATTCTCTGTTGGCGGTGGTGGTTATAAAGATGCTGATA
CCAGGGACAAAGTAATAAAACAAGGACCTGGAAATTCATCTAACAAAGAC
AGTGCAGCCATTCTAACTGGCTCAAACAAAAATGCTATTCTTAATTCAGA
ATTCACAAGTAAAGACAGCATTACAGACAGCATGAATAAACTTTTGGGAC
AACTCGTGTCTAACGGACAGAACAATAAACGGACACTTAACGAACCGGAA
AGTATA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_016963XLOC_016963-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000023_pilongenomesc0000023_pilon:1993065..2007373 +
Properties
Property NameValue
Aaloc1210-1323:14196
Aaloc718-1209:13692
Aaloc532-714:13509
Aaloc376-531:11500
Aaloc262-375:3932
Aaloc148-261:144
Aaloc133-147:127
Aaloc1-126:1