XLOC_016957 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_016957
Unique NameXLOC_016957
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000023_pilon:1966080..1973286-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_016957 ID=XLOC_016957|Name=XLOC_016957|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7207bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000023_pilon:1966080..1973286- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAGCAAGTTGGACCCTAACTGGGTTTGGGCTTCAGGTGGTCTAGCGGC AGGTTGTATATTAACAGTCTGCGTCAGTAAGATCACTGGCCTCTTCTCCC AAAAAGCCGTAATGGACGATAAAGATGAGATGGATGCTATAAGTAATTTC AACAATCAAGTCACCACCTTCAGTGACATAACAATGTTGGTTGGAACACC TTTCACCAGTGCACATACAATGACCACCTCAGAATATCTGATTTATCCAG CTGAGAAAGGATATCCCAAATTAGAAGGAAACCGGTAAGCTTTTGTTTGG AGATATTTCTATGCTGTTTATTGGTAGGCTTATAGGGGTAATTTATTGCA ATTTTTAGACTCGTCATCGACTATTCATCAGAATTTCGAATGGTTAATCC GGGCGAAGGTTCGAGACCTTGATCTCTCAAAGAATCGATCAAAGTTTTTT CTCGAAAAAGAGTTTTTTCTTCTACGTATTTGAAAAACTCGAGAAACTTG TTAAAATTTATCTACTTAAAGATCTCTTTTTGCTCATTCCTTTTTCATTT TATTTTATCTATTTATTTCAGTACAATCATGGCTCGTTACCTGACACAAC AAGTTTACGAAGATCTCTTCAACTTAAGAACATCATCTGGTTGTGATTTT GACACCTGCATCCAAACTGGTATTGATTGTTCAGAAAAAGTTAGTTGTGG CTTAGTTGCCGGTGACGAAGAATGTTATGATTTATTTTCGGTTGTCTTTG ATCCAGTTATTAGTGATCGGCACCGTGGCTTTGGACGTGGTAATGAAATA ATCGGCCAGGAAATGAATATCAGTGATTTGAAAGGTTTGTAATTTTTTGT ATTCTTGCAAATTTTACTGTGTATGTGTCTTAATATAGCCTAAAGTATAA TCAACATCGCGCTGGGCCTTGAATTAACATTTAGGCTAAAAAAAATCTCT CTCCGGTGTATTTGGTTGAAGCAAATGATACTCGGTCAAATTGCGAACCA CCTTTACGCCGTGAGCAAGTTCAACACAATACGGTCTTATTCCGTTACGT GACTAAAGGAACTCATTCGATTGGATAAAATTGAAACCCTCTAAAACCAA AGGCATTTCTCTATTAAGTTTTGAAATGTAACGGGACCCAATATCGTACT AAGAACTTTGCACATTTTTTGATTTTATTAATGTGGCAATACATTCGTGA GTGTTATCAGAACCATAGAAAAGCCAACTAAGGAACTAAAAACGAGTTCA AAAGGTACAATATATTTCTTTTAGCGAATGTTTTTGACAGACGATACGTG AAATCCATTCATTTCTTGGTGGGCCGTTGCATAAAAGGCTTTCGTTTTCC ACCGACCTGCAGAAGAGCTGAACGCAGACATACTGAGAAACTATTGAAAG ATGTCCTGTTATCTCTGGAAGGTTTGTTTTTTTACATACCTTGCACGTTA AATGATTGGTTATTTTCTTCGAGTCTTCTATTTCTGTTGTGGTGCCATCC TATGATTGACTTGTAAAAGACGGATACAGAATTTATAGTCGAAAAGGGGT TAATATCCATGTTTTGTTCATGATTTTGTCCCTTGTTATAGTTGACCAAT AGTGTCAATACATAACACGGTGGCAATTGGGATGGCAATTTTTGAGGGAT CTGAAAAGGGTTATTATCATCCTAAGCACATGTGATTCGATTTACAAAAG GAGAATGAAATTTCAGTTAGATTTTAATCCCAGTTCCACCGAGGCTTTCC GGGGCTTTCAGTGTCAAGATAAAATTGTAGAAAATAAATAATTTGGAATT ATTTGTTTGGATAGTCGGTTAGAAAGGAATCTTTGACACATTGATGATGT TTCTTTATAGATAATTTTGAAGGTTCCTACCACCACTTAGTCGATCTTTC GCCAGAAGAGCGTTATCAACTACCAGACATCCTACAAAGCGTAACTGATG CTCCTATAAGCAGAACTCTTATCTCTAGTGGCTCGACACGCGATTGGCCG TGCGGACGCGGCGTGTTTTATAGCCAATCATGTGATCTCTTTGCGTGGAC AAACCGTGAGGATCATTTGCGCATTATGTACCGTGATCGTGATATGGACA TTGTTGCTGCATTTAAAAGGTGAGTGTTAGGTTTTATCCTTTACTTTGTT ATCGTGGTACAGTTGACAAATATGAGTTTCTTAGGTGTGATTTCAGGGGA TCCTTACTCGAATAATACGAGTAATTGTAAGATTTTTAGATTCTCTTTCC GATCAAAAGTACTTTTAACGTGGGTCATTGGTAGGTGTTTACTTTTCCAG GTCCGAGTCCGGAAAATGTCGGGCGACTAGGTCGTTTTTAATAAGGTGAA AAAATGTTGTTCTTTCTAAAACCCAATGCATTCTTCTCGACCATGGTAGG CCACAATAAACGTCAAAGTATAGTGGGTTTAGTTTGGATATTTTAACGCT TTTAATCAGAATTTAAAAATAGGAAGAGAAGGACAATTTCAGTATTTCCA CGCATTCTTAGGTTCAGTTGCTAAATTCCATGATGGTGATATTCTTACCA TATTCTTAATTTTTTGGCCATTTTCATCATGGACATTCTTATAAAGTGTA TTCTTATTTAAAAAAAAGCGTGTATTCCAGTCTTGAGCTTTTGGATTCCA AGATCCTAAGGTCTCAGAGATAAAACTCTACATTCTAGAAGTAAGTTAAG CCACTTAAAACCTTTGGTTTTCAAAATTTTTGCTTCAGGTATTCTAATTT CCTTTTCTTTTTTCAGTTTTACCAGAGCTTTAGAAGAAATCAAATCTAAG CTAGGAGATGCAGGTTTAGAATACAGTATCCATAAAGATTATGGTCATTT ACTGACATGCCCAAGCGGGATTGGAACCGCCCTTCGAGCGGGTGTTCATC TTAAATTACCAAACTTAATATGTGTAAGTTAAAGTCTGTCCAGATATAAT TGGCAGTGGAAACAAGAATGCCTGAAACTTTTGATAGTGAAATATGATTA TGGAAATTTTTTTTGCCTGTTTTAGAAAATCAAAAGCGCTATATTTGAAT GTATTTTTGGTTGAAAAATTCGCGATTTTTAGCGGTTAAATTTGCGATTG TAAAAATTGAGCTTTTTTTCTACTTATGCTATAACGTTCATTTTTACACC AGTGGTAGTTCAACCTTAGGTTAAGAAGTTTGTAAAATTTCAAGGCGAAC AGAAAAGTCCTTCGGAAGATATGGGACCCGAAATACCCCTTGGTAGCACT TTTCTGTGAAATATCAAATCTCCAACTTATTACTAAAAACGGGGGTAGTG ATATGATAAAACAGTTTTTCGATCATAGCACATTTTACGATCTCTTTAAT GACCTCATAGCCAAACTGTGTTTAGTGTTTTGGGAATTAGCAAAGTTCTT TAATGACTTAAAAATAACAAAGGCAATATAAGTTCTTGCTTATCTTTTCA ATAAAAACAATTAAAAATACTGTGATTTACTTCGTTTCGAAATAATCAAT GATACCAATAATCGTCAGCCGTGCAAAATTACTCGAATCTGATTGGTTTA GAGGAGTGCGATTAATCGTTAATTGCACTATTACCACTTTTTGCACTCTT CGGCGGGGGGACACTTTTGTCCCCTTATTCTTTTCTCTCCCAAGTCCTGT GTCAGAGACTTTTTTTTACTATATAATAAAAAACAAAGACATTTTTTTTC TTCAATATAAAAAAGAACTAAGAAATCTTACGTTACAATAGCTTCTTTTA ATTGAAAACAAAGAAAAATTACACTGCAATGTTTTCTTCTTAAACAAAAG AAAAAAAGGAGGTTTTCGAATGTTTACAAAAATATAAAAGTTAGAAAAAG ATTCTTTTTCAAAACTATTTACTGACGATTACCTCGGAATCGTATGTTTT GTCGTGCAATTAACGATTAATCACTCGTAACAAAGGAGAAAATACTGTAA TTTGCACTCGTCCTTCGGACTCGTGCAAATTACTATTTTCTCCTTCGTTA CTCGTTTTAATTGCACTGTTCAAAAAAGATAACATAACCCCCGTTTTTAG TAATAAGTTGGAGATTTGATATTTCACAGAAAAGTGCTACCAAGGGGGAT TTCGGGTCCCATATCTTCCGAAGGACTTTTCTGTTTGCCTTGAAATTTTA CAAACTTCTTAACCTAAGGTTGAACTACCACTGGTGTAAAAATGAACGTT ATAGCATAAGTAGAAAAAAAGCTCAATTTTTACAATCGCAAATTTAACCG CTAAAAATCGCGAATTTTTCAACCAAAAATACATTCAAATATAGCGCTTT TGATTTTCTAAAACAGGCAAAAAAAATTTCCATAATCATATTTCACTATC AAAAGTTTCAGGCATTCTTGTTTCCACTGCCAATTATATCTGGACAGACT TTAGTTTGTTGTCAAATTTAGTTCAACTTTGAGTGTGGTTTTTATCCTTT CTCACTGGTAATAAATACACGTTTGTTTTTTTAAGAAACAAACTTTTAAG AAACATGAGGCTCAGAATGTCTAAAAACTAAGAAACATCTAAGAAACATG CTGAGGCCGAGAATGAGAAAATAACATTTTTTAATTCGATTTTTTTAAGA ACCTTCCAATCCAGCCTTTCATAAGGGTTCATAAGGCTGATTATGTCAAA AAGTTTAGAAGCATGTAAAAAACATTAAAGGCTCAAAAGGCCGATTTCTT AAGAAACATTGAGGCTGCTTGGTAAAACTAGTTTCTTAAAAAAACGTGTA ATACACATGGGAATAAAATATAGGGATGAATAGAAACTACTTTCGATTTC ATCTGAAACATTTTTCTAAACTAAACGCTTATGATAAAATATAAAATTGA TAGCATTCTCAATTTTGAGATTTCGTCTTAACTTTGAATGTATTTAATTG TTGTTTTTAGGATCCGAGATTTCGTACCATCATAAAGAATCTCCGTTTAC ACATGGGAGCAGAAGACCAGGGTACGTTTCGAACTCTCTTACTTGATGAT CCTATACGTCCGTAGTTTTTAAAAAGGTTGAGCCCATTGAGGAAAGCCCG AAGTGCCCGGAAAATCCCCCCTTGTGAATCCCCCCGGTGAATCTAACCTT TCCCAGGCAAGAAAAAGTGAAACCACTTATTTCCCATCCAGAACACGCCT AGAATGCGCCGTAATCTTGATGACGGACTGTATCTCGCGGGTCATTTGTT TTTGATGACTGTATTTTTTGAAATCTAGCGACGTTTCAATCCGACGTTTG TGTAAAAACCACGCACATGTGTTCTGGATGGGAAATAAGTGGCTTCATTT CCCATCCAGGAGGGGGGTAGTTCAAAAATAGGGAGACTGTTCCTGTACTA CCCCTTAACTTTTGATCTAGTGGGTCTTTTTGTATGAAATTTGGCACACA AGATCCTTGTCATATAAAGTAACTTTTGACAAACCTTTGATGACGTCACT TGTCATGCGCAAAGTGAGCAAAAACCAAAAAATGCCTTTGTTCTTATAAA TAGCTATCGTCTTTTAACAAAGGCTTTACAAAAAAGTTCCCTTAGTTTTT AAAATGCTTATTTTATCCTAAATATTCAATAAATTACGGTTTAAATGATA TATTTGACATTAAAAATAAATTTGTATTGGAACAGTGTCAATTTTTGTGA CACCTTACTGTCAGAAATGTCATAATGCTCAAGGTGTGAAAAATTTTAGG TATCAAATTTTTTTTATTTGAAGCTAAATAAAAGTTAGGAGTTCACAGAA AATTTCACGCCAAAAGCTCTATTATTTCATTAGTTTCACCTCCGAACAGA AACAGCAAATAGGGTTAAAACATTTAAAAGTAACCAAAATATGCCGAAAC TATGCATAAGCTGTTTGCAAACAATTAGACCAGTATTATTAAATGGTACC TTTTGTTTTATTTTGAACAAAGGGAAATTCCCTCTCGGTGAAAATCTTTT TTACCACAAGTGGTTTTACTCCTCTACAATTTAACTAGTTCAGTTTTTTA AGAAATTTAGTAACTCGCTTTCTAGGCTTGCGCCTATGCCTACTGAAAAG TTTTTGTACGGCTTTTTAATAAGCCAAATATAACATCAAAAATGAAAGAA AGAGGCTATCGTAAACTAAAAACAGATTGACGAAAGTTTCGCCGTTAAAT TTGAACTCTTTAATCTCATACTAACCTATACTAGACGTTTTTCTACCACG TCTAATCCACTATCGGACTTTAACAGTTGGTTACTGCAAATCATTGTGAG AGACATCGTCAATGGACGAATTCCGAACGACTACCACAGATTTGTAAAGC CCGAAGGAGGGCTAGCAAGCAAAAATAAAGTGAATATCGCAAAAAATATT ACTGCTATTGTTTTCGAAAACCCGCGAAGCTTCTGATTGGTCAAGCCCTG AACTTTATTGTAATGTTACGTGACCTAGGCAGGATTTCCTATCTAGCCAC GGCACACATTTAGTCACTTGCAACATCTACATCTAGCCCTTCGGCCTTAT AAATCTATGACGACTACACGCTCCTTACTTTTTAATCTGTTGTGCTCCTC TAATCACAAATGTGATACCGTTCTTTACAACTTTTCCTTTCAGATATGCT GAAAAAAGGATACGTGGATGTTTATAATATGGATCGACTCGGATACAGCG AGGTAATTCTCATTTTTAATAGGGAAAAGAGTTTGTTAATAGTAGAGTAT GCTATAGTCTAAGACTAATCACTATCAAAGAAAAAAGCCCAAAGAAAGGG CGGTCCAACCGGGTCTGAGAAGGGGTTATCAATCAAGTTGTGATTCATGG GAGATAAATTTAGAAATTTGATGGAATCTCTGGTTTTGTCTTAAAAAAAC TCATAACCTTGGAACGGTGTTTTTTGTAGGTATTACCCAAATGAAATTAC CGAAATAACCTTGGGGTTGTTCGGGGGGCTTTGTTGGATACTCTTTGAGT AGACTATGATAAGTTTTGAAAGCAGATCGTAATGCTGACAGAACCATGCC AGAGCAGATGATCGGTTATTCGGTCGGGCTGATACAGGGGCGTAATTGAC TTGTTGATATTTTTCTTTTTCCCAGGTTTATCTTGTGCAACGAGTAGCAG ATGCAGTTGACTTACTCATCAAAATGGAACAAAGACTCGAACATAAACAA GCCATCTCACAACTGATTACTAAATCAGAAAATTTTAATGACGATTTGGA TTATTAA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000023_pilon:1966080..1973286-

>XLOC_016957 ID=XLOC_016957|Name=XLOC_016957|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2724bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000023_pilon:1966080..1973286- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAGCAAGTTGGACCCTAACTGGGTTTGGGCTTCAGGTGGTCTAGCGGC
AGGTTGTATATTAACAGTCTGCGTCAGTAAGATCACTGGCCTCTTCTCCC
AAAAAGCCGTAATGGACGATAAAGATGAGATGGATGCTATAAGTAATTTC
AACAATCAAGTCACCACCTTCAGTGACATAACAATGTTGGTTGGAACACC
TTTCACCAGTGCACATACAATGACCACCTCAGAATATCTGATTTATCCAG
CTGAGAAAGGATATCCCAAATTAGAAGGAAACCGATGAGCAAGTTGGACC
CTAACTGGGTTTGGGCTTCAGGTGGTCTAGCGGCAGGTTGTATATTAACA
GTCTGCGTCAGTAAGATCACTGGCCTCTTCTCCCAAAAAGCCGTAATGGA
CGATAAAGATGAGATGGATGCTATAAGTAATTTCAACAATCAAGTCACCA
CCTTCAGTGACATAACAATGTTGGTTGGAACACCTTTCACCAGTGCACAT
ACAATGACCACCTCAGAATATCTGATTTATCCAGCTGAGAAAGGATATCC
CAAATTAGAAGGAAACCGTACAATCATGGCTCGTTACCTGACACAACAAG
TTTACGAAGATCTCTTCAACTTAAGAACATCATCTGGTTGTGATTTTGAC
ACCTGCATCCAAACTGGTATTGATTGTTCAGAAAAAGTTAGTTGTGGCTT
AGTTGCCGGTGACGAAGAATGTTATGATTTATTTTCGGTTGTCTTTGATC
CAGTTATTAGTGATCGGCACCGTGGCTTTGGACGTGGTAATGAAATAATC
GGCCAGGAAATGAATATCAGTGATTTGAAAGTACAATCATGGCTCGTTAC
CTGACACAACAAGTTTACGAAGATCTCTTCAACTTAAGAACATCATCTGG
TTGTGATTTTGACACCTGCATCCAAACTGGTATTGATTGTTCAGAAAAAG
TTAGTTGTGGCTTAGTTGCCGGTGACGAAGAATGTTATGATTTATTTTCG
GTTGTCTTTGATCCAGTTATTAGTGATCGGCACCGTGGCTTTGGACGTGG
TAATGAAATAATCGGCCAGGAAATGAATATCAGTGATTTGAAAGCGAATG
TTTTTGACAGACGATACGTGAAATCCATTCATTTCTTGGTGGGCCGTTGC
ATAAAAGGCTTTCGTTTTCCACCGACCTGCAGAAGAGCTGAACGCAGACA
TACTGAGAAACTATTGAAAGATGTCCTGTTATCTCTGGAAGCGAATGTTT
TTGACAGACGATACGTGAAATCCATTCATTTCTTGGTGGGCCGTTGCATA
AAAGGCTTTCGTTTTCCACCGACCTGCAGAAGAGCTGAACGCAGACATAC
TGAGAAACTATTGAAAGATGTCCTGTTATCTCTGGAAGATAATTTTGAAG
GTTCCTACCACCACTTAGTCGATCTTTCGCCAGAAGAGCGTTATCAACTA
CCAGACATCCTACAAAGCGTAACTGATGCTCCTATAAGCAGAACTCTTAT
CTCTAGTGGCTCGACACGCGATTGGCCGTGCGGACGCGGCGTGTTTTATA
GCCAATCATGTGATCTCTTTGCGTGGACAAACCGTGAGGATCATTTGCGC
ATTATGTACCGTGATCGTGATATGGACATTGTTGCTGCATTTAAAAGATA
ATTTTGAAGGTTCCTACCACCACTTAGTCGATCTTTCGCCAGAAGAGCGT
TATCAACTACCAGACATCCTACAAAGCGTAACTGATGCTCCTATAAGCAG
AACTCTTATCTCTAGTGGCTCGACACGCGATTGGCCGTGCGGACGCGGCG
TGTTTTATAGCCAATCATGTGATCTCTTTGCGTGGACAAACCGTGAGGAT
CATTTGCGCATTATGTACCGTGATCGTGATATGGACATTGTTGCTGCATT
TAAAAGTTTTACCAGAGCTTTAGAAGAAATCAAATCTAAGCTAGGAGATG
CAGGTTTAGAATACAGTATCCATAAAGATTATGGTCATTTACTGACATGC
CCAAGCGGGATTGGAACCGCCCTTCGAGCGGGTGTTCATCTTAAATTACC
AAACTTAATATGTTTTTACCAGAGCTTTAGAAGAAATCAAATCTAAGCTA
GGAGATGCAGGTTTAGAATACAGTATCCATAAAGATTATGGTCATTTACT
GACATGCCCAAGCGGGATTGGAACCGCCCTTCGAGCGGGTGTTCATCTTA
AATTACCAAACTTAATATGTGATCCGAGATTTCGTACCATCATAAAGAAT
CTCCGTTTACACATGGGAGCAGAAGACCAGGGATCCGAGATTTCGTACCA
TCATAAAGAATCTCCGTTTACACATGGGAGCAGAAGACCAGGATATGCTG
AAAAAAGGATACGTGGATGTTTATAATATGGATCGACTCGGATACAGCGA
GATATGCTGAAAAAAGGATACGTGGATGTTTATAATATGGATCGACTCGG
ATACAGCGAGGTTTATCTTGTGCAACGAGTAGCAGATGCAGTTGACTTAC
TCATCAAAATGGAACAAAGACTCGAACATAAACAAGCCATCTCACAACTG
ATTACTAAATCAGAAAATTTTAATGACGATTTGGATTATTAAGTTTATCT
TGTGCAACGAGTAGCAGATGCAGTTGACTTACTCATCAAAATGGAACAAA
GACTCGAACATAAACAAGCCATCTCACAACTGATTACTAAATCAGAAAAT
TTTAATGACGATTTGGATTATTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_016957XLOC_016957-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000023_pilongenomesc0000023_pilon:1966080..1973286 -
Properties
Property NameValue
Aaloc1231-1362:133
Aaloc1174-1230:613
Aaloc1111-1170:2298
Aaloc955-1110:4441
Aaloc697-951:5346
Aaloc550-693:5932
Aaloc286-546:6636
Aaloc1-282:7208