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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000023_pilon:1966080..1973286- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_016957 ID=XLOC_016957|Name=XLOC_016957|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7207bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000023_pilon:1966080..1973286- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGAGCAAGTTGGACCCTAACTGGGTTTGGGCTTCAGGTGGTCTAGCGGC
AGGTTGTATATTAACAGTCTGCGTCAGTAAGATCACTGGCCTCTTCTCCC
AAAAAGCCGTAATGGACGATAAAGATGAGATGGATGCTATAAGTAATTTC
AACAATCAAGTCACCACCTTCAGTGACATAACAATGTTGGTTGGAACACC
TTTCACCAGTGCACATACAATGACCACCTCAGAATATCTGATTTATCCAG
CTGAGAAAGGATATCCCAAATTAGAAGGAAACCGGTAAGCTTTTGTTTGG
AGATATTTCTATGCTGTTTATTGGTAGGCTTATAGGGGTAATTTATTGCA
ATTTTTAGACTCGTCATCGACTATTCATCAGAATTTCGAATGGTTAATCC
GGGCGAAGGTTCGAGACCTTGATCTCTCAAAGAATCGATCAAAGTTTTTT
CTCGAAAAAGAGTTTTTTCTTCTACGTATTTGAAAAACTCGAGAAACTTG
TTAAAATTTATCTACTTAAAGATCTCTTTTTGCTCATTCCTTTTTCATTT
TATTTTATCTATTTATTTCAGTACAATCATGGCTCGTTACCTGACACAAC
AAGTTTACGAAGATCTCTTCAACTTAAGAACATCATCTGGTTGTGATTTT
GACACCTGCATCCAAACTGGTATTGATTGTTCAGAAAAAGTTAGTTGTGG
CTTAGTTGCCGGTGACGAAGAATGTTATGATTTATTTTCGGTTGTCTTTG
ATCCAGTTATTAGTGATCGGCACCGTGGCTTTGGACGTGGTAATGAAATA
ATCGGCCAGGAAATGAATATCAGTGATTTGAAAGGTTTGTAATTTTTTGT
ATTCTTGCAAATTTTACTGTGTATGTGTCTTAATATAGCCTAAAGTATAA
TCAACATCGCGCTGGGCCTTGAATTAACATTTAGGCTAAAAAAAATCTCT
CTCCGGTGTATTTGGTTGAAGCAAATGATACTCGGTCAAATTGCGAACCA
CCTTTACGCCGTGAGCAAGTTCAACACAATACGGTCTTATTCCGTTACGT
GACTAAAGGAACTCATTCGATTGGATAAAATTGAAACCCTCTAAAACCAA
AGGCATTTCTCTATTAAGTTTTGAAATGTAACGGGACCCAATATCGTACT
AAGAACTTTGCACATTTTTTGATTTTATTAATGTGGCAATACATTCGTGA
GTGTTATCAGAACCATAGAAAAGCCAACTAAGGAACTAAAAACGAGTTCA
AAAGGTACAATATATTTCTTTTAGCGAATGTTTTTGACAGACGATACGTG
AAATCCATTCATTTCTTGGTGGGCCGTTGCATAAAAGGCTTTCGTTTTCC
ACCGACCTGCAGAAGAGCTGAACGCAGACATACTGAGAAACTATTGAAAG
ATGTCCTGTTATCTCTGGAAGGTTTGTTTTTTTACATACCTTGCACGTTA
AATGATTGGTTATTTTCTTCGAGTCTTCTATTTCTGTTGTGGTGCCATCC
TATGATTGACTTGTAAAAGACGGATACAGAATTTATAGTCGAAAAGGGGT
TAATATCCATGTTTTGTTCATGATTTTGTCCCTTGTTATAGTTGACCAAT
AGTGTCAATACATAACACGGTGGCAATTGGGATGGCAATTTTTGAGGGAT
CTGAAAAGGGTTATTATCATCCTAAGCACATGTGATTCGATTTACAAAAG
GAGAATGAAATTTCAGTTAGATTTTAATCCCAGTTCCACCGAGGCTTTCC
GGGGCTTTCAGTGTCAAGATAAAATTGTAGAAAATAAATAATTTGGAATT
ATTTGTTTGGATAGTCGGTTAGAAAGGAATCTTTGACACATTGATGATGT
TTCTTTATAGATAATTTTGAAGGTTCCTACCACCACTTAGTCGATCTTTC
GCCAGAAGAGCGTTATCAACTACCAGACATCCTACAAAGCGTAACTGATG
CTCCTATAAGCAGAACTCTTATCTCTAGTGGCTCGACACGCGATTGGCCG
TGCGGACGCGGCGTGTTTTATAGCCAATCATGTGATCTCTTTGCGTGGAC
AAACCGTGAGGATCATTTGCGCATTATGTACCGTGATCGTGATATGGACA
TTGTTGCTGCATTTAAAAGGTGAGTGTTAGGTTTTATCCTTTACTTTGTT
ATCGTGGTACAGTTGACAAATATGAGTTTCTTAGGTGTGATTTCAGGGGA
TCCTTACTCGAATAATACGAGTAATTGTAAGATTTTTAGATTCTCTTTCC
GATCAAAAGTACTTTTAACGTGGGTCATTGGTAGGTGTTTACTTTTCCAG
GTCCGAGTCCGGAAAATGTCGGGCGACTAGGTCGTTTTTAATAAGGTGAA
AAAATGTTGTTCTTTCTAAAACCCAATGCATTCTTCTCGACCATGGTAGG
CCACAATAAACGTCAAAGTATAGTGGGTTTAGTTTGGATATTTTAACGCT
TTTAATCAGAATTTAAAAATAGGAAGAGAAGGACAATTTCAGTATTTCCA
CGCATTCTTAGGTTCAGTTGCTAAATTCCATGATGGTGATATTCTTACCA
TATTCTTAATTTTTTGGCCATTTTCATCATGGACATTCTTATAAAGTGTA
TTCTTATTTAAAAAAAAGCGTGTATTCCAGTCTTGAGCTTTTGGATTCCA
AGATCCTAAGGTCTCAGAGATAAAACTCTACATTCTAGAAGTAAGTTAAG
CCACTTAAAACCTTTGGTTTTCAAAATTTTTGCTTCAGGTATTCTAATTT
CCTTTTCTTTTTTCAGTTTTACCAGAGCTTTAGAAGAAATCAAATCTAAG
CTAGGAGATGCAGGTTTAGAATACAGTATCCATAAAGATTATGGTCATTT
ACTGACATGCCCAAGCGGGATTGGAACCGCCCTTCGAGCGGGTGTTCATC
TTAAATTACCAAACTTAATATGTGTAAGTTAAAGTCTGTCCAGATATAAT
TGGCAGTGGAAACAAGAATGCCTGAAACTTTTGATAGTGAAATATGATTA
TGGAAATTTTTTTTGCCTGTTTTAGAAAATCAAAAGCGCTATATTTGAAT
GTATTTTTGGTTGAAAAATTCGCGATTTTTAGCGGTTAAATTTGCGATTG
TAAAAATTGAGCTTTTTTTCTACTTATGCTATAACGTTCATTTTTACACC
AGTGGTAGTTCAACCTTAGGTTAAGAAGTTTGTAAAATTTCAAGGCGAAC
AGAAAAGTCCTTCGGAAGATATGGGACCCGAAATACCCCTTGGTAGCACT
TTTCTGTGAAATATCAAATCTCCAACTTATTACTAAAAACGGGGGTAGTG
ATATGATAAAACAGTTTTTCGATCATAGCACATTTTACGATCTCTTTAAT
GACCTCATAGCCAAACTGTGTTTAGTGTTTTGGGAATTAGCAAAGTTCTT
TAATGACTTAAAAATAACAAAGGCAATATAAGTTCTTGCTTATCTTTTCA
ATAAAAACAATTAAAAATACTGTGATTTACTTCGTTTCGAAATAATCAAT
GATACCAATAATCGTCAGCCGTGCAAAATTACTCGAATCTGATTGGTTTA
GAGGAGTGCGATTAATCGTTAATTGCACTATTACCACTTTTTGCACTCTT
CGGCGGGGGGACACTTTTGTCCCCTTATTCTTTTCTCTCCCAAGTCCTGT
GTCAGAGACTTTTTTTTACTATATAATAAAAAACAAAGACATTTTTTTTC
TTCAATATAAAAAAGAACTAAGAAATCTTACGTTACAATAGCTTCTTTTA
ATTGAAAACAAAGAAAAATTACACTGCAATGTTTTCTTCTTAAACAAAAG
AAAAAAAGGAGGTTTTCGAATGTTTACAAAAATATAAAAGTTAGAAAAAG
ATTCTTTTTCAAAACTATTTACTGACGATTACCTCGGAATCGTATGTTTT
GTCGTGCAATTAACGATTAATCACTCGTAACAAAGGAGAAAATACTGTAA
TTTGCACTCGTCCTTCGGACTCGTGCAAATTACTATTTTCTCCTTCGTTA
CTCGTTTTAATTGCACTGTTCAAAAAAGATAACATAACCCCCGTTTTTAG
TAATAAGTTGGAGATTTGATATTTCACAGAAAAGTGCTACCAAGGGGGAT
TTCGGGTCCCATATCTTCCGAAGGACTTTTCTGTTTGCCTTGAAATTTTA
CAAACTTCTTAACCTAAGGTTGAACTACCACTGGTGTAAAAATGAACGTT
ATAGCATAAGTAGAAAAAAAGCTCAATTTTTACAATCGCAAATTTAACCG
CTAAAAATCGCGAATTTTTCAACCAAAAATACATTCAAATATAGCGCTTT
TGATTTTCTAAAACAGGCAAAAAAAATTTCCATAATCATATTTCACTATC
AAAAGTTTCAGGCATTCTTGTTTCCACTGCCAATTATATCTGGACAGACT
TTAGTTTGTTGTCAAATTTAGTTCAACTTTGAGTGTGGTTTTTATCCTTT
CTCACTGGTAATAAATACACGTTTGTTTTTTTAAGAAACAAACTTTTAAG
AAACATGAGGCTCAGAATGTCTAAAAACTAAGAAACATCTAAGAAACATG
CTGAGGCCGAGAATGAGAAAATAACATTTTTTAATTCGATTTTTTTAAGA
ACCTTCCAATCCAGCCTTTCATAAGGGTTCATAAGGCTGATTATGTCAAA
AAGTTTAGAAGCATGTAAAAAACATTAAAGGCTCAAAAGGCCGATTTCTT
AAGAAACATTGAGGCTGCTTGGTAAAACTAGTTTCTTAAAAAAACGTGTA
ATACACATGGGAATAAAATATAGGGATGAATAGAAACTACTTTCGATTTC
ATCTGAAACATTTTTCTAAACTAAACGCTTATGATAAAATATAAAATTGA
TAGCATTCTCAATTTTGAGATTTCGTCTTAACTTTGAATGTATTTAATTG
TTGTTTTTAGGATCCGAGATTTCGTACCATCATAAAGAATCTCCGTTTAC
ACATGGGAGCAGAAGACCAGGGTACGTTTCGAACTCTCTTACTTGATGAT
CCTATACGTCCGTAGTTTTTAAAAAGGTTGAGCCCATTGAGGAAAGCCCG
AAGTGCCCGGAAAATCCCCCCTTGTGAATCCCCCCGGTGAATCTAACCTT
TCCCAGGCAAGAAAAAGTGAAACCACTTATTTCCCATCCAGAACACGCCT
AGAATGCGCCGTAATCTTGATGACGGACTGTATCTCGCGGGTCATTTGTT
TTTGATGACTGTATTTTTTGAAATCTAGCGACGTTTCAATCCGACGTTTG
TGTAAAAACCACGCACATGTGTTCTGGATGGGAAATAAGTGGCTTCATTT
CCCATCCAGGAGGGGGGTAGTTCAAAAATAGGGAGACTGTTCCTGTACTA
CCCCTTAACTTTTGATCTAGTGGGTCTTTTTGTATGAAATTTGGCACACA
AGATCCTTGTCATATAAAGTAACTTTTGACAAACCTTTGATGACGTCACT
TGTCATGCGCAAAGTGAGCAAAAACCAAAAAATGCCTTTGTTCTTATAAA
TAGCTATCGTCTTTTAACAAAGGCTTTACAAAAAAGTTCCCTTAGTTTTT
AAAATGCTTATTTTATCCTAAATATTCAATAAATTACGGTTTAAATGATA
TATTTGACATTAAAAATAAATTTGTATTGGAACAGTGTCAATTTTTGTGA
CACCTTACTGTCAGAAATGTCATAATGCTCAAGGTGTGAAAAATTTTAGG
TATCAAATTTTTTTTATTTGAAGCTAAATAAAAGTTAGGAGTTCACAGAA
AATTTCACGCCAAAAGCTCTATTATTTCATTAGTTTCACCTCCGAACAGA
AACAGCAAATAGGGTTAAAACATTTAAAAGTAACCAAAATATGCCGAAAC
TATGCATAAGCTGTTTGCAAACAATTAGACCAGTATTATTAAATGGTACC
TTTTGTTTTATTTTGAACAAAGGGAAATTCCCTCTCGGTGAAAATCTTTT
TTACCACAAGTGGTTTTACTCCTCTACAATTTAACTAGTTCAGTTTTTTA
AGAAATTTAGTAACTCGCTTTCTAGGCTTGCGCCTATGCCTACTGAAAAG
TTTTTGTACGGCTTTTTAATAAGCCAAATATAACATCAAAAATGAAAGAA
AGAGGCTATCGTAAACTAAAAACAGATTGACGAAAGTTTCGCCGTTAAAT
TTGAACTCTTTAATCTCATACTAACCTATACTAGACGTTTTTCTACCACG
TCTAATCCACTATCGGACTTTAACAGTTGGTTACTGCAAATCATTGTGAG
AGACATCGTCAATGGACGAATTCCGAACGACTACCACAGATTTGTAAAGC
CCGAAGGAGGGCTAGCAAGCAAAAATAAAGTGAATATCGCAAAAAATATT
ACTGCTATTGTTTTCGAAAACCCGCGAAGCTTCTGATTGGTCAAGCCCTG
AACTTTATTGTAATGTTACGTGACCTAGGCAGGATTTCCTATCTAGCCAC
GGCACACATTTAGTCACTTGCAACATCTACATCTAGCCCTTCGGCCTTAT
AAATCTATGACGACTACACGCTCCTTACTTTTTAATCTGTTGTGCTCCTC
TAATCACAAATGTGATACCGTTCTTTACAACTTTTCCTTTCAGATATGCT
GAAAAAAGGATACGTGGATGTTTATAATATGGATCGACTCGGATACAGCG
AGGTAATTCTCATTTTTAATAGGGAAAAGAGTTTGTTAATAGTAGAGTAT
GCTATAGTCTAAGACTAATCACTATCAAAGAAAAAAGCCCAAAGAAAGGG
CGGTCCAACCGGGTCTGAGAAGGGGTTATCAATCAAGTTGTGATTCATGG
GAGATAAATTTAGAAATTTGATGGAATCTCTGGTTTTGTCTTAAAAAAAC
TCATAACCTTGGAACGGTGTTTTTTGTAGGTATTACCCAAATGAAATTAC
CGAAATAACCTTGGGGTTGTTCGGGGGGCTTTGTTGGATACTCTTTGAGT
AGACTATGATAAGTTTTGAAAGCAGATCGTAATGCTGACAGAACCATGCC
AGAGCAGATGATCGGTTATTCGGTCGGGCTGATACAGGGGCGTAATTGAC
TTGTTGATATTTTTCTTTTTCCCAGGTTTATCTTGTGCAACGAGTAGCAG
ATGCAGTTGACTTACTCATCAAAATGGAACAAAGACTCGAACATAAACAA
GCCATCTCACAACTGATTACTAAATCAGAAAATTTTAATGACGATTTGGA
TTATTAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000023_pilon:1966080..1973286- >XLOC_016957 ID=XLOC_016957|Name=XLOC_016957|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2724bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000023_pilon:1966080..1973286- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGAGCAAGTTGGACCCTAACTGGGTTTGGGCTTCAGGTGGTCTAGCGGC AGGTTGTATATTAACAGTCTGCGTCAGTAAGATCACTGGCCTCTTCTCCC AAAAAGCCGTAATGGACGATAAAGATGAGATGGATGCTATAAGTAATTTC AACAATCAAGTCACCACCTTCAGTGACATAACAATGTTGGTTGGAACACC TTTCACCAGTGCACATACAATGACCACCTCAGAATATCTGATTTATCCAG CTGAGAAAGGATATCCCAAATTAGAAGGAAACCGATGAGCAAGTTGGACC CTAACTGGGTTTGGGCTTCAGGTGGTCTAGCGGCAGGTTGTATATTAACA GTCTGCGTCAGTAAGATCACTGGCCTCTTCTCCCAAAAAGCCGTAATGGA CGATAAAGATGAGATGGATGCTATAAGTAATTTCAACAATCAAGTCACCA CCTTCAGTGACATAACAATGTTGGTTGGAACACCTTTCACCAGTGCACAT ACAATGACCACCTCAGAATATCTGATTTATCCAGCTGAGAAAGGATATCC CAAATTAGAAGGAAACCGTACAATCATGGCTCGTTACCTGACACAACAAG TTTACGAAGATCTCTTCAACTTAAGAACATCATCTGGTTGTGATTTTGAC ACCTGCATCCAAACTGGTATTGATTGTTCAGAAAAAGTTAGTTGTGGCTT AGTTGCCGGTGACGAAGAATGTTATGATTTATTTTCGGTTGTCTTTGATC CAGTTATTAGTGATCGGCACCGTGGCTTTGGACGTGGTAATGAAATAATC GGCCAGGAAATGAATATCAGTGATTTGAAAGTACAATCATGGCTCGTTAC CTGACACAACAAGTTTACGAAGATCTCTTCAACTTAAGAACATCATCTGG TTGTGATTTTGACACCTGCATCCAAACTGGTATTGATTGTTCAGAAAAAG TTAGTTGTGGCTTAGTTGCCGGTGACGAAGAATGTTATGATTTATTTTCG GTTGTCTTTGATCCAGTTATTAGTGATCGGCACCGTGGCTTTGGACGTGG TAATGAAATAATCGGCCAGGAAATGAATATCAGTGATTTGAAAGCGAATG TTTTTGACAGACGATACGTGAAATCCATTCATTTCTTGGTGGGCCGTTGC ATAAAAGGCTTTCGTTTTCCACCGACCTGCAGAAGAGCTGAACGCAGACA TACTGAGAAACTATTGAAAGATGTCCTGTTATCTCTGGAAGCGAATGTTT TTGACAGACGATACGTGAAATCCATTCATTTCTTGGTGGGCCGTTGCATA AAAGGCTTTCGTTTTCCACCGACCTGCAGAAGAGCTGAACGCAGACATAC TGAGAAACTATTGAAAGATGTCCTGTTATCTCTGGAAGATAATTTTGAAG GTTCCTACCACCACTTAGTCGATCTTTCGCCAGAAGAGCGTTATCAACTA CCAGACATCCTACAAAGCGTAACTGATGCTCCTATAAGCAGAACTCTTAT CTCTAGTGGCTCGACACGCGATTGGCCGTGCGGACGCGGCGTGTTTTATA GCCAATCATGTGATCTCTTTGCGTGGACAAACCGTGAGGATCATTTGCGC ATTATGTACCGTGATCGTGATATGGACATTGTTGCTGCATTTAAAAGATA ATTTTGAAGGTTCCTACCACCACTTAGTCGATCTTTCGCCAGAAGAGCGT TATCAACTACCAGACATCCTACAAAGCGTAACTGATGCTCCTATAAGCAG AACTCTTATCTCTAGTGGCTCGACACGCGATTGGCCGTGCGGACGCGGCG TGTTTTATAGCCAATCATGTGATCTCTTTGCGTGGACAAACCGTGAGGAT CATTTGCGCATTATGTACCGTGATCGTGATATGGACATTGTTGCTGCATT TAAAAGTTTTACCAGAGCTTTAGAAGAAATCAAATCTAAGCTAGGAGATG CAGGTTTAGAATACAGTATCCATAAAGATTATGGTCATTTACTGACATGC CCAAGCGGGATTGGAACCGCCCTTCGAGCGGGTGTTCATCTTAAATTACC AAACTTAATATGTTTTTACCAGAGCTTTAGAAGAAATCAAATCTAAGCTA GGAGATGCAGGTTTAGAATACAGTATCCATAAAGATTATGGTCATTTACT GACATGCCCAAGCGGGATTGGAACCGCCCTTCGAGCGGGTGTTCATCTTA AATTACCAAACTTAATATGTGATCCGAGATTTCGTACCATCATAAAGAAT CTCCGTTTACACATGGGAGCAGAAGACCAGGGATCCGAGATTTCGTACCA TCATAAAGAATCTCCGTTTACACATGGGAGCAGAAGACCAGGATATGCTG AAAAAAGGATACGTGGATGTTTATAATATGGATCGACTCGGATACAGCGA GATATGCTGAAAAAAGGATACGTGGATGTTTATAATATGGATCGACTCGG ATACAGCGAGGTTTATCTTGTGCAACGAGTAGCAGATGCAGTTGACTTAC TCATCAAAATGGAACAAAGACTCGAACATAAACAAGCCATCTCACAACTG ATTACTAAATCAGAAAATTTTAATGACGATTTGGATTATTAAGTTTATCT TGTGCAACGAGTAGCAGATGCAGTTGACTTACTCATCAAAATGGAACAAA GACTCGAACATAAACAAGCCATCTCACAACTGATTACTAAATCAGAAAAT TTTAATGACGATTTGGATTATTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000023_pilon | genome | sc0000023_pilon:1966080..1973286 - |
Properties
| Property Name | Value |
| Aaloc | 1231-1362:133 |
| Aaloc | 1174-1230:613 |
| Aaloc | 1111-1170:2298 |
| Aaloc | 955-1110:4441 |
| Aaloc | 697-951:5346 |
| Aaloc | 550-693:5932 |
| Aaloc | 286-546:6636 |
| Aaloc | 1-282:7208 |
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