XLOC_016956 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_016956
Unique NameXLOC_016956
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000023_pilon:1974323..1992694-

Legend: polypeptideCDS
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>XLOC_016956 ID=XLOC_016956|Name=XLOC_016956|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=18372bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000023_pilon:1974323..1992694- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000023_pilon:1974323..1992694-

>XLOC_016956 ID=XLOC_016956|Name=XLOC_016956|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=4260bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000023_pilon:1974323..1992694- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCAGGATCAAATGACTCTGTTGCTATCAAGCTCTTCACATTATCGTG
TAGCGTCGTTGGATGGTTCTGGAATACCGTTACTTTTATACCCTGGTATG
TTTTGAGTGGAAATTTCAAAAGACCAAAATATGGACACATCCAAGGAAAG
TCAATCACTGGACGTCCAGAGGGTCCTTATGCTGATATTAACCACCTTTC
TGGATCCAAAGATGGGTTTGATGGGATCACTACCTTGGATCAGTTGTTTA
AATGGCAGGATCAAATGACTCTGTTGCTATCAAGCTCTTCACATTATCGT
GTAGCGTCGTTGGATGGTTCTGGAATACCGTTACTTTTATACCCTGGTAT
GTTTTGAGTGGAAATTTCAAAAGACCAAAATATGGACACATCCAAGGAAA
GTCAATCACTGGACGTCCAGAGGGTCCTTATGCTGATATTAACCACCTTT
CTGGATCCAAAGATGGGTTTGATGGGATCACTACCTTGGATCAGTTGTTT
AAAAAATCTGTTGAAAAACATGGAGACAGAGGGTGCATGGGAACACGAGA
GCTTTTGGCCGAAGATGATGAAGTCCAACCCAATGGACGTATTTTCAAAA
AGATGATCCTTGGTGACTACAAGTGGATGAGTTACAATGAAGCATATACA
GAAGTTCAACGTGTCAGTGCTGGTCTTAAAGCTATTGGTGTACAAACCAA
AGAATATGTTATCATCTTTGCCGAAACTAAAGCTGAATGGATGTTGAGTG
CTCAAGCATGTTTCATGAGAAATTTCCCAGAAAATCTGTTGAAAAACATG
GAGACAGAGGGTGCATGGGAACACGAGAGCTTTTGGCCGAAGATGATGAA
GTCCAACCCAATGGACGTATTTTCAAAAAGATGATCCTTGGTGACTACAA
GTGGATGAGTTACAATGAAGCATATACAGAAGTTCAACGTGTCAGTGCTG
GTCTTAAAGCTATTGGTGTACAAACCAAAGAATATGTTATCATCTTTGCC
GAAACTAAAGCTGAATGGATGTTGAGTGCTCAAGCATGTTTCATGAGAAA
TTTCCCAGTTGTCACAATCTATGCCACTCTTGGCGACGATGCTTTGGTCT
ATGGATTCAACGAAGCAGAAGCCAAGTATGTCATGGTGGATGCAGCCCTT
CTACCCAAACTGAAAAATTTAATTTCCCAACTAACACACGTTGAACAAAT
TGTCTATTTTGGAAATGCCAAGAAAGCGCTTGTACAAGAATTCCCTGAAA
ACATCAAAGTCTATTCTTATCAACAAATCAAAGATATTGGATCCAAACTA
AAGAATTTTGTCACAATCTATGCCACTCTTGGCGACGATGCTTTGGTCTA
TGGATTCAACGAAGCAGAAGCCAAGTATGTCATGGTGGATGCAGCCCTTC
TACCCAAACTGAAAAATTTAATTTCCCAACTAACACACGTTGAACAAATT
GTCTATTTTGGAAATGCCAAGAAAGCGCTTGTACAAGAATTCCCTGAAAA
CATCAAAGTCTATTCTTATCAACAAATCAAAGATATTGGATCCAAACTAA
AGAATTTTGATTCACCGGTAGAATCACCGGATCAAGATGACGTAGCTGTG
GTGATGTACACATCAGGATCCACTGGTGTTCCCAAAGTTGATTCACCGGT
AGAATCACCGGATCAAGATGACGTAGCTGTGGTGATGTACACATCAGGAT
CCACTGGTGTTCCCAAAGGTGTCATCATTTCTCATTTGAATGTCACATCT
TGTTTACATGCACTCGTTTCCAGTGTCCCAAACATGGGGTGTCATCATTT
CTCATTTGAATGTCACATCTTGTTTACATGCACTCGTTTCCAGTGTCCCA
AACATGGGACCAAACGATCGTTATATCGGTTACCTTCCACTGGCACATAT
CATGGAGTTAGCTTGTGACCAAACGATCGTTATATCGGTTACCTTCCACT
GGCACATATCATGGAGTTAGCTTGTGAATGTGGATGTCTAGCATTGGCTA
CACCGATTGGATATTCAAGTGCGCTGACTCTATCTGACCAAAATGTGGAT
GTCTAGCATTGGCTACACCGATTGGATATTCAAGTGCGCTGACTCTATCT
GACCAATCTTCCAAGATCAAGAAAGGAACCAAAGGAGATGCGAGTGTTCT
TAGACCAACTTTGATGGCTGCTGTTCCGTCTTCCAAGATCAAGAAAGGAA
CCAAAGGAGATGCGAGTGTTCTTAGACCAACTTTGATGGCTGCTGTTCCG
ATGATCATGGATCGTATGAGAAAAGCTGTTTTAGATAAAGTGGCCGGTGG
CTCACCTTTCGCACAAGCGCTCTTCAATTTCGCTTTCAACTATAAATTGA
GGCTCATCAGAAAAGGATATGACACTCCCATACTGAACAAATGATCATGG
ATCGTATGAGAAAAGCTGTTTTAGATAAAGTGGCCGGTGGCTCACCTTTC
GCACAAGCGCTCTTCAATTTCGCTTTCAACTATAAATTGAGGCTCATCAG
AAAAGGATATGACACTCCCATACTGAACAAAGTTGTCTTCAAGAAGGTTC
GTGCCATCCTGGGTGGTGAATTACGAATGATGTTGAGCGGTGGCGCACCT
CTCTCTCCTGAAACTGAAGAATTCATGAACGTCTGTTTCTGTTGTCCCAT
TGGCCAAGGTTACGGTTTAACCGAAACGTGTGCTGGTGGTACCCTCTGTA
ATGAGTTGTCTTCAAGAAGGTTCGTGCCATCCTGGGTGGTGAATTACGAA
TGATGTTGAGCGGTGGCGCACCTCTCTCTCCTGAAACTGAAGAATTCATG
AACGTCTGTTTCTGTTGTCCCATTGGCCAAGGTTACGGTTTAACCGAAAC
GTGTGCTGGTGGTACCCTCTGTAATGCTTGGGATCAATCAACAGGACGTG
TAGGAAGACCCATCCCATGTTGTCAAATCAAACTAGAAAGCTGGGACGAA
GCTTGGGATCAATCAACAGGACGTGTAGGAAGACCCATCCCATGTTGTCA
AATCAAACTAGAAAGCTGGGACGAAGGTGGCTACACAGTAAACGATAAGC
CGTTCCCACGTGGTGAGATAATCATCGGAGGTAATCACGTGACTTTAGGT
TACCTGAAACAAGAAGCCAAGACGCGTGAATCGTACAAGGTGCAAGACGG
GAAAAGATGGTTTTACACAGGTGATATCGGTGTTGTAGAAGATGACGGTG
TCATTAGGATCGTCGGTGGCTACACAGTAAACGATAAGCCGTTCCCACGT
GGTGAGATAATCATCGGAGGTAATCACGTGACTTTAGGTTACCTGAAACA
AGAAGCCAAGACGCGTGAATCGTACAAGGTGCAAGACGGGAAAAGATGGT
TTTACACAGGTGATATCGGTGTTGTAGAAGATGACGGTGTCATTAGGATC
GTCGACCGCAAGAAGGATTTGGTGAAACTAGCTCACGGTGAATACATCTC
ACTCGGAAAAGTCGAAGCCGCCTTGAAACAATCCAAATACGTAGAGAACT
GTTGCGCGTACGGCGATTCCCGTGAAACGTTCATCGTGTTGCTCGTTGTG
CCCGTTCAAGCGGCCGTTGAAGAATTGGCAGCTAGTTTAGGAGCATCGGG
AGCTTTTGAAGATCATTGTTCAAACAAAGATGTGGTCGCGAAAGTGTTGC
AAGACATCCAAACTGCTGGCAAAGGAGACCGCAAGAAGGATTTGGTGAAA
CTAGCTCACGGTGAATACATCTCACTCGGAAAAGTCGAAGCCGCCTTGAA
ACAATCCAAATACGTAGAGAACTGTTGCGCGTACGGCGATTCCCGTGAAA
CGTTCATCGTGTTGCTCGTTGTGCCCGTTCAAGCGGCCGTTGAAGAATTG
GCAGCTAGTTTAGGAGCATCGGGAGCTTTTGAAGATCATTGTTCAAACAA
AGATGTGGTCGCGAAAGTGTTGCAAGACATCCAAACTGCTGGCAAAGGAG
CTAACCTTCACAAGAGCGAGTTACCTGCTAAAATCAAATTGTGTGTCGAA
CCATGGACGCCTGAGAATGACCTGGTGACTGCAGCTTTCAAACTGAAACG
TAAGAACATTCAAAGAAGTTACCAAGCCGACATCGATGTGTTGTATGCCA
AGTAACTAACCTTCACAAGAGCGAGTTACCTGCTAAAATCAAATTGTGTG
TCGAACCATGGACGCCTGAGAATGACCTGGTGACTGCAGCTTTCAAACTG
AAACGTAAGAACATTCAAAGAAGTTACCAAGCCGACATCGATGTGTTGTA
TGCCAAGTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_016956XLOC_016956-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000023_pilongenomesc0000023_pilon:1974323..1992694 -
Properties
Property NameValue
Aaloc1978-2130:154
Aaloc1705-1974:786
Aaloc1516-1701:1540
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Aaloc253-528:12449
Aaloc1-249:18373