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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000083_pilon:1012041..1019530- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_016854 ID=XLOC_016854|Name=XLOC_016854|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7490bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000083_pilon:1012041..1019530- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGAAACTTTGGACAAAAGAACATATATTCAGGTAAATATTTTACATTTT
ACACAAACTCAACAGAACCCTTTCGTATTGAAAAGTTTGTTTCTTTTGCC
GTTTATTTTTGATTGGGTTAAACTCTTCTGGTCTGCAAGCTATAAAATAA
TGCTGGCTAGAATGCAAAAACGGGTAAATGGCTACCGGAAGTTGGTCTAA
TATCGACATCCCTTATCTAATTCCGACACCCTTGACAGGAATAATATGGA
AAGCTTGAATCGCTGATTGAAAAAGGATTATTCCTCTCTGACCACTAAGC
AAAATAAAACAGTTTCATCCTTTATCAATTTCAGATGATAAAAAGGGTGT
TGGAATTAGAGGAGGGGTGTCGTCAACGCGACATTAGACCAAGTTACGGT
ATAGGGTTGTCGGGAAACTTGCCTCAGTGCACAGCAGTGGAGGCAAACAT
ACATAGGCTTCAAATGAATGACCTGTGGGCAAAATTATTTTAAAGGGAAC
CAGAGACCACCTTGATTTCAAAAGGATATCATTAGGGAGGGGACTTAGAA
AAAAACAATTAGTGGCATATGTACAAAAGCTGCCAAATTATATAAAAAGA
AGAAAAAAATCAAAAATTTTGACCGGGGACCCTTTTCAGGGTCCCCCCGG
GCCCCATTTCTGCGGGGTACCCAGCGCACCCCCGGACCAATAATAGCCTA
ACACCAACTTTCTCAAAACATAGTCATGTGGCATATCAAATTATCAGAAA
TTTTATGCTGATTCCAAAAAACATTAGTAGTAGGGGTCAGAAATAAAGCT
AAAAAAAGTTATGACCATATCTTGGACCAGATTTTGAGTAAATTGCGTAA
TTCGCAAGAAATTCGAATAGAATCTTGATTATGACTAACATTTCATGTAG
TTAGTAGTTAAACTTTGACAAAATTCTGGTTTATTGAATGTAACTGTTTT
CATGATATGAAGACATTTTCAGTTTTCTTTGGAGAAAAGGATTATGAATG
TAGACAAGGATGGTGAAGCTGAGGTACTTCGAACAAGAGCAAAAGATATT
TTATCAAGCCAGAAATTGCCAAGTAAAAAATCAAAACAAACACAGAGAAA
TAAAAAGTTTTCAATTGCAAAGAGCATCACAAACTGCCACATCATGAGTG
GACAGATAAATGTAAAGATTGTAATACCTGTGTTAATTTTGAGATGTTGG
AAAGATAACCTTTGGATGTTCTATCAAATGCCAAGAAAGCGTTGGAATAT
CTATTCACCACTAAGATGGTCAATACAGGAAAGAATAAGAATTTTGAAAA
AACTGTTGCAAAGGGTGTTGTATTGAAATGGATTTTTTGCAATGTTTATC
CAAAGAACTTTTGAACACTGGAGCACGATATCAAAAGATTATTATTACAA
TTTTATAAATAATTAAAATAATATATAAATAGTTATGAATCATTGAAAAA
AAGAAGCACTACGAAGAATCCAGATGATTACTGGCCTAAGTTTGAGAAAT
ACAGCTTAAAGAATTGTTTGACATTATTGGCAAGATTTCTTTTTGATTAT
TGAATAGTCAACTGCTAGGGCAAATTCTCTTCGAACTGACAGTGATATTC
AATAGCGCTTCGTCGTGCAAACGTCACGATTATTACTTCTCTCATTTGAC
CGAAATTCAATCCCACAATCCTTTTTTGTTTTAATTCAAAAGTCGTGAAA
GTTCTTACTTTTTCTTTGTAATTGAGTGTAATTTGCGTGTAAGCATAATA
AACGCAAAGGTTGACAGGATTGAATTTCGGTCAAACAGAAAAATCAATGT
CTACTTTTAGATTCGCTACGGTATGCTATTCAATTGTTTAGGTATACAAG
TTGAGTTTAATCCATAGACCATGATTTATGGCACCTTTAAAGTTTACATT
TGCAGGATGCAGAATGAGGAGGCAGAATGGCAAGAGGTTGAATAATCAAG
GGGGTGGGTTATCAAAATGGGTTAAAAATATATTTTGAAGGCACCAGATC
AGCTACCAGTATCTAGTTCTAGTTCTAGTTATGTATTTGCATAAGACAAT
TAAGCCTAATCTCGCAAATTCTACGTAAAAATTACAAAAATGAAAATATA
TCTATCTCAATGGCAAGTCTTAAGAGCATCCTCAGGGAATTGGAAAGTTA
AAAAAAGAGAGTCTATCAGTGAAATTGGTACAAAACCCTTCTACTGGCAT
TTGTTCTTTGTTATTGTAAAATGTCCGGTCATTTTGCCACATTTTTACAT
CCAGGTTGTTTCTTGTAGCCTTACCCTTTCTTTTGAACTTTTAAATTAAA
TTTAGTACCAATCAATGACTGTACCCTACAATGCCTTTTCAAATAAAATG
TAAACTTTAAAGGTGCCATCATGGTCTATGGATTGAACTCAACTTGTATA
CCTAAACAAAAATTGCAAAGAATTGAATTGGATATCACTGTCAGTCCCAG
GAGAGAATTTGCCCTAGCAATGGACTATTCAATAATCAAAGAGAAATCTT
TCCAATAATGTCATACAATTCATTAACCTATTTGCTTTAAAAATCATCTG
TTTTTTTGAAGTGCTTCTTTTTATTCAATAATTCATAATTATTTAATAAA
TAATGTTTTAATATCACAATTTCTGGCTTCATAAAATATATTTTGCTCTT
GTTCAATACAAAGTACCTCAGCTTCACATTCATAATCCTTCTCTCTAAAG
AAAACTTAAATAAACCTGAAAATGTCTTCATATCATGAAAACAGTTACAT
TCAATAAACCAGAATTTTGTCACAGTTTAACTACTAACTACATGAAATGT
TAGTCATAATGAAGATTCTATTCGAATTTCTTGCGAATTATGCAATTTAC
TCAAAATCTGGTCCAAGATATGGTCATAACTTTTTTTAGCTTTATTTCTG
ACCCCTACTACTAATGTTTTTTGGAATCAGCATAGAATTTCTGATAATTT
GATATGCCACATGACTATGTTTTAAGAAAGTTGGTGTTAGGCTATTTTTG
GTCCGAGGTCGCGCTGAGTACCCCGCAGAAATGGGGCCGGGGGGACCCTG
AAAAGGGTCCCCGGTCAAAAATTTTGATTTTTTTCTTCTTTTTATATAAT
TTGGCAGCTTTTGTACATATGCCACTAAATTCTTTCTAATTTTCTTTTTT
TAAGTCCCCTCCCTAATATCATGCATAAAGTGGAGATTGTCATTGAATGA
TTTTAATTTCAGAGGATGCACAATAAAAAATGCTGAAAAATGAGAGCTCA
CACAAGTCTGTTGTAGCACAAGCGAAACTAAAGTTATGGCATTTTAAAGC
TCAAAAACTGCTGATTTTTTCCATGAAACAGAGTGTCACCCAAAATTTTG
CATTGTTAAAGTGGTTAATAAATTGACACTGACTGATGATTATGCTATCA
AAGTCATGATTTTTAGCCATAGCAACAATAACACTTTGAGAAAATCAAAA
AGATTTTTGGTAACACTCAACCAATTTTTTAAATTTATCATGAATGCGGT
ACACACGATATGAAACAGAATCGGCTGTAAAAATCTTATTCAACTTTAGA
ACCCTATAGAGGGTTAATGGAAAGGTTTTCAAGATGGATCAAATGCTTAG
ATTTTGATACAAAGTTACTGTATCAGCTTGAAAAATGTTTGAGGTGATAA
GGTTAAGTGAAAATTTCATAATTTTTATTTCAGTAAAGTAAGATAATTTT
CCGTCATTCCGTAACCAAAAATGATTTCTCAATTAAAAACCAGTCTTCCC
CCAATGGCAATTAATTTATGCCTGGTTTGAAAGTACTCAGTAAGAGGTAG
AAACTTGCCAAATATTTTACTCTAAAAATGTTTCCTTAAAACTTTACAGC
ATTTTTAATTTTTCCGTCATTCCGTAACCAAGATTTTTAGAAAATAAAAT
CCTCAATCGTTCAATCCAGGGAAGGCCAAACATGCTGTAAATGAGTTTTC
TTGATCAATTGTTGGCCTATGTTGGATTTAGAATAACTAAAACTGCAGCA
TTCATTGTATTTTTTGTGATAAGGCTTTGGCTGTTTTTTAGGCTAAAAAG
CTTTAATTTCAAGGCTTTTTAGCCTGAAAAATGGCAAAATCAAGTTTCAG
AAGTGCTGTAGCTCTAAAACAACTGCAAATGAGTTTAGGATACTATGAGA
AATGATATATATAAATTTGAAAATGTTTACTGAAAAAAAATTTTCAGCTC
TCAAATGCACTTTTTGGTTCCCTTTAAAATAATTTTGCCCCTGTCAGTGT
AGACCTAAAGCTCTAAAACAGCATCTAATAACATGAAAACCAGAATATGA
TTCTTCAATGGGAATCAAAACTATAAAGTGCACTTACAAACATCAATTTG
TCAGATCTAACAAAATTAATAACCGCACTGTCATCATTGACAATAAAACA
AACGATTTTCTGTCAAGAGCCTTGTAAACATTCCAACAACTTCCATCGAA
ATGATTTATCACAGCTCAGTCTACCATTTTTAGCGTGGTCCGAGGATTGA
GCCGAGAACACTCCGCGAACTCCTGCGCGGTTGAAAACTTCAATCTGTCA
ATCATTTTCTCAAGCGAAGAGTACGCGAAGCGAATCTAGCTTTACGATAG
TGCCGCAGGACATCAATGGATAGTATTCAATCATCATTATCCCTTTATTT
TCATTTTTAGAACTTTTGCAAAAAAAAGGAAAAATAGAAAAGTTGTATTT
TTTACTGCTTTATTCACATACTGAATTTGAAAGATCTTCTATGTGGCGTT
TTTTTGCAAACTTCAAAAAACTGATTTTTGTCCCGCCTTTGCGGGACTTT
GGCTTAAGTGCTTGAGTGCAGCATAGGGTACAAAGTCCAAACATGCGTTT
CCCGTAATTTTTGTATGAAGAGTTAGGTCTATACTGCCTGTCTGGTCATT
TAAATACAAACTTTAATCAAAACAAAAATGATAGAGTAGATCTGTCCATT
TTTTTGGAAATTTTGCTGCTTTGATTGGCTTGGTCAGTCATTTGATGGCT
ATGCATGTTTGCCTCCGCTGATGCAAGTTACCCGACTTCACGGTACGCAC
TTGTCAAGGTCAAGATTTCTTTAGCCAAACAAGGAAGAATTTACAAAAAT
GAACTTCAATGCATTGGGCCATTCCAGAATTTGTCTGTTACAGGGGGCGG
ACAACACAGGATTTCCAAGGGCAAAAGTTTTCACCAAAATTCGAAATTTC
CAAGGAGAGAGAAGTAAATGTATGAATTTGCAAGGCAGTTGAATTAAAAA
AGGCAAAAAAGAGTGGAATTTCTAATGCATTTTGCCAAAGTACATAGATT
TTTATCTGAATTTCCGACCACCACTCGAAAAGGAAAATTAGTTCCGATGC
TAGAAAAAATTAAAAAATGAATTTTGGTAACAAAAATTTTCTGGAATGGC
CCATTATTACTTACCTTTGTTGATCAACCAAATCTGATCATTCTTTTTTT
TAAATCAATCAGAAATTTTCAGAGAAACAGGTAAAAAAAATCTTTTCTTT
CCAAAATTATTGATAGGCTCCAACATCAAGGTGAAAACACAACTTAGCGC
TGAGTTACAGCACCAGAAAATTCTTGACCCACATGGAAACAAATGACTGC
CGCTAAGGCCGATGGAATTGGATTTCAAGTTTACTGTAAGATCCACTTTC
CGAATTCGATGCGGGCGAGTTGTCATTATTCATCATTTTAAAACACACAC
CTAACTTTATGTATGGAGATTAGGCCTTTAAATGACTCCTAGACTCCAGA
CCTAAGCTAAAGCTATCATCATTATTTTTTTTTGATTTCATATCTTTTAA
CACTACAGTAAAACAAAAAAAGCAAGACAGGTTTTTGAACATGCGTGCAG
CTTATGGTAAACATAACATTAAATTCCATCTGCCTATGAGCTGGCTCAGG
GTTTGAATTATAAATTTTAGGAGCTCTGCAATTTTTCCAAGCAAGGCACA
ATGTTTGGGAAGCATTTTTAGTATTTTTTTATGTTTTTTTGGTGTTCAGA
TCAATGTTTTGATTTGAAATTTACGTCATTTCACCGCAGAAGTAATTTAT
ACTAAAGTAATTTGTTATCTGCATATTCAGAATTTTTCTGGAGCTTTGCC
CTCTAAACCCCCACCAGCCCCCGCCAGAGCTTTGGTGCCCTGGACCCACA
GGGGGTTTAAAGAAGCAGATACCCTTTCAGATATACTCAATCTAGATTTA
TGAAAATGGCCCTAGTTCAAAGTGCTTAGAAAAATCCCTGATTTAGGGTT
GATTGTGTAAACAATCAAATTGCACACCTCTGTTGGTCCCCAAAGGCAGT
GAAGATGTAGAAAACAAAATTTAAAAAACTTCTGCAAAGTTTGGTATCAT
TTATCAGCATTTATTGTATGAATTATTTTGTTAAGCTCAAATCTCCTTGT
TTAATGTTTGTAAACTTTCTAAAAACAGGTTAACTAAAGTTTTTTTATTA
ATGGTTTTTATCTTAATTTATAATTATAGCCACCCATGGAAAAATGTAAC
AGAGGCAGCCTGGAAAAAGTACCCAAATGAACACAACACCAACGTCACTG
CAATCGATGTGCTGGACAGGAAGGTTTCTGAAGATGGAAAACTGTCAACA
ACTAGGATATTTGGGTCACATTGGAACTTCCCTGCTCTCCTAGCAACAGT
TTTGGGACTGCCTGAAATGTGTTACGCAGTTGAACACTCAGAGGTTGACC
TTAAAGAACAGAAAATGACATTGAAGATGGTCAATTATACATTTTTGGGA
ATCTTAGCTGTTGAGGAGACACTTGTTTATCAAAAAGACAAAGAAAATCC
TAATACGTAAGTATTTTTTATTTTGTTAAATGCTTTATTTAACGTGCTAG
AAAGCTCTTAATTATGTAACCAGGAAATATGGGGTTCCTACTGTAAAGCT
TGCTTGACCTATTTGCAAACAGTAAAATTGAAGCTAGAAAGGAAGCGCTA
ATATTGGATTGATCAGGAGTCATGTTTTTTTTATCCCTTATCTCTTAACT
TTTTAGAACATGTTTAACTCAAGATGCAAAGATCAGTGTACAAGGAATTT
CATTCTCTGGCTATTTCGAAGACCTAGTCGTTTCAAACTATGATGTCAAT
TCTGTCAAAGGACGTACCGCTATTGAACAAGTCGTTAACAAAATCAAAAT
AGAGAACATACTTGATACCGTCAAAGAAGAACTTTGTGAATTGAAATTAG
ACGTTGATAGTGCTACCACTAAATTAGATAACGAATTTCACGTCACTGAA
AAATTACAAGCTCTAACCAAGGACTTAGACAATGCTACTGATTTGATAAA
CACGGAACTCAGCAAATTTTCTAGTTATTTGAGTGAGGAATTTCACCAAC
TTGTAGAACGTTTATCAACTGAACTTGACCAGATAACTGTACGCGTTGGA
CATATTGATACTAATGCTGGTGTTGTTGAATCGCAGAGGAAAATTAATTT
AACTGATGCCGTTAAAAATGCTGGTATTGGAGTAAAATGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000083_pilon:1012041..1019530- >XLOC_016854 ID=XLOC_016854|Name=XLOC_016854|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1686bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000083_pilon:1012041..1019530- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGAAACTTTGGACAAAAGAACATATATTCAGATGAAACTTTGGACAAAA GAACATATATTCAGCCACCCATGGAAAAATGTAACAGAGGCAGCCTGGAA AAAGTACCCAAATGAACACAACACCAACGTCACTGCAATCGATGTGCTGG ACAGGAAGGTTTCTGAAGATGGAAAACTGTCAACAACTAGGATATTTGGG TCACATTGGAACTTCCCTGCTCTCCTAGCAACAGTTTTGGGACTGCCTGA AATGTGTTACGCAGTTGAACACTCAGAGGTTGACCTTAAAGAACAGAAAA TGACATTGAAGATGGTCAATTATACATTTTTGGGAATCTTAGCTGTTGAG GAGACACTTGTTTATCAAAAAGACAAAGAAAATCCTAATACCCACCCATG GAAAAATGTAACAGAGGCAGCCTGGAAAAAGTACCCAAATGAACACAACA CCAACGTCACTGCAATCGATGTGCTGGACAGGAAGGTTTCTGAAGATGGA AAACTGTCAACAACTAGGATATTTGGGTCACATTGGAACTTCCCTGCTCT CCTAGCAACAGTTTTGGGACTGCCTGAAATGTGTTACGCAGTTGAACACT CAGAGGTTGACCTTAAAGAACAGAAAATGACATTGAAGATGGTCAATTAT ACATTTTTGGGAATCTTAGCTGTTGAGGAGACACTTGTTTATCAAAAAGA CAAAGAAAATCCTAATACAACATGTTTAACTCAAGATGCAAAGATCAGTG TACAAGGAATTTCATTCTCTGGCTATTTCGAAGACCTAGTCGTTTCAAAC TATGATGTCAATTCTGTCAAAGGACGTACCGCTATTGAACAAGTCGTTAA CAAAATCAAAATAGAGAACATACTTGATACCGTCAAAGAAGAACTTTGTG AATTGAAATTAGACGTTGATAGTGCTACCACTAAATTAGATAACGAATTT CACGTCACTGAAAAATTACAAGCTCTAACCAAGGACTTAGACAATGCTAC TGATTTGATAAACACGGAACTCAGCAAATTTTCTAGTTATTTGAGTGAGG AATTTCACCAACTTGTAGAACGTTTATCAACTGAACTTGACCAGATAACT GTACGCGTTGGACATATTGATACTAATGCTGGTGTTGTTGAATCGCAGAG GAAAATTAATTTAACTGATGCCGTTAAAAATGCTGGTATTGGAGTAAAAT GAAACATGTTTAACTCAAGATGCAAAGATCAGTGTACAAGGAATTTCATT CTCTGGCTATTTCGAAGACCTAGTCGTTTCAAACTATGATGTCAATTCTG TCAAAGGACGTACCGCTATTGAACAAGTCGTTAACAAAATCAAAATAGAG AACATACTTGATACCGTCAAAGAAGAACTTTGTGAATTGAAATTAGACGT TGATAGTGCTACCACTAAATTAGATAACGAATTTCACGTCACTGAAAAAT TACAAGCTCTAACCAAGGACTTAGACAATGCTACTGATTTGATAAACACG GAACTCAGCAAATTTTCTAGTTATTTGAGTGAGGAATTTCACCAACTTGT AGAACGTTTATCAACTGAACTTGACCAGATAACTGTACGCGTTGGACATA TTGATACTAATGCTGGTGTTGTTGAATCGCAGAGGAAAATTAATTTAACT GATGCCGTTAAAAATGCTGGTATTGGAGTAAAATGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000083_pilon | genome | sc0000083_pilon:1012041..1019530 - |
Properties
| Property Name | Value |
| Aaloc | 361-843:484 |
| Aaloc | 34-357:1011 |
| Aaloc | 1-30:7491 |
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