XLOC_016854 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_016854
Unique NameXLOC_016854
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000083_pilon:1012041..1019530-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_016854 ID=XLOC_016854|Name=XLOC_016854|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7490bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000083_pilon:1012041..1019530- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAAACTTTGGACAAAAGAACATATATTCAGGTAAATATTTTACATTTT ACACAAACTCAACAGAACCCTTTCGTATTGAAAAGTTTGTTTCTTTTGCC GTTTATTTTTGATTGGGTTAAACTCTTCTGGTCTGCAAGCTATAAAATAA TGCTGGCTAGAATGCAAAAACGGGTAAATGGCTACCGGAAGTTGGTCTAA TATCGACATCCCTTATCTAATTCCGACACCCTTGACAGGAATAATATGGA AAGCTTGAATCGCTGATTGAAAAAGGATTATTCCTCTCTGACCACTAAGC AAAATAAAACAGTTTCATCCTTTATCAATTTCAGATGATAAAAAGGGTGT TGGAATTAGAGGAGGGGTGTCGTCAACGCGACATTAGACCAAGTTACGGT ATAGGGTTGTCGGGAAACTTGCCTCAGTGCACAGCAGTGGAGGCAAACAT ACATAGGCTTCAAATGAATGACCTGTGGGCAAAATTATTTTAAAGGGAAC CAGAGACCACCTTGATTTCAAAAGGATATCATTAGGGAGGGGACTTAGAA AAAAACAATTAGTGGCATATGTACAAAAGCTGCCAAATTATATAAAAAGA AGAAAAAAATCAAAAATTTTGACCGGGGACCCTTTTCAGGGTCCCCCCGG GCCCCATTTCTGCGGGGTACCCAGCGCACCCCCGGACCAATAATAGCCTA ACACCAACTTTCTCAAAACATAGTCATGTGGCATATCAAATTATCAGAAA TTTTATGCTGATTCCAAAAAACATTAGTAGTAGGGGTCAGAAATAAAGCT AAAAAAAGTTATGACCATATCTTGGACCAGATTTTGAGTAAATTGCGTAA TTCGCAAGAAATTCGAATAGAATCTTGATTATGACTAACATTTCATGTAG TTAGTAGTTAAACTTTGACAAAATTCTGGTTTATTGAATGTAACTGTTTT CATGATATGAAGACATTTTCAGTTTTCTTTGGAGAAAAGGATTATGAATG TAGACAAGGATGGTGAAGCTGAGGTACTTCGAACAAGAGCAAAAGATATT TTATCAAGCCAGAAATTGCCAAGTAAAAAATCAAAACAAACACAGAGAAA TAAAAAGTTTTCAATTGCAAAGAGCATCACAAACTGCCACATCATGAGTG GACAGATAAATGTAAAGATTGTAATACCTGTGTTAATTTTGAGATGTTGG AAAGATAACCTTTGGATGTTCTATCAAATGCCAAGAAAGCGTTGGAATAT CTATTCACCACTAAGATGGTCAATACAGGAAAGAATAAGAATTTTGAAAA AACTGTTGCAAAGGGTGTTGTATTGAAATGGATTTTTTGCAATGTTTATC CAAAGAACTTTTGAACACTGGAGCACGATATCAAAAGATTATTATTACAA TTTTATAAATAATTAAAATAATATATAAATAGTTATGAATCATTGAAAAA AAGAAGCACTACGAAGAATCCAGATGATTACTGGCCTAAGTTTGAGAAAT ACAGCTTAAAGAATTGTTTGACATTATTGGCAAGATTTCTTTTTGATTAT TGAATAGTCAACTGCTAGGGCAAATTCTCTTCGAACTGACAGTGATATTC AATAGCGCTTCGTCGTGCAAACGTCACGATTATTACTTCTCTCATTTGAC CGAAATTCAATCCCACAATCCTTTTTTGTTTTAATTCAAAAGTCGTGAAA GTTCTTACTTTTTCTTTGTAATTGAGTGTAATTTGCGTGTAAGCATAATA AACGCAAAGGTTGACAGGATTGAATTTCGGTCAAACAGAAAAATCAATGT CTACTTTTAGATTCGCTACGGTATGCTATTCAATTGTTTAGGTATACAAG TTGAGTTTAATCCATAGACCATGATTTATGGCACCTTTAAAGTTTACATT TGCAGGATGCAGAATGAGGAGGCAGAATGGCAAGAGGTTGAATAATCAAG GGGGTGGGTTATCAAAATGGGTTAAAAATATATTTTGAAGGCACCAGATC AGCTACCAGTATCTAGTTCTAGTTCTAGTTATGTATTTGCATAAGACAAT TAAGCCTAATCTCGCAAATTCTACGTAAAAATTACAAAAATGAAAATATA TCTATCTCAATGGCAAGTCTTAAGAGCATCCTCAGGGAATTGGAAAGTTA AAAAAAGAGAGTCTATCAGTGAAATTGGTACAAAACCCTTCTACTGGCAT TTGTTCTTTGTTATTGTAAAATGTCCGGTCATTTTGCCACATTTTTACAT CCAGGTTGTTTCTTGTAGCCTTACCCTTTCTTTTGAACTTTTAAATTAAA TTTAGTACCAATCAATGACTGTACCCTACAATGCCTTTTCAAATAAAATG TAAACTTTAAAGGTGCCATCATGGTCTATGGATTGAACTCAACTTGTATA CCTAAACAAAAATTGCAAAGAATTGAATTGGATATCACTGTCAGTCCCAG GAGAGAATTTGCCCTAGCAATGGACTATTCAATAATCAAAGAGAAATCTT TCCAATAATGTCATACAATTCATTAACCTATTTGCTTTAAAAATCATCTG TTTTTTTGAAGTGCTTCTTTTTATTCAATAATTCATAATTATTTAATAAA TAATGTTTTAATATCACAATTTCTGGCTTCATAAAATATATTTTGCTCTT GTTCAATACAAAGTACCTCAGCTTCACATTCATAATCCTTCTCTCTAAAG AAAACTTAAATAAACCTGAAAATGTCTTCATATCATGAAAACAGTTACAT TCAATAAACCAGAATTTTGTCACAGTTTAACTACTAACTACATGAAATGT TAGTCATAATGAAGATTCTATTCGAATTTCTTGCGAATTATGCAATTTAC TCAAAATCTGGTCCAAGATATGGTCATAACTTTTTTTAGCTTTATTTCTG ACCCCTACTACTAATGTTTTTTGGAATCAGCATAGAATTTCTGATAATTT GATATGCCACATGACTATGTTTTAAGAAAGTTGGTGTTAGGCTATTTTTG GTCCGAGGTCGCGCTGAGTACCCCGCAGAAATGGGGCCGGGGGGACCCTG AAAAGGGTCCCCGGTCAAAAATTTTGATTTTTTTCTTCTTTTTATATAAT TTGGCAGCTTTTGTACATATGCCACTAAATTCTTTCTAATTTTCTTTTTT TAAGTCCCCTCCCTAATATCATGCATAAAGTGGAGATTGTCATTGAATGA TTTTAATTTCAGAGGATGCACAATAAAAAATGCTGAAAAATGAGAGCTCA CACAAGTCTGTTGTAGCACAAGCGAAACTAAAGTTATGGCATTTTAAAGC TCAAAAACTGCTGATTTTTTCCATGAAACAGAGTGTCACCCAAAATTTTG CATTGTTAAAGTGGTTAATAAATTGACACTGACTGATGATTATGCTATCA AAGTCATGATTTTTAGCCATAGCAACAATAACACTTTGAGAAAATCAAAA AGATTTTTGGTAACACTCAACCAATTTTTTAAATTTATCATGAATGCGGT ACACACGATATGAAACAGAATCGGCTGTAAAAATCTTATTCAACTTTAGA ACCCTATAGAGGGTTAATGGAAAGGTTTTCAAGATGGATCAAATGCTTAG ATTTTGATACAAAGTTACTGTATCAGCTTGAAAAATGTTTGAGGTGATAA GGTTAAGTGAAAATTTCATAATTTTTATTTCAGTAAAGTAAGATAATTTT CCGTCATTCCGTAACCAAAAATGATTTCTCAATTAAAAACCAGTCTTCCC CCAATGGCAATTAATTTATGCCTGGTTTGAAAGTACTCAGTAAGAGGTAG AAACTTGCCAAATATTTTACTCTAAAAATGTTTCCTTAAAACTTTACAGC ATTTTTAATTTTTCCGTCATTCCGTAACCAAGATTTTTAGAAAATAAAAT CCTCAATCGTTCAATCCAGGGAAGGCCAAACATGCTGTAAATGAGTTTTC TTGATCAATTGTTGGCCTATGTTGGATTTAGAATAACTAAAACTGCAGCA TTCATTGTATTTTTTGTGATAAGGCTTTGGCTGTTTTTTAGGCTAAAAAG CTTTAATTTCAAGGCTTTTTAGCCTGAAAAATGGCAAAATCAAGTTTCAG AAGTGCTGTAGCTCTAAAACAACTGCAAATGAGTTTAGGATACTATGAGA AATGATATATATAAATTTGAAAATGTTTACTGAAAAAAAATTTTCAGCTC TCAAATGCACTTTTTGGTTCCCTTTAAAATAATTTTGCCCCTGTCAGTGT AGACCTAAAGCTCTAAAACAGCATCTAATAACATGAAAACCAGAATATGA TTCTTCAATGGGAATCAAAACTATAAAGTGCACTTACAAACATCAATTTG TCAGATCTAACAAAATTAATAACCGCACTGTCATCATTGACAATAAAACA AACGATTTTCTGTCAAGAGCCTTGTAAACATTCCAACAACTTCCATCGAA ATGATTTATCACAGCTCAGTCTACCATTTTTAGCGTGGTCCGAGGATTGA GCCGAGAACACTCCGCGAACTCCTGCGCGGTTGAAAACTTCAATCTGTCA ATCATTTTCTCAAGCGAAGAGTACGCGAAGCGAATCTAGCTTTACGATAG TGCCGCAGGACATCAATGGATAGTATTCAATCATCATTATCCCTTTATTT TCATTTTTAGAACTTTTGCAAAAAAAAGGAAAAATAGAAAAGTTGTATTT TTTACTGCTTTATTCACATACTGAATTTGAAAGATCTTCTATGTGGCGTT TTTTTGCAAACTTCAAAAAACTGATTTTTGTCCCGCCTTTGCGGGACTTT GGCTTAAGTGCTTGAGTGCAGCATAGGGTACAAAGTCCAAACATGCGTTT CCCGTAATTTTTGTATGAAGAGTTAGGTCTATACTGCCTGTCTGGTCATT TAAATACAAACTTTAATCAAAACAAAAATGATAGAGTAGATCTGTCCATT TTTTTGGAAATTTTGCTGCTTTGATTGGCTTGGTCAGTCATTTGATGGCT ATGCATGTTTGCCTCCGCTGATGCAAGTTACCCGACTTCACGGTACGCAC TTGTCAAGGTCAAGATTTCTTTAGCCAAACAAGGAAGAATTTACAAAAAT GAACTTCAATGCATTGGGCCATTCCAGAATTTGTCTGTTACAGGGGGCGG ACAACACAGGATTTCCAAGGGCAAAAGTTTTCACCAAAATTCGAAATTTC CAAGGAGAGAGAAGTAAATGTATGAATTTGCAAGGCAGTTGAATTAAAAA AGGCAAAAAAGAGTGGAATTTCTAATGCATTTTGCCAAAGTACATAGATT TTTATCTGAATTTCCGACCACCACTCGAAAAGGAAAATTAGTTCCGATGC TAGAAAAAATTAAAAAATGAATTTTGGTAACAAAAATTTTCTGGAATGGC CCATTATTACTTACCTTTGTTGATCAACCAAATCTGATCATTCTTTTTTT TAAATCAATCAGAAATTTTCAGAGAAACAGGTAAAAAAAATCTTTTCTTT CCAAAATTATTGATAGGCTCCAACATCAAGGTGAAAACACAACTTAGCGC TGAGTTACAGCACCAGAAAATTCTTGACCCACATGGAAACAAATGACTGC CGCTAAGGCCGATGGAATTGGATTTCAAGTTTACTGTAAGATCCACTTTC CGAATTCGATGCGGGCGAGTTGTCATTATTCATCATTTTAAAACACACAC CTAACTTTATGTATGGAGATTAGGCCTTTAAATGACTCCTAGACTCCAGA CCTAAGCTAAAGCTATCATCATTATTTTTTTTTGATTTCATATCTTTTAA CACTACAGTAAAACAAAAAAAGCAAGACAGGTTTTTGAACATGCGTGCAG CTTATGGTAAACATAACATTAAATTCCATCTGCCTATGAGCTGGCTCAGG GTTTGAATTATAAATTTTAGGAGCTCTGCAATTTTTCCAAGCAAGGCACA ATGTTTGGGAAGCATTTTTAGTATTTTTTTATGTTTTTTTGGTGTTCAGA TCAATGTTTTGATTTGAAATTTACGTCATTTCACCGCAGAAGTAATTTAT ACTAAAGTAATTTGTTATCTGCATATTCAGAATTTTTCTGGAGCTTTGCC CTCTAAACCCCCACCAGCCCCCGCCAGAGCTTTGGTGCCCTGGACCCACA GGGGGTTTAAAGAAGCAGATACCCTTTCAGATATACTCAATCTAGATTTA TGAAAATGGCCCTAGTTCAAAGTGCTTAGAAAAATCCCTGATTTAGGGTT GATTGTGTAAACAATCAAATTGCACACCTCTGTTGGTCCCCAAAGGCAGT GAAGATGTAGAAAACAAAATTTAAAAAACTTCTGCAAAGTTTGGTATCAT TTATCAGCATTTATTGTATGAATTATTTTGTTAAGCTCAAATCTCCTTGT TTAATGTTTGTAAACTTTCTAAAAACAGGTTAACTAAAGTTTTTTTATTA ATGGTTTTTATCTTAATTTATAATTATAGCCACCCATGGAAAAATGTAAC AGAGGCAGCCTGGAAAAAGTACCCAAATGAACACAACACCAACGTCACTG CAATCGATGTGCTGGACAGGAAGGTTTCTGAAGATGGAAAACTGTCAACA ACTAGGATATTTGGGTCACATTGGAACTTCCCTGCTCTCCTAGCAACAGT TTTGGGACTGCCTGAAATGTGTTACGCAGTTGAACACTCAGAGGTTGACC TTAAAGAACAGAAAATGACATTGAAGATGGTCAATTATACATTTTTGGGA ATCTTAGCTGTTGAGGAGACACTTGTTTATCAAAAAGACAAAGAAAATCC TAATACGTAAGTATTTTTTATTTTGTTAAATGCTTTATTTAACGTGCTAG AAAGCTCTTAATTATGTAACCAGGAAATATGGGGTTCCTACTGTAAAGCT TGCTTGACCTATTTGCAAACAGTAAAATTGAAGCTAGAAAGGAAGCGCTA ATATTGGATTGATCAGGAGTCATGTTTTTTTTATCCCTTATCTCTTAACT TTTTAGAACATGTTTAACTCAAGATGCAAAGATCAGTGTACAAGGAATTT CATTCTCTGGCTATTTCGAAGACCTAGTCGTTTCAAACTATGATGTCAAT TCTGTCAAAGGACGTACCGCTATTGAACAAGTCGTTAACAAAATCAAAAT AGAGAACATACTTGATACCGTCAAAGAAGAACTTTGTGAATTGAAATTAG ACGTTGATAGTGCTACCACTAAATTAGATAACGAATTTCACGTCACTGAA AAATTACAAGCTCTAACCAAGGACTTAGACAATGCTACTGATTTGATAAA CACGGAACTCAGCAAATTTTCTAGTTATTTGAGTGAGGAATTTCACCAAC TTGTAGAACGTTTATCAACTGAACTTGACCAGATAACTGTACGCGTTGGA CATATTGATACTAATGCTGGTGTTGTTGAATCGCAGAGGAAAATTAATTT AACTGATGCCGTTAAAAATGCTGGTATTGGAGTAAAATGA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000083_pilon:1012041..1019530-

>XLOC_016854 ID=XLOC_016854|Name=XLOC_016854|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1686bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000083_pilon:1012041..1019530- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAAACTTTGGACAAAAGAACATATATTCAGATGAAACTTTGGACAAAA
GAACATATATTCAGCCACCCATGGAAAAATGTAACAGAGGCAGCCTGGAA
AAAGTACCCAAATGAACACAACACCAACGTCACTGCAATCGATGTGCTGG
ACAGGAAGGTTTCTGAAGATGGAAAACTGTCAACAACTAGGATATTTGGG
TCACATTGGAACTTCCCTGCTCTCCTAGCAACAGTTTTGGGACTGCCTGA
AATGTGTTACGCAGTTGAACACTCAGAGGTTGACCTTAAAGAACAGAAAA
TGACATTGAAGATGGTCAATTATACATTTTTGGGAATCTTAGCTGTTGAG
GAGACACTTGTTTATCAAAAAGACAAAGAAAATCCTAATACCCACCCATG
GAAAAATGTAACAGAGGCAGCCTGGAAAAAGTACCCAAATGAACACAACA
CCAACGTCACTGCAATCGATGTGCTGGACAGGAAGGTTTCTGAAGATGGA
AAACTGTCAACAACTAGGATATTTGGGTCACATTGGAACTTCCCTGCTCT
CCTAGCAACAGTTTTGGGACTGCCTGAAATGTGTTACGCAGTTGAACACT
CAGAGGTTGACCTTAAAGAACAGAAAATGACATTGAAGATGGTCAATTAT
ACATTTTTGGGAATCTTAGCTGTTGAGGAGACACTTGTTTATCAAAAAGA
CAAAGAAAATCCTAATACAACATGTTTAACTCAAGATGCAAAGATCAGTG
TACAAGGAATTTCATTCTCTGGCTATTTCGAAGACCTAGTCGTTTCAAAC
TATGATGTCAATTCTGTCAAAGGACGTACCGCTATTGAACAAGTCGTTAA
CAAAATCAAAATAGAGAACATACTTGATACCGTCAAAGAAGAACTTTGTG
AATTGAAATTAGACGTTGATAGTGCTACCACTAAATTAGATAACGAATTT
CACGTCACTGAAAAATTACAAGCTCTAACCAAGGACTTAGACAATGCTAC
TGATTTGATAAACACGGAACTCAGCAAATTTTCTAGTTATTTGAGTGAGG
AATTTCACCAACTTGTAGAACGTTTATCAACTGAACTTGACCAGATAACT
GTACGCGTTGGACATATTGATACTAATGCTGGTGTTGTTGAATCGCAGAG
GAAAATTAATTTAACTGATGCCGTTAAAAATGCTGGTATTGGAGTAAAAT
GAAACATGTTTAACTCAAGATGCAAAGATCAGTGTACAAGGAATTTCATT
CTCTGGCTATTTCGAAGACCTAGTCGTTTCAAACTATGATGTCAATTCTG
TCAAAGGACGTACCGCTATTGAACAAGTCGTTAACAAAATCAAAATAGAG
AACATACTTGATACCGTCAAAGAAGAACTTTGTGAATTGAAATTAGACGT
TGATAGTGCTACCACTAAATTAGATAACGAATTTCACGTCACTGAAAAAT
TACAAGCTCTAACCAAGGACTTAGACAATGCTACTGATTTGATAAACACG
GAACTCAGCAAATTTTCTAGTTATTTGAGTGAGGAATTTCACCAACTTGT
AGAACGTTTATCAACTGAACTTGACCAGATAACTGTACGCGTTGGACATA
TTGATACTAATGCTGGTGTTGTTGAATCGCAGAGGAAAATTAATTTAACT
GATGCCGTTAAAAATGCTGGTATTGGAGTAAAATGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_016854XLOC_016854-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000083_pilongenomesc0000083_pilon:1012041..1019530 -
Properties
Property NameValue
Aaloc361-843:484
Aaloc34-357:1011
Aaloc1-30:7491