|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000312_pilon:179989..181932- Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_016727 ID=XLOC_016727|Name=XLOC_016727|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=1944bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000312_pilon:179989..181932- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CCACGTTTTAAAGATTTGTTTTTGTTCGTTGAAATGGAAATGACAGTTGC
AAGTGATCCTCTGTTTTCTAAAGAAGCACTTAAGGAGCGTTTTCCAAGTG
ATTCCAAAAGCTCTGGTTTTTCTGGTAGTTTTAAGCCAAGAAAGTATTTT
GATAATAAATCTCCAAAAAGTTTTTTATGTGTCACTTGCAATGTCAACCA
TGATATTGAGGCTTGTCCAACATTTAGATCCAAAACTCTTGAAGAAAAGT
CCAAATTTTTTATGAAAGAGAGATTGTGTTTTGGTTGTCTTGGTAAAGGC
CATATATCTGCTCAGTGTAGAAATCGAAGAACTTGTGTTGTTTGTAACAA
AAGACATCCTACAACTCTTCATGGTTTGAGAATTGAGCGTAGACCACCTG
CTGATGATTCTAAGAAAACAGATTGTGATGTTAGACCTTCTCCTCCAGTG
CCACGACCAAGGCCTGATATAGCTAAGTTTGATGATTCGAAATCAAAACC
TGAAACAAAAGGTACTAAAGGAGGTGTTAAATGTGGAGTTCTGAATAACA
GTGCTAATAAAAATCTCAGTATGTGTGTTGTACCAGTTCCTCTTCGACAT
GATCATTCAAAGTCTGATATTGTAACATATACTCTTCTTGATACCTGTTC
TCAAGCTTGCTTTATTTCTGACGAAATTGTTTTTTTGATGTCATTGAAAA
CTATAAGTACTGAATTGAGCATTAACACGATAACATCTGTCAAGTCTGAG
AAGTGTCAAGTGGCTTGTGGATTAAGAGTGAAAGGTCTTCATGCTGGTGA
TGGTAGTTGGTTATCTCTGCCGAAGTGTTTTAGTAAACCTAATATTCCTG
TTGATTCCAGTGAGATTCCGACAGCTGACTCTATAAAAGAATGGCCTTAT
CTTAAATCTATTGAAAATGAGCTTCCTAATACAACGTCTTTAAAGGTTGG
AATTCTGATTGGTGCTAATTGTTTGAAAGCTATCGAACCTTTGAAAGTTA
TACCAAGTCAGGATGATGGCCCATTTGCCTTTAAAACTAAGCTTGGTTGG
TGTGTTGTTGGACCTATCAGTTCGTCAAGGTCATCAGATACTATTTCTTG
TTGCAGAGTCATGGTTAATGATCATGGTAGATCGAACCATCTTGTTGTTG
AAGAAACACAGGTTAAAGACTCTGGAATTGAATCTATGCTAAAAAATCTT
TTTGATATTGAAAGTGTTCCTAAAACTAAGTTATCTACTGAGTACGAATC
TTTTTCTCAAGATGATTTACACTTTCTAGAAATTGTTGAAAATCGTTCTG
AATTCATTGATGGACACTATCATGTACCTCTGCCCTTTCGTAACGAAAAT
ATTAGCTTTCCAGATAATCGTCCTCTAGCTCTGAAAAGGTTGAGTTTGCT
GAAGAAAAAGTTTGAATCTTCTTCAAAATTTCACTCTGACTATGTTGCCT
TTATGAAATGCAAATCTACTGAACGTGTGCTAGGTGTTTTGTGGTCCCTA
GAAGATGATGTTTTCCAGTTCAAAGCTCCTTCTAATGTTTTCTCAAGATC
TCGTAGAGGGATGTTATCAGCATTGAATTCAATCTATGATCCTTTGGGTT
TGATTTCTCCTTTCATTCTTAAGGGAAGACTTATCTTTCAGACAGTGTGT
CAGCTTTCAATCGGTTGGGATGATCCAGTTCCTAACGAGTATCTCATTCA
ATGGGATAAATGGGTTGAATCTTTAGTAAATTTACAAGTGCTCAGTGTCA
GTCGTTGCTTTAATGCAAGAAGTTTTACTCGAATTGTTGAAATCAGTTTA
CACCACTTTTCTGATGCTTGTTATTATGGTTATAGTGGTTCTCATTACTT
AAGATTTGTAACGTCTGATAATTATGTTCATTGTTCTTTGGTGATGGGTA
AATCTCGCGTTGTCCCAGCTAAAAGTAATCACACTATGCCTCGT Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000312_pilon:179989..181932- >XLOC_016727 ID=XLOC_016727|Name=XLOC_016727|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3888bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000312_pilon:179989..181932- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CCACGTTTTAAAGATTTGTTTTTGTTCGTTGAAATGGAAATGACAGTTGC
AAGTGATCCTCTGTTTTCTAAAGAAGCACTTAAGGAGCGTTTTCCAAGTG
ATTCCAAAAGCTCTGGTTTTTCTGGTAGTTTTAAGCCAAGAAAGTATTTT
GATAATAAATCTCCAAAAAGTTTTTTATGTGTCACTTGCAATGTCAACCA
TGATATTGAGGCTTGTCCAACATTTAGATCCAAAACTCTTGAAGAAAAGT
CCAAATTTTTTATGAAAGAGAGATTGTGTTTTGGTTGTCTTGGTAAAGGC
CATATATCTGCTCAGTGTAGAAATCGAAGAACTTGTGTTGTTTGTAACAA
AAGACATCCTACAACTCTTCATGGTTTGAGAATTGAGCGTAGACCACCTG
CTGATGATTCTAAGAAAACAGATTGTGATGTTAGACCTTCTCCTCCAGTG
CCACGACCAAGGCCTGATATAGCTAAGTTTGATGATTCGAAATCAAAACC
TGAAACAAAAGGTACTAAAGGAGGTGTTAAATGTGGAGTTCTGAATAACA
GTGCTAATAAAAATCTCAGTATGTGTGTTGTACCAGTTCCTCTTCGACAT
GATCATTCAAAGTCTGATATTGTAACATATACTCTTCTTGATACCTGTTC
TCAAGCTTGCTTTATTTCTGACGAAATTGTTTTTTTGATGTCATTGAAAA
CTATAAGTACTGAATTGAGCATTAACACGATAACATCTGTCAAGTCTGAG
AAGTGTCAAGTGGCTTGTGGATTAAGAGTGAAAGGTCTTCATGCTGGTGA
TGGTAGTTGGTTATCTCTGCCGAAGTGTTTTAGTAAACCTAATATTCCTG
TTGATTCCAGTGAGATTCCGACAGCTGACTCTATAAAAGAATGGCCTTAT
CTTAAATCTATTGAAAATGAGCTTCCTAATACAACGTCTTTAAAGGTTGG
AATTCTGATTGGTGCTAATTGTTTGAAAGCTATCGAACCTTTGAAAGTTA
TACCAAGTCAGGATGATGGCCCATTTGCCTTTAAAACTAAGCTTGGTTGG
TGTGTTGTTGGACCTATCAGTTCGTCAAGGTCATCAGATACTATTTCTTG
TTGCAGAGTCATGGTTAATGATCATGGTAGATCGAACCATCTTGTTGTTG
AAGAAACACAGGTTAAAGACTCTGGAATTGAATCTATGCTAAAAAATCTT
TTTGATATTGAAAGTGTTCCTAAAACTAAGTTATCTACTGAGTACGAATC
TTTTTCTCAAGATGATTTACACTTTCTAGAAATTGTTGAAAATCGTTCTG
AATTCATTGATGGACACTATCATGTACCTCTGCCCTTTCGTAACGAAAAT
ATTAGCTTTCCAGATAATCGTCCTCTAGCTCTGAAAAGGTTGAGTTTGCT
GAAGAAAAAGTTTGAATCTTCTTCAAAATTTCACTCTGACTATGTTGCCT
TTATGAAATGCAAATCTACTGAACGTGTGCTAGGTGTTTTGTGGTCCCTA
GAAGATGATGTTTTCCAGTTCAAAGCTCCTTCTAATGTTTTCTCAAGATC
TCGTAGAGGGATGTTATCAGCATTGAATTCAATCTATGATCCTTTGGGTT
TGATTTCTCCTTTCATTCTTAAGGGAAGACTTATCTTTCAGACAGTGTGT
CAGCTTTCAATCGGTTGGGATGATCCAGTTCCTAACGAGTATCTCATTCA
ATGGGATAAATGGGTTGAATCTTTAGTAAATTTACAAGTGCTCAGTGTCA
GTCGTTGCTTTAATGCAAGAAGTTTTACTCGAATTGTTGAAATCAGTTTA
CACCACTTTTCTGATGCTTGTTATTATGGTTATAGTGGTTCTCATTACTT
AAGATTTGTAACGTCTGATAATTATGTTCATTGTTCTTTGGTGATGGGTA
AATCTCGCGTTGTCCCAGCTAAAAGTAATCACACTATGCCTCGTCCACGT
TTTAAAGATTTGTTTTTGTTCGTTGAAATGGAAATGACAGTTGCAAGTGA
TCCTCTGTTTTCTAAAGAAGCACTTAAGGAGCGTTTTCCAAGTGATTCCA
AAAGCTCTGGTTTTTCTGGTAGTTTTAAGCCAAGAAAGTATTTTGATAAT
AAATCTCCAAAAAGTTTTTTATGTGTCACTTGCAATGTCAACCATGATAT
TGAGGCTTGTCCAACATTTAGATCCAAAACTCTTGAAGAAAAGTCCAAAT
TTTTTATGAAAGAGAGATTGTGTTTTGGTTGTCTTGGTAAAGGCCATATA
TCTGCTCAGTGTAGAAATCGAAGAACTTGTGTTGTTTGTAACAAAAGACA
TCCTACAACTCTTCATGGTTTGAGAATTGAGCGTAGACCACCTGCTGATG
ATTCTAAGAAAACAGATTGTGATGTTAGACCTTCTCCTCCAGTGCCACGA
CCAAGGCCTGATATAGCTAAGTTTGATGATTCGAAATCAAAACCTGAAAC
AAAAGGTACTAAAGGAGGTGTTAAATGTGGAGTTCTGAATAACAGTGCTA
ATAAAAATCTCAGTATGTGTGTTGTACCAGTTCCTCTTCGACATGATCAT
TCAAAGTCTGATATTGTAACATATACTCTTCTTGATACCTGTTCTCAAGC
TTGCTTTATTTCTGACGAAATTGTTTTTTTGATGTCATTGAAAACTATAA
GTACTGAATTGAGCATTAACACGATAACATCTGTCAAGTCTGAGAAGTGT
CAAGTGGCTTGTGGATTAAGAGTGAAAGGTCTTCATGCTGGTGATGGTAG
TTGGTTATCTCTGCCGAAGTGTTTTAGTAAACCTAATATTCCTGTTGATT
CCAGTGAGATTCCGACAGCTGACTCTATAAAAGAATGGCCTTATCTTAAA
TCTATTGAAAATGAGCTTCCTAATACAACGTCTTTAAAGGTTGGAATTCT
GATTGGTGCTAATTGTTTGAAAGCTATCGAACCTTTGAAAGTTATACCAA
GTCAGGATGATGGCCCATTTGCCTTTAAAACTAAGCTTGGTTGGTGTGTT
GTTGGACCTATCAGTTCGTCAAGGTCATCAGATACTATTTCTTGTTGCAG
AGTCATGGTTAATGATCATGGTAGATCGAACCATCTTGTTGTTGAAGAAA
CACAGGTTAAAGACTCTGGAATTGAATCTATGCTAAAAAATCTTTTTGAT
ATTGAAAGTGTTCCTAAAACTAAGTTATCTACTGAGTACGAATCTTTTTC
TCAAGATGATTTACACTTTCTAGAAATTGTTGAAAATCGTTCTGAATTCA
TTGATGGACACTATCATGTACCTCTGCCCTTTCGTAACGAAAATATTAGC
TTTCCAGATAATCGTCCTCTAGCTCTGAAAAGGTTGAGTTTGCTGAAGAA
AAAGTTTGAATCTTCTTCAAAATTTCACTCTGACTATGTTGCCTTTATGA
AATGCAAATCTACTGAACGTGTGCTAGGTGTTTTGTGGTCCCTAGAAGAT
GATGTTTTCCAGTTCAAAGCTCCTTCTAATGTTTTCTCAAGATCTCGTAG
AGGGATGTTATCAGCATTGAATTCAATCTATGATCCTTTGGGTTTGATTT
CTCCTTTCATTCTTAAGGGAAGACTTATCTTTCAGACAGTGTGTCAGCTT
TCAATCGGTTGGGATGATCCAGTTCCTAACGAGTATCTCATTCAATGGGA
TAAATGGGTTGAATCTTTAGTAAATTTACAAGTGCTCAGTGTCAGTCGTT
GCTTTAATGCAAGAAGTTTTACTCGAATTGTTGAAATCAGTTTACACCAC
TTTTCTGATGCTTGTTATTATGGTTATAGTGGTTCTCATTACTTAAGATT
TGTAACGTCTGATAATTATGTTCATTGTTCTTTGGTGATGGGTAAATCTC
GCGTTGTCCCAGCTAAAAGTAATCACACTATGCCTCGT
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000312_pilon | genome | sc0000312_pilon:179989..181932 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1-1944:1945 |
|
