XLOC_016581 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_016581
Unique NameXLOC_016581
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000342_pilon:151147..159789+

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_016581 ID=XLOC_016581|Name=XLOC_016581|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=8643bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000342_pilon:151147..159789+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AAGCTCATCAGTATTTTCATCAACAtattcatatttgtatttttcaggga aaaaataaataaacaacaacaacaaaaacaaaacaaattatgaAATTGGT ATGGGCGTTTGGATTGCTCTTGATTTTCCTTATTGGTTCATGCCACGCAG TTGATGATGTTGTTGCCGCAGCACCAAGTGAAAAACAGGTATGACTTTCA ATTCCTTTAGTAGGTAAATTTTGTGACCGTTTTCGAGGTGACCCGAATGC TTCCTTTTCTTTAGATATCTACCCGAAAGTAGGGAAGGGCGCTATcactt tccctggatttctctacCATGCTACGGCCGACTCCTTTCATATGAGAAAT TTAAAACTATTTTGGACACTTTTTACAGTGATTTTAGGGATGTATATGTT ATCTATGGTAtgggtaatttttttaatcgggTTTAACACAGCTCTCAATT TTAGCGAAGGTGGACTTTCAATAACAGAAGTGAAACAGTTTGGTTGAGAT ATTTATTTGAAATACTctttaaggttttatttttacattagtgtccccgt ttcatatcagacacatatttcatatcaggacagtgtctgcctatttttat tttactctttctaaccaatcttattccacatctgtgtcaatcccatgtga aaaaagcttgtgaatgaaaattgacgagtaagcaaaggATATTactcttt tttttcacttttaaaattattttgggaATGAACTCGTTGGCTTTATCCTC TTTGCTTTGGAAATCTTAAAATCCATTCAGAAATCTATcctgttttgaaa taaaaaatcagacCCTCTACCATGCACACACACTTTACATTccgaaagat tttttcaatccCTTAATTTATGTTCTttcattctttgtttttttttgttt ctccaGAAAGTCACAGTGAGCGGTGACAAACACGATGGAGAGGGTGGACA 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GCTCTGTTTTTACAGATTTATGCGAAATACCGtatcaaacaaaagaaatc tcaaCAAGTGACGAATCCACGTGAACAATCTGATATGGCTTAA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000342_pilon:151147..159789+

>XLOC_016581 ID=XLOC_016581|Name=XLOC_016581|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2962bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000342_pilon:151147..159789+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AAGCTCATCAGTATTTTCATCAACAtattcatatttgtatttttcaggga
aaaaataaataaacaacaacaacaaaaacaaaacaaattatgaAATTGGT
ATGGGCGTTTGGATTGCTCTTGATTTTCCTTATTGGTTCATGCCACGCAG
TTGATGATGTTGTTGCCGCAGCACCAAGTGAAAAACAGAAGCTCATCAGT
ATTTTCATCAACAtattcatatttgtatttttcagggaaaaaataaataa
acaacaacaacaaaaacaaaacaaattatgaAATTGGTATGGGCGTTTGG
ATTGCTCTTGATTTTCCTTATTGGTTCATGCCACGCAGTTGATGATGTTG
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TCGCCACATGCACCATTGGTCTTCAAGTATCTTACCTAACGTGGGGTGTG
CTCCAAGAGAAAGTGATGACACACAAGTACGGGGAAGGCACACAAGCCGT
CAAATTCAAGAACTCCGAATTCCTCGTCTTCATGAACCGTATCGCAGCTT
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TTGGTGTCAATACGAAGCGTTGCGATTTGTCAGTTTCCCGACGCAGGTAC
TTGGGAAAGCCTCCAAGATGATTCCTGTTATGATCATGGGTCGTGTGGTT
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CTACGGAAACTACCGTGTCCGGCTTAATTCTAATGATCGGATATATGGGT
TTTGATAGCTTCACAGCCAATTGGCAATCGCATATGTTTACCGAATATAA
AGTGCCATCCATGCAGATGATGTTTAACGTGAATTGTTTCTCCTGTTTAT
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AACATCGGTGACAGGCCAAATGTTTATTTTCTACACTCTTGCTGAGTTTG
GACCGCTTGTTTTTACAACCATAATGGTGACACGGAATATGTTGAGCATT
TTATTGTCTTGCATTATTTATGGTCATGTTTTAACTTCACAAGCTGCTTT
GGGTGTTTCCGTTGTATTCTGCGCTCTGTTTTTACAGATTTATGCGAAAT
ACCGtatcaaacaaaagaaatctcaaCAAGTGACGAATCCACGTGAACAA
TCTGATATGGCTTAAGTCTTCAAGTATCTTACCTAACGTGGGGTGTGCTC
CAAGAGAAAGTGATGACACACAAGTACGGGGAAGGCACACAAGCCGTCAA
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TTGTTGCTGGGCTATATATCCAAATCACACGGTCAGGCCAATGGAACGGA
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GTGTCAATACGAAGCGTTGCGATTTGTCAGTTTCCCGACGCAGGTACTTG
GGAAAGCCTCCAAGATGATTCCTGTTATGATCATGGGTCGTGTGGTTTCT
AAGAAAACGTACCAATATTATGAATACGTTGTGGCACTTATGATTTCAGT
TGGCGTTTCCCTCTTCTTAACGGCTACCGGCTCCGATAAACACAACTCTA
CGGAAACTACCGTGTCCGGCTTAATTCTAATGATCGGATATATGGGTTTT
GATAGCTTCACAGCCAATTGGCAATCGCATATGTTTACCGAATATAAAGT
GCCATCCATGCAGATGATGTTTAACGTGAATTGTTTCTCCTGTTTATTCA
CCTCAGTACCGTTACTCATCTCGGGCGGCATGACTTACGCCCTGGCGTTT
ATGATGGTCCACCCATCTTTTGCCACTCACGTTGGTATTATCTCCTTAAC
ATCGGTGACAGGCCAAATGTTTATTTTCTACACTCTTGCTGAGTTTGGAC
CGCTTGTTTTTACAACCATAATGGTGACACGGAATATGTTGAGCATTTTA
TTGTCTTGCATTATTTATGGTCATGTTTTAACTTCACAAGCTGCTTTGGG
TGTTTCCGTTGTATTCTGCGCTCTGTTTTTACAGATTTATGCGAAATACC
GtatcaaacaaaagaaatctcaaCAAGTGACGAATCCACGTGAACAATCT
GATATGGCTTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_016581XLOC_016581-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000342_pilongenomesc0000342_pilon:151147..159789 +
Properties
Property NameValue
Aaloc556-1500:7699
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Aaloc208-408:907
Aaloc94-207:75
Aaloc19-90:1