|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000342_pilon:151147..159789+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_016581 ID=XLOC_016581|Name=XLOC_016581|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=8643bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000342_pilon:151147..159789+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) AAGCTCATCAGTATTTTCATCAACAtattcatatttgtatttttcaggga
aaaaataaataaacaacaacaacaaaaacaaaacaaattatgaAATTGGT
ATGGGCGTTTGGATTGCTCTTGATTTTCCTTATTGGTTCATGCCACGCAG
TTGATGATGTTGTTGCCGCAGCACCAAGTGAAAAACAGGTATGACTTTCA
ATTCCTTTAGTAGGTAAATTTTGTGACCGTTTTCGAGGTGACCCGAATGC
TTCCTTTTCTTTAGATATCTACCCGAAAGTAGGGAAGGGCGCTATcactt
tccctggatttctctacCATGCTACGGCCGACTCCTTTCATATGAGAAAT
TTAAAACTATTTTGGACACTTTTTACAGTGATTTTAGGGATGTATATGTT
ATCTATGGTAtgggtaatttttttaatcgggTTTAACACAGCTCTCAATT
TTAGCGAAGGTGGACTTTCAATAACAGAAGTGAAACAGTTTGGTTGAGAT
ATTTATTTGAAATACTctttaaggttttatttttacattagtgtccccgt
ttcatatcagacacatatttcatatcaggacagtgtctgcctatttttat
tttactctttctaaccaatcttattccacatctgtgtcaatcccatgtga
aaaaagcttgtgaatgaaaattgacgagtaagcaaaggATATTactcttt
tttttcacttttaaaattattttgggaATGAACTCGTTGGCTTTATCCTC
TTTGCTTTGGAAATCTTAAAATCCATTCAGAAATCTATcctgttttgaaa
taaaaaatcagacCCTCTACCATGCACACACACTTTACATTccgaaagat
tttttcaatccCTTAATTTATGTTCTttcattctttgtttttttttgttt
ctccaGAAAGTCACAGTGAGCGGTGACAAACACGATGGAGAGGGTGGACA
TGACCACGCGCATCACATCCCGCATCGCGTGCACAACGAGGAAGAAGAGT
CATGGGTTCAGGGATTCGTATGGAATATGGTCGGATATTTGATCATCATT
ATACCCGCGTCTTTTCTCATCCGAATggtcaaaaattcaaacttcaaAGA
GCAAGGAGGTGAGAATGGTCTAAATCTACACGAACTATTCTACATGGATA
GCTATGGTAGATTCTAGTACCGTACAATGGctaaactttcttttttcccG
GTTAAACTTTcctattagcgagtttatgtatttgcacttttgaggacggt
aaagtgactgaagcgatttagaaTAACCCGCAATTCtaccccgcaaaatc
gaggacggttaaagtgctgatttaccgtcgtcctcagttggtcatgatct
agtcaaattagaaccttaccgtctccgtcgctgaaaaacacacatacata
cataaactcgctattgccACTTTAACAACGGAAAATTCCAACACTTGCTA
GGCGGTCAGTCACAAGGCTGTTGTGTATTATCTACGCCTTAGTACGCTGC
gaaaaaaaacagcagaaagaTCCTGGAAATGCAAGGAATGTTTCCCCAGG
ATTGAAAAGCTTTAGGCAGCCtacggtgcatttttttgttttcaattttg
aagacCGACCCTTGGTCTATTACGTTTTGTGTATTTTACCTTCCACTGAT
AGGACGTCCGTTCCTTACTGTAATTCACCAAGTGACGTCAATCTCTCTCG
TGATTCCTGagtgcaatatttgcaaaaagttACAAATAAGAAATGGTGCT
GGGAATAAAACAAAACCatagatttataaagcccgaagggctagatggag
tgctttaagctcttccaagcaaaaaagtgaatattgcaaaaaatattgct
gctattgctTTCGAAAACcagcgaagcttctgattggtgaaGCGCTGAAA
TGTCACGTGGCTTAGGTATGATTTCCTAtttaacctcggcacacttttca
gcaaaagcacgatatctagcccttcgggctttataaatctatgaacAAAA
CCCGTTCCCGTCTATTACAAgctattttatttataaaaacaaaacaaata
gaAAGATTCCTTTTATATGTCCGTTTCTTCCGGCAAAAGTTTACGTTCAG
GCTAGAAATAAATACATCGGAAgctgtgaaaaatttgaaaagaagtggaa
tctctataactcaaacATGCACAAGGAACGCGACCGTAGcataaaggtag
agcatccagctacggtgcgctaggttgtgggttcgatccccagccgggtc
ataccaaagattcccaaaatggcacttgatgcctctctgcttgatgctca
gcaactaaagagacggatcaagggtactttaatgggatgaattttcgcgg
ggattaaatttcgcggttgagcttagtctgattcgcagacctatacttcc
tataggtctgcttaatagtGTATGGATTGGTTTCCCGCTACGGTGGCTCT
TATGGTGGCTGACTCGTGCTATTTGGCGAGTTGCTAAGTTTTATGGGAAC
TCGAATGCGAgttaaaagataaacaaaagaaatcaaagtgaagacattcC
AGTGTCAGACGGATTCCATTTTGCCACAGGCACgccttttcgaatgtttc
ttttattttcgaatgatttttttctattttcgaatgttttttttattttc
gaatgttttgatattagagCTTTGAGTCaacgaatttgaatttctcaaaa
actttgaaagaaaatttcactATATATAAACTATTTGTTTCTAAAGAACC
TCTTCAGGTTAGTTAAATGAGACATATTGGGTTtcatcaataaaactgat
tccaACATTCTTCCCGTCCCTGTCAAAGtttaacaaaacaaagaataacA
GAATCTGCTGCTGCACTTTTTCAAACACTGTAAGTAGacacaaaaaaagt
aaaagggAAGAAGGCTCTCTGGAAAGAGATAAAGCCACAAAATAATATTA
CTACTAGATACTTACAACAACAATCTTTCCCTATCATAAGCTTCTAAAAT
AACCACATACCTGTCAATACCTGTTACTGTATCTTTTCTACATTCGTTca
aaacgaacaaaatgtccaccaaaacaaatcaaaattccaCATTATAAGCT
TGATAACAAATGTTCTAGACGGTAATTTTTTCTTGGTACACATATTATAT
ACTCTAAAACTTGTAATTGTATTAACAAAACTTCTTTCGCCTTAAACAAA
CTACcccaaatcaaaaacaagtacTCGAGCTTGACGAAAACCACTTCCCG
CTTCGAcggccatcttgaatttgaacagCGAAAGCTATGCTACTTCGTAA
CAGGTAGAGTACCTTTGCAAATTAATCATCATAAGCACTCGCCAGCAAAA
ATAGCCTTCTCGCCGAATTTCGGCGAGAAGCGGCATTTTGTGGGAAAGAG
GATTTACCGAGTATTAAgcagcctctataagaaacttttttcgctagagg
atgagcagaagcctaggttgagctcatccgcgaaatttaaaatttcacgg
ggattaattttcgcggatgaggcatttcctgatttttcgcggggatttaa
tctcgcggattggggtacaaatttttgaaaagggtcaaaacattaaaata
aaatttttccaggaaaataaataattttttttcaagtaataagagggtgt
tttggaatagggcgaggagatatgtattacaaagAACACTGTTTGCAAAT
GCTGCTGCCAAAACAAAGCGTTCGAGTAAACCAGAAAACCCATCTGTTAT
CCCGAAGACATCTAATGCGCCTATTTTGTTagactagtcatagctttcac
taaatgcccacgcagaagatcatgtcatgcacttataaactttttaatgc
tttaaaaattaaaacattaaaaataatcagaaataattgattgatttaat
tattgaatgattgattaattgattgaggcatatgcttgaaaaaaattata
ttccattaacacaatacttgaagaattcctgcagcttgataatttgataa
atttaaggaaaagcttctcacaaatatatttcaaaaattatggtataaTT
AGCATactggttttcacatctcctgtttgtttttttctcccagtttctat
cttacaacaatatatgtcatgattattactcacaatagaccttttctgat
aatgccgcagacattTTAGATTGTAGGCGAAATATATAGtagtgaataaa
tcaacaaggtaaccaatcagaaatagcttgtttttttcattggctgctat
atttcaacaattctctattgcaactttgcctaataaacaatagtcaagag
gatactgcgtatgaaatttatcaaaaagttctgcgccatcttaaataggg
tgaactagaaaccaatcctagttaaggcccggcctccacttgcgtacgct
gtgattgcacttctcaaacaaaatcttctattttatcggtcaaaagaaaa
ataaaggaatgccattgtggtccattcagacgtacagtcgagaaaagttg
aaatgcgcctaaattttttttcaagtgcatagtactttttcatgatgcaa
tcttttctccaagctgaaaggattgaagccattaggatgatcgcagcgca
gacgaTGAAGAGACGtggtgccttcaggaagctagactttttgagtttat
agctatatatactttcactttatggtgtttctatatgactgtctgtgtac
ctagtctaaccaccgttaaatgccttcgggaaggtccatcctaacttgga
aagccagaattggagttATTTTaacaaaccactggagcgtaagttattta
gaaaaagttgaatatgcgcatgtaaagttaaacgaatgttaacaaacttt
tttcaggttttttaaatagattttaccacactgaaaaaacagtgaataca
ctctaagtgaggtaaatctatattgaagaccaaaagaaaaagtttgttta
cattgattgacattcaacattcattcaaccacttttggattcaactttac
atatggccatatgcatacattcaacattcttgtactttgccggtatcttg
ttttactaagttaagaaggactttctcgagttacgaccatatgatggtat
ttaaagcttaATAAGCTCTAtaaacaataaagctagttattaatataata
acagacaaagataaattacagtttgaacaaaaatatcaaatgtacgtaca
tttaaaaaaaacttgagcaaatttctttaaagattccagaaaaagaattg
aaatcattgctgaaatgaacttctgactaaattacagtatttagtattca
gtttcaaagacaagaaacaaaatttgacatacaaaacactttttccagta
aATGAATCAGCtaatcatcataaccagtctaccattttgtttgttttgat
ttgcacaagtaatattgtaattcgtgttatatcatacactgttataattt
catttataacactcgcttcagcttttcaaggctaaatcaaaactaataaa
ttgtaatatgtattaatggtaatagcatataacgtaatatgaaataATGC
ATACTACTGTCCCGaaaaaaaacccgaacatttacggaagagactaacta
cggagatgcttgcgcgacaaaacacaaaaacaacaaaaacaacaaaattt
cgagattccagtccaatatctatgcgtgaaactatgagtgcctcctcgtc
gctgcgctcctgcgggggcaattaggAAGTTTTTTAACTTGTTAAAACAG
AGATAAATAAAATGACTCAAATGACTTGTTGTTTCGTTATTTTCACTCTT
Tcttatcattgaaaataaattcttttgttttccgttttccctccttttcc
ttttcttacatatccttttaaatgtttaaaggaaacgacgcatggtatat
ttatgaaatgttGATCTAGTATTGGCACAAACATCCATACggagtattta
ggagtgcTGGAtcataacaaaaaccaaaagtgactttattccaaaaatat
atattcaaaaaagtgaatgtaatctactataatgttcaacaacaacacaa
aaaggcatacaggaaaactgaaagaaaaaaagaatgtctttttcttttga
atgaaatcgagtgtttctatttttaaatgaaaacattctattgtgaattt
attcgaaaacttctttgcaatctttttgtttatattttgtcttcattcac
tttcgtttactgttgaaaacataacaaagttttagctatactctTAAATC
GCGTATAACTgtcggttaagccaatcagctttcgggctgacatcagcatg
tatttcagagtataccatggaagTGCCACAAAAtccgacccctactataa
gtatagcgctataacctttaatttcaagccagttggattaccctcttgca
ttgaaaagctattaacaataagcgatcactttagataaaaaattttccaa
tacctcttccaagtttgtaaatttgtggagaaaattttgaggaaaacgat
tttttgctaacaagcatatcgaggattttacctttttcgagggttgcgtg
ccctcatgtagaaaataaaaaaggataaaaatagaaatttcgcggattgc
aaaaaaaattcaaatttttcgcggaaacttattttcgcggatgggccttt
ttcaaatttccaataggacttattttcgcggatgacacccaaatccgcga
aaattaatccccgtgaaaatttatcccattaaagtaagtggagaaatcca
gggaaaggagtggcgccctcccctaccttcgggtagacagctatacgaaa
aggaagccttcgggtcgccctcgactgcgatcgcaaacttacttactact
tacaGGGAACGCCAATTTGTTCGACTTATgggaatttcgagttatagaga
cgtCCTTTTAAGGCATTATTTAACTGATGGGACAAGAGAGTTTTTTTCGG
GTTAAGGATACAACCGAGTTATAGAGGTTCGAGTTAATGAGACTCCACTG
TAGttttttttttcttaaaaaatatagACGTGTTTGTCAGGCATAAAATG
AATGTTCGTCGCTGTGGAAaattattgaatatttttttcttcactgaAAC
AACAAGCATACTTTCATTCAGttttaattttagagttctttattttttac
cggtttttaGGCCAAGGTAAATGGTACCAACTACTAACGTGTTGCATTTT
CGGTAATGAAGCTTCACCCACTGGTAACAAAAGATCAATCTTTCCATGTC
TTTCTGGCGACACCACCACTGCAACGGCTATCAAACTCGCCACATGCACC
ATTGGTAAGCCATAGCCACAATCtggaattttcttttcatttcttttcat
aTGTCATTTCCTTCAGTGCGCACATTGccgtttttgtctttttgttttat
gttttttttcctgCGAACTGGAACTCTCTCTTTTCATTCAATAAAGATGT
CATTTTATTTCAGTGTGCACATccgtttttatatttttgttttttcgatc
tttctctttctataaggatatccatatttgaaattttttatggtaaattt
TAACGATATATCCGATATTCCAAGTTGACTTTTCGACTTTGTATTAAGCA
AGAAACATTATAATTTTGACACTTGGACAGCAACAATTAGGTTTTATTTA
GGGTCATACAAGAAGCTATATCTTTCGTTCTTATTGGTAATTTCAGGTCT
TCAAGTATCTTACCTAACGTGGGGTGTGCTCCAAGAGAAAGTGATGACAC
ACAAGTACGGGGAAGGCACACAAGCCGTCAAATTCAAGAACTCCGAATTC
CTCGTCTTCATGAACCGTATCGCAGCTTTTATTGTTGCTGGGCTATATAT
CCAAATCACACGGTCAGGCCAATGGAACGGACCATTTTATCGGTTTTCTT
TTGCCTCTTTATCGAATATTTGCTCGTCTTGGTGTCAATACGAAGCGTTG
CGATTTGTCAGTTTCCCGACGCAGGTACTTGGGAAAGCCTCCAAGATGAT
TCCTGTTATGATCATGGGTCGTGTGGTTTCTAAGAAAACGTACCAATATT
ATGAATACGTTGTGGCACTTATGATTTCAGTTGGCGTTTCCCTCTTCTTA
ACGGCTACCGGCTCCGATAAACACAACTCTACGGAAACTACCGTGTCCGG
CTTAATTCTAATGATCGGATATATGGGTTTTGATAGCTTCACAGCCAATT
GGCAATCGCATATGTTTACCGAATATAAAGTGCCATCCATGCAGATGATG
TTTAACGTGAATTGTTTCTCCTGTTTATTCACCTCAGTACCGTTACTCAT
CTCGGGCGGCATGACTTACGCCCTGGCGTTTATGATGGTCCACCCATCTT
TTGCCACTCACGTTGGTATTATCTCCTTAACATCGGTGACAGGCCAAATG
TTTATTTTCTACACTCTTGCTGAGTTTGGACCGCTTGTTTTTACAACCAT
AATGGTGACACGGAATATGTTGAGCATTTTATTGTCTTGCATTATTTATG
GTCATGTTTTAACTTCACAAGCTGCTTTGGGTGTTTCCGTTGTATTCTGC
GCTCTGTTTTTACAGATTTATGCGAAATACCGtatcaaacaaaagaaatc
tcaaCAAGTGACGAATCCACGTGAACAATCTGATATGGCTTAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000342_pilon:151147..159789+ >XLOC_016581 ID=XLOC_016581|Name=XLOC_016581|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2962bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000342_pilon:151147..159789+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) AAGCTCATCAGTATTTTCATCAACAtattcatatttgtatttttcaggga aaaaataaataaacaacaacaacaaaaacaaaacaaattatgaAATTGGT ATGGGCGTTTGGATTGCTCTTGATTTTCCTTATTGGTTCATGCCACGCAG TTGATGATGTTGTTGCCGCAGCACCAAGTGAAAAACAGAAGCTCATCAGT ATTTTCATCAACAtattcatatttgtatttttcagggaaaaaataaataa acaacaacaacaaaaacaaaacaaattatgaAATTGGTATGGGCGTTTGG ATTGCTCTTGATTTTCCTTATTGGTTCATGCCACGCAGTTGATGATGTTG TTGCCGCAGCACCAAGTGAAAAACAGAAAGTCACAGTGAGCGGTGACAAA CACGATGGAGAGGGTGGACATGACCACGCGCATCACATCCCGCATCGCGT GCACAACGAGGAAGAAGAGTCATGGGTTCAGGGATTCGTATGGAATATGG TCGGATATTTGATCATCATTATACCCGCGTCTTTTCTCATCCGAATggtc aaaaattcaaacttcaaAGAGCAAGGAGAAAGTCACAGTGAGCGGTGACA AACACGATGGAGAGGGTGGACATGACCACGCGCATCACATCCCGCATCGC GTGCACAACGAGGAAGAAGAGTCATGGGTTCAGGGATTCGTATGGAATAT GGTCGGATATTTGATCATCATTATACCCGCGTCTTTTCTCATCCGAATgg tcaaaaattcaaacttcaaAGAGCAAGGAGGCCAAGGTAAATGGTACCAA CTACTAACGTGTTGCATTTTCGGTAATGAAGCTTCACCCACTGGTAACAA AAGATCAATCTTTCCATGTCTTTCTGGCGACACCACCACTGCAACGGCTA TCAAACTCGCCACATGCACCATTGGCCAAGGTAAATGGTACCAACTACTA ACGTGTTGCATTTTCGGTAATGAAGCTTCACCCACTGGTAACAAAAGATC AATCTTTCCATGTCTTTCTGGCGACACCACCACTGCAACGGCTATCAAAC TCGCCACATGCACCATTGGTCTTCAAGTATCTTACCTAACGTGGGGTGTG CTCCAAGAGAAAGTGATGACACACAAGTACGGGGAAGGCACACAAGCCGT CAAATTCAAGAACTCCGAATTCCTCGTCTTCATGAACCGTATCGCAGCTT TTATTGTTGCTGGGCTATATATCCAAATCACACGGTCAGGCCAATGGAAC GGACCATTTTATCGGTTTTCTTTTGCCTCTTTATCGAATATTTGCTCGTC TTGGTGTCAATACGAAGCGTTGCGATTTGTCAGTTTCCCGACGCAGGTAC TTGGGAAAGCCTCCAAGATGATTCCTGTTATGATCATGGGTCGTGTGGTT TCTAAGAAAACGTACCAATATTATGAATACGTTGTGGCACTTATGATTTC AGTTGGCGTTTCCCTCTTCTTAACGGCTACCGGCTCCGATAAACACAACT CTACGGAAACTACCGTGTCCGGCTTAATTCTAATGATCGGATATATGGGT TTTGATAGCTTCACAGCCAATTGGCAATCGCATATGTTTACCGAATATAA AGTGCCATCCATGCAGATGATGTTTAACGTGAATTGTTTCTCCTGTTTAT TCACCTCAGTACCGTTACTCATCTCGGGCGGCATGACTTACGCCCTGGCG TTTATGATGGTCCACCCATCTTTTGCCACTCACGTTGGTATTATCTCCTT AACATCGGTGACAGGCCAAATGTTTATTTTCTACACTCTTGCTGAGTTTG GACCGCTTGTTTTTACAACCATAATGGTGACACGGAATATGTTGAGCATT TTATTGTCTTGCATTATTTATGGTCATGTTTTAACTTCACAAGCTGCTTT GGGTGTTTCCGTTGTATTCTGCGCTCTGTTTTTACAGATTTATGCGAAAT ACCGtatcaaacaaaagaaatctcaaCAAGTGACGAATCCACGTGAACAA TCTGATATGGCTTAAGTCTTCAAGTATCTTACCTAACGTGGGGTGTGCTC CAAGAGAAAGTGATGACACACAAGTACGGGGAAGGCACACAAGCCGTCAA ATTCAAGAACTCCGAATTCCTCGTCTTCATGAACCGTATCGCAGCTTTTA TTGTTGCTGGGCTATATATCCAAATCACACGGTCAGGCCAATGGAACGGA CCATTTTATCGGTTTTCTTTTGCCTCTTTATCGAATATTTGCTCGTCTTG GTGTCAATACGAAGCGTTGCGATTTGTCAGTTTCCCGACGCAGGTACTTG GGAAAGCCTCCAAGATGATTCCTGTTATGATCATGGGTCGTGTGGTTTCT AAGAAAACGTACCAATATTATGAATACGTTGTGGCACTTATGATTTCAGT TGGCGTTTCCCTCTTCTTAACGGCTACCGGCTCCGATAAACACAACTCTA CGGAAACTACCGTGTCCGGCTTAATTCTAATGATCGGATATATGGGTTTT GATAGCTTCACAGCCAATTGGCAATCGCATATGTTTACCGAATATAAAGT GCCATCCATGCAGATGATGTTTAACGTGAATTGTTTCTCCTGTTTATTCA CCTCAGTACCGTTACTCATCTCGGGCGGCATGACTTACGCCCTGGCGTTT ATGATGGTCCACCCATCTTTTGCCACTCACGTTGGTATTATCTCCTTAAC ATCGGTGACAGGCCAAATGTTTATTTTCTACACTCTTGCTGAGTTTGGAC CGCTTGTTTTTACAACCATAATGGTGACACGGAATATGTTGAGCATTTTA TTGTCTTGCATTATTTATGGTCATGTTTTAACTTCACAAGCTGCTTTGGG TGTTTCCGTTGTATTCTGCGCTCTGTTTTTACAGATTTATGCGAAATACC GtatcaaacaaaagaaatctcaaCAAGTGACGAATCCACGTGAACAATCT GATATGGCTTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000342_pilon | genome | sc0000342_pilon:151147..159789 + |
Properties
| Property Name | Value |
| Aaloc | 556-1500:7699 |
| Aaloc | 412-552:7163 |
| Aaloc | 208-408:907 |
| Aaloc | 94-207:75 |
| Aaloc | 19-90:1 |
|