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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000342_pilon:96186..104185- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_016577 ID=XLOC_016577|Name=XLOC_016577|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=8000bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000342_pilon:96186..104185- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGGAAGAACCTGCTGATGAGAACAGTAATCCGACAGCTGTTCTCGGTGA
AGATGTGGTGCTCAGAGAAAGAGAACAACTCTCTGATCTGCTACATTTAT
TACCACTCAGAGCTCAACTTGGATTCTCAGGTCTCAAAGACAAATGGAGC
AATCGTGGTGACAAAGGATTGAAAGATATGATATCAGTTGCTGCTAAAAC
TAATGATCCACTGATGGTGGAATATACGTGTCTGGATGTGACCTCCAAAT
CCATCGTGTTTGGTTCTAATCTAGGTATTGTCTACATGTATGACCGTGCT
ACCAGAAGGCTCAGCAAGTTCATTTGTGATGTAAGGATTTTTTTCTATTT
ATAATTTGAATACTTTTTTTAGCAAATTGCTATTTTGTTGTTCTTTTAAA
GATAATAACACTAACAAAGTGGCTTTATAGAAAGACTGCACTTTAACATT
AGGGGCACGTTGGTTTTAGCAGCTATATCAAAGTCTGTTCTCCCGTCTCC
CATCCTTTCTCCTACTTTCTTGGCACCCTCTAAGTTTGGGAATTATTGAT
AATGAATTTTAACTGTTTTTCAGTTAGATTGCACACCAAATTTTTTTAGA
AAGGGGGTTAAGATTGATTCCACTGAAGAACCTAAATAATGTTAACCTTC
CCCTTTTTCTCCTTTTTCTTTCTTATTGGTTAGGAAAAAGGGGAAAAGTC
TTCTTGGGATATCTTTCAGTTTGAGGTTTTCGAAAGCTCTTCCTGTTACA
CTTATATTTTTGGAAATTTGATCCATCTAAAACGTCATTGTTGTAATTCG
ACACATATACCTTACTAGACTACTTTCTAGACATTCGGTTTTGATTTACT
AAAGTGCTAGCACACCCATATAATGTTTCTAAAACCTTTTTAATCACTAT
CGAAATCACGTTATGTTAAAACTAGAAAAAAGTGAAGAATTATTTGGCAC
TAGAATTGTTCATGTTTACTCGGGGATCCATACTTTTTAGTTTAATCCCT
TCCTTGTGTCTAAAGGTGTGTCCATTAGTGAATTTGAAATTTTCTTCTTT
CAGATCCTTGGAGCCTGAAAGGTTCTGAAACCAATAAGTTTTCTTCAAAC
TTTTCTTCTCGTTCAATCAGCAAAAGCAAGTCTAGAGGGGTCTCCTTTAG
TGGCTTTTTCCTCTTTCAGTTCCTTGGATAAGGAACATTATGCCTTTCAA
CCGATGATGACCATTGAATCATAAACTAATAAGTTTTTTAACAAACTTTT
CTTCTCTTTCAATCAGCAAAAGCAAGTACCCATCACATCAATCAAATTAT
TGGAATCGAGGTCTTTCGTGGCGACTGGTCAATTCAATGGTGCTGTCACG
TTGTTCCAGTATGGTGATGAAAGGAATGGTGTAATGAAGGTATGACTAGC
CTACTATATTATAGAGATTTTTTCTAATCGCTTTTTTGTAACTGCATACT
GGTCAAAATATTCAATTCAAGGGAAATCTAGAAACCCTTGGATGGGGTAG
GTTCCATAAATAAAGAAACTCATTCTGAAATTGACCACAAATGACCCAAT
TTGTAATTGCTTCAAAAAAAATCCTTACGTTATTTATATTTCAAGGTTAT
GTTTTCAACTCCGTGGCAAGAGCTCTATTTTCGGGTTTGGATTCTAGATT
CTATCAAGTGTCTTAAAGTAATTGCTTGGGACTCAGACATGCCACTTGTC
CTCCGATAGCTAACTTCCAGAGTAATTTTTTTCGATTCTCTTTCTATTCT
TGTGACATGCAAATTAATCTTGTGATATAATCTATGTGCCCTCTTGATGA
TAGAAATTATATAAGGGAATTCTTAACCAGTTTTTGACATTTTTTTCCTT
TACTGTACTTATCAATGAAATGGAAAGAACAGATAACTTTTAATGAATGC
ATAGATGTTAGATGTTTAATTAAAACGCTAATTATTGATCACTTTAACAG
ATTTTAATGTTTGTTATCTTGTTAAGAACTTGTCATATTCAAGAAATAGA
TGTCTTTTGAATCTTTCACAAATGGTCAAGCAATACAATATGACTGAAAG
AATTTCCACAGTTTATCATCGAACATTTTCGGCCATTTTCATGTTTTTTT
GTAGATACATTCACTCACCAGTTATCTATAAGGAAAACAAATATACAATT
TCTGTGATAATCTCATGTAATCGCTCTTGATGTTTGCCTTCTTTTTAGTC
TGTGTACATTTTTGGATCTCCAGCCATCACTGATTCTTTCTTATCAAAAT
ATTTAGTCATCAATGAAAGTACTAGACGCTTTTAAAACATGGTGCGGAAA
GGGGTCTGATCCCCCCTTGTTAAATAACCCCCCCTTCTAAAAATCAATCC
CCTTGTTTTCAAACAGAAAAACTTCCTTTCATGCAGACCAAATTTCATAA
CATTGCTGGAAAATAATCTACAATATATGTAAGCCCCCCTTCTTAAACGA
TCCCCCATCCTTGCTAATCCCCCCTTTTTAATGAAAATGTTCTTAGTTGT
TCTTAAAATTCTTCAGCCTCGAAGCTTTGTGTTCTTATTAACTTTGTTCT
TATTAATTAAAACCTGTAGTACTTGATTGCTCAACTAAAATAGTATAAAA
AACTGTGTTTTCTCCCGACTATTTGGAAGTCGAAAATCGAAAATTCGTGC
CTTTTTCGTGCTTGTTTGAAGTTATAGCTATACGAATCTATTTATAACCA
TACAATAGAAATAAATTTCCCCCGATGCGCAATCACAACATTATTGACTA
TAAAAATTGTAATTTTTGTATAAATGTCACCAAAGCTTCTAATTATTTAA
GATCTGCTATCTTTTTGAATTTGATGAAATGAAATCCTCAGTTCGACAAA
AATTTATTTTAAAACGATATTCCTAGGAATTATATTCATTGACTTTAAAA
AAATAAGGGACACTGAAATTTTGGGTTCTTGAAAAAAGCTCTACCATGCC
CTTAATATGCACGTTGCCAGACCAGTTCTTTGAATCGATAGAGTCAATAT
ATACGAATCGGAATAATTTTCGCGAGATTTAATTTTGTTGTCATTTTCGC
AAAAAAATGAAATTTGTGAAATCGCTTGAGATCGTTGACTCAAACGTGAG
ATTTTTAGCGTAAAGTACACTGTAAATCCTGAAAATTTAAGGGCTACATT
CAACAGATTTTTGCTTGATTCGTGAAATTAAATCCAGACACAGGCTGATA
ATATGCGAAAATCCAGGAAATTTAGCGAAAATTTATCCGATTAAAGTAGA
CGATAGGATTATTTTAAATTTATACGTTCGAAATTGGACGTAAAATAGAA
AAAAAACAGGGTAAGTCAAACAATGAACTTTTACAGTTTTTTTTGCAAGA
TATGATATAATGTATGCCTTCACTTTTACAGGTCAATTTGAAATGCACTG
TTGAGTCACATCACCTAACACCGATCACCTCCATCCAATGGACGCCCGAC
GGAATGAAATTGTTCACCGCCGATAGTGAAGGGAATGTCGCTATCACGGT
GATAAATATGGATGAGGTAAGATTTGTTTCTAAGCTATATTTATATACTG
GCCATCAACCAACCAAACTATTTTTAAAGATGTTTTATGGAGCAATTTCT
CTAACTATTATTTTGCCTGAGTTTTTAACCAAAACTAAAATGCTTTGAGA
AGAAAGAAATTACGGTTTTTAGGTGGTGTACTGGAGGTTTACCGGACTTA
TCTGTTCACTGGCCTTAGGTCGTCACTAAAGTCACGAAAACCTGGACCGG
CAACTCAGCGAATGAGATTAGGTTGGGTAATCTGATCTGGGCGGTAAGTA
ACCGTGAGCTGAGAGTAGCTGTGGCGCTCCACTTGTGCATTTGATCTCCC
AGGTCTAGTGCAAGAAGAAAAGGGATACTCTCGGGTACCTAATAAGCGTC
CCCTCCCCGCTTATTAACTTTTGGGAAAAAGCTCCCTCTTTTGCCCTATT
TCTGCTGAATTAGCGTCCTTTTCAAAAAGTTTCCACCCAATTTCCACCCC
CCCACCGCTTATAAAGTTTCGAGAATTTTTCCACCCATCCCGCTAATTAG
GTACCTGAGAGTAATTCCGCTCTGCCAATAGCTATCAGATGAATATACTT
ACATACTACTCAAAAATTTAAAGTGGCAACCTTAAAGTGATACCAAACTT
AACTCTAACACATTATTTCCTTACCTAGGGTAAGACGCACACTGTTTTCA
TTTGTAAAGAAGATTCACCGATCGTACAACTTTCCTTCTCACATTCTGCA
TTATTGATCTCCACTCTCCGTCGCACCTTGATTTGGCCCTTCACTACAAA
GAAAATCGTTCAAGTTGGCATGCAAGAACGAAAAGTGTACGTATTTTTTC
TCGAACTCGATTAACACCATTTAGCAATTTTTGCACCATGTTGCAACGTG
TATTAGCGTTTTGTTGTTCCTTCGACAACTTTTTACTTTGCCCTTAGGAG
TAATGTTGTCTACTGTTGTACTAATTTGGCTATCATATCAAAACCTGTCT
GTTTCCACTTTTCAGATTTGGAAATTTTGGTGCATGTTTCTTCCCTGAGG
CAGGTCCTTTACCTACAGATGATGTTGTTGATGTGTACGCCGCGCGGCCT
GGATTGCGCTTATGGCGGGCGACCAGTGAAGGAAAGGTCTTAACTACCAT
GATGTTTCGAGAGTCGATTAATAAAGGAAAACCGGAAATCCAGACTATTG
ATTTACAATCCAATTTACCGGTATCGGCCCACGGTGAACAACGTCAATTT
GGACCAATCAAAACGTTTCACGATCAATTTTTAATCACGTGGCAAGGTTC
GAATGTATGGGTGCTGGACCCGACTACAGGCGTCGTAGTCGGTTGTCATA
GTAACTTGGGGTGCGTCGTCGACGTTGGCGTAGTGGATAACGAGATATTT
GTTTTGTCGAAAAGCAAAGAGAACTTTGTACGGAGGATTTTATTTGAAGT
AAATCCGTGCATCGTTGTTGAAGAACTTGATTTGAATAACCCATCAGATG
TGATGAAAGCACAACGACACGGTTCCGTCAACTCCTTTGAGGACCAGGAC
AAGATTGATAAAATCCTCGACGAAGTCGGTAATAAAATGGGTCGCGCTTT
CTTTGATGTTAAAACTCGTGTTAAAGGAATCACAGAGCAGATTAGATCGC
GAGAAGTCTCCGAGGATGATCGCGGCTCAGAATCTGACCGCTTCTCAAGC
CCTAAAGCTTACTACAAAAAAGATGCGTATGGTGAACGTTGCCTGGCAAC
CAGTGAAGGCTATTCAACCGGTAACGGGAATTCAACAGACGAAAACGATT
TTAGTGATCGACCTTTCGAATCATCAAGTAACGAATCCTTTAGTTCGCCA
AACAAAAGTTTAGACTCTTCGAAATCTCCATTATTAAATGTTACGGTCAA
TGAAACAGATGCGATGTCATTGGTAGACGGCCTTACGAACGTTAAAAACG
ATACTAGTGATTCGGCTTTAAGTCCAGGCCAAATAACACCGACAAATCCC
GAAGGACAGCAACAAGTGCCGCAAAACCAAACCATAGACGTTATATTAAC
GCATAAAACGCGAGAAGAGGAACCAGTGTTTAGTCACCTCAATAAAGAAG
AGTTTGCCAAAGATATTGTGTTTGAGGGAACGTCCGTTAGCACCACGCGA
AAGAAAAAGAAAAGGAAGAAACCAAAGAAAGGTATTTCTTTATAATACAG
TATTGAAAGCTCTTGCGTTTCAGACGGTATTCCGCCTTAGCGAAGTTTAT
AAAGAGGCTTTTCCGTCTCAAAATTCACCAAAGTTTCAACCGAAGAAAGG
TATATTTCTCTCATACAATGACCCTAGCTCTGGCCCCTTTTGATTTATCA
AGTGAATCGATTCTCTGAATTCAACCTTCCACCTGTTTGGGACACAGATA
TCTTATATTAAACAATGATGATGGAGCTATTTTATTTCTATTTATTTTAT
TATATTGGAGCAAAATAATCTGCCATCTTTGCTAAATTAGATCACAGTGT
AGACAGCAGCTCGGTGCCGGCAATTCGACTTATAAAGACCATTCTCTTGC
CTCGCTTTGCGCCATGCAGGTTGTTTGTCTATTTGAACAAATTGCCTGGT
ACCAGTACTACCTATGGTCTACTTCAGCAAATATGGCGCATTATTTTGCT
TCAACTGCCGTTTCTTTGGAATTACAGAGTAGGCCTATCTAGTGTTTTGT
ATAATATATCAGTGGTTTGGGATCCCCTTTTACTTTTAAAGGTTTTGTTT
TTAAATAAGAGTGATATCGTTTGCTTAATCATCAATTTTAATTTACAAGC
TTTTTCACATTGAATTGACACGGATGTGGAGCAAGATTGGTCAGAAAGAG
GAAAAGAAAAACATTTTTTTGCTTATATCAGCATAATATAACAATAAGTA
GACACTGTCCTGGTATGAAATATGTGTCTGATATGAAACGGGAACACTTA
TGTAAAAATAAAACCTTTAAGTTTTCTCTTTTTTTCTTCTTTTTCTTCTT
TCCGAACGGGAAAAACCAAATTTATAGCAAAGCAAAATACGAAAAATTAC
TTCGTGAGGCTGTCGTTTTATGGAGTTTTTTGTAGGACGAGATATTATAT
TTAACAATCAAAACTCAAAACAAAACTTTAGCATCACAACAATAACTCTC
AAAAGCATGTTTGTAAACGTGCGTACTAAATATTTTCTCATCGTCGCTTT
GATCATGGTCATGAGAAAAAAACCGGTCTGGCACTGTATTCTTTTAGGAG
CTTTTGTTACAAACAAAAGACAAGTTGCGGTTTGCATACTTTTTGATCAC
GTTACCAAAATCTCCTCATGGTCTATTTTTTAATCACATTATTAAAAAGT
TTGCAAAATAAATCGATTTTGGGAGGTAGGCTCCATCTTTTAACAATAAA
AAGAGACAAAAGCCTTCCAGACCAGTGTTTTTATAATGACTATGCTTTGA
TGTTGGAGTCAAGACTTTAGAACAACAAGGGTCATTTGAAGTTCGGATTC
TTTTTCACATGTTTACACGGACAGATTCAAATAAGATACTTCTAATTTTA
TTCCAGCAAACGATGCCGAAATAACAGACCGTCTCTCTGCACCAGCTGCG
ACCTCCAATATCCTCTCCTCTACTGAAAGCACCACCATGGAAACCAATAC
TCTGCCACCGCAACAAAATGATCAACAAACTGATGTTGATACAGCTGAAC
AGAACGTTGAACTCACTCAAAATGGCGTTGTTGTAAACGGTGTCATCTCG
AACGAAGACTCTCAACAAAATGGACTTAATATTCAACAAAACGATAACGT
TGTGTCTAAGCATTTTGAAAATAATACTCGACAAAACACTAACAATTCTG
AACTTGATTCGAGCGATATTCGACAAAGTGAAGAATCCGCGCAACAACAA
ATACGTGTTGTAGATAAACCTTCGTGCGATGAAAATGTTGAAATTTATTT
ACCATTGTCCAGCACAAATTTTGAAAATAATGTCCATACTGAAGGAAACG
TAGACCTTGTTGATGGAGTCGATAAATTGGATTTACACCAAGTTGACGAC
ATTCAGAATAGAGGTAATAATTGTGTTGAGAATGGTGAAAATTATGTAAA
CGAGGACCAGTCATTTCAACCTGCTATTGATAGAGCTAAACTTCAAGATT
CTGTGGATAGTGAGAAATTAAAAACCCTGGACACACACGAAAATAATGTT
GAAAACAATAGTTTCATTGAGAATCAACAGCAGATAGATAATAAGGGTCT
AATTAAATCTGCTGACGATGAAAAGTTGATTCTTGAACTGAACAATGTCG
ATTCTGGTGTAAACACATCTGTAGAAGATTCGCCACATGTAAATAGTGCC
TTAGGTGATAATAATATTACGATGAAAAGTGATTGTGAAAACGATGCTAA
TAATGAACTTTCGATACAGACTGCTCCTACAAGTAGTGTCCAAGAGCATG
GTTTATTAACGGTGGCCTCCATTGATCAAAATATAGACTCTGGTGTGAAA
Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000342_pilon:96186..104185- >XLOC_016577 ID=XLOC_016577|Name=XLOC_016577|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=5712bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000342_pilon:96186..104185- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGGAAGAACCTGCTGATGAGAACAGTAATCCGACAGCTGTTCTCGGTGA AGATGTGGTGCTCAGAGAAAGAGAACAACTCTCTGATCTGCTACATTTAT TACCACTCAGAGCTCAACTTGGATTCTCAGGTCTCAAAGACAAATGGAGC AATCGTGGTGACAAAGGATTGAAAGATATGATATCAGTTGCTGCTAAAAC TAATGATCCACTGATGGTGGAATATACGTGTCTGGATGTGACCTCCAAAT CCATCGTGTTTGGTTCTAATCTAGGTATTGTCTACATGTATGACCGTGCT ACCAGAAGGCTCAGCAAGTTCATTTGTGATATGGAAGAACCTGCTGATGA GAACAGTAATCCGACAGCTGTTCTCGGTGAAGATGTGGTGCTCAGAGAAA GAGAACAACTCTCTGATCTGCTACATTTATTACCACTCAGAGCTCAACTT GGATTCTCAGGTCTCAAAGACAAATGGAGCAATCGTGGTGACAAAGGATT GAAAGATATGATATCAGTTGCTGCTAAAACTAATGATCCACTGATGGTGG AATATACGTGTCTGGATGTGACCTCCAAATCCATCGTGTTTGGTTCTAAT CTAGGTATTGTCTACATGTATGACCGTGCTACCAGAAGGCTCAGCAAGTT 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Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000342_pilon | genome | sc0000342_pilon:96186..104185 - |
Properties
| Property Name | Value |
| Aaloc | 2569-2847:280 |
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| Aaloc | 454-588:4620 |
| Aaloc | 331-453:6735 |
| Aaloc | 1-330:8001 |
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