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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000343_pilon:116898..124547- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_016402 ID=XLOC_016402|Name=XLOC_016402|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7650bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000343_pilon:116898..124547- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCAGGAAGAGGAGGCAAAGGAAGAGGCAAAGCTTCCATGAGTTTTGA
TGTCAGCCGTCTTGGTTTCAGTGCTGGAGAAGGATTACCAAAGGCTAATA
TTCAACCTCCACCTCTTTACCCTGTAAGTGTTTTAGCTCTTTGAAAATAG
TATTGTTCTGGTACAAAGCAATTGAAGTGGAATGTCTTGAATTTTTATTT
TTAAAAATTGGAAACGAGTTCTAGCAAAAGAGATTTCGTTTGAATTATGT
TTTCGTCTTCATTGCTGCTACGCTGCATCATTCTTTGCTACCAGCTTTTT
TGGCATATTTTACCTGTAGATTAATTCTTGCCTAGATTGATCTATAATGA
ATTTTTTGTGAGGATTTAATTTGGTGCATTGGGATGTTGGAAGAACTTAA
TTTTTAAACACATGAAAATGTAAAAGGCAATTTTTCATTTTACTGTTTTT
GTTAAATTTGCCGAATGATCATTATTAGAAATGATTGTGGGGATAGACCT
TTTCATAAATTACGTCACGAACATCACTTGCCTCTTATTCAAATAATTAC
CATGGTTATTATGCCCCTTGAGACATTTAATGACTTTTTAATGAATAAAA
AGTAGTTTTAATAAAATCCGCTGGGAGTTAATCACCATGACACTAATTTC
AAAACGAGGCAAGTGATGCTTGTAACGTAATTTATGAAAAGGTCTATTAG
TAGCGATGACAGCCGGGATGCCGAAAATTCATTCACTTGCGAACAGATCA
TTGCGCGTAACCCCTTTTATATTATGTTTTTTTCTCTTTATTTCAGCCGT
TAAATCAAAGACCCACCCCTCTTCTCTCCACTGAGGTTGATGAATACTTG
TTAGCACTGAGTCAAGAATATCGTGGCAGTATTAGAGATTCACCATTCTA
TCTGAAGCCGAAAACCATAAAGCGAGGTGCTGAAAGTGGTTTTTCTTAAC
TTCTTTACAAAGTTTATATTCATGAATCTTTTAATAAGTTACATTGTACT
AGATAGATTTTAAGAGCTTTGAATTTTTCCAAATGTCCTTTAAAACTGCT
TGAAATCAATGAGATGTATAAAATGTTAAAGTTCTGCTTTGTAATTTTTG
ATTTTGTAATTGTTTTGATTTTGGGATGTTTCTTCTTTAGACATCGTGCG
CTACACTGATCGATATAAGCAGAATCAAGCTAAAGGTGATGCAACAGAGA
CTTGGACACCAGGTACCAGAATAATGGGTTTCTTTTGAATACGATTTTAA
GAGGAATAATGCAATTCGAATCCGCTAAAAACAACTTAAAGCATTTTAAT
TTACAATGAAACAGACATTATTCTGAAAATTATTGTGTAGATGGAAGATA
AAGAAATAAAAGATAAACTTTCCTTCCTTTGGTGGAATAAACATGTAAAA
AGTTAGAAAGTTTTCAGCTACAACAAGCCATATTCTAGGGCATTTAAATC
TTTTGATGGAGTAATGCTGCAATTCATAGTTGCACTGTAGGCTTACCCGA
TAAATAAGTTGAGTGATTATTCAAATTGTTTATTAATGATTTGTTGTTCA
AATTTTAAGATTGGAATTTTATTCCCGGAGAATTGAAACCAGCAAAAGTG
AGGAAGCTATCCAAGCGTGGTGGTAAGATTTTCTCAGTCCATTTTGCAAT
GTTATCATTAAAATACATTTCGTATGAAACTGATAGCGTTTTTTCAGTGG
ATATATGAATGTTTCTACAATTCTGTTTGTTGTTCTTTGAAACTGCTGAT
TTTCATTTAGTTTTGCTTTAATTTCAGCCAAGGTGAATGTATCTTCCTCG
ACCAAACTACCAAACACAGCAGTAGATGGTAAAGAGGTCCTCAAAAGGCT
AGAGGTAATATTCTTTAAAGTTGAAAAGATGGGCAAAATGATTATAAAAC
TTTGACATGACGTATTACACGAATAATTGCTTTCAGCTAAATATTTGAAG
CTACTGAATTAAAGGATACTGCAGTGATCTAACCCTTTTCCCCTCTTATC
TTTTTGTAGGTGCTAGAGAAGACAGGTGGTGATAAGGGTGCGACAGAGGG
TACGAAGGAAGATGAACAAGAAGTTGTTTATGAAGAAGATGATGACTTTG
AGGAGGTTTTAAAAAAACATAAATATCCTTGTTTCAAGTTATTTTATTGT
TTCTGTTTGGGTGGGGAGAGCAATCTTTTTCAATCCTTTTCAAGAGGTTG
CCTTTTGTTGTTGTTTACTTTTACCTTTCATTTGTTGTTTTTCTCCAGTC
ATCAACTATTGTCTATTAATTCCTTTTTCTTTTCTTTCTAGAAATCATAC
ACGTTTTTTTTATAAGAATAACTTACATAAGATTATCATTGTGAAATTTC
AGAGTTAGAACAATAGGCCTATTGTTTAGAAAAATAGAAAAATAAGAATA
ATTAATGCTCACCCTCAGCCAAATACACTATTCTTATTAAAAAAGCGTGT
ACAACAGGAAAAAGATTGTTTTTGTATTAGTTTCCGTTATTCAACGATGA
TGGTCCCCTCTCTCTCGTGCCATTTCACTTAATCGATTATCTCTTAAAGC
TGTTGAAAGTCAAAATTAGAAATTTCTTTTTCAGTTATAGTATAGTCTTG
TGACATTTTTCGTTTCATTAATGGCCTTCTTTCTGCCTCTTAATACGCGA
CCCTTGACACTCACGAATTTCTCTTGTATCTTACTCGTGTGTTTGTACGA
AATTTGACAACGAAAAATACGTATTGGAGAATTTTTTCACTTTAAAAGAA
CGCTTTGACAATTGTTCTTATAATTAAGATTATAGAGCAGAACACTTCCT
CAATAAGGAACTAATGATAATTAAAAACTATGTTTATGTTCATTAACTCA
TAATTCTATTTTTGATACTGTGTACAAATGATGATGGAGAAAACAAAGCG
AATTTTCAGTCCGGGGAAGATGTCCTTATTTATCAGACTAAAAAATGAAG
AGTGGTGATATCGAGCCATTATAACTCAAAGAAAACAAGAATTTCAGTAC
AATTAGTAATTTTGTATTCCCAAATAAGATATAATACTAAAAGTGCAGCT
AAAGCTACTTTCAAAATGTAATTATTGATTAACTAACAGGTCAAAAAGTG
AAGCACTCGAATTTTCGGAGTTACCGATACTTTCCGGTTATTCATCTCAC
ATGTAGCTTGTGATAATTTCATTTCAACTTTTGATAGTATGATAAAGTAA
CCTTAATTATATTATATAATGGACATTAGATCTACCCTAAAGAATAAACA
GCTTTATATAGATGCTGAAAACTTTAGTGCATGAAAAATATTAAATAACA
AATCAAAAGGCAAAAGCAAGTAGTTTATTAAAAGTTGTTTATTTTGACTT
CTGCATTTTTAAAAATATCTGAATCAACGTCTTCAATGATGTTCTCATGG
TTGCAAATCTTGCCTTCGAAACTTTTGATCATTCGATACAAAATCAATGC
TTTTCTAAATTCTTCATTTTTCTCCCAATGTTCAGCAAGCATTAAAGTTT
CACGAAATAAGTTCCCGGTGTATTTTTGGTTATCTATTTCTGGTGATACT
TCAGTTTGTAAATACTCCCTCGCTTCTTCGACTTTGTTTTGGTCAATCAA
ATGACAATAAATTAACAGTTTCACCCGACTTGGACGACAAAATACATAAG
GTGAAAACACAGAAAGATTGTATTGGAGCATTGCGACTATGTGTTCCCTA
GTGGTAGTCCCCGTAGTAGTACACTGCAAGATGGTCATTTTACAAAAAGC
ATCCAGATCGTAATGTGTGCAGCGTACTGCAAGCCATTTCTTGAAATAGC
CTTTACTCTGTTCAAGCAAATTGACGTCATAAAGGGCACGGCCAATGTCA
CGAAATGAGTCATACGAACTTGATAAATCCAATGATTCGATAATTTCAAG
ACCTTCTTCGACTTTCCCTTTCAAGATCTTACAACAGGCAATTTGAACCT
TGCTATTGGTTCCATATGGATTATCATCATCTAACTCTGGTATTTTGAAG
AGTAATTCCAACGCTTTATCATACTCTCCCAACTCTTTGTAACAAATGCT
TACCAAAAATGTTTCTCTTGAAGTAAAGAATATTTTCTTAATACATTCCA
AAGCTTTCTTCCAATGTCCATTTTTCATCAAAACCATTTCATTAAAGCTA
TTGTTGGTTTGATAATGACTTTCTGGTGAATAAAGTTCACGATTTGCGTA
CAGAAAAATCAATAAACGATCTTTAGCCGTCGATGATGGAACGTTTAAAA
GAATCCTCGCTTCCAAACTGTCCAGTGCTGACAGTATATATTCAGCTTTC
CTTGATTGTTCGTTTTCAATACGCTTATCTCGCAGAAAACCCAGTTCAAT
AAGATAAGGCACTGGATGAGATTGATCATTTTTCTTAAAATTATAAATAT
AACTTAAAATAACAAACTTGTCGACGAAGTTGAGCATTGTCATCATAGTT
CCAACGACAAAGAAATCATCGGATAAGAATTGCAGCAAAGTATCCCGATA
ACATGGTTGCTTATAAATGAACATAATTTGATTATACCAAAGAATTTTTT
CTTCATTATAATCATGTTGAATCGTAAGGTTTTTCCCTGCCATTGCAATA
AGCTTTTGGATAGTATGTCTTTTCCGATTTTTCTGTATTATATAAATTTT
GATAGCCTCTTGGTACAAAGAATGAATAGTCAAATAATTCACTTTTTTAT
GAGTGAACTCGACGATCCTTTCGTTTCTTTCAACGATGGAATAGCTAGTC
AAAATTTGTTTGACTTTGTTATATTCTCTCTTCCGTTTGTAACATCTTTC
AAGAAACTCTTCTTTCATGCAAGAACCGTCTAGAATACCGACAACTGATA
AAAGTTCAATGGCTTCTGGATTGTTTTTCTCAATTCTCTTGATGGTTTTT
AAGAAAGAAGCGAGTACTGAAGTGTTGATTCCCAAGCCAAGAGCAACCCT
TTGAGACAAAACATCACCTTTATCTTCTTGGAGATCTGTTAGGTATTCAG
CCACAGACATTCCAGTTTGATGTATTGTTGCCACCGCATGTTGAAGTCCT
AATGGATGACATTCTAATTCGTCTGTCAGTTTCGTTATATCCTGGATGCT
AGGTGTAGGTAGATGGTCTTTTAAAAACTGGATTGCTATTGGTTGAGCCC
AGTTCTCCAATGGAATGAATTCAAATCCTTGTCCCCAATGTTTTATTTGT
GTTGTGATGATATTGTGTTGAGAGAGGTCCAAGTAATCGCTCAATTGGCC
AACATCAGTGCAGTTATCGTAAATGTAAAGCACTCTTTCATTCATAAAGT
ACGTCTTCAGAAGGTTCACAATGATTTTGACGTTGGTTTTTTCGTGAAAT
TGGAGGATAGAGGCGATGTTCGTGAATATATCTTTGATGTTATCGACATT
AACCCAAATCACGTGATCGTAATTAGTTTTATTGATGACGTAATATTGTT
TTGCAAGTTCACTTTTACCGACACCTGGGATACCAGAAATCACCACATTA
GATTTGTTGTTAACATTTAAATGTTGATAAATTTCGCCCAATTCGTTTTG
TCTCCCGATAAAGCTTTGGTTTGCTGGTGAAAGGTCATATTCAAAAGACG
GTAACAAGTTATTCAGTTCGTTTTGAGGGCATCCTAAAGCTAGTAATGGT
TTTTCCAGATATCTGAAGGACTTTCGATACTCTACTGTGGAGATTGATAC
CTGACCATGCTGCATTCGATTTCTTTCGAGTTTCAATCGAAGAGCATTTG
CAATGTCATCAATATCGTTGACATCTGGTTCTTTATCCCAACCATTGGAA
GGTGCCTTGCAACCACATAATGTTCGTATCAAAAGAAAAAGCAAAGTGAT
ATCAAATTGTGTTGAATCTGTTTGCTGAGATTGTGGAAAGACTTGATCGT
ACTGGTCGTTTTTCAGTACCCCTTTCTTTTTCAATTTATCCAACTCTTTC
TTGTGTTTTGTCTGTGACAACTCTTGATACAATGTCGTTGGATTTGTTGA
AAACTTTTGATGAAATAAATCAAGTAAGCATTTGGTAGATTTCTCACGTA
AGAGTTGCTGTTTGAAACCGTTCTTCTGTTGTTGTGTCGGATATTTTGTT
TGTAATCCAATATTCGCTGAAGCCATTATCGTTTCAGATTTTACTTTCAG
GTCACCATCTTGCCCTCTTCGACAATGTTCATGTCTGAACTATTTTCTTT
AACTAACGTAATCAGGATATCAGTTCATTATGATTATATAATATCTGATG
TATTGATCGATCCTTATTAATCGAGCTCATCACAGTACCGCTCATTAAGA
AGTTTTTACTAAAGAAGGTATTAAGTTTAGACAAAATATATAATATCTGA
TGAATTGATCGATCCTTTTGCTTATCACAATACTGCTCATTAAGAAGTTA
TTAAGTTCAGACAAAATGTATCACCCACATTTCTCTTACTGCATCTATTC
ATTTCTTAATCCGTGTTTATCCCAGCAACCATATAATAAGTTGAATATAT
TTTGTGTCTTTTGACAAACGTCTTCGTAATTTAATATAAGCAGCTCTAAA
GCAGATCCTGACTGTTACGTATACACTCTAAAGGCCATTGCTCCGAAAGA
GAATTTGTCCAGGCTGATGGACCGCTTTGACAATTTCATCCAAATTTTAA
TATTTAATTAATATTATATTTATCGCATTAAAACGCACTTTTTGTCTATT
TTTGATAAATGTAGGATTCTTTAGATAAACCCCTCTAAAACGCACTCTCG
TTTGCCATCGTTTGTAAGCAATAAACAACACAGTTGCTGCATCCCTTTAA
AGCAAAGCGTGGTGTGTACATAATGGATGATCTCTCATGAGATTAGATTT
AATACCCAACAGCTGAGCATCATCGATTCTTCATGTGGTCCTAAATCTTC
TCCTTGAAGTGAATTTCTTAGCGGTATCAATTGAAATTGAAGAGGCTAAC
AAAAATGTTGTCAAGATATAAATCGTAAAAGTGATTACGTACGGAGAATG
AGGCATGTTCGCAAAGCGAAAGGAATTCTATAGACTAGGATTATATAGAG
ACACGGAATGTTGCCTAACTGTAACAAACCGAACTTCGCGTTATCTTTTC
AGTCGGCGAAGAAGATTTGGTACATGATACTTCAAACTCGAGATATCGCA
TTTTGAAGTTGTTCCTAAACCCATGACGTCATTGGGTCCCTTTACCCCGT
AATGTTGTCAACGGTCAATTCGCAAATTTTGGATTTTTTGAAGTCAAAGG
GTACCTTGAGCCCCAAAGGTCCCAAAAAAACAAAAATGTTAATTATTTTC
ACGGGAAAGCGAATTTTGCAAAGATTGATACTGCAACGACTTCTTCTTAA
AAAACGCTAATTTTCACGAAATTCTCAAAGTTGAAATGTTCCAAGGGCAA
GAGAAAGGCCTAATTTTGTTTAATACACTGAGCATTATTTTTACAAGATA
ACAGATAAAGATACTTCTCAACCAATAAGATTATTCCTATTATTCCCTTC
GAGAGCCAAACACAAACACACGATCAATCTCAGCTCTAACTTAACGTATA
TACTTTATTGCAGGAGAATGATTACAATTTCGATTATTACAATGATGGTG
GAGATAAGTATGGAGATGACGAGGATGGTGAAGAAGGACCTGTTTATTGA
Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000343_pilon:116898..124547- >XLOC_016402 ID=XLOC_016402|Name=XLOC_016402|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1296bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000343_pilon:116898..124547- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCAGGAAGAGGAGGCAAAGGAAGAGGCAAAGCTTCCATGAGTTTTGA
TGTCAGCCGTCTTGGTTTCAGTGCTGGAGAAGGATTACCAAAGGCTAATA
TTCAACCTCCACCTCTTTACCCTATGGCAGGAAGAGGAGGCAAAGGAAGA
GGCAAAGCTTCCATGAGTTTTGATGTCAGCCGTCTTGGTTTCAGTGCTGG
AGAAGGATTACCAAAGGCTAATATTCAACCTCCACCTCTTTACCCTCCGT
TAAATCAAAGACCCACCCCTCTTCTCTCCACTGAGGTTGATGAATACTTG
TTAGCACTGAGTCAAGAATATCGTGGCAGTATTAGAGATTCACCATTCTA
TCTGAAGCCGAAAACCATAAAGCGAGCCGTTAAATCAAAGACCCACCCCT
CTTCTCTCCACTGAGGTTGATGAATACTTGTTAGCACTGAGTCAAGAATA
TCGTGGCAGTATTAGAGATTCACCATTCTATCTGAAGCCGAAAACCATAA
AGCGAGACATCGTGCGCTACACTGATCGATATAAGCAGAATCAAGCTAAA
GGTGATGCAACAGAGACTTGGACACCAGACATCGTGCGCTACACTGATCG
ATATAAGCAGAATCAAGCTAAAGGTGATGCAACAGAGACTTGGACACCAG
ATTGGAATTTTATTCCCGGAGAATTGAAACCAGCAAAAGTGAGGAAGCTA
TCCAAGCGTGGTGATTGGAATTTTATTCCCGGAGAATTGAAACCAGCAAA
AGTGAGGAAGCTATCCAAGCGTGGTGCCAAGGTGAATGTATCTTCCTCGA
CCAAACTACCAAACACAGCAGTAGATGGTAAAGAGGTCCTCAAAAGGCTA
GAGCCAAGGTGAATGTATCTTCCTCGACCAAACTACCAAACACAGCAGTA
GATGGTAAAGAGGTCCTCAAAAGGCTAGAGGTGCTAGAGAAGACAGGTGG
TGATAAGGGTGCGACAGAGGGTACGAAGGAAGATGAACAAGAAGTTGTTT
ATGAAGAAGATGATGACTTTGAGGAGGTGCTAGAGAAGACAGGTGGTGAT
AAGGGTGCGACAGAGGGTACGAAGGAAGATGAACAAGAAGTTGTTTATGA
AGAAGATGATGACTTTGAGGAGGAGAATGATTACAATTTCGATTATTACA
ATGATGGTGGAGATAAGTATGGAGATGACGAGGATGGTGAAGAAGGACCT
GTTTATTGAGAGAATGATTACAATTTCGATTATTACAATGATGGTGGAGA
TAAGTATGGAGATGACGAGGATGGTGAAGAAGGACCTGTTTATTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000343_pilon | genome | sc0000343_pilon:116898..124547 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 562-648:88 |
| Aaloc | 466-561:5642 |
| Aaloc | 391-465:5872 |
| Aaloc | 328-387:6090 |
| Aaloc | 256-324:6509 |
| Aaloc | 124-252:6855 |
| Aaloc | 1-123:7651 |
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