XLOC_016397 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_016397
Unique NameXLOC_016397
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000343_pilon:138517..156948+

Legend: polypeptideCDS
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>XLOC_016397 ID=XLOC_016397|Name=XLOC_016397|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=18432bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000343_pilon:138517..156948+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000343_pilon:138517..156948+

>XLOC_016397 ID=XLOC_016397|Name=XLOC_016397|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1992bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000343_pilon:138517..156948+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCTGATTCTGAAATCAATATTGACAGTCTGATCTCACGACTCTTGGA
AGATGGCTGATTCTGAAATCAATATTGACAGTCTGATCTCACGACTCTTG
GAAGCTCGTGGCAGACCAGGAAAAACAGTTCAAATGACAGAGGCTGAGGT
CAAAGGGCTTTGCATGAAATCAAGAGAACTTTTCCTCAGTCAGCCCATTT
TACTGGAACTTGAAGCTCCCTTAAAGATTTGCGCTCGTGGCAGACCAGGA
AAAACAGTTCAAATGACAGAGGCTGAGGTCAAAGGGCTTTGCATGAAATC
AAGAGAACTTTTCCTCAGTCAGCCCATTTTACTGGAACTTGAAGCTCCCT
TAAAGATTTGCGGTGATATACATGGACAATATTCCGATTTATTACGTCTT
TTCGAATACGGAGGATTCCCTCCAGAAGCCAACTACTTATTCTTGGGTGA
TTACGTGGACAGAGGAAAACAATCTTTGGAAACCATCTGTTTATTACTGG
CATACAAAATCAAATATCctgaaaactttttcttgttAAGAGGAAACCAT
GAATGTGCCAGTATTAACAGAATCTACGGCTTTTATGACGAATGTGATAT
ACATGGACAATATTCCGATTTATTACGTCTTTTCGAATACGGAGGATTCC
CTCCAGAAGCCAACTACTTATTCTTGGGTGATTACGTGGACAGAGGAAAA
CAATCTTTGGAAACCATCTGTTTATTACTGGCATACAAAATCAAATATCc
tgaaaactttttcttgttAAGAGGAAACCATGAATGTGCCAGTATTAACA
GAATCTACGGCTTTTATGACGAATGTAAAAGACGATTCAGTATCAAATTA
TGGAAGACGTTCACAGATTGCTTCAATTGTTTACCCATCGCAGCTATCGT
CgacgaaaaaattttctgttgtcACGGAGGTAAAAGACGATTCAGTATCA
AATTATGGAAGACGTTCACAGATTGCTTCAATTGTTTACCCATCGCAGCT
ATCGTCgacgaaaaaattttctgttgtcACGGAGGACTTTCACCCGATTT
ACAATCCATGGAACAAATTCGACGAATCATGAGACCAACCGACGTCCCTG
ATGCAGGACTTTCACCCGATTTACAATCCATGGAACAAATTCGACGAATC
ATGAGACCAACCGACGTCCCTGATGCAGGTTTACTTTGCGATTTATTATG
GTCTGATCCCGATAAAGAAATCACAGGATGGGGAGAAAATGATCGTGGTG
TCTCATTCACATTCGGTGCCGATGTTGTCGGCAAATTCTTAAATAGACAC
GACCTCGATCTCATATGCAGGGCTCACCAGGTTTACTTTGCGATTTATTA
TGGTCTGATCCCGATAAAGAAATCACAGGATGGGGAGAAAATGATCGTGG
TGTCTCATTCACATTCGGTGCCGATGTTGTCGGCAAATTCTTAAATAGAC
ACGACCTCGATCTCATATGCAGGGCTCACCAGGTCGTTGAAGACGGATAT
GAATTTTTCGCTAAACGCCAATTGGTTACACTCTTCTCTGCACCCAACTA
CTGTGGTGAATTTGATAACGCGGGTGGTATGATGAGTGTGGACGACACCC
TGATGTGTTCTTTCCAGGTCGTTGAAGACGGATATGAATTTTTCGCTAAA
CGCCAATTGGTTACACTCTTCTCTGCACCCAACTACTGTGGTGAATTTGA
TAACGCGGGTGGTATGATGAGTGTGGACGACACCCTGATGTGTTCTTTCC
AGATCCTGAAACCGGCAGAGAAGAAAGCGAAATACCAATATAGTGGTTTG
AACACTGGGCGCCCTATTACGCCACCACGCAACCAAAACAGTAAAGGGAA
AGACAACAAGGGGAAAAGATGAATCCTGAAACCGGCAGAGAAGAAAGCGA
AATACCAATATAGTGGTTTGAACACTGGGCGCCCTATTACGCCACCACGC
AACCAAAACAGTAAAGGGAAAGACAACAAGGGGAAAAGATGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_016397XLOC_016397-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000343_pilongenomesc0000343_pilon:138517..156948 +
Properties
Property NameValue
Aaloc877-996:18313
Aaloc742-876:17794
Aaloc592-741:17260
Aaloc520-588:16748
Aaloc415-516:16337
Aaloc184-411:15673
Aaloc55-180:14770
Aaloc1-51:1