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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000018_pilon:2638337..2644353+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_016376 ID=XLOC_016376|Name=XLOC_016376|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=6017bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000018_pilon:2638337..2644353+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAActtaaatttaatatttgtatTGATTGcattcaaatttgaatttac
tTTTTCTTGGCCTTATGAATGTGATAGGAACCGAGATTGTTGCAGCTATG
TAGTTGATCACGAAAATGGAACTATGCAGACAAAACAAAAACCAGAATGT
CATCAATTTCACATTGATCTCAGTATTCAACACCGAAAAACTTTCACGGC
AAGTAATAATGGAAATTTAGAATACTATATGTTGGAGAATGTTGGTGGTG
TTAGTGTTTTGAAATGGGTTGAATTTAGGCTTTCAAGCACAACGCAGGGC
TGCGCTGGTGAAATATATGTTCAAGTTGGGTAAGTAAGAGATCATTCAAT
ATCTGAAGAAGAACTTCAATATCTCACAAACAACCTTATTTTTCTCTTAG
AAAGCTTTTCTGCTCGAGGGTGGAATACTAGAAACCTTCTAAAGGTATTC
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TACGTCGATCATCTGTTCTCATCGGACGGAGGTAGATGAAAATAAGCTTA
AATTTGAATACtttaagggaaaaaatttttgcgggaagaaatttttgcgg
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AATTGCACGGCTGGGAgaattgttttgtttacaatatggcctattttgcc
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AACTTCTTCCCTTAtattacaatcatggtcgaaatgagaattccggttat
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tcaaggctatattctgagcctttttgaactatttttgaacttttggatcc
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ctctaccatttgaacctactttagagcacttacaaatcgattggggtttc
aaaacttcctggggaatttccctttctTCTCAAATATTGACCTTGATGta
gatttaaattttcattttgtcttAGGTGTACGAATCAGAAAGTTTTTGGT
CCATTTTGTGGGAACTCTGCACCACATGAATTCTACAGTCGAGACGGTTG
TATGACAGTGATTGTACAAAATGGAAAACGATATAATACTACTGTGAAAT
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TCTACGTGTAATAACCAAAAAGTCTTCAAACAGAGTACTGGAGTGATAAT
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CTACAAGCGAATTTATAAGCAACCATGTTGCTAAAGTTCATGCCCTTCAA
TAAGCCAATTTGTTTCACTACCTgttaaagtaaaagctttttagaaaaTC
TAACCATAGCAGACGTTAACCCTTCATCTAATATGCATAAATATGGTATG
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cggaaattgaaaattaaagaaataaaaaggaaTATGTAATAAGATAGCAA
AGATAAATTCTTGCGGATTGGCACCCTTAACCCTTTAAATGTTATCACGC
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GGTTAAAAAACAGGGCGGCATCGGTTGCAGCGTTCCTTACCGTGATacgc
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cagcgcgcaatcaacgcagagaaaagtaaccatgacgaccatccaagatg
aAGTTCAAagctgatatttttattcctgtcgttgaaaacacaactcaaaa
atgtcatcattgctttttaaaaagagtcagtgatagagaatcataaccca
aaagtttgtctattatttcgatttgattccgggggtactagggttgcgag
ctgacggggggggggggggggggggggcgctgCCCAACTTTCgacctttg
gacccttaccgggactaaaaaggagaaaacaaaggaaaattttgtgaata
ttacgacccttattgggacaaatttgaccaatttagaccaaatttcgatc
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gaactgaaatttgattttctgattttcccgacccttagcgggactttgga
aatccaaaaaaggtacccttaagggcggcacataccgtaccctccatttg
cctaagtactcccccccccccgagatccaattaaagtgacatttccataa
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AACCTCATAAGATGCCAGTCGCACTGGATTTAATCTCAATGTTTCAAAGG
ATGTCTTTTTGAAatctcaaaaactttgaaagtctcttatgctgacaaag
cagaataagacaaaaatataatagaataaatattatctttaaaacttttt
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AAGTATTGAGTTTGATAGCttttttacacctccatggtaccgttttatga
tattcatttttgtattatttattttgactttttaatttaAGGTTTCAAGC
CTAAAGACACAAAGTACAACAAATTTAATAAGAAATTGGAAAGACAAGAG
GATTTCAACCAGCACAAATCATTTTCCACCAAGAGATATGGAATCCATGT
GACTTTTCATGGTCGCAGATCAGCCCGTGGTTTTGCTCTAGGCTGGACAA
CAACAAGTAAGTTCATTAGTATGTACACCCGCTCTAAATGTTGCCGGTGT
CGGTCTGTTCTGGTTAGAGAATTCTGTGTTTCTTGATTTGAGTTGAGAAC
GACGCTACAATTAGAGGACAGTGCTACCGAAAGAACTCATGCCTCGTCTT
GAAACGGTTACCAAGGAACAAGTTATGATTATCGAGTCATtaagaataca
ccttttcgacagtagccgccaattgccgcgcaaTTTTATCCCAATACAAC
ACCGTCCCAAtatttttttcgcacctatagacaatagaaaaatgtatcaa
aaaaggactgggacggttttagtttgataaaaatgcccgcgcggtaattg
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taatgcaATTTATTTTCACTTGCTTCACGGCTAGCTGGCTCGGTTTgata
tctatgaactgaacgaaaCGGTAGAGGAAATTAGCAGAGGTTCGGGAAGT
CCTGGTTTGTGGCACTGAAACCTTAAACCCTTAAACCACATGATCCTAGG
CGACTTCTCAAATACCTTATACCTCTCGTCACCAGCGTTTCTTCTACGCA
ATAAACGTCTATTCAACTTTGCAACTTTCTTGAATGTTATTCCCCAGTtg
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TGTAATGgcgaaaaaaatcgaatttgcgtcaaagcacttgaaaggcttct
atttttcaaaaatcgtcaaaatggAACTAAAAATATTTAGACAAGCGAGA
TGGTCAACTTTTCCTTATCTGGCACTCGATGTAATTTGTTCCTACACGCT
AAAACAcagattttttttgttatgattacggaattttgccaGACCgtatt
ttttcagtgggaaggcgGAACCTCAGCCCTCATTTTTGGAGATTATTGTT
ATTATCAGGCTTACCCCAAGGGCCGTTGAACCTGACTGGGATGCGGCGCA
TCTAAGGGTGACTATTATTCCTCTCACATGGGAAATTGGTTCACTCTTTT
AGAGCTTAAGAGAGGGCAGTCACCAATCCGGAATCAGAATATCAGACAAA
AGTTAGCGCAAATTTCCGCttaaaggaaaaaatgaaaCTCCCTGGTCTAc
tgtaatgggcttttccagttAAAATCCGTACCCCTCACGTTGAGGATatc
cattttcaaaattgttaaacCCCGGGATGGGAGAAGCCCAATAATAGCAA
ACTATATTCCCCATTCTAGAAAAGGCAGAAGAAGAGGTCGGTTACTTACA
TTTCATTGGTATCGGTGTTGCCATCATCTTCTTCATCTGTTGTAACTGTG
GACAAAGAAAAAGACGTCAGCAGCAAGCAATTCAGGATTCTCAAACAGCA
AACGAGGAGGGAGATTCCCAAACAGAAGAAGGGGGATCTGAAGCAGGTGA
AGAGGAATCACCTGCACAAGAAGGAGGAGATTCCCATTCAGCCCCAACGG
CGCCAGCATTCGATGAGGGATTACCAGCTACTATCAACAACACGAATATG
AATCCTGAGCATAATTTTCCACCACAATTTGTTGGTTATCACCCAAACCA
AGAAGGGAATGGCGCAATCAATTTTGGTTTTGATAACTCTTTACCATCAG
CAGGTAAACAAATTTTAGATGACAATGTCCCTCAGTTCTTGGGTCTATTG
TCGTAAACGTATGTCGTATTCTACACATTAAGTACGTTTAGTATAGCGTA
CTACAATCagtgtcataatatattggcacttttggctaatttacaatttt
tcgaaaattgaagttcgagcgagaatgtcaatttttaggccttcaacttg
atttcatcgagtatttcgatctgggtgggatttattggtttctaggctat
atttcaagccctactggaccattttttaactttcggatcctcagatccta
aggtcctaagacttaagtctagcgttaaaactcagagttgaaactctacc
cttcgaacctactttagagcacttacaaatcgattgtggtttcaaaacac
cctgGTGAATTTCCCTATTgtgtattttgtccctgattgtacgGCAAAAG
ACTTTAAAGTATCCGTAGATTCCGTCTTTCACAGATACGGACATTTCCCA
TAGAGAAATAAtatactaaagtctgttcacgataagtgtgcactcttttt
tcttttacctataacttttgaaggaattctataaatttggtatttttgaa
GAGATATTTATGAgtagaacaatttgaaataaaaaagtttaaaaataaat
tctaaaaacgaagatgaaaatgaagaagaaaaaattaagatcttgtagaa
aagtgctttaactttcattttcactggagagattctttgatcttaggagg
tcatcactgtgaagaaatttcactaaaatatttattcaatataaagttaa
aaTCCAAAGTTAATAattgattgaccccaaaaaacagcagaaaacagcgc
ttttagacgtcaatcagcttaactttgtttgatatcctAGCCAACCAACC
TCACCTCTAAGGCTGTTATGTTTGGTTTTTAAGTAACTAGCCAAAGACAT
AAAACTTATTTGGATCAGAGTTCTTCTtactctttttgttttaaaaggtt
ttaaagttttcaatcaaaattttagttcCACCACCACCAAGCTATACAAC
CGCTTTGGAATATCCAGATCAACCGCCAACATATGAAGAAACtattgctg
attcagcaaataAATGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000018_pilon:2638337..2644353+ >XLOC_016376 ID=XLOC_016376|Name=XLOC_016376|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2670bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000018_pilon:2638337..2644353+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAActtaaatttaatatttgtatTGATTGcattcaaatttgaatttac
tTTTTCTTGGCCTTATGAATGTGATAGGAACCGAGATTGTTGCAGCTATG
TAGTTGATCACGAAAATGGAACTATGCAGACAAAACAAAAACCAGAATGT
CATCAATTTCACATTGATCTCAGTATTCAACACCGAAAAACTTTCACGGC
AAGTAATAATGGAAATTTAGAATACTATATGTTGGAGAATGTTGGTGGTG
TTAGTGTTTTGAAATGGGTTGAATTTAGGCTTTCAAGCACAACGCAGGGC
TGCGCTGGTGAAATATATGTTCAAGTTGGATGAActtaaatttaatattt
gtatTGATTGcattcaaatttgaatttactTTTTCTTGGCCTTATGAATG
TGATAGGAACCGAGATTGTTGCAGCTATGTAGTTGATCACGAAAATGGAA
CTATGCAGACAAAACAAAAACCAGAATGTCATCAATTTCACATTGATCTC
AGTATTCAACACCGAAAAACTTTCACGGCAAGTAATAATGGAAATTTAGA
ATACTATATGTTGGAGAATGTTGGTGGTGTTAGTGTTTTGAAATGGGTTG
AATTTAGGCTTTCAAGCACAACGCAGGGCTGCGCTGGTGAAATATATGTT
CAAGTTGGGTGTACGAATCAGAAAGTTTTTGGTCCATTTTGTGGGAACTC
TGCACCACATGAATTCTACAGTCGAGACGGTTGTATGACAGTGATTGTAC
AAAATGGAAAACGATATAATACTACTGTGAAATTCACATTCGAAACGGTT
GATTTCTCAATGATGGCCAGTCGAAATTCACCATCTACGTGTAATAACCA
AAAAGTCTTCAAACAGAGTACTGGAGTGATAATGTCACCAAATTGGCCTT
TTCCATTAGACAATGATATTGATTGTCTTTGGAAAATTGAAACTGCTTCA
AATCGTGACATCTTGATTAATATAATAGACTTTGAATTGGATTCTAACGA
TGACTCACTTGTCGCGATTTACGGTGTACGAATCAGAAAGTTTTTGGTCC
ATTTTGTGGGAACTCTGCACCACATGAATTCTACAGTCGAGACGGTTGTA
TGACAGTGATTGTACAAAATGGAAAACGATATAATACTACTGTGAAATTC
ACATTCGAAACGGTTGATTTCTCAATGATGGCCAGTCGAAATTCACCATC
TACGTGTAATAACCAAAAAGTCTTCAAACAGAGTACTGGAGTGATAATGT
CACCAAATTGGCCTTTTCCATTAGACAATGATATTGATTGTCTTTGGAAA
ATTGAAACTGCTTCAAATCGTGACATCTTGATTAATATAATAGACTTTGA
ATTGGATTCTAACGATGACTCACTTGTCGCGATTTACGGTTTCAAGCCTA
AAGACACAAAGTACAACAAATTTAATAAGAAATTGGAAAGACAAGAGGAT
TTCAACCAGCACAAATCATTTTCCACCAAGAGATATGGAATCCATGTGAC
TTTTCATGGTCGCAGATCAGCCCGTGGTTTTGCTCTAGGCTGGACAACAA
CAAGTTTCAAGCCTAAAGACACAAAGTACAACAAATTTAATAAGAAATTG
GAAAGACAAGAGGATTTCAACCAGCACAAATCATTTTCCACCAAGAGATA
TGGAATCCATGTGACTTTTCATGGTCGCAGATCAGCCCGTGGTTTTGCTC
TAGGCTGGACAACAACAAAAAAGGCAGAAGAAGAGGTCGGTTACTTACAT
TTCATTGGTATCGGTGTTGCCATCATCTTCTTCATCTGTTGTAACTGTGG
ACAAAGAAAAAGACGTCAGCAGCAAGCAATTCAGGATTCTCAAACAGCAA
ACGAGGAGGGAGATTCCCAAACAGAAGAAGGGGGATCTGAAGCAGGTGAA
GAGGAATCACCTGCACAAGAAGGAGGAGATTCCCATTCAGCCCCAACGGC
GCCAGCATTCGATGAGGGATTACCAGCTACTATCAACAACACGAATATGA
ATCCTGAGCATAATTTTCCACCACAATTTGTTGGTTATCACCCAAACCAA
GAAGGGAATGGCGCAATCAATTTTGGTTTTGATAACTCTTTACCATCAGC
AGAAAAGGCAGAAGAAGAGGTCGGTTACTTACATTTCATTGGTATCGGTG
TTGCCATCATCTTCTTCATCTGTTGTAACTGTGGACAAAGAAAAAGACGT
CAGCAGCAAGCAATTCAGGATTCTCAAACAGCAAACGAGGAGGGAGATTC
CCAAACAGAAGAAGGGGGATCTGAAGCAGGTGAAGAGGAATCACCTGCAC
AAGAAGGAGGAGATTCCCATTCAGCCCCAACGGCGCCAGCATTCGATGAG
GGATTACCAGCTACTATCAACAACACGAATATGAATCCTGAGCATAATTT
TCCACCACAATTTGTTGGTTATCACCCAAACCAAGAAGGGAATGGCGCAA
TCAATTTTGGTTTTGATAACTCTTTACCATCAGCAGttcCACCACCACCA
AGCTATACAACCGCTTTGGAATATCCAGATCAACCGCCAACATATGAAGA
AACtattgctgattcagcaaataAATGAttcCACCACCACCAAGCTATAC
AACCGCTTTGGAATATCCAGATCAACCGCCAACATATGAAGAAACtattg
ctgattcagcaaataAATGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000018_pilon | genome | sc0000018_pilon:2638337..2644353 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1246-1335:5928 |
| Aaloc | 862-1242:4522 |
| Aaloc | 697-858:3044 |
| Aaloc | 331-693:1227 |
| Aaloc | 1-327:1 |
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