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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000316_pilon:4934..13106- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_016330 ID=XLOC_016330|Name=XLOC_016330|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=8173bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000316_pilon:4934..13106- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGATCGCTGGTGCTCCTGGTATGTACAGATATCCTTATTCCTTTAAGCT
TTTTTCACACGCACTCAAAACTTTACTTTAGACCTTAAAGAACGGGGAAC
TTCCCTAAGCTTCCATAGTGTTTTAAGGCCTTATGCTTAAGTTGAAAAGT
CACGTAAGACCCTTTTAATCAACAAAAGCTCTACATAATGTCGGGGAAAT
TCCCAAAAGCCTTACGAACGATTTTCTGTAAGGTCTGAAGTAAAATTTTA
CGTGCATGTGAAAAAAGCTTTACACACTAGATACGCTAACTGCTTACAAG
ATTTCCCTTGAAAATATGTCATGGCGTCCTCCAGCTTTTTGGTCCCCCCT
AATATGAGCTAAAATCCCCCATCTGGCCTTTCCCCCCCCCACCTGTCTTT
AAAATTCGTGCTCCCCCCAATTGGGAAATCCCCCTAGCCGTATTGTATAA
GGGTTGCGAAGTGATGATCCAGACTCGCCTCAATTCGCAAGCTACTATAG
CAAAAAAAAGACTCTCAAAATCCCAAGAAAGACAGGCTCATAAGCCTGAA
TGCCCAAACACACCAGGAAGGTCTGTATTTATCCTATTACTCCCCCCACT
AGGTAGAGGACTGAATATACCCCCTATTCGCCTTTCTCCCCCCATCAAGC
TTGAAATTTTCACTTCCCCCCTGGCATCAAAATCTGATTCCCCCCCATCT
TCCTGGGGGGGGGGGATGATCCCATGTATGTCCAGTGAAAAAGTCGACTA
GTCCGCCATGCTGTTTTCTGTTTTACACTAGATTTTTGCACGCTCGAATT
TCCAAACATTGACAACAAAGATAGCAGTTGTATCTGCTATCTATATGGCA
GATTAGTCAGCTCTTATGGACATTCATTTCATTCCAGTCATTTTGTAGGC
CTAGAAGCCTGGAACTATCTATTATGTAGTTTACCATTGACACCATTCTA
ATTTTTTAGTTCTAATCCTAGGAAAATCAATCTCACTGTTATGCCAATTT
GGAAATGATGACCTAGGTTTTTCTCCATCTGTTTTAATGGGCTCTTCCAG
AAAATATTTGAGTATGAGGGGTAGAGGATATAACATGTTTTGGAAATTTA
GCCCTGGACATTGTGAATTTTGAGCCCCCGGACAAGCATTGCTTGACCCC
CCCCCCCCCCCCCGAACATTCAAAATCACCCCTAATCAGAGCAATTTTTT
CCCCAAAACAAGGCAAATTTTGCAGATTTTTCACTACCCCCGGACAAAAT
ATCCAATATATCCTACACCTTTGTAGAAAGGCATTATTGGTATGCAGGTT
TTTTTTTATAAGAACATCCCAAATCTTTGTAGCCTTTGGATACCTCTTTT
TGGGTCTTAAATGTTCTTAACTTGTTCTTATTTTTTACAATTTTGTGACT
ATTTTGTTCATTTCCCTAAGAAAATAAGGTGGTTTTAGCGTCCAGCAAAG
CCTTTAAAATGTTCTTAACTTGTTCTTAATATTTTGACCATCGAAGCCTT
AAAATGTTCTTATAAAAAAAATGTGTATATAACTTTTTTTTCTCTTTTTC
TAGATCCGACCGGTGGAGCATCCGCCTTTGAAGACGCAAAATGGGTTTTA
GATGAAGCTTCACTGCAAGAAAACATCAAGAAGATTTTGGCACGGTTTTG
TGGAACTTTACCTTATGTTATGATGGACTCCAACGCTGCTTTCTTGAATT
CAGTACCCCCTGTTTCTCAAGAATGGTAAGTTTACATCTCTATTTCTGTT
CTGTTCGAAGACAGTATTTTGTCAATCCAAAAATCGCTTTTCTTTTTTAT
GAATCGCATTATTTTTCCATCAAAAGCAAGTGTTCATGATATGCAAAAGA
GAAAGAAAATAAATTCTTAAGTATTCGTAAGCAATGTCAACGGCACCTAA
TGGGCCATTCCAGAGGAAGGGGTGTCCATGATATGCACCATTGCAATGTC
TTCCGGGCACCCGACAGCTGATTGGTTGAAAGTGACGTATTGACTGATTT
TACGTCACTTACAACCAATCAGCTATTGGGTCCGTGATGTAATGTCAGAA
GACGTTGCAACGGTGCATATCACGAATTGCACTTTTGAGGACGGCGGAGT
GACTAAAGCGTACCGGGTGTGCCAGAAATAAGTTACCCTCTTTTGACTTT
AAGTGAAATTTCTCAAGTTATACAACTTCTTTAGGACTCGAACCTATTTC
ATTAGAAAGAAAAAGAATAAATTTTAATAGATTTTGATGGATCATTCATT
GAGTTTGGTAATAAAACAATATCAAAAGTTTTGCTTGAATGAATTAAAAA
ATCATTCTATTAAATTTTCATTCTCACTACTGTGAATTATTACCTTTCGC
CCGAATGAAGTGTTTTAATTGCGACTAGAATTAGATTAAATTAGCTTTCT
ACCCAATTTATCCTAAAATTGGGTCTAATTTTTGGTTAAAGACCCCAAAA
ATTCCAAAGTTATCGTCAGTAATAATAATGGCATTTCTTCTAGAAATACC
ATATAGTTTCACTTTTAAGGATATTTTCCTTTGTAGCCTTAAGACTGAAA
TCCTTTTTTCCTTGCATTGTAATTTTTAAACGCTTAGCTTTTGTTTTAAT
CACTTAAACAATGAAATCAATGCTACATGCATTCATGTTTCTGTCAAAAT
TTGATTGGCTGATTTTTGAACTTTTTGAGCAATCTCAGAAAACGATTCAT
TTTCCATTTAATCATAACTTTTGATCTAGTTAGTAGGAGGTCAAACCTGG
GGTCCCGTGACATCTTTTTTACGATTTAGCCATTTTTAGTCCATTCCAAA
GAACAGTATATTATGAGATATTTTTTAGAGGGAGGACACGGATTAGGCCA
GGGACTGCCCGGGAAAACTTTTTATGAACATTAGTGACGCCGTAGGCAAA
ACTGCAAGGAAAAATAAGGGGTAGAGAATAGCTTATTTTCAAAAGTCAAA
ATTAACGGAAATGATTGGTGCCATTAAAAAGAGCATGAAATTCCGAGCAA
AAAAATGTATTACAAAAACTCTCTGACTAAAGCACACAAAGAAATACAGC
CGCTTTAAGACCAACTAACTGTCAGCTCTACTGTGATTTGACGTTAAATC
TTGTCTTGGTCGTACTGACGTCGGTATGTTTTTGAACTTCAAGAGGCTGT
ATTTCTTTTTGGACCTACCTGGAGGTCCTATAAATTAACCTTTGTCCGTC
CGTCCGTCCGACCGTTCGTCCGTTCGTCCGTTAGACTGGAGTCGATTATA
ATGCATGTAATACTAATAATAAACACAAATAATGATACGGGATTTAGTTT
GTATAAACGACTGGAAGAATACGGTGTTCCAGCCTTATAGATACCGGGCC
TAGCTACGCAGAAACTTGCGTAGCGAGAAAACAATTTGTCAAACAACAAC
AAACTCTCAAAATAAAATCAACTCAAATGAAAAACTTTTAACACACAAAT
CCACACACATTTTATTTTCAAGAATTTTTTTTGAGCGGGAAAAAATTTTA
ATTGCGAATTTGACACTTTTTATTTGTTTGGAGCTAGTGCACAAAGGTTT
CTAGACGACTAAAATTTACTTTTTGCTTTATTTCTAATATGTCTGAATTA
GTCGTCTAGCTTGCTAGACTATTCGTCCGTCTGTTACCTGCTTTTCTCGA
GATTGGCTCATTAGTTTTTTCTGATTTTTGGCACAATGATGCAAAATGGT
AATGCCCAAAATGTGACGGAGCCCGATTTTCGAAAAAAATTCACTTCCGG
CCGAAAATACCGGAAATACGCCGGAAAAACCGGTTTTTTGGCATTTTCTC
AAGATTTCATAATTAGTTTTTTCTGATTTTTTGCACAAAGATGCGTATTA
GCAATGCCCAAAACTTGGCCTAGTCCGATTTTTGAGAAAAAATCTTTTCC
GGTCGAAAATGCCGGAAATATGCCGGAAATCGCCGTTTTTGCAGATTTTC
ATTGGACTTTTTCCATATAATTGGTTGTTTTTTCATTCAAAAACATTATT
AATAGCAATGCCCACCATCAAGCATGTTTCAATTTTCAATAAAATTGATT
TTTGAAGCCGGAGCTATTTTAAAAGTCGCCGGAACAACCTATTTTCGCCG
GAAAGACAGTATAATTTCTCGAGCTGTACTTTATATTTTTTCATGAAATT
TTGCACACTGATGCAATATGACAATACCTAAAATGTGACGGAGCCCGAAT
TTCGAAAAACATTTTTTCCGGCCGAAAATGCCGGAAATATGTCGGAAAAA
TGGGCTTTTTGACATTTTCTCGAATTTTCATTTTTAGTTTTTTCTGATTT
TTTGCAGAAAGATGCGTATTCCAAATGCTCAAAACATGGCCGAGTTCGAT
TCGAGTAAAATTTTTTCCGGTTGAAAATGCCGGAAATCGCCGTTTTTGCA
GATTTTCATTGGATTTTTCCTTATATTTCTATGTTTTTCACTCAAAAAAC
ATTATTGATAACAATGCTCACCGTCAATCATGATTCAATTGTCAATAAAA
CTGATTTTTGCAACTAGAACATCCTATTTATTTTTTTCCCTACAACCCTT
CCCTCTCCCCCCATCAACAATCAATGATGAATTTATTGCGTTGTGTATTT
TCGCTAAACGCTATATTTTCTGACTGATTTTTTTCATTTTTCTTTTCGCA
TTGCTATCTAACTTTCATCATCAGGTAGGTCCAATCAGCATCTAGCTTGT
TGTGTTTGAGTCAGAGAGTTGCTGTAATACATTTTTTTGTTCAGAATTTC
ATGTTCTTCCAGATGTTACCAATCAGTTTCATTTATTACCTATGACGTCA
CTATTTTGGCCATAAAAAGTTTTCCCGGGCCCAATCCGCGTCCTCCCTCT
CAAAAATATCTTATAATATACTCTGTTCTTTGGAATGGACTAAAAATGGC
TAGGTCGTAGAAAAGATGTCACGGGACCCCAGGCTTGGCCCCCCTACTAA
GTAAACCAAATTTGATAAATGACCGATCAAAGTTTAAGTTTACCTTTCCT
CTTCATTATAAAAAATAGTTAGATTCTTTAGAAAGTCGTAGATCTCGAGA
AATTCCGTTTTGAAGAAGGTTAACTTATTTCTGACACACCCGGTATGTGA
AGTATATGGAACATATTATTCTAATAATTTTTCTTTGTCGTATAGGTCAA
ACTTGCTACGCTCATTCCAAGGAAACGATCCAGAAGCATTATGGAACCTT
TTAAACATATCCCGACATTTATACGCCAAAGGTGATCGTAACGCCGCTCA
TCTTCTGCATTTGATCACAGAGGAATGTCTATTGTCTTACCAAATGATGT
TCTATTGGATGTTGAGCTATAATTCGACGTCCAATCAACACGCAGCTATT
GGGCGTGGTCGTCCTGGTAAGCCACACCCTCTAAAGCTTTTTCACATGCA
CTTAAAATTTTACTTAAGACCTTAGAGAATTGGGGATTTCCCTTAGCTTA
CGTTTAAAGCTTTAAGGCCTTATGTAGAGTTTGCTTACGTTCAAAAAGTT
TTGAACGGAATGAAAAGTTACGTAAGACCCTCTTACTCAACAGAATTAAA
AATTTGCTACAAGGGGTTTTTCGCCATTTCATTTTTCGACACGCAAAACA
AAAACTTTAAAGCCAATATATCTAGTCATGAGTCTGACCTTCTATAAAAA
ACCGACTAAAATTTTACGTACATGTAAAAAAGCTAAAAGGTCTGTTTCCC
CGTTTACGAACCTAGCTGAAAGAACGTTGCTGTTTCAGAGATGATACACT
AGTTTTATTGCTCATTTTGGTCCGGTCTTTTTCGTGTACAGTTAGTTTTG
CCTCTCTCTCTCTAATTGAATCCTTCAAGTGACTTAGAATTTTCTTTGAA
TTATAAGGAAAGTGTTTCACATCACCTTTCAAGCAAATGGAAAATGTTTT
ATTCGAGTTACAGAGACATTCGAATTGGGCTTTTCCAGAAATAGTCCGTG
CCCCCCTTGTTGAGGATATCGGATATCCAGAGGGTTTACGATTTTTGCTC
AAAAGTGGATATCCATGGGGATAAATATCTAAAGGGAGCGGATATCCAGG
GGGTAAAGTGTCTTTTCAAGTAAAAAATACAATACGATATCCAGGGGTAA
GCATCTTTATAAGAGAGGATATCCAGGGGTTTGAGCATATTTTTAAGAGC
GGATATCCAGGGGGTTCAATACTTCGAAAAATCAATATCCTCAACAGCGG
GGGTTGAATTTTTTTCTGGAAAAGCCCATGAGGTTTGATTAAGAAAGAAT
ATTGACTGTACTTCACAACTTTGTACATTAACTCCCTATAATTCGAACCT
ATAACTATTAAAATCTTATTCTAATTCGAACCAAAAAATTGGTCCCTCAG
TTAGAAATTAGTATAAAATACTTTCTGTTTTTCAAATCTTTCTCTGATTC
GAAGAAAATACTTGGTCCCTTGTAAATCAAATTAGAGAGGGTCAACTGTT
AGCGAGTTCCCAATCCAAAAACCGGGATTTTTCATTCCGTTTCTTGGTGA
GTTCCACTTTAATGATGTTCTGAAATGAGCGAAAAAGTTGCAAAGTGGAA
TAGTGTCGTGTTGCTCAAGGCTGATCATACCTGAGCTAATGACAACAAAA
TTTATATTTAAAAGTTTTTCCCGGATATCGGCCTGACTTACCGCTGGAAG
GTAAGGAGACGGGTTGGTACCCTTTGTAGCTCCTGGGTCAAGGCTCAACG
GAGTGGACACGAATTTAGTTCATTATAAGTACTCAATATTAAAACACGAT
ACCAACAATAAAATCCAAATAAATATATATAAAAAGTTCATAAAATATTC
ACGTCTGGATGCGCCGTTCACTGCAGATTATTACGACTTGGGTTTTATTT
CACTCTGCGGAGATCCCCAACTCCGCAGTCTTTTCCTTCTCTGGGTTTAA
CTCAGCAATGCCAATAAATCTAATACATAATTTCTCTTCCTGGGACGTAC
CGCTCGGTGGCCAATAAATCATTTTGACACCGTCGACCGGCTCCTTCGGA
GTCCGGTGGGCGAGTGTTCTTTTTTGTAAAACGAAAATGTTCTTTTGAAA
TCAAAGTCTTTAATAATTTACACACATTCATATTTTTGTAGCTTCTTTCT
AGATTCTAGATTATGCTTTAGTTTCTTGACCATGACAATAGACGTTACTG
CGTAGAAAAATTTGTGCAACATTTGTGATGATTTCACTGATTTCGTCTGC
CATTTTGTTTCTAAGCGCCGTCCGCCATCTTGGTACGATCAAGAAGTTTA
TGTTGTTCGTATAGTAAGTGTCTAGTGTAAGCTAGTCAGCCGTTAATCCT
TTATTCCTTCATTTTCAGAGCCGCCCCACATGTCATTGCCTTCCACACAC
GTGCTATCGAGGCACGCGTCAGCACATCTCATGGAAGAGATCGTCCACTT
GTGGGAACTGACTGTCATGTCTCCTTACCTTGATAAAGACACCAAGTTGC
AAATGAAACTCAAATTTGAAATTTGGAACCAACAAGTGATCGAATCTGGT
CGCAAAGGTAATAATAAGAACTAGCCGGTTAAAACTTTGACATGTTATAC
ATTTTCTGTTAGGCTAACTATCCTTGAGTCTGAAAATTTTAGAATCGCAA
AGAAAAAATTAGTTGAACAAGAAAATGAAGACTTTTGCGACGAAGAGTAT
TTCAAATTTGAAGAGCTTATTTTCGGCGAAGACGAAATATCTTTAAAAAA
CTTTGGGGTAGATGGTGTATCTTTTACCGAACTAAAAATATATTTTCGGA
AAATTTTTCTAAAAGCTTATTTGTCTCAAAATCTTGAAAATTTGCTTTTT
GACCAATTTTTCATCCAAATTGTTCATAGAAAAACAGCTATTACTTTTGA
TGCATCAGTTTAGAATATTTTTCCGAAAAATTTAAAACAGTTCAATTCTT
TGCGGACAGTTTGAAAAAAATTCGAAAACAAAAAAATTTATGTAGGCGCC
CTCCCCTACCTTCGGGTAGACAGCTATACGAAAAGGGAGCCTTTGGATCG
CCCTCAACTGCGATCGCAAACTTACTTACTTACTTTAATGCACAGGTCAG
GGTCAAGGGATCGCTTTCAACTCAAGGATGATAAAAGACTTTCCTGGGTT
TAATGGACCACTGGAAGCAGCTGAGATTGATTGGGATGTCTTCTATCAAG
TCCTTGGAATCCCTCAAAGTGAG Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000316_pilon:4934..13106- >XLOC_016330 ID=XLOC_016330|Name=XLOC_016330|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1458bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000316_pilon:4934..13106- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGATCGCTGGTGCTCCTGATGATCGCTGGTGCTCCTGATCCGACCGGTG
GAGCATCCGCCTTTGAAGACGCAAAATGGGTTTTAGATGAAGCTTCACTG
CAAGAAAACATCAAGAAGATTTTGGCACGGTTTTGTGGAACTTTACCTTA
TGTTATGATGGACTCCAACGCTGCTTTCTTGAATTCAGTACCCCCTGTTT
CTCAAGAATGATCCGACCGGTGGAGCATCCGCCTTTGAAGACGCAAAATG
GGTTTTAGATGAAGCTTCACTGCAAGAAAACATCAAGAAGATTTTGGCAC
GGTTTTGTGGAACTTTACCTTATGTTATGATGGACTCCAACGCTGCTTTC
TTGAATTCAGTACCCCCTGTTTCTCAAGAATGGTCAAACTTGCTACGCTC
ATTCCAAGGAAACGATCCAGAAGCATTATGGAACCTTTTAAACATATCCC
GACATTTATACGCCAAAGGTGATCGTAACGCCGCTCATCTTCTGCATTTG
ATCACAGAGGAATGTCTATTGTCTTACCAAATGATGTTCTATTGGATGTT
GAGCTATAATTCGACGTCCAATCAACACGCAGCTATTGGGCGTGGTCGTC
CTGGTCAAACTTGCTACGCTCATTCCAAGGAAACGATCCAGAAGCATTAT
GGAACCTTTTAAACATATCCCGACATTTATACGCCAAAGGTGATCGTAAC
GCCGCTCATCTTCTGCATTTGATCACAGAGGAATGTCTATTGTCTTACCA
AATGATGTTCTATTGGATGTTGAGCTATAATTCGACGTCCAATCAACACG
CAGCTATTGGGCGTGGTCGTCCTGAGCCGCCCCACATGTCATTGCCTTCC
ACACACGTGCTATCGAGGCACGCGTCAGCACATCTCATGGAAGAGATCGT
CCACTTGTGGGAACTGACTGTCATGTCTCCTTACCTTGATAAAGACACCA
AGTTGCAAATGAAACTCAAATTTGAAATTTGGAACCAACAAGTGATCGAA
TCTGGTCGCAAAGAGCCGCCCCACATGTCATTGCCTTCCACACACGTGCT
ATCGAGGCACGCGTCAGCACATCTCATGGAAGAGATCGTCCACTTGTGGG
AACTGACTGTCATGTCTCCTTACCTTGATAAAGACACCAAGTTGCAAATG
AAACTCAAATTTGAAATTTGGAACCAACAAGTGATCGAATCTGGTCGCAA
AGGTCAGGGTCAAGGGATCGCTTTCAACTCAAGGATGATAAAAGACTTTC
CTGGGTTTAATGGACCACTGGAAGCAGCTGAGATTGATTGGGATGTCTTC
TATCAAGTCCTTGGAATCCCTCAAAGTGAGGTCAGGGTCAAGGGATCGCT
TTCAACTCAAGGATGATAAAAGACTTTCCTGGGTTTAATGGACCACTGGA
AGCAGCTGAGATTGATTGGGATGTCTTCTATCAAGTCCTTGGAATCCCTC
AAAGTGAG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000316_pilon | genome | sc0000316_pilon:4934..13106 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 604-729:127 |
| Aaloc | 415-600:854 |
| Aaloc | 193-411:3028 |
| Aaloc | 22-189:6619 |
| Aaloc | 1-18:8174 |
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