XLOC_016327 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_016327
Unique NameXLOC_016327
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000316_pilon:83145..95288-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_016327 ID=XLOC_016327|Name=XLOC_016327|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=12144bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000316_pilon:83145..95288- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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AAGGTTATTAATTTGTAAAGAAGGTTGTCAGAGAAGTTATTTTGTATACT ACTTCAACGGTTTTGGTTCAAAAACATCATTTTGAATGTATCTTCTACCA TTTGCTTGTTAAAATACATTGTTTCTAAACAATCCTCCAGAAACTAATTC ATAAATTAAAAAAGAAGTTGCAAGCCTGCCTGTATGTCATCAAATATTGT TGTAATTTCTTTTCACAGAGAATCGAACTTCCCTCGACTTGGTCAATTGA TCATAGATTATGAAGTACCTTTCAAGAAACTATCAGAGGAATTCACGCCG CATGCACAACGGGTTGGAATTGCGCTAAGCTCCTTGAATTTGCTTTACAA AAGACGTCACTTAGGTGGTGAACAGGTTAGACAGACCATTTTTCATGCCC TTTAAAAGCGGCCGTTTATCGGACGCTGCCCCTCTTGAAATTACTTAAAT ATTGGTAAAAAAGCCTTTTTTTTGGAAAAACACTGGAAAAAGTGCCACCA ACGGCCATCAACGGACGCTGCCTTGTCTTTCTAAAATATGGCCTGTTAGC TCCTTTAATAAACTCACTGTTAAAAGTTCTTTCGTCTCAGTGAAGTATAA ATAAAGAGACTTTTCCATCTCAAACTTCTACATTATTCACCAAAGTTTTA AAAACTTGCTGTATAAAAATATTTTTCGTCTTAAACGGAAGACCTTGCTT TGACCACTGTAAACTAAACACTTAACAATCCTTTCGTTTCAGACAGATTC TCGTTTAAATGAAGCATAAATAAAGAGACTTTTCCGTCTCAAAATTTTGC ATAATTTGACCAAAACTTTAAGAATATGTGCTAAGTACAGTATTGTGTAA TAGTCGCGCGGCTGAGGTCGAAAAAAGTGGCTAGAAAATGATTTTCGTGA TACACCTCTTAGATTCCACTTTTTTCGATGGAAACTCTCGAATTAGTATA TATGTAGATTCCAAAATCAAAAAGTTTCCACGATATTGTCGTGCAAGTAA CGAGTAAATGGCGATTTTTTGCGTTCCCAGGCAAAATTGCAAGGCCTGGA AATTCATGATTTTTGGAGGGTCTTCAAATTAAAAAAAAACCTATATCACG TGATAGAGCTCTTCAAACTGAGCAAAAAAGTGTATATAACCAAAGTCCCA ACTTCTCTAGATCAAAAGTTATGGGCCTATTTGTGGTCAAAAAGGTGTTT AATTTTGCATAAATTAATGCAGATTGTGGGGAAATTCCCTGTTTTCCATC AGTTTTTTACCACAAATAGGCCAATAAATTTTGATCTAGAGAAGTTGGGC CTTTGGTGTAATACACTTTCTTGCTCAGTTTGAAGAGTTTTATCATGTGA TATACAGTAGGTCTTTTTTTAATTTGAAGACCCCCCAAAAATCATGAATT TCCAGGCCTTGCAATTTTGCCTGGAAACGCAAAAAATCGCCAATTACTCG TTACTTGCACGATAATATCGTGGAAACTTTTTGATTTTGTAATCTACACA TACTAATTTGCGAGTTTCCGTTGTTTTTATTTGGAATCTAAAAGATGTAT CACGAAATGAAACGTTTTTCGACCTCAGCCGCGCGACTATAAATCTTGGC TAGCGAGCACCTCACCAAAAACCGAGAATTTTCATTTTGTTTTTAATAAG TTCCACTTGACTCTTAAAAAAAGAAACCTTTCAAGTATTCTGAAGCAAAT TCAATTTCCCCCCTACTGCAAGAATTTCGAAAGTTTAAAGTGACATAGAA AATCGATTGTTCGGAGCCCGAAAACTTTGGCTCCAGACATCAGAAAAATT CGCAAAGCGGAAGAGACTTTCACTGCGTAGAATAAGTTGTGACGTTTTGG ATAGGCTTAGTCTTGGCTTGGTTTGAAGGTATTTTGCTTCCTTTATGACC GTTATTATTTTTTGTCTCTAGATGCGACAAGCACAGATTCTTAGTTTAAC CAGTATGCCACAACAGATGTTGAGTCCAGCTCTCAGCGAAACTGTAAGAA AATAATATGTATTCTGAACAATTATTTGATTGATTAAGGCCTCTTGCTAT TATTGCACCTACTACCTTTGGCTTGGCTTTCGGTGGTTTTTTGATGATGC TGAGTCCATTGAAGTAGACTAGGAGCACTTGACAAGGTCACCATTTTTGA ATGAAAAACATCAAAATTGCAAACAACGATTGAGCACTATTATACACCAC AAGGCTATTTAATCGGGCCATCCAGTTACTCAGTCAAAAATCCTAATTGG CTTTAAGCTCCTTTGCACCTTGCTTGTGTTGATCCGGACCTATCCATTAT CTTTTTTTTAGTTCTATCAAATTTTGTAACCGGCGACTTTTTTTTATACT TTCAGGTGCCTTGCGAATATTTATCAATGGAAACCATGACCAAGTGGATC TTATGTTAGTATCGTTTACCTTATCGGCCAAAACTGAGTCGGCCTTAATT TTAGTCGGCCTTAATTATTAGTCGGCCCTAATTTTAGTCACCTCGTCAAA ATTTCGTCACTAGAGCCGACTAAAAATTTGAGCCATTTCTAAATTTGGTA TAAGGTAATACCGATATGAAAAGTGGATTAAAGAAACCTTAAATTATAAA GTTTTAATTTGGCCCAAATTTTTAGTCGGCCCAAATTTTAGTCGGCCCAA ATTTTAGTCGGCCCTAATTTTTAGTCGGCCCTAATTTAGTCACCTGTCTA AGCCAAAATTTAGTCACTTAGGGCTGACTAAGTTTTGGCCGGTATACATT ATTTATTTCTGAAAATGTTTCATTCTAACAAACTTGACACGTTCTGTTAA ATTCATTGTCATTACGGATGTACATGTCTTCTAACGGTAGCGTAGAAAAT AGGGGTGCAAAATTTTTATCGGAGAGCAGATTTTTATAACATAGTAATTA TACTTTTATATTATGAATAGTCGGTAGAGTATTCGCCTTACAATCTAAGG GTTGTGGGTTCGATTCCCGGTCACCGCCAACTCAGTGAATGAGTAGCTTA GATTGGGTAATCTGATCTAGGTGGTAAGTTGCTGAGAGTAGATTCGGCGC TCCACCTCAGCATTCGATTTCTCAGGTCTAGCGTAAATAGAAAAGGGGAA AGACTCCCTCACTCCCAGCTCCGCCGACAGCCACCAGATGAATATACTTA CTTACTTCTACCCTTGAAAGGGTAAAAATGCTTCTACTAAGAATAAAAAA ACTTTGACATTGAGATTTCCCAGAAAAGATTTTTACCCCCACTGTTGAGG ATATTGATTTTTCGAAATATCGAACCTCCTGGATATCCTACTTTATTAGT AAAGATCCCCTGGATATCCACTCTTAGAAATATGCTCAACCCCCTAGATA TCCTCTTTTATAAAGATGCTTACCCCGTGAATCTTTTTTACTTGAAAAGA CACTTTACCCCTGGATGTCCGCTCCAAGGGAGATATTTAACCCCCTGGAT ATCCACTTTTGAACAGAAATCGTTAACCCCCTGGATATCCGATATCCTTT ACAGGGGGGCACGGACTATTTCTGGAAAAGCCCATTTCGTTCTGAAAATG TTTCTCATTCTAACAATTTTGGTTTGCAAAGACAAGTTCTACCTATACCT ACCCTTGAAAAGTTCGACAGCAAAATGCTTCTAAGAATAAAAATACTTTG ACATCACAAATAGTAATCGTTTTTCTTTTCAGTTGCATATACCTTATGTC CAAGTCAGATCACAGCTGTCAGTAATGCTGGCGAAGTTTGGAAGATGTGT TTGCAAGACGGGTTTTGTATGACCCTCTTTCGTGATGAAGTGCTGTACAT ACATAAAGAATTACAAACTTTGTTCGAGTCTATCAAAGGGTAAAGTTTGC CTTATTTTGCTTGATTTTGTATTAACTTGCCGCGTGTCAGTCTGCTTCGG TTAGCGAAATTCAATGTCTCAGTTTGTCTCAGTTTTCTGAGACAAAATCT GAGAAAACAAAAGCGTAGGAGTGCTCTTTAAAAAAAAAAAAAATACCGCA TTGCATTGATTCGTTGAATGTAACGTCACTTTAATTGAGCTAGTTTGAAT GCAAAAAATAGCTACGCTCCACCACAGAGACATTCAGAGATTTGCGTAAA AAGACAGAATTCCGAGACACAGAATGTTGCCTAACCGTAACAAACCGAAC TTAGCGTTATCTTTTCAGTCAGCGAAGAAGAGTTTAGTACAGGCTAATAT CGCTGTTGCCATTGAGTTTAAAGCCCGAAGGACTAGATAAGAATCTGTAA CCTTTCCCAGCCAAGAAAAAGTGAAGCAACTTATTTCTCATCCAGAACGC ACCTAGAATGCGCTGCAATCGTGACGACGAATTGTATCTAGCGATTCCTT TGTTTTTGAGGATTATATTTTTTGAAATCTAGCGATAGATTTTACTAGTC TATTTTCAATCCGACGTTTGTGTAAAAACCACGCGTGGGTGTTCTGGATT TGAAACAAGTGGTTTCATTTCCTATCCAGGAGTCTCGAGTATAGACTTTC GGGCTTAGAAGTCAATGGTTGTTACATGTTTTTAATTTTATTTGAATATT TTGAACGACAATTTTTTCTTGATTGTTTTCAGACAGAACAAACGAACGAA AGAAGTTCAAGATTGCTTGGCTCACTCATTACAAACCAGGTATAATAATC TGCGCTTTTTTTTCTAACGAAAAGGATACAACTTCAGGAAACTGGTTCGA GTGAGTATTATTTTATTACAGCTCTTGCCAAAATTGCGTAAATTAATATT TTTATGATTTTAGCTCCTCTTCAATTTTAGTGAAATAAGATATTATTCAA GATAAGTGTGAGAGGTCAAATATACACCTTTTCGACCGTAGCCGTCAATT GCCGCGCGGGCATTTTTTTTCTTCGTTTTACCAGACTAAAACCGTCCCAG TCCTTTTTTCGCGCCTATAGACAATAGAAAAATGTGTCAAAAAAGGATTG GATCGAGTTTAGAGGGATAAATAATAATTAAGTAGCACGCGCCTGACCGC GCGACTACGGTTGAAAAGGTCTATTGGAAAAATCTTTACGTACGTACAAT ATGGACGACCCCAAGGGAGTTCATAAAAAACGAAACATTGGTTCATTGAT TCAACTTTTCTCTTTCTTTGCAGTGCTAATTTTCACCGTGAACGAAGGAA ATACTTGATCACAGCAATGGATGAAATGATAGCGATTCTAAGTGATCAAC CAGGACTCCTTGGACCCAAGGTAAGGTTTATAGTTCCATTCATACTGAGA CGGAAAAATCGTATGAGACGAGTAGTTTGTAAAATGTTATCTGTGGAGGA GATCCTATATTGAAACATGAATGGAAAGTACAGAACTAATGATCATGTCT AGCTTCTCCGACTACAAAAGGAGCCCGGTTCCTTTTTCGCGAAACACGCC AATAGTCTCTCTAGCTTCTTTCTACGGTATAATTGCTGAGTTTTTTGGTG GTTTTAGGCATTAGTTCCTCTAAAAAGCCGACGTTGGAAAAAAATGAGTC AATAGAAAGTGACGAATTTTCTGGCAAGTTTTTCTGACAAATTTTCTACT AATAATAAGGTAACTTTAAGAAAAATTCGGTTTTAAATATTTGGGTTGCA TTGGACTTTCTGATATTTTTCCTAAAGAGGAAGCATTTCAACCCGGAAAA TTTCCAGGTCTTTTCTTACTGTTATATAATAAGTCAAAGTGAAGACAGAA CATATTTTTTTGACTTTGTCTATTTTTTATTTTTATTATTTTCTGACTCG CCATATAAAACTCGTCCCTTTCAATAACTCGCCAAAAAAGGTAAAATCGG CCACCATAAGAGCCACCATAGCGGGAAGGCAAGCCGCACACTAATAAGGA AGGTCTTTTCTGCTACCGGATAACGATGGCAGATACTCAATCTTTGCTTG AATTTTGAAACTCAATCCTAATTTTTGTACATAAGCCATGAGAATCATGA CAAAAATTTGATATCATAGGCCCCTTATTAACAGAAAAAGCCCATTTTGA GGTTAATTCTTTGTGTTTTAATAGTTCCCAACTTATTAAAAACAGACCCT GGGTTGATTATTTTGTTCTTCGAACTGAATTCAAACTCAATCTTTGAAAT AAAAACGGTAGCAGCTCAAAACCCTGGAAATTTTATTGGAAGCATTTCAA TTATATTGTGCTTTTCTGCAGGTCTTGGTGGCTTTACTCGGTATGTCCCA CGCCCGTGACGAAATCTATTGGTTATTACGCCACAAATACCACCCACCAC CCAAAGGAAAGAAAATTGCTCAAGACGACTACGAAGATGAGTAAGAAAAC TGTTTTTTAAATGCATAATGATTGTGTTTTTATTGAAACTTTTGGTATCG TCCTTTCGCATAAGATTCCACTTCCCGTCTGCTGACTTTTCCTTCCCAGA ATTCCTTTCTAAGTTCGTTACCAGTCTTTGCAAAAGTGGACATAAAAAGT GAGCCATCAAAGGTTGACAGTTGACTCTCTCTATTTCGACCTTCAAGGGA CCAAAAGGTTTCTTCAATTTAGGGAAAAATTGGAATTCCAGCGAGAATTA ACACTATCTTCCATGTGGGGGACCAATGTTTTACTGTGAACTGTCGCTAA TTCGAACTTTTATTATTCGAATCTTCCCGTAATTTAAAGTAATTCTCAGT 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000316_pilon:83145..95288-

>XLOC_016327 ID=XLOC_016327|Name=XLOC_016327|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2868bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000316_pilon:83145..95288- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGATCGAGGAGGAAGTGCTGCAGAACAGAAACTGGCTGAGAAACTTGT
CATTCTCAACAACAGAGGTTTGGGAATGCTTACAAGAATTTATAACATCA
AAAAAATGGATCGAGGAGGAAGTGCTGCAGAACAGAAACTGGCTGAGAAA
CTTGTCATTCTCAACAACAGAGGTTTGGGAATGCTTACAAGAATTTATAA
CATCAAAAAAGCATGTCAAGATCCAAAGTCAAGACCATCTTTTTTGAATG
ACAAATCTCTGGAACAAGCACTCAAGATTATCGTCAGGAAATTCCCTGTA
ATGGAAAACTCAAAGGCATGTCAAGATCCAAAGTCAAGACCATCTTTTTT
GAATGACAAATCTCTGGAACAAGCACTCAAGATTATCGTCAGGAAATTCC
CTGTAATGGAAAACTCAAAGGCTTCACATATGCAACCCGTTATGCAGATG
CACATGGATGTAGTGAAAGGACTCTCAAATTATTATTTCACTTTTGTTGA
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TGGATGTAGTGAAAGGACTCTCAAATTATTATTTCACTTTTGTTGATGTC
ATGATCTTCAAGGATCATGCAAGTGAATTATTAACGTCGATAGATGCAAG
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GATGACCGGAAAGCCGTACTCAGTCTTTTCAATCATGCTCACGAAATGCA
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ATTATGAAGTACCTTTCAAGAAACTATCAGAGGAATTCACGCCGCATGCA
CAACGGGTTGGAATTGCGCTAAGCTCCTTGAATTTGCTTTACAAAAGACG
TCACTTAGGTGGTGAACAGAGAATCGAACTTCCCTCGACTTGGTCAATTG
ATCATAGATTATGAAGTACCTTTCAAGAAACTATCAGAGGAATTCACGCC
GCATGCACAACGGGTTGGAATTGCGCTAAGCTCCTTGAATTTGCTTTACA
AAAGACGTCACTTAGGTGGTGAACAGATGCGACAAGCACAGATTCTTAGT
TTAACCAGTATGCCACAACAGATGTTGAGTCCAGCTCTCAGCGAAACTAT
GCGACAAGCACAGATTCTTAGTTTAACCAGTATGCCACAACAGATGTTGA
GTCCAGCTCTCAGCGAAACTGTGCCTTGCGAATATTTATCAATGGAAACC
ATGACCAAGTGGATCTTATGTGCCTTGCGAATATTTATCAATGGAAACCA
TGACCAAGTGGATCTTATTTGCATATACCTTATGTCCAAGTCAGATCACA
GCTGTCAGTAATGCTGGCGAAGTTTGGAAGATGTGTTTGCAAGACGGGTT
TTGTATGACCCTCTTTCGTGATGAAGTGCTGTACATACATAAAGAATTAC
AAACTTTGTTCGAGTCTATCAAAGGTTGCATATACCTTATGTCCAAGTCA
GATCACAGCTGTCAGTAATGCTGGCGAAGTTTGGAAGATGTGTTTGCAAG
ACGGGTTTTGTATGACCCTCTTTCGTGATGAAGTGCTGTACATACATAAA
GAATTACAAACTTTGTTCGAGTCTATCAAAGGACAGAACAAACGAACGAA
AGAAGTTCAAGATTGCTTGGCTCACTCATTACAAACCAGACAGAACAAAC
GAACGAAAGAAGTTCAAGATTGCTTGGCTCACTCATTACAAACCAGTGCT
AATTTTCACCGTGAACGAAGGAAATACTTGATCACAGCAATGGATGAAAT
GATAGCGATTCTAAGTGATCAACCAGGACTCCTTGGACCCAAGTGCTAAT
TTTCACCGTGAACGAAGGAAATACTTGATCACAGCAATGGATGAAATGAT
AGCGATTCTAAGTGATCAACCAGGACTCCTTGGACCCAAGGTCTTGGTGG
CTTTACTCGGTATGTCCCACGCCCGTGACGAAATCTATTGGTTATTACGC
CACAAATACCACCCACCACCCAAAGGAAAGAAAATTGCTCAAGACGACTA
CGAAGATGAGTCTTGGTGGCTTTACTCGGTATGTCCCACGCCCGTGACGA
AATCTATTGGTTATTACGCCACAAATACCACCCACCACCCAAAGGAAAGA
AAATTGCTCAAGACGACTACGAAGATGAGCGTCTACCGAAGCTTTTGTAT
TGTGTTTTGGAATTGCAAGAGTTGTTTAAGAAGTATTCCAAGGTGATCCA
AAGATATTTCATCCAATATTTGTCCGGATTCGACGTCGCCTTACTGAAAA
CTATTATACAGGTAACATTTTATGTAAATAAAAAATCAGACGGTTTGGTA
GCGAGCGCCTCACTAAAAACTGGGATTTTTCATCTCGTTTCTCAGTGAGC
GTCTACCGAAGCTTTTGTATTGTGTTTTGGAATTGCAAGAGTTGTTTAAG
AAGTATTCCAAGGTGATCCAAAGATATTTCATCCAATATTTGTCCGGATT
CGACGTCGCCTTACTGAAAACTATTATACAGGTAACATTTTATGTAAATA
AAAAATCAGACGGTTTGGTAGCGAGCGCCTCACTAAAAACTGGGATTTTT
CATCTCGTTTCTCAGTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_016327XLOC_016327-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000316_pilongenomesc0000316_pilon:83145..95288 -
Properties
Property NameValue
Aaloc1216-1434:220
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