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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000124_pilon:834161..845147+ Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_016094 ID=XLOC_016094|Name=XLOC_016094|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=10987bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000124_pilon:834161..845147+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTCTGCAATACAGCTCGAAGTTTGGGATTACATCATTTTTGGTTTGAT
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GacttccttttttgttttttttatagctCCTTGAACCTTCtcttaatgat
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TTCTTCTAGTTctaattagcgagagtcaactgtcccggggggggggctac
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gagtcccaggtGGGGtcacaaaataccaaaatagaaaaattagtcccatt
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GTACCATATACACAACCATTGTACGTGAAACTCAATTAAACCTTTTGATT
TTGCTATATTATTCTGAGAGAGAAACCAAGGATTTTTGTAATTTCTCCAA
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AGCTCCACTATGTGGTATGAAAagcttttggtggcacgtgttttttttag
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GTAACTTTAAtagagggtgaacaataatgtcattactgtaGACAAGACCc
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TTCCTGGTTTAATGGTTATCGTTGGCCTTTGCACACTTGCTGGATGGGTG
ATCTATGCAAATTATGAGAAATGCGACTTGAAAAGTAGTGGCCAAGTTCA
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ttatctaacgttcacaacgtccatataacgttagatgaacgttgaaacaa
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GGTGACTTTgataccatagatttataaagcccgaagggctagatggtgta
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gttttcgaaaacaatagcaatgatattttttccgatattcacttttttgc
ctgcgatggcttaaagcacgacatcttgccctttgggctttataaatttt
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AAAGCTCAAACACACAGCAACATTCCCTTATCTTAAATGTTTTTTGTTCA
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AACAAATTACACCATTTGAAAGGAGTTCCTGGCATTTTCATGGCCAGTTT
GTTTAGCGGAGCATTAAGGTAGATTTTCTTGACCAAATTAGTTTCATTCA
AATCAATAAAACGTTTTGATGGACAAGTGTCTTTGAGAGCACATACCttt
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ACTCATCATTTTCTATTCACACGCTTTttcatattgaattgacacggacg
GGTCagagagaggaaaagaaaaatattttttgcttatatcagcataaaat
aacaatagacagacactgtcctgatatgaaatatgtatctgatatgaaac
gggaacactaaaAATATAAACCCTTTAACTGTCAGATAAGATTCCTGTTC
ACAGACTAAACCACTGTTTCTCGTTAAAATCCTTCCATATTTATAATAGA
GGCTCctagcggtaactctgatcacgatatcacgcaattttttgttttca
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GTGTATAACTTCCAAACCTAATCATTAATCATATATTTTCATAGCACTGC
GTCATCAGGCTTCAATTCTTTAGCAGCTATTACATATGAGGATATCTTCA
AGAAAATCCACGGTGAACTCTCACCACAACAAGCTGCAAAGGTCTCCAAA
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TTTAGTGGAAAACTAAGCATACCAGTGACCTTTGGTCAATGGCCATGTGT
ACTTTGTGTACTTGTGTTCATTAAACATTTCCAGGATTTTTCAGGATCTT
TGAAAGATGAGCCAGTTTTCAAACTTTCCGATTTTCGAATTCATAATTCC
TCTCGGACCTagatcgaaggatgatgatgaagaCCTTGATTTGGTGAAAA
ACTAAGCATACCAGTTTTCAATACACACCCTTGTCTCTCCGCCCTGGTTC
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TGGTTTTGGAGTTCCGTTTTTAGCATTTAATTTCTAAttgagatgaaatc
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ATATGGAtgactaccgtgaaaagcacaggtcaaaatcatatattgacgct
gtgccgacgaatagagattctattcatcgcgcaatcaacgaagacaaaag
taaccatgacgaccatccaagatcttggatgaagttcaaagttgatattt
ttattcccgtcgttgaaaatacaacaaaaaaatatcatcaatgcttttta
aaaagagtcagtgatagagaatcataacataaagtctgtctaatatttcg
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atacatttggggatcatgtaaaagatttctttagAAAGAAACTCGCTTCG
ATTACactggaggtttctggggaattcgtaaatagtaaactgcatactga
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ttttttaaagcttttataTATGGATTTGTTGTACTGGGCGTGGCTTTTCT
TGTTAATAAAATGGGAACTATGGTCTTACAGGTAACTCCAAAGTTTTATC
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TTTCTGGAGCGGCTTAAGCTAATTTGGAAAAGCTGCAGTTCAGAAAACGG
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AGCCTATGCAATTCATGGGGTGATTGGTGGTCCATCGATGGGCATGTTCG
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GCCGAAGAAACCTATTTTttagggctctgaccatagtgaatttttcataa
ttgacgtgtttaaaatgtgttttctgaCtgatgtaaccaacaaaactatg
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ttcaaacaaataaacaacaccaaaaatttgattttattaaacAAAGCTTT
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TTtggtgttgttttttgtttgaatcATTGGTTAAGCTATGACTATCCATA
TATTCTGcataaagtcttctttttttttttttctttgtgctTTCCTACTT
TTCCTCTCGTTATCGTGCTAATATATGAAACTTTAATTTTCAGTGACCCA
TTGACGTCATATTATTCGGTCTCGTACCTTTGGTGGGGTGGCGTTGGTAT
AATTTCTTCGTTTGTTTTTGGCATGATCTTCTCTGCAATATACAGTAAGT
AATCAAAACCTCTTATATCGTAAGTTTTCTTGTAGCCACGTTCATTTTTA
TTGAGTACAATTTCATAGTTGtttgtctctgtaagggtccgaaaatcacg
aaatttaaaatttcctctctcaaagggtcgtgattgacaaaaattgagtg
aaaatcgacaacaattttgagaaaagtctctaagggtcccaaaaacgcca
aATTCTtactctctctaagggtcgattttcgatttttggttcggatatac
ccgtcacctcgcaaacctagcaCCCTTCCCCCAGGTAATGGACCTATAAG
TTAGtggatcgagaaaaaaaattaatctaattcaaatgaaaaatgtaaag
tgaagaagtgtgaaaatttttcaaggaaacatcTCCCTTTGAAAAGACGA
AAAGACTAGATACAACAACTATCTAAATAGACAAGGACCAGAAACCtgaa
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ctccacgagtcccaggtagggtcgcaaaaacaccaaaacagaaaaatcag
tccctcgtagggtgcctttttttggaaaatttggggaaaaagtagaaaat
ttgagaaaattttggaatttcagtcccattcagggtcacttttttcgcaa
atttcgagtcccacgtagggtccatttttcgaacctcggcggagcacccc
cgtcggtcgacaagggtaataccccccccgggcaaccccgtcggtcggca
agggtagtatgCCCTGGGTCCTTTAGGATTTTTTACGGTGTATGGTTTTG
AGGTGTTTTTCTGTCGTTGTTTCGGTATTTGAAAAGAAGAGCGAcggtat
ttttgttttgaacatacAACGCAGATATAAGATATGCAATTTTTGCTGTC
GGTGTTTAAGGTGACCCAGGAGATTGCTTTGATATTTCGGTGTTCGCAGC
CCACCGTATGATATAATCTTTTTTGCTGTCGGTGTTTAAGGTGACCCACG
AGAATGCTTTGGTATTTCGGTGTTCGCAACCCACCGTATGCATCTTTCAT
ATAGTCTGTTATACCATACCCGTTGTAACGTTAACGCTGATCAAATGCTT
TTTCTTTACAGGATGTTGTGTAAGTGAAGAAGAACTAGAAGAAACGCGAC
CATCTAAAGAACTCTTGTTTGATTATGGATATATGTGGAGATGTTTAACA
TGCAGGTGTTCAGATAGTGAAGAATTTAAACTACAACATGTCGATAAAGA
AGAATTCATCTTGAACACGTATCACAccaatgaatga Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000124_pilon:834161..845147+ >XLOC_016094 ID=XLOC_016094|Name=XLOC_016094|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3528bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000124_pilon:834161..845147+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTCTGCAATACAGCTCGAAGTTTGGGATTACATCATTTTTGGTTTGAT
GTTGTTATTGTCGTCAGTGATTGGTTTATATCATGGTTACCaaagcaaca
aaaacaaaagagatTCCAAAGATGACTATTTATTGGCTGGTCAAAGCATA
AGCTGGTTCCCACTCTTTATTTCTCTGGTTGCATCTTACTTGTCAGCTAT
AGCCTTGCTTGGAATTCCAAGTGAAATTTATACATATGATGTCTGCAATA
CAGCTCGAAGTTTGGGATTACATCATTTTTGGTTTGATGTTGTTATTGTC
GTCAGTGATTGGTTTATATCATGGTTACCaaagcaacaaaaacaaaagag
atTCCAAAGATGACTATTTATTGGCTGGTCAAAGCATAAGCTGGTTCCCA
CTCTTTATTTCTCTGGTTGCATCTTACTTGTCAGCTATAGCCTTGCTTGG
AATTCCAAGTGAAATTTATACATATGGTGGAATGTATATTGTAATTATGA
TGTCTTACCCATTGTTCATCTTTCAATGTCTTGTCATCTATGCACCCATA
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ATTATGATGTCTTACCCATTGTTCATCTTTCAATGTCTTGTCATCTATGC
ACCCATATTCAGACGAAGTAAAGTCACGAGTGCCAATGAGTACCTAGAAA
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GAATATTACCTAGAAAAAAGATTCCATCCGGCAGTTCGTGTTTTTGCAGC
CATTTTGTTCATCAAAGAATATGTTTTATACCTAGCCGTTGTACTGTACG
CTCCAAGTCTAGCGCTGCAAGCAGGTTTTATACCTAGCCGTTGTACTGTA
CGCTCCAAGTCTAGCGCTGCAAGCAGTGGCAGGTGTTCAGATGGAGATTT
CATTGGTGACAATTGCTGTTGTTTGTACCATATACACAACCATTTGGCAG
GTGTTCAGATGGAGATTTCATTGGTGACAATTGCTGTTGTTTGTACCATA
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GACGTTCATTATATGCGTCGGTTTGGTCGTTGTCGTTATTATCGGGTCGT
CGGAAGTCGGTGGAATACAAAACGTCTTTGAAATCGCTGAACGTGGAGGA
AGAATGAACATTCTTGAGGTGGTATGAAAGGAGTGATATGGACAGACGTA
TTTCAGACGTTCATTATATGCGTCGGTTTGGTCGTTGTCGTTATTATCGG
GTCGTCGGAAGTCGGTGGAATACAAAACGTCTTTGAAATCGCTGAACGTG
GAGGAAGAATGAACATTCTTGACTTCAACCCTGATCCACGTGTCCGGAAC
ACATTTTGGTCTTTTGTCTTTGGTGGGATGTTTAGCGCCATGCCTGTATA
CTGTGTTGGTCAAATGATGGTACAACGGATCATGTCCgccaaatctgaaa
aaactgtTCGAATCTTCAACCCTGATCCACGTGTCCGGAACACATTTTGG
TCTTTTGTCTTTGGTGGGATGTTTAGCGCCATGCCTGTATACTGTGTTGG
TCAAATGATGGTACAACGGATCATGTCCgccaaatctgaaaaaactgtTC
GAATCGCTTTGTTACTACAAATTCCTGGTTTAATGGTTATCGTTGGCCTT
TGCACACTTGCTGGATGGGTGATCTATGCAAATTATGAGAAATGCGACTT
GAAAAGTAGTGGCCAAGTTCAAAGCAATGATCAGCGCTTTGTTACTACAA
ATTCCTGGTTTAATGGTTATCGTTGGCCTTTGCACACTTGCTGGATGGGT
GATCTATGCAAATTATGAGAAATGCGACTTGAAAAGTAGTGGCCAAGTTC
AAAGCAATGATCAGATTCTTGCGTATTTTTTGGTCAACAAATTACACCAT
TTGAAAGGAGTTCCTGGCATTTTCATGGCCAGTTTGTTTAGCGGAGCATT
AAGATTCTTGCGTATTTTTTGGTCAACAAATTACACCATTTGAAAGGAGT
TCCTGGCATTTTCATGGCCAGTTTGTTTAGCGGAGCATTAAGCACTGCGT
CATCAGGCTTCAATTCTTTAGCAGCTATTACATATGAGGATATCTTCAAG
AAAATCCACGGTGAACTCTCACCACAACAAGCTGCAAAGGTCTCCAAAAT
CATTGCACTGCGTCATCAGGCTTCAATTCTTTAGCAGCTATTACATATGA
GGATATCTTCAAGAAAATCCACGGTGAACTCTCACCACAACAAGCTGCAA
AGGTCTCCAAAATCATTGcttttataTATGGATTTGTTGTACTGGGCGTG
GCTTTTCTTGTTAATAAAATGGGAACTATGGTCTTACAGcttttataTAT
GGATTTGTTGTACTGGGCGTGGCTTTTCTTGTTAATAAAATGGGAACTAT
GGTCTTACAGTTAGCCTATGCAATTCATGGGGTGATTGGTGGTCCATCGA
TGGGCATGTTCGCTTTGGGAATGCTGGTCCCTTGGAGTAATACTGTTTTA
GCCTATGCAATTCATGGGGTGATTGGTGGTCCATCGATGGGCATGTTCGC
TTTGGGAATGCTGGTCCCTTGGAGTAATACTGTTGGTGCATTTCTTGGTT
GTGTGTGCGGTATCCTTATTACAACTTGGTTGGCCGTCGGTGCATTTATT
TTCCCACCTGACAAGAACATTTTACCGGTATCGATCGAGCAATGCTCCAT
ATTCAACAGTACAACTATGAATGCAACTATTTATCATCAATTTCAACCGC
ACAAGGTGCATTTCTTGGTTGTGTGTGCGGTATCCTTATTACAACTTGGT
TGGCCGTCGGTGCATTTATTTTCCCACCTGACAAGAACATTTTACCGGTA
TCGATCGAGCAATGCTCCATATTCAACAGTACAACTATGAATGCAACTAT
TTATCATCAATTTCAACCGCACAATGACCCATTGACGTCATATTATTCGG
TCTCGTACCTTTGGTGGGGTGGCGTTGGTATAATTTCTTCGTTTGTTTTT
GGCATGATCTTCTCTGCAATATACATGACCCATTGACGTCATATTATTCG
GTCTCGTACCTTTGGTGGGGTGGCGTTGGTATAATTTCTTCGTTTGTTTT
TGGCATGATCTTCTCTGCAATATACAGATGTTGTGTAAGTGAAGAAGAAC
TAGAAGAAACGCGACCATCTAAAGAACTCTTGTTTGATTATGGATATATG
TGGAGATGTTTAACATGCAGGTGTTCAGATAGTGAAGAATTTAAACTACA
ACATGTCGATAAAGAAGAATTCATCTTGAACACGTATCACAccaatgaat
gaGATGTTGTGTAAGTGAAGAAGAACTAGAAGAAACGCGACCATCTAAAG
AACTCTTGTTTGATTATGGATATATGTGGAGATGTTTAACATGCAGGTGT
TCAGATAGTGAAGAATTTAAACTACAACATGTCGATAAAGAAGAATTCAT
CTTGAACACGTATCACAccaatgaatga
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000124_pilon | genome | sc0000124_pilon:834161..845147 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1591-1764:10814 |
| Aaloc | 1489-1587:9545 |
| Aaloc | 1318-1485:8703 |
| Aaloc | 1231-1317:8099 |
| Aaloc | 1162-1230:7213 |
| Aaloc | 1048-1158:5996 |
| Aaloc | 958-1044:5180 |
| Aaloc | 829-957:4485 |
| Aaloc | 688-825:3875 |
| Aaloc | 532-684:3359 |
| Aaloc | 466-531:2905 |
| Aaloc | 412-462:2207 |
| Aaloc | 346-411:1639 |
| Aaloc | 241-345:1060 |
| Aaloc | 1-237:1 |
|
