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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000124_pilon:856949..866448+ Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_016092 ID=XLOC_016092|Name=XLOC_016092|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=9500bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000124_pilon:856949..866448+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCTCAGCAAAATACCGCTTATGATGAAAAGGTTCGTCAGGAGCTCGA
GTGCTCGATTTGCATAGATCAATACCAGAAACCTAAACTTTTGGGTTGTA
TGCACACGTTTTGTGAACCTTGTATAACGAGGCTGATTAAAAATGGAACA
ATATCTTGTCCTCAATGCAGACAAGTTTCAAAGGTAAAGTTTATCCATTG
GGCCATACTTGTTTTGGAGAACGTgacggtctattgaataactaattgag
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gtggagtaatacctgtcgcgttctccaaaacaTCTATTGCTATAACTCTG
ACTGACTCTAAGGGGTGGTACCTGGGTAAAATGGGTGCCCGCCAGTTATG
TGGAAGCCATAATAAAGGTCGTCTTTTTTAAAAGTCTCTCAAAGCGAATA
GCAATCATGAAATCTATGCActacagttagggaaaccatccaggatcctt
ccattctatcagccagcaaaaactgaatgacacttgtaaacttaagtttc
ttaccattttccatcgaaaacaatcgaaaacattactacttcctgaagcc
ggagaccaaagcaaatgattttttttgatgagggcgcccttttggatcta
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CcactgcttcgagggtggtaacgccaaaacgccccaTATGAccagccaac
agaaggcgagtttgttgccgcgcgagcaacgtcatgcactccaccgtagc
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tctatttgactttgagagcttcatggaagatgaagaagtagaaagatgaa
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agttgaagaaatttctaccgacgcataatttttttacagccaattaaagg
cacagtaTGCTTATACctactatgtttgctatatcatctaggcaaaaaac
ggtaaaaaaagacacaaacacgatttttttatgagtgtggttatgatttt
tttgattgcggccgcgtacaggaactcgccaaatgttcctaactgcaCTA
GGgtccaaaaattacaaaatatataaaattgacTCCCTCAAAGGTCAACC
CGCGGtccaaggattgagccgagaacgcccACGAGCTCCTgtgcgggtga
aaaactttaatctgtcaatcattttcttgaGTGAAGAtacgcaaagcgat
tctagctttacgatagtgctgcgggtcatcagtggatagtattcgaaatt
atcattatccctttataccagacccgatcaatcgaacttgtcgaaccaat
cgaacaatcgaactaatcaaactccatcgaacgattaaagttcgattaaa
taaattaatcaaactcaaagcttttttaaaagattgtgacagttacatca
aaatgcctcgaaaatgtcaatatgaaaattgcgttatcagagaacgtatg
tcttgctcattataaaaaggccgacacaaactttcaataattggattgta
acatcgagttaagtctcttttgttaagtcaccagggggtaaataaaacag
accttgatacatttatcgttcgtttcaacttgacgattcatttaaaactc
agcctcctaaatatttggggtaggtaaaatatgtacaaagaaattcatac
ttttccaacccggcgaatctttaaaaaagaagcgaacaataaaatataat
taccctttccaaataaacctcttcggtggcgagcgtagtctactctgacg
taattgtaaaatttatgtgatgggagtttgacatagaaatgtaatgttgt
ttggggaattatgaagttctctggaatttcgattgcatttattcaggttg
attttttatgacttctaatggtactttttctaacgagtttgattactctg
ttctcacacttatgtctttttttttcgcgtccttttccgtgattactttt
atttatctttttaaagactggtaagaaggcatattgatgtaactgtgtga
gtgttcgattaagttcgatcattgggtttcggttcgatcagttcgataaa
ccaattttgtttgacaaatttgtgctgctccgccaccgtatattagcttc
ttttcaaagccaaattcggaatgtaaattgggaaattacttccgataacg
gattacacacttttcctgtatccttttagctcCAGAAGAAGTGGTTTGTT
GGGGCGGacgtagtattccgccactcggctGCGCGCGAAATCGTAACAGA
Ctttttttccggatagacaaatatccgggtacaataaacatcaagctgtt
aagtccgggaactgtcgaaattggcaatcgcgtgccaggacaaagttttt
gcaagcgagggaagatatgaggattttaatatcatcgaactaatcaaact
ttttactgaccgaactaatcaaactgctattgcttcaaaaattgtgagtg
ttcgattaggttcgattaatttttttaatcaaactttaatcgttcgatgg
agttcgattagttcgattgttcgattggttcgacaagtttgatTGATCCA
GTCTGGTTTATATTCATTTCttgaacttttacaaaaaaaaaaatgaaaaa
tagaaaagttgtattttttactgctctattcacatactgaatttgaaagt
tcttctatgtggcgttttttgcaAGCTTAAAAGCTCTTGCGGGGCGTTTC
ACAGGCGTTTCCCAGTGCCTTTTGTGAGCAGACTAAAGGACTGTATACTT
ACTTCAGTATACTTCAGTTTGATCTTTTGAACAGCCAGTGATATTTCGTA
TGTCAGAGGGAATACTGTTGAAGAGTTTTGGACCCTGTACAGCTAAGCTC
TCACAAATAAATCTGCGAAAGCTTCTTCGTTCAATTGTTCGTAGTTGGCA
TTTTTTACCATGACGGCTTTAAGTTGAAGACAGACACCACCTTTTACAGT
ACCGTCTCCTTCAGTGTGGCTGACATTTGGTACTACACCCTCTAGTATCG
ACCAAATATAAATAATTCTGTATCTCTCCCTCCTCCTTTGAAgagaatat
attttcaaaattttcaattgttcCTAATAATCGAAAGCACTAAGgccttt
gattttattgaagaagttCTTTTGTACAGATTCAATCTGTTCAATTTGGT
GGATGCTGTTTGGGGACCAAAGCTGAGAACAGTAGTCGAGGTGAGGGAGA
ACTAAGGATTTCCATAACGTTATCATAACATCACTGTTTCTGTTGTTGAA
TGTTCTCAAAATCCAACTAGAAATGTCCTTAGCTTTTGCTATCATTTTAT
TGATGTAATCTGTGAATGAGTCACTACTTATCCACACTCCAAGATCTTTG
AcagagtttttgttttcaattacagTTTTGTTGTTAGTGAAATAGgttga
taaactttttgatcTTTACCGTATTTCAAATGTTCGAATTTACAACTATT
TAGTTTCATGTTATTGTTCTCAGTCAAATCGTAAACTATGTTGAGATCAT
GTTGCAACTTGAACGTGTCAATTATTCCTTGGATTTCTTTAAGCATTcta
gtgtcgtcagcaaagcTTGCAAGGATTGAATACCTGATATTATCATCAAT
ATCAGAAATcatcatcagaaaaaaaattggcctaaGTACTGTTCCTTGAG
GTACTCCTTTTCAAAGGTTATGATTTTCATTATGTGCGAGGTTAGTGACA
CTGGCCGATAATTTTGACCTTTGTAAATAGGAATGATATGACTGTCTTTG
AAGAGATGTGGTGTTACCCCATTATCAAAACACTCTCTCCAGATTGTACA
GAAAGGAGTTGCTAGTTCTTGGCTACAATTTTTGAGAGAGATAGCAGAAA
AACTACCGGGTCCTGGTGCTGCATTTTTGGATATTGTTCCAATCTCCTCA
ACAAAGTCCTCTTTCGTAAAATCATATCAGTCAAAACAAAATCACTGTCT
TTATCATTATATTTTGCGTTTTCGAGTGGTGTACTGAAGACTGATTGGTA
CTGTTTATGAAGAATGTCTGCCATTTTTCTACTGTCAGACGCATAATTGT
TTGTTGTTTTATCTATTAAAGGACCAATTCTAGCTTTTGTCTTACTACTG
TGTCTTTTAGcataagaaaagaaatattttcgatTTAGTTTGATCGCTTC
ACAAGCTTTCTTTTCTGCAGTTGTAGTACTCTTCCTGTATGAGGTTTGTA
CAGTAATTGTCTTTCAATATCAACAAGTTGGGTTTAGATTATTTTAATCT
GAAAACAGTTTCTTGCTGAGATGATTCTTTTTTCTAACTTAGAACGCCTC
CTCATTAGAATTCTCCTTTCTCTCggaattcttttaaatttttgttcgtT
TTGTAAGGTTTCCTAATTGGAACAAAGttttctacgattttttcgcattt
tcaatagtttttctaatttttctacatattttaatttataaaaCTCATTG
TCCCAGTCAATTTGAGACAGTTAATATTTTACAGATTCCCAGGCAATTTC
TTTGTGATAGAaactgaatttttcaaattagttACTTGGAATTCTGTTGT
TTGTTTCAGTTACTGTTTCTATAGTTTTATGAATGTTAATATTTACAGAT
GAATGGTGCGTTATGTTTGGGTTCGTTGGCATGTATGAGTAGTTATGTAT
GTACTAATTCACGGTTGTTTGTCCATACTAAGTCAAGTATATTGCCATCT
TTGTGTGTTTCCTTAAAGGATACACTGTTGTAACGTAAATTCATTTGAAA
GTTCGCTTAACAGATATAAACATTGCTTCTCATCACTAGAAGCTCCTTTT
GTAGAACTCCCACAAGGCCAGGATGCATGTGGAAGGTTGAAATCTCCTAG
CAAGAATATGTCTTGTAAGGTATTTTCCGCAAAAGTATTGAAAGTATCTC
tcatcttttttaatatttcagaaaattctttcgAGCTTGATGGATGGCTG
TGAGATGAGTCATCTGGTTGTCGATAAATAACAGATATCAATATGTTTAA
TTTCTTGGAGTGAacaattaaagtctattcacgataagtgtgcactcttt
tttcttttacctataacttttgaaggaattcctcaatctttataaatttg
gtatcattggaaagatattagtgagtggaacaatttgaaataaaaaagtc
tttaaaaaaattctaaaaacgaagatgaaaatgaagaagaaaaaaatgaa
gatcttgtagaaaagtgctattactttcattttcactggagagattctgt
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aaaaaactgcagaaaacagcgtttttagacgtcaatcagcttataacttt
gtttgatatcttttgactcaatgattatttttgagaatttttttcacagt
gatgacgttcgataatcaaggtttcacttcagtaaaaatgatagttatag
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gttataggtaaatgaaaaaagagtgcacacttatcgtgaatagactttag
caGTTCATAATCACACCGTTTGAATACTGCAACACTGGTTTAAAGGTTGA
AATTATGTCGTTTCTAACGTAAAGTGCTACTCCTCCACTGTGCCgaccat
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ATTTCAACTTCTGCATCTTTGTGATCAGCAAGCCACGTCTCAGTTAGAGC
gatgaaaagtgaatttttctcATGTAAAATATCACTTATAAATGGAACAG
ATGATTGGACAGTTAATGGTTTTAGTGCTTGAATGTTGAGTAGCGTGAAT
GATTCTAAGCTTGCATCATATGCTGGTTGTGCATGTGGTGTTGAAAGATT
GTTTGAGTTGaccattggttgaaatttgggaCTTGATTCCACTTGGTGGT
GGTTGAGGTTGATTTTTGTTCATCTCTGCAAACTTTTTGTCCATTATTGT
CTGCAGAATcttgtttttcagattttggaTGAGTATTAGAAAATCCCTCT
CCTTATCACTGGCATCAGGAATTTCGCCAGGGTCTGTCAAATGTATATCT
TTCCTGTATTTTAACGAATTCTCAGTTAGTGTTCCCTTGACATGTAAAAA
TTTGCATTACATCCCTTTGGTTTTTTATTTCCATGtctcaaaagtttttt
gtaAGCTTGGGGGTGCTTGTACTGacattttttaccttttataCCAAACT
GACAGTTCCCTCTCAAATAATATTTGCACATTATATCCTTCTTCTCTATT
GGATGCTCAGTACCAATATTTAAATGTTGTTCGGCTTCTCTGGCATTTTC
GAGTTTATTACTTTGAGCATTTAGTGAAATTTGAGCTACTGCTTTTGAGA
AGTTCTTGTCGATAACATTAAGTTCACAACTCTGGCAGATATAGTGGAAG
CTTGGTATCGATTTAAAGAATAGCTTGGGCAAACCTTTGTCGTCAAGTAA
TTTAAATTCTGAAAGGATTTTGCTATAGCATTCACGATGAACTTCTTGTC
CACAACTTTCACAGCAAAGGAATAGTTGACTTCCATGTTTGAATCTATAT
TGTTCATCGCATATCTGACATATATCAGGAAAGAATCATTTTACTTTAAC
AATAAGCATGTCGATTGCATCATCTTTCAAGACTTTTTCAGTTATTTCCT
AGTTTGGACCCAAATAAATCAAAGTGACTGGTTTTGAGTTTGATAATTAG
AGCTTcaacttttcttataaaaaaattttgttattatttctatttctctt
tctttttcctttttctttttcttatgaGTGCTAAGGAACCATGCTTTTTT
CCTCTACATTATACCTTAGGCATGAGGTAGCAGAAACATTAACAGCTGAA
TGGTAGCATAACTAAAAAGAAATGTAGTagtaaaactgaaaaatattcaa
gtcttaCCATCGCCATTTTCAGAgttttagctctagtttagactgGTTTA
GACGGCCCAATTTTTgtcctgcctattctaattgtgaattaaagagggca
taaagtgggctgtctaaagtcgatgcatagccctcttttgacgtcaatgc
aggtcaatgcaatgtcttctttcaaacctttccaagcaaagattttaaca
accaactttgtgccctctttctgcctactctaacaattagaataggcagg
gcagaaagtcggccgtctaaactagagctaattcacatttcaattttatt
gtCTCTCTTGTTCTGAGGATTTTTTGTGTTGTATCTCATCTCATAATATA
TAGGTGTTAATATATAACAAGTTTTTATTGGTTAAAATGAATTCTTAAGG
TTAATGCAtttttttATAGGTGGTATGGTGGTGGGCGTGtatcttttgtt
tttcaatttcaattgatCTCATTGGCTTACGTTATTTCAATATATCCAGA
TATATCAcgtgatagtttctttttattttggttgcttgggatgttattgt
tttatttggGCTGTAGTTTAATGTGGGCTCATGAGTCTTgctattttaaa
gatttcttttcGTAAAGTTgggattttgcttgaaaaaatttcatttccat
cATAGACACATCCTAGGCCCAAATGCTTTTGATTTCCTCTGGAACATTTT
TGGTATTTGCAGAATAATATCACTGCAGAAAGAATTCAGGTCGAAATTTA
ATCTCATTTGATAGAAGCTTGCCTTTTTCTAGCTAAAGAGAGATTTTTGA
AGACTTTACattacaaatttttgaaaaatggtaaaatttatTTAGCTTAA
AAATTAATACTTCAATCTCTGAAAACTTCAAACAGTTTATTAGTTCGAAA
GTCATGGACTTGAAAATAGACCTTCAAAAGCATTTTGTTGCCTGAAATTG
GCTTTAAATGGTTTATTTAGAGCTCAAATGGATACAATTTTCAACCATta
actttgttttttctttatatagcttgtaaaatttagtacaacaagtgaaa
aaataagatttggaATTATTTACAAGCCTGAAAAGGCCTAACATGCTATT
TTTCCTAACATTTACCTTCAGTGTAAATCAGGATCTAATttacagagaaa
aaaaattcttttacaaTTAAGCTTGTATCCGCACCTTTATTAGGGGATTT
AAGACTACATAAGGGAATAATATTTAAATCAACTTTTAATTGATATGCAG
GTTCCAAATGGTGTATCAGGGCTATCTACCAATTATATTGCTCAAAACAt
catCGAAAAGCTGAAAACATCTGCAAGAGGAAATCAACCATGTTGTCATG
ACTGTGCTAATGGAATACCTGCCACAAACCATTGCAAAAATTGTGTTCTC
AATTTATGTAAAGATTGTACAAATTATCATCAAAGATGTGTTCGCTTTGT
TGGCCATTGTATTGTCGCAGTTTCGTCCGTCTCACAGGAATCTGTCAACC
AAGTTCGATACTGCGCCAAACATAAAGAGCTACTCAAATATTTTTGTGAG
AATTGTAAGGTGGTTGTTTGTAATGACTGCATGATTAGCAATCAACATAA
ACAACATTCCATGTCACTTATCACCGAGGCTAAagagaaagcaaaaaaag
aattgaaacaaaAGCTGTTAAAAGGCCTggaatgtaaacaaaatttgcTC
AATACTCACAAAGaaggtgaaaattttaaaaaaagagtTGAGGCTGCCGA
AGATAAATCTGTCTTGTTGGTCAAGAAGGTTTTTGTCGAAATTAGAAAAG
AAGTAGCTAAGAGAGAAAAGCAATTGGTTGACCAAATTAAAAAGGAGAGT
AATTTCCAATCATTTGATAAATTCTCAACGGCCTTAAAGAAGATATCGGA
TTCTTTAGAATATGTGAAAGAAGTGATGAAAAATGACAACTATGACAACA
TGGAGATTATCATGGATTTATCGAATCATTTGGACTTGCTGGATAAAGAA
TttgatttcaataaaaaatatcattcttACGAAAATCCCAACCAGCATCA
TCATCAAAACCAAATGCATGGAGGTCTATATTACAGTCAGCATCAACACC
AGCAACACCAACCGTTACTTATCAAACCACAGCAAAACAAAGTTTTTATC
TGTGAGCAAAAAGGGAATATACATCATCAAAGTTATCATCAGGCGACAAG
CACTAATAATTTATCATTCCAAATGACTTTGGTTGAACGTGATTTGGCTC
CAAATCGTAATCATAAAATAACCCAAAATTTAAACGAGTTTCAGATTTGA
Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000124_pilon:856949..866448+ >XLOC_016092 ID=XLOC_016092|Name=XLOC_016092|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2466bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000124_pilon:856949..866448+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCTCAGCAAAATACCGCTTATGATGAAAAGGTTCGTCAGGAGCTCGA
GTGCTCGATTTGCATAGATCAATACCAGAAACCTAAACTTTTGGGTTGTA
TGCACACGTTTTGTGAACCTTGTATAACGAGGCTGATTAAAAATGGAACA
ATATCTTGTCCTCAATGCAGACAAGTTTCAAAGATGGCTCAGCAAAATAC
CGCTTATGATGAAAAGGTTCGTCAGGAGCTCGAGTGCTCGATTTGCATAG
ATCAATACCAGAAACCTAAACTTTTGGGTTGTATGCACACGTTTTGTGAA
CCTTGTATAACGAGGCTGATTAAAAATGGAACAATATCTTGTCCTCAATG
CAGACAAGTTTCAAAGGTTCCAAATGGTGTATCAGGGCTATCTACCAATT
ATATTGCTCAAAACAtcatCGAAAAGCTGAAAACATCTGCAAGAGGAAAT
CAACCATGTTGTCATGACTGTGCTAATGGAATACCTGCCACAAACCATTG
CAAAAATTGTGTTCTCAATTTATGTAAAGATTGTACAAATTATCATCAAA
GATGTGTTCGCTTTGTTGGCCATTGTATTGTCGCAGTTTCGTCCGTCTCA
CAGGAATCTGTCAACCAAGTTCGATACTGCGCCAAACATAAAGAGCTACT
CAAATATTTTTGTGAGAATTGTAAGGTGGTTGTTTGTAATGACTGCATGA
TTAGCAATCAACATAAACAACATTCCATGTCACTTATCACCGAGGCTAAa
gagaaagcaaaaaaagaattgaaacaaaAGCTGTTAAAAGGCCTggaatg
taaacaaaatttgcTCAATACTCACAAAGaaggtgaaaattttaaaaaaa
gagtTGAGGCTGCCGAAGATAAATCTGTCTTGTTGGTCAAGAAGGTTTTT
GTCGAAATTAGAAAAGAAGTAGCTAAGAGAGAAAAGCAATTGGTTGACCA
AATTAAAAAGGAGAGTAATTTCCAATCATTTGATAAATTCTCAACGGCCT
TAAAGAAGATATCGGATTCTTTAGAATATGTGAAAGAAGTGATGAAAAAT
GACAACTATGACAACATGGAGATTATCATGGATTTATCGAATCATTTGGA
CTTGCTGGATAAAGAATttgatttcaataaaaaatatcattcttACGAAA
ATCCCAACCAGCATCATCATCAAAACCAAATGCATGGAGGTCTATATTAC
AGTCAGCATCAACACCAGCAACACCAACCGTTACTTATCAAACCACAGCA
AAACAAAGTTTTTATCTGTGAGCAAAAAGGGAATATACATCATCAAAGTT
ATCATCAGGCGACAAGCACTAATAATTTATCATTCCAAATGACTTTGGTT
GAACGTGATTTGGCTCCAAATCGTAATCATAAAATAACCCAAAATTTAAA
CGAGTTTCAGATTTGAGTTCCAAATGGTGTATCAGGGCTATCTACCAATT
ATATTGCTCAAAACAtcatCGAAAAGCTGAAAACATCTGCAAGAGGAAAT
CAACCATGTTGTCATGACTGTGCTAATGGAATACCTGCCACAAACCATTG
CAAAAATTGTGTTCTCAATTTATGTAAAGATTGTACAAATTATCATCAAA
GATGTGTTCGCTTTGTTGGCCATTGTATTGTCGCAGTTTCGTCCGTCTCA
CAGGAATCTGTCAACCAAGTTCGATACTGCGCCAAACATAAAGAGCTACT
CAAATATTTTTGTGAGAATTGTAAGGTGGTTGTTTGTAATGACTGCATGA
TTAGCAATCAACATAAACAACATTCCATGTCACTTATCACCGAGGCTAAa
gagaaagcaaaaaaagaattgaaacaaaAGCTGTTAAAAGGCCTggaatg
taaacaaaatttgcTCAATACTCACAAAGaaggtgaaaattttaaaaaaa
gagtTGAGGCTGCCGAAGATAAATCTGTCTTGTTGGTCAAGAAGGTTTTT
GTCGAAATTAGAAAAGAAGTAGCTAAGAGAGAAAAGCAATTGGTTGACCA
AATTAAAAAGGAGAGTAATTTCCAATCATTTGATAAATTCTCAACGGCCT
TAAAGAAGATATCGGATTCTTTAGAATATGTGAAAGAAGTGATGAAAAAT
GACAACTATGACAACATGGAGATTATCATGGATTTATCGAATCATTTGGA
CTTGCTGGATAAAGAATttgatttcaataaaaaatatcattcttACGAAA
ATCCCAACCAGCATCATCATCAAAACCAAATGCATGGAGGTCTATATTAC
AGTCAGCATCAACACCAGCAACACCAACCGTTACTTATCAAACCACAGCA
AAACAAAGTTTTTATCTGTGAGCAAAAAGGGAATATACATCATCAAAGTT
ATCATCAGGCGACAAGCACTAATAATTTATCATTCCAAATGACTTTGGTT
GAACGTGATTTGGCTCCAAATCGTAATCATAAAATAACCCAAAATTTAAA
CGAGTTTCAGATTTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000124_pilon | genome | sc0000124_pilon:856949..866448 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 184-1233:8451 |
| Aaloc | 1-183:1 |
|
