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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000066_pilon:1221696..1225918+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_015310 ID=XLOC_015310|Name=XLOC_015310|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=4223bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000066_pilon:1221696..1225918+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGcccgattttattttgttttactaATATCAATGGTAAGTGATGATGT
GCTTGGATGTTTCATTTAAAATCTAAATacccttttttcttcatttcggG
CATCTTTGCATTTTATCAATCTCCACTTTTTCGAGAGTAGTCAAGAATAT
TAAATTCTTTCAATAAAGTTGTTGAACCACCATCAAGATATCGAGGAATT
CTTTTATCAAgagtatttcttcttttaatgtaGTTTTTCAACCATCATGA
AATTTCTGGTCAGCTATCCAACTTCACGTTTGATGAATTTGTCACATTGA
ACAACCAACTATCGAAACAATGTCTTCGGAATTCTCCCCGATTGATTCAT
AGTGAGTGGCTGATATGACTAGCTGTAGCTATTTGTCCGAGGGGGAAGGG
GCGCTCGATTTCTCTAAGTAAAATATGCCTATCCCACCACgcgatttttt
tatcactttgtTGGTCTTTTGGATTTTAAGTGTTTTAATATACAATGAAG
TAACGTCAGTTCTTTAAAACAGCATTGCAATCGCacttaaagtgacgtca
aacttCCCCCGTTTTTTCTTGGGGAAAATATTTGTTAAAGGTTACAGACG
GAACACTGTCGAGACAAACAGGCAaactttatattaaaaaaaaatgaaaa
tgcaacTTTGAAGAGAAAGAATCTATATTCGCTATTGACGCCGAActcat
tttcaatctttaagATTCGTCAAAGACCTGTGAAGCTGAGTTCAATCCAC
ATTGGCTATGTTGGCCAGACACTCCTCCCAACGTTACTATAACAACCACA
TGTCCATCAATGCTTTATAACAACACTTTTGGTGAGTTAAAATTGCCAAG
GCTGTATATTACAAGGTCCTGTATAAGGCTCGCATgttttatatatctat
tggaaacCACGCTTTTTTGGTGCATGATTCAATTTATCttgatgaaaaat
attgaatttcgaccgttaaagtattcttaagaaagtgccaaaattgaggg
tgaaatattcttaacctattcttacttttttagacttgtcttttttacaa
acatgagaaatgatcaatttgagagttttggacttttgagtgaacatttg
ggttaaaattaaaaattctgtaaaattcaccctagagggtattcttaggg
tatttaCGATTTGGCCAtatttcaccctgatattcttataaaagatattc
ttataaataaagcgtGTATTTAGGCTGTTTTTGAGTTACGACACTCCCTA
ATAATTAGGGCAACAAAGTTCATGATTCCTGGCCATGACTTCAATGAACT
TATTGAACCTTTCTTCAGCGTTATTTaggttattttgaaatttggcttTC
AACCCTCGGACCGCCTTAGTGGTCCTAGAAAAGTggaaaaaaggaagatt
ttttgagttttgcaACCCATTGGAACTAACTTAAccaaattttgttgttt
ttgagggaaaaatttaaattttcctatttttccgaccctaaTAGAACTGa
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CACCCTTAAGAACAACACATACCCGTACTTTCACTTACCTAAGAGTATGT
TTGAGTGTATATTTtcaatcttgaatttttttaaattctaatcaAACGTT
ATTTGTACGTTATATGGAGGTtagaaaattgttgttttgatcgTTTCTAT
TTTTTCAGGCCAAATTAAACGCAAGTGTTTGAGCAATGGTACTTGGGATA
CATCTGTTGATAAAAGTGAATGTGTTCCACTAAATACACAACAATCATGG
TGGAATGTTGAAGACTTCCTAAGACAGTATAATTTCACGGTTGGTTTTTT
ACCAGCTGTCTTAAAGGGGGTGGGGTAGTTGAAtgaagttttaaaaattg
ttccacggattttaaagtaaaatctttCGGTGCAGTTTTTAACAGAACAA
GAATCATTTGCTGTTTTCACTCTCaaagtcaaatttaattttttagcttA
CAAAATTGCTAATTATGAATTTTGTTTTCAGCGTACTGTTCCAAATAATA
TCTTGCCAACTCAAGTACCTCCAAAAAGGGTATGTTACATTGATTCGTAT
GCTtttatttcatgaaattttatcTCAGAGAATTCGACTCGCGCATCGGC
ACCTAATTGCTTTTGTGCAATACAACTCTCTTTTATCTACAAAGATAGCC
GGATAATTCTCCGACAGAAATTTCGAACGATCACAAAACTCTTCGGATAT
AAATCAAGTGATCTGGGAAAACGGTCAACGGGGTTATGTCCTCAAGTTTT
CTTGGATCTCTATGCTCCCTTTTTATTACATTTGTTTGATGTACATATGA
ATGAGTGACcacaaaaataatgaataaaacgGTGAAAATTTAGTATTTAA
TAAGGATGGAGTAGGAGAATtacgtcgtcgtcgtcgtcgtcgtcgtcgtc
gtatCTCGATTTTTTAAGGCGCACCTTAATTTTCCGAGTTGATTCTAAGT
CGGTCATTTTAGGTGCAccttaaattttcgagttttaGAACTCGGTTATT
TTTAGGTTCACCTTATTTTTTCGAGTTACATAACTTGGTCATTTTAGGTG
CACCTTAAATCTTCGTGCTACATAACTCGCTTTTTAAGGTGCAccttaat
ttttcgagttatgtAACTCGATTATTTATGGTGCAACTTAAGTTTTCGAG
TTTCATAACTTGGTTACACCTAAAGCGACTTAATCGAGTTAATTTTTCAC
ATAACCAAGTTGGTCAATCATACTGTAATTTTCTCTCTTCGAATAAAGTA
GTAGTTTCGACGTCAGAAGAGACGGggataaactttcaaaaatgcGTCAG
AAAAGCCCTTTCTATAGTGTCGTGTTTATGGTAATTTATTGATATTCCAA
AACCCTTTTTGAAAAGAACTCATGTCCAAACTCAAATTCAAGTCTTTGTA
CGATTTTTCCCTTCACAAAAGACAACCTTTGCAGAGTAGCAGAGAGTTTG
AATCTTTTCCGTTCCGAAACCCAGGCTTAATTATAACGTTACTTATGGAC
GCCAAAGAAAGTGTATAGGCTCAAAAGCAAACGTCTGGTATCCTTCTAAT
TGTTATAAAAAAGCCTTCAAACTTTGATAATCTTTTCAACTAACGCTGTG
TCGCTCCTCTATCCGAAAAGAGAAAATTACAGTATGATTTACCAACTTGG
TTGTGTGAAAAATTAACTCGCTCATTATAGATGTACCTTAAAAAACCAAG
TTATGAAACTCGAAAacttaaggtgcaccataaataatcgagttatataa
ctcgaaaaattaaggTGCACCTTAAAAAACCGAGATAGGTAACTCCGAAA
TTTAAGGTGCAACAGGTGCACCTAAAATGACCGAGTCatttaactcgaaa
aattaaagTGCACATAAGAAACCGAGTAatataactcgaaaatttaaggT
GCACCTAAAATGACCCAGTAAACTTAACTCGGAAAATAAAGGCGCAcctt
aaaaaatcgagttatgacgtcgtaactcgggttttttaactcgggttttc
caggCCTCGAGAATTAAGGGATGGCTAGATGtttagctcaaattttcaag
gctttCTCTTAAAGAGAAAATGTTTCTAGATCTGAGTGAAGGAACGTGGC
ATGGGACAGGGTGTAAAATTCCGAATAATTTCTTTGCTCTCTCGACATCT
GTCTATTAGTCGATTAAACCTTCTCAAAACCATAAGGACTGAGAACATCT
AAGAAggctttaaaatatttatatctTTATTGATCCGGTGACAACttcaa
tggtcaaaattcttgtaTAAAAAGTTATAGGTCTTAGAAGGTTGCCCGTT
GGAGTTGAAAAAGAATAGCAAAGGTTTTATGACCCAAATGAGCTGCCTTC
TAGAGGCTGTAGCTTTTGATTGGagaaatttaagggaaaaataACTAATA
TAGTTGAAGTCAGGAGGCTTCAAATTAATTCTCTAgcaaaatgaagattt
tcatcGTCATCTActaaagtttttaaattatttttcctaGAAATCACAGT
GCTCTAAATATGATATGTACATTTTTCGAAGAATGAATTAGAAAATTGCT
TACGTCCTTTCAATCAATGACATTTATATACATTAGGTTCTTGAAATTAA
CGTGTTGACGTTTTTCATGCGTTTTTAGTCCAATGAAAGATTGGAAATAA
CAATTGAGATGTTGCAACAATTC Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000066_pilon:1221696..1225918+ >XLOC_015310 ID=XLOC_015310|Name=XLOC_015310|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=990bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000066_pilon:1221696..1225918+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGcccgattttattttgttttactaATATCAATGATGGcccgatttta
ttttgttttactaATATCAATGTTTTTCAACCATCATGAAATTTCTGGTC
AGCTATCCAACTTCACGTTTGATGAATTTGTCACATTGAACAACCAACTA
TCGAAACAATGTCTTCGGAATTCTCCCCGATTGATTCATATTTTTCAACC
ATCATGAAATTTCTGGTCAGCTATCCAACTTCACGTTTGATGAATTTGTC
ACATTGAACAACCAACTATCGAAACAATGTCTTCGGAATTCTCCCCGATT
GATTCATAATTCGTCAAAGACCTGTGAAGCTGAGTTCAATCCACATTGGC
TATGTTGGCCAGACACTCCTCCCAACGTTACTATAACAACCACATGTCCA
TCAATGCTTTATAACAACACTTTTGATTCGTCAAAGACCTGTGAAGCTGA
GTTCAATCCACATTGGCTATGTTGGCCAGACACTCCTCCCAACGTTACTA
TAACAACCACATGTCCATCAATGCTTTATAACAACACTTTTGGCCAAATT
AAACGCAAGTGTTTGAGCAATGGTACTTGGGATACATCTGTTGATAAAAG
TGAATGTGTTCCACTAAATACACAACAATCATGGTGGAATGTTGAAGACT
TCCTAAGACAGTATAATTTCACGGCCAAATTAAACGCAAGTGTTTGAGCA
ATGGTACTTGGGATACATCTGTTGATAAAAGTGAATGTGTTCCACTAAAT
ACACAACAATCATGGTGGAATGTTGAAGACTTCCTAAGACAGTATAATTT
CACGCGTACTGTTCCAAATAATATCTTGCCAACTCAAGTACCTCCAAAAA
GGCGTACTGTTCCAAATAATATCTTGCCAACTCAAGTACCTCCAAAAAGG
TCCAATGAAAGATTGGAAATAACAATTGAGATGTTGCAACAATTCTCCAA
TGAAAGATTGGAAATAACAATTGAGATGTTGCAACAATTC
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000066_pilon | genome | sc0000066_pilon:1221696..1225918 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 451-495:4179 |
| Aaloc | 403-450:2032 |
| Aaloc | 274-402:1711 |
| Aaloc | 157-270:717 |
| Aaloc | 37-153:234 |
| Aaloc | 1-36:1 |
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