XLOC_015267 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_015267
Unique NameXLOC_015267
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000408_pilon:157442..173517-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_015267 ID=XLOC_015267|Name=XLOC_015267|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=16076bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000408_pilon:157442..173517- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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AGACTGTAGACCGCTTAATTTTATCGTGTTTTAACGATAGAAGGTGTTGG CTAACTTTTGGTTTAGTGCTAGTAAAAATCTGCTTCTTACATGCTACTAA ATATTACTAGAAATATCATCTTGATCAGGTGTATCTACTCTTACACTGTA ACAGGAAATGTAATGAGGTCTGAGGGAAGGGGTCTATAGAGGAGCAGTAC GTTATATCAAATTTTATGAACTCTGGAAGCTAGTAATGTTTAGTCAACAT GATTTAAGTAGAGGTCTTTCTTTCAGTATCTACGCAAGTGAGAAAGCCTC TCCAAAATTATTCAGGCTATAACGTAGCTTTAAAGAAAGAAAGGTACAAG TACAACTGTGGTTTGCGCTGACAGAGAACTTTTTGATTTTCAACCCCTCT CGTTTGGGATTTTCTACGTTTTAAAATGACCATGACAATGACCATAGAAG TCGGGTTAAACACAGTTAATGTATTGAAGTGGAACATTTGATGGCGAGCG AGCGAAGCGAGCAGATTTTTTTGGCTTTTTCGGATCTTTTACTTTTAAAG AAGTCGAAGGAGAAAATTCTGGTGGGGTGATTTTTTTAAAGAAAAGTTCT ACTGGGGTACGTTAAAATAAGGGCATTTCGAGTGGGGTATGTGTAAACTT TTTATCATTTTCAATGGGGTGTTTTTTTACTACAACATTCCAGTGGGGTG AGTGATTTGTCCAGTGGGGCTGAAAAATGAGCCATTTTTGGAAAAAAATT TCACTGGGGTGGCCAGTGGGGTGGATCCCACTGGGTCACAGAGGCAGGGG TGTTTATAAGGATGTTGTGAACGTTAGAAAAACGTTGAAACAAAGTTGTG TGCTAGCTGAGAAGTTACCGTGAGTATCACAGCGTATGATTATTATTGTG ACGACAAACATCAATTTCAATTAACTCAGCGAGAACAAAAGTTACTATGG CAATCATCCAGAATCATTGAATAGTAATGGTTGAGACTTGCGCGATAAAT TTCTTTTAGTCCATCTCCTCAGTTTGAATTTCAGAGAAATTTCGTTGTCA CGATACTTTTAAGGGATAAAAAGATATCTCAAAAGCCGCATTGCATGATT GAACGTTTTGCACATGCAATTTTGACGGTGTCGGTCAGATGTTTGATTAA ACTGAATGTAAATTGATTTCTCGAAAAGAATTGAAGATACTCTAGATGCT TAATCCTCCAAATGAGTTTGTAATTCTCAGCGCTACGTAAGCCTATACTA TAGACCTCACTATTTGACTATATTGACTTTTCACTGTCTTTCTTTTTTTA CCATAGCGAAAATCGAGGAACATCCTAGGAAGCCATTATGGATGGACAAA GGTCACGTGCATTTCTACGCACGTGAGTTTAAAAATGGTGAACATCTTAA TTATTACATCGAATTTCTACCTCGCAACGGCTTGTGTGAACAAAAGAAGG TAAGGATAGGCCTTTTCATAAATTATCTCAAGTGCAATGACTGCCTCGTT TTAAAACCATTACAAAGATTCTTTCATTTATCAAGGTCCCTTAAGTCTCC AATTGTGATATTTCGACCGTAGCTGCCAATTGCCACACAGACATTATTTT CTCCGTTTTACCACTCTAAAACCGTCCCAGTCTTTCTTTCGCGCCTAAAG ACAATAGAAAAAAGTGTAAAAAAAGGATTGAATCAAGTTTAGGGTGGTAA ATTAAATAATAAATTGGTACACGTCTGACCACACCACTACTGTCGAAAAG GTGAATTACTAAAGCAATATTTTGAAAGCAAGATAACCGTTTCCCGTGAC ATAATTTATGAAAAGGTCTACTGTATATAGTTTTTATGTACGGATTTGAA CATCGACCGATTCTTTAATTTTGATTTAGAAGATTGAGTTTAAAGCCCCG 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000408_pilon:157442..173517-

>XLOC_015267 ID=XLOC_015267|Name=XLOC_015267|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3870bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000408_pilon:157442..173517- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAAGTTTCTGGTTTATCTTACCTTATTTTTGACTGGTTTTAAGGATGA
AGTTTCTGGTTTATCTTACCTTATTTTTGACTGGTTTTAAGGGGTGTCAA
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TGGCAAATATGTATGGACTGAAACTGGTGAGAATCAGATGTCCAAACTGA
GTCAGATCTATGAATTGGAGACAGATTTCAACAGTAATTATTTCATCGGT
GACTTGACCGAATGCAATGGTTTCATTAAAGATACTATCTGTTCACAGGG
TGTCAAGCAGGTTGTGATTTCTATATTGGTCCTGAGGATCTTTGTCCTGA
TTTGGTTGGCAAATATGTATGGACTGAAACTGGTGAGAATCAGATGTCCA
AACTGAGTCAGATCTATGAATTGGAGACAGATTTCAACAGTAATTATTTC
ATCGGTGACTTGACCGAATGCAATGGTTTCATTAAAGATACTATCTGTTC
ACAGGTGCTTCCACCATGCAATGCTAGAGGTACCAAACCCAAAAGAATCT
GTCCCAAATCTTGTGTCAAACAGAAGAATTCAATTTGTTTTCAAGATATC
ACATTTGGTAACTCGCAATTCAGAGAATGGTTTGATAGCTTGGATTGCGA
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CCACCATGCAATGCTAGAGGTACCAAACCCAAAAGAATCTGTCCCAAATC
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AATGTTGATGACTGCTGGAATATGACCATACCAACTGACAGACAACTACA
ACTTGCGTCTTGCAAGAAGAACTACCAAAAACTCAAGGATCCTGACAGAC
AACTACAACTTGCGTCTTGCAAGAAGAACTACCAAAAACTCAAGGATCAA
AATGAGGAGCCTTCCGTCTACGCAATCGACGTATCAGAAAGTATTTTATT
AGAAGATTTGAGACGTCTCAAAGAATCATACGGGCGACGTCGTAAGAAGC
ACGTCGAGTGCAAGAATCATCCTGTTGCTGAGCTTAAGGAACATCTTGAA
TCTTTGGACCAATCTAAACTAAGAGTTTTGAAGAATCTTCGACTTCAATC
ACTTGATAATAAAATGAGGAGCCTTCCGTCTACGCAATCGACGTATCAGA
AAGTATTTTATTAGAAGATTTGAGACGTCTCAAAGAATCATACGGGCGAC
GTCGTAAGAAGCACGTCGAGTGCAAGAATCATCCTGTTGCTGAGCTTAAG
GAACATCTTGAATCTTTGGACCAATCTAAACTAAGAGTTTTGAAGAATCT
TCGACTTCAATCACTTGATAATGTAAAAACACACGGCTCGTGCGAAGATG
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CGATTTTGTAATGAAGGGAAATTCAAATATCATCTATACCAACAAGACGA
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CAATCCTAACTTTATATCCCATTTTAAACGATACAAATAGCTTATCACTA
TGGAAACAGATTTACGAAAATTTGAAGATCTCGACGGATTTAGAATTCAA
GAAAATGCAATGGTATAATTTCTGGGACGCAGATGTCGACGATTCTTGGT
CATTCTTTAAATCAAGGCCAGGAGCTACAACAAAACTACATTTCCCAGCT
TTTGGTAATTCTACTGTTATCGATAAGAAGTTGAAGTTGATGAACTTTGA
GGCTATCACAAACAAAAAAGGAACTTTAAATTACCACTCATTGTCTTTTG
AATTGGATTTCCAAAATTTTGTAAAGATTTGGTTACTTTCGATTTTGTAA
TGAAGGGAAATTCAAATATCATCTATACCAACAAGACGACTCCATTACGG
CTCTACGGAGCCATAGTGTGGAGCCAATATCATGGACCTCAATCCTAACT
TTATATCCCATTTTAAACGATACAAATAGCTTATCACTATGGAAACAGAT
TTACGAAAATTTGAAGATCTCGACGGATTTAGAATTCAAGAAAATGCAAT
GGTATAATTTCTGGGACGCAGATGTCGACGATTCTTGGTCATTCTTTAAA
TCAAGGCCAGGAGCTACAACAAAACTACATTTCCCAGCTTTTGGTAATTC
TACTGTTATCGATAAGAAGTTGAAGTTGATGAACTTTGAGGCTATCACAA
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GTTTGAAGATTTATCCTCCTTCATCTCAATAGATGGTTCAGCGGAGTTTG
TTGGTGTTCACGGCACAATTATTCCAGAACAGTTCTCTAAGTTCCATTTG
TTGGTGAAGCGAAGTAATTTTCTCCCTTTTAACATTTATGGTGGTCGGTT
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TGAACATCTTAATTATTACATCGAATTTCTACCTCGCAACGGCTTGTGTG
AACAAAAGAAGCGAAAATCGAGGAACATCCTAGGAAGCCATTATGGATGG
ACAAAGGTCACGTGCATTTCTACGCACGTGAGTTTAAAAATGGTGAACAT
CTTAATTATTACATCGAATTTCTACCTCGCAACGGCTTGTGTGAACAAAA
GAAGATGAGTGATTTCGATTCTTTGAACAAAAAACTCGAAAGCATTGGAG
TGCTCCACAAGAAGGTGTACAAAACTTCATGTCCTCAATGTTGTGACGAT
GTACCCACATTGAAACTTATCACCATAGCAACAGAAAAGAAGATGGTGGA
TGATGTGGAAAATGAATGGTTTTTGGACATCCAGATGCGAACCAAAACAC
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TTCATGGATTAAATGAGTGATTTCGATTCTTTGAACAAAAAACTCGAAAG
CATTGGAGTGCTCCACAAGAAGGTGTACAAAACTTCATGTCCTCAATGTT
GTGACGATGTACCCACATTGAAACTTATCACCATAGCAACAGAAAAGAAG
ATGGTGGATGATGTGGAAAATGAATGGTTTTTGGACATCCAGATGCGAAC
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Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_015267XLOC_015267-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
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Properties
Property NameValue
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