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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000412_pilon:111347..122577+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_015049 ID=XLOC_015049|Name=XLOC_015049|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=11231bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000412_pilon:111347..122577+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTTCTTCAACTGCTTCACCATCCTTTCTTTGGCACTCGCTGTACATGG
TAAGAAATCATGATTCTTCTAAAAGCTGTCATTAGCCGGCGTTCTCATGG
GTGTcggaaaatttgtgtaggagagcacatttttattacaaagtatTTAT
CTATCCATTAcattaaaagataattacttcGTAACAAAATTGTGCTCTTC
TACAAATATTTTACGACACCCTGAGAACGCTACTGAATGAGTTGAGTTTT
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AAGGAGTGCCGTCCGATTTTTTGGCATCAAGATCAACTCAGAGAAACCCT
TAAGCAAATGAGACCCCAAAGACttttgtgaccttttttgagaatttttt
attaaagattttaaacttttgaacaTTAAAGAAGGGTTAAAGATAGTTTT
TAAAACCGCTAGCaaaaaaaTGTCGCTTGGTACCTCAAGATGACGCCTCC
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TAACGGAAACTAAACCCACTTAAGTgccttacatgtttttttataagcaa
gtgtctgtccctgttccaggctcgcattatgcttagcataattctcaaac
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GATctaaacaagaatcgcaaaattgcgactaaatatttccttaaaaatta
aggtcattattgacatatataaaaaagcacacataataaagtatacatat
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ttggtaattaatacaccgtttaaccccgggggtactagggcaaaatgggt
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tgcctatttttggaaaatttggggaaaaagtagaaaatttgagaacattt
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aagggtagtacccccccgcccccccGGGCGTTTAACAGGTGTCGGTTGCA
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cttcactctcccccgtaaaaaatggtaggtaaacatccagttctcataag
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ataacttcttttcctcttgatgaatttttgtgaaattttcaggagagata
cataaaattgtcattaatatcatgttcaaaacatctaaaacattctcttt
aaaggaaggaaaaaaatggcaatgtttacatttctctaaccttccagcca
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agactgttaaacggtgtattccaacaaacaacaatcaatataccgtaaca
ggatcccacagtgtaaacattatcaaccaacaaaacccacaccaccaaaa
ttgtaaaaataagtcaatataatttctatcaacaatttcttgtaaaatat
tttatttccaacattctgactgtctgataccaatcatggctggagtcatc
atgtgtaagagtgactgtgtataacaacaaaagtttattgaaaatcatcc
gacggtcatggtgaagctaaaaatttatcaaccaaacaaaactgacgcca
agtcaaatctgtcgcttaaaaatttccatgaaaattacaatcgaaactta
tctcataaaatgcttttttcaacattctggaggtgttcaaagttagaggt
atcatatgtagacaGTAGAGCCaatcaatacatgaaaagtcatttgctat
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atcatgtctcttcactttcatgtcacatcgtgtttatatggggtaaccag
aaagtcaatccacaagaacaaccatcttcctttattatggagtgttccaa
aactattggtaggttgtttggaagtaaagaaacccacacagtttgattta
ttttaaagatttaacttggtgaaaacaaactgcatctttctagcaaaaac
tcatgtttcaacctgctacataacaattgccagtcgggtctgctactaac
atgtaatagttttattataaccgggcttgagaatccgtaaggaacttgta
gcatatattatatatatagtttttcAGTCGActcgaatcatgatacatta
cttatacttcactgggtgcattagtgaggttaagtaaattggtaaaatca
cgacgacgaacgaaaatttaacaggctagtgagtttcaaccaatcaaatt
ttgtatttccactagcctattacatttttcgtccgtcgtcgtgattatcc
cggtatacttaacctcactatttttcgctgtgaaattaaaaacgggcgtc
agtcagggcgtacggaaggcgttttgacacgggaaattatggagaaagcc
cgttttaataaatatttcccttttggaaaacgggaaatatttaaaaacac
tCCGAATAATAGCAAGCCAATCCTTTGCCAAAGAATCTTTATGACATTAt
tgattcttcttaattttcatCGCTAATCAAATGTCAATTTAAAAGTGAAT
CTAAACTTAAATTTAATGACCCCCTCTGTCCAATAGATACCTAGGAGTGA
ATATTACGGAGCCAAACTATTTAAATTTTATAACAATACATTTGACAGGT
TTattcagggatatgttatagcggagctggataacgcacatttaaaaaag
gcttgttctatctctgtccctgacattaaaatttgatatgaaatttaact
tttataattacaaactcgtgaaatttggatttcctcttagctaTTGATTC
TGCTactgcatttatcgttcacgattaaaaacttttaattatcaagaggg
tctgtaaaacattggtgaatgacaatttaaaaaaatgaaaaacattattt
tcattaatgaagttataagaaatttcttctgtaagattatagatagtact
ttttcatttgaaataccgcgctacaccgcggggtgcctcactttctaact
gatattttcagatagcaagtcggtatgtctgattatggaaaaaaattcaa
gttaattgaaacaatatttgtcaaaatatttacatccgaaatttttaaaa
agaaatcatgaaagcttctcaaattcataacacacgctgataaaaataga
tttcatttacaaggaagcttttggggtatcttctacaaatattattttga
tgaaaagcgggaacatcatagcaaaatatgtgcaaacctactgcatgaat
actttgtctgcttcatttttcttataaaaacagaacactcaaggggacag
agatggatttctattatcaacagtttacaatagaaaagacaaagaagcaa
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gtaaaaaaggaGAGCTAGTTTGAATACCGTCATCAGCAAAGTTCCTTGAA
GCCCATAATCAATCAGATGTGTGTGAAgaataaatttctctgatcttctg
gactaccgtaacttggtagacatccctcctctaattctgacacccttttt
atcagctgaaattgatagaaaggttgaatttgtttttctttgcttagtgg
tcagagaggaatagtCCTCTTTCAATCAGTCATTAAAGCTGttatattat
tcctgtctctaaagaagggtgtcggaaatagacgagggatgtcgatatta
gaccaattTACGGCAATGAAAGATACCTTATTTTTCAGGCAATCCAGTAC
CAAACTGTGGTACTGTTGTGAAGAATCCAAGAATCGTAAACGGAGTGGAT
TCAAAAGCTGGACGCTGGCCCTGGATGGTAAGTTAAAAAGTTTTTGCGTG
CACTCTTGAGACAAAAATCAATGGTAATAGTCAGGCATCTTTAGACAGTC
TTTTCTACcaacttttatcaaaaacaaGGGAAGGCAAGgaaccagctggc
acacaacgttgttttaacattcacctaacgttatatggccgttgtgaacg
ttataaaaacgttgaaacaacgttgtgtgccagcttgggaCCGTCTGAAC
TAGGTCtaaacaacattgtttcaacattcagCTAACGACCATACATTCAT
CTAACAATAGTAAACACATCGAGTTTAAATCTCAAAGAGCTAGAAACGCT
AGAAAGGCATCTCTTGAAGGGGAAATGAAAGCCACTTTAATAGAGGGAAT
TTAGTTCGATTTTTAAATGTAAAGGTTAAATCATATTTTAACTTGATTTC
GGTCCGTTCGCCCCAACATTCTCGCAGTCAGCAGCATCTGAGCAAATCAC
GCCATATCAGAGGGCGCCGTTCGGCACTTTCCACGGTTTGGCAAACTCCT
AGCTTTCATTCTCCTCGGATTAACAGAGTGCCTAAGTAACCTTTTTACTG
TAAGTGGAGCTGTGCAAATTCtggccagaaaatttttttaaacccaCCCG
CCCTACAAAGGTTGCAGGCAACTATCAGAATATTTATTGTTTATAAAAAG
GGACaattttactcaaaatattTCCTGTGTGTAGTTAGCCTAGAATCATG
CCAAATAATGAAATACGAATCTCAATTTCTTGCTCCTCCGCGCCAATGAA
AGTACAAGTTAAactcaatttttatttcttaataatattcacattttttt
ataaacagcTCCAATTTTTGGGTCAGGGATGCaattgcttagcattctag
ctcattttctgaagaatttgctttgaccatccctgatattataccataca
CTGGTGAAAATACTTTTCTTAGTGGAGAAAGGTTTTCTTGTTTGAGATAC
CATTTCTCTCctaaagaaaaacattcttatTGATCTATGGGAAAAACTTT
GTACGAGTTAATTAATCTTAGcatattattgaaatttttcagatcaaaac
tCAAAGAAAAGATTTCTTTATGAGAAGAAAACTTGagttctttaaagaaa
ttttttcttggaatttttctcaagaaaaaagttcttctgaaaagttatcg
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aacatttttttatttctattgtGGCTTTTGAACAAAAGCTCTTATCTGAA
TTGAATTAGCCAAGCGTGGCTCCAGCAAATGTGAATTTACAAAAAGTGTA
ATACGAGCGTAATATCTCTCTCTTAAAATTTTATATGTGGTGTGATTGGa
agacttttgaaaatggtaagaatatttttttttagttttcctttatgatt
tcaaaatttgtatacATATTAGGGACCAAATCTTAAATCTGTTCCCCTAG
AGCCCTAGAGGTAATTCTAGTTAAGCAGTTTATTATTTTATTCTTGTTTA
ATAAGTGCTATTGATTGTTTGCCAACCTACTGGCGGGTGCTTATTTTGTT
GTGCTTGTGTCTCATTGATTAACCTTTCATTCCAATGCCCCAAAATCTCT
AAAACCTTTACCATTAAGATCGTGAAATTTTATCCATTTGAGTAAATCTA
ATTCAGTGCTTGCTAGCCTTATGGCGGGTGCTAATTTTGTTGTGCTTGTC
AGCCTTCTGGCGGGTTATCCTTTTACTCGAATGACTTAAAACATCATGTT
TCGTCaaatttgtttgttgtttgtaaAATACGTAAGacatatttgtatat
tttttgtcCTTGCTTCAATTAAGATCAGGGTTACAAAAATCGAAGTTTCT
TTGTCGTTCtctcttttccttttttcaggacAACCGATGGTAACTGGACG
CAGCTGACAGAAAACAACGTGACGATCATAGAACAGATAACGCaaaaaaa
GCATCCAAGCTACCACAAGTTACCCACATTCAAAGTAGGTAAAAACTACT
TTTGCCATGCACTTTCGAATCTTTGGTGTATTTTTATCTGATTAATTTTA
CTTTGTTTATAGAATTCCTGCTTATATCTATCGTATTAGCTTTAGTGGCT
CTCGTTTCTACTCATAGGTCAATCCAGGTTCCAAAACAAGTAAATTTTAA
TATgctcattttgattgtttttcagATTGACGAGGCTAAAGAGATGAAAG
CTTTTTGTAACTATCAATTGACCGATTTTAACAATTACTGTTGATGACGT
GGAGTAGAGCTGCCAAATATTAAATCAATTTATACTAAAATCATGTAGTA
TTTCAGTCAGTTACATTAAAATTAAAGTGAAAGATACAAATACAGAATAC
AACAGAAATTCATAATATTAATTGAATTGACCTGGAACTAAAATGAGCAG
CTACCGTTGTTTCGACAACAATAAGACAAATAAGCATtgtagaaaagaat
tttttaccgaagaaaatttcgaaaagaaaaatgcactaaatattcaagaa
aaaattactcgcttgaagaaaagCCTTCTTATATTCTTGCTGGGCAGAAG
AGAAAAATTCTCTTGAGAGAAGTATACAATTCTTCttagaagaaaattat
tttcaccagttaagaaaatgattcttaatttgagtttttttttcttatga
tttaagagttttttcttaagggggtagtcatatgagaaatttgaaatgtc
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gaaactttccacaattgtagcacaactataaagaatatgaaaaattaaaa
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gtggaaaaatttttccaaatttcaagccagggggtctggaacctaaaatt
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tcattcatcctgaggcttaccataatggaaaactaccctgaaaatttcaa
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ccccctaaaacgtgttttgagaaaacggcgcagaaagttgaaaatagagg
tttttctaaattttcctgcgatacatagaccgttttacaaaatttttgct
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GCTCCGGGGGAATCTCCAAGTATTTTGCGTCAATTCTGCGTACAATGCGT
AAACATggctttaagtcaataaaagtgcattttctcatcaaaaagactat
tgccaacaaaatatatcaGCCTTGAGCTCTCTCAAAtctgtttatatcat
ttacagttgaatttcagtgttgatcttAGGGAAACGTGTCTTCAGGTTGA
ACGTCAATCGTGCAtagttttactcaattttccagGATCGCCTCTGGCGC
CATGAGTGCCATGATTCATCaaagactagatttccactggatttaagact
cataatggatacatcattgaatgtgtttggttcctttcttcaaactttat
tcaaagtctATAGTCCatcattttgaaaagtttttttcggtgTACAAGTT
TTACTGTTCGAAAGCTTCAGTTCGCAGAATCAAATTGTTGCTTTCACTCA
AATTATAGGCTTCCAAAGCTTTCCCAGATGTGAGTaaatctcatatgact
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TAGCTTGATTGGTACTTTATATGATagaactttaaatttcattaaatttg
aatcaTAAATTTGACTTGCTAGAGGTTATTACTAtccctactctcgggta
cctaatagccggggggagccctaattaatttttcaatattttccacccag
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AACttaccttttctttttctagaCTAGACTAGCAACAAAATATTGGCGTG
ATGGCGGGTGGGGGCTCTTATATAAgagatcaaaaatttgaatggctaaA
GGTTATTACTATCCCTATGTTTAattttaccttttcttttttctagacTA
GACTAGCAACTACGGGTTATTACCTCGATTGCGGTGGCACACTTATCTCT
GATCGCTGGGTGTTGAGTGCTGCACATTGTTTCACTGCTGCGGATAAAGA
CTCACTTACCGCTACTTTAGGTATAGTAAAAAGCcctatcggccaaaact
tagtcggccttaattattagttggccttaattattagtcggccttaatta
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atttagtcactttagGGCCGACTAACtattggccgataaggtagaaTAGA
TTTATCGTTGGCCTTGTTGTATATATTGTACGTGTAAAGCCTAGTAATGT
AACACTTTTTTCATCATTCAGATGATAGTTGACGGACTATACTATAACTa
aactagacgtcacccgcttTTTTCTAAACAATTACTCTtatctcccgaat
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ACGACAGAATATTTTTTAACttatatcaatttcaacaacaaaaaaagaaa
ctttaacaaatgaacacgtaaaataagaaccaatactaacaaaaaggaaa
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cgaatttaattagaaatctttataaatttggtatcattagaaagatatta
gttagtggaacaatttgcaataaaaaaatctttaaaagaattctaaaaat
gaagatgaaaatgaagaagaaaaaaatgaagatcttgtaaaaaagtgcta
taactatcattttcattaaagtgaatccttgatcatcgaacgtcatcact
gtgaaaaaaattctcaaaaattatcattcagtcaaaagatatcaaacaaa
gttataagctaattgacgtctaaaaacgctgttttctgctgttttctgct
gtttttttgggtcaatcacttatcaactttgtatcataactttatattga
atagatattttagcaaaatttttttacagtgctgacctcctaagatcaaa
gaatctttccagtgaaaatgaaagttatagcacttctctacgagatcttc
atttttttcttcttcattttcatcttcgttttttgaatttttttaaagaa
ctttttacttcaaattgttCTACTTGCAAacatctctccaacgataccaa
atttataaagattgaagaattccttcaaaagttataggttaATGAAAGTG
CACACTTACCGTGAACAGACTTAAGTTAGTTATGTTATTCGTATTGACTT
TATTGTTTGATTTCTAGGTGACCTTACAATTACTCAGGACGAAGAAGGGG
AGCAGATAAGAAACGTTAAACAGATCATTCGACACCCGCAATACAATGAT
AACACCCTTGACAACGACTATTTGTTGATCGAACTTGACAGCCCTGTAAC
AATCACCGATCACGTGCGGCCCGCTTGCTTACCATTTGGTCTTTCCAAAA
ATGCGTTCAATAATgcaacaagagccgcaaagatgcggataaatatttcc
tttacaaatgttaaaataataatcgatgtcctcaaaagatttcaaagtgc
tttaaatctcagataacatcgtccctaaaaatttcaaaattccatttatg
taattgccagtatttacagaATTATTCATAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000412_pilon:111347..122577+ >XLOC_015049 ID=XLOC_015049|Name=XLOC_015049|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1020bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000412_pilon:111347..122577+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTTCTTCAACTGCTTCACCATCCTTTCTTTGGCACTCGCTGTACATGA
TGTTCTTCAACTGCTTCACCATCCTTTCTTTGGCACTCGCTGTACATGGC
AATCCAGTACCAAACTGTGGTACTGTTGTGAAGAATCCAAGAATCGTAAA
CGGAGTGGATTCAAAAGCTGGACGCTGGCCCTGGATGGCAATCCAGTACC
AAACTGTGGTACTGTTGTGAAGAATCCAAGAATCGTAAACGGAGTGGATT
CAAAAGCTGGACGCTGGCCCTGGATGacTAGACTAGCAACTACGGGTTAT
TACCTCGATTGCGGTGGCACACTTATCTCTGATCGCTGGGTGTTGAGTGC
TGCACATTGTTTCACTGCTGCGGATAAAGACTCACTTACCGCTACTTTAG
acTAGACTAGCAACTACGGGTTATTACCTCGATTGCGGTGGCACACTTAT
CTCTGATCGCTGGGTGTTGAGTGCTGCACATTGTTTCACTGCTGCGGATA
AAGACTCACTTACCGCTACTTTAGGTGACCTTACAATTACTCAGGACGAA
GAAGGGGAGCAGATAAGAAACGTTAAACAGATCATTCGACACCCGCAATA
CAATGATAACACCCTTGACAACGACTATTTGTTGATCGAACTTGACAGCC
CTGTAACAATCACCGATCACGTGCGGCCCGCTTGCTTACCATTTGGTCTT
TCCGTGACCTTACAATTACTCAGGACGAAGAAGGGGAGCAGATAAGAAAC
GTTAAACAGATCATTCGACACCCGCAATACAATGATAACACCCTTGACAA
CGACTATTTGTTGATCGAACTTGACAGCCCTGTAACAATCACCGATCACG
TGCGGCCCGCTTGCTTACCATTTGGTCTTTCCataacatcgtccctaaaa
atttcaaaattccatttatgtaattgccagtatttacagaATTATTCATA
Aataacatcgtccctaaaaatttcaaaattccatttatgtaattgccagt
atttacagaATTATTCATAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000412_pilon | genome | sc0000412_pilon:111347..122577 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 442-510:11163 |
| Aaloc | 265-441:10870 |
| Aaloc | 139-261:9447 |
| Aaloc | 52-138:4541 |
| Aaloc | 1-48:1 |
|
