XLOC_014833 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_014833
Unique NameXLOC_014833
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000112_pilon:277725..295079-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_014833 ID=XLOC_014833|Name=XLOC_014833|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=17355bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000112_pilon:277725..295079- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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TATACTTTTTGATCATGTCTCCAATAATTCAAAATGTCATTTCAATTTCC TATGCATCTTAAGATTTGAAGTCAAATTGAAGGACCAATATCGGCCACTC ATAATAAATATTTTCATTATAAGTCTACGTTTAAAAGATCTTCAGTTTTT CATTCGAACCCTGTCCATGTTATTCCAGCATTCTGAAGATAAAATTTTAT CTGTTACTTTAGGCGTACAAACTTTTATGAACATAAACTTTCGCGAATCA AGACATAAAAATGAAGGTTTTCACAAAAGCTTAAAGGGGCTAAAAGAGGC TTTAACAGGCTAAAAAGTGCCATAAATCTTACGTTTTATTTTAAGTTAGA AATTTTACAGATTTTTTATTTTGTCAAGAATTTTTCGCTTAAACTTTCGC GAATGGCCCTTTCAAGAATTTTCAAAGACATTTACTTTCGCGAAAATGTG AAAAATCGTGAAAGTTTCTGATCGCAAAAGTTTTTACGCTTAAAGTATCT CCATACAAAAGTCTTCGTCAAATAAATCAATCTTATTTCGAAATTTCTGA ACCGATGATAATACGAGCGCAGAAATCTACCCTTCCTTTTTCTCTGGTCA TCAAAATATTTTCTTAGTCTAGATGCATTATTTTTTTATTTTGATTTTTC TACAATTTACAGTTAAACCCAGGGTCAGCAAGCTTTTTAGCTTTGCGCAA TATTTAAATCGACGATGCCTTTTGATATTGAAATAAAAATCACTTTAAGA AGAGATAGAAAAGTTTACGGTTTACAGCCTGAATATCCAGGCTAGCTGTA CCAATTTTTTGAGAAAAAAATTTAATTCAATAAACTGTTTGATGTTCATT ATGCTTTGATGAGTACAGTATTCGAATCTTTATAATAGTTCGAACTTATT TTCAGTCACCGTCCCGTCAAGGAGAAACCTTCGTAAAATGCTTTCTTTAA 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TTACACAAATGATAGATTGAAACTAAACAATATCAATCGTAAACAAAGGA ATTGCTTGATTCAATCTGTCGTCAAAATTGCGGCGCATTTTTTAAGGCTT CACATTTTCTTGCCTGAGAAAGGTTAGAGATTGAACTCTAGCCCTTCGGG CTTTAAACTCAATGCTCTGGACGTAAGCACAGACTTTCTTGGCGTAGAAA GGACATACTACATAAGCGATACACATTGTTGTTTCAACGTTCATCTAACG TTATGTGGACGTTGTGAACATTAGATGAACGTTGAAACAACGTTGTGTGC AAGCTGGGTCTTACTGTCAATGTCAAGTTTGGAATTTGCATGTATTTTTA AAAAAATCAATCGAATCAATCAATCCACAACAATCCTTTTTGGGAATTCC TATTGTTATGATGTTTGTGTATATTTTATTTGGATTTTTTATGGTATTAG AAGGGGCAAACCCTTATGGGACGCAACTGCGATTGGTTCGAAAATAGATA GAATTTTGAGATTTCCTTGAGGGAGGTTCGAATTAGGACTGACAAAAGTT TTTATTGCCAAAAAGCTGACGTTATCGGCAAAACTTCTAAGCCCAAAAAT ACGCAAACAATTTCTATTTGTTTAATCTCATTTGTTCAGAATGTGGTCGA AGAATGGGGCAAGAAAGATGAAAAGGATAAGAATTTCGACGCCTTCCATC GTGCAATGCATGCTGCAGCTTTTCACGAACGAGGAAAATTGAAATATAAA GTCAACCTATTACAATCGGTAAAAAAAATTTCCTATTATGAAATAATTAC TCACTATCACGTATTAGTAAGAATTTCATTGGCAAAAATAAATTTGTATT GTGGAGGCAGGTTATGTATGTACCATATTCGCCATTCCCACCTTTCATAT TGATAAAGGCTCTCATAAAGCGGAATTCAGTGGGATAAATCTACCCCTCG 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000112_pilon:277725..295079-

>XLOC_014833 ID=XLOC_014833|Name=XLOC_014833|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3132bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000112_pilon:277725..295079- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTCACATGGACGTTTTTTTGACGTTGTGTGCCGTCTGGTTTACCTCAA
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TTGTAACTCACCAAGAAGGACGAGTTAGTTTGAAACCCGGTTCACCGGGT
GCGAAAACCAAGGTCAATGGACTAGCGTTAACAGATGAAATAACGCTAAA
GCACCACGATCGTATTGTCTTTGATGTCACATGGACGTTTTTTTGACGTT
GTGTGCCGTCTGGTTTACCTCAATCTAACCGTTTCCTTTTTTTTCTATTA
TAGTATGGCAACTGAGCATGCTATTGTAACTCACCAAGAAGGACGAGTTA
GTTTGAAACCCGGTTCACCGGGTGCGAAAACCAAGGTCAATGGACTAGCG
TTAACAGATGAAATAACGCTAAAGCACCACGATCGTATTGTCTTTGGGAG
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AAGGCTCACCAGCTGAGGTGGATTGGGATTTCATGAATAAAGAAATCGCT
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GCTCACCAGCTGAGGTGGATTGGGATTTCATGAATAAAGAAATCGCTCAA
ACCAAAGGTTTTGCTGCTGATGCTAAAGGAATGAACAAAGATCAAATTCT
GGCACAAGAGCAAGTTCTTGAACTTCTTCCCATGGTTGGTGAAGCTAACG
CTGTCAGTGAAGAGCTTGATAAGAAAATATCAAATTCTGGCACAAGAGCA
AGTTCTTGAACTTCTTCCCATGGTTGGTGAAGCTAACGCTGTCAGTGAAG
AGCTTGATAAGAAAATGGGATTTGAAGTTGTGCTGATTTCAGCAGCCGCC
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TGAAGAATTTGGTCAACGAAAATGTTTGGTTATGGGAGCGTGGAAAATTC
ACCAATCGTCGCTTTCTGATGCAGGACTTATACCAACGATGGATGGAAGG
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CTGAAGATGTCTTAGTTGGAACCGCTAATGTCTTCTTACAGAGTTTAGCA
TACGCTCTTGACTTCAATGATAAATTATCCATTACTGATTACAAGGACTT
ATACCAACGATGGATGGAAGGGGAAGATATTTCAAAAGTTCCAAAGGAAG
AAGATCCCTTCTGGGAGCCACCTGAAGATGTCTTAGTTGGAACCGCTAAT
GTCTTCTTACAGAGTTTAGCATACGCTCTTGACTTCAATGATAAATTATC
CATTACTGATTACAAGGGCTCAGAAGAAGGTAGTGCAGTGATCGAAGTCG
CGCCGTGTACTCAAGATGGCAAGCCATTGGATGAAGATTACTTTGTTGAA
AATCCCAAAGAATTGATCGGAAAGCCGTATCATTTTATGGGCTCAGAAGA
AGGTAGTGCAGTGATCGAAGTCGCGCCGTGTACTCAAGATGGCAAGCCAT
TGGATGAAGATTACTTTGTTGAAAATCCCAAAGAATTGATCGGAAAGCCG
TATCATTTTATGGTCAAAGTGATCAACTGCGAAGTTCAAAAAGCTCGATA
CTGTCATGGTCTTTATATGAAGTATACAAGCTATGGTGAAGAAAATGCTT
GCCTGACTGAAATCAAGAAAGATACTTTATCTCCAGTATTCAACCACAGC
AAGATTTATTCTTTCCCTGCTGTTGCTGAGGAACATTTAAATTGGTTCGA
GGCTGGAAGTTTGTCTTTCTCTCTTTACGCTAAACAAAATGATCAAATTT
TCGATGCTAAGCTTGCTAAGCTAACTACTAAGGTCAAAGTGATCAACTGC
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CTATGGTGAAGAAAATGCTTGCCTGACTGAAATCAAGAAAGATACTTTAT
CTCCAGTATTCAACCACAGCAAGATTTATTCTTTCCCTGCTGTTGCTGAG
GAACATTTAAATTGGTTCGAGGCTGGAAGTTTGTCTTTCTCTCTTTACGC
TAAACAAAATGATCAAATTTTCGATGCTAAGCTTGCTAAGCTAACTACTA
AGGAGTTGCGAGCCAAAGATACCATTCAAAACAAGAAAGCGGACAAGAAG
AACGCAACTTTCCGCGAAAATAACGCCGGTATCATCTCGCAATTGAAATC
AGAACTCATCCTTTACAAGACGAGATACAATCGAGCTATCGAGAAAGAAA
AGAGAATAAAGGAGTTGCGAGCCAAAGATACCATTCAAAACAAGAAAGCG
GACAAGAAGAACGCAACTTTCCGCGAAAATAACGCCGGTATCATCTCGCA
ATTGAAATCAGAACTCATCCTTTACAAGACGAGATACAATCGAGCTATCG
AGAAAGAAAAGAGAATAAAGAATGTGGTCGAAGAATGGGGCAAGAAAGAT
GAAAAGGATAAGAATTTCGACGCCTTCCATCGTGCAATGCATGCTGCAGC
TTTTCACGAACGAGGAAAATTGAAATATAAAGTCAACCTATTACAATCGA
ATGTGGTCGAAGAATGGGGCAAGAAAGATGAAAAGGATAAGAATTTCGAC
GCCTTCCATCGTGCAATGCATGCTGCAGCTTTTCACGAACGAGGAAAATT
GAAATATAAAGTCAACCTATTACAATCGTATCTGAAAAACCAACCAGATG
CCGTTGCCAATGGTGGTAAAATCAAGACCGACGGCGATGTCAAGGTCCCT
GCTGGTAGTAAAGCTTGTAGCGTCATGTAATATCTGAAAAACCAACCAGA
TGCCGTTGCCAATGGTGGTAAAATCAAGACCGACGGCGATGTCAAGGTCC
CTGCTGGTAGTAAAGCTTGTAGCGTCATGTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_014833XLOC_014833-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
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Properties
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