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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000336_pilon:266626..274147- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_014790 ID=XLOC_014790|Name=XLOC_014790|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7522bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000336_pilon:266626..274147- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GGTATGTCAATGGAAACACCTGCCATGACTTCTTTTGCTACAAATTCAAC
AATTTCTGGTAACAATCGAGTTTTAACCTCAAAACATAGTGGGTAAGATT
TCATATCTGATCTTTACATTTTTTAACTTATTTCTTAAGACAATCCAATA
GGAAATTTTGCGCTGTTTTCAATCCCAGTTTAGCTGTTTACGTCCAAAAT
GATATAGAGTAAGCTGTAGACCTGAACGTACTATTTTGCTTTTTTGTTAA
AGTTTTTAATTTAAGGGATAACTCTCATTCCTTGCCACTGGACTGACAAA
ATTATTAACTCGGATTGTATCAATACACCTTTTCGACCGTAGCCGCAAAT
TGCCGTGCGGGCATTTTTTACCACCCTAAAACCATCCCAGTCTTTTTTTC
GCACTTAAAGGCAATAGAAAAAAGTTAGTGAATCGAGTTTAGGGTGGCAA
ATTAAAATATAATAAAGTGGCACGCGCTTGACCGCGCGACTACGGTCGAA
AAGGTGTATATTTAATAACTATAAGATCACAGATATATTTGTAATGATTT
GGCTTGAAGTTAAGAACTGTTTTAGAGGCTGCTCTTTACAGATAACTACT
TATCGGTTCGATAGGCTTTAGTATGAATTTCTTCGGATTATCCTAGCTCA
CTAAAGTCGAGTCGCTGAGTAACTTAAAAGTGACTACCTATCTGTTCGAT
AGGCTTTAATATGAATTTCTTCGGATTATCGTAGCTCACTAAAGTCGAGT
CTCTGAGTGACTTAAAAGCTATCAAAGTATGGTTACCCTGATCGATAGTT
ATAAATTACTTTCTAAGACTATCAAAAAGGTGTGATGTTGGCAGAGTGGG
TCACTGTAGAGTTTTCTCTTTTCATTTCTTCAGAGCAAGATCTGTGCCAC
GATCAATAAGTACACCTGGAGCAGGCAAAAACAACATGCTTTTGATAGGT
AGAAAAGCTTTCATAATTACAATTAGGTGGATTAAGTGATGTCTGTCTCA
AAGATAATGTGGACACTTTTCTGTGATGTTGGTCATTTTTGATCACTTTA
GGCCTACTTCAAAGGGCTGTAACTTTTCATCCAAGTAAGATACTAAAAAT
CTGAACACATGTTTGAAATAAGTAAGGCTCAAATATTCTAAAAATCTTCA
TGTCATTATTTTTAAATCAGTAGAACAAATCTTAATTTTTTCATCTTCAT
TTTTCAATTTTTCTTAAATCTTTCATCCTTTAGATTATTATCCTTGGAAA
TACCTTTCCAATGGTGCATAGCTTTATAACTCAGCATCCAAGCTTGTACA
TAACGTTGATTTATCGTTTGACCAATGTTCATAACGTCCATATAACGTCA
GGTGAACGTTGAATCAACGTTGTGTGTCAGCTGGGATAAAAAGGTGCTGA
GAAAAGTTCAAACTAAAGTTTTCACGTACTTTTGAGACAGACTTTATAAG
TTTGTATGATTTATTCTGTAATTCTAAGAAACCAATGAACAAAGCTGGTT
CAATATTGTTTCCTTTAACTTTTTGACAGCATCTGTGTTTTCTTTATAGT
GTATTTAATTATAAGCCTCTACTTACTTGAAAAATCGGCCAAGCACTCGT
GGAAATATTTCTTTCTCTTTTGTAGCTATTGCTGAAGGAAGAGGGCTAGC
TAAAGGAGAAATTGGACTTACAAGTTTAGACTTCAAAGCTTCTGAAATGG
TTCTTTCACAGGTATGAAAATATTGCATCATTAATATTGATATTATATTG
ATATTATTTAGCTCGACGTAAAGTTAGACAAAATCCATAATTTACAAATA
AACACCCCTTCTCACAGACCCACTGGAACCTTTTCCCGCTGGAAAAATTC
AATTGACCAAAATATACTGGCCAGTGAAAAAATTATATTCTGATTTTTGT
TCCCACTGAAAATAATCAGATAATCAAATCCTCACTGAAAAATCTTTTGC
TTTTCTTTCCGATTTATTGAGCAGCAATCTGGCTTCATACTATTTAAAAT
CTATTTTACGTTGGGCTCTGTAATCTTGTAAAAAGCAACAGCTACATTCG
GCTAATTCGGCTAAAATTTTCTTTACAGTTTTCAGATAATGCAACTTATG
TGAAAGTATTGACCAAAATTCAAGTGCTGCAACCAAATGAGGTAGATTGA
GTTTTTCTTTATTTCATGATATATACTATCTTCTTCACCCATAATGCCTA
TTCAGAACCAAAATATTACCAAAATAGTTCTAGTGCTTGAATTTCTAATT
GGATGAATTTTTGACAAAACTATTCCATTTCTTTTCTTAGATAATTATGC
CTACAACGGCTTGTGAAAACGGGAATATGTCTCCATTATTTGAAGCTATA
TCTCAACAAAATCCACATATTAATTTAACAACTGTCCAACGAAAATATTT
CAATGAAACTAAAGGTTTGTAAAGCAAAGTCATTTCTTCAATTTGCTGAG
CGGTGTCTGACTTTTATGAACTGTGCTTTTTATTCCTTTTGGCACTAAAT
AAATAAATGGACAAAAGCGATATACGGTTCCAAGGCTTTAACATGTTCAA
TTTTAAATATGTACGATCAATTTTATGTTGACCTTTTGTTTAATGTTTTT
TGAGGTAAAAATTCCTACTGTTTCAATATATTTTATCATAATTCCTCTCT
TAATTTTGATTTTTTCTTTGAAGGCTTAGAATGTATCAAGGATGTATGTG
TTCCAGAATTTCAAACAGTTGAAATGGATGTTCAGAACAAGTAAAATTTT
CTATTATTCTTATGAGGGCATAGTATTTTCATTAACATTCAGTGTCCCGA
AAAAAAATAAAAAGAAATACCTTATTACACGGAATGTAATTAACACGAAT
TAAGAAATTTCGTGTTAATTAAAACCCCTTTAATTAAAACCAGCCGTGGT
GTCCTTGAAAAAGCAAATAAAATTTGTGTTATTTTTTTGCTTGTTAATTC
CAAGGCCGTTGAATACTTGTCTAGTAATATTCGTGTAATAATGTAGTTTG
ACCCATAAGGCCGATAACGTTGCGCCTGATTCAAACTTGATACTTGAAAT
GATACGAAGGAGCATCTTTTGAGAGTACCCATAAAGAAAGCTCAATCAGT
CATTGGCATGTATATCTCAAATTCTGAATAATGTTTGCAAATAATGGCTG
AAAACTAGGCTTGATTATTTAACAAATAGTTTGAACAAGGATTGACGTAA
AATAAAGTTTGTTTCCTTATCTTTTTAGATATTATTGCCTGGCTACTACT
GCAGTAAGGATATTTCTTATGGAATTCTTTTTTCTATTCCGGGTTAGAGT
TTAGGATCCAGTATCTTAATCCATAGCCCAAAACATTTTACATATTTGAA
AGTTGTAAACACCGTGACCCCTAAAATTAATGTACCAACTTATAAAAACA
ATCCACTATTCCTGGGTTCGGTATCTGGATTCTGTTCCCCTGCTAATTTT
TCTCTAGATGAAATAAACTTTTCAGCCTCATTTGATGGGAATATTCGAAA
TGGAATAATTCGAAATATTTCTAAAATACGCCCCCATGCAAGTTTAGGTT
GTAAACACTTGTTAAGACTCTACGCTTCACATCAGATAATTTTAAAACGA
ACGGATTTTATAGTCCGACATGTTTAATTGTTTAAAGACACTTTATTTTC
ATTGTTTCTGATGGTGAAAAGGAAAAGGTTTGTACTAGAAAAGTCGTCAA
TGGTTCATAGGAAAATGGGCGGGACTATAAAAAACCTATTTATTCTTGTA
AATTGATCGAGCTTCTTCTCTTTTGTTTTTCAGGCGTTAGTGAAGTATAC
AGAGTTTGTTTACAACATGGTATTAGCTGCCAAATCATTGAAAGTTCTTT
TCAAAGGTGGTGAGAAGACAATGTTGATAGGTAAGTTTTCTTTAATTGCA
GTAGGGAGTGTCCCAAAGGTTCGATAGCTTCTTACCAAAAGGTAATGAAA
GTGCTACTCTCTCCCTGGATCGCCCCACTTACCCTTGATCCTTCTTTTTA
ATTGGCTTTCACTAAACAGATAGACATGAAGTCTTTGAGGTCCTTGGTTT
TACCGACCATGGGTTGAACCCATGACCTTTCATATCATACTCCATTTTAG
AGTGGTCTGATCCAGAGTACTATAATTTCTAAAAAAATATTTAAGAGGAT
GAAGCTGAAAAACGAAGAAATGAACTTTTTTTAAGACTCCTGGTTCCAGC
AAAATAGTTATTTTTCCATTAAGTTCTTGCATCGAGCTAGCTGGGAGACC
CGACTTCTCTGTCTATGTGGTTTCAAAAAAATATCAAAGTATAGACAGTA
GTTATTATACAAGATGCAAGAATTAATCGCAGAATTTGATTGGCTAATAT
CTTATTGTTATGATTTGATAAACAAAAGTATGACGTCAAACAGCTCTATT
GTTTAAAGAAGTGGCGCGAGCTTTTGAATTGTTTTGAAAAAATAACGGTT
TTTTCTTTTGTGATTTGAATCGAGTCAATAATTCCATACTGTATTTCAGT
GAAGTTGTTGGGATTTTAACAGGATAGAAATATTTTTGTACAGAGTATGG
TCTCCAGACTAGCATCGAGCATTACAGCCTTTTTGCTGTTAAAATAATAA
TTTTATGTGAGATCTATCTATCGATCTACCTATCAGATAGAGATAGTTCC
GACCCATTCGTTTGAATGAAAAATATGCTTAAGCACCTTTTCTCTACCGG
AAAAGATTCTAGGCATAAAACAAAGTCAAAACATAATTACAGATCGAAAA
CGTCACTGTAATTAAACACACTTTAATTACAGCACCCAGGAGAAGCATGG
GAAGCTATGAGGAAGTAAGATATGACCTGATCTAGAGAAAAAAGCGATGC
GAAAGTAAACCTTGGCACACGGGGTAATGAGATTTTACATGCGGGTCATA
TTATTGAATCTATTCCTGATATGGCAAATTTCTTAAAGCCCGCTTTTTGT
TGAGTTATTAAACTCCAGTTAAAGAGTTTCTTAAAACCAATCTTTTTCAT
TTGTAATTGTGCGTAAATCCGATCAATCGCGATAGTCGGGTTTGATTTCC
CGATTTTGTTTGCGTTTGCGCTCGCACTTAATAGGATATACTCTTTTAAA
TTTTATGTTAGATATGTTAAGAAAGGCTGACCCATGACCGGAGTTTGCAG
CCGTCATTACGGCTGTTTTATTTCGTTTATATTTGTCACTTTTTTATATG
GACTGTAATGGCCTGTTCCATTTGATATACATACAGGTGGTAAAACAAAC
CTTTCCAAGCCAAAAATTTCTTGAAAATAATATATTTAGATACCCCCTGG
TGGCGTAGTGGTATGGTGGTCATCGCTCTTGACTCCCGTCTGAGAGGCCC
GAGTTCGATGCTCACCATGGTACTTTGATTCACTTGGCAAGTGAATTTAT
CTTCGCCCGGGTCAACCCATGCCATGTGAGAGGAATTGGGTACCACTACT
CTGATACAAGAGTGTGGGTAGATGTGCCGTGCATTGTGACGTGCCGCGAC
ACTTGTTACAGGTTCGAGTGTCAAGGTATACGCCAAGACTCGGCAGCTCG
CACCTGTAGAGTCGCAATGCGTGGCAGCGCAGTGTTTCCTACTCCCTCGT
AGGTAAGAAACATTCCGAGATATGGGAGGGCTTAATATCAATCAAAACAA
TCCTCCCTGGAAAATGGTAAAATTTGAAAATAAAAAGACCTTGGAAAAAT
TCTTCTTCGTACCTTAGAGTGGGAGTGGACAAACTAAAACCAGTTTTATA
CCCCCTGGAGGAATTTGAATATTATTTACCTCCTGGAAAATTAAATTAGG
TCCCTGGAAATATAAACTTTTCGTTTCACCCCTGGTAAAATAAAAATAAT
TTTCCTTAGACCACTCGGATCACTCCTTGGGAAATTTCATCAACCCCATG
TATAAATATTAAACGGAATGTTCCTGTCTAAAGCGGGCTATCTGTCATTT
TCTTGGATCTTCTGAACGAAGAAAACAATGTTTATAGTTTATGTTTTCTA
GATATTAGAAGCCTATTTCGATTCCATCTATGACTCCATGTACATGTTTT
TTTTATAAGAACAAATTATATAAGAACATAAGGCTTTGCTGGCCAAAATG
TTAAGAACAAGTTAAAAACATTTTAAGGCTCTGCGGACTCAAAACACCCT
ATTTCTTCAGATTTCTCTGGAAAATGGTCAAAATAAGAACATGTTAAAGA
ACATTTTTAGGCTTAAAACTCAAATAGTTAGGAACATCAGAAGGCTTCAA
AAATTTTGGATGTTCTAATAAAAAAAACATGTATCGGTCACGTACCATTT
TCCCACTATTTTCCATTTTTGTTGTCTTTTGTAATACTTTTAATCACAAG
ATAAAGAGTGCTCAACCTTAATAAGTGGATCACTACAGTGACAGTAGAAA
AATATCATGTACTAAAAAAAAAACATGCATCCTATCCTAATGTTTGTACC
TCATTTACGCGATGAGCAGATGCCAATGCAGCAAAATGGGGTTTTCCAGA
AAAATATTTAACCCCAACTGTTGAGGATATTGATTTTGCCAAGTATCGAA
CCCTCTGGATATCCACTCTTAAAAATTAGCTCAACTCCCTGGATATTCTC
TCTTATAAAGATGCTTACCCCTGGATATCCACTCCTTCGTAGATATTTAA
CCCCCTGGATATCCACTTTTGAACAAAATTCGTTAACCCCCTGGATATCC
GATATCCTCGACAGGGGGGAACGGACTATTTCTGGAATAGCTCGATATCC
TATGGTTTAAAAAGCCGGACTCATCAAAACATTATTCGGAGCTTTTTTCC
ATTTGTGGTTTGTGAATAGCAACTTTTAGTCTTAAGGGAACAAAAAATGC
CGCAAAATACATTCGGTGCTAAATTGACAGTTTTCTCATTCAGTCCCTCG
TGTGCAGGTCAAGCCACACCTGTTGCTAATCACGAGACAAGAAGAAAAAA
AAAACTGTTTCTAAATCTAAGTTTTTAATCAAGCACACTTCCAAATAGTT
GCACATGGAGATAGAAGAAGTAATTAACAATTAATAACAATTAAATATTC
GTAAAATTTACTAATTACTTAGTTTCGGCATTTATCACAACTTGTATAAA
TAGGGATAAAAAATTCAAGAGTTCACCATCAAACGTTTTCAACCTTCATC
AAGTGAAGTGGTTTGGCGAACAAGAAAAATCTTCAGATTACAATTTAGAA
CGTAAGTCGTACTGCCAGTTAGTGATTTAGTTAACCTTTCAAAACATTTA
AAATGTCCCTGTTTCAAGTAAACGCGCCTCCAAGAAAGAAGGCGTTCATT
ATTCAAAGAGGGGCGTTTATCGAAGAGGTGCATTAAAAAGGAGGCGTTCA
TTCGCAGGGGGTATTTATTCAGAGTAATGCGATATTTCATACATAGTAAA
CCAGCGTGTTTTTTTGCGACCCTAATACTAAATCCTAATCGTTTTCTTTC
TTTATAGATGTACTTGAAAGGTGTTCTGTGCCTCTTGGCACTGTATCAAG
TCCAATGTTATATCAAGCATGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000336_pilon:266626..274147- >XLOC_014790 ID=XLOC_014790|Name=XLOC_014790|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1368bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000336_pilon:266626..274147- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GGTATGTCAATGGAAACACCTGCCATGACTTCTTTTGCTACAAATTCAAC
AATTTCTGGTAACAATCGAGTTTTAACCTCAAAACATAGTGGGGTATGTC
AATGGAAACACCTGCCATGACTTCTTTTGCTACAAATTCAACAATTTCTG
GTAACAATCGAGTTTTAACCTCAAAACATAGTGGAGCAAGATCTGTGCCA
CGATCAATAAGTACACCTGGAGCAGGCAAAAACAACATGCTTTTGATAGA
GCAAGATCTGTGCCACGATCAATAAGTACACCTGGAGCAGGCAAAAACAA
CATGCTTTTGATAGCTATTGCTGAAGGAAGAGGGCTAGCTAAAGGAGAAA
TTGGACTTACAAGTTTAGACTTCAAAGCTTCTGAAATGGTTCTTTCACAG
CTATTGCTGAAGGAAGAGGGCTAGCTAAAGGAGAAATTGGACTTACAAGT
TTAGACTTCAAAGCTTCTGAAATGGTTCTTTCACAGTTTTCAGATAATGC
AACTTATGTGAAAGTATTGACCAAAATTCAAGTGCTGCAACCAAATGAGT
TTTCAGATAATGCAACTTATGTGAAAGTATTGACCAAAATTCAAGTGCTG
CAACCAAATGAGATAATTATGCCTACAACGGCTTGTGAAAACGGGAATAT
GTCTCCATTATTTGAAGCTATATCTCAACAAAATCCACATATTAATTTAA
CAACTGTCCAACGAAAATATTTCAATGAAACTAAAGATAATTATGCCTAC
AACGGCTTGTGAAAACGGGAATATGTCTCCATTATTTGAAGCTATATCTC
AACAAAATCCACATATTAATTTAACAACTGTCCAACGAAAATATTTCAAT
GAAACTAAAGGCTTAGAATGTATCAAGGATGTATGTGTTCCAGAATTTCA
AACAGTTGAAATGGATGTTCAGAACAAGCTTAGAATGTATCAAGGATGTA
TGTGTTCCAGAATTTCAAACAGTTGAAATGGATGTTCAGAACAAATATTA
TTGCCTGGCTACTACTGCAATATTATTGCCTGGCTACTACTGCAGCGTTA
GTGAAGTATACAGAGTTTGTTTACAACATGGTATTAGCTGCCAAATCATT
GAAAGTTCTTTTCAAAGGTGGTGAGAAGACAATGTTGATAGGCGTTAGTG
AAGTATACAGAGTTTGTTTACAACATGGTATTAGCTGCCAAATCATTGAA
AGTTCTTTTCAAAGGTGGTGAGAAGACAATGTTGATAGATGTACTTGAAA
GGTGTTCTGTGCCTCTTGGCACTGTATCAAGTCCAATGTTATATCAAGCA
TGAATGTACTTGAAAGGTGTTCTGTGCCTCTTGGCACTGTATCAAGTCCA
ATGTTATATCAAGCATGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000336_pilon | genome | sc0000336_pilon:266626..274147 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 622-684:64 |
| Aaloc | 523-618:3740 |
| Aaloc | 499-522:4294 |
| Aaloc | 433-495:4848 |
| Aaloc | 307-429:5233 |
| Aaloc | 244-306:5445 |
| Aaloc | 160-243:5896 |
| Aaloc | 94-156:6639 |
| Aaloc | 1-90:7523 |
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