|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000336_pilon:290167..293004- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_014782 ID=XLOC_014782|Name=XLOC_014782|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=2838bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000336_pilon:290167..293004- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CAGAGCCAATCGATTTCATTGAGTCAATCGATGTCACCGATTGAGTCACT
ACCACCAAGTCAATCAATGTCACCAAGCCAATCAATGTCACCAAGCCAAT
CAATGTCACCAAGTCAATCAATGTCGCCAAGCCAATCAATGTCGCCAAGC
CAATCAATGTCACAAAGCCAACCAATGTCACCAAGCCAATCGATGTCGCC
AAGTCAATCGATGTCATCAAGCCAATCGATGTCTGTGAGTGAGTCAATGT
CACAAAGTCAATCGATGTCACCAAGCCAATCGATGTCTGTGAGTGAGTCA
ATGTCACAAAGTCAATCGATGTCACCAAGTGAGTCATTATCACCAAGTCA
ATCGATGTCGCCAAGCCAATCGATGTCACTAAGCCAATCGATGTCAACGA
GTGAGTCAATGTCACCAAGTCAATCAATGTCTCCAAGTCAATCAATGTCA
CCAAGTCAATCAATGTCACCAAGCCAATCAATGTCACCAAGCCAATCAAT
GTCACCAAGCCAATCGATGTCACCAAGCCAATCGATCTCACAAGGCCAAT
CGATGTCATCAAGTCAATCAATGTCACCAAGTCAATCAATGTCGCTAAGC
CAATCAATGTCGCCAAGCCAATCAATGTCGCCAAGCCAATCAATGTCACC
AACCCAATCGATGTCGCAAAGCCAATCGATGTCAGCGAGTGAGTCAATGT
CACCAAGTCAATCAATGTCGCCAAGCAAATCAATGTCACCAAGCCAATCA
ATGTCACAAAGCCAATCAACGTCACAAAGCCAATCAATGTCACCAAGCCA
ATCGATGTCCCCTAGTCAATCAATGTCACAAAGTCAATCGATGTCACCAA
GTGAGTCATTATCACCAAGTCAATCGATGTCATCAAGCCAATCGTTGTCA
CCAAGTGAGTCATTATCACCAAGTCAAACGATGTCGCCAAGCCAATCAAT
GTCACAAAGTCAATCAATGTCACAAGCCATCAATGTCCCAAGTGCCAATC
AATCACCAAGCAATCAAATTCACAAGCCAATCGAATGTCACCCAAGTCAC
GTCACAAAGCCATCAATGTCACCAAGCATTTCAAATCACAAAGCAATCAT
GTCACAAGCCAATCGATGTCACCAACCAATCGATCTCACCAAAGCAATCG
AGGTCAAAAGTCAATCGATGTCACAAAAAATGTCACAATGTCCACAAGCC
ATCGGTGCAACCAATGAGCAATGTCGCCAAGCCAATCGACTGTCACAAGC
CAACGATGTCGCACGCCCAATCGATCGATGTCAATCGAGTGATCAAGTCA
ATCGATGTCACCAAGCAATCATGTCCACCAGCCAATCAATGTCACAAGCC
AGTCAATGTCAAAGCCATCCAATGCAATGTCGCAAAGCCAAATCGAGTCA
CGAGTCATGTCACCAAGCCTCGATGTCATAAGCCAATCTAAGCCATCTGT
ATGTCGCCAAGCCAATCAATGTCACAAGCTCAATCAGTCGCAAAGCCAAT
CGCTGTCACAAGCCATTCAATGTCGCAAAGCCATCGATGTCATCGAGTGA
GTCACCAAGCCAATCCCATCGATGTCACTAAGCCAATCGATGGCACAAGC
AATCTATGTCAATCACCAAGCCATCAATGTCGCAAAGCCAATTATGTCAC
AAGCCAAGCCAATCGATGTCACCAAGCCAATCGATGTCATCAAGTCAATC
AATGTCACTAAGCCAATCGATGTCACTAAGCCAATCGATGTCTCCAAGTC
AATCGATGTCATCAAGCCAATCAATGTCGCAAAGCCAATTAATGTCACAA
AGCCAATCGATGTCACCAAGTGAGTCATTATCACCAAGTCAATCGATGTC
ATCAAGCCAATCGATGTCACTAAGCCAATCGATGTCAACGAGTGAGTCAA
TGTCATTAAGTCAATCGCTGTCATCAAGCCAATCGATGTCACAAAGCCAA
TCGGTGACACCAAGTGAGTCAATGTCACAAAGCCAATCAATGTCGCCAAG
CCAATCGATCTCACAAAGCCAATCGATGTCATCTAGTCAATCGATGTCAC
CAAGTCAATCAATGTCACCAAGTAAATCAATGTCACCAAGCCAATCAATG
TCACCAAGCCAATCAATGTCGCAAAGCCAATCGATGTCAGCGACAGAGTC
AATGCCACCAAGTCAATCGATGTCATCAAGCCAATCGATGTCTTTAAGCC
AATCGATGTCTTTAAGCCAATCGATGTCTTTAAGCCAATCGATGTCACTA
AGCCAATCGATGTCACCGAGTGAGTCAATGTCGCAAAGCCAATCGGTTTC
ACCAAGTGAGTCAATGTCGCCAATCCAATCAATGTCGCCAAGCCAATCGA
TGTCACAAAGCCAATCGATGTCACAAAGCCAATCGATGTCAAAAAGTCAA
TCAATGTCGCCAAGTCAATCAATGTCACCGAGTGAATCAATGTCGCAAAG
CCAATCGATGTCACATAGCCAATCAATGTCCCCAAGTCAATCGATGCCAT
CAAGCCAATCGATGTCTCCAAGCCAATCAATATCGCCAAGCTATTCGGTC
TCACAAAGTCAATCGATGTCATCAAGTCAATCGATGTCACCAAGCCAATC
GATGTCTCCAAGTCAATCAATGTCACCAAGCCAATCGATGTCGCCAAGCC
AATCGATGTCACCAAGTCAATCAATGTCGCCAAGTCAATCAATGTCTCCA
AGCGAATCGATGTCTCAAAGCCAGTCAATGTCGCAAAGCCAATCGATGTC
AGTGAGTGAGTCAATGTCGGCAAGCCAATCAATGTTGCCAAGTCAATCAA
TGTCACCGGGTGAATCAATGTCCCCAAGCCAATCAATG Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000336_pilon:290167..293004- >XLOC_014782 ID=XLOC_014782|Name=XLOC_014782|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1686bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000336_pilon:290167..293004- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CAGAGCCAATCGATTTCATTGAGTCAATCGATGTCACCGATTGAGTCACT
ACCACCAAGTCAATCAATGTCACCAAGCCAATCAATGTCACCAAGCCAAT
CAATGTCACCAAGTCAATCAATGTCGCCAAGCCAATCAATGTCGCCAAGC
CAATCAATGTCACAAAGCCAACCAATGTCACCAAGCCAATCGATGTCGCC
AAGTCAATCGATGTCATCAAGCCAATCGATGTCTGTGAGTGAGTCAATGT
CACAAAGTCAATCGATGTCACCAAGCCAATCGATGTCTGTGAGTGAGTCA
ATGTCACAAAGTCAATCGATGTCACCAAGTGAGTCATTATCACCAAGTCA
ATCGATGTCGCCAAGCCAATCGATGTCACTAAGCCAATCGATGTCAACGA
GTGAGTCAATGTCACCAACAGAGCCAATCGATTTCATTGAGTCAATCGAT
GTCACCGATTGAGTCACTACCACCAAGTCAATCAATGTCACCAAGCCAAT
CAATGTCACCAAGCCAATCAATGTCACCAAGTCAATCAATGTCGCCAAGC
CAATCAATGTCGCCAAGCCAATCAATGTCACAAAGCCAACCAATGTCACC
AAGCCAATCGATGTCGCCAAGTCAATCGATGTCATCAAGCCAATCGATGT
CTGTGAGTGAGTCAATGTCACAAAGTCAATCGATGTCACCAAGCCAATCG
ATGTCTGTGAGTGAGTCAATGTCACAAAGTCAATCGATGTCACCAAGTGA
GTCATTATCACCAAGTCAATCGATGTCGCCAAGCCAATCGATGTCACTAA
GCCAATCGATGTCAACGAGTGAGTCAATGTCACCAAGTCAATCAATGTCA
CCGAGTGAATCAATGTCGCAAAGCCAATCGATGTCACATAGCCAATCAAT
GTCCCCAAGTCAATCGATGCCATCAAGCCAATCGATGTCTCCAAGCCAAT
CAATATCGCCAAGCTATTCGGTCTCACAAAGTCAATCGATGTCATCAAGT
CAATCGATGTCACCAAGCCAATCGATGTCTCCAAGTCAATCAATGTCACC
AAGCCAATCGATGTCGCCAAGCCAATCGATGTCACCAAGTCAATCAATGT
CGCCAAGTCAATCAATGTCTCCAAGCGAATCGATGTCTCAAAGCCAGTCA
ATGTCGCAAAGCCAATCGATGTCAGTGAGTGAGTCAATGTCGGCAAGCCA
ATCAATGTTGCCAAGTCAATCAATGTCACCGGGTGAATCAATGTCCCCAA
GCCAATCAATGGTCAATCAATGTCACCGAGTGAATCAATGTCGCAAAGCC
AATCGATGTCACATAGCCAATCAATGTCCCCAAGTCAATCGATGCCATCA
AGCCAATCGATGTCTCCAAGCCAATCAATATCGCCAAGCTATTCGGTCTC
ACAAAGTCAATCGATGTCATCAAGTCAATCGATGTCACCAAGCCAATCGA
TGTCTCCAAGTCAATCAATGTCACCAAGCCAATCGATGTCGCCAAGCCAA
TCGATGTCACCAAGTCAATCAATGTCGCCAAGTCAATCAATGTCTCCAAG
CGAATCGATGTCTCAAAGCCAGTCAATGTCGCAAAGCCAATCGATGTCAG
TGAGTGAGTCAATGTCGGCAAGCCAATCAATGTTGCCAAGTCAATCAATG
TCACCGGGTGAATCAATGTCCCCAAGCCAATCAATG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000336_pilon | genome | sc0000336_pilon:290167..293004 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 421-843:424 |
| Aaloc | 1-417:2839 |
|
