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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000401_pilon:171237..176329- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_014589 ID=XLOC_014589|Name=XLOC_014589|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=5093bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000401_pilon:171237..176329- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCCAAAACATACAAACTTGAAGAAGTTGCAAAACATAATGATGGGCG
GTCAACTTGGATGGTCATTCACAACAAAGTTTACGATGTAACTAAATTCC
TTGAAGAGGTATATTTCCATCTTAATTTTACTCCTTATAATGGCTTAACA
ATAATTGAAACCTTCAACTATAGTGTAAAACTTGTGTTTAATGGGAGATT
CGCCGTCATTCTGGGTAAAGCAAATCCCATGACTATTCATATTGGGCCAT
TATTCCAGAATTTGTCTGTAGCAGGGGGCAGACGACACAGCACAGGATTT
CCGAGGGCAAAAGTTTTCACCAAAATTCGAAAATTCTAAGGGGAGAGAAG
AAAATGTATGAATTTCCAAGGCAATTGAATTTAAAAAGGCAAAAAGAGTG
GAATTTCCAATGCATTTTGCAAAAGTACATCGATTTTCATCGGATATTCC
GACCACCACTGGAAAAGAAAAATAATTATCGAGGCGTAACTAAAATAAGT
TTTTTTTATCTTCTAGCATCCAGGAGGAGAAGAAGTTTTGTTAGAGTTAG
CAGGTAGGTCAAAGATAAAGCTCAGTATCACTCAAATAAAATTATGAGCA
CGAGTCTGGTAATGTCACCCAAAAAGGTGAAAAATTTTGGAAAAAATAAA
GTTTTGAATTTCAGTTTTATTCCTGGATAATTTTTTTATTAATGACCTCA
ATTTTCAGAAAACATAAGTATCAGGGCTTAATCAAACTAGTTTGGTCCAG
AAATTTGACCTAGAGTAGTTATAATCAGACAAATTTGGCAAAAAACTCTT
TGTAGTTTACACTTCATTTGAGATAAAATATGCATAATCTAATGCTTGTC
TTAGATTTCAGTTCATGGCTAATATATTAAGCTGCATTGGAAAGCAATTT
TTACCGTCCAGTATAGCATATTTTTCAAATTATGACACTTTTTTCAAAAG
AAAATCGAAAATACTAAAAAATATTCCCATAAAGTTTGACTTCATGAAAA
GAAAACTGGCTATGGTCAGGTAATTTTATTCTAGATTTGAAGGACTCATC
ATAAGCCTTCCAAAAAACCAAAAGTTTTCTATAATTCAGTTATTCAATAA
AAAATTAGAAAATGAAACCTTGTTGGTTGCGGACATAACTTTTTGTTAAA
TTTGGTTTAAAATAAGCAATAAACATTAAATTGAGTTTATATTTGGCTTT
TAATACTTTGCTGTACTTGAACCAAAACTTAATCATTGAAATTTGTTGTC
TTGAAAGATCTTTGTAACTATGATTTCCTGAAAATTGAAGATTCATTTGT
AAAAGAGAATCCAATCATATAAAATCTTTTGTTAAAATCTTTTCTTAAAA
GTTAAGATTCGAGCTTGACATCAACTGTTGTACATCTTCATAATCATTAA
ATATGATTTTTCCTTGAGAGTCACTCAACTTTTTCGATAGAAAGGATTAA
ATGTATAATAATGCTGTGTTGCGGACATAACTTTTTTTCTTCCAGGGTAG
AACCATAGGACATTATACATCATTTATTTAAAATTTTGGAGTGTCTTTTT
CTATTGCCAAAATTTAAGGAATATTATAGAGACTAAATCAATATAAAACC
AAAAGATTTGGTTTGGTTTAATGTCAGTTATTACATGTTTTTCTTCGAAA
AGAACAAAAGAAGACTTATTAATGATATTAGAGCTTTCTCATATTTCTAA
TAGAAGAACGACCCTAGAGGACACAAAAAAATTGAAAAAAAGCAAGGAAA
TGCATGGTTTTTACAAATGTAACTCTTTACCGTATTGCCAATGTGTTAGC
ATAACTGCTTTAAGAGGGTTAAAAATCTGATAAATACTTTAAATAGTTAT
GTCCGCAACATACAATTTGCTACAGAATATGACTCTGTTTTGAACTATTG
GAGCAATTCTAACCAGTCTGTAAGTGAATGTGTAGTAGGTTATGTTGTGT
GAACACTACAAAATGAATTTAACATGCAAATTAATGCATGATTTATCCTT
TATTCAAGCTCGTAGGCTCAGAACCATCATTTTCAAAGAAATAAAAAGGT
TATTTTTCTGTTAAAATTTTCATTTTGGACCTCAACTTGGCATCAGAGTA
TTTGTTTTCTATTTCTAATAGCCTAAGCACTACTTCCATATGATAAAACA
TCATGCCAGCTTGCAAAAACACTTTATCAGCAACATTTTTAGATGAAATA
GTTATGTCCGCAACATGAAATACATATGATATGAGGTGGAAAAACTGAAA
TCTTGCCAATGGATAATTATCAGACTTTTTTCTGTTTTTTTCCAACTTAA
AATGACCTCAAATGCAATAATTTGTCAAAATAACCTAAAAATGATGTTTG
GGGGCTGAAAAAACTTCATGAATTGTTGCGGACATAACTTTTTGTTGCGG
ACATAACTAATTTTTGGAGAAACTGTTTTGTTTCACCGTCTCCCAACAAA
TAGCCTTTGAGACTTCAAATTTGTATAAAATGACCCCAAATATGACCCTT
GATATAGAAAAATGATTCCGCTGAGTAAGGATAACTCCTTTGAAAATTTA
AAGGATAAAATAATGTGCGGACATAACTCAAAATTGTGAACGGAAATCAT
ACCCTGTTCACTTCAAAATGGATTATTTTTCAATGAAGGACAACTGGTAT
TTTAGTGTTACTTGGTTTGGTTCTCTAATGGATGGGAAGGGTTAAAAATC
AAATAACTATAGATATTAACACTTTCACTTCTCTAGAAAATCAAATGTGT
GCGGACATAACTTTGTGAACGGAAAAATTTATGTCCGCAACTTTTTGCAT
TTATTCTGGGAAAAACTTCATTTTGAAAAATCTTTTTGTAGATTTTGTTT
TTATATCCATTGGCTGTAATAAAAACAAAAATCAAGTATGATCAGAGATG
ATTGGCCTAGATTATTAACTAATGAATTTAGACAATTTGCTAAAAACCTT
ATTTTCCGTTCACATTTTGATGTAAAAAGCTGTCCTGAAAAAATTGCGTA
CTTTGTAAAGTGAAAAAAATGACTATTTAAGCTTGCCAGTATCAAGACTG
ATAAAAAACATCAGCTTGTATCATTATTACATGCACCTAGATTTTTCACT
GGGGCCTTAAAGTTGAAAAGTTGACAAAACCGAAAATGGGTGACATTAGC
AGACTCATGCTCTTATTTATTTGATAACATTAAAAAACAAAAAAAAGCTG
AAAGAGCAGAAATTTTACCTTTGTGAAAATAAATACAAACAAATTCTTCG
AAATCAGATTCAGCGTAAAATATATTGTAAGCTTGCCATTTTTGGCAAAA
AGTTTTTGAATATATTTTAATGCTTTTATACTATATAGGTCAGGATGGCA
CTGAACAATTTGAAGATGTGGGTCATTCTACCGATGCTAGAAGTTTGTTA
GATGATCATTACATTGGTGATTTGCATGAGGTGGGAATGTCTTGGATATT
TAAAAAAAGGTCTATTCGTTTCAGAGCCACTTTTAAAACTAATTTTAGGT
TTTTCACCAATAGGATTCAAGTTTATGGTATACAGTATATGATATCCTTA
CAACTTTTTATTTTTATAGGATGATGTTGTAAAAGAAGCTACACCTAAAA
AGACTCAGGTGAAAATCTTTATTCTGAAAATACTTTACAGTGAAAAGCTC
AAAACAACTTTAAGATTCTGCTGTAGAGATCTCTTCAGATTTAACTTTTT
ATGGGATAAAATTTCAGATTTTGCGGAATGGAAATTAAGAAAGTCCCTAT
CCACAAAATATTATTAAACAAAACTTAAAAAAACGTCAAAGTAAGGCAAA
AATAAAAAAATGTAGTGTTTCCGGAAACCGGCCGGGTGAAAAATATAAAT
CTTCTGACCCGGCCGCAGACTATGGGTTCATCATAAAGAAAATCGAGTTG
ACCGTTCAAACTATCAAACATTGTTTAGCTAGATATTCCCGCTTGTAAAT
CAAGTTCCTTAGTAGTTGATACATTAGTATTCAGGGCTTACTTCTTACTG
TTTGTACATAAAAGTTATCTTTAAAGTTCTATTTCAATGATCTTAAGTGA
TTAAAAATAGCAACAAAAAGTTTTTTTCCGGCCGGTTGCATGAGAGCTTT
TTTCCTTCACCTGCATCCTGGGAACACTACATCTTTCTATTTTCGCCTAA
CTGTATACTTTTTAAATGTTTGGCATCAAAGAAACGCTAATAATGCGTAT
GTATTTCAACAACTAACATGCAAGGTTTGGCTGGGCAGTAAAAGGCACAG
GATTGTGAAAATATTGTCTCCCAACAGTGAAATTTGCAAAATTAAGTCTC
CGTGAAAGATTATCCCATTAAAATACCATGGTAGTTATAAATAAAGCAGT
ATATATTTGTGAGATTTTTTGAAATTACGAATCCGCTGATTTCTTCATTT
TTTTAGGTCACAACATCAGACAGCGAGGGAAGGTATCCAACATTTAGTTT
TAATTTCTAACCACAATTAAGAGCTTACAATTAATTTACTGTACAATTTT
ACACAATTCACAATAATGATAATTATTTTGATGCCCTGCATACAGTGTGT
CCCAAAAAAGTTGACAAGTTTTTATATAAATTAAAATCCTCATGGTTTAT
GTGTAATTTTATGACTTGTATACTTGATATTTCATCTTGGGACTTGATAT
TCATTGACAAGAAAATTTTAGTCTTATTTCAATTATTTTAAGCTAGATAA
TGAGTTTTTTACTTAATATAAAAATATTTCTACTTTTTTGGGGCACGCTG
TATTCGAGAGAAATTTGAATAAAATCTACTAATCAATGTAACAAATTGAA
AGTTCGAACAAGTTTAAAAAGATATATTTCTCCTTTTTTAACAGTGGATG
TACCTTATCGTGAAAACACATGCTTCTGTATTCACCCCTTGTTTTATTGT
ATTCGCCAAACGTTCAGAAATTTATTGACATATGCACTAAAAACAGTCAA
CCAAGTTAAAAAACTGTCCAGTGAATCCAAAAATCATCCGTTTCATTTTC
AGTACTTCATCGAATTGGTTGCTAATGGTTTCCGTAATGGTAGTAGGGGT
TGCTATTGGATGTTTCCTCTACATGCAATCTACAAAAAGCTGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000401_pilon:171237..176329- >XLOC_014589 ID=XLOC_014589|Name=XLOC_014589|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=786bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000401_pilon:171237..176329- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCCAAAACATACAAACTTGAAGAAGTTGCAAAACATAATGATGGGCG
GTCAACTTGGATGGTCATTCACAACAAAGTTTACGATGTAACTAAATTCC
TTGAAGAGATGGCCAAAACATACAAACTTGAAGAAGTTGCAAAACATAAT
GATGGGCGGTCAACTTGGATGGTCATTCACAACAAAGTTTACGATGTAAC
TAAATTCCTTGAAGAGCATCCAGGAGGAGAAGAAGTTTTGTTAGAGTTAG
CAGCATCCAGGAGGAGAAGAAGTTTTGTTAGAGTTAGCAGGTCAGGATGG
CACTGAACAATTTGAAGATGTGGGTCATTCTACCGATGCTAGAAGTTTGT
TAGATGATCATTACATTGGTGATTTGCATGAGGTCAGGATGGCACTGAAC
AATTTGAAGATGTGGGTCATTCTACCGATGCTAGAAGTTTGTTAGATGAT
CATTACATTGGTGATTTGCATGAGGATGATGTTGTAAAAGAAGCTACACC
TAAAAAGACTCAGGATGATGTTGTAAAAGAAGCTACACCTAAAAAGACTC
AGGTCACAACATCAGACAGCGAGGGAAGGTCACAACATCAGACAGCGAGG
GAAGTACTTCATCGAATTGGTTGCTAATGGTTTCCGTAATGGTAGTAGGG
GTTGCTATTGGATGTTTCCTCTACATGCAATCTACAAAAAGCTGATACTT
CATCGAATTGGTTGCTAATGGTTTCCGTAATGGTAGTAGGGGTTGCTATT
GGATGTTTCCTCTACATGCAATCTACAAAAAGCTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000401_pilon | genome | sc0000401_pilon:171237..176329 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 304-393:91 |
| Aaloc | 277-300:688 |
| Aaloc | 238-276:1525 |
| Aaloc | 148-237:1754 |
| Aaloc | 109-144:4578 |
| Aaloc | 1-108:5094 |
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