XLOC_014316 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_014316
Unique NameXLOC_014316
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000228_pilon:349044..359029-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_014316 ID=XLOC_014316|Name=XLOC_014316|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=9986bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000228_pilon:349044..359029- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CAGAAATCGCCGCAGTGCTCCAGAAGACTCCCTACCAGGTACCTAATTAT TTTGAGGCTTTATTCTATTTTCTATTTCAGTTACTTTTCAATCCCACTGT TAATTTTAAATTTCCAAATAAATACACAAACGCCCACAAACGGTTAGATT TTATTAAAAAAAACAGTAGTGTCGTGATCGCATGCAGAGGATGCAGCCGT CGATTTTTGGTTGGTGGGAGCGAGGGTCCCTTATATACAAGGGAAACAAT TATTATCGTCAATATAGCACTTTTCTTTTCTCCCCGCAAACTGAGTGGTT TTTCAGCTAAAAAAGGTAAAATTATCCCGAAAAAAGCTCTAAAATCCTAA TTTCTTTCCTTTTCCTCCCCGTAGTCTTAGTTTAGCCACGTTAATTGCAA TACAGCAACCTACATACAGCTTTATTTCATTTTTTACTTTCATAGTGGAT TTAAAGTTGGAATTCAACATCAAGAAAGGATTATTCACGGGGTGTTTCAT GGGCGTTTGACAACCATATGGTGTGACGGTACCGCCCAAATGGCGTTGTG TCCAAGCCTTTATGCTGTTGTCCGTATTAGCCAGTATTGGAGCAGTGATA TGTGGTATCACTTTTATGACACATGATAAAACACATGGGAATGCCATTTT TATAGCCCTGCTAATTACTTTTTGTTTTCGCATTGAGTATCTTCATCAAT ATCAAAGAGGACATCATTTATAAGCAATATAGCTATGGATGGGCGTTTAC TTTAGGATGGGTTGGCGCCCTTTCCGCCTTGGGCGCTGGTATCGCTATCT TTATCATTAATCGATCGTCATAAAACAGTTCCCGAGTCTAAAATCCATTT TCTTTGAGTATCTTTTTTCCATGTGGAAACCACTGTTAAGGGAATAACTG ATAAAACGCTGTCATGGTTTCTTTAAAGAAGCAGAACAGAGTAAACTTAA 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GCAATCGAGAGCTAAAATAGTTTATTTAGTGGTATTTATTAGGAAAAAGG ATCTACCGAGTACCGTGGAAAGCACATGCAGAAATCATATATCGACCTGT GCCGACAAATCTAGATTCTATTCAGTGTGAAGTATCAACGCAGGAAAATT AATCATGACAACAATCCAAGATCTTGGATTAAGTTCAATGTTGAAATTTT TTGGCGTCGTTGAAAACACAGCTCAAAAATGTTATCAACGCTTTTTAAAA AGAGTCAGTGATAGAGAATTGGGCTGTTCCATTAAAAAACCATACAGGGG GTGGACGAACCTTTTCAAGTGAAAAAAAATCATCGAAAATGTCTGGATAC CCCCCTGGAAAATGGCAAAATTTACACTTTTCATAAACTGAAATAAGGGT GGACGAACTAAAATCAGTCTTTTACCCCCTGGAAATTCAAAATAACTTTT TACCCCCTTGGAAAAATGAAACAACACCCCCTGGAATTCTTTCTCTGATA CCCCCTATTCAATTGAAGTAACATTACCATAATTGATAATTTAGGGTGCT TTTTCACTACGCTAGATAGATAAGTGGCTCTCATCAACATTTTGATCGCT TCATATTAATATTCCAGATTTTTGGTCATTAAACCTTTTGTTCTCCAAGA GAGCAGTAGAGGGGTGGGTTTACATCTGTCGGGAGAAATCGATTAACACT GCCTTTATCGATAACAGTTCAGACCATAAACGAAACAAAAGCTCAAAATC ACTTTTACAAATTCTTTTATAAACATAATCGATCTTTCCCTCGTTGTTGC CATCGTTACAAGAGGTAGGTTTGGGTACCTCTTAAGACAAAGGACCTAAC GAGGAGAAGATCCATTAAATTTTTAAAAGAAATCATGTAAACGATTTTTC CAATTCATTTTAAACAAATAAAAAATTGGAAAATGATTTCGATAACGAAG ATGACGGGTGTTTTCACTCTATCTGCTTGAAACATGGTGAGCAATTGAAT GCAAGATTTTCTCTATTGTTTGCTGAAGATGTCAAGCATACTTGAAGTCG ATATGATTAAGTAAAATGAGCAATTAAAATAGGTTTGTGAACCGAGATTC TTTTCGGAATGTCACTTATCATTAGAATATTTTTGATTCTTATATGGAAA AATAGCCGTATTACACGTATTGGAAATATACAAATTTAGGGTTTTTAATT TAATTTGTTCAAATATGTATAGTCAGTTCATTTTCGTTTGGATAATCGTT TTAACGACCTCAGAAGCAAATATTTTCTTTCAACTTTCGAAAATAATGAA ATTAATGGGTTTTAAAAAAACATTATCCAAATGAAAGTGAACAAAACTAT ATCAATATGTTGCGAGTCTCTTTCAAATGTAAAAATCTGTGAAAAGTCAA AATGGATGGACACAGACTTAAGGTGTTTATTATAAGGAAGATGTTTAAAA GACGTAAAAAGTTCAAAGGAAATCATTCACATTGATTTTTAAAACTCATT GTTAAGTAATTACACTGCACGCTTTCCAACATCTCAAGGAACGTCAGACC TTCCCCAGGAAAACAAAAGAAATTATTACTTTTGCTTGAACGAGTCTCTG GCATTCCAGCGAGAATTAATAAAATTTCTTTTCTTTTCCAGCCTTTCTTT ATTTCATCAACAAAACATTTATATGATTCACACGTTCAAGCAACAATTAG CTTTAACTTGCAGACTAAAAACACCCGACAACTACGCAAATTACTTTTTT GATCAATATATTCTATGGCTGCGTTTAGACCAACTGGCATTTGTAATTTG GCATTTGCTCATGAGGGATTCGATTTTAATAGCTTTTTTAATTGTACTTT CTGTCATGGCATTTAAGGAATCGTCTTTTTAGAGTCATTACTGAAAAGGT GATTCCCTCAAGTTCAACTTTGACAGATCAAACAATGAAAAGCATGCAAT TTCACACGAAATTGGCAACGAAATGCCAACACGCTGGTATCATTAGGCAT TTGGCAAACCGAACAATTGCGCGGAACAATAGAATTCAAAAGAATACTGC AAGCAATTACAAATGCCAGGCTGGTCTAAACGCAGCCTATGTAGCATGAA CTTGTACGGGGTGCTTTTTCACTACGCTAGATAGATAAGTGGTTCTCATC AACGGTCCTTTTCATAAATTTCTAAGGGTTGTAAAAAATATACAATAAAG ATTCGTGCTTAACATCAGATTTTGATCGTTTCATATCAGCATTCCAGATT TAACGTCGAAAATTGGTCATTAAACCTTTTGTCCTCCAAGAGAGGGGTAG ACCTCTCTTGGCTTAATGACCAATTAAGTGAAAAAGGCAGCATAAATAAA TTGGTTGCCATAAAAGTAGCAGAATGTGCAGAGGGATTCTTTTGTAAAAA ATTGGTCGTATGGGAAAAGTGTTTTCTTTCCCGATAGAGTTGAAGAGCAA ACTTTCATCTGTATTGATTTGATACAAAAGACGAGGAATCTTGTCACAGA AAATGTTCATTAGAAGGCTGTAATTCTAAATCCCTTGATATGCGAGTTGA TGATTTTAATAAAATTTTCTTCAAATTCAGAGGGTTGTAAACGCTTTGAA AACTGTCTTAGGAGTCAATAATGTTTTCCTACCAATTTTGTTTGTTTCAG CTAATCGATTTTCTTAAACAGCCTCAGTGAAAAAGCACCCACACCATCAA CATTTATCAGCAGTGAAATGGTTCGGTTTTTGCATAAAATGAAAGAACTG CCTCCACTGTTGGAGAACTGTTTATAGAAACGACTGACTTAAAATATTTT TTAATTAGATTTTGTCAACCATGCTGCAGTTAACTCCAAATTCAAAGTTT GACAACTGTTTTGGGAGTCAGTAATTTTTTCCTATCAATTTTCTTTGTTT CGGCAAATCGATTTTCGCCAGACAGTCTCAGTGAAAAAGCACCCTTAGTA AGTACTGTAAATTTGGGAATCGTGTAGAAGATTTCTTTTGAAAGAAACTC ATTTCAATTACACTCGGAGGTTTCTTGGGAATTTCGTCAATAGTAAACAT GTATATTGATACAATCTGCCAGACATTAGTATGGTAATACTTGCTCTTCA TCTTTGATTTTTTCTACTGTGATTAGATTGACACATGCGTGATAAAATTT CTTTATTTGGTGCTCAGAGGTTGATATGTTCGTCTTGTCAACCTCTGATA CTCAGGGTATGTACCGATTATTAATCAGCCTCTACAAGAAACTCGTTTCG CTAAAAACGGAAGTTATTTTTCTTTATTTTTCGACACTTCTTTTTCTTTC TTTTTAGAATTTACATTGACACAAACCGTAGCCTGGATATCCAAGCTCAA AATTTTAGAAAAAACAAAATTTACCTCAACATACAAAGTTCTGAAATTAT AGAGCTTGGTCTCCCTAGAGAATGAAAGTGCAAACCCATGTTTCCAAAAC TTTCCTAGCCAACCCAAGGCAACAAAACAGAAATTAATAAAAAGCAGCCT TACAAGATCTAAAACCATTTAAAACATCCAAAGATTACACCAGAATCCAT AAAAAAGTTTGCATGTATTATCATGACCAACCATGTTTTCTTGGAAAATG AACTCGCCTCTGTTTCTTCTTTTTCATGTTTTCATATAACAGAAAGCCCT ATTTTCACTAGCAACTGGATGACTATCCTATTTTTGCTTTAGAATTGCTC AACGTAGTGAAGATTGGCCCTTACGGTTTTAGCGAAGTGAGCGCAAGCAA GCGGACTTTGCACAGAATGCAAATCGCTCTAGGGAGACCAGGCTGTAAAC CAGAACATAAAATATAAAAAACTAGACTGTGAAATAGTTTACAGCCTGGA TATCCAGGCTACACAAACCGGTGCAATATTTCATCCAACATTTGAGAAAT GGCCTTACCCTGGCCTTACATTTCCACAATACAACGTTCAATCCGGTCTT TAAGAAGAGGGTTTGTATCAAGTGGAATATATATCTCTTTCAAGTTAAAA TAGTTATCTAAATTTCTTGACATACAGGCTTCTAGAGTCTGCCTCCTAGC TAAAAGAGGAAAAAAGTAATCATTATTATAAATTAACGATGTCAGTAGAA ATACTATTGTTAACCTATTGTTAACTCCATTAACAAGCAATTTACGATTG TAACTGGAGTTCAAAATTATAATTAACATGAAAATGTTAAACAGGATAAC CTCTTCTCTGTAGGATCTGTTAAGGGACCATTTCACAATATAAGAAGACG GTTTTTGAGTTGATTCCATTATAATTTCAGGTAAATTTAGAGAAGTCTAA TTATTTGGTTTGTGCGTCAAAAAGGTAAAATTTTACGTTTGTCGATAAAT TTGTCTTCTGGTTTACAACCCTGTCTCACTTTCGAACCCAGTCATTTCTA GAGTAAAGAGTCCAAAGAGAGACCCTCTATCCAATGTCTCTTTTATCTAA GGTAATGGCTGGATTGATCGGTGAGACAATGGCGTTTTTTCCACTAGCGG CTTAAGCTAACAGGATTAACAAAACGTGTAATAAAACGCTGAATAGCTCA AAACTATTTATGTAAGTTGTAGATGAAAAGAGATGGTTACACGTTTACAT TTTCTTTTGAAAAAATTATTTTCATTTCCCACAGTTTGCTTACAGTATGT GGCCCCAAAAACGTCGATCAAATTTTAGGTTTTAAAAAACTTTTTGCTGC ATGAAAAACTTTAACATCTCTACTTTATTTCCCGAAAGTTCTCCTTCAAA ATATTCAATATTTCAACAATATTTTTCAATCGCTTAAAGATAGGTAGCTT TTTTCTAATGGCCCCCAAAACGGAGGTTTGCTAATTTAGCGATTTCTCGA GATCTTTAATGAAAAGGTTTGATTTGCAATCACAGAAACATTATGCTGGA TTACGAAAAGGGCTACGGCATCAAAATTGCCTCGTGAGATAGTTGCCTCG TGCCAGTTGCCAGGTCTAATTACGTCATGAAACGTAATATATAATTTTTA AATGGAATTTAAGACAATCTTATTTACCAGCGTGGTAACCTTTCGAGCAT CTTCCTATTTATTAAACTAGAAGAAGCAACTTGGGGAGGGGGACTCGAGG CCCATCACTTACAATCTTAAGATTGACAAGTACTATGACCTTGAAATTCT TACCAGTGGTAGATATGAATAATCAAAGATGATTCGCAAAATTTTGGTTC GGCCACCTATCTTGTTGGTATTTTACAGACCAAGATGTACATCAGGCAAA AATCATATATTGACTGATTGACTCCTACGATTTGACCGAAAGTCGTTCCT GAAGGCTACTTTATCAAATAAAAGAGAATCGTGATAACGTTAGCCACCTG CCGCAGTTCAAGAACCAGTGATATTAACCATTTAAGACATTCTTTGCTTT TTAATTCTATGAGCAGTGCCGTAGCCACCGGGGGGGGCCTGGGCCCCCCC CAAAAGATTTTCAGATTATGGTGTTTTTGAAAAAGGTGTAAATTTCGTCA ACTTTGTCTGTATATTTACTTTTTGAAAATGTAATGCACTAACTATTTAC AATGATAGTCTTATGATTTGAAAATATACATGGCCCCCGTCACCGGGGGG GCCAGGGGGGCCATGGCCCCCCCAATATTTTGCAAAGTAATTTTTTTTAA TTTAAAAGATCTTACATATACCGTTTAGAGGGGTGAAATAAGGGTGAAAA GTCGAAAATTTTCTTTGTCGCCCAACCATGGTGGGCGACATATTTTTTTG GCCCCCTCAATTCAATTCGCACGCCGGGGGCCATGATATACTAATATGCA TATCACGCGATTTCTACTTGCCTTTTTCTAAAAATTGACTTTCGGAGAGG TAGTTTTAGCCAATCTGGAGGGTGTGAAGTCCAAAGATTTTTCTACCCCC TCGGCCCCAACTATGGTGGGGCCTCCTTAGATACTATAAACTTATATGGC CCCCGCTAGAATATAATTTATGGCTACGGCACTGATGAGGGAGCTTAAAG CTCCAATTTCAGACCACCATAAAGAGTCGATGAACGAACGAAAAAAACGA GGTTCTTATTTTGGTCACTGGGTACGAATGCCTCAAGATGGCCTTCGGTC CTAAATTCTTACTCTCGAGTTCAATCCTGACCCTAAACCCTAACTGGTAA CAACCCAATACCCCCTGAGAAGTAACAGTAAAGAACGAGAAAAAAACAAC AAAAATGATATTGCGAGGACATTCTGGGATAGCTTACCAGAAAATGGTGC TCTTTTTAGAGATATTTTGCTGTCGGTATTCCTTTAATCTTTTAACCCCC CCCCCCGTGTTTCTTACTCCGCTGTCTTCAAAACAGTTCTCTGTCTCTTT GAGTGTAGGTACTAGATTCAATTTTTTGTTTTGTTTTTGTTTTTCAGAAT TTGATCAAGATGGTTGAAGGAAAGAAAGTTGGAGTTTTGATTGCATGTGC TGCGGTTTTCATATTGTTATCGGCTTCTACTGGTGGTGTTGGATGGTCAA ATTACGAGGGTAAGACCAAAAAAGTCAATTTCAAAATTAAACTAATTTTA CAACTATAGTTTTGGTTCAAAAGGTTAATATTTCTATCCACTAGTTTGTC GTCTATTAAATTCCATTCAGAGCCGCTGTTTGTGGTTCGACGCTCTTTAG AGAGAGCCACCTATTGAAAGTCAACACTAAAGAAAGAATACAGTTACAAT TTCGAAATTTTTATTTCATTTAGCATTGTTGGATGGAGGGTCTGTCGAAT TAAAAATGGGTTTATTCAGATCATGCCGAACTGAAAAGAGTTTTTCAACT TTTTCAATCAGCAATATTTGTTCAGATTTCAAAAGTGAACAGCTCTCTTC CAAGCATAAGGCGATTCAAGCATTCATGATCTTGTCTGTGTTAGCATCCA TTGCAGCTGTCGTTTGTGTTATGTTCATTGACAAAATCTCTGCTAAGCTT ATCTCCTGGCTTATGATTGATGCTTTCATTTCGGCATTGATTGGTTTGGC AATCTTCACTGAGAGTAAAGAAAACAGTATTATTGACATTTATGACTATG GTTGGGCCTATGCATTAGGGTGGGTTGGCGCTATAGCCGCCCTGATTGTT GGTGTAGTGGTTTCTGTAGCTTATGGATCATCTTAA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000228_pilon:349044..359029-

>XLOC_014316 ID=XLOC_014316|Name=XLOC_014316|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=954bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000228_pilon:349044..359029- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CAGAAATCGCCGCAGTGCTCCAGAAGACTCCCTACCAGCAGAAATCGCCG
CAGTGCTCCAGAAGACTCCCTACCAGTGGATTTAAAGTTGGAATTCAACA
TCAAGAAAGGATTATTCACGGGGTGTTTCATGGGCGTTTGACAACCATAT
GGTGTGACGGTACCGCCCAAATGGCGTTGTGTCCAAGCCTTTATGCTGTT
GTCCGTATTAGCCAGTATTGGAGCAGTGATATTGGATTTAAAGTTGGAAT
TCAACATCAAGAAAGGATTATTCACGGGGTGTTTCATGGGCGTTTGACAA
CCATATGGTGTGACGGTACCGCCCAAATGGCGTTGTGTCCAAGCCTTTAT
GCTGTTGTCCGTATTAGCCAGTATTGGAGCAGTGATATGCATAAGGCGAT
TCAAGCATTCATGATCTTGTCTGTGTTAGCATCCATTGCAGCTGTCGTTT
GTGTTATGTTCATTGACAAAATCTCTGCTAAGCTTATCTCCTGGCTTATG
ATTGATGCTTTCATTTCGGCATTGATTGGTTTGGCAATCTTCACTGAGAG
TAAAGAAAACAGTATTATTGACATTTATGACTATGGTTGGGCCTATGCAT
TAGGGTGGGTTGGCGCTATAGCCGCCCTGATTGTTGGTGTAGTGGTTTCT
GTAGCTTATGGATCATCTTAAGCATAAGGCGATTCAAGCATTCATGATCT
TGTCTGTGTTAGCATCCATTGCAGCTGTCGTTTGTGTTATGTTCATTGAC
AAAATCTCTGCTAAGCTTATCTCCTGGCTTATGATTGATGCTTTCATTTC
GGCATTGATTGGTTTGGCAATCTTCACTGAGAGTAAAGAAAACAGTATTA
TTGACATTTATGACTATGGTTGGGCCTATGCATTAGGGTGGGTTGGCGCT
ATAGCCGCCCTGATTGTTGGTGTAGTGGTTTCTGTAGCTTATGGATCATC
TTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_014316XLOC_014316-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000228_pilongenomesc0000228_pilon:349044..359029 -
Properties
Property NameValue
Aaloc268-486:220
Aaloc196-258:283
Aaloc40-192:9541
Aaloc1-36:9987