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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000366_pilon:187915..197700+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_014259 ID=XLOC_014259|Name=XLOC_014259|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=9786bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000366_pilon:187915..197700+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) AACACAATGGATACATCAGCTACAAAACCATCCATGGAAGAGGAGAATGA
AACCCAACGCAAAGCCTTCGCTGAAACTCTCAAAGTTGCATTGGTAAGAG
AgaactttgattttattttgcatGTTATTAACAGTGACCCTTATTGATCA
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gttattccaaatcgcttcagacagtctaccgtcctcaaaagtgcaaatac
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aaaagctGCATAATTTCGTggagtcattgcagtggtgcatatcatgaatt
ccatcACTTCCAATCTAATTACTCCAAAGAAGGTCAAAATCTCCAGTGCT
GGACAAATTATGGCAATATCAATCATGATAATAACAGAAGTGAGTAACGA
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TGAGTTTAGTCAGACAAAACTTGAAGTTGATAGCACAACTAGAgcttttt
ttggaccacccggtaTTAAAATTATACTATAATGTCAAATATCCTccata
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ATGATCGAGAGGCTTTTCTCTTCCACTGTcccttcattttcttttctagt
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GCTGCATTAAAAGAAGTTGCATTAAATGACCATGAAATTTCACTCGTGGA
AAACTCTTCAAAGTATTTATCAGgtaacaaaaagtttttcaattgtgTTT
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TTCAGGTATGAATATAATGAAGTCAGAACAACCTGCCTAGTGAAGGGATT
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GTGCAGAGGGGttgaagcccccccccctgaaggttcagccccccccctga
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CTAtgctacttgactggatcgagCTACCCTTACAATAGAAGGGTGTCCAG
GTTTAGAGCTAACTAGTCCgtcatcttgttttcaattctggtcgtTAACA
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ATAGTTGAGCGTGATATgtgcagaatggatgatctgttatgagagtGTTA
TGGGTGTTATGAAAGAGTTATGTTATGAGACTTttaacccccgggggggg
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gctcggacattcccgtcacctcgcaaacctagtacccccccgggctttAA
CCTACTTTACTATCTAAGTCTAGCGCCATTCTAACACGATGATGACAATG
TATCTGTTCCCCAAAATGAGATTTGAACCACTTTGAAGCTACGAAAATGC
AtgaaaaagagacaaaacattttcttctttagcCCAGCTTATTAATAGTT
TAGATTTAGTGACATCTAAAAAGCATAATgatgaatttcaattttcttcg
tTTAGGGTAAGAGATTGAACAGTGCGCTTTCAGCATCGTTATTACTCTTC
TGTCAATCATCACCAATGATATGTGAAAATGTTGTCGCCATCATGGTACG
TGTAATCGCTGGTTTCACCAATCTTTTGAAAGGTAAGACAAGGTGGCTGA
TTTCACAATAGCCCGGGACCACTAATatctttttgatagactggatagtg
ctgataagtggcccggtgtaATTTGGCAGACTCCATTGTTTGGCTTTGCT
TTGAGCACGTAGCAAATCCATACCACCAGatccctttttggagaaaaaca
aacgGAAAACCATGATCAATTgaccattttcatcaaatttggagactttt
attatagtttcatgagttttatatgatttttgaaaacgaaattaaaaaat
tgatgacAGAATCCTCTAGTCTTCTTACTAGACATCAAAATCTATCAAAA
TCATCATGAAGCAAAGTAAGAAGACCTTAATGGCGAAAATTGTGCTGAAA
TATCTCAATATGTTATCGGATGTAAAAGAGGGCATCGGAATTTTAGAGCT
GAATTAATGCTGGAAAATACCAATTAATAGAGTGCCAGTCGAATATACTT
TCTTGAATTCAGAAAATTGACTCTATATGTACCGGAACCGTGATACAAAA
TACCCAATAGAGTTGGTTGTattgttttcttcatttctaTGGAAAATGGG
ATGTTAATGATCGATTTATTTAAACCGAATTTTGTGCTTCGATTGGGTTC
GATTAGTTCCATCTCAACTGAATAAAGCTCATTTGAACCCCTGGTTTATG
ATGATCTAAACCTGTTTTGATTCAttgattcttattttcactCTGATAAA
TTTCCATGCTTACTGTGGAGAATCAGACCGTTGGCAAAAGAAccctttga
aaaattcttttcataccttaaacagtcagggaattccctcaattgcggta
tataCGAatacatatagtgctggtcgacaaagataaacaaacattgaTTG
TAAAAAATAGTACGAGGAAAAAGcttctccttgaatcttgaattctgttt
cttgcATATACTGCATTTgcagtttatgaaaaatgtaaaagcgATGTTTA
TACAGCAATTGCGGTAGAAAATTACTACCGCTATAGAGGGAATTCCTTGT
CTGTTAAAGTGACGTTGGAATGTACTAAAACCACTTTTTTACCCCCattg
gaaattttaaaacactCTTTTAGACTCCTGGGAATTCTGCTcgaattacc
ccctggaaatgttcatcCACCCCTCTCTATGgacataaaatggaatggcc
catttttcGATTACTATAACTGTTCTTCCCAACACTGTAAATATTAGTTG
TGAAGTATGTCACATTTTATAATTTCACAGATCTGTCATCCTTCACCAAC
TTGAACGTTTCCAAGTACCAAAACATTTGCTACATTTGCAATATCCTTCA
TGACGTCATTGTACAGGCTGCATCTCATATCAATGCGTCCCTCTTTGGTA
GGTTTGTTTTTCATCGATGTTGCAATAATCTATCGTCCGATCATTTTCAT
TCAGATAATCTAAGATAATGGTTGACAACTTTCAAGTGCAAACCCgttta
tttttactattcaAAGCAATGGGTATTGGGTGTTTTGTAAAAAAGCcatt
ataaagaaaataacacccctgtctcacagccccggtggaacttgtCCTTA
ATGGGGATATAAATTCCTCTTGAAATCCCgatattctattgttccaaaat
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GGATGAAAAGTCGATTTCCCAGTGAGGTTAAAATCCCCACCGAGtgcgaa
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AGCTAAAATGCTCATTATTGGTCCAATAAAGTTGGTTTTTGGTCAAATGA
TAGAAATCTAAgtaaaatagaattttcaaacaaaaaatttccattttaca
aattttgttcCTTTCCAATATGATTTATTAGCCATTTAGAGGGATCCAGT
ATCAGCCATTTGAGGGATCCAGTCTGAAGTTTATAGAGGCTGCAATTTCA
ATCTTCTGTCTTATCCCATTAGGAATTAACTCATTGAACCAGGCTCGCCA
TTTATACggtattctcaacttcagttgagctagaatctgacagtgtctgt
ctatctgtctgacttcaaaaatggtcggatttgattgaaattttgcatat
ttGTTCTTTTGGTGAATATCtagggtgttttttcattttttgaaaatttt
gatttttggggcctggggacgagttttagCGCCAAAGCGAGGCTAAAACA
TTGGGGCAGGTTGAAGACCTCAGAAATGGTCCgatttaattgaaattttg
gaCACTTGTTCCTTTGGTGAATATATGGGGGTGgtttattcatttgtttt
caaatttttcattttaagggcgtggtcacaagGTTCAGCCCAAAACGAAG
CTAAAAcatttctcaaatcaaaaattttctgttgatgtttacaattgggc
ctacgagtaatttaaaagatactgaagttgagccagtgcggttagcacat
TCGACAGTCTTAATAGGGTACACTTTTCTATTTTCCAGCGGACTAAAAGT
GAGAATTAGGCTTAAGAAGAAACAATTCGACTGGAACACATTTGTTTtca
atcttcaatttttctcataGATCAATACGCTGTGATGCTGGACAAGAATT
TGTTTGACGTATCCAATCAATTTTCAATGTACACACATATGGTGTGGAAG
CTCAGCTCCTTGATGAGTATGGTCACATTGGTGTAG Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000366_pilon:187915..197700+ >XLOC_014259 ID=XLOC_014259|Name=XLOC_014259|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2034bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000366_pilon:187915..197700+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) AACACAATGGATACATCAGCTACAAAACCATCCATGGAAGAGGAGAATGA AACCCAACGCAAAGCCTTCGCTGAAACTCTCAAAGTTGCATTGAACACAA TGGATACATCAGCTACAAAACCATCCATGGAAGAGGAGAATGAAACCCAA CGCAAAGCCTTCGCTGAAACTCTCAAAGTTGCATTGGCGATGTCCATCAT AAGAAGCAAGCCAGAGGGTGTGACATCAAAAGAATATGCTCAACAACTCG CCATCAGACTCAAAGAAACGGACTCATCCTGGAAAACTAAGGCGATGTCC ATCATAAGAAGCAAGCCAGAGGGTGTGACATCAAAAGAATATGCTCAACA ACTCGCCATCAGACTCAAAGAAACGGACTCATCCTGGAAAACTAAGTATA AAGACATGGAGACAGTGTTGAAGAAAGCTCAACAAGAAATCGTCATGCTT AGATTAAAGGTACCGTCTAAATCAGATGATCAAAGATTGACAGTCGAGCA AATGCAGTCAGATGCAGAAAGCATATAAAGACATGGAGACAGTGTTGAAG AAAGCTCAACAAGAAATCGTCATGCTTAGATTAAAGGTACCGTCTAAATC AGATGATCAAAGATTGACAGTCGAGCAAATGCAGTCAGATGCAGAAAGCA gtaccaaaaactcaGTGGTTGAATTCAAAACCCATGGAGACTTCCTTAGA ACAGgtaccaaaaactcaGTGGTTGAATTCAAAACCCATGGAGACTTCCT TAGAACAGtTTTGTCGATCGGGAATTGGTATGATCGGCTGCAAGATGACG TGAGTTGTTTGTCGACTATTAAATCATCTTTTAAGTATGTATTAACAGtT TTGTCGATCGGGAATTGGTATGATCGGCTGCAAGATGACGTGAGTTGTTT GTCGACTATTAAATCATCTTTTAAGTATGTATTAACAGATCTCGAGGCTG CATTAAAAGAAGTTGCATTAAATGACCATGAAATTTCACTCGTGGAAAAC TCTTCAAAGTATTTATCAGATCTCGAGGCTGCATTAAAAGAAGTTGCATT AAATGACCATGAAATTTCACTCGTGGAAAACTCTTCAAAGTATTTATCAG GAATGATGAAAGTGAAAGACTTTTGCCAAGATAAAAACATCAAGGAAATT TGTAACAGTATCATTCGTACCATGGTCACCAAGATCATGAACGCTCACCC TGTTCAGGAATGATGAAAGTGAAAGACTTTTGCCAAGATAAAAACATCAA GGAAATTTGTAACAGTATCATTCGTACCATGGTCACCAAGATCATGAACG CTCACCCTGTTCAGGGTAAGAGATTGAACAGTGCGCTTTCAGCATCGTTA TTACTCTTCTGTCAATCATCACCAATGATATGTGAAAATGTTGTCGCCAT CATGGTACGTGTAATCGCTGGTTTCACCAATCTTTTGAAAGGGTAAGAGA TTGAACAGTGCGCTTTCAGCATCGTTATTACTCTTCTGTCAATCATCACC AATGATATGTGAAAATGTTGTCGCCATCATGGTACGTGTAATCGCTGGTT TCACCAATCTTTTGAAAGATCTGTCATCCTTCACCAACTTGAACGTTTCC AAGTACCAAAACATTTGCTACATTTGCAATATCCTTCATGACGTCATTGT ACAGGCTGCATCTCATATCAATGCGTCCCTCTTTGATCTGTCATCCTTCA CCAACTTGAACGTTTCCAAGTACCAAAACATTTGCTACATTTGCAATATC CTTCATGACGTCATTGTACAGGCTGCATCTCATATCAATGCGTCCCTCTT TGATCAATACGCTGTGATGCTGGACAAGAATTTGTTTGACGTATCCAATC AATTTTCAATGTACACACATATGGTGTGGAAGCTCAGCTCCTTGATGAGT ATGGTCACATTGGTGTAGATCAATACGCTGTGATGCTGGACAAGAATTTG TTTGACGTATCCAATCAATTTTCAATGTACACACATATGGTGTGGAAGCT CAGCTCCTTGATGAGTATGGTCACATTGGTGTAG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000366_pilon | genome | sc0000366_pilon:187915..197700 + |
Properties
| Property Name | Value |
| Aaloc | 904-1017:9673 |
| Aaloc | 787-900:8283 |
| Aaloc | 658-783:6906 |
| Aaloc | 553-657:5251 |
| Aaloc | 472-549:4845 |
| Aaloc | 382-468:4002 |
| Aaloc | 328-378:2650 |
| Aaloc | 199-324:1862 |
| Aaloc | 94-198:840 |
| Aaloc | 1-93:1 |
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