XLOC_014250 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_014250
Unique NameXLOC_014250
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000366_pilon:161026..170390-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_014250 ID=XLOC_014250|Name=XLOC_014250|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=9365bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000366_pilon:161026..170390- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGCTACTAATTGTGTTATTTATTTCCTTTCTTACTGAAGAGACACTGGC CCAACAAGGAATACTGGGTATGACTTTTTTTGCATTTATTTTTATACCAA AAGTATCCCCCCACGCCACCACCAGCACCATCAACAATAAAATTCTGAAA ACAGCATGCTCCAACTGGAAATAGAAATTTGTTCTAAGGAAATTTGGTGA CCTGGAAAGTGTTGATCTGTTTCTAGTTAGGTATTGGATATAACAGGATG TACCGTGAAGTCGGGTAACTTGCATAGTAGAAGCAGGGGGGGTCGGTAGT AAAATCTCAGACATATATGAGTAGTAAAAGGATTTTTATGAATTTTTACA TACCACCACCCAGACTCTTGGAAGAGGTATTTTACTAACCTGGTAGTAAA AGTTTTTGGGACAATTTGTCATAAAGACCACCTAATTTTGGTTGCTTTTC GCACTGATTTTACAAAAAAAGCTAAAAAATGATTATTTCTGTGACACATT TTTCACTTTGTGCAAAAATTAATGTTTTGCCCTTAGAATTAAAGTCTTTT TTATATTGACAAAAATCTCGAAAATTTTTTGTTTGCAGCCAACAACTTTC CAACAGAAAATATTTTCAAGTTATAAAAATTTTCAGATTTTTTTCAGAAA AGTCATCCAAAAAATTAAAAGAATTACAAAAATAGCTAAAATTTGCTAAT TTTACCAGTTTTAACTACCCAGGTAGTAAAATTTTTTCAACATTTAACAC ATAGATACCACCCATTTTAGTATTTAACTACCCTGGGTAGTAAAAATTTT TTTCGATTTTTCGTCACACCACCACCGTAGTGAACGTCATTATGTCTGAG ATTTTACTACCGACCCCCCCCCTGGTAGAAGAGGGAAATTTGCATAGCCA TCAAATGACTGACCAATCAAAGCAGCAAAATTTCAAAACAAATGAACTAC 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ATTTTCGCGAAATTAAAACTCACAAAAATGGGTGAGATTTCTAACTCGCC AAATTAAATTCATTACAAAACTTTTTTAAATCACATTTTCGGCGGAGAAA CCATTTCAAAATCACCAATTGTGGTAAAAAATGGCTGTTTTCAAGCTGAT TTCAACTGATTACAATGAAAATTGAACATAAAATTCTCAAAACTTTCCGT TCTCCTAAACGACTATTTCACAGGTATGAGAAGATTTTAGAAAACAGCTA GAAACATTCCAGCCATATAGAAGATTAAATAGAGACCCATCACGAAGGAT GATATTGTTTGCCAACTAAAAAACTTCTACCTTGAAATTGAGGATTGTGC AAGGGCCCGAAGGGCCTGTAGTGCAATCCAGATTTTATAAGATAAAATCG AAGCCAAAGATAAATACTGGAAATCCGCTATGACTCGCAAGAAATAAATG AAATCGCTCAAATAAATGAAATTTATGAAAATGAATTAGAAGTTAGGCCT ACGGCTTCGATCCTATCACATCATCGACCCCATAACAAAATGATAATACA GAAATAGAGCTTTCGAGCACAAAACAATCTGTGATTATAGTGTTAGGGAG GGCTTGGTGGGCAGTATTTATCTTTGGCTTCAATTTTATCTTATAAAATC TGGATTGCACTACAGGCCCTTCGGGCCCTTGCACAATCCTCAATTTTATG ACGATAAAATCTCCGCCAGATAAATACTGGAAATCCGCTATGACTTTTAA GAAATAAAAGCCATAGCTCAAACCCACATCGACCTCTCTTCAAAGCCCAA AGTAGAATAACCATCTTGTTCCACACAAAATTGAAGATTAATACACGCGC GACACTTTTTAAGTTGATCCGATAACTCCTCCTATCTGAGACCTCAAATA CTTATTTACAATAATAATGACCTTGTTGCCGAAACTCCCGTACTAATTGT TCAAGTGACTCCCTTCGGGCACTTCAATTCGACTTAATATTTGCAAAGAA AAGCAAACTTGTAGCCTTTAAAGGTCAAAAGAAGTCCAGGGAACAGGGAA CCAAGACAAGACTACAGGAGAATAGGAAATTGTTTACTATGAATCCATCT GCCTGGACTTTGGAAAGTCAGGGAAGATTCTACAGGCTGTTGCTGTCAAA CAACATGTCCTGTCATTGAAGACGCAAGTATCATCGGAATTTTTCGAGTC TATATTAGTGGGAAGCTACAACGGCAAAATTTACTACCGGTAACTCGATT AGAGTATCTAGTACACGAATAAATGTGAAATCAGTGGTATGCATCGCTAA GTACTATACCTGTATGTATACATACTACTAGGGCCTGTCTTGTAACAATA ATCATCTTAAACACAGAACTTACGAAGTACTTCAGATCGGCGACGAGAAC AGCCCAATGGAATGTTAGATGACGTCTAAATTATAGGCCTTAGGTAATAC CTGGATTCCAGCCAAATTTTTACAGGTGTTGGATCAGGAGCTAGAAATGA AACTTTTTCCAACCCAGAGACCCTCTAACTAGAGTTAACTATCAAGGACT GTCCTTTATCAATCTATATAGCAACAATCGAGGGACAGGACAGGACTCCC ATTATAAGATAAGAAATCTCAAAGTAAGAAAGAAATGAAATGCATATATT ATTTCTGGAAAAAAAATGTTTCTTCAGAAAAAATACATATTTTGAATATG AAACATTCAAAAACTTTAATGAATCACTAAAGATAAATCCACGTTATGGA AACAAGAATAGCCATCCAATATTATTGGTTGAAGCCTCAATGCTGCATAC ATAGAGTTTTGTCATGTTAATGAGTCGCAACTCAAAGTGTACCAAATAAA TGACAGTTACGTTGGTTGCAATGCATTATCAACAGACTGAAAATGTTCAT AAAAGTCATGTAAAACTCATTTTGGAGAAAATCTACTTTCAGGGTCCATA TATGAACTCTCCTATCCATCAGTGAGAGACATAAAATTGAATCATATGAA CAAATTTGTATTCAACCATACAGGAGGTACGGGATATGACTTTAAGGTTT TAACCTGAAATCCTTTAACTATCCATCTACTAAACAGGAATGTAGCAACA GTTCTGGAGCAAGTTATTCTCGTGAACATTACAACACTACTCAGTGATTA TACTACTCAGTGATTGGTGGTAGCTAAGTGTTCGACCCACTCAATTATCT GGGTTTAGAGCTAATAGTATCTTGTCTAGTGCATCTGCTTTGTTCTTCCT TTGTTCCCGTCAAAGTTAATATGGATATTTCTTTCAGCTGTAATGGTTGG TACAAGGTATCCTCTTCACCTACAAATAATCAAAGAAGCTTTATGTACAG TACATCTAATCACATGACTGAATAAAACTCAGTGATTCTCATCTCATGGT ATTGATGTTGATAGTAAACAATCCACCTATCCCATGGACATGTATGTGTG AAAAATAAAGCTTCAAGCCGCATCTTGAGATATAATAAATAATTTAGTAA TCCTCAGTCTATTGAAGGTGCAAAAATAAATTCATATGTGAAACTTGCAA CATTCTGTTAGTTGGAAGATCGTTATCGAACACTGGTATAATCAGAAGCA GTATTCACTGGGTCTTAGAATGCCTAGAAAAAATATGTGAAAAACAACAT TAAAATCAAAAGTTAATGTTGGTAACCTTGCCAAAAAATATGGAAGGGAA AGAATCTTTTTTGTGTATTAAGTTCAAATCATCTGCAATGGCAGACAATT GAAGGGTAATTTAAATGAATGTTCATATCACCCCCATGCAATGAGAAAGA GTTATTTGACATCGACAGAAGCAATAAATGTCAAATAACGTCAACCGAAG GAGAAAGAAATCCTTGAACAAGTACTGAGTATTGCAAATAGTATTTCTCG ACTCAATTCTTATCAAGAAAGGAAGAGGTAATTTTTAACCAATCTACCGG GCCATAGGTAACCCAAATTTTAAGGATTTGGACAGAAACTGCAATAAACA GATATCTACAGTGCCAGATTAACACTTAAGGATGGTATTTAAACCATATC ATATGTATTGAATCCGGTCCCTTTATATTTTATAACAGAAAAGGATTGTA TCAGTAAATTTTTACACCCCATCTTGATTTTTACACCCCAACAATTTGAT ATGGAAGAAAATTAATTTTAATTTATATAAAAAGAAATTCAAGATTGGGA ATTTTTATGTAAAATCTCTGTCAGGTAATTACTGCAAGATCTTCAACTTA ATTCAACTAATATAGAAATTTTTTATTGTATTGTTCCTCTCTGTCACATA TTGACAGCAAGGTAAAAGAAATTCAACTAGTTTGACATTTTACTGTATCA TCCTCATCATGTAATGACAGTGAGGCTCCTAATAATGATACAAATGGTAC AAGACATTCAACTAATTTGAAATATTGTACTGCAACAGCCATCCCTCTCT GTCATATTGACATCAGGGTCTTTATCATGATAGTATAAATTAAAACTGAT ACAGTACTGGATATTCTTGATTTGTTCCTCTCTCACTCAATATGACAACA AAGGTCCTTCATAATGGTAAAAGAAATTCAACTCTCAGAAAACAGAATCG TATCAGCTCTCTCTGTCACTTAACGACAGCAAGTTAATCTATAATGATGA AGAGTTTAAACTATGAACTGATCAAAAGTACTTCTCAATATTCCTCTCCC TGTCACGTAATGGCAACAAGGTTTTTATAAGTAGTAAAATGAAAACCACT AGTCTGAAATGCTATTGTATCAGCCCTCTCTTTCTTTGTCTTGTGATGAC AGCAAAGTTCTTTACGATTATATACTATATAGAATCTCTCTGTCACGTAA TGGCAGCAAAGTTCTTTATGATGATATACTATATAGAATCTCTGTCACAT AATGACAGCAAAGTTCTTTATGATGATATGCTATATAGAATCTCTCTGTC ATGTAATGACAGCAAAGTTCTTTATGATTGTATACTATATAGAATCTCTC TGTCACGTAATGGCAGCAAAGTTCTTTATGAATATATATACAATATAGAA TCTCTGTCACATAACGACAGCAAAGTTCTTTATGATTATATACTATATAG AATCTCTCTGTCACGTAATGGCAGCAAAGTTCTTTATGATGATATACTAT ATAGAATCTCTGTCACATAATGACAGCAAAGTTCTTTATGATGATATGCT ATATAGAATCTCTCTGTCACGTAATGGCAGCAAAGTTCTTTATGAATATA TATACAATATAGAATCTCTCTGTCACGTCATGAAAACAAAGTTCTTTATG ATGATATACTATATAGAATCTCTCTGTCACGTAATGACAGCAAAGTTCTT TATGATGATATACTATATAGAATCTCTCTGTCACGTAATGACAGCAAAGT TCTTTATGATGATATACTATATAGAATCTCTCTGTCACGTAATGACAGCA AAGTTCTTTATGATGATATACTATATAATGAATTCCACTAAATGGAAATA CTATTGTATCAGCCCTCTCTCTGTCACATAAATGACAGCAAGGTGTATCA GCCCCTCTCTGTCCCGTAATGGACAGAAAGTTTCTTGTAAAGCCTGTCTT GTGATAATCTAAGACTCTTCATGCTAATGTTCTCCTAACCCCATCTACAA ACTAGGTGAAGGGTGATTTACGACCACAATTAGTGCTAACTAAACCAATT TTTGAAACAAACAAATATTGCTTGGAGTTATGTTGCTCTATCTAGTATCC ACCGAAATATGGAACATTAATAAGCATTTAATCCCCTATCGAGTAACGAT AGAAAGAAAAGTCATTAAGCTCACTGCTTCAAATAGCATGATTCATACGA TAAATCTAGATTAAAAATCATAAACATTATTACTTACATTTGTTAGACAT CTTGTTTTTTATAGCGAGAAAGCGAAATGAGGTCGATGTGGGTTTGAGCT ATTGCTTTTATTTCTTAAAAGTCATAGCGGATTTCCAGTATTTATCTGGC GGAGATTTTATCGTCATAAAATTTAAAACTGTTTTTGAGGTTGACCTGTT CTGATCAGAGAGAGTTTCCTCATTTTCAAACATTTTAAAATTTGTTTTCC TACAAACCAAGAGAAACAGTTTTTAACCTAAATCCAGCTAAATCAAGGAT CAAATTAAATGATCAAAATAAAAATTTCTGGCCATTTAATCAAATAAAAG GATCTTATAAGCAATTTGTATCAAAAAAATCTTTTTAACTCCTATAATGA AGGTTTAGATTAAAAAGATATTTTACATACTATATACATCCCCTTAAGAA AGCTCAGTTTCCCTGCTTTGTTTAACATATAGAATTGAATGAACTGCAAT CATGGTCAAAATAATTGAGAATCCCGGATCAAGATTTAAAGTTCCGGCGA GAAAGTTGATTTTGGGCTTCCTTTCTCTTTAATTTAATCAAAGTTTTCAA TTTGGGATGGGTTGGCAGACTTCTAGGCTATATTCTGAGCCTTATTGGAC TGTTTTTGAAGGTCCTAAGTCTAGCGTTAAAACTCTATCCTTCAAACCTA CTTTAGAGCACTTACAAATCGGTTGTGGTTTCAAAACTTCCTGGGGAATT TCCCTTTTTTCTCAAATATTATTTTTACCTTGATTGTGCTCTATCAAAAA TGTTGCTCAAATCGAACATCAGCGTTCTTTTGTGTTGAAATAGTCGGCTA ATAGTAATAAAAACCTTTCTTTTTGAAAGCCATTGGATGTTGATATTCAA TTAATTGGTGTACCTTAAGTGGATAAATTTTCGCGTGTACTAATTTTTGC GAGGTGAGAATTTAAAGATTTCGCGTGGATTAAATTTTGCGAAAATGGCC TTCTTTATTTAATTTCGCGACTATACAAATTGTAACTAGAAAAGAGATGT GTGTTTTTAATCAAACAAAGACAGACAAAGTCACTCAAAAGCTTTCAAAA AACTTCAAAGAAAGTACTTTTAGGAGGTTACTAGAGTTTAAAATTGAAAT GATTTCTTTCTTTCATTTCGCGAATTTTTTTTTTCGCGATTGTAAAATTC CAAATAATTTCTTGTGGTCTAATTTTCGCAAATCAATGGCCTTCAAAATT TCTGCGTGGACTAAATTTCGCGAAAATGTCCAAAATTCGCGAAAACCGCT TTTATACGAACCCCTTTTATATGATTTTGCATGGCTTGTTTTAAATAATG TCTATATATTTCCAATTAGGTTTTACCATCCAGCCACAGGACAGAATCAT TATTTTGGGAACAAGAAATGTGTCCATTCCATGCAATGCTACAAGCAATT CAACAAGTGGAACAGTTATTATTCTTTGGAAGCATAACCAAACAACGATA ACCGATTATACCAATAAACATTTTATGAAAGACCAAAATGGGTCTATCGT TTTTGAGCAATTTCTACAAAGAGATGTTGGTACATATCAATGTGTTGCTA TTCTTTACCGTGAAAATATTAAACAAAAGCAAATAGAAAGCCGCTTAGCA AGAATTCAAGCTGCT

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000366_pilon:161026..170390-

>XLOC_014250 ID=XLOC_014250|Name=XLOC_014250|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=726bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000366_pilon:161026..170390- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGCTACTAATTGTGTTATTTATTTCCTTTCTTACTGAAGAGACACTGGC
CCAACAAGGAATACTGGATGCTACTAATTGTGTTATTTATTTCCTTTCTT
ACTGAAGAGACACTGGCCCAACAAGGAATACTGGGTTTTACCATCCAGCC
ACAGGACAGAATCATTATTTTGGGAACAAGAAATGTGTCCATTCCATGCA
ATGCTACAAGCAATTCAACAAGTGGAACAGTTATTATTCTTTGGAAGCAT
AACCAAACAACGATAACCGATTATACCAATAAACATTTTATGAAAGACCA
AAATGGGTCTATCGTTTTTGAGCAATTTCTACAAAGAGATGTTGGTACAT
ATCAATGTGTTGCTATTCTTTACCGTGAAAATATTAAACAAAAGCAAATA
GAAAGCCGCTTAGCAAGAATTCAAGCTGCTGTTTTACCATCCAGCCACAG
GACAGAATCATTATTTTGGGAACAAGAAATGTGTCCATTCCATGCAATGC
TACAAGCAATTCAACAAGTGGAACAGTTATTATTCTTTGGAAGCATAACC
AAACAACGATAACCGATTATACCAATAAACATTTTATGAAAGACCAAAAT
GGGTCTATCGTTTTTGAGCAATTTCTACAAAGAGATGTTGGTACATATCA
ATGTGTTGCTATTCTTTACCGTGAAAATATTAAACAAAAGCAAATAGAAA
GCCGCTTAGCAAGAATTCAAGCTGCT
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_014250XLOC_014250-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000366_pilongenomesc0000366_pilon:161026..170390 -
Properties
Property NameValue
Aaloc70-363:295
Aaloc1-66:9366