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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000240_pilon:35054..51246+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_014220 ID=XLOC_014220|Name=XLOC_014220|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=16193bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000240_pilon:35054..51246+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) AGATATGTGGAGTATTGGCGAGAGAGATTCACGACAACAAAAGATTTGAC
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CGGAATTCCAAAAAGGGTTTCGCAAGCTCAATTTAAACGTCTATACAACA
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ATTATCTTGTGGCAGCAAATTCATCCTCCTCCAAGAAACCATAGGCCGTC
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AATTATTTCTGACTGGTCTTGTTGATTTGTTCTATTTTCTGGTGTAGTCA
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GATCCCTTAAAAGTCATTTGACTTGAGGAATTTCACATTAAACAGGGTAA
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GGGTTTTAGTACACGCCGGTGATTTCATTGACATGATGAAAAGCAAGTTA
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ttttttgtttgtcACCTTTTAAccaatatttcaattctaagttattatat
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CGAATTTTGCCTGTGTCGCCTAAAGCCTTTTCTAGAATATCAACCCCTAT
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TTTATACCCTTTGTGCcatacccagctgacacacttGGGTTCATGTATCC
TAATGATGATATCTGTGCTAATCTGGAATCTAATTCTGGATTTTGTCCAT
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GATGTGAAATCGAAAttaggtaaaaaattattttttttcatttcaaagaa
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tggtggttGTTCACAAGACAACTTCATTGTAATATACAAATGAAAAAacg
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ACGATGTTCGTTAGCTTTGAGCAAGATAAAATCTGCCAATAACTGAGGGC
AATATGGCCTAGATTTATCTGCAAGGGGTTAGAAATTACTTTAgcttagg
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tttactttcgcgaaagggccaaaattcgcgaaagtctCTGCTTGCGAAAA
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TTTTGTCTAAGCAAACCCAGACACCAGTCGACAACAGTTTTGTATTCGAA
AAGCCTTCTCTCGACAACGAAAAAGAATCATTTCTTCCCTCTAGGTTTAC
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ACAATATCATCTTGCCGATGAAAATCATTTTGGACTACCGGACGATCGAA
GTGTTTGGGATCAACCAGGGTTAGTATTATTCATTTTCATCGTTCCTTTT
CATATTTCACAAGATTTGATGTTccatttcagaaaaaaatacaccAGTCA
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GATCAAAGAAATGATTATCGGTATGATGATCAGAAAGTTTAAAAGAATTA
TTCAAGAAACGCCAAGATAAATCTActagaaatattaaaaaagtcGTATG
TAATCTTACTAAAGTTATGTCAAATTTTTCCTACTTGCACAAGTAAATGT
GGGAAACTAAAAGTGTTACTTTCTAATCCTGCCACAATCACTTTTCTTGA
ATTCattactttcacaaaaatattcatttttggGTTTAAAAATATACGGA
AGAAATAAGTGTAAATCCCAGTAAACTTAACGATGTCCAGATATTGCGAA
CGGCCTTCTCTGGCAGTTTGTTTTGCTTCTTTTGTTCAGTTATTTCTTCT
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TCTCAACGTTTGACGATGACAAGTTTGTCTTACTTCTTTTGTTTAGTTAT
TTCTTCTCGACGTTTGACGATGACAGTTTGCTTTGCTTCTTTTGTTTAGT
TATTTCTTCTCAACGTTTGACGATGACAGTTTGCTTTGCTTCTTTTGTTC
AGTTATTTCTTCTCAACGTTTGACGATGACAGTTTGCTTTGCTTCTTTTC
TTTAGTTATTTCTTCTCAACGTTTGACGTTGACGGTTTGCTTTGCTTCTT
TTGTTTAGTTATTTCTTCTCAACGTTTGACGATGACAGTTTGCTTTGCTT
CTTTTGTTCAGTTATTTCTTCTCAACGTTTGACGATGACAAGTTTGTCTT
ACTTCTTTTGTTTAGTTATTTCTTCTCGACGTTTGACGATGACAGTTTGC
TTTGCTTCTTTTGTTTAGTTATTTCTTCTCAACGTTTGACGATGACAGTT
TGCTTTGCTTCTTTTGTTCAGTTATTTCTTCTCAACGTTTGACGATGACA
GTTTGCTTTGCTTGTTTTGTTTAGTTATTTCTTCTCAACGTTTGATGATG
ACGGTTTGCTTTGCTTGTTTTGTTTAGTTATTTCTTCTCAACGTTTGATG
ATGACGGTTTGCTTTGCTTGTTTTGTTTAGTTATTTCTTCTCAACGTTTG
ACGATGACAGTTTGCTTTGCTTCTTTTGTTTAGTTATTTCTTCTCAACGT
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CGTTTGACGATGACAGTTTGCTTTGCTTCTTTTCTTTAGTCATTCTTCTC
AACGTTTGATGATGACGGTTTGCTTTGCTTGTTTTGTTTAGTTATTTCTT
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ATTTCTTCTCAACGTTTGACGATGACAGTTTGCTTTGCTTCTTTTCTTTA
GTTATTTCTTCTCAACGTTTGATGATGACGGTTTGCTTTGCTTGTTTTGT
TTAGTTATTTCTTCTCAACGTTTGATGATGACGGTTTGCTTTGCTTGTTT
TGTTTAGTTATTTCTTCTCAACGTTTGACGTTGACAGTTTGCTTTGCTTC
TTTTGTTTAGTTATTTCTTCTCAACGTTTGACGATGACAGTTTGCTTTGC
TTCTTTTGTTCAGTTATTTCTTCTCAACGTTTGACGATGACAGTTTGCTT
TGCTTCTTTTCTTTAGTTATTTCTTCTCAACGTTTGATGATGACGGTTTG
CTTGGCTTGTTTTGTTTAGTTATTTCTTCTCAACGTTTGACGATGGCAAG
TTTGCTTTGCTTCTTTTGTTTAGTTATTTCTTCTCAACGTTTGACGATGA
CAAGTTTGTCTTACTTCTTTTGTTTAGTTATTTCTTCTCAACGTTTGACG
ATGGCAAGTTTGCTTTGCTTCTTTTGTTCAGTTATTTCTTCTCAACGTTT
GACGATGACAAGTTTGCTTTGCTTCTTTTGTTTAGTTATTTCTTCTCAAC
GTTTGACGATGACAAGTTTGCTTTGCTTCTTTTGTTTAGTTATTTCTTCT
CAACGTTTGACGATGACAGTTTGCTTTGCTTCTTGGAAGACGAAGACGAT
GATGAGGAAGAAtatgatgaagatgaaaattacGTGGAAGacgaaaatca
aaacatcaccAAAAGCCCGAAACCATATTCACATGAAACGTGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000240_pilon:35054..51246+ >XLOC_014220 ID=XLOC_014220|Name=XLOC_014220|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2154bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000240_pilon:35054..51246+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) AGATATGTGGAGTATTGGCGAGAGAGATTCACGACAACAAAAGATTTGAC TGAATATTGTGTTGTTGTTAATACCAACACCAAGGAAGAAGATCTAGAGA TATGTGGAGTATTGGCGAGAGAGATTCACGACAACAAAAGATTTGACTGA ATATTGTGTTGTTGTTAATACCAACACCAAGGAAGAAGATCTAGgaccga aagaaaaatactttttattgACCAATTATTTACCTGAAGACCTTGAAATT CGACAGAagctttcaaatgaaaaattggaccgaaagaaaaatacttttta ttgACCAATTATTTACCTGAAGACCTTGAAATTCGACAGAagctttcaaa tgaaaaattgGTGAATATTTTGGACCAGCAACATTTGGAACGACAAGACA GCAAGTTCTCCAAGAAGTGTCTTTTTTGTAAAGTCATGTTTCATGGAAAC AGGTGAATATTTTGGACCAGCAACATTTGGAACGACAAGACAGCAAGTTC TCCAAGAAGTGTCTTTTTTGTAAAGTCATGTTTCATGGAAACAGGTCGAA ACTTTTCCAGCATATGGCTAAAGACCACGCCTTCAATGTTGGAAATCCTG ATAATATTGGTCGAAACTTTTCCAGCATATGGCTAAAGACCACGCCTTCA ATGTTGGAAATCCTGATAATATTGTACACGCCGGTGATTTCATTGACATG ATGAAAAGCAAGTTAGATAATACACGCCGGTGATTTCATTGACATGATGA AAAGCAAGTTAGATAAGTTCACTTGCCTGTTTTGCGAGAAGGAGTTTAAA GAGTGGAGCATTTTGAAAGATCACATGCGCAAGAAGGGACACAAACGTTT AGATCCTAAAAACAAAGAATACGATAAATACTACGTCATCAATTATCTGG TTCACTTGCCTGTTTTGCGAGAAGGAGTTTAAAGAGTGGAGCATTTTGAA AGATCACATGCGCAAGAAGGGACACAAACGTTTAGATCCTAAAAACAAAG AATACGATAAATACTACGTCATCAATTATCTGGAACCCGGAAAAGACTGG AAAGCGCTTCAGACGGAACCGGAATACGAAAAAGAAGCGGAAATACCTGT TGCAGAAGAAAATATGGAAAAGAACCCGGAAAAGACTGGAAAGCGCTTCA GACGGAACCGGAATACGAAAAAGAAGCGGAAATACCTGTTGCAGAAGAAA ATATGGAAAAAGAATGGGAGGACTGGATCGAGGATGACCCAACTCTTTCC CTTTGTCTCTTTTGTATGAAGACTGACAAAGACGTTTACAAAATCCTCGA TCACATGAAgAGAATGGGAGGACTGGATCGAGGATGACCCAACTCTTTCC CTTTGTCTCTTTTGTATGAAGACTGACAAAGACGTTTACAAAATCCTCGA TCACATGAAgGGTGAACATAAATTCGATTTGAAAGATGTGAAATCGAAAt tagGGTGAACATAAATTCGATTTGAAAGATGTGAAATCGAAAttagaact gGATTTTTATCATCAAGTCAAGATAGTCAATTACGTGCGTAAGCAGaact gGATTTTTATCATCAAGTCAAGATAGTCAATTACGTGCGTAAGCAGGTTT ACCAGTGTAGATGTCCGATGTGTTTGCGAGAGTACGATGGGCAAGACGAA TTACAATATCATCTTGCCGATGAAAATCATTTTGGACTACCGGACGATCG AAGTGTTTGGGATCAACCAGGGTTTACCAGTGTAGATGTCCGATGTGTTT GCGAGAGTACGATGGGCAAGACGAATTACAATATCATCTTGCCGATGAAA ATCATTTTGGACTACCGGACGATCGAAGTGTTTGGGATCAACCAGGTTAT TTCTTCTCAACGTTTGACGATGACAGTTTGCTTTGCTTCTTGGAAGACGA AGACGATGATGAGGAAGAAtatgatgaagatgaaaattacGTGGAAGacg aaaatcaaaacatcaccAAAAGCCCGAAACCATATTCACATGAAACGTGA TTATTTCTTCTCAACGTTTGACGATGACAGTTTGCTTTGCTTCTTGGAAG ACGAAGACGATGATGAGGAAGAAtatgatgaagatgaaaattacGTGGAA GacgaaaatcaaaacatcaccAAAAGCCCGAAACCATATTCACATGAAAC GTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000240_pilon | genome | sc0000240_pilon:35054..51246 + |
Properties
| Property Name | Value |
| Aaloc | 1159-1311:16041 |
| Aaloc | 1033-1155:13795 |
| Aaloc | 985-1032:13076 |
| Aaloc | 940-981:12877 |
| Aaloc | 841-939:8188 |
| Aaloc | 751-837:7983 |
| Aaloc | 619-750:7544 |
| Aaloc | 574-615:6812 |
| Aaloc | 508-570:3377 |
| Aaloc | 415-504:2865 |
| Aaloc | 334-414:199 |
| Aaloc | 235-330:1 |
|