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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000142_pilon:570323..574452+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_014138 ID=XLOC_014138|Name=XLOC_014138|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=4130bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000142_pilon:570323..574452+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAGAGTCAACATCAATTTATATTTGATTCTTGTATCTTATTTCATTAT
TATAAATTCCATAAATTGCAAGAGGAAAGATTGTCCTTTGCTTGGTACAC
AGCTGGTTAATACGTCACATGGTATAAAACAACCTGTTTGCAAGTGCAAA
CATAACAAGAGGAGTCATCACCATAACTATTTCTACTGCAGAGATACCAG
GAAAGGTCCAAAGGTTTATATCcttaaaggtatttttatacggaaacact
cGGAAAAATTCCAGACTTTTTATTTGACTGACTTACCCTTTAACGACTGC
GTAAATTACCGCGGCTTTTTTAAGAGCCGTGCCAAAAAGActgaatgggc
tcttccagaaaaaatccgttcatggggggggtggaggatgaattgtcaag
gggtattgaaaaaattgcaatgtccagggggtaaattccaatgtccaggg
gtaattttttgtgtccacggggttgatttggtgtttgtccaggggtataa
cccgtgtccagggggttaaaaatcaaaacgtccaggggtaattcatgaaa
taaataatatatcctccacccccccatgaacggattttttctggaagagc
ccaatgataGAATAACGCGTCAgaaaacacccctttctcacagacccgat
tGGACCTTTTCCCATTAGTCATAATATCTTCCCCAGTGGAAAATATTCAT
CAGTTTTTGTCATCGCTGAAAAGGTTCAAATAAACAAAGCCTCAATTCCA
AATAATTCTCCATCACCGTTGatttttctgacttaaaaacagtGGAATTC
AATCCCCAATCCATGGAAAACACATGGTGCCTAACCCGAGAGTCGTCTCC
CCTATTACCACGagcatggttgaaatatattgagaattttggttatttca
acgtttttcaagatttaaagttccggcgagaaagtcgattttgggctatc
tctttatatcgaatatttcaatttgggaggggttggcatagacttccagg
ctatattctgagccttattggactatttttgtcttaagtcttaagtctca
tgttgaaactcagagttaaaactctacccttccaacctactttagagcac
ttacaaatcgattgtggtttcaaaacttcccggtggattacCTTGATTGC
ATTGATCaacctttatttttcttaacaGGTCGTTGGTGGAACGAATCTCT
CGGTAGCAAAACACTTCCATGCCCCTTCGGCTATTGTCGAAATGACTCTA
CAAAAGGAGAAAGCGATTACCGCCTGTTAGATGTTAACAACCAATGTGCC
GAAGGTCGAGAAGGCAGACTTTGTAGTCAGTGTAAAAAGGGACTTAGTGT
TATGTTCTTGAGTGAAGATTGTGAAAAATGCACCAATTATTTCATCCTTA
TCATCCCAGGATTTTTAATCTTGCTTTCTTTGCTCATTCTGGTCATCATA
TATTTCAACGTAAACGCATTTTCAGGATATTTTAACGCGTGTTTATATTC
ATATCAAGTAATGGGAGTTTTTATACCCAAGTACGTAGTTCTAAAGCTAG
ATAAAGTCACTCTTTTTATCTTATTCGGACCTGGTTTACAAGGAACTGGT
GGTaatattaaattttgtttattcGACGGTATGGACAATTTGGATAAGAT
TGGATTGGTGTATCTTTTTCCTGTATGGATGATTTTATTTACTGTTTTCA
TTAATTACCTACCCGACAGCTTCTGGAAACGTATTACCAAGCGGCAAACA
TTTGGACATCGGAATACGTCGATTTGCCGTGCCTTGAGTTTTATTGCCGT
TCTCTGTTACTCTCTTATAACAACGGTTACTTTAGATTTACTTGATCGAG
TGacagttgaaaataataaagatTTCGTATATCGTGCAGCATTTGTTGAA
TATTTGCATGGAAGCAAGCATATGGGATTATTTGCTTTTGCATTAGTTAT
TGGCTTTGTTTTTGTGGTAGGATTCCCCGTCCTGCTTCTGGTCACGCCGT
TCGTGGAGAACTGTTTTTCACGTCATATGAAAGTACGTCTACAACCTACG
TTGGACATTTTAAAATTCTGCTTTAAACGTAAAATGATGGTGTTCTCTGC
TTTCTATTTTATTTGTCGACTCAGCATTCTTTTGATAACTGTTTCTGTGA
AAAATGATATGCCGAAAGCATTTTTATTGGCAATGGTATCGTGtttattt
ttggtcatttttgctATATGCAAACCGTATCATAGATGGAATTTTAACTT
TTGGGATTTAATACAACTTGGGAATATCTGCTTAATCAGCATTATTGGTT
TGTTACTTCAAGTTCAATCTGCCATGAGGAGAGAGCTTCGTAACCGCTCC
ATAGTTTTGTTGACGGTTTTGATTTATGTTCCGTTGGCAATCGCATTTTC
AAGGATTATATCGTTTATGgttgtgaaaaaaatgaaagacaatACGTGGT
GTTGTAAGTGAAACAAAGCTTCTGttttttttGCCAGTTAatggccggtc
tccacttgcgcgcgctgcgatcgctcTTTTTGGCTttaatcctttttgct
tggaaacaaagattacgtcataaaaatgtagcgcgcgctcgaaaaaaaag
ttgaacacgtTTCAACtattttcaaccgttacgtcagatcgcgccaatgg
agttgcttcatttttcttttgaccaatagcgtgaaagctttgctcgaaaa
agtgcgatcgaagcgcgcgcaagtggagaccggccttaagtccTTAAGTA
AGAGGTAAAGAAATGGCGTGTTTTGCGTTAAAAGCGCGTACACTAAAAAC
TTCTTTGCCATTTTTATATTGTTCCTTAAGCACGCTGTTTTATCTTTTTA
cacttatttcaatttttttaaagaacacgGCAAGGGGCTCAAGTTTTTAC
CAAGACATAATATGAGgtgcaaattttttcaaaattttgaaaaactaact
TACTTCAAGAAAAGCTtgcatcttcattttttttcgctTTCCCTTTGATT
TTAGGTTATCAAAAATGGAATAATTTGCGAAAAGATGCTTTGTTTGGAAA
TGAAGGTACCTTTTGTTTTCTAATCATTTTTTCTGATATCTACCGAGTTA
TAAAGTTACCGCTCTATATAAAATAGGTAATATTCAGTCAAATTTTCAAC
CccgggggtactacccttgtcgaccgactgGGGTTTTCCGCTGGGGCTCA
TAAAATAGACGCTACGTGGGATTCATATTTTAAGTGTTCTCAATTATCAC
AAAATGTTTCCTAATCTCCCCGAAAAGGTACCTTATGAGTAGCCGATTTT
GCGACCCTAGGGACTTGAAGAGGTGAAAAAAGACCCAGATCAGCCGACTG
GCCTGacctttttgcccaagtacccaCCCCGGGATTTAGTCTAATTCCTA
CCCTGTCactgaagtttttttttcacctaACAACCCTTAAAGCTTGAAGG
GAGTAGTTTAGAAAGAGGAGTGACATCAAAATTATTTGGCCATCAGAATA
TCAATTCCagacattttgacgtcaattcttcGTGGTAAACTTTTCAAAGA
CCAGTCCCATTGCGCTTTAAtggtaggctgctggcatccactaatggatt
cgtgctccttatagtcCTATACTACCTggagttttgtagaggtctgcgat
tcagactactttAATGGTTGATAGATGTTGAGACtgacacacccccttct
cacagacccactgggacctctttccactggaaattggccaaaatatctga
aaatatcgtccccagtgggaaattAAACTCTCATTTTTGTccccgttgaa
aataatcagatAagcaaatcctcactgcaaatcATTATGCTATTTCttac
catccccactgaattttttgcctcgaaaacaatcaaatataaATCCCCAT
TTTAATCCctatcgagttttggtccgttatttttaccaccACTGGCTGAC
AAAATCCCACcggggtctatgagaaggggtgtaCTTATTCCTTTGTGGAT
GAATTGTACTATCCATTTAATATTTTTAGGTGCGAACATTGGACATCCAG
TACCACAGCGAGTGAGGGATTCTAACGAAAATGAAACATTTCAAAACTCT
CTTCTGAGattgggtcattccattttataa Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000142_pilon:570323..574452+ >XLOC_014138 ID=XLOC_014138|Name=XLOC_014138|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3312bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000142_pilon:570323..574452+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAGAGTCAACATCAATTTATATTTGATTCTTGTATCTTATTTCATTAT
TATAAATTCCATAAATTGCAAGAGGAAAGATTGTCCTTTGCTTGGTACAC
AGCTGGTTAATACGTCACATGGTATAAAACAACCTGTTTGCAAGTGCAAA
CATAACAAGAGGAGTCATCACCATAACTATTTCTACTGCAGAGATACCAG
GAAAGGTCCAAAGGTTTATATCcttaaagATGAGAGTCAACATCAATTTA
TATTTGATTCTTGTATCTTATTTCATTATTATAAATTCCATAAATTGCAA
GAGGAAAGATTGTCCTTTGCTTGGTACACAGCTGGTTAATACGTCACATG
GTATAAAACAACCTGTTTGCAAGTGCAAACATAACAAGAGGAGTCATCAC
CATAACTATTTCTACTGCAGAGATACCAGGAAAGGTCCAAAGGTTTATAT
CcttaaagGTCGTTGGTGGAACGAATCTCTCGGTAGCAAAACACTTCCAT
GCCCCTTCGGCTATTGTCGAAATGACTCTACAAAAGGAGAAAGCGATTAC
CGCCTGTTAGATGTTAACAACCAATGTGCCGAAGGTCGAGAAGGCAGACT
TTGTAGTCAGTGTAAAAAGGGACTTAGTGTTATGTTCTTGAGTGAAGATT
GTGAAAAATGCACCAATTATTTCATCCTTATCATCCCAGGATTTTTAATC
TTGCTTTCTTTGCTCATTCTGGTCATCATATATTTCAACGTAAACGCATT
TTCAGGATATTTTAACGCGTGTTTATATTCATATCAAGTAATGGGAGTTT
TTATACCCAAGTACGTAGTTCTAAAGCTAGATAAAGTCACTCTTTTTATC
TTATTCGGACCTGGTTTACAAGGAACTGGTGGTaatattaaattttgttt
attcGACGGTATGGACAATTTGGATAAGATTGGATTGGTGTATCTTTTTC
CTGTATGGATGATTTTATTTACTGTTTTCATTAATTACCTACCCGACAGC
TTCTGGAAACGTATTACCAAGCGGCAAACATTTGGACATCGGAATACGTC
GATTTGCCGTGCCTTGAGTTTTATTGCCGTTCTCTGTTACTCTCTTATAA
CAACGGTTACTTTAGATTTACTTGATCGAGTGacagttgaaaataataaa
gatTTCGTATATCGTGCAGCATTTGTTGAATATTTGCATGGAAGCAAGCA
TATGGGATTATTTGCTTTTGCATTAGTTATTGGCTTTGTTTTTGTGGTAG
GATTCCCCGTCCTGCTTCTGGTCACGCCGTTCGTGGAGAACTGTTTTTCA
CGTCATATGAAAGTACGTCTACAACCTACGTTGGACATTTTAAAATTCTG
CTTTAAACGTAAAATGATGGTGTTCTCTGCTTTCTATTTTATTTGTCGAC
TCAGCATTCTTTTGATAACTGTTTCTGTGAAAAATGATATGCCGAAAGCA
TTTTTATTGGCAATGGTATCGTGtttatttttggtcatttttgctATATG
CAAACCGTATCATAGATGGAATTTTAACTTTTGGGATTTAATACAACTTG
GGAATATCTGCTTAATCAGCATTATTGGTTTGTTACTTCAAGTTCAATCT
GCCATGAGGAGAGAGCTTCGTAACCGCTCCATAGTTTTGTTGACGGTTTT
GATTTATGTTCCGTTGGCAATCGCATTTTCAAGGATTATATCGTTTATGg
ttgtgaaaaaaatgaaagacaatACGTGGTGTTGTCGTTGGTGGAACGAA
TCTCTCGGTAGCAAAACACTTCCATGCCCCTTCGGCTATTGTCGAAATGA
CTCTACAAAAGGAGAAAGCGATTACCGCCTGTTAGATGTTAACAACCAAT
GTGCCGAAGGTCGAGAAGGCAGACTTTGTAGTCAGTGTAAAAAGGGACTT
AGTGTTATGTTCTTGAGTGAAGATTGTGAAAAATGCACCAATTATTTCAT
CCTTATCATCCCAGGATTTTTAATCTTGCTTTCTTTGCTCATTCTGGTCA
TCATATATTTCAACGTAAACGCATTTTCAGGATATTTTAACGCGTGTTTA
TATTCATATCAAGTAATGGGAGTTTTTATACCCAAGTACGTAGTTCTAAA
GCTAGATAAAGTCACTCTTTTTATCTTATTCGGACCTGGTTTACAAGGAA
CTGGTGGTaatattaaattttgtttattcGACGGTATGGACAATTTGGAT
AAGATTGGATTGGTGTATCTTTTTCCTGTATGGATGATTTTATTTACTGT
TTTCATTAATTACCTACCCGACAGCTTCTGGAAACGTATTACCAAGCGGC
AAACATTTGGACATCGGAATACGTCGATTTGCCGTGCCTTGAGTTTTATT
GCCGTTCTCTGTTACTCTCTTATAACAACGGTTACTTTAGATTTACTTGA
TCGAGTGacagttgaaaataataaagatTTCGTATATCGTGCAGCATTTG
TTGAATATTTGCATGGAAGCAAGCATATGGGATTATTTGCTTTTGCATTA
GTTATTGGCTTTGTTTTTGTGGTAGGATTCCCCGTCCTGCTTCTGGTCAC
GCCGTTCGTGGAGAACTGTTTTTCACGTCATATGAAAGTACGTCTACAAC
CTACGTTGGACATTTTAAAATTCTGCTTTAAACGTAAAATGATGGTGTTC
TCTGCTTTCTATTTTATTTGTCGACTCAGCATTCTTTTGATAACTGTTTC
TGTGAAAAATGATATGCCGAAAGCATTTTTATTGGCAATGGTATCGTGtt
tatttttggtcatttttgctATATGCAAACCGTATCATAGATGGAATTTT
AACTTTTGGGATTTAATACAACTTGGGAATATCTGCTTAATCAGCATTAT
TGGTTTGTTACTTCAAGTTCAATCTGCCATGAGGAGAGAGCTTCGTAACC
GCTCCATAGTTTTGTTGACGGTTTTGATTTATGTTCCGTTGGCAATCGCA
TTTTCAAGGATTATATCGTTTATGgttgtgaaaaaaatgaaagacaatAC
GTGGTGTTGTTATCAAAAATGGAATAATTTGCGAAAAGATGCTTTGTTTG
GAAATGAAGGTTATCAAAAATGGAATAATTTGCGAAAAGATGCTTTGTTT
GGAAATGAAGGTGCGAACATTGGACATCCAGTACCACAGCGAGTGAGGGA
TTCTAACGAAAATGAAACATTTCAAAACTCTCTTCTGAGattgggtcatt
ccattttataaGTGCGAACATTGGACATCCAGTACCACAGCGAGTGAGGG
ATTCTAACGAAAATGAAACATTTCAAAACTCTCTTCTGAGattgggtcat
tccattttataa
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000142_pilon | genome | sc0000142_pilon:570323..574452 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1558-1656:4032 |
| Aaloc | 1507-1554:3007 |
| Aaloc | 232-1503:1181 |
| Aaloc | 1-228:1 |
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