XLOC_013709 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_013709
Unique NameXLOC_013709
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000419_pilon:56808..69188-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_013709 ID=XLOC_013709|Name=XLOC_013709|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=12381bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000419_pilon:56808..69188- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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CCTGTTACCCCAGTGTTACCCCCTGTTACCCAGGTGTTACCCCCTGTTAC CCCATGTTACCACTTTTAGTAAAGTAAATAAAAAGGGATCCACAAAATGA TTATTAAAGATAATGTGTTCTGTTTTGCAAATAAAAAGAGGGTGAAAAAG GCTTAGTCGTAATAAGAGCACCTGTCTTCATAAAGGTAACCTGATAACAG AATAACAGCCGTGGAGTTTTCTTAACGCGACACGCTGAAGCTCCAAAGGT CGCTGAAAACTAACATCACATCACTATGAAAAACTTTCAGTCCACTTTTT GTCGTGCGCATTAATAACGTATCGTCGTGAATCATTGAAATTGAAATGGC CGCCCATAAAAAGTCAATGCCGGAAAATTGAAATACAAGCTAATTTATTT GGTTTTGTAATTGATTCGGTCGAGAGGAATCTTAATGATGTCTGTGAGGG GAGGGTACGTCAAATAATAGACGACACGTCAAAAAATCAAGGGCACGTCA AAAATAGAGGGCACGTCAAAAATAGAGGGCACGTCAAAATTTGAGGCCAC GTCAAAAATAGAGGGCACATCAAAAATAGAGGGCACTAAAAATTTCAGGG CACTTCAAAAATAGAGGGCACGTCAAAATTTGAGGGCACGTCAAAAATAG AAGGCACGTCAAAATTTCAGGGCACGTCAAAAATAGAGGGCACGTCAAAA TTTGAGGGCACGTCAAAAGATTTTTAAAGATAAATAGTTACTCTTTAAAT AAAATGCCGGGTTTTTATTTTGAAATGGTTTTTTATTGTTAAAATCAATG CTGAAAATCAGTAAAATTTCCAAAAATTGATGACGTCACAAATGAAGACG TTATCATTTAATAAAAGTTTTGTTAACAATTTCTTATTAGGGTTGTTAAT ATCTATCAGCTGTCAAAGTTTGATTTTAATTGGCTAAGTAGTTCAAAAGT TATGAGCGTTTGAAACTTTTGAGTTTCATTAGATTTTAGCTGGGTTTTAC GGTATATTTCACAATAAGTTCATAAAACATAAACTAGAGTGTCTACAATC ACAAAAATTCGTACACTTACTCCTTAATAAGATTTTTATAAAAGTCAGAA AGTTTCAAATCGTTTCAATTTTTTTTATGAGATATAAAGGAAATAACAGC GGTGTGGTAGATTCCATCCCCTAGGGGCTAATTAGGTTAAACTTGAAAAC TCTCTCAAACTCACAGGAAAAGATATTTTACAAAAATATGTTTCTACTTT TTTTCCCAAAACTTCTTTCAAAAGTTTCAGCATCAACAAAACAATCTTTT TCAGTCACTTGAAGGCAGATTTTTTTCATGGGCCCCAATATGTAGGTCAG CTATTTCTATGATTTCTCGAGATATATTTCAGATGGATACAAAATTTTGA CCATAGTCTGGAATTGTAATTTGAAAGGTCGTGAGTATAAGCTTGCTAGG TAAAATGCTCACAGTTAGACCGTCAGAATGCAGGTTTGTGGCCCCCAAAT TGTCGATTTATCTATAGTCCAGTGTTGTTAGAGTGAAAAACCATTGACAT GTGCTTGTTCTCTTATAGATATTCCACCTGACTGATGTAAAATTTGTTAA CTTTCATGAAGGATTTCTGGATTTTTGATAATGCAAATTCCAAACCGGAA AGGATAATGACTGTTTTGTTGAAATGACGCTTTTATTGAATTTTTGAAAA ACATTTTAGTGCTACTCTTGTGTGCTCAATTGTAGGGGGATCATTTTCTA ATTTTTGGGAAAATAATCACCCCAATATCATTTTGTAATGACTCCCGTAT TATGAAATTTTCCTGAAAAAGTGCCAAAACCTTCATTTTCCTAGCTGTTT TGGATGACTCCCCCATTTTATGATTTTTCTTCCGGAGTATCTCCCCCCCC 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TTGGTATACTGATCGCTCAACTAAACACGATCCGTTCAGGGGACAGTTGG TTTTTACCCTGCAGTTACACATTTGGTTGTCTATGTTCTCGTTTGCTTCG TTTTTCAGGATGTTTTTATTGTGACTCTGTATGATGTTCTTCATATTTTT GGTGCAACTATAGCTGACTTTGACAGTGTTATGGTTGAATATTTTGTTGA GTCTGTGTTGTTTTGGAAAGTGCTCATCTATGAGTTGCAGAAACCTTCGT GGAACTTTCGTTTTGACGTTCTGGTTGTACGGGGGGTTGAACCAAGTGAT TTTACGCTTACGGTTATTTTTACGATTGTTATTTGCGAAGGTAGGATTGT AGGATAGCTGGATGTTTTAACCACTATCTTTCAGTGCCTTTGCATACGGC TTTTTTGCTTGGTTGAATATGTGCTCGTTCGATGAATGGTTAGACAGTCT TTGTTCGATAGTTTTCGGAATTTGCTTGATCACGTTCGGTGGATGGTTTG ACTGTTTGTTAATGTTTTGAATCTTGTTGTCTGGTTTTGAGTACGGCTTG AAAGTTCCGTCATTCAAATTGAACGTAACTTCCAGGTAGTTAAAAACTTT CTTGTTGCATTCAATCACAATTTCCAGTCCGTCCCGTATTCACGGAACTT CGACTGCAGATCCTTTTTGATCCGTTCGGATTTGTTGCCATTAACATTTC TGAAAACTGAAAGACTATCGTCACGATAGATTCCCAAGTTCTTAATGTCG TACGTTTCACTTGATTTATGCTGTAGGTAGATTCCAACTAGCTCACAAAC TTCAGCGCCGTCGAACGCACCCATGGTTACGTCAAACAGGTTACCATTTT TCTTCATCCAAGCGGAGTCGTCGCTGAAACAAAGAGATTTTCGTGCATGG TTGATAATTCTAACGTCTTTTGCTGACAGAGTAGTGATGGTTTTAGCGAA TTCGATAGCGTTGGATAGAAGATTTTTAGAGATTGAAGGATAAGTCTTTC ATGTCAAACACTATGAATTTGTGGTTCTTTTTATCCAGTATTGCTTTGAA CCATTCGATAACCTCATCGGTGTTCTTCCATTGGTTTATGTTCTTTATGG GCTTTAACTTTGTTGTTGACCCTATCGAGGATCGATTTTGCGATACGGCC GATCTCGTTTTTGGCTGGATTTAATAAGCGTACCTTTGGATTGTTTTCGA AGCTATCCTTGTGATCTTTGAGGGTTACGAAAGCCTCGTTCTCGCCATTT ATAAGCATTCTGTCGAAAACTTTCATGTGTTTTACGATTTTTTTACCGGT CACAAAATTAAGTTTTTCAAAATCAACGGTACAGCTTCTTTCTGTTCATA TAAAGTTATAAATTGATGTTTTTGCTTCCAATGATGGTACATCAAAGAAA AGCCACTTTGAGTAGATCTATAAAAGATTTCAACGACCATTTAGGTCATT ACCGAGACGTTTTCTCTCCATCTGTATCTTTATTACCTTCATGAACAAAT GAGAATACAATTTTTTTATAGTTGATGTTCAAAACAGAGAAAATTTGGCT TTACATGGTAAAACAAAAGCATCAAGCAGCCGTCTCAGCTCACTTGCAGT TGATGGAGACAACCTGAACTGTGACATGGGCAACTTGGAAGGGCTAGATT CCGTTCATCCCGTATTTATTTCCAACGATTATTTCCGTGGTTATCCCAGG CCTGTGTATGAAAAAAGCCGTGGTTATCCCAGGCCTGTGTATGAAAAAGG CCGTGGATATCCCGGGCCCGTCTATGAAAAAGGCCGGATACCGCCAGACC ATTTGTCGCAACGGCCAGGAAGGCATCGTTATCCCGGGCCCGTCTATGAA AAAGGCCGGATACCGCCAGACCATTTGTCGCAACGGCCAGGAAGGCATCG 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000419_pilon:56808..69188-

>XLOC_013709 ID=XLOC_013709|Name=XLOC_013709|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=4740bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000419_pilon:56808..69188- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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ATGCCAAAAAAGAGCATACTTAGCTATTCGAAGCGAAAGAGCCAAATTTA
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AAGGAATTGGAAATGCAATTTCCTGCATTCCGAGATTATTCCTTTTTAAC
ATTACTCGTTTTGCGCTCAGTAAGGGACAGTTTCAAAAACGAAAGAGGCG
AATGGGACGAATACAACGCTTATTTGAAAAAAAGCATCACAGTGTCACAA
GAACTTATTAAATACGCTCACGAAGTCAACAACGCTATACTCAACTTTTA
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GCTGATGCTTTACCTCATGAATTGTGTGAATATCGATCAATCAATCGGCC
ACATGGTACATGGCATGATTTCAAAAAATGGCTTGGAATTAACGCAGAAG
ACATGCTGTACAGACACGAGGATATTTATTGGAAACAAACATTTAATCTT
GTTAAAAAATATTGGCAAGAGACTGTAATGTCTCAAGTTCAATTGTGGGA
GAAATTCGCAGTCGACGCTCAAAAGGAGCTCCTTTCAATCGCAGGTCCGC
CAAATCTCGCCTTGGGTCGGTCGACTTCTCAATCAGGCCAAAATAGCGGT
AGCAATCTTGCCGTCGATGGAAAACATGACAAATGCTTTCCACGGGATCA
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TGGACAAAGCTTACGATGTCAGATATATCATTCTTTATGTTGGTAATTTC
AACCCTTACGCCCATGCAAACTCACTTTCACATACTGATATTTACGTTTA
TGATAAAGACAACAAACCACATTTTTGTGCAAATACCGGACACATGAGCG
TATCTCGTAAAATGATACGAGTTACGTGCAATTTTGGTGCAATAGGAAAT
AAAGTCAAGCTTGAAAAGCAAGTCCACGGACAGCTGAATTTATGTGAAGT
TATGGTTTATGGACAAAAAGGTCCGCCAAATCTCGCCTTGGGTCGGTCGA
CTTCTCAATCAGGCCAAAATAGCGGTAGCAATCTTGCCGTCGATGGAAAA
CATGACAAATGCTTTCCACGGGATCACCAGAGTACGAACACAGGTCTGCA
ACAGAATCCATCTTGGACTGTCACACTGGACAAAGCTTACGATGTCAGAT
ATATCATTCTTTATGTTGGTAATTTCAACCCTTACGCCCATGCAAACTCA
CTTTCACATACTGATATTTACGTTTATGATAAAGACAACAAACCACATTT
TTGTGCAAATACCGGACACATGAGCGTATCTCGTAAAATGATACGAGTTA
CGTGCAATTTTGGTGCAATAGGAAATAAAGTCAAGCTTGAAAAGCAAGTC
CACGGACAGCTGAATTTATGTGAAGTTATGGTTTATGGACAAAAAGTCGA
ATCTTATGGTAGGAACCTTGCATTAAACGGTTTAACAAGGCAATCCTCTA
CCCTATCCAATTTTCCAAGTTCCAAAGCTGTAGATGGTAACAAAGCTGAT
TGTTCAAACAACACGGCATGCTCAAGCACAATGGTTTCACAATCTCCTGA
CGGAAAAATCTGGTGGCAAGTGCAGCTACCAACATCGTATTATGTTGAAA
ATGTTTTTATATACGGATGCGGTGACAGTTCGTTATCACAATTTGATATT
ACAGTCATCAATTCGGACGGAAAGATTTCCCTGTGTAGACATGTGTACGA
TTTAGCCCGCGAATTCCCTTTCAACAATGTCAAGTGTGGAGAGAAGGCAT
ATGGCAAGGTTGTCCGTATTGATATGAAATATTTAGATCAACCGTTGAGA
TTATGCGAAGTTGAAGTTTATGGGCGCCAATTCGAATCTTATGGTAGGAA
CCTTGCATTAAACGGTTTAACAAGGCAATCCTCTACCCTATCCAATTTTC
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GCATGCTCAAGCACAATGGTTTCACAATCTCCTGACGGAAAAATCTGGTG
GCAAGTGCAGCTACCAACATCGTATTATGTTGAAAATGTTTTTATATACG
GATGCGGTGACAGTTCGTTATCACAATTTGATATTACAGTCATCAATTCG
GACGGAAAGATTTCCCTGTGTAGACATGTGTACGATTTAGCCCGCGAATT
CCCTTTCAACAATGTCAAGTGTGGAGAGAAGGCATATGGCAAGGTTGTCC
GTATTGATATGAAATATTTAGATCAACCGTTGAGATTATGCGAAGTTGAA
GTTTATGGGCGCCAATTTGATGTTCAAAACAGAGAAAATTTGGCTTTACA
TGGTAAAACAAAAGCATCAAGCAGCCGTCTCAGCTCACTTGCAGTTGATG
GAGACAACCTGAACTGTGACATGGGCAACTTGGAAGGGCTAGATTCCGTT
CATCCCGTATTTATTTCCAACGATTATTTCCGTGGTTATCCCAGGCCTGT
GTATGAAAAAAGCCGTGGTTATCCCAGGCCTGTGTATGAAAAAGGCCGTG
GATATCCCGGGCCCGTCTATGAAAAAGGCCGGATACCGCCAGACCATTTG
TCGCAACGGCCAGTTGATGTTCAAAACAGAGAAAATTTGGCTTTACATGG
TAAAACAAAAGCATCAAGCAGCCGTCTCAGCTCACTTGCAGTTGATGGAG
ACAACCTGAACTGTGACATGGGCAACTTGGAAGGGCTAGATTCCGTTCAT
CCCGTATTTATTTCCAACGATTATTTCCGTGGTTATCCCAGGCCTGTGTA
TGAAAAAAGCCGTGGTTATCCCAGGCCTGTGTATGAAAAAGGCCGTGGAT
ATCCCGGGCCCGTCTATGAAAAAGGCCGGATACCGCCAGACCATTTGTCG
CAACGGCCAGGAAGGCATCGTTATCCAAAAAGCTTTTGGCAAGTTCAATT
GATCTCAATTGCGAAAATCGAATCCGTTATCATATACAACCGTGTCGACT
GCTGTACAAATGATTTATCGAATGTAAAAATAACTGTTTTAAGCTCAATA
AACCTAGCTTCTGGTTCGAAAGATGGTAAACCATATGAAGTACCATTTGG
TGATACAGGAATCATGCATGCTGTAATCGCCAAAGAAATTAAAACGAAGA
AAGATGTTTTTGGTGATATTGTGAGGCTTGATCATACAAGACCAAACGTG
CCTATAGCTTTGTGCGAAGTTGAAGTTTATGGAAGAAGAGGAAGGCATCG
TTATCCAAAAAGCTTTTGGCAAGTTCAATTGATCTCAATTGCGAAAATCG
AATCCGTTATCATATACAACCGTGTCGACTGCTGTACAAATGATTTATCG
AATGTAAAAATAACTGTTTTAAGCTCAATAAACCTAGCTTCTGGTTCGAA
AGATGGTAAACCATATGAAGTACCATTTGGTGATACAGGAATCATGCATG
CTGTAATCGCCAAAGAAATTAAAACGAAGAAAGATGTTTTTGGTGATATT
GTGAGGCTTGATCATACAAGACCAAACGTGCCTATAGCTTTGTGCGAAGT
TGAAGTTTATGGAAGAAGAGCCACGGAAAAAGATTTAAGGATTGCACAGT
GTCTAAAAAAATATGGAGAAATCAAGGATCATTTTAGTTATGTTATGAGG
CGAGCATGCATGATGGGGCGACATTTCTAACCACGGAAAAAGATTTAAGG
ATTGCACAGTGTCTAAAAAAATATGGAGAAATCAAGGATCATTTTAGTTA
TGTTATGAGGCGAGCATGCATGATGGGGCGACATTTCTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_013709XLOC_013709-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000419_pilongenomesc0000419_pilon:56808..69188 -
Properties
Property NameValue
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