XLOC_013556 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_013556
Unique NameXLOC_013556
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000416_pilon:116066..131881+

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_013556 ID=XLOC_013556|Name=XLOC_013556|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=15816bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000416_pilon:116066..131881+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTCAATCATTGGACGTTGTGAAGCATTTCGTCCCGGTGTGTCTCCTAA GTATACCCATAATGTAAGTTTTCTTTCCATGCTTTTCTTGTTTGTTCCCT AAACCGTCTGAGAACTTATCCATTAACCGCTAtaatattttaagcttttt gacTCAGGAAATGATACACCCTAGATACACACCTGGTGTGTCTCCGTTGG ACGGCTCATACCCACTGGAGAAATATCTTTGTTTTAAGTGGATGGGAATA GAGTAAGGTTGAcaagattttatcattttaacCATCATAATATGCTGAGA ACTTCGGTTCTTAGAGCACTCTTTAAAACTATGTTGAGGAGCAAGCTCTG CTTCTCCTTTCACCATAAGCGATTATGCGAAGCTCAACTGTTAGTGTTTT GAacactctggtgacaacagcagtctatgctcgcttaccTGAGCCGCGCT GACGAGTCCTGGGACggacgaaacacgtgtctgcggTAATATATAACCAT CATACGTATTATACTTTCATGCAATACAGGAAGATGTCGTTGCAAAAGTT GGTCTAGCTTCCGCGTCACTTAcgtaagtttttttattttatctctACCC TGGATTTCCATTTCCTTACGTTGGAATTGGATGATTAACATCTGGTGCGC CAAGCTGAGCAGAATCTCTTACAGTATCGAGCCATGACTTTTAGAGTGAA CACGTGCCCTGCGTGAAGTATCAGAATCtgttccaggctatattctcagc gttattggaatatttttgagctttttctaAGAGCCTGAGATCCTGAGGTC TTAATTCTTAAGTCGAAtcttaaaactcagagttaaaactctactttcaa agcacttaaaaatcatttgcggttttaaagttttgagggaatgtcccttt tgtgtcaaatatttcggcgccgattgtagaGATCATAGTGCCATGAGAAC TAAGTCTGTAAACCAAAATGGGGTGCCAAACAGGGAACTTTCTAGGTCCG CATTATGTGACTTTCCAATGAACAGGTAGTCAGTTTTATTTGAAACCTCG GAAACTAAAGAGATCGATATCAAGGAGGCTTAACAACACTTCATTTCGAC CAGACTTTGCATTGCTAATACGTAAGACAGGAAATTGATATTGAGACAGG GAGCTCTTCTTCCATCTCATTTTCACAGGTTTCTATCGCATTCCTGCAAT GCGGAATATAATGTAATCTGCATCTCCCAAGCATTTTTGGTGTCCCTTAg ttgaaaaatatgtttaaaGTTGAAGAATTAGGTCGCCTCCAATCCTGTTT GTTAACATTTGTAATACATTATGTAATGCAGTATTAATTTATACATTagt agcgaccgtagtgcagtggtagagtatccggctacggtgcgcaaggttat GGGTTCCACCCTCAGCCGGGTcacaccaaagattcccaaaatggtacttg atgccgctctgcttgatgctcaacaATTAAGAGACGGaccaagggtaagt ggagcaatccagggagaaagagtgacgCCCACCCCTACGCTCCGGTAcgt tcgggtagatagctatcgaaagagtaGCCTTCGTGACGCCTCCGGCTGCG CTCGCAGACTTACTATGTCATACATTTGTCACATTCAAGAAACGAAAAAC TTTAGTATAGTGTCTGCGTTATAGACATTCCGGGCCACTAGCCCGAACTA GGATTTCTGAATTGGGAAGAATTTCCCGAACTGGCAGGAATTTCCCGAAT TGGCAGAACTAAAGAGAAGTTCTTCTTGATTAGGTTCCCGTCCACGTTGA TTTTAGTGCACAGCGTGGCTTCAGCTTCCCGTTCGGCCAGATTCAGAAGA TTTTGGACAaataggatctcaggatctaaaagctcaaaaatgttgttTGG CAAACATGGTTTAAAAGCACTGAAATGGGGAAAACGAAATTCCTTAGACA CCCTGAATTTAGGTAATTAATGTTAACTTTAGTTATAATCTGAAACGGGT AGTAGTAAAAGAAGTATCAATATCGACAGGCTTAACAACACCTCATTCCG AAGACGAATGATGGTAATGATGCGAAAGAAATGATACCTAGAAACTCCCT TCAAACAATGCGGAACATACACCTTCACTCACATTATTTTATGTCCTTTT TATGTACAACAAACGTCTTTTTAACATCCCATTTCTTACATAAATGATTT AAGAATCTTTAGTTATGTAAGGCTTAGTTTTAGTTTCTGGGAAATACAAT AACAATTCTAtcgtaaatttttttctccatccCATCTATTCTACGCTAGT ATCAAGAAACTTTCTATCGTTATCCAATAAGCTTGTCTAATGAGAAGAAG TTTCACAAGAGTTAGCAATGCTTTCATAACCTTTTCGTCTCGACATAAAG ATCACGAGACCTAACCAGTTATTACAACAATAAATCCATGTTGCAACCTA CTGAAAATTCAAAGTATGGTACAGTCAAAATTACAACATTGTTCAAGGGG CTAGAGCTATTGAAGCGCGCGTAAAAATCATCccatttaaaatcaatttt tgaccgtTTTGGCCGTACTAAAACAACAATTCGACAAAAAATCCGATTAA ACggagaagaaaaaataatagtTCATAATCGCACTACGAAGACTAAAATT TATATATCtacatattattatttttctgttttagacTGGTCTCCACACTC AGTATTGTTTGTTTCATCCTTTGTAAACACATCCAGTCTAATGTTCAAGT CAAGCCTCTACTCCATCTGTCCATCGCAGACTTTTTGTTAGCCTTTGCAT GGGTGTCAGCCAACACTGCTTATCTGGTGAAAAATGATTTCGAAGATGTT CAACAAACTGCGATGTCTTGTTTCACATGGCAGTTGATCACAGAGGTATT TAGTTTTCGAATTCCAGTTCCCACTTGCAGCTCCTTTAAATTATATGATG TCCTCCGTACGTCTGTCCTgctactctataactcgaacctcttcggggaa cataaatttgttcgagttaaggaaatttcgaataATGGAGTAAGGCttaa aaggcattgttaactgactgaagggaccataaaacgtgttcgagttaaga agacattTTGAGAAGACACATTTgagttatagaagttcgagttatagagg ttctaCTGTATCACTTTTCCGAAAAAGTTTCctgaaatattttaaagttg TATCACCTTAAATACAATACCAAAGTTTTGCAATTTTCGCAAATAGATAA TAATGCTGCTTCAATATGGCAAAAGCCCTGCACAATAGATAGTAAAGTTG AAACCAGGtgacaaaactttcaaaaaaatacttaTAAGTCTGTATTAAAA GGAAGTACTTGCACCGGGTGTGGCCGGAGTCGGTAGAGCATTAAAGCGGT AAAGCCTTACAATCCAAGGTTTGTTGGTTCGAACCCTGGTCACCGCCAAC CTCAGggaatgagtagcttagattgggtagtCTGATCTTAGCGGTAATTA GcgcccaggtctagcgcaaatagaaaagagGATGGATTCCACCAACAACC ACCAGATAAATATTATACTTACTTATAtgtccttcttctttttctttcag atcATTCACATTGTGACATTTTGTTTCACCATCAATTATTCGATTAACGT CTACTTCCTCATGAAGGATCGTGTTCGTAGCATGGGTATGGATTACACTG AGCAAGTTCACGTAAGATTATCACCAAAAACTACAGCTAGCTCGAAAATT TACACTTCAAAATTTCTATAACTACTTTATCCCAGCCCTCTCTCGTATGA ACCTCGACACTTAATGTGTTCGTCTAGCTCCGAAGGGGCTAGAGTTTAAT CTCTTGGACGGGAAATAAAGCCATTTGTCCCCATTCAAATCGTGTAACCT GCGTCATTTCACACAAATGcctgattgaaagtaaaatatatcaCCAGATT TCGAATATTATGCCACGTGAAAACAAAGAGAACGCTAGAATCAATCCGTC ATTCAAAACCCAGCGCAAAGCTTAAGGCTTAACTTGTTCATTCTTAAAAA AGGTAGAAGATTTCTTCTCTAGCCCTTTGATTTTTAAACTCGATGTTGGA GTCCTTGTTTGTTTACAACATGAATATTGTTCACCTtgtgttttgtattt ttcaggaaatGGCAAGTTTATCGGCGATCCGTTTACAACGCTTCAAAAGT CTTTTATATTACATTTCTTGGTAAATATTATttgcgtttattaaataatt ctcgttttttgagagaaatgactaaaatttccataaataaGACTTCATTT TTCCCGATAAGGTACATCTCTAATGGACAAAATGATTCGAATTACCATAT CCATATGGTTACAGGGCTTGGGTCATATTTCGCACATCATTATCTTAGAT TCAAAAAGAACACTATGGCTTTGCTCATCAAAGAATAGTATTGTGCGTTc agtaaacaaaaagaaatttagtgAGTGAGATCActtgaaatatttaaaac cTTATTATTGAATGAGAAtgcgtagtggtatagtggttatcatccttgac tcccgcttgagaggcccgagttcgatacccaccgtgtctctacgattcac ttggcaagtgaatataccttcacccgggtcaacccattCCATGTGAGGGa aattgggtaccattactctgatacaagagtgtgggtagattagacagaca ttgtgaTGTGCCGTGGCACTCATAAGCTTCGGCCTCGCGcgagcatcgct ctcccagtgtcgttcgagtgccATTGTATAAGCCATTGGCAGCTCGCGcc tgtcaagtcgcagtgtctttcagcgccgtgattcctactccttcgtgaGT AGaacccatcccgaatgcattcgaAGGactcatatctatctatctattga ATGAGAAGTATTTCACATGACTTTTGATAGCgaggaaaagattttttaaa agattttcattttattgttaTTCAGGTTGATGCCAATTATTTTGATGTTA CCAATTATCATCGAATCGAAAATGGAAAACATAAGCTCTTGTCAAAAGTA AGTAAGTTGATTATCTCAAATTTCCTGGAGACATTAATTAGTCCAAAGGG AAGGCCATTCCATTTTGTCTCCATACAGAGGGGCCCCCTCTGAGGgggag ggtggacgaacatttccaggggggtaACCCGAGAagattttccagggggt ctataggaatgttttttatttttacccggggggtaaaaagttattctaaa atttcaagGGGGTAAAGACAGGTTTTAGTTCGGCCGCCGTCTCCGTTAAA GTATGCAAAGGCTTTCcaaggtttttttttgcaaatttagcCCTTTTCCA ACGGGGAATCCTCACATTTctaagaattttattttgacttggaaaggttc gtccaccccctgtatggatatttAATGGAACAGTCCAATGCAACGATTGA TGGTGCTTCAGCcttaattttgttgaaagtacaGTTTTATAAATGGGTTT AGGAAGGCTACTCAATATCTTATCGACCAAATGATTCGTCGTCAAAAGAA ATTCGTTggtaaaaagtgacgaaattttttaacaattgaGGAAAATAATC GCAGACGCATTTTTTCACTAGATgtgtatttttcctcgttttcagATGCG TGATAGCAATAGACGTACCAAGACTAGTTGTAAGTCAACCtttctctttc atttttgaTCTTTCTACACAATACTTGTCGTTTTgtcttcaaaatataaa aacaaatctttgcaaaaaatcaacttctgAGTTCAGTTAGCCATCCAAAC ATTTTGTTGATACTTTTTCAACtccttttctgaaatttgaacctttatga atttttcagtaatttttaAGGCAATTGTTTGGGGGCAAAAATAATGTGTA TGAATCTTGATTAAATAGGAGCTATAAGTATTAGAACAGTGTTTGAGTAA AATAAATTTACGGAATTCAATGTATTATATACACAGTTATCTTATCAGTT ATCtaatcaataataaaatcaatcaattatttaaTACCCAATCTCGGTGA CTCAgcacaaaaattttgaaaaatgtgaataGCAATTCACATTATGGGga ttatacagtggagtctccataactcgaacatgcacGGGGAATATAAatgt gttcgagttaaggagacattcgagtcatagaggttcgagttaaagagaat cCACTGTAATAATGtatattgttaaccggttactttttcgaagcggccta catgactttttgcgcaatgcaattggttcttttcgcatgacgacgggcct acactgcccagagttgcccgtcgttaggaaaattcattgtgacgtcactt tttcaaaggaaaatgaacaatgcgttgacatcatttctctcattttttat ttctgacgtcagaaattatagcaattttttatctcttttcgcttgttttt tctgctttatttcgctatttttcctggataaagcgctcaaaatcaatcga agctgaaggaaacggttaacaatacaataatgaccggtttttttcgggct gtactgaaaatattgccctcggtcaatgcaacaacctcgcaagctcggtc gttacttgacctcgggcaatatttctcagtacagccctcactaaccggtc attattgtattaataatACGTATAATTTATAAATTCTTAATGTTATTATT TAAAAGGATTACTTTCATACCTTTTTGTGCCACTTTATCGTACCATTTTT ATACACAttaagaaaaacacaaaaataatgtCAACAGAGTCTACATTTTT CATGATGCTCTGCGCATGTGCACAAAAACTGTATATTAATTTGTTAAGCG GAACTGTTTTTCAAGTCTGATTTCAGGAAACTGAAGtatctttttttagt tttgaacaACCTTGAAGTATATCATAGTCCATACTCTCCCATATTATGGG TAATCGTTTTTTATAAGCCATGTTGAAAATGTCTCAGTCAGCCGGTGAGA CTTCTTTATCCAGTGTGGGTGAATTGACTTAGCTTAATGGTACAGGAGTG ATAAAACTTTAAATGGGCCGGGGTTTAGAATTTTGATTTGTCTACAGCTC AAAAATCTAATTATTTTAGTGTTTTCCTTACACTGATATTTCATTTGTAG TTTTGGAACGAATTTCAGTTTTTACATTCTCACCAGAGACGAATTTTTCG AGTAATACAACTATGTTTCATTAACAAAACGCACATGGTAAGAAGGCCAT GGTGGATAGACTGAAAACTATATGGGATtctcataaaaatatttgatgtt TATTTTATACATTCTATACCCACCAGCTTTTCAAACCAGTTGATTTCGGT GGTATTTTTGCATTAACTCGATAAGTCAAACGATGTTTCACGTTGACAAT AGCTGCCACAAAGGTGCTCGTGAATAGATAACCGAGAAAAATCAATATGA TGGGCACCGCAATGTGTTGTGGTTTCTCGGTAAAAGAGTCTGGGATCAAG TTTTCGTCAGACATAGTAGTCAACAACATCAACCATTTGAAACTATGGCT TTGGAATGTGACACCCGCCCGGGCATATCCTGTAGTCACTCCCGCGCAGA ATAAAATGTAGAGCCCTACAAGGGCGGTAGCCGCCAACAGGACTTCGTAT TTCAGCGATTCTTTACGGTGACGTCGGAGTCTCGCTCGTAATTTTCGAAA TCCGAAATTGAGTAAATTCACCCCGATAAATCCGATAAGTGTGTATAATC GGGTTGCCAAGATAATCCCGAAAACGATAGCTGGACCAAAAACGGATTGG CCGCCAGTTGAGCGCAAGTGAAGGAACAGCGTgtctgaaatatttcaaaa aggaaATTGTTTAAAGCGTTTCACATACTTAGGTACTACGTATCTTCCTT AGAAATACGTAACGTCGTGACGGGACCTAAACCTAAACGGACTTGTTTAA CTTTAAACTGGACTAAAACTTGACACACTTTCAGGAATTCTATATGCAGA TAGCCTTTCTatcttaaaaaacaattttgctatATCTGGAACGTGTCAGA GCgttatttttataagattttgttaatAAAGCTCACCCGCGCCGTGGAAA TGCGCCACTGTgaaataaatccatttcataACCGTCATCGACTTCAAACT GCATTTCGTCGTGCCGTCAATGATGTCGTTTGTTGTCGTCGTTTTCATTT CACTTGGTGGAGTACATTTCGTGATGTCAGCTACACCACCCTTCTCTCCG TTATTGCTTTCCTTGTTGCCATGGTCGTGGATACCATTCCCAACGTGTGT TTGAACGGTTGTACAATTTTGACGTTGTGCTGCCGCCGGTGTTTGAACCT TGTTTTGAGACATACTATTTGATTTTGAATCATGGTTTTTATGATCACTC AGACATTGCTCAGTTGAGAAAAATACGACACTTGCAACTATGGTGTAGAC TAAAAATATGAAGTAGAACTTAACGACTTTGGACCATGGGAATAAGTTCA GGAATTCTCGTATGTTCATTGTACGTTGAACTAAGTTTTCTTTGTCGGAT GCCGTCATTTTGTCGTTCCACGGTATATTTGTTGATTATTGTGAGCGTTT TTTATTCGGCTTGTTACTGTACGCAAAGGTATTGGTTGTTATATTTCGTC CTTCGACTGCGATGAAGAATGGTGTTTCATATAGGTGCTTTGCCACACAT CCACTGTTTTATGATAATATAATTTCAATTACAATATGTGGTGTTATTCT TGCtagaatctttttttgaaatattgttaaACTACCATCGAAACTAGGAT CTTACCAATAAGAAACAATCTTGAGATTGTGTTCATCGATATTTGTTGAA CTACGTACTGAAATAAATATCCCTTTATCCTCAAAGCTGGcgatttcgtt tttttcttcttttgaaattcaccAAAATATTTCCCATAAAGCCTTGCAAG ATTGATTTTGTCTTGTgaactaaaaaaaatcaaatttagaaattggtttt catgaaatattgaaaaaatctaaatgaaatttagcaaaatgcattgataa agtaaaatttactttacaaaacgaaaacaaaacacCAATACATGTCGTAT AAAACATTCCCAGCCCAAAAAAGTTATAagaacgtttttttttctttttg cttttttccatCAAATTAACCAGcgttgtttaaaaaatataatacaaGCG TTTTTGAGCTAGAAAGAATACTGAATGAATTCAAATCCAACTCTGTTAGT TTTTAACTCAATTTGGCTCCAAGCCGATCCTTCCCCAATTTACTCCGTTT TTATAAAACCTGAATGAATAGAGTTTCTCTATGcagaaaaataatattat tcaaaacgacatcaaaaatttaatttaatattttgatatatTCTATCGAA TAGTCAGATTTACTAAATATTTATGAGATTTtaagaaatcattttttatt AGCATTGCTAATAAACTTCCGAAACAATATAAGGGCAagtgaaaactttt tgttaatatcTTGGTTTCTTATAACAAGTGACAAAGCTTGCTATGATCTC CTTTCCTTGGTTGAAGCATGGagaaaaaataaaggaaaaaatattgaatt tttggAGAATATGCTAATCAACAGAGCATTGATTTTAAAGCTCCGAAGGG GCTAGAtccgaaactcctggatgggaaatgaagccacttatttttcccat ccagaacccgtgtgtttttcaaacaaaatttctaaatgcagctcaaatct taaggcttcactttttcttgcttgaaaaaggttgaagattcatctctagc cccttcgggttTCAAAACTCAATGCAGGCTAGTCCCTTTAATAAGACAAA ACTCCCCTTTCATCTATGATGTTTCTTGCTTTCATGTTTAGCTCTTTgga cactcccttctcacagacccactgggaaccatggctagaaaacaatggaa ttcaagtCCTAAGCCATAAAAACACGGGAATATCAAtacccatcgagttt tggtccgttgtTTTTgcccccagtggaaaattgtaCTCTGATTTTTGCtc ccgctgaaaataaccagataagcaaatcctcactgcaaaatattgtgctt ttttccatccccactgagttatctggctagaaaacaatggaattcaagtT CTCAGCCATAAAAACACGGGAATATCAAtacccatcgagttttggtccgt tagttttgaggctcggaaaacacgagttaaaaaacacgagttaaaaaaca cgagttaagttaaatgtgacgtcaccaatgggaaattatgacgtcacaag tagataatttaactcgtcagtttatggtgcaccttaaattgacgagttaa attttcatgaaaccaagttggtcaaaaattctaaaatggtggttaaatta ttttttgtgcctATTTTAAGTTTAAAACTATTGGAATGGTAATTTTCTCT CATAATATTCTATAGTCTTTAACTGAGACAGAAGTTGACAAAAAGTATTT AGGCTGGCTCAAATGCTAAGGGAGGGGCATATGTATAGAGTTTTGTTTCC TGTagagatttgaaaataaaattacgaATTTTGAAGCTTAAgaagaaaaa tgttatttttactgatttttggtCGACTTTAAATCTGTATCTAAGTCCCC ATCTCCATTCCCCCATaaaaaaaCGGTCACTTTGAGCCAAATTACAGACG TAATTCTAAAAAGTTACTctcaggtgccaaataaacggggggggggctcg gaaaaatttaataaacaggagggcctaattaccgggggtTTGAAAATGTA CCTCTAAAAACCCTAAGAAAGGATAAAAATAGACtataaatttaggcttt ttataTAGCAAAATGAGGAAATTTTCTTTTGGTAGctgtgaattttttga aaaatcaataaccaggcgggggtcctaataaggtccgggggttggaaaaa atcgaaaaatttacaAGCGCCCCCCGCGTTTACTCGGCACCTTAGTACTC GGAGAGTACTAAATATTTGACAAATAAGACAATCATCGTATATAATTGAA AGGCCTTGAAATTCTTGTTTCAATGTgttatatttatatttaaaattacc attccaatagttttaaactaaaaataggcgcaaaaaataatttaaccacc attttagaatttttgaccaacttggtttcatgaaaatttaactcgtcaat ttaaggtgcaccataaattgacgagttaattaactcgtaagattaaggtg caccataaattgacgagttaattaactcgtaagtttaaggtgcaccataa attgacgagttaattaactcgtaagattaaggtgcaccataaattgacga gttaaattatctacttgtgacgtcataatttcccattgatgacgtcacat ttaacgtaactcgtgttttttgtaactcgtgttttttaactcgtgttttt taactcgtgctttCCGAGCCTCGTTAGTTTTGCCCCCACTctctgataaa atcccaccaagaagggggtgtttttagcGATTGAGATATTTGCCGGTTAA AATAGCCTGTGTTGATCACTCTATAACCAAAACTTTGTCTTCATTAGAGA GATATCATTATGCATTTTCTTTGCAAACCCCTTCCAACTACTTCAAGCTT GACATTTTCTACAGAGAAAGATCTTGGCAAAGttagaatacacgcttttt ttataagaaccatttttttGactcaggctgggctgttcttaattttttga aattttcagtggtatttgttcttatgatgttcttactatgcttagtttct ttacttaaaatctgttaaaatcaatACTGTCTtagtaatttttgaaatct gaggcttagattgttcttaatttattcttaggttttggccaattttcagc ctcatgttcttataaaaaatgcgtgTAAGTTGAATCACGTAACTTAAAAC TCATAGTATCTCTTTAGTTAGTTTCGGGCTATGAATTCAAAGAACTTCTA AACAATTTTACAAAGAACATGTCTTCGTTTGAAAAGAaggtttttccaaa aattttaagcTGATAAAATAACTTTAAACATGTTTGTCTGATAGCCGAGT CGCCATCTCGACTCAGATACCCAGTGttattaaaattaatttaacCACCA TTGCTTATTcacaatatttcaattttcttttccaaCAGAATAAAGTTCCG CCATTTATAAAAGCTTACGGATTTATCTTACTGGCTGCAACCCTTTTGTT GTCAATGGTTACCATTATGGTATGTTCGTTTTACTCACGGAGGTTTTTCC CTCAGCAAAATGTAGCTTGACGTGTGCAGTATCTCTTTTGACCTTCTCCT TATTATTTAGGCTGTCAATTTAGACTTTAATTCAAAAGACAAAATACCCG AACTTTAGTTTAATCCTCATTTTTTCACATAGTGTTGGTTAGAACTAagc caaatgaaattttcttcgaaACTTAAAAAATCCGTTCAAGATTATGTTAT TTTTGGATCAATCCAGGAAGAAAGAGTGGCGCTCTCCTCTACCTTCAGGT GGATGGCTATCGAAAAGAGAGCATTTAGATTCACATCCAACTAACCTTGC TGGCCTACTCATTTCTCTTTTCAGGTTTTATATGGGTTAACCTTGAGGTT GTACTGGCGAGCTATTCCAGGTGATTATATCTATtatctgtttttgttta tttatcctTAATTTCTAATTTAAGTTGAAACCAATTTTCAGTATGTActa ccatggaggtaataaagatagatggagagtcaatgccttttgttctattc tgatttatcatcggaagcaaacagctgtttggttgctttgggaataagat gattaattttgggtatactcgtgggaatatttacgatgaatgaaaagaca caagacaagtatattgaaataagGCTattagccttgtcatgaaaaataaa gttaaaaattgatgttttttgcttccaatgatggtacatcaaagaaaagc cgctttgaatagatttataaaagatttcaacgaccatttagatcattacc gagacgttttctctccatctatatctttgtTACCTCCGTGGTACTACAGT AGACTCTCTTAttctcttattcgaacttctattattcgaactttcCCCGT CCCCGTCAATGAGAAACCCtcttgaaatactttctataatctCTGCGCAA TTCGAACGAAAAGATTTCCCACGAGTGTACTGTACTTCTTTACAGATTTA AAGAATGGGCTTTTCTTGCCAAAAGTCCCATACACAAGGCTTTTCTTCAG AGGGTTTCGACGAATCAGGGCTGGCATTTTGTTTGGGAATTTACGATTCA ATGAATTATTACGGGTTGGGAGGAGGAGGTGATTTATTGTGCTTTCACGA CCATTCCAGGAAAGTGCCTAGATCACTTTCCCAGGGAATTTAGAAAAACT TAGCCGTAtttttttGCGGGTATTCAAACTTTATATTTTGGGTATTGTTA TCGTGCCGAAGATTGATTACTTAAGAAATTGTTCACTAATACCTTCAGAA AGtaaatatctgaaaattttgaatgttttataaacattttttcagCGTAC CATACAGATCGTCAACGACGTCAGCTATCGAACATGAAAAAGAGAATCAG CGTTTATGTGGTAGTGTTCATGGTGTGCTGGCTACCCGGTAAGTATACCT TGTACCCAGTCCCTACCCAGTGCTCGCTTTTTATGGTTTTGATATCGCTC AGGAAATAGCACAACGTCCACCTATTGAACCGAAAATTGGTCCACGTTAC TCTGGGTGGTATCCAAGTAATTCGAAGAAATATGTTGTATTGGGCTCCAC TAGAAAAAGTTGTAAACCAAAGTGgttaaaatatgattttttcaaaaatg ttccattCCTGTGAAAGTCTATCTATTCCCTACAGTAGACATGAATTACT CTTTGGTGAATTTACCCCCTCTTCTTCAACCTGGTCATGACAGATTCAAC TCTGGACAAAGCTATCAGCCCTATTGAAAAATGTACTCTTTTTTATTCGA ACCCCTTTTTCTACTGTTTTACATTTCTTGCTTAATTGTTGAAACTTCCT TTCCCATTAGCCTTGATTCTGTCGATCATGAAAAGCAGAGAGGTGTGGCT AGATGTGGAACACAAGAAAGTAGATTTGAATGATTATTTCGCATTGTACA TCCTCCAGGTGAGTTTTTATGTCTCAGCTTTGCGTGCATTTTTAGAATCT GAGTGCTATGAACTTTGACATTTTGATAAACTACTCGAATTACTTTAGGC Gtgcaaactttcgcgagcagaaacttttgcgaggtcgaaaaatcacgaaa tctacgacatttactttcgcgaattaggTATATTTTAagtagaaaattta atttttcggTTTATTTTATCATTGTTATCAACAAAGAGGGAAATTCGAGT AACTTTTCTTTGCATatttttttcgcgagcataaactttcgcgaattgcc ctctCAAGAATtctcaaagacatttactttcgcaaaaatggctaaagttt gtacgcctaacaAAGTAGTTTTCGCAAGccaaaaaatcgtgaaattttct ggatttatttttgttgattAGCGTTTTCTTTTACAATCTGTTCCAAaaac attacacgttttttttatataaggaacacgtttatgaGCAAGTTCCTTGT TAtgaggaactcgaggctgaaaatggtccaaaaaataaggaattgtttag gaactgctcaggctgagaataagaaaacaagttttaaggaacagtaagag atggttatccaaacttggcagctatgtaaataagaaactctgaggctgaa attctctgtaaaaataaggaactccaggctcagatcaaagttaaggttcc ttataaaaaaacgtgtaactctTGTTGAAAAAAGTAATAGCATGTTGGAA ATAACATTTTAAGTAGTTTGATATAAGACTTTttagtttttcctgaaaat ttgaaaatcaagaagaaaaacgaagaagcaAAATCGAAAGCTATAGCACG AATAGCATCCCACCTTTATCCTTTCTTGCTCAAAACTATCTTTCTAACGA GATATTACTTTTAGCTATATCTTTTCCtcaagaaaaatgtttgaaaaagt attcattgccaattttttggaacaaacttaaaaaaaaaatcaattgacAG TAAAGGCTCTGAAAACCCTTTAAGTCAAAAATATGATCTTAAAACGTTCA CGTGGATTCAGTCCGACCAATTGATTGGTTGGTTTAAATTATTGCGCTGA TTTACGGTAAAAGTCTATAAAATACTCGATACTTTGTACCCTTtttgaaa atagtatttttgagGGTAACAAAAGTTGCTTTATCATTTCAAAGCTATTA TCATTTGTAGGATAACACTCATTTCTCTGGGATGGAAAAATTCCGAATCT CATTTTCAACTAGCTGTGAGTTTTAGCTTTTTCCCACTGGAGAATGGTAG AGGAAATTTAGTGCGAGGCTAAGTGTCATCATACACGACGGTACAAAAAG GGTTCTGTTTCCtttttttCTGTTAATAGGCTGTGTTGACGCCGCTACAA GGATTCTTTAACACGATCGTTTACGGATGGTCACGACGTTCTTTCCGTGA AGCTACCCGTCAATCCCTTTCTTCAAGTCAAATGTTCGTACCTACACCCG AATTCACGTCGGCGTATTACGATCAATCGCCCGATTTCCCGAATTACATT GATGATGAACCCGAATCGGAAACAGCTTTTGATCCAGCTacgaaaaataa gaaacaagaCAGTAGT

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000416_pilon:116066..131881+

>XLOC_013556 ID=XLOC_013556|Name=XLOC_013556|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2310bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000416_pilon:116066..131881+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTCAATCATTGGACGTTGTGAAGCATTTCGTCCCGGTGTGTCTCCTAA
GTATACCCATAATATGTCAATCATTGGACGTTGTGAAGCATTTCGTCCCG
GTGTGTCTCCTAAGTATACCCATAATGAAGATGTCGTTGCAAAAGTTGGT
CTAGCTTCCGCGTCACTTAcGAAGATGTCGTTGCAAAAGTTGGTCTAGCT
TCCGCGTCACTTAcacTGGTCTCCACACTCAGTATTGTTTGTTTCATCCT
TTGTAAACACATCCAGTCTAATGTTCAAGTCAAGCCTCTACTCCATCTGT
CCATCGCAGACTTTTTGTTAGCCTTTGCATGGGTGTCAGCCAACACTGCT
TATCTGGTGAAAAATGATTTCGAAGATGTTCAACAAACTGCGATGTCTTG
TTTCACATGGCAGTTGATCACAGAGacTGGTCTCCACACTCAGTATTGTT
TGTTTCATCCTTTGTAAACACATCCAGTCTAATGTTCAAGTCAAGCCTCT
ACTCCATCTGTCCATCGCAGACTTTTTGTTAGCCTTTGCATGGGTGTCAG
CCAACACTGCTTATCTGGTGAAAAATGATTTCGAAGATGTTCAACAAACT
GCGATGTCTTGTTTCACATGGCAGTTGATCACAGAGatcATTCACATTGT
GACATTTTGTTTCACCATCAATTATTCGATTAACGTCTACTTCCTCATGA
AGGATCGTGTTCGTAGCATGGGTATGGATTACACTGAGCAAGTTCACatc
ATTCACATTGTGACATTTTGTTTCACCATCAATTATTCGATTAACGTCTA
CTTCCTCATGAAGGATCGTGTTCGTAGCATGGGTATGGATTACACTGAGC
AAGTTCACgaaatGGCAAGTTTATCGGCGATCCGTTTACAACGCTTCAAA
AGTCTTTTATATTACATTTCTTGgaaatGGCAAGTTTATCGGCGATCCGT
TTACAACGCTTCAAAAGTCTTTTATATTACATTTCTTGGTTGATGCCAAT
TATTTTGATGTTACCAATTATCATCGAATCGAAAATGGAAAACATAAGCT
CTTGTCAAAAGTTGATGCCAATTATTTTGATGTTACCAATTATCATCGAA
TCGAAAATGGAAAACATAAGCTCTTGTCAAAAATGCGTGATAGCAATAGA
CGTACCAAGACTAGTTATGCGTGATAGCAATAGACGTACCAAGACTAGTT
AATAAAGTTCCGCCATTTATAAAAGCTTACGGATTTATCTTACTGGCTGC
AACCCTTTTGTTGTCAATGGTTACCATTATGAATAAAGTTCCGCCATTTA
TAAAAGCTTACGGATTTATCTTACTGGCTGCAACCCTTTTGTTGTCAATG
GTTACCATTATGGTTTTATATGGGTTAACCTTGAGGTTGTACTGGCGAGC
TATTCCAGGTTTTATATGGGTTAACCTTGAGGTTGTACTGGCGAGCTATT
CCAGCGTACCATACAGATCGTCAACGACGTCAGCTATCGAACATGAAAAA
GAGAATCAGCGTTTATGTGGTAGTGTTCATGGTGTGCTGGCTACCCGCGT
ACCATACAGATCGTCAACGACGTCAGCTATCGAACATGAAAAAGAGAATC
AGCGTTTATGTGGTAGTGTTCATGGTGTGCTGGCTACCCGCCTTGATTCT
GTCGATCATGAAAAGCAGAGAGGTGTGGCTAGATGTGGAACACAAGAAAG
TAGATTTGAATGATTATTTCGCATTGTACATCCTCCAGCCTTGATTCTGT
CGATCATGAAAAGCAGAGAGGTGTGGCTAGATGTGGAACACAAGAAAGTA
GATTTGAATGATTATTTCGCATTGTACATCCTCCAGGCTGTGTTGACGCC
GCTACAAGGATTCTTTAACACGATCGTTTACGGATGGTCACGACGTTCTT
TCCGTGAAGCTACCCGTCAATCCCTTTCTTCAAGTCAAATGTTCGTACCT
ACACCCGAATTCACGTCGGCGTATTACGATCAATCGCCCGATTTCCCGAA
TTACATTGATGATGAACCCGAATCGGAAACAGCTTTTGATCCAGCTacga
aaaataagaaacaagaCAGTAGTGCTGTGTTGACGCCGCTACAAGGATTC
TTTAACACGATCGTTTACGGATGGTCACGACGTTCTTTCCGTGAAGCTAC
CCGTCAATCCCTTTCTTCAAGTCAAATGTTCGTACCTACACCCGAATTCA
CGTCGGCGTATTACGATCAATCGCCCGATTTCCCGAATTACATTGATGAT
GAACCCGAATCGGAAACAGCTTTTGATCCAGCTacgaaaaataagaaaca
agaCAGTAGT
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_013556XLOC_013556-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000416_pilongenomesc0000416_pilon:116066..131881 +
Properties
Property NameValue
Aaloc919-1155:15580
Aaloc823-918:14113
Aaloc730-819:13598
Aaloc682-726:12625
Aaloc601-681:12189
Aaloc568-600:5647
Aaloc496-564:4977
Aaloc430-492:4156
Aaloc319-429:3601
Aaloc109-318:2686
Aaloc64-105:530
Aaloc1-63:1