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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000416_pilon:172066..181240+ Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_013555 ID=XLOC_013555|Name=XLOC_013555|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=9175bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000416_pilon:172066..181240+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCGGCAAatctttcactttcgattttgaaaaaagtagctCAAGTCAA
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TTTTATATGTTCCTGGAGATGAAAACAAGAAAGTACAAAAGGCATCTGGT
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tttgattattttacagatccggtgtctagattgcaagacgtatgtcgaga
ttagacgactctacggtacttatcgatccggatatgataggagatcgata
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catcgatctatcatcgatcttttatcgatcttatcgaccctatcgactct
ttctagaaatcgagctctaatattaatcgatctttctcgctatcgtttac
ctatcgacacctatcgattacctatcgacacctatcgattacctatcgac
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AATGGTGGAGttgctttgatttcatttttatgattttgtttcgTGTGCTA
GGCCTATACGACACGGTGTAAAATTTCATTGCGATTGCgacaatttgttt
ttgttgcaattgCACAAAAATTGTTTCCGTGTCCCCTTAGCTTAAGAAAG
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catttttgtagttttgagaaaatcaagtttaaaggtttgaaatggCTGCC
ACTTTTGACCATGTTGGGTTAGCTAGCTGcttttttgatatgaatataaa
tgaagaaagatctttcaagttctaaagtatcaacattgtcacttatacca
ttgcggagatatgaatgcttcttcatagcatgtttttcgagaatggactt
aaacctttttttctatgtaaatttccttgattaaaactgaaaatttgaaa
aatttccagtgaaaaagtgtcttaactccaaaatggacttaagactttct
tgctttaaactttcttaacttttttgaaccttttaactaaaaccttaatc
taaaaggtcctaaagtccaactaaaatgacaatggacttaagactttctt
aacttgagaaaatttcaaaaataaaaattcttatttttcaaaaaacttaa
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taaaaaatggggCGTAAACCATCGgtatggtcataactcaatttttgaaa
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TGATCGATACATGATCGATACATTATAGATGCataatcgatgcataatcg
attaacgatcgatgacgaatcgattaacgatcgagcgatcgagattaacg
attaacaatcgatgacgaatcgatGacgaatcgattaacgatcgatgacg
aatcgattaatgatcgatgacgaatcgattaacgatcgatgacgaatcga
ttaacgatcgatgacgaatcgatatactcgattgaaatactagctcgata
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catcgatctcctatccggatcgataagtaatccatcgatcacatatcgat
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attcaatgattttttacagcactttgttgacaatctaactcaaattccca
ctttcttcagaaaattgatGATGAGAAAAAGCCTTAGCCTTAGGATCACG
GATCGAAACAAATATAttgtgagtggtcctaaatccgacagccctgccta
aatccgacccccaaataactgctatgaaaaatattcaatgtttacaaaca
ttccctctccaagttgaacgataaactattacAATAActttcgaaacaaa
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gttcggtgtatcaaatctctcagtttagttgacacttcaGTATCTTCATT
GCgccacagcgaaaggtttgtttttattttagtttgtatctttgaaagac
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tttttttaatgttttttgcctagatgatatagcaaacatagtaagtataa
gcagactgtgcctttaattggctgtaaaaaaattatgcgttggtagaaat
ttcttcaactttcaacaatgatagaacacacctatttaaaaaaaattaac
cagtgcatttttcatctttctacttcttcatcttccatgaagctctcaaa
gttaaatagaattaagcacataatatattcttataattgtgaaatgtcGT
TTGCGCTTtcgctacggtggagtgcatgacgtaactcgcgcggcaacaaa
ctcgccttctgttggctggtcatattgggcgttttggcgttaccaccctc
aaagCAAAGGGCGCCTTCGTCATTCCGTAACTCCGTAacaccattttaaa
tgagttaacaatagatccaaaagggcgccctcatcaagaaagatcatttg
ctttggtctccggctttgggaagcagtagtgtttttgattgttttcgatg
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tgatagaatggcaggatcctggatggtttccctaactgactGCGAAGGAG
CGCCAGGAAGCTATCAGTAGAAGaaatcacttttgtttttgttgcagatt
ttgatataaatctCTCACAGGGATTGCTTGTTAATGTGAAGTGttaactt
gtcagcattgtattgttgcagtctagtttctaatcctgatatagaaGTGT
AAGTCTAGACTGCTAGTGTGAATAAGGGTATTGACCAACTGTTTTACCAA
CCCCTTTCCCCCCTATGGAAATTTGGGGATAGAACCCTCTGGaaagtaaa
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AGAGAATCccttgaaattttctcaaactttcaacaaTAATAAATAATGTT
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GCACAAAAATGCAACGAATTTCCTAACAGACCCTTGCCTTTTCCTTTTCC
ATTCTAGGCTGAATGCAGAGACAATATTTGTAGATTGCTACCAACGTTAG
ATTTTGGTCGGAGTGAATCTGCTGTGAGGATCAATGGTATCGACACAGAA
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AGCTTTGATGGTTCCCAAAATTGAAGAAAGAGATCAATTAGTATGGGTGA
GTATCAATTCTTTTTTACCTTTCCTTGCGCACAATAAGCTCAGTTTTCAA
TCACTCAAacgtttcaatttcaaaacattgagaACACTGGGATCCAGAAC
AGAATACAAAATGGCGCACTAGTAGTTAGAGATTGCATGACTTGAATTCA
ATGGTTGCAGTGTTATATATAAATGAATCgaatataaatatatttttggt
tttatttttttctcaacaaaatgaataaaaaattaatttttcctttttag
tttaaatcaaaaGTGAATGATCTTATGAAAAACCACACCAACCAATCACC
ATTAAAAGTGATTTGTCAAACAGAAACTCCAATTGGAATGATGAATCTGC
GTGGaatcttggaagaatgtttgaTACCAGATAAGAATTTACAATTCGAA
GCTTTTGTATTTGGTTCAGATGATTTTTTAGCTAGTATTGGTAAGAACTG
TAAACTTTGTTGTAAGGGGCTATTCAAgatcttacccccccccctggact
gCCCTGGACAACAGATCTCACCGGtgtagtgaaaaatctgaaaaatttga
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atatccttcACCCCCATGTAGAAAGATTTTCTGGAAGTGCCCAAGTTTCA
TACTTGTGTAAATTTGAGTGAAAATTTCATGGTCATTCCTCACATTAAAA
TCTACAATATCTCAACTGACTTGGATTTAGGTTTACACaaattttttatc
ttaaatCTTTCTTGGGCCAGGCAGGGAGCTGAACTTTTGTTGGTACATCC
AGTTAAACTAATGAAAACCAAATGACACATTCTAAAGCtttgtgttaata
ttatttgtctttgttttttagtaaatgttgtaatttttataatgttttaC
ATACTAGGTGGCACAAGGACGGAGTCAGCCATCGAATTACTTTTTGCACG
CCAAAATTTTATTATGCATGTCAAAGGGTTTGGTCTACAAGCTATTGATA
TGGTTTACATCAACTTCAAAGGTACATAAAGCTAATTTAATGGATCATTT
ATGCCAGTGCAAAGTAGGGCGTTTTTATACGCACTTTACCTCCTTCAAGG
GTTGTTCCTCAATTAATGAACATTGTCTGTACTTTCTGTACCTCGAAAGA
TggttttatgaaaatatttctggAATTGATTCTTGACATTTACGAACAAT
TTATTCAATTGagggaaaaatttattttttacaaaattctgaGATTAAAT
GAATGGCGTACAGTAGCACATATCTACAATTTAAATAAATACTCCCATTA
TGTCaagtttttcacaaaattgatATCCCAACGTAGTACAGTACTTTTAT
TCCAAGTATCATTATTTTAATACATTTCATACACATCAAATCAAAAGGAC
GTGGTATACATTTTTGGGTTGATACTGAACCCTCCAAAAACAACATCACA
ATGGTGATGCAGCAGCCAGCAATAATCGGTGCAGAAAAGTTATCATAGTG
ATGTTGTgtctcattttatttttcatccaaTCTTTAGATCAAGAAGGTCT
TGAAAGGCAATCATCAGATGGAGCCAAAATGGGTTTTACAGGTTTGCCTT
TTAACTTTTGTCTGCAAATTATAAACATAAGCGGGTTTAATGGACATTCT
AACCAAAGCGGCCGGTGTATTTCTTTGTAGCCCTGGAGCCACTTATAGCT
ATTAGATAGACTGGATGGTGCTGATAAGTGGCTCCGTATTATTAGCTGAC
TCAATTTTTTGGCGTTGCTTGCGGTGGTAGCAAATCCATACCACCATACC
CAgtccctttttggagaaaaagaaACACCAAACTACACCCAAAagaccat
ttttttcaaatttggtaggtatttatgttttttttatagtttcataaact
tttatggagttttagaatgaaatttgttgttttattattttcatataatt
tttgaaaagtaaaaatgaaaaattccaaGATGGCGaaatcctctagtcta
cttcgCTGGACTTAGTGTCATCAAAAGCATCAgtaagcaaagttcagtca
gaataTAACACTCTAGTCTAGTTTATTTGTGACTGTCCAATTTTCTCGCT
TTATGTATGACTCTCGATTAAAGATCAAAACTATACTCGAAATGTAAAAT
TTCATCGCTACTAGATCGCTTTAAAAACCATACCAAGACTGAACCgattt
gttaatatttttaatgtattttcTttaaagtcaaaaaaggtgTACAAATC
TGTACCTAGCACTAGTAGCTAATAAAGTTTGATTGCCtgttttacaaaat
gaattatttctcatcatctgttgatgcccaaacgctgacgatttcttctg
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cCTTGTACGAAAGCATGGTTTTGACAGCAAACGCTTTCTTGCTGAGTTGT
CATAtacatttcaaatttattcatCTCATGTTAAAAAACCTAAtccttca
aacattttttaggAAAGCAGATCATTCATCCAGCACAAATAGACGTTGTA
AACAAAGCTTTTGCACCTACTGAAGAACGAATCGATTATGCTGAAAGATT
GGTCAAAGCATTCGATGCACACCAACTTACTGGGAAGGTAGGAAAAACCG
CATACTGTCCTGACAGGCTGCCCCCCGTTTTGAATatgaaaaacaacttt
tttatcCTCCCTTTTTCATCCCACTAGATGACACTTATCCAATTTTCCCC
ACCCTTTTCCAATTTTCTCTTAAAAAATCTCCCCTTTTCGCGAGACAGCT
TCCCtcgcgaaataatttaattttcgctggacttattttcgcgaattgga
aaattttttgcagattttcacatttttcgttAGTTTGATTACGAGATTTA
GTgtgtacagtagagtctccataactcgaacggctacgaggaatgaaaat
ttattcgaattatagagacatTCAAGTAATGGAGACACATTCAAGAGAGT
TTCTTAGCTGAAAGAATTTTTAGCTTAAACAAacttaattttcgcgagga
ttacaTTTTGCGAATTTAGCGAGAGatgagattttgaaattttttgcgaG
GGATTATATATTGCGAAAAAGGCAAAATTCGAATgcgaaatataatcctc
gcAAAAATGTTTTACCTGTTAAAGCTTTCTATAATCTAGAACCTCTATTC
TTCTTTGAACAATTTTGAAGGTATTTAATAATGTAAGACGTGAAATTTTT
AATAGATCAATTTTCCATTTCACCTTCTTCTCCAGGGAGCTTTCGCTTTC
GAAGGGAATATGATCGATATGCCAACTGTCCTTCAAGCCCAAAACATTCT
GAACCTCGCAAAGGCTATTGCTTGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000416_pilon:172066..181240+ >XLOC_013555 ID=XLOC_013555|Name=XLOC_013555|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1938bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000416_pilon:172066..181240+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCGGCAAatctttcactttcgattttgaaaaaagtagctCAAGTCAA
GATTATTCGTTATTCATCATCGATTGCAGGATTTAAACCTCGACGTTCTC
TTTTATATGTTCCTGGAGATGAAAACAAGAAAGTACAAAAGGCATCTGGT
TTAGATGCTGATGTTGTTGTCCTAGATTGTGAAGATGGAGTTGCTCAATC
AAAAAAGATGGCGGCAAatctttcactttcgattttgaaaaaagtagctC
AAGTCAAGATTATTCGTTATTCATCATCGATTGCAGGATTTAAACCTCGA
CGTTCTCTTTTATATGTTCCTGGAGATGAAAACAAGAAAGTACAAAAGGC
ATCTGGTTTAGATGCTGATGTTGTTGTCCTAGATTGTGAAGATGGAGTTG
CTCAATCAAAAAAGGCTGAATGCAGAGACAATATTTGTAGATTGCTACCA
ACGTTAGATTTTGGTCGGAGTGAATCTGCTGTGAGGATCAATGGTATCGA
CACAGAATATGCTGCTGAAGATATTAAAGCAGTTTTTTCTTCTGAAACCT
TGCCCAAAGCTTTGATGGTTCCCAAAATTGAAGAAAGAGATCAATTAGTA
TGGGCTGAATGCAGAGACAATATTTGTAGATTGCTACCAACGTTAGATTT
TGGTCGGAGTGAATCTGCTGTGAGGATCAATGGTATCGACACAGAATATG
CTGCTGAAGATATTAAAGCAGTTTTTTCTTCTGAAACCTTGCCCAAAGCT
TTGATGGTTCCCAAAATTGAAGAAAGAGATCAATTAGTATGGtttaaatc
aaaaGTGAATGATCTTATGAAAAACCACACCAACCAATCACCATTAAAAG
TGATTTGTCAAACAGAAACTCCAATTGGAATGATGAATCTGCGTGGaatc
ttggaagaatgtttgaTACCAGATAAGAATTTACAATTCGAAGCTTTTGT
ATTTGGTTCAGATGATTTTTTAGCTAGTATTGtttaaatcaaaaGTGAAT
GATCTTATGAAAAACCACACCAACCAATCACCATTAAAAGTGATTTGTCA
AACAGAAACTCCAATTGGAATGATGAATCTGCGTGGaatcttggaagaat
gtttgaTACCAGATAAGAATTTACAATTCGAAGCTTTTGTATTTGGTTCA
GATGATTTTTTAGCTAGTATTGGTGGCACAAGGACGGAGTCAGCCATCGA
ATTACTTTTTGCACGCCAAAATTTTATTATGCATGTCAAAGGGTTTGGTC
TACAAGCTATTGATATGGTTTACATCAACTTCAAAGGTGGCACAAGGACG
GAGTCAGCCATCGAATTACTTTTTGCACGCCAAAATTTTATTATGCATGT
CAAAGGGTTTGGTCTACAAGCTATTGATATGGTTTACATCAACTTCAAAG
ATCAAGAAGGTCTTGAAAGGCAATCATCAGATGGAGCCAAAATGGGTTTT
ACAGATCAAGAAGGTCTTGAAAGGCAATCATCAGATGGAGCCAAAATGGG
TTTTACAGgAAAGCAGATCATTCATCCAGCACAAATAGACGTTGTAAACA
AAGCTTTTGCACCTACTGAAGAACGAATCGATTATGCTGAAAGATTGGTC
AAAGCATTCGATGCACACCAACTTACTGGGAAGgAAAGCAGATCATTCAT
CCAGCACAAATAGACGTTGTAAACAAAGCTTTTGCACCTACTGAAGAACG
AATCGATTATGCTGAAAGATTGGTCAAAGCATTCGATGCACACCAACTTA
CTGGGAAGGGAGCTTTCGCTTTCGAAGGGAATATGATCGATATGCCAACT
GTCCTTCAAGCCCAAAACATTCTGAACCTCGCAAAGGCTATTGCTTGAGG
AGCTTTCGCTTTCGAAGGGAATATGATCGATATGCCAACTGTCCTTCAAG
CCCAAAACATTCTGAACCTCGCAAAGGCTATTGCTTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000416_pilon | genome | sc0000416_pilon:172066..181240 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 880-969:9086 |
| Aaloc | 757-879:8315 |
| Aaloc | 703-753:7340 |
| Aaloc | 589-699:6710 |
| Aaloc | 397-585:6051 |
| Aaloc | 208-396:5608 |
| Aaloc | 1-207:1 |
|
