XLOC_013549 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_013549
Unique NameXLOC_013549
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000416_pilon:151806..160983-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_013549 ID=XLOC_013549|Name=XLOC_013549|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=9178bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000416_pilon:151806..160983- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAAAGAAAACAAACAAAATAAAGAAATGTTTGAAAAGATCTTTTCTAC CGATGAGTTTCACAAAAGAATATGTGGCTTCGACTTTGAGGAAGCCTTTG ATATCTGGAACCAAAAACCGCAAGTTGCCAACAGAAGATTAGCTGGTGCT TTAAAAATCACTGAAAATATCGATATTATTTATGATTCTGATAATGTTGA TGACTGCGTCACATGCATAAAGGGTATACTCTCAAATATCGAAGAGGATG GTTTCAAGCAATGGTATTTAGAAAATGACGACAACATTCGAAATATGCTG TCTCCAATGATGGAATATTTTTGTTTTCATAAGATTTATCGAACAGAAAC GAATACTATTACACTCTTTGTAAGGAAATTGTTACCTCGCTCCATTGAGA GGTACAAAAACACATATGAGATGGTGTTGTGGAAGTCAGGTAAGTTCAAC CTCATTCAAAACCTGTCAGTAGTCTCTTAGTTTAGTGTTTATTTGGAAAA TCTGAAAAAAAAGTATTTCCTAACTTTCAAGAATTCAAATGCACCAGTAA GTGTTTTTGGCAAATTGCTTCATACTCTGGAGACCAGACTCAAATGTATG AATTTTCTTCCAAAAAAATTAGCTGTTAGAATTCATCATCTGTGTATTTT AGACCACTCGATATCCGCCATTATGTACATACCCTTATGTATAGGTGAAA CCAATGAAACATGTTTATCATCAAGAAGTTATGTCTTTGTTATGGTGGAA GCAGATCGCAGGTGACTCTTTTTTTTGTATTACAGTTAAGTCCGAACAAA TTTGTGTTTGCTGTGTGTGTTCGAGTTATTGAGACTTCATTGCGTTAATA GTGCGTTAATTACATCCCAAAACCTGGAAAAGTGTTTTAATTAGTAAATT TCTCTTGTCCTCTTTTATTATATCCAGATACTAATGTATTTTTAAAAGGT 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AGTGCAATTTTTTAATTTCAATTTTGAGTGGAGATGAAATCAAATTCAAT TTCCCAGTGGGGCTGAAATTCAAGGGTATTTTACCACCGGGGACAAAGTT TTTGCTTAATTTGTGACACAGGGACGTGTTTAAATCTTATATAGAAAGTT TTTATTTTTTCATTTTGCCTAAAATGCTCGGTCAATAGTTAAATTTCCTA AAATTTGTTGGTTTTTAGTACACATGGTACTAAAATGCTTTCAGGCTTTT TTTGTAATACCACCACGTCACTAAAAGTCATGATGACTGAAGTTTTAGTA CCGACCCCCCCCTGCGGTTATTCGTATAAAAGTACGTTTTCCTATTTCAG GATTGATGTTTTAACGCACCAAAACTTTACAACGACTGATGTCCCAACTC ACTGTTTAGTAACCAGTCAAGAGTGGCTTCACACTGTTCTTATCAAGAAG ATAACAGCCTGGATGGAAGCTGCATCACTGTCTGACCACGGATTAAGAAA ACAACAAACACTTTCTCAAATCAACATTGAATCCTACATGCAAACGTATA ATAGACTCAAGAAAAAATACGGACCTTACTTCGTGGAGGTATAGCTTTCC GGCTACATTTATGTGGCGGAGTCGGATTTTTGAGAGAAAAAAATGCCGCA AATATGCCGGAAATCGCTGTTTTTGCAGATTTTCATTGTATTTTTCCTGT TATTTCTTTGTTTTTCACACAAAAACATTATTGATAACAATGCCCACCAT CGGCTACATTTAAAGGTTTTATTTTTACATACAGTATACGGCCCCCAAAA CGTCTATCAAATTGAAATCTTTCTAGTAAATTCAGAAAACAGGGAACGTT AAATCTTTTTAGTAGTAAGGAAAAAAATTCTGACCCACGGTTAAAAATGC GATACTAACAGCTTATTTTCTGGGTGTTAGTGGCTTGATGATTTCTTTGC ATTCATCTTCTTCAATACAATACAATCTTTCATTAATCATTATTTTATCT TCAGAATTGGACTGAAAGTACAGATGCCCAAAAATTTGTGTATGAAGATA TAGCATTGGCATCTTATCTCATAGTATGTTCCAATCAACTTTGTCAAAAC CATTTGGACCAGAGGAAACTGGTTCTGTTAAATATTTAATTTTTGATATT CATGGCGTAATATTTTTATACGGAAACACACGAAAAAAAACGGGGTGTTT GCCACCCGTTTAATTTTTCAAATTCAAAACTAGTGGCGAATTCCCGGTGC TTTTCGGTTGTTTCTATATAAAAGATTACGTCATGAATATCAAGGTTTCA ATTTGCCAAATTCGCTAAAAATCTTTCTCGCTAAAATTTTTTCCCCTCAG CAAAAGATATAACTTTGTTTTTTTGTAGGTGTTATGGAGCAAAGAACGCG AAGAAAGAGATTTGTTAAAGATGCAATCATTTATTGATTTGGGATGTGGG AACGGTTTACTTGTTCACATTCTCTCTTCCGAAGGGGTATTCATGATATG CACCATTGCAATGTCTTCTGAAATTACATCACGGACCCAATAGCTGATTG GGTCTAAGTGACGTAAAATCAGTCAATACGTCACTTTCAACCAATCAGCT GCTGGGTCCGTGGAAGACATTGTAACGATTTATCTAACACTCACAGAAAG ACTGTCTAGAGTACTGCGATCTTAGCGAGGTAGTTTCTCGGTTGAAACCG GATTGGAACACTTAATCATTTATGGCGATTAATATGACGTATCTTAAAAT TTTATGCCGGTGTAGCTTCACTTTGGTTTAGATTTCAAAGAAAAATTCTC TAACAATTATTGACGAGCAAAGTAAACTTCTCTAACAATTATTGACTAGC AAAGTAAACTAGGAACGCTTGACAAGGACACCATTTTGGAAGAAGAACAT CAAAATTCAAAACAGCGGAAAAGCTACTATTGAACAAAAAATAATGACAA ATGAGAAACCAACATGAAGAACAGATTTGCAATACCGTATTTTCAAATAA AGACATTGTCCCACCAATTTTTCTAAACTGGAATCTGTTTTTGCCTAAGC CAAGGCTCAAAATTGAGAATAATCCCATACTACCGGGCCACTTAATCCCG CCATTGACCCCATGCTATTTTAGTGTCACGGAGTGTAATGGTCGCTTAGT TATACCTATATTACTTTTTAGCATCCTGGTAGAGGAGTGGACTTGGCAAG AAGGAAGATTTGGAATATGTATGGTGAAAATACCAAGTTAGAGGTAAAAG TTATTCAGAAGGGTCTGCTTTGATTCCAGGGTTCGAAAAATATAATTTAC AGTAACAAAAGCCCATTGGTGATTTTTTTTTAAATCACGAATTTTTCAGC CAAAAATTTTTTCTTTTGGTTCTCTAAAACAAGCAAAAAAAAATTTTGCA AATATATTTGACTATCAAAAGTAAAGAAAAGTAGATTTTCTAGACCATTC TTTATGTCTTTCAAGTGATCGAACACTGCCACCTTATCCTCCCACCTTAT TTTCTTAACAAAAACAGGCGTTTTCATGAAAAAGCCACAGAAAAAAGTGC CTTTCTGTCTCACTGCACTGCCATTTTATGATTTCGGCTTGTTTACCCAG AGGTTGACGCAATTCCTCCATGGTGAACGAGTTCCATGGACTTTTAACGG TGAATGCACTAAATGATGTTTTCTACTATCCATTTGTTTAATTCAAATGA AACAGATTTGGTTTTAACGCTTTTCTTGCGGAATCAAAAGTGTTCTGACA CGTAAAAGAACAATTTGACTTTACCGCGGAGAACTGTTTGTCCTTTGTAG GGAAGGAAAATATTATCCCTCGAGAGAATGGGAACAATAAGTTCATAGGT TCATTTGAAAACAGAAGAAATGAACTGTTCTTTCATTAGGCTGGACTTAA AAAAATGTTGGTTTGCCGTCAGCCGAACGACTCTGAAAAATTCCATGAAT GACCAAAATAACAAAATTCTCCGACCGACGCACCTCCAAAATCTAGGGTC CGGTGATGGCAAACCAATAATGTTTTACGTCCAGCCTCCTTGAGAACATT TTAAGTAGTTTTTTATAGGGACACATTAACAACATTCTACCATTTTTTAA ACACCATCAGGTGGAAACCATACTACCGGACACTACCACTGTCACTGAAG ACTGGATTATTGGTAATCATTCAGACGAACTAACACCGTGGATTCCAGTT ATAGCCTCTAGGTTTGTCTCAATTATTGATAGACAATCACTTTAACAGCT TTCACCATTTCCGTGTCGCTGTCGGCATATTTGTTTATATATGTTTAAAA ATACCCTTAAAAATACGAACGGCAGTTAAAGGGTTAAAGTTCCATTCGGT TTCGCTGCAGCTCCCAGTTACTTGATATACTATAATTTTAATGGCTAAAA CATTAGTTGATTTTAAACTATGAAGAATTAGAGCTGAGAATTCACTAGAA AATAAGCGCATTGGTATAATTACTTTAACATAATTATTTTCTTATTGTAG ATCTTCTTTTGACACGCGATATTTCGTTCTCCCGTGCTGTTTTCATGATT TTTATAATAAGGTACAGAACTTTTTTTCTTGATTGAATTTCAGGCATTCA CAATTTATCTTTCTGTTCCGCTCTGAAACGAAATGAAGCCATTATATTGC TTAAACTTGATGTTTACGTCACTTTTAACCAATAGAATGGCTCAGGGTAG CACTTGATTTAAAAGCCGTATGTGCGTATGTACGGTGAAAAGATAGACCT TGAAAATCTTACCCTTACAGTGTAGAGGAAATTTAGCCATTTTTTCTTAC GTTTTATTTTCGTGAAAATATTTCTCAATTTAAGGCTAAAAGTGGTAAGA TTTTTAAAGCTTTGCCCAAAAAAAAACTTCGCTTTCTCATTTCGTTTCTT ATCTGACTTTGGGAAGGCTGAAAACGCACCCTTGTGGGCTGCAACTAAGG TCGGCCGCTCACCTTGAATGCCTCCCCCAGGAAGGGATTTATTCTATATA GAGGGAATGGAAGTTAAAAACAACGTTTTCTTTTTTGAGCGTTTCATCCT TCGGTTTCGTGAAGTATGTCTCCATAAGCTAGTCTCCAAGGTAAGGGGGG TTTTGAAGCACTGTTAGGACAAAAAGTTTGCAATGTCAAACATTTCTAGT AACTTGAATAAGGCTTTTCCAGAAAAAAATTGAATATGGGGATGGAGGAT ATAACAATTTTTGGAAATTTACCCGGATATTGTGACTTTCGGACAATTAA AATTACCCTCAAACAGAGTGAAATTACCCCCAAACAGAGAAAGGCAAAAG ACAAATTTTGCAGATTTTTCACTACCCCCCGGACATTATATCCTCTACCC CCAATGTACGGACATTATCTCGAAGAGCCCATAGGTTGATCCTCCTGAAT AGAATTTCATAAAAAAAAAGCCAAAAAGCTTTTCAAGGGGGCGCCAAGAT TTTGTTGATGTTTAATTGGGCAATTTGGCGCCCTTCGGGACGTTTATAGC GCCGTACAATGTTAATTCTTTTCGCCTGCGGCGCTTTATTTTACCCTCTT GCATCCTTTCTCTTGAATTTTTTCAAAACTTCTATCAATATTGAATCAGA AGTAAGAGAAGTGTTGTGTATCCACCAGGGGTTAAGGTGAATGTGTCGCC CTTATAAATTGGGCTTATCTGATATTCCGATGGTGTATTGGCGGCCGCCC ACGCTAAAGCTCTGAAGGAGCGGGCCAATATCACCATCGGAGACCTATAG TAGTCATCGTTTGATGTACCGCATCACAGTCGTGTCTAGCTGTCCTTACA CTTTTTGCATGAAAATCTCTGCTGCCTGAAAAACCTTACAGAAAAATGAT AACCCAAAGATTCCAGATGTTAAAATTTTCCCGACCTTCAGAGCTTTAGC GTGTCGGAAGAAAATTTCTACATCGAGTACCAGATAAGAATTGGGCGTAT GAGAGTGCTCTTCCGCGGCCCGCTAGAAATGTTTGTTTGACGGATATGAA AGTCAGTTTTGATGGAAATCAAAGATGGCGTCTGTTGTTTCATTCGACAT CTAAGTTTTGTTGCAAGAAGAGAAATTTAACATTATTTAGCAAACTCGAT TCGACTCAAATTTATTGCTCACTTTCCCCTAGTTACAAACGCTCACCCCC AAAATGAGAGATTGCCAAAATGATCAAAACTTGTTGATTCTCTCTGTGGT TTTTGTGGTCTTATACTGACTAACTGTCTCCGTTTTAGAAGATCTTTTAA GCTGTTTGACCTTTCTTACACCAAAATTTTTTCCCTGCGGCGCCAAAATT AGAACGAACCCTTCCTCCCAACTTCTGATTTTTTGGGCCCTTTTTAAGCC ATGATCTTTAATGGAGAGTAAAGTAAGACCAGTGGCGTAAAAAGTTTAAA GATTAACAGGTAATTTTTCGGATAAGAGTTTTAGAAAGCAAAAATATAGA CTAAATCGACTTACCAGGTATTTCCATTTCAAAGATTAGGGGCGTTACTT TCAACCAGTCACTGCTCTTACAGTTTAATATTTTCACTTAATGATGGAGG GCGCAAATAAGGACAAAAATACCAGGGGCGCCAATTTCATAGTTTGCACC ACCAAGAAAATTAAGCCAGGCCGCTACTGCTCCCAAATATTATTTTCTTC TTAGTTTCACCATAAAGACCAGAAGAAATCACATTATGAAAGTTATTTGG AACATATACTTCAAATTGGAAGAGAGTGTCTTTTCGAAGTCGCTCAGGAT ATGTTAAGGATACCATCTACCAAAAGAGTAAGAAATCATTCATTGTCTAT CAACAGATATGTAAACTTTCTGCCTCAGTATAATCTACAGCGAAAACAAA AAAGGCTGTAGCTACCGATAGAGTTAGCTTTTTTTTGCTTGTTGAAAAGA TAATTAGGAGTGGAAGATTATCATATAGAAAAAAAATCAAAAAATCGAAA ATTGAAGATGAAAACGAAAAGGAAAAAATAAACTTCTTCAATAACTAAGC TCTAATTATCATGTTTACATGAACGCTTTATTGAGGAAGGTACTAGGGTA AAAGTATAACTTGCTCTTTCCTCTTTCAAATGAGCCAAAAGGAATTTTAC GCTAGAATTATATCACAGCAGCTCAGTTGCAATTGTAATTTTAGTTATTG ATCAACGAAAGGTAAATTCACCAGGCTCGCTTTTGATTATTATTTTATTG CTCCTTTTGTTGTAACAAATTGGAATAGGATGAATTCAAACTAAATTCTT TTTCAAAACAGATTGTATCTTTAATATTTTTCTTAGATTTGTCAGATTGG TACCCGCCGGAACTCAACTTATGAACAG

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000416_pilon:151806..160983-

>XLOC_013549 ID=XLOC_013549|Name=XLOC_013549|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2724bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000416_pilon:151806..160983- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAAAGAAAACAAACAAAATAAAGAAATGTTTGAAAAGATCTTTTCTAC
CGATGAGTTTCACAAAAGAATATGTGGCTTCGACTTTGAGGAAGCCTTTG
ATATCTGGAACCAAAAACCGCAAGTTGCCAACAGAAGATTAGCTGGTGCT
TTAAAAATCACTGAAAATATCGATATTATTTATGATTCTGATAATGTTGA
TGACTGCGTCACATGCATAAAGGGTATACTCTCAAATATCGAAGAGGATG
GTTTCAAGCAATGGTATTTAGAAAATGACGACAACATTCGAAATATGCTG
TCTCCAATGATGGAATATTTTTGTTTTCATAAGATTTATCGAACAGAAAC
GAATACTATTACACTCTTTGTAAGGAAATTGTTACCTCGCTCCATTGAGA
GGTACAAAAACACATATGAGATGGTGTTGTGGAAGTCAGATGAAAGAAAA
CAAACAAAATAAAGAAATGTTTGAAAAGATCTTTTCTACCGATGAGTTTC
ACAAAAGAATATGTGGCTTCGACTTTGAGGAAGCCTTTGATATCTGGAAC
CAAAAACCGCAAGTTGCCAACAGAAGATTAGCTGGTGCTTTAAAAATCAC
TGAAAATATCGATATTATTTATGATTCTGATAATGTTGATGACTGCGTCA
CATGCATAAAGGGTATACTCTCAAATATCGAAGAGGATGGTTTCAAGCAA
TGGTATTTAGAAAATGACGACAACATTCGAAATATGCTGTCTCCAATGAT
GGAATATTTTTGTTTTCATAAGATTTATCGAACAGAAACGAATACTATTA
CACTCTTTGTAAGGAAATTGTTACCTCGCTCCATTGAGAGGTACAAAAAC
ACATATGAGATGGTGTTGTGGAAGTCAGACCACTCGATATCCGCCATTAT
GTACATACCCTTATGTATAGGTGAAACCAATGAAACATGTTTATCATCAA
GAAGTTATGTCTTTGTTATGGTGGAAGCAGATCGCAGACCACTCGATATC
CGCCATTATGTACATACCCTTATGTATAGGTGAAACCAATGAAACATGTT
TATCATCAAGAAGTTATGTCTTTGTTATGGTGGAAGCAGATCGCAGGATT
GATGTTTTAACGCACCAAAACTTTACAACGACTGATGTCCCAACTCACTG
TTTAGTAACCAGTCAAGAGTGGCTTCACACTGTTCTTATCAAGAAGATAA
CAGCCTGGATGGAAGCTGCATCACTGTCTGACCACGGATTAAGAAAACAA
CAAACACTTTCTCAAATCAACATTGAATCCTACATGCAAACGTATAATAG
ACTCAAGAAAAAATACGGACCTTACTTCGTGGAGGATTGATGTTTTAACG
CACCAAAACTTTACAACGACTGATGTCCCAACTCACTGTTTAGTAACCAG
TCAAGAGTGGCTTCACACTGTTCTTATCAAGAAGATAACAGCCTGGATGG
AAGCTGCATCACTGTCTGACCACGGATTAAGAAAACAACAAACACTTTCT
CAAATCAACATTGAATCCTACATGCAAACGTATAATAGACTCAAGAAAAA
ATACGGACCTTACTTCGTGGAGAATTGGACTGAAAGTACAGATGCCCAAA
AATTTGTGTATGAAGATATAGCATTGGCATCTTATCTCATAAATTGGACT
GAAAGTACAGATGCCCAAAAATTTGTGTATGAAGATATAGCATTGGCATC
TTATCTCATAGTGTTATGGAGCAAAGAACGCGAAGAAAGAGATTTGTTAA
AGATGCAATCATTTATTGATTTGGGATGTGGGAACGGTTTACTTGTTCAC
ATTCTCTCTTCCGAAGGGGTGTTATGGAGCAAAGAACGCGAAGAAAGAGA
TTTGTTAAAGATGCAATCATTTATTGATTTGGGATGTGGGAACGGTTTAC
TTGTTCACATTCTCTCTTCCGAAGGGCATCCTGGTAGAGGAGTGGACTTG
GCAAGAAGGAAGATTTGGAATATGTATGGTGAAAATACCAAGTTAGAGCA
TCCTGGTAGAGGAGTGGACTTGGCAAGAAGGAAGATTTGGAATATGTATG
GTGAAAATACCAAGTTAGAGGTGGAAACCATACTACCGGACACTACCACT
GTCACTGAAGACTGGATTATTGGTAATCATTCAGACGAACTAACACCGTG
GATTCCAGTTATAGCCTCTAGGTGGAAACCATACTACCGGACACTACCAC
TGTCACTGAAGACTGGATTATTGGTAATCATTCAGACGAACTAACACCGT
GGATTCCAGTTATAGCCTCTAGATCTTCTTTTGACACGCGATATTTCGTT
CTCCCGTGCTGTTTTCATGATTTTTATAATAAGATCTTCTTTTGACACGC
GATATTTCGTTCTCCCGTGCTGTTTTCATGATTTTTATAATAAGTTTCAC
CATAAAGACCAGAAGAAATCACATTATGAAAGTTATTTGGAACATATACT
TCAAATTGGAAGAGAGTGTCTTTTCGAAGTCGCTCAGGATATGTTAAGGA
TACCATCTACCAAAAGATTTCACCATAAAGACCAGAAGAAATCACATTAT
GAAAGTTATTTGGAACATATACTTCAAATTGGAAGAGAGTGTCTTTTCGA
AGTCGCTCAGGATATGTTAAGGATACCATCTACCAAAAGAATTTGTCAGA
TTGGTACCCGCCGGAACTCAACTTATGAACAGATTTGTCAGATTGGTACC
CGCCGGAACTCAACTTATGAACAG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_013549XLOC_013549-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000416_pilongenomesc0000416_pilon:151806..160983 -
Properties
Property NameValue
Aaloc1321-1362:43
Aaloc1198-1320:675
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Aaloc1-438:9179