|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000345_pilon:136338..141048- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_013545 ID=XLOC_013545|Name=XLOC_013545|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=4711bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000345_pilon:136338..141048- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCTTTTCTGCGATTTAATGTTCATGTAAGTTTAAAATGTTCATGTTC
ATGACTTTTGCTTTCAAGCGAGCTTCTTCTATTCTCTAGTTTGTCATTTG
TTTCCCAGTGCCAGTGTGTTCAGTCAAGTCCAGGGTAGCTATCAGGCTAT
CTGGCTATTCTATCTGTCTATTAGTCCAGAAGCTGCAGCTCAACATTATG
CCTTTAATGAGGGGAAAGGTGAAGGTAGAGATCGCAGCGCCATCATTCAA
ATCAGAAAGCGAAGAGAGCTTTTAAATGCAGGAAATTTCTGACTATGCAT
GTAGCTATGCTTTTAGCTATAAACTATTGAGCTACGGTACAAGATTATAA
ATATTGTGCAGATTATTATATCACTCTTGACTTGATGCTGTGCAAGTGTT
ATATAGCGAGGCAGGGTATACGTATAACGGTATAGCTGCTGGGCGGGGGA
AGTATTATTTAGGAGAGGATAAAACCTCAGGCTCAGGCAAGTTAAGGCCT
GTGCAAAAAATTCGATAAATCGTAACGGCTGTGGCGGCCAGTTATTCCAC
CCCTTTTTATGGGAAAATTTTTCGTTATTTTCACTCTTCATGTTAATACC
TTTCAGAAAAGTCCTGGGCCAAAAATTCTGTTTCTGCTATTTAGGGAAAT
TTAAGGCAAAACACTTTTTGGCTGACATCAGCAAAAATTTTAAATACTAA
TAACCCCCGGAATATTTATTGAAATGAGCTCAAATTTTGTACGAAAGTAG
GGTGGATAAATATCTTTCATTTCCAAAAAAAATGTTTCAAAAGATTGATG
ACGTCAGCAAAAATCAACAATTTTCGTTTTTTCTAAAAAAATGCTGACAT
CATCAATTTTTTGGAAACAAGAGATGTTTATAAATCCTACCTTTGTACCA
AATTTGAGCTCATTTGGATAAATATTCCAGTTTCCTTAATTTTATCAAAA
TGGCAAGGCTGGAAACACAATTTTTGGCCCAGGACTTTTTGAAAAGGTAT
TAATATGACGAGTGAGAAAAATCAAAAATTTTTCCCAAAAAGCCAAAGCA
TTATTTGATTGATTCGTTAATTTTTTACACAGGCCTTAACTTGCCCGAGA
CATTGAAAAAATTTTCTTGGTAACCTTCTGAAACATATTTTTGAACACTC
CTGTCCTGTTATTTTTCTGGTTAAAGTGGCTGGAATCTTATAGGAGAACC
CCTTCTGAACAACTCTGATCTAGGTTACACACAATATTTCTTTAGGGACC
ATTCAAAAAGTACGTACGCTCAAAATCAGTGAAAATTGACCACCCTCTCC
CCCCTTGTACGCTCTCGTACGCTTTGGCATTACCCTTTCGTGTATGTACG
CTTTTGAAATGACCCCCCCCCTCAAAAATTTTAGATCATATTAAATAAAG
AGTATACAAAGGTAAATTAGGGGATTTTGAGAAAAATTGAAACAATTTCA
ACTTCTGTTTGTCTTTGTTGATGATATAAAAATGTCAAAGCGTACATACC
TTTCTACCTGACCTCCCCCTCCCCCTCGTACGCTTTTGGTCGTACCCTCC
CCCTCCCCCTCAGAGCGTACGTACTTTTGGAATGGTCCCTTATTGCTATT
GGAAAATCATATTTTTTCAAGGCTGCTCACACTGTAAGTTGGTCTCTAAT
GTTGGCATCTGTCTTATAATTTTGACACCCTTCTTTAGAGATAGGAACAA
TAGAAAGTGAGGAAGGTCAGAATCGCTGATTGACTTTGATTAGCACGATG
AGAGGAAAAAATCTTTAGTCTATCAGTGATTTCGACCTTCCTACCGGGTG
TCCCAGAAAAAAGTTCCGCTCTTTGAAGTGAATTTTCTCGAGTTCTATGA
GCTTTTAAATAATAAAGCTTTTTGCATTGCAAAGAAGAAGGATAAACTTA
AATTTTGAGGGGTCATTTATTAAATTAAGTCAACATGATCAAAAGTTATA
GCCTAAATGTTAAAACATCACTTTTCAAAAAAGTCAAAAAAAGACGAAAA
AAGAGGGGATTAAATTCATTGTAAGACAAAGACACAAAAAGCTTTGAAAA
CTCTTGGTAAGATTTTGATGAATGTTTGGAGTTTGAAAAAGCATCGTGCC
CCTTGATTATGCCCATGGGAGCTCGTTAAATTAGACAAAGAAAAGAAAAG
GAATTAACAATAAAATAAAGACACCTTAAAGAACTGCATGGAAAAAACTT
TGACCTTAAAATAAATTGGCAAAAGAAGTGCTTTCTTTATGATGATTTAA
TCTCCTCTTTTTTCGTCTTTTTTTGACTTTTTTGAAAGTGATGTTTTAGC
ATTTAGGCTATAACTTTTGATCAAGTTGACTTAATTTAATAAATGACCCC
TCAAAATTTAAGTTTATCCTTCCTCTTTCCAATGCAAAAAGATTCATTAT
TTAAAAGCTCATAGAGCTCGATAAAATTCACTTCAAAGAGCGGAACTTTT
TTCTGGGACACCCGGTATTATTCCTATCCATAAAGAAGGGTGTCGAAATT
AGAAGACGGATGTCGACATTAGACCAACTTACGATACTCTTCTGTGTGCT
GTGGAACTGGCATGTCAAAATGTTAATCTATTCATCATGTCAAAAAACAA
AATTTATTGGTATCAACCCCCTAATGCCCTAATGACAACAAACTGATGGT
TCAGAGATTAAAACGAGTCGACAACTTTCTTTATCTTGTAAAGTTACACT
GAAACACGACAGATCACATGCAATACTGTGCCGTGAGATCAGGTAACTTG
CATCATTGGAGACTAACATGCATTATAGCCCTCAAATGAATGACTTAGCT
GGTCATTAAAATACAAAGCTAAATCAAAACAAAAATCGTAGAGTAGAGCT
GCTTTGAAATTTTGCTGCTATGATTGGTCAGTCATTTGATGGCTATGCAA
GTTTCCCTCCACTGATGCAAGTTACCCGACTTCAAGGTACGAACGTCAGA
AAGCCAAAGCCTGGAATGCTCTTCATTCTCTTTGCAAAGTATGGGATAAA
AAGTATGGGATAAAAAGTATGGAAATCGAACATCTCAAAATCTATCAAAA
CTGCCAAAACTGTTAGGTGGCTCAAAAACTTGGACCTTTTTAATATCTCA
ATAACAAAACGCCACGTCAGACATGTCCAATCCAATAATCGCCTTTTGGT
CCGAAAAATTAAACAAACTACATGTGTTTTTTTATAAGTATTATTGCACT
TGTAAGCATATTCTGGGCTCAGATACAGGGGAAAATTAAGCATACAGTAT
GGCAAGCATTACCTTGAGCCTACGTTTTTTCCTGATTTTGGCTTTTTTTG
GCTGGAATTTTTAGTCTTTTCAGTATTTCCCTAAATTTTTGCTTTGGATA
TAAGCATCCCTCAAGCATTCAGCCTTACTAAGCTTTCGACCTAAGCATCG
TTTTCGGATTTTTATATGCTTATTAAAAAAAACATGTTATACAAATCTAA
AAATTGGTGAAGGGTATTTATTCGCCCTATTTTTAGATTAAAATATGTTT
GCCTGTTTGGATGTTTCCAATTTGTGACCTTCTTTCTATCATCAGAGCTG
CAGGGCTCGAAATAACGATATTTAGGTGGTCGGACACATTGTCCGATCAA
AAATTGATTTGGGTCGGACATGTTCTAAGGCTTTTAAAGTAAAATGGGTC
GGACATGTCCGATTGATTTTTATGTGGGGTATACTTCAAGTCTAATACAA
GCTTCTGATAGAATTTTCACATTGATCACGAAGAAGCTAAACAAATGTCA
ATTAATGGTCAGAAGCCCATGATTTTTACTTGAAGCATCCTTTCATTTGT
TGAGAAAAAGCATCACACAAAATGAATATCTAACACTAATGATCGCAACT
TTGAGAGTTTTTGTGTGTAAATAAATAAGTTACTAATTCTATGTAAATTA
TAATTTCTTTTGGAAATATCACAACGCATCCTGACAAATTTTTTGGAGGC
ACCAAAAGTAATTGGGTCGGACATGATGTCCGACTAGAATCGATTTGGGT
CGAACATCAGCAATTGGGTCGGACAATGTCCGATGTCCGACCGTTATTTC
GAGCCCTAGAGCTGGACCATACCAGCCAAATCAAAATACATTTAACAATA
AATATTTTGTAATTTTATATTTCTGAAAGGTCTAATCATAACTAGTACCT
ATCAGATTAAATGCAACTTTGATTCAAACATGGCAGAAGAAATTGACATT
TTGAAAAAAAGTAACAAGGTAATCAATCTTATTTCTACATGCCAATAATA
TCCATAAGGGAGAGGTGAGGGTGTAGCTGTATATATAATAGAACAAAATA
CTTAATTACCCAAAACATGCCCTTGCACCTAACTATAGATTTATATTATT
TTATTTGAGTTATATTTGGCCTAAGTCTAGTTATTTTTTTATTAACTCTT
ATTTGAAATATTTACAGTTACAATTAATGATGACTAAGCTAATGTTTAAA
ATTGAAGATTATTATAATTAGGATATTCTTTTTAGAGGAAAGGACGTCCA
ACTGACAGAGAGAAGCTCAATGAGTATTTAGCATCCAAGAAAAAACATAA
TACTGTTACTAACTACTACTCAAATAAAAACGATGACAGTAATAAAGAAA
ATGACCAATACTCTTTCCCAGGAAACAAAAACAGCGAGGTGGAAATAACC
TATCAAACCATCTACTAAAGAATGTGGTATACAAGTTAATCCTGAAGATG
TAACAAGCAAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000345_pilon:136338..141048- >XLOC_013545 ID=XLOC_013545|Name=XLOC_013545|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=506bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000345_pilon:136338..141048- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCTTTTCTGCGATTTAATGTTCATATGGCTTTTCTGCGATTTAATGT
TCATAGGAAAGGACGTCCAACTGACAGAGAGAAGCTCAATGAGTATTTAG
CATCCAAGAAAAAACATAATACTGTTACTAACTACTACTCAAATAAAAAC
GATGACAGTAATAAAGAAAATGACCAATACTCTTTCCCAGGAAACAAAAA
CAGCGAGGTGGAAATAACCTATCAAACCATCTACTAAAGAATGTGGTATA
CAAGTTAATCCTGAAGATGTAACAAGCAAAAGGAAAGGACGTCCAACTGA
CAGAGAGAAGCTCAATGAGTATTTAGCATCCAAGAAAAAACATAATACTG
TTACTAACTACTACTCAAATAAAAACGATGACAGTAATAAAGAAAATGAC
CAATACTCTTTCCCAGGAAACAAAAACAGCGAGGTGGAAATAACCTATCA
AACCATCTACTAAAGAATGTGGTATACAAGTTAATCCTGAAGATGTAACA
AGCAAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000345_pilon | genome | sc0000345_pilon:136338..141048 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 196-252:58 |
| Aaloc | 91-192:161 |
| Aaloc | 28-90:227 |
| Aaloc | 1-27:4712 |
|
