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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000146_pilon:790690..799133+ Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_013505 ID=XLOC_013505|Name=XLOC_013505|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=8444bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000146_pilon:790690..799133+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) atgaaTCCAATATCAGCTCTGGCAAACATCTTATTGGTGATGTTGATTGC
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GATGTATTCGTAATGCcaagaataacttttttaacatttcaaTCAAACTT
GAAAATCTCATTTCCGGTGATAAAAACGCCCTTAAATTTAGACctcactg
agaaattgactttaactttcatccccatattaaatttaatggaaaaacgt
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ATCACCAGTAAGATTACCATAGAAATTTTCACCCCCATTGTGGAAAGTAG
CTCCACAGGGGCACTAAGACAGAGTCACACTGATTTATTTCaacgatttt
tcaatttttcttataGACAAACCTAACCCATTTAGTGGCTCAACAAAGGT
AAATCATAATATCCAcatttaaattttctcaaaaccatttttctactttc
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TCAATCGTTAAGTGTTACACTTAACGATATTGAGTAAGTCTaagaccgca
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AGGGGAGGGCGCCTCTTTCTggctggattgctccacttacccttgatcct
tctcttaatggatgagcatcaagcagagaggcatcaagtaccatttctTT
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ACAGTATTTAGGAAAGTTTTCAGgataaattttttacaaattccAATCTG
CTCTCAAATGATTAAtcactttcttttcatttctagGCCTTGTTCAATCA
AACTAATCACCCTGGTAACCTACATATAAACAACAACGGTGGAAATAGCC
CAGCGCCGCCCGTTCCTCGATCGCCAAGACCAAATAGCCGCCCAGTCTCA
GCTGCATTCAATAACGGTTATATAGATATGGCGAATGATAACCCACAACA
ATATACAGCCTTAAATTCAAACACAAGGGTCGATCAGCAGTATCAGCCTA
TTAATTCACCAAAAGACAAAATACCAACCTTGTCAGAACAGGATGAATAT
CTAGATTTAACAGACCCTAAAAATAATAAGCAGCAGACTACACCAGGAGA
GATATATACAGATCTAGACTATCAACCAGGAAATATATACGAAGGGGTTG
CTCAACCTGGTCATAAAAATAATCCTCGAAATTACAATGGGTCTAATAAT
CCTTCAAAAACATCAGAGACATATGCGGATTTACAGGGAGCTCAAAGGAC
CCCAGAGACGTACCAAGACTTGAATACCGCGCGTCTGCCTGTCAATGGAA
CTTATGAGGATATAACAAACGGGACAGATTATGATAATCCAACG Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000146_pilon:790690..799133+ >XLOC_013505 ID=XLOC_013505|Name=XLOC_013505|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3198bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000146_pilon:790690..799133+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) atgaaTCCAATATCAGCTCTGGCAAACATCTTATTGGTGATGTTGATTGC TTCGACATCCTCATTTGCAAGTCCACCAACATCACAGAAACCTTTTCGAC AAAGAATCGAACAGATAGCCTCAGCTTCTGGTGATGGCAGCGCCGGGTCA CAATCGACAGAGTGGTACCCACAAAATTACACAGTAAACCGTTATAGAAC TGGTGATCTAGTCTCTGGTAATTTCTCAAATGGTTGCCATGAGATATTCG CGTATGATGTTAATGATACTAATTGTATTTGTAAGAATGAGACTACGTTT TATTGGAGGGATGGAGCTAATTGGTGGACGGAGATGTCGTGCTGGCTGAC CACCCCATCGGatgaaTCCAATATCAGCTCTGGCAAACATCTTATTGGTG ATGTTGATTGCTTCGACATCCTCATTTGCAAGTCCACCAACATCACAGAA ACCTTTTCGACAAAGAATCGAACAGATAGCCTCAGCTTCTGGTGATGGCA GCGCCGGGTCACAATCGACAGAGTGGTACCCACAAAATTACACAGTAAAC CGTTATAGAACTGGTGATCTAGTCTCTGGTAATTTCTCAAATGGTTGCCA TGAGATATTCGCGTATGATGTTAATGATACTAATTGTATTTGTAAGAATG AGACTACGTTTTATTGGAGGGATGGAGCTAATTGGTGGACGGAGATGTCG TGCTGGCTGACCACCCCATCGGATTTCCAAGTCCGATTGAAGGGTTCAGT ACGCGGTGTCGGTTTCATCAAACATATGGGTGCTGCGTGGCAAATAGATG GAAATTCAATGATAGAAGCTAGAACATTATCTGGTTTAAATCTTTCGAAT TGCCAAACACTAACTGTGGAGACAGATTCTTTGGTATATATGGGCTACAA TGGATGGAATAATTACTATAATTCATCAAGCATGTTTGAAGTAACTCAAC ATGGAACTGGTCATTTTAAACTAAAGATTTCCAAGTCCGATTGAAGGGTT CAGTACGCGGTGTCGGTTTCATCAAACATATGGGTGCTGCGTGGCAAATA GATGGAAATTCAATGATAGAAGCTAGAACATTATCTGGTTTAAATCTTTC GAATTGCCAAACACTAACTGTGGAGACAGATTCTTTGGTATATATGGGCT ACAATGGATGGAATAATTACTATAATTCATCAAGCATGTTTGAAGTAACT CAACATGGAACTGGTCATTTTAAACTAAAGATCAACTCCAAGGATCATAC ATTAGCGGGTCACTTGGTGCAATTATCATTTACttgtttcaagaattttt catcTGGTGAATTATTCTCCACTGTACTGAAGTTTGAAGGACAAATGTCG TACCAAAACCATCAACTCCAAGGATCATACATTAGCGGGTCACTTGGTGC AATTATCATTTACttgtttcaagaatttttcatcTGGTGAATTATTCTCC ACTGTACTGAAGTTTGAAGGACAAATGTCGTACCAAAACCTCTCATCAGT CCCACCTCCCACAATGCCACCGACACAACCAACCCCTATTGGCAAGTCTC ATCAGTCCCACCTCCCACAATGCCACCGACACAACCAACCCCTATTGGCA AGTCAACACCCCGTGATGCGGAGAGCGAAGGGGTCGAAGATACGAACGAA GCGTTGGTTATTGGAATCGTTGTTGCTGTGGTAGTCATCTTTGTGCTTCT CGTTCTCTTGGTTGTTTTGTGGAGAAGTCAACACCCCGTGATGCGGAGAG CGAAGGGGTCGAAGATACGAACGAAGCGTTGGTTATTGGAATCGTTGTTG CTGTGGTAGTCATCTTTGTGCTTCTCGTTCTCTTGGTTGTTTTGTGGAGA AGACGAGGAAAACAAAATACTCCGACTAATACTAAGCAGACGAGGAAAAC AAAATACTCCGACTAATACTAAGCAGAATGAAACAGAGTTTTATCAAGCA CCATCGTACAATTACCCAGACAAATGAAACAGAGTTTTATCAAGCACCAT CGTACAATTACCCAGACAACAAACCTAACCCATTTAGTGGCTCAACAAAG ACAAACCTAACCCATTTAGTGGCTCAACAAAGGCCTTGTTCAATCAAACT AATCACCCTGGTAACCTACATATAAACAACAACGGTGGAAATAGCCCAGC GCCGCCCGTTCCTCGATCGCCAAGACCAAATAGCCGCCCAGTCTCAGCTG CATTCAATAACGGTTATATAGATATGGCGAATGATAACCCACAACAATAT ACAGCCTTAAATTCAAACACAAGGGTCGATCAGCAGTATCAGCCTATTAA TTCACCAAAAGACAAAATACCAACCTTGTCAGAACAGGATGAATATCTAG ATTTAACAGACCCTAAAAATAATAAGCAGCAGACTACACCAGGAGAGATA TATACAGATCTAGACTATCAACCAGGAAATATATACGAAGGGGTTGCTCA ACCTGGTCATAAAAATAATCCTCGAAATTACAATGGGTCTAATAATCCTT CAAAAACATCAGAGACATATGCGGATTTACAGGGAGCTCAAAGGACCCCA GAGACGTACCAAGACTTGAATACCGCGCGTCTGCCTGTCAATGGAACTTA TGAGGATATAACAAACGGGACAGATTATGATAATCCAACGGCCTTGTTCA ATCAAACTAATCACCCTGGTAACCTACATATAAACAACAACGGTGGAAAT AGCCCAGCGCCGCCCGTTCCTCGATCGCCAAGACCAAATAGCCGCCCAGT CTCAGCTGCATTCAATAACGGTTATATAGATATGGCGAATGATAACCCAC AACAATATACAGCCTTAAATTCAAACACAAGGGTCGATCAGCAGTATCAG CCTATTAATTCACCAAAAGACAAAATACCAACCTTGTCAGAACAGGATGA ATATCTAGATTTAACAGACCCTAAAAATAATAAGCAGCAGACTACACCAG GAGAGATATATACAGATCTAGACTATCAACCAGGAAATATATACGAAGGG GTTGCTCAACCTGGTCATAAAAATAATCCTCGAAATTACAATGGGTCTAA TAATCCTTCAAAAACATCAGAGACATATGCGGATTTACAGGGAGCTCAAA GGACCCCAGAGACGTACCAAGACTTGAATACCGCGCGTCTGCCTGTCAAT GGAACTTATGAGGATATAACAAACGGGACAGATTATGATAATCCAACG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000146_pilon | genome | sc0000146_pilon:790690..799133 + |
Properties
| Property Name | Value |
| Aaloc | 1039-1596:7887 |
| Aaloc | 1009-1038:7319 |
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| Aaloc | 925-960:6354 |
| Aaloc | 799-921:6057 |
| Aaloc | 745-798:4938 |
| Aaloc | 613-741:3218 |
| Aaloc | 361-612:1234 |
| Aaloc | 259-357:262 |
| Aaloc | 1-258:1 |
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