XLOC_013062 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_013062
Unique NameXLOC_013062
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000168_pilon:5487..18306-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_013062 ID=XLOC_013062|Name=XLOC_013062|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=12820bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000168_pilon:5487..18306- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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CGTTTCTTTAGTTGCTCCCCTTCTTTCATGAAAAATACATCTACGTGCAG CGACATTCCTTTCTTTCCAAAGTAATTTTGCTGACCCTCACGAAATTGTG TGGGTAAAATTTTCTGGCAGAAGTCTTTAAGCCAAAATGCTGTATTTGGT GTCAAATTTTCAATACACCAGGCTTTTGCTTTCTTTTGTTGAACATCTCG AAGAATGTGGCAAATGTAATCCTGGATGTTCTTTATGGCTGTATTTATGT CAAACATAGTTCCTTCATCTGCCTCAAATTGTGCTGCTAGCTTTCTCACA TCAGCCATTGCTTTGCAAAGCTGGTAACAATCCTCGCAAACACCTTCAGG ATTTTGATGCTTTTCTTGGAGCTCTTTCTTTTTTGGGTCTGACAGGGCAT AGTGAATATTGTGTGAAGCAATGTTGCTATCTTCAGAACAGTGAGTGGGA TAAGTCGTCTTGAGGTACCGTTTGCCTTTCTCCAAAGAAGAAACAAGATC CTTGTCCCCAAACCTTTCAGCAATTTTTTGAAGATCAGCAAACCCATTCA AACCTGCTGCAGTTAGATCATCAAGGCCAGCTGAATTTAACAGAAACAAA ACGAATGCATTAAAAATATTAGAAAATTAAAGTTAGAGCATAGACTTTTT CCAGATTACTAAAAACAAAACATGAATACGTTATTCCAAACAAAGTAAAG TTATTATTGAGTAGAATTTTGATTAAAGATTAGAAGTCACTGGCACTTTG ATTTATAAATCATTTATCCTTTTCAAAGCTAATCAAATGATAGATACAAG AATTTGAGCAAACTTTTTTAGAAGTTACTAATAGAAAAATAAATGATACT GATACTTTACCCAAACACTTTCGCTTTGATGGTTTTATCTCTCTCAATAT TCGCCATAAAGAACTCTCTGACAAAGGCTGATATTCACAATCACTACAAA ATTTCTGATACAATGCGATGGTGTGACTGTATTTAGCTGTTAGTACTGCA TGTGCGACCTTCTCTTTCAGACCATTATCATAGGTTACTGTAGTAACTCC ATATGCGACATCCTGGAGTAAGCCACTGTTGAATACAAAATCAAGAAAGT GTTCACATTTATTGATATCTAGCTTGTGCCTCTTCAACTTTTCCTTTGCT GGGATCACTAAAGTTTCATTGCTTGCCCTCCATTTTCTAGCCTGGTCTAC CTGATACCTGGTGCATCCAAACAAAGCCATTAGCTCCTCCTTGGTAAATC TGAAGGGGTCAATAAGCGATAGAATTACCATCTTGCTTTTACTGTCTCCT GCATTCTTATAGAGCTCCTGATAATATTGAATGTCTTCATCTACCTGTAG GTTATCATCAGAATCAGAGTCAGACAAGAACTTCAAAACACTTTCGTCTT GGCCAGGGGCAATAGAGGCAGCAAACTGTTTTTTGAAGAGGAGTTTCGCT CTTTGATACTTTTGTTTGATTTTGGTTTTGGTAGTTTCAGCCAAATCCTC AACATGTTTTCGTTTGACTTGAAATTCGAGAGCTATTGATAGAGGACTTT CAGCTAAGCTCGAGTTTCCAACAGATGAGTCACTTGGAAGTATTGGCTCC TCAGGTTCATAGTTAGGATCACAATCTATACTGGTATCATCCTCTGTTTC TTCCAGTAATTTTAATATGTCCTTTTTGTGGTTTATGCAAAGTCCACCCC CAATTGGCATTTTAATATTGAAAAGCTTTGGAAACGCAGCAACTATTCTA TAGTATGCTGTAATGATATTCTTATTTTTCTTAGGTCCTGTTTTGGTTTT TCCATGATTTGGATGATAACAGAAATGTGGTTGTCTCCAAAACTTACCAT TGATCTCCCTATGCTTACCACATATCTTCTCATCATTCTGTAAATCTCTA CCAATTCTGCTTTCAATAAGACATTTTTCTTGTTCAAACTTCAAAGGAAC TCCAAAAACTTTTAAAGATGATAAGTGCTCTTCCACATTCGCATTTAACT CATTGACTCCAAAAAGCTTGTCTTCAAAGTGTCTACTCTTTCCACACCCT CCGTCTATGTATAATGTACAGTTCGTATAAATTTCATTTTCACCACTTTC AACATTCTCATTTCTTTCATCTTGCAAACTTTTTCCACTTTTTCCACACT TATTGTTCTTATTAACTTCACTTTCAGTCTCACTGTTCTTCATTTCTTTT TAGTTTTCTAAAAAATATAAATAATATATACATATATTATAGTATTATTT CAAAACAACTCCCTCAACAAAATCTTCGCCTGACCATTTACCTTCTGTGG ATCTGCCATCATGAATTTTTCCCGCCCTTTTTTGGACAAAATGGTAGATT CAAAATGGTTGATTCAAAATGGTAAATCAAAAGTTGTCTATAAAATATAT ATATCAAAGTTACTGAAACATTTCTCTAGCACAATCCCTGTCGCATGTTA AAGCTTCATTTGGATCTACCATTATGAATATTTTCCCGCTCTTTTTTGGA CAATATGGTAGATTTAAGATGGTAGATTTTGAAATGGGACACTTGAACCT GCAAATACCATATTGGGCTAAAAGTGAGCTAGGAAGATAAATTACCCCCA AAAAGATGACATAGACTGTTATTGCTTGATAGTTATTCTTTCTAAAAAAA TTGACAACTTTTTTTACCTGAATAATTGCACAAACATAGCATTTTTTGAC ATTTATTTCAGTTTTTGCGCCTTTTTTGGGGTTCAAAATTGGAAAATTAA GTTCTTAACTCATTTTCTAGTGGTTATTTAAACACCAAATGAGGAAAAAA CAAAAGAAGGTATTTAAGCTATCTTAACCAAGGATTTTTCAGAGTATAAT 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TATGAGTTAAGAGGGAAAGAAGTAACTCAATATGAGTCAAAATTTTTTTC AAGAAAACACATTATCTGTTCCTCAGTTTTCGACCTACACAGGATTTCGG CCATTTGTGAAAATATCCTCCTATATGATGGAAATAAGGTTGTGTAGGTA GGCCAAGCAGTGTTAGCTAGACACCACCACAGATAAAAAGATGTAAAAAG ATGTGTTTAGTGAAAGTATGAAACGCGCGCAAATATAAAATAAACTAAAA CTTAAACTCCACGGAACCAGCCAAAGAAACTAAAATAACAATGAAAAAAG AAGTGTACTTTCTACTAGACAAAGTTGCCACACCTTTGACACGTTTCTGC CACAACGTTGTAGAAAGCATACTAGATGGGAAGGAACTGGGATTGGATCG CCACTATCCAACCCTGTGGCTCTCACACACATTTTACAGTTCAAAGAAGA AGATGGAAAGAGTGGGAAAAGAATGAGAATTTAAAAAAAAGTCAGACTAG AACCCAGTTCGAAGCCCGGTACACCCATGACCGCTCACTGCAAAAGCTGG CGAACGACTGCGACTTCAGATCTACAAACAACAAAGAATGGCCGAATTCT TTTTCCTCTTAGAGAGACGATGTTATAATGAAAGGGTAATTAGTCCTCTC TGGGTCCCTCTGTCTTTATCCTGGCTTGGGACAGGCTGACTGTCATTCAA GACAGGCAGGCGACATTACCCCAGCGGCCTGTACAAGATGACAACAAACT CCAGGTAGACTTACAGGAGAAGAAAACAAAAAATGAATCAACGAAGGTGT AAACACCTTAGACTCCTTTGGAGCCGACTGCACTAGACAAATAGCAAAAT CTTTGTTTTTCAAATGTCAAAATTGACAATTGGGTGTTTAACATAAAAGC GGCAATTATTACTCTTTTTAGTAATTATTGCCAAAAATGGCAATTTTCTC AACAATTGTTTGTTTGTTTATCTTTTTTGAGATTATAGAAGAAGAATAAA CTATATACATAAGGTTTAACCCACAGATATCTGTAAAGCCCGAAGGGCTA GATTTGCGGCTTTTATCGAAAAGTGAAGCCTAGGTTTGGAAGGATTTCCT ACCAAAGTCACGTGACTAAAATATGCAATTTCACCGGTTTGAGAGATGTG AAATAGCGTTTGCTGCCTACGTTTTTTGATCTCGCGCTCCGAAAACAATT AAAATGCTAGATCCTATCCATCGGCACGAAATTTAAAAAGTCAAATTTTT GCATTGTCGTTTTTGGAAGGAAAAGTTGATTTTATTATTGAACACATTGT ACTTGACACTGGTTGACACCCTCGGAATTAGTAGGCCCACTGTGACCTGT TTAGTTTTGTTTTGAACTGGTCTTAGTTGGAAGTACAGAGAAGAATAATC AAGTCATATGTAAACAAACTTACAACGGGGGTTATGTTTTCTCTTTCCGG TGGTGTTTCACCATCGATGCAGGATCTTTTTACATATAATTTTAGAACTT TTTATGTTATTGAGCAACGAAAAATTGAAAAAATCACTTTTATGAACAAT TCGAAAAACACTTTCTTCAATGCAATTTTACAAATTTCAAACACCTCTGA CATCTTTGCCCTTATAAGGACTCTATGCTGACTCTGTATTTCATCGTTGA AAAAATTCCTGTTTTCGGCATAATAATTTTCAAAAAGTGCAATAATTGCC ATTTTTTTAATTTTAAACACCCAACTGGTTGGAAAAAGTCAAAAATGATT GTATGCTTTTTTCCAGTAGTTTACCCCTCTGCAGGAAATTTTGCAGTCAC AATACAAGATATTTTCAGATAGTTTTATCATTAACTAACTTTTTGAGCAT TTTTAGTGAAAATTGTATTTCTCAAAACCAATTTCGCGGTAGAAAACAAA CCAACAAAAGTCCAAAAAAATTAAAAATTTCCATGATATTTTGACACTTA CAGTCTTTTTCGAACAACATCATCTCTATAAGCTTAAAAATCTAACTTCA CACATCTTCTAGAAATTTGAAAAGATAATAGATAATTTGATGGCTGTAAA ATTAAAAAAAGCTTATATTAATAAAAACAAAGAAAAATGATACAAAGGAC GTGCAAAAAGACAATTATTATATTGAGGTCTTTGATCATTAGTACCTCAA AGGTCATAAGATGCAGTTCATCCTTTGATGACGTAGCCTGGATATCCAAG CTCAAAATTTTAGAAAAAATAAGTTTTACCTCAGGCAGACAAAGTTCTAA AATTATAGAGGTTGGTTCACCTAGAAATCAGGTGAACCCCTTTGACAGAT TTTCCTGCATGAATCGCATGGCTGCAAATAAATATATGCACATAATTTCA AGATGGTACCCCAGCAGTGATAAATCAATTTAGAATGGCAAAAATAAAGA TATATATACCTTTAGTTCATTCATACCTTTAGTTCTTTACACGATGCATT ATTAAGAAGATTAAAAACAAGAATATCTAAGCAAGTATGAAAAGAAAACA ACCAGAACATCTAAAAATTCCCATGTTTTGATCTTCCCACTTCTTCCCTA CCATTATTGTTATTTTTATTTGGATCTATGGTCAAACACCTAAGGGAGAT AATTAGGCATTCTATTGTTATTTGCTTCGAAGAAGAAAAACCAGGGAGAT TTGTAAAGCAGCATACACGCCTTGCTGATCGCCCGCGTGATCTATCCAAA TACTTAGGCGGACACTTCAAGTCAGCTTGCATAATTTCTTATACGCGCTC CGCCATTCAGATCTCTGATTCACTTGGACCCAACCAAGCAGAATATCTGC ATAATCATCCTCAGATCAGAATGCAGACGATCTAGGTAAACCAGACCGTA AACATAAGAAGTATCAACATCAAAAAAAAGTTTACGGGCTGGATATCCAG GCTATTGATGACGTAGCAATGATTGAAATTTTAGTTTATACATAGTGTCC TCCTCTTTTTAAAAATCCAAAATCCAGGGGGGTGTCAAAAACCTTTGCTT CGATTAAGTTGTTACATCAATAAAACTTTTTATTCTGTACATAAAAGAAT CGTTCATTTCATTATTTTAAGTGTGTAGTTAAAATGCCGGACGGTTTGTC CAACTTTATATGATTATCGATTTCAAATGAGTTATACTATGTTCAAAGTT GTTATAGTATCTGGTATATGAGACGTTGTCTTGATACTTTCAATTTGGGA ATTATCTCAATATATTTTCGTGAAAAAATATATAAATTGAAAGAGGTTTT GTTCAATAACTCAAATTACAACTCTACTATACTATTTCCTTCTTATTACA GAGTTTACGAGGATCCACAAAACTTCAGACATCAACAAATTTAGTAAAAT TAATAAAAGGTAAAATTGTTTTTAAATTATTTACAGAAAATCTTCTTTAT CTCCTTGTAAAATTCTACTGCCAAATTTGTTGACCTATTCAACTTGTCAG TATATACTCATGCTAAATTTTTCGTTTTTTTTCAGGAAGCCAAACGATAT CAAGTTCAATAAAGAAAAGAGCTTTATCTCAGTAGGTTTCTAGTTCTTTT TAAGAAATCAAGATTGAAAGATGTATTGAGAATATGCCTAATGCAGCATA AGTTTCGCTTGAATTATCTCAAGTTGAAATTAATAGTTTATGCTAGAACT ATATTTTTGGTGAGTTTTAGATTCTTTGACTTGACTTTACCTCATCGTGA AGATAGAAAGCAACCAGCCGTGTTTTGTAAAAGTGTTTCTCTTTTTCGTT TTGTAGATTGACTCCTTGTCTAGCTTTGCAAGCCTCGAGACAGCTGGCCG TTGGGCAACTTAGCACCAGCATACTAGGTAAGTTTGATAAATTCTAAAGG AATGGTTTTATGCTCTGGTTTGTGCAGAGTCGTCATTTCATTTCGGCTCA TTTTCCTTTTTGCAATATAAAGATTAATTCATTTCGTATGGTATTAAATA ACCACTGGTTGGTTCATTACATAATTTTTTGTCTACCCCTATATCTTGCT TAGCCTTCTATCATTCTTAAACAATAGGTTTAGGTACCAAAAACTGAGCC GCACAAGCTTATAAACGTTATGTTATGCCAATCTACTTTAATCTCATCGT TTTTCTCTTCGACAGACAATTGTTTGGTAGGGAAACACACAGCGCTGACG ATAGCAGTGAACGAAGCGGAAGTGACTTCAGTGGAGGAAACAGATGAAGA TGACGAAGCTACATTATACATATTGAGTGAAATGTTTTCAATGCTCACCA TCATAACGGGTGATGGATAA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000168_pilon:5487..18306-

>XLOC_013062 ID=XLOC_013062|Name=XLOC_013062|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=774bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000168_pilon:5487..18306- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCGACGTCTGGCAGGATATTTCGAAGTGTTATTGGGTCAACTAATTT
AGTTAGGATGGCGACGTCTGGCAGGATATTTCGAAGTGTTATTGGGTCAA
CTAATTTAGTTAGGAGTTTACGAGGATCCACAAAACTTCAGACATCAACA
AATTTAGTAAAATTAATAAAAGAGTTTACGAGGATCCACAAAACTTCAGA
CATCAACAAATTTAGTAAAATTAATAAAAGGAAGCCAAACGATATCAAGT
TCAATAAAGAAAAGAGCTTTATCTCAGAAGCCAAACGATATCAAGTTCAA
TAAAGAAAAGAGCTTTATCTCAATTGACTCCTTGTCTAGCTTTGCAAGCC
TCGAGACAGCTGGCCGTTGGGCAACTTAGCACCAGCATACTAGATTGACT
CCTTGTCTAGCTTTGCAAGCCTCGAGACAGCTGGCCGTTGGGCAACTTAG
CACCAGCATACTAGACAATTGTTTGGTAGGGAAACACACAGCGCTGACGA
TAGCAGTGAACGAAGCGGAAGTGACTTCAGTGGAGGAAACAGATGAAGAT
GACGAAGCTACATTATACATATTGAGTGAAATGTTTTCAATGCTCACCAT
CATAACGGGTGATGGATAAACAATTGTTTGGTAGGGAAACACACAGCGCT
GACGATAGCAGTGAACGAAGCGGAAGTGACTTCAGTGGAGGAAACAGATG
AAGATGACGAAGCTACATTATACATATTGAGTGAAATGTTTTCAATGCTC
ACCATCATAACGGGTGATGGATAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_013062XLOC_013062-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000168_pilongenomesc0000168_pilon:5487..18306 -
Properties
Property NameValue
Aaloc235-387:154
Aaloc163-231:514
Aaloc118-159:784
Aaloc58-114:970
Aaloc1-57:12821