XLOC_012947 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_012947
Unique NameXLOC_012947
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000066_pilon:303558..312829-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_012947 ID=XLOC_012947|Name=XLOC_012947|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=9272bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000066_pilon:303558..312829- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCATTTAAAAGTCAGGGCGTTAGTTCAAAATTTCCTTTTGCAAAAGT TTTAATCAATACGCAAGGTAGCAAGCAAGCAGGAGGAAGAATGCTGAAAA AGGTAAGGTCTTTTATTGTAAATAATACATACAGCGAAATCAATAGAACC ACAAAGTACTCAAGAAAATTCGAAAAAGTTCGAGCGAAATAATAATATCA AGTATTCAAGAACTAACTTTAACTTACTACACGGTGTTTCATGCTGTCTC AATCTTCAGGCAGTGCAGTGTATTGTAAAATGCAATAAAAAAAAGTTTCC CTATCAAAAGTTATGGCTCTTTGAAGAGCTGTCGGTATTTTGACCCCTCT ACTACGAGTACTCTATACAAGTATACTTGTAGTTGGCAATAAACGTTTTA ACGGGAAATAATCAATAACTCGAAATTAATTTTACGTATTTTATAAAATG TTCTGACCTTACACTTTCGATGCATACCAGAACAGAATAAGCTAATAAAT TTCCCCCCGGAACTTAGGCAACAAAAAAAAACTAAAAGTCGAAATGGTCT CGCTAGGGGTTGGAATTCCGACCTTTTAGGCTCCCTCAAAATATATAAAA ACCACGAAAAATCAAAAAGGGTACAAAATCTTTAGAAATTCGTCTCCCAA AGGGTCAATGCTAAAATTTACTCACATAACGGTTTAGCCTGGATAGCCAG AAGGTTGTAAAATTTTTTTATATTTTATGTTGCTGGTTTACAGCCTAGTC TTCTGAAGCGATTTGCATTCCAATACCAGAAAACAGCGCATGTGTATACT TTGTTAATTCAAATATTGCGCAAAGCTAAAGTTTTGCCAAGCCTGAGTTT ACAAGCAAGTATGTAGACCAAGCTCAAAATAGTAGAAACATCGAAATAGG AAAACAATTAACACCTTGTGGATATCTAGGCTACAAAGGGAAAGTTTTCG 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GTCCGCTAATTGAAGGGTCCGCTAATTGAGTGTCCGGCTTTTGGAAGCTT TTTATGAGGATTTGACTAGGAAATGGCCGGGGTAAATAAAATTTTCCACT AGTCAGAGGTGTCCGCCTTTTAGAGTGTCCGTTAATTGGAGGTTTTACTG TATATGCTCGAAAATTGGGTAAACAGTCATTGCCAGATGCTTAATTCAAT GTAAGTCATTCGCATCATATGAGAGGACTCGTTGGTACAGTCCTGTACCA AACTTAGATCTAGGAGTTATATAAAAAATGGCGGATTGGCGGTCCTCTAC GTTTAAAGCTCTAAAGGAGTGGGCTAATTTCCTATAGAAGAGGAATGATA GTCGGTCTTTCATGTACCACATTCCCAGACGGGTTAAACTACCCTTACAC GTAAATCTGAAATATTTTGGTTGGACCTGCTAATCCCCGAAAACGAGGGC TGGATTCAAGGCCTCCAACTGCAAAACCAACCGTAATCTAACCTTCCATA TGTAGAAAATTTCCCGACTCTGGGAATGCGGTACATGAAAGACCGACTAC CATTTATTCCTCTTCTATAGGAAATTAGCCCACTCCTATAGAGCTTTAAA CGTAGACGACCGCCAAAGCGTGAAAATTTCTGCATCTGGGAGTCAGATAA ATATAGAAGCGCTCCGATCCACCCAATAGAAAAAATTTTATTCTGGTCAG AAAGATCTTGATCAGGCCTTTCAATGATCGATTTTTGCGTTTAGAAATTC TGGTTGGTAAAAAATGAAAGAAATTTTATACACTTGCCAAAATTTGTCTA TTTTTGGATAAGTTAAAAAAAACCTAAATCCTTTCGCTCTCTCGTGACCG CAGTGCATGCACTTATATGACCGTCATTAGGTCTCGAAAAAAAAACGAAG CAGGGAACTTTTAAGTAAACACAAAGCCAAGTCGAACACGTCAAGACACG TCAACTGACGTCAATAACACGTCAATTAACGCACAAAAAAACAGGCTTAC AGTTGATTCTCCATACCTCGAAAATGCACGGGAAACACAAATGTATTCGA GTTAAGGAAATTTCGAATTATGGAGTAAGGTTTATAAAGTAATAACTGAT ATGACCATCTAACTTGTTCGAGTTAAAGAGATATTCGAGTTATATAGGTT CGAGTTAAACAGACTAAACTGTAGCCCGGACGAGTCATAAAAATGCAATT AACTTATGGAAAAATAATCATTTATCTTAGAGATGGGAAAACTTTCTTTT CAAGGCCGCATAAATGGAGTTTTCATATTATACAGAAAGTAAAAACCATA TTACTTCGAATAAACGCTCCCTCAAATAAACACCCCCTTCGAATAAACGC CTCCCCCTAGGAGGGGCATTTGTAAAGGAAGTATAAAAGGAAAAAAAAAC TCTATTCTTTTTATATTAAAACTGGTTTCGACCCATTTCTATATGCCTAA GTAAATCGACATATTTGTACCAACAAAACAAGGTTCCAATTCACGTTACT AACCAACGTGACCTCGTTTATTAATCAATTGATAAATTAGCATAATTTGC AGAAATAGTGAACTGACTTTTGATTTAATTATTTCTTAATTTTGATGGGA ACTCCTTTAAAACTTCAGTTGAGCTCTTTTCCGTTTCAGCAAAAACAACA ATCAATCAATATTTACTACAAAATATTTCTGTCATGACTATTATGACGTA ATATTTTGTCATGCGCATGCACGCAAATCAAGGGCTTGGAAAACTAATAA TTTTTGTTTGAAAATTTCAAACTTACACCATTTGTTACATAAAACAGAGA AACATGGGTCTGATTTTGGATTTTTTGGGTGTTTCTCAGGAAAAATGGCC TAATTCTGGCATATCGATATTAAAATGATGATTTTTTACCAGCCTAGGAA ATAGGTTAGTAATTGTTTAAACTAAATTTGTAATTTCTTTTGTCTCTCTA CAATACACAGCAAAACAAGAAGGTTTTGGATAAAAATATTTTCTTGGACC ACGAACAAATAATTCAAATGTATATAGGGCAAGACCAATTTAATTGGTTC TACGGGCAGATCGTTCGACAATTATGAGTCGGTCGGTCGGTAAAATAAGA ATAAATTTTTCATTCATCAGGGTTGGTAAGGTACCGAAAATATTTTCCAA AAAATATCTGGATCAAAAATTCACTTTTTTATCTTTCGATGAAGATCATA ATAAAATTTGGAATGTATGGAATGTTTGATTTTCTAATTTTTCCAATTTC TTGAATTAATTTTCAGCTTTACTCAAAATAACTAGTGTGTAAAATTCAAT ATCATTATTTTTTTTGATTTTAGCAAAAATTAGGTTGGTCGGGCTCGTAG AACAACAAATTAAATTGGTCTTGCCTAAGTGAAAAACTTAGAACTTAATT TAATTTAATCTTATGTTTTTTTCAGGTTGTATGGTTATTTACTTTTGTGA TATCTCTACTGGTGGTCAGAGCATATTCCACCAAAGGTATTGGTCTCTAA CAGTCTCTAGCTTTGAAACTGGTTTTAATTTTCTTAACTTGATGATTTTA AAGAAATACTTTCAAACTTTTGGCCTATAGATTATTTTTTGAGCAGTTCT TTTGCCATTGATTTTTTCACATTCGGTAAGAAAAATGTTCATTTTATTTC AACTTCAAGTACGGGGATACTAGTAACTGTATCTTGAAAAGGGAAATGAA AAAAGTAAAATTAATTTTAAGTGGATACCCCTTAAAACCTACAAAAAATA GAGGTAACCTTTATCTGAAAGTTTAGGTGGAATTTGAGGCTGAAACTTTT TGTGTTGAAATTACACTGTCTACGATTTTCTTCCCTAGCAGTGATCTTTT GTAGAAACCAGTTTTCAGTTTTTCATGAGGAATTGAAAAAACGCCCTTTT AGCTATTTACCCCTTCAAACCTACAAACATTGACCCCTTGCTCACAACTT ACTGAAATGGTGAGATTGCAATTCAGGTGCTGAACTGTGATTCAATTGAT ATTTGCTAGATGACCAGGTTTTGAGAAAGTAGATTTTCAGATTTTATTGG CCACTACCATTAATGAGCTTTGAAATAGAACTTTGAGGGCCTTAAGATTT CTTTGAGGTCTAACCATGAAGAAGAAAATGATCTTTTCATACCTGCAATG AGTAAAGTTACCTAAAAAGTATAGGTTTTATGACCTTAAATTCAAATGTG TAATCTGTAGGTCCCAAAAACTTGATTCTTTGAAGGGATTTTTGATAAAA TTTTGAATAACTTCGAATTTTACGACACTTTGCTGCCATAATTGAAATTT TCGAAATTAGGTACTTTATGAAAGTACATTTATAAGAGTTCGTAAAAAAG TGAATTATACAATATTAAATTAAGTTTGATGGCTAAGACAGCCAAAAGTA CAACTTTGTAGGTTTTGAGGGGTGTGGTTTTAAGGGATATCCACTGGTAG ATCAACAACAATTTATCTAATTATCCTTTTATCAACCAATTTGTGGAGTT ATGTACGATCATTAGTAAACTGAAATTTATGTTTTCTATTTTCAATACTG CTATTGTATTGAAAACTATGTAAATTTATTTAAAAAAATTTCCAAGAGGC AATCGAATCTAACCATATCATAATAAAACAAAATTGAATTAATTTCAAGA GTATTCAAAGATTTATTTTTTGTAATTTTTCAGGGAAAATTGATTTTGAC ATTAGCGAGCAAAACGAAAAAGACTTCAAATCTTTTTGGCTCTTTTTGAT TCAACACTCACAACCATTCAACCAAAGCTGTTTGGACTTGATCAATAATG AAGAAAGAAACCATTTGAAATCTATTACAACAATCGTAAGAAAGAGCCAA GAATGCCACCAAATCAACAAACCTACTTCAAATGGAAACCAGGTTTATTA TGGCCAGTTAAATGGTACCTTCCAAGTACTGAGAAATATCCGAATTAAAA AACCAACCATATTTTTAAAACACGAAAAAAACAAATCGCCAACCCTGGTG TTCGGTGTCATAGATTTCCCTGGAATCTCACTTAAACTAATTGAAGAGAA CAATGTAGTAATCAAAATCAATAATGATGATGAAATTACAATAAAGACTT TTGGTAAAATCAATTTCAAACCATCTTGGGTTGACACTAATCTAGTGAAT ATACAGAGATTCAAAAGTCGAAAAATCCAGTATATCTCACGCTACAATAT CAATTATTTCACCAATTTAGAAGTCAGTCAGGATACAAGATTATTGGGTA CTGAAAATAGCATTATTATGCAAGATGGAAATTCAACATTCAAAACACTT TATCCTAACATGGAGAAATCAGAAATTGAACATTACCACGATGTAGAATC TGAAATGTTGATTCTTGGACATGATTTTCTTGGAGTTTATCTAAGTTTAG AGATGGTTGAAACGAAACATTTGTTAAAAATGATATTACCGAGATTTCTA CATCGAAGTGTTTCCACCCCAAAAATGAAGGTATTAAAAGTTATTTACAA TATTCTAGCTAAATATTCTAACCAACCAGACCAATTGTATCAAGTTACAA AGTCATTGCCAGGGCAATACTAGATTCTTTCGTGGTAGGTTAAACCCTTT CCAGACGCAAAGTCCACGGGGTAGCCCATACTAGTGACGAAAATTAAAAC CAATATATCTCGAGATCTAAGCCTTCCCAAGAGCTCGTTCGGCTATCGTT GGATTGAGTAGAAAATTTTGAATAGGATGGGTCAATTTGAGGCTCCGTAC CCACGGCGAAATATTTTGAATTTTTTTTCAGAATGTACATTTCTCTCATC CGGCAAGGGTTAAAAAATGTCAAGATTTCTAATAATTAGGGGACCAAACT AAAAGGTATTTTCTTTTCCTGCTCAATACTCAATAGATTTTTTCATAAAT TACGTCACGAACATCACTTGCCTCGTTTGAAATTATTGCCATGATGATTA ACTCTCAGCAGCAGATTTTATTAAAACTACTTTCTTTTCATAAAAAAAAA TCATTTTTCTCAAGGGACGTAATAACCATGCTAATTGTTTGAATACGAGG CAAGTGATGTTCGTGACGTAATTTATGAAAAGGCCTATCAGATTATTATG AAAAAGATGAAAAAATTAGATGATTTATTTCCTAGGGGGGTTCAAATCGC GATAATATTGAATGAATGGATAGCATTTCTACAGCTGAAAGAATAATGGC TGGATCGAGTTTTGGGTGACAGAGAGGATATTTTGACTCAGAAAATATTT ACATCATTTTGAACAAATAATCAAAATTTTAAAAAATTTGAAGATTAAAA ACTTTCATTAGAGAAAAAACCATGAAGAACAAACAATATACATCAGATCT TCAATTTCAATTTCAGGCGAACATAGTTCTACTACGTGGTCCTAAAAATT TGAAGCTTGATCAATACGACACGATGGAGAGACAGGAGAAACTAATGAAA GTATCGACTGTCTATAGCTTGATGAACAAGTACAGATTCTACAATGGTCT GCTGATTGAGCTGTTTGGAGCAACACCGAGCCGATATGATACTAACTCCA AATTCCCTTCGTATATCTATCCAGAATCACAAGTTCAAGTTATCATAAAG TATTCCAAAATAATGAAAGTTCAAATACTTTTCCACAGACAAAACGACAC AAAATGCATGTCAACAAAGGTAAACATCTCTATCTTAACTTCGATCTATT GGTTAGAAATTACGTCATTTTCAAATTAACCGATAGCAAAGCTTAGTTTT AACATTAGCGAGTTTACGAGTCTACCCTTTTTAAGGACGGCGCGGCGACT GAAACGATTTGGAACAAAACACAGTTCTGAAACGGTAAAAGTGACAACTT TACTGTCCTCCTCAGCCAGTTAGGGTCTAGAGAAATCAGCAATGAACCAA TTCCGTTGCAAGAAAAAGCGTCTTTGAGCTGCAAAACGACACAGTCTGGA AGATATTGAAAAAAAAAATTATGTTGGTTCTTGAATTGTCATACTTCAGA TGAGATGTTTGAATCATTTAAAATGTACGTCCAAATGGTCATTCTTCATA TGAATTTTTTTTAAGCAATATTTCGACCTCCTTAGTGGAGGTTTTCATCA GGTTTACAAACGTTCAAATTATGTTGGTATTTTTTAGGATGAATCTTGGT CAAGCCTACGAAACACTTTGTCAAAAATGAAGAAGTCCTCATCAAAAACA AAACATGAAGAACATTCAATATCACATTTAATACACCCATATTGTGACCA TGACCAATATCTTTTACACTCAATCGAGGTCGAATTTGACAGCTCAAGAT TAATGGGTGTTTATAATATGGTTGTGGAATATTTGAATGGCGGAAAGCTT AATGTTGATCACTTTAGTGGAGCAAATATTTCTTTATATTCAGTTATGTT TTTTATGTTCAAAGGAACTTAA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000066_pilon:303558..312829-

>XLOC_012947 ID=XLOC_012947|Name=XLOC_012947|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3096bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000066_pilon:303558..312829- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCATTTAAAAGTCAGGGCGTTAGTTCAAAATTTCCTTTTGCAAAAGT
TTTAATCAATACGCAAGGTAGCAAGCAAGCAGGAGGAAGAATGCTGAAAA
AGATGGCATTTAAAAGTCAGGGCGTTAGTTCAAAATTTCCTTTTGCAAAA
GTTTTAATCAATACGCAAGGTAGCAAGCAAGCAGGAGGAAGAATGCTGAA
AAAGGTTGTATGGTTATTTACTTTTGTGATATCTCTACTGGTGGTCAGAG
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ACCAAATCAACAAACCTACTTCAAATGGAAACCAGGTTTATTATGGCCAG
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CATATTTTTAAAACACGAAAAAAACAAATCGCCAACCCTGGTGTTCGGTG
TCATAGATTTCCCTGGAATCTCACTTAAACTAATTGAAGAGAACAATGTA
GTAATCAAAATCAATAATGATGATGAAATTACAATAAAGACTTTTGGTAA
AATCAATTTCAAACCATCTTGGGTTGACACTAATCTAGTGAATATACAGA
GATTCAAAAGTCGAAAAATCCAGTATATCTCACGCTACAATATCAATTAT
TTCACCAATTTAGAAGTCAGTCAGGATACAAGATTATTGGGTACTGAAAA
TAGCATTATTATGCAAGATGGAAATTCAACATTCAAAACACTTTATCCTA
ACATGGAGAAATCAGAAATTGAACATTACCACGATGTAGAATCTGAAATG
TTGATTCTTGGACATGATTTTCTTGGAGTTTATCTAAGTTTAGAGATGGT
TGAAACGAAACATTTGTTAAAAATGATATTACCGAGATTTCTACATCGAA
GTGTTTCCACCCCAAAAATGAAGGGAAAATTGATTTTGACATTAGCGAGC
AAAACGAAAAAGACTTCAAATCTTTTTGGCTCTTTTTGATTCAACACTCA
CAACCATTCAACCAAAGCTGTTTGGACTTGATCAATAATGAAGAAAGAAA
CCATTTGAAATCTATTACAACAATCGTAAGAAAGAGCCAAGAATGCCACC
AAATCAACAAACCTACTTCAAATGGAAACCAGGTTTATTATGGCCAGTTA
AATGGTACCTTCCAAGTACTGAGAAATATCCGAATTAAAAAACCAACCAT
ATTTTTAAAACACGAAAAAAACAAATCGCCAACCCTGGTGTTCGGTGTCA
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ATCAAAATCAATAATGATGATGAAATTACAATAAAGACTTTTGGTAAAAT
CAATTTCAAACCATCTTGGGTTGACACTAATCTAGTGAATATACAGAGAT
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ACCAATTTAGAAGTCAGTCAGGATACAAGATTATTGGGTACTGAAAATAG
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ATTCTTGGACATGATTTTCTTGGAGTTTATCTAAGTTTAGAGATGGTTGA
AACGAAACATTTGTTAAAAATGATATTACCGAGATTTCTACATCGAAGTG
TTTCCACCCCAAAAATGAAGGCGAACATAGTTCTACTACGTGGTCCTAAA
AATTTGAAGCTTGATCAATACGACACGATGGAGAGACAGGAGAAACTAAT
GAAAGTATCGACTGTCTATAGCTTGATGAACAAGTACAGATTCTACAATG
GTCTGCTGATTGAGCTGTTTGGAGCAACACCGAGCCGATATGATACTAAC
TCCAAATTCCCTTCGTATATCTATCCAGAATCACAAGTTCAAGTTATCAT
AAAGTATTCCAAAATAATGAAAGTTCAAATACTTTTCCACAGACAAAACG
ACACAAAATGCATGTCAACAAAGGCGAACATAGTTCTACTACGTGGTCCT
AAAAATTTGAAGCTTGATCAATACGACACGATGGAGAGACAGGAGAAACT
AATGAAAGTATCGACTGTCTATAGCTTGATGAACAAGTACAGATTCTACA
ATGGTCTGCTGATTGAGCTGTTTGGAGCAACACCGAGCCGATATGATACT
AACTCCAAATTCCCTTCGTATATCTATCCAGAATCACAAGTTCAAGTTAT
CATAAAGTATTCCAAAATAATGAAAGTTCAAATACTTTTCCACAGACAAA
ACGACACAAAATGCATGTCAACAAAGGATGAATCTTGGTCAAGCCTACGA
AACACTTTGTCAAAAATGAAGAAGTCCTCATCAAAAACAAAACATGAAGA
ACATTCAATATCACATTTAATACACCCATATTGTGACCATGACCAATATC
TTTTACACTCAATCGAGGTCGAATTTGACAGCTCAAGATTAATGGGTGTT
TATAATATGGTTGTGGAATATTTGAATGGCGGAAAGCTTAATGTTGATCA
CTTTAGTGGAGCAAATATTTCTTTATATTCAGTTATGTTTTTTATGTTCA
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ATGAAGAAGTCCTCATCAAAAACAAAACATGAAGAACATTCAATATCACA
TTTAATACACCCATATTGTGACCATGACCAATATCTTTTACACTCAATCG
AGGTCGAATTTGACAGCTCAAGATTAATGGGTGTTTATAATATGGTTGTG
GAATATTTGAATGGCGGAAAGCTTAATGTTGATCACTTTAGTGGAGCAAA
TATTTCTTTATATTCAGTTATGTTTTTTATGTTCAAAGGAACTTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_012947XLOC_012947-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000066_pilongenomesc0000066_pilon:303558..312829 -
Properties
Property NameValue
Aaloc1264-1548:286
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Aaloc103-162:3998
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