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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000175_pilon:67094..71926- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_012846 ID=XLOC_012846|Name=XLOC_012846|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=4833bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000175_pilon:67094..71926- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTTAGTTACATTTATTTTGATCCTATCGTTGGGGTTGCTGCACGGGAA
AGGTAATTAAGATAGATTTTTGTGTGTTTATATCCCTGATTATATTTTGC
AAATAAGGTATTGTAATGTTGGGAGATCCAGTCATTTCTACTAAACATTC
GTAGCGAAATTCCTGAGGTTTTACGCTTAAAATTACTTATCCGGAAAATA
GGATCTTCGCCCCTCCAATTATCTTCCTGTACATGCATCAAAAAGATTAT
CAACCCTATAGGATGAAAATAAAGGCACCCTATTCTTAATGATTTTCAGA
TTGTCCGGTTCGATTCGAAAGAAAAAGATGCATCAAGACAAACCGAGTTG
TCTATCACACACAAATCGCAAATAACAGAGATTCGAACAGTGCTATTTTT
ACTGGAAAGCAGGTCAACTGGGGAAACTTTAAAGACTCCCTTCAAGAGTA
AGAAAATATACATTTTTTTTATAAGTACAAACTATATAAGAACATAAGGC
TTCGCTGGCCAAAATGTTAAGAACAAGTTAAGAATATTTTAAGGCTTTGT
GGACTCAAAAACATCCTATTTCTTAGGAAAATAGTCAAAAATATTCACAA
AATCGTCAAAATAAGAACATGCTCAGAACATTTTTAGGCTTAAAACTCAA
AAAGTTAAGAGCATCCGAAGGGTGTTTTTTTGAGACAAATTGTCAAAGCC
CCGTGTAGCCTCCATTTTTCTAATCTTTGACAGTCAAACCCTGTCGACTC
AAGAATGTTTTTCAAAATGTTACACCGTTTCAGGAGTTAAAGTCAACGAT
TGCTAAACAAATATTCATTTTATTCTACTGACAAAGTGACTTCATTTATT
CTAGGTTATCCTGTGAATGTGCAAAGAGAGCGTTACAAAATGGCGTTGCT
TTTGCTTTGGGAAGTTTTGCAGAATGTTGGATAGCTACCAACGAGAAAAA
CTTTAATATGAGTTTAGCAAATCCTTGGCAAAAATCTGATCGTTGCATAG
GACATGATTTCAAGAAGTGCGATTCTACACACAAACTTTGTATTGGTGGA
ATCGGAACGCAGTATGTTTATAACATTGGGGATCAAACGGGTATGCTTTA
TTGATTGTTTTTTCAGATGAGATGGAGTTTTTATAAGATAATTTAATAAT
TGGTCATTTGAAGTAATAAAAATGAAGTGTTCTTTAGAAAAAGTAACAAA
ATTACTAGTTAATGACCAACCAAATCAAATAAGAGCTTGTAAAAACTCCA
TCTCGTCCCTTTTTTTTGCAATTTTGAGGATTTCGAAAGAAAAAATATAG
CTTCTCTTGCTACACATGGTCTATTTAATGACCATTGTTCTTTCATTTTC
TATCACAGTAAAGTTAGTTCTGTAAGTTAGAACATCCTCTATACGATAAA
AAATAATGAATAAAAAATAAAAATCCTGAAGCTCACAATATCCCGACAAA
CCTGTATACTTTTTTTGGTGCACCCAGTAGATGTCCATACTACTTACACT
ACATACTACTTATCATTTATAGTGACATTTTCTGTTCAACTTACTTCATA
GTTGATGGTGAATGGGGAAGCTGGAATTCCTTCACAAAATGCAGTAAAAG
TTGTGGTAGGGGATTTCAGATTCGTTCAAGATCTTGCAATAACCCACCAC
CAAAATATGGAGGAAAAGATTGTCAAGGACCAGCCACACAGAATCAAGTC
TGCAACGTCAACTCTTGTCCGAGTGAGTGATACACGTTTTTTTAATAAGA
ACATCCAAAAATTTTTAAGCCTTCGGATGTTCTTAACTTTTTGAGTTATA
ACCCTAAAAATGTTCTTGGAATATTCTTATTTTCTCCTTTCTGTGATCAT
TTTTACCCAATTACTTAAAAATTCGGGGTTTTTCGAGTCCGCAAAGCCTA
TAGATGTTCTCAACTTGTTCTTAGCATTCATAGTTTGTTCTTATTAAAAA
AACGTGTACTCTATTTCAAGTACTAGTATTGAAGTGTTAAGCGACCGTAG
CGCAGTGGTAGAGTAACCGGCTACGGTGCGCATGGTGTGGGTTCAACCCC
AAATCGGGTCATACCAAAGATTCCTAAAATGGTACTTGATACCTCTCTGC
TTGATTCTCAGCACTTAGAAGGATCAATGGTAAGTGGAGCAATCTATGGG
AAAGAGTGACACTCTCGCCTACCTTCGGCTAAAAAAAGAAACCTTTGGGT
TGCCTCTGACTGCCGACTAAAAAAAAGTAGGTCAAACAAGATCGTTGGAG
ATTGTTGGAAAATTTAATTTCCAGCCTGCAAGAACATTAAGAAAACTTAT
ACTTAACATAAACACACCCCTGTATCAAATTTTAACATCGCGAGATATAT
ATTTTTAATAATCTCAACCTTAGTCAATGGTAAATGGGGAAATTGGAGTT
CCTTCACAAAATGCAGTAAAAGTTGTGGTAGGGGATTTCAGATTCGTTCA
AGATCTTGCAATAACCCACCACCAAAAGATGGAGGAAAAGGTTGTGTAGG
GTTGGCAAATGACAGCAGAGCCTGTAACGCACAAAACTGTCCAGGTAAAA
TTATATCTCTAAAAGACTAGAATTTCCCTGAAATGTTTTCTTTAAATAGT
CAGGAAGAGTCTTCTGTTTCAGTATTCGGCCCTAACAATATGTTGACGAA
ATGGCACGTAACCGTCGAGATATCTTACTACGAGAAATAAGTGTTAAAAC
TTTTCTTGATTTTATCTCAAGCTAATTCCACTATTTATGGTATATTTGAT
ATCTATCTTTATTATTCATTAAAAGTTGACGGCAAATGGGGCAACTGGAC
TTCCTTTGGACCATGTACAAAAAGCTGTGAAGGAGGATTTAAGATTCGAT
CAAGAGCTTGTAATAATCCACCGCCAAAATATGGAGGCAAAGATTGCGTA
GGGATATCCGTTGAAAATAAGACCTGCAATCTTCAAAATTGTCCAGGTAC
ACAGAGTTTTGTTTTAGTGAATCTGTATTTCATTTTTACTATCATTCATG
TTAAAGGTTTTGTTTTTAAGTAAGAATGATATCGTTCGCTTTACTCATCA
ATTTTAATTCACAAGCTATTTCACGTTGGATTGAAACGGATGTGGAGCAA
GATCGGTCAGAAAGACAAAAAGAAAAACAATTTTTGCTTATACACCATCA
TGTCATGATATGAAATAATATGTCTGGCATGAAACGGGAAAAATTATGTA
AAAATAAAACCTTTGATTTTGAATAGGTATCCTTTAATAAAAATGAGCTT
TTCTATTTCTAGTCGATGGTAAATGGGGAAATTGGACTTCTTTTGGTTCT
TGCAGTAAAAGTTGTGGAGGAGGATTTCAGATTCGATCAAGAGCTTGTAA
TAATCCACCACCAAAATATGGAGGCAAAGATTGTCAAGGAATGTCCAAAG
AAAATAGAACCTGTAATACACAAAATTGTCCAGGTATATTGGTACAATCT
ATTAACTCTTTAATTAGAACTGAAATATTGGCCTCCGCTGCTAGCGAGTG
GTATAGATTACTCTCTGTAATTCGAAAGAAAAGTTTTGGTCCCTTAAAAT
TCGAGAAATTCGAAATGAGATCAGATCAGGTGTAGAAATTTTCGCGTATG
GAATCAAGTTTTGCGGCCTCTTTTTGTACCTAATATCATTCCATTTTCCT
CGTACAGAGGTTCTGGAAAATAACGATATTTTGGAAGGACTAAATTACGC
GTAGATGGCCAAAATTTGCGAGAAAAAAAATAATCCGCTCTTAATTAGAT
TAATTATAAATGGGAACAAAAACAATCTTAAAACTTTATTCTATAAAGAA
ACTTAAATAGAAGTTTTATTAAAGTTCCTTGCTTCTATTTTCTATATATT
TGTTTCTTCTGTTTTTTTCCACAGTGAATGGAGGTTGGGGAGCTTGGTCA
CTCTATGGATTATGCAGTAAGAACTGTGGAGGTGGTACTCAGCAACGATC
AAGAACATGTAACAATCCAGCACCAAAGTATGGTGGAATTAAATGTCCCG
GTGCAGCCACTGAAAATCGTGCTTGTAATGCTCAAAGCTGTAAGACCAAA
TTTCTATGTTAGAAATTTTCTTGAAGCTCCTCTGGCTTCACTTTAATACC
GTCCGGTAAACGCCATTCAAACACCCCACACTCAAACGCCCAGGCGCCAT
TCATGCTTTATTACTGAGTACAACTATCCTTTCCTTCGGTAGTGCTTTGA
CCTTCGATGCTTATAGAGAGACAATTTTCAAAAAGTCCCTTAGAGAGATT
ATTTTGACTTTTTGTTGTTTTTTTATAACCCAGAGACTCGGGAAGGTAAA
AATACCGACCCTTATAGTCCGCACATACCCAGCACCTATTTTGTCTATCC
CCTCTCCCGAGGTTTCGACAAAGGTTGCCGGTGGTTTGGACTCAAAATCT
TAGAATTCATCTTCAGTTCTGAAATTTTTCTTTACTTCTCTCTATTTTCG
ATAATCAATCAAAGGCTTTTTTTTTGAAAAATATTTTTTCAGGTTGGTCT
TCTTATAATGAAGTGAATCTGTGTAACGGAAATACCAAAATGATCAAATG
CCCAAAGGTTACACAAGTAATTCGATTGTCTGATTATTTTTATGGTCGGC
AATCATCTACCGTATGTCCATCGAGCAGTGGCGGGGGTTGGTTCATTGGA
ACTTTAAAAGACAATGTCAGATGTCGGGGTGGACAAACACCAATCCGTAA
CAGTTGCGAGGGTAAAAACTCGTGTACAATTTCTGCAACAGATACAGCAA
TGGGAGGCTATCCATGTCCGACTGGACAAAACACAAGGCGAACGGAACCA
TACGCTTATTTGAAATATAGATGTTATGGATAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000175_pilon:67094..71926- >XLOC_012846 ID=XLOC_012846|Name=XLOC_012846|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3252bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000175_pilon:67094..71926- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTTAGTTACATTTATTTTGATCCTATCGTTGGGGTTGCTGCACGGGAA
AGATGTTAGTTACATTTATTTTGATCCTATCGTTGGGGTTGCTGCACGGG
AAAGATTGTCCGGTTCGATTCGAAAGAAAAAGATGCATCAAGACAAACCG
AGTTGTCTATCACACACAAATCGCAAATAACAGAGATTCGAACAGTGCTA
TTTTTACTGGAAAGCAGGTCAACTGGGGAAACTTTAAAGACTCCCTTCAA
GAATTGTCCGGTTCGATTCGAAAGAAAAAGATGCATCAAGACAAACCGAG
TTGTCTATCACACACAAATCGCAAATAACAGAGATTCGAACAGTGCTATT
TTTACTGGAAAGCAGGTCAACTGGGGAAACTTTAAAGACTCCCTTCAAGA
GTTATCCTGTGAATGTGCAAAGAGAGCGTTACAAAATGGCGTTGCTTTTG
CTTTGGGAAGTTTTGCAGAATGTTGGATAGCTACCAACGAGAAAAACTTT
AATATGAGTTTAGCAAATCCTTGGCAAAAATCTGATCGTTGCATAGGACA
TGATTTCAAGAAGTGCGATTCTACACACAAACTTTGTATTGGTGGAATCG
GAACGCAGTATGTTTATAACATTGGGGATCAAACGGGTTATCCTGTGAAT
GTGCAAAGAGAGCGTTACAAAATGGCGTTGCTTTTGCTTTGGGAAGTTTT
GCAGAATGTTGGATAGCTACCAACGAGAAAAACTTTAATATGAGTTTAGC
AAATCCTTGGCAAAAATCTGATCGTTGCATAGGACATGATTTCAAGAAGT
GCGATTCTACACACAAACTTTGTATTGGTGGAATCGGAACGCAGTATGTT
TATAACATTGGGGATCAAACGGTTGATGGTGAATGGGGAAGCTGGAATTC
CTTCACAAAATGCAGTAAAAGTTGTGGTAGGGGATTTCAGATTCGTTCAA
GATCTTGCAATAACCCACCACCAAAATATGGAGGAAAAGATTGTCAAGGA
CCAGCCACACAGAATCAAGTCTGCAACGTCAACTCTTGTCCGATTGATGG
TGAATGGGGAAGCTGGAATTCCTTCACAAAATGCAGTAAAAGTTGTGGTA
GGGGATTTCAGATTCGTTCAAGATCTTGCAATAACCCACCACCAAAATAT
GGAGGAAAAGATTGTCAAGGACCAGCCACACAGAATCAAGTCTGCAACGT
CAACTCTTGTCCGATCAATGGTAAATGGGGAAATTGGAGTTCCTTCACAA
AATGCAGTAAAAGTTGTGGTAGGGGATTTCAGATTCGTTCAAGATCTTGC
AATAACCCACCACCAAAAGATGGAGGAAAAGGTTGTGTAGGGTTGGCAAA
TGACAGCAGAGCCTGTAACGCACAAAACTGTCCAGTCAATGGTAAATGGG
GAAATTGGAGTTCCTTCACAAAATGCAGTAAAAGTTGTGGTAGGGGATTT
CAGATTCGTTCAAGATCTTGCAATAACCCACCACCAAAAGATGGAGGAAA
AGGTTGTGTAGGGTTGGCAAATGACAGCAGAGCCTGTAACGCACAAAACT
GTCCAGTTGACGGCAAATGGGGCAACTGGACTTCCTTTGGACCATGTACA
AAAAGCTGTGAAGGAGGATTTAAGATTCGATCAAGAGCTTGTAATAATCC
ACCGCCAAAATATGGAGGCAAAGATTGCGTAGGGATATCCGTTGAAAATA
AGACCTGCAATCTTCAAAATTGTCCAGTTGACGGCAAATGGGGCAACTGG
ACTTCCTTTGGACCATGTACAAAAAGCTGTGAAGGAGGATTTAAGATTCG
ATCAAGAGCTTGTAATAATCCACCGCCAAAATATGGAGGCAAAGATTGCG
TAGGGATATCCGTTGAAAATAAGACCTGCAATCTTCAAAATTGTCCAGTC
GATGGTAAATGGGGAAATTGGACTTCTTTTGGTTCTTGCAGTAAAAGTTG
TGGAGGAGGATTTCAGATTCGATCAAGAGCTTGTAATAATCCACCACCAA
AATATGGAGGCAAAGATTGTCAAGGAATGTCCAAAGAAAATAGAACCTGT
AATACACAAAATTGTCCAGTCGATGGTAAATGGGGAAATTGGACTTCTTT
TGGTTCTTGCAGTAAAAGTTGTGGAGGAGGATTTCAGATTCGATCAAGAG
CTTGTAATAATCCACCACCAAAATATGGAGGCAAAGATTGTCAAGGAATG
TCCAAAGAAAATAGAACCTGTAATACACAAAATTGTCCAGTGAATGGAGG
TTGGGGAGCTTGGTCACTCTATGGATTATGCAGTAAGAACTGTGGAGGTG
GTACTCAGCAACGATCAAGAACATGTAACAATCCAGCACCAAAGTATGGT
GGAATTAAATGTCCCGGTGCAGCCACTGAAAATCGTGCTTGTAATGCTCA
AAGCTTGAATGGAGGTTGGGGAGCTTGGTCACTCTATGGATTATGCAGTA
AGAACTGTGGAGGTGGTACTCAGCAACGATCAAGAACATGTAACAATCCA
GCACCAAAGTATGGTGGAATTAAATGTCCCGGTGCAGCCACTGAAAATCG
TGCTTGTAATGCTCAAAGCTGTTGGTCTTCTTATAATGAAGTGAATCTGT
GTAACGGAAATACCAAAATGATCAAATGCCCAAAGGTTACACAAGTAATT
CGATTGTCTGATTATTTTTATGGTCGGCAATCATCTACCGTATGTCCATC
GAGCAGTGGCGGGGGTTGGTTCATTGGAACTTTAAAAGACAATGTCAGAT
GTCGGGGTGGACAAACACCAATCCGTAACAGTTGCGAGGGTAAAAACTCG
TGTACAATTTCTGCAACAGATACAGCAATGGGAGGCTATCCATGTCCGAC
TGGACAAAACACAAGGCGAACGGAACCATACGCTTATTTGAAATATAGAT
GTTATGGATAAGTTGGTCTTCTTATAATGAAGTGAATCTGTGTAACGGAA
ATACCAAAATGATCAAATGCCCAAAGGTTACACAAGTAATTCGATTGTCT
GATTATTTTTATGGTCGGCAATCATCTACCGTATGTCCATCGAGCAGTGG
CGGGGGTTGGTTCATTGGAACTTTAAAAGACAATGTCAGATGTCGGGGTG
GACAAACACCAATCCGTAACAGTTGCGAGGGTAAAAACTCGTGTACAATT
TCTGCAACAGATACAGCAATGGGAGGCTATCCATGTCCGACTGGACAAAA
CACAAGGCGAACGGAACCATACGCTTATTTGAAATATAGATGTTATGGAT
AA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000175_pilon | genome | sc0000175_pilon:67094..71926 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1444-1617:175 |
| Aaloc | 1288-1443:340 |
| Aaloc | 1123-1284:958 |
| Aaloc | 952-1119:1570 |
| Aaloc | 781-948:2057 |
| Aaloc | 610-777:2459 |
| Aaloc | 439-606:3281 |
| Aaloc | 202-435:3979 |
| Aaloc | 55-198:4533 |
| Aaloc | 1-51:4834 |
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