|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000049_pilon:1016266..1018081+ Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_012825 ID=XLOC_012825|Name=XLOC_012825|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=1816bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000049_pilon:1016266..1018081+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGAAAAGTTTGAGAGCATAATTATAAGTGACGATAATTTGTTAACAAA
TGCCTTCAAAACTTTGAATGTTTTTCGTGAGAATGGGGAACTTTGTGACG
TTGTTCTCAAAACAGATGATGGTATTGCAATTCCTGCTCACAAAGTTGTT
TTGAGTGCTTCCTCTCCTTATTTTCGTGCTATGTTTACACTCAACTTTGT
TGAATCTTCAAGTTCATTCATCGATATGAAGTATGTTCCTGGAACGGCGT
TACGAGACATGGTGAACTATTTTTACACCGGACAACTCTGTGTGAATCAT
TTAAATGTCATTGGATTGATAGAACTTTGCCATGTCTTACAGGTGGACGG
ATTGATTGAAAAATGCGAAGTTTTTCTGAGGCGCAATCTGTCAACTCGTA
ATTCTCTTGGTTTGCAAGCATTTGCCAGACATTACTCTTTGGCTGGTTTG
AAGGATCATGCCATGAGATTTAGCTGCTGGAATTTTAGTCATATTAAGGA
GGAGGAAGAATTCTTTTTGATGCCACAGAAAGAGTTAAAACAACTGATAG
CTCACGATACTTTGAAGGCACAGTCGGAAGAAAGTATCCTTGAGGCTGCA
ATTAAATGGCTCGTTTATGATTTTGACAACAGAGAAAAACAGTTTGAGGA
ATTACTTGCTCACATCAGATTCCCATTGATGAGCCAGAAATATTTATTGG
AAAGTGAGCTTGTCAAATATATTCGTGAAAAATTTCCAACGTCTAGTAAT
TTGATTACCAAAGCAATAGACTACCATTCTCAAAACCCAGGGCTTGATaa
catttttgaattgaaaaacttttcaccACGTCTGGCCTCAGAAGATATCT
TTGTAATTGGGGGTTGGTCTAATGGTCAAAAGCTCAGTACTGTTCAGTGT
TTCAATGTTGATACCTTGAAATGGACTTCTGTAAACAATATGACTATTGC
ACATGTTGCAAAAGAGCATTACTTCAGAGTTATTGTATCCCAAGATGAGC
TGTATACTGTTGGCTACAATAAAGTTATGAAGTATGACCCTGTTGAAAGT
GCTTGGTATAAATTTGCTGATGGACCAGAAGTTCAATGTAAATGGGCAGG
TGTTTGTGAATACGATAATGGATTCTATGTTATTGGTGGCAGTACAAATA
AAACAAGTAAACGCTTCAATATTCAGAAAGCAACATGGGAGGACCTTCCT
GTTGGCCATCATGCAAGgtttaataattttcaattataatggattttttt
ttctaccacaaatattagttcccgcaaaaaattagttccaataagttAGT
AATTATTTCAAACTTgtgtttgaaaaatctaaattacTTATTATATAAGA
AATAAAGATGTTTCAAGCAATAATATTTAGAGGTCTTAATAGGCTTCAAA
TTGGAAAGAATCTATAATGTAGCAAACTTTAGTTATACTATGGTAATTAT
TATTTTAGGTACTATCCTGGAATTgctgttatgaatgaaaatttGTATGT
TATCGGTGGACTGGATAACAAATGGAGGCCGTTGAAAGTTTGTGAAATGT
ATGATCCACGACAGAGAAAATGGATTGAAATTGCAAAGTTACGCTCTCCA
AGATGGAATTTAGGTGTTGCTACACTCAGAAATAGACTTTATGCCATTGG
TGGAAATCATAATTTAGAACAATTTGCAAATACTGTTGAAGTGTATGACC
CAAAAGAAGATAGCTGGGAGCGCTCGGTTGCATCAATGAACTGTGGACGA
AGATGTTTAGGAGTTGCAGTTGTGAATGATTTGATTTATGTTGTAGGTGG
ACGAGTAACCAATACC Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000049_pilon:1016266..1018081+ >XLOC_012825 ID=XLOC_012825|Name=XLOC_012825|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3150bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000049_pilon:1016266..1018081+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGAAAAGTTTGAGAGCATAATTATAAGTGACGATAATTTGTTAACAAA
TGCCTTCAAAACTTTGAATGTTTTTCGTGAGAATGGGGAACTTTGTGACG
TTGTTCTCAAAACAGATGATGGTATTGCAATTCCTGCTCACAAAGTTGTT
TTGAGTGCTTCCTCTCCTTATTTTCGTGCTATGTTTACACTCAACTTTGT
TGAATCTTCAAGTTCATTCATCGATATGAAGTATGTTCCTGGAACGGCGT
TACGAGACATGGTGAACTATTTTTACACCGGACAACTCTGTGTGAATCAT
TTAAATGTCATTGGATTGATAGAACTTTGCCATGTCTTACAGGTGGACGG
ATTGATTGAAAAATGCGAAGTTTTTCTGAGGCGCAATCTGTCAACTCGTA
ATTCTCTTGGTTTGCAAGCATTTGCCAGACATTACTCTTTGGCTGGTTTG
AAGGATCATGCCATGAGATTTAGCTGCTGGAATTTTAGTCATATTAAGGA
GGAGGAAGAATTCTTTTTGATGCCACAGAAAGAGTTAAAACAACTGATAG
CTCACGATACTTTGAAGGCACAGTCGGAAGAAAGTATCCTTGAGGCTGCA
ATTAAATGGCTCGTTTATGATTTTGACAACAGAGAAAAACAGTTTGAGGA
ATTACTTGCTCACATCAGATTCCCATTGATGAGCCAGAAATATTTATTGG
AAAGTGAGCTTGTCAAATATATTCGTGAAAAATTTCCAACGTCTAGTAAT
TTGATTACCAAAGCAATAGACTACCATTCTCAAAACCCAGGGCTTGATaa
catttttgaattgaaaaacttttcaccACGTCTGGCCTCAGAAGATATCT
TTGTAATTGGGGGTTGGTCTAATGGTCAAAAGCTCAGTACTGTTCAGTGT
TTCAATGTTGATACCTTGAAATGGACTTCTGTAAACAATATGACTATTGC
ACATGTTGCAAAAGAGCATTACTTCAGAGTTATTGTATCCCAAGATGAGC
TGTATACTGTTGGCTACAATAAAGTTATGAAGTATGACCCTGTTGAAAGT
GCTTGGTATAAATTTGCTGATGGACCAGAAGTTCAATGTAAATGGGCAGG
TGTTTGTGAATACGATAATGGATTCTATGTTATTGGTGGCAGTACAAATA
AAACAAGTAAACGCTTCAATATTCAGAAAGCAACATGGGAGGACCTTCCT
GTTGGCCATCATGCAAGATGGAAAAGTTTGAGAGCATAATTATAAGTGAC
GATAATTTGTTAACAAATGCCTTCAAAACTTTGAATGTTTTTCGTGAGAA
TGGGGAACTTTGTGACGTTGTTCTCAAAACAGATGATGGTATTGCAATTC
CTGCTCACAAAGTTGTTTTGAGTGCTTCCTCTCCTTATTTTCGTGCTATG
TTTACACTCAACTTTGTTGAATCTTCAAGTTCATTCATCGATATGAAGTA
TGTTCCTGGAACGGCGTTACGAGACATGGTGAACTATTTTTACACCGGAC
AACTCTGTGTGAATCATTTAAATGTCATTGGATTGATAGAACTTTGCCAT
GTCTTACAGGTGGACGGATTGATTGAAAAATGCGAAGTTTTTCTGAGGCG
CAATCTGTCAACTCGTAATTCTCTTGGTTTGCAAGCATTTGCCAGACATT
ACTCTTTGGCTGGTTTGAAGGATCATGCCATGAGATTTAGCTGCTGGAAT
TTTAGTCATATTAAGGAGGAGGAAGAATTCTTTTTGATGCCACAGAAAGA
GTTAAAACAACTGATAGCTCACGATACTTTGAAGGCACAGTCGGAAGAAA
GTATCCTTGAGGCTGCAATTAAATGGCTCGTTTATGATTTTGACAACAGA
GAAAAACAGTTTGAGGAATTACTTGCTCACATCAGATTCCCATTGATGAG
CCAGAAATATTTATTGGAAAGTGAGCTTGTCAAATATATTCGTGAAAAAT
TTCCAACGTCTAGTAATTTGATTACCAAAGCAATAGACTACCATTCTCAA
AACCCAGGGCTTGATaacatttttgaattgaaaaacttttcaccACGTCT
GGCCTCAGAAGATATCTTTGTAATTGGGGGTTGGTCTAATGGTCAAAAGC
TCAGTACTGTTCAGTGTTTCAATGTTGATACCTTGAAATGGACTTCTGTA
AACAATATGACTATTGCACATGTTGCAAAAGAGCATTACTTCAGAGTTAT
TGTATCCCAAGATGAGCTGTATACTGTTGGCTACAATAAAGTTATGAAGT
ATGACCCTGTTGAAAGTGCTTGGTATAAATTTGCTGATGGACCAGAAGTT
CAATGTAAATGGGCAGGTGTTTGTGAATACGATAATGGATTCTATGTTAT
TGGTGGCAGTACAAATAAAACAAGTAAACGCTTCAATATTCAGAAAGCAA
CATGGGAGGACCTTCCTGTTGGCCATCATGCAAGGTACTATCCTGGAATT
gctgttatgaatgaaaatttGTATGTTATCGGTGGACTGGATAACAAATG
GAGGCCGTTGAAAGTTTGTGAAATGTATGATCCACGACAGAGAAAATGGA
TTGAAATTGCAAAGTTACGCTCTCCAAGATGGAATTTAGGTGTTGCTACA
CTCAGAAATAGACTTTATGCCATTGGTGGAAATCATAATTTAGAACAATT
TGCAAATACTGTTGAAGTGTATGACCCAAAAGAAGATAGCTGGGAGCGCT
CGGTTGCATCAATGAACTGTGGACGAAGATGTTTAGGAGTTGCAGTTGTG
AATGATTTGATTTATGTTGTAGGTGGACGAGTAACCAATACCGTACTATC
CTGGAATTgctgttatgaatgaaaatttGTATGTTATCGGTGGACTGGAT
AACAAATGGAGGCCGTTGAAAGTTTGTGAAATGTATGATCCACGACAGAG
AAAATGGATTGAAATTGCAAAGTTACGCTCTCCAAGATGGAATTTAGGTG
TTGCTACACTCAGAAATAGACTTTATGCCATTGGTGGAAATCATAATTTA
GAACAATTTGCAAATACTGTTGAAGTGTATGACCCAAAAGAAGATAGCTG
GGAGCGCTCGGTTGCATCAATGAACTGTGGACGAAGATGTTTAGGAGTTG
CAGTTGTGAATGATTTGATTTATGTTGTAGGTGGACGAGTAACCAATACC
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000049_pilon | genome | sc0000049_pilon:1016266..1018081 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1219-1575:1460 |
| Aaloc | 1-1215:1 |
|
