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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000202_pilon:342157..348080- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_012730 ID=XLOC_012730|Name=XLOC_012730|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=5924bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000202_pilon:342157..348080- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGCCATACGTTGAAATCAAGCTTGGAGCTAATGAGATTGGAACATGGAG
ATTCTGGAGAGCAGTTTTAGCTGAATTTCTCGGAATGCTTTTATTTTTGC
TTTGCGTCACTACTGTGGCCTTGCATGGTACCAAAGACAATCAATCGGCT
AATAACGTTGAAGCTGGTTTAGGTATTGCATTTGGTATCACAACATTAGC
ACAAGCGTTTGGCCACGTCAGTGGCGGTCATCTTAACCCAGCGGTTACGC
TTGGGCTTGTAGTTGGTGGACGAACACCTATTATTAGAGGATTCTTTTAT
ATTGCAGCTCAAATGGTCGGAGGTAAGAAAAACTATTTATCAGCTTTATT
ATATAAGAACAAATTATATAAGAATATAAGTGATAAAGCATCGTTGGCCG
AAATATCAAAAACAAGTTAAGAGCATTTCATATGTCGGGTGATGATGAAA
TCAATGTCAATTTTCCAATGGGGCTGGGGTCTCAGCGGGCCTGTGACACA
CGGGTGTATTCAAAATCTTGATCATACGTAGGTGACCTCCAACTCTAGAA
AAGCCAATTAGATAATGCGCATGCGCTGCTAATAAAGTCATTGATCGAAA
ATCACCTCATCGTACCATCATTTTGCAAAAAAAGAAATTTATGAATGGAA
TTTGCAAAATGATTGTAATTACGTCCAGAGATAATTACTTTCTATGTTCC
AGTAATTGCATTAACATCATAAAACTTTTCAGTTGTTGTGGGTGAGGCTT
AACTATTGTATTTGTGTTATGACAACATCAGAAAAAACTTTATAAGAACA
CAGACCTCTGCACTGAGGCTTCCGAAATTTTAAGAGCGCTATAAAACTTT
ACAGACTCTATTAAATTACATAGAAAATATGGTTAGAAAGTGCCGAAAAT
GAGTAAATTTTCAGGCTTGATACGCAGGTCCACAACTGAAGCCCACAAAA
AGTTCTGATGTTCTTAAGAAAAGAAAGAATGTGGCGTGTCTTTTCCTTTG
TTTGTTGCTGTGAACTACAGTTTGGTTATTAGAAATTGAATTTATGTCAT
CCATGAGATAGGAGGGGATAGGGAGGGGTAATTGCAGAGTATGAAGTGTT
TACGTGTCCGTGGTTCTCCAGGTACACGTTTTTTATAAGAACAAACTATT
TAAGAACATAAGGCTTCGATGGTCAAAATGTTAAGAACATTTTAAGGTTT
CGTGAACTCTAAAACAGCCAATTTCTTAGGAAACTAGGTAAAAATGGTCA
TAAAATGGTGAGATTTAAAGATAGTTAAGAACATTTTTAGGATTAAACCC
CAAAGAGTTAAGAAAATCCAACGGCTTCAAAAATTTTGGATGTTCTTTAA
AAAAATGTTTATTATTATTATGAGAACCAGCAAATTTTTGAAGAGGCTTG
TGACTCTTTTTATTTCATGACACTTTTTAAACTTGTACTCGTTCTTTTCT
TATTTCAAGGGAAAAATTGAGGTATTTAAGGCTTAGTACCCTATTTTACT
CTACTACATTGACCATTTATTTTGCATAAAGATCGGTCGTTCTAGACTCA
GCATTGTTTGTATTTTTAAGTCTCATTGTTCTTACAAAAAGAGTGTACAA
CCAAAGCTCTCACTGGCCAAGAAATCCTCTTCAAACTAACCAAAGGCTGA
AAAAACAAACATCGAAGTACATTTTTTAATTAGATTTCATTAAGAGAATA
AGGCTCTAAAGCAAAAGGAAATTCAAGAACAAAACCTAGACGTTGGATAT
CTAATAATAAAGTGTATTGGATGGAGGCTAAAAAAGAAAAAAATTGAGAA
AACTGAGACTTTCAGGCTCTTTTGCGAGACCACGAAATTACCTTGTTTTA
ATAGATTCAAATTTCTTTTTATCTAAAAAAATGTCATAACAAAGAAAATA
AAAGTGAAGATGATAATAAATTTTATCGGCGACCCAAAAAATATCTGCAA
TCTGATTGGTTAAAAAGAGTACAATATATCTTGTATTTTACATGTAAAAA
TATAAATTGACGAAAAGATGTTGTTGCATTGAAGCGGTAGCAGCAATCTA
ACGTCACTTTGCTACAAAAGTGCCCTGCGCTTTTTTCCAACACAAAAAGT
GCATTTTTTGGGTCACCGATAAACCAGTTATCAGACATTTGCTCGTACAA
TATGGAAATATTTTACTCGTTCCGGATTTTCCGTATATTTTCCTCGCCTA
CAGGCTCGGAAAATATTGTACGGAATAATCTCGGAACTCGTAAAATATTT
CTCATATTGTACTCGCAACTGTCCGATAACTATTACATATCGGAATCGAT
AACTTTTCGATCAGCTTTGATTAATTTTCAGCTAACTTCGATTGATGATA
CACCCCTGTGTCACAGACCCGCTATAGGGTCCCAGCCCTACTGGAAGATT
TGGCGGAGATTTCATCCCGTTGGGGAAATTATTCTACCATTTCTGCCCCC
ACTGAGATATTGAGTTTGATAGTTTCATCCCTTTTTGAAATCTAAGGGAA
AGATTTTCATTCCAAATCCAACCACACTGGAATTTTTTGACTTGAGAACA
ATAGAATTTCTATCCCATTGACATTTTGTATATATTTTCATCCCCACTGT
CACTGTGGAAACATTCTCACGCCGGGGCTTCAAGACAGGGTTGTGTTGAT
ACAATATTTACTTAATGATCGACTTCGATTGTAAAATCGTTTAACATTCG
ATCACTGTCTCACCCGGGGGGGGGGTACTTAGGCAAAAATAGGTGCTGGG
TATGTGCGGACGGTAAGGGTCGGGTTTTTCACTTTTCAAAGTCTCTCTAA
GGGTTACAAAAATCAGGAAACTTCAAAGTAGTCTCTCTAAGGGTGGGTAA
AATCACGATTTTTAGAAAAAAATTTTGATTTTGAGAGAAAAAATTACAAA
AAAGTCTCACTAAGGGTAGGAAATTTTTGAAAATCAGAGAAAATCTTTCG
AAAAAGTCTCTCTAAGGGTCACTTTTTCACTAAAATTTGGTCTCTCTAAG
GGTCGGTTTTCGGAGGTCCCGTCCGCACATACCCCTCATCCAGCAACCCT
AGTACCCCCCCCCCCCGGGCTGTCTCATGTAACTCTTTCATGTTCAACTC
AAATCCGTATTATCACAGATCGAGTTAATCGAATTATTCAAGGTAATAAA
CTAGAATCAAATCTCATAAAGAAAATAATAATTAAATGATACAAGTTTTG
AACTTTACCCTGTCCCTTATAGTTTGCTTTTTTATGATTCTGATAGCGCT
CGCACGAGAGGTTGTATCGCGTCCATCTGTGAAATGCAAGGTCGGATACA
GGAGGGAGGCTATCTTATTCATGGAGAGTAATTAGTTTACATATAAGGTA
ATACGATAATAAAGTGCACTCTCCTCCATTGGTTATAGCCTCCCTCTGTG
TCCGAGCCTGAAATGAGTAAGTGTGTAATGAGATAGTTTTCGAGATTGAG
TCAATATACTTTAATCGTAGAAACTTTAGCGAGGCTAATTTTGGCGTTTT
AGCGAGTTTTCCCTATTTTCGCTAAAGTAAATCCAAAAGTACCCAAGATT
TTCTTGACTCGCTAATATACGCTAAAATTAGTTTCGCTAAGATTTCTACG
ATTAAAGTATATGATATTCATGACATTTTAACAGAAAAAACTTGGTGTTG
CCACTTATGTCGAGTTAAAACAATGAACTAGTGGCAAACAACTGGGTTAT
TTTTAGTGCTTCAGTATAAAAATGTCATGAATATCATGAATCATGTTCTT
TTTATTTTATCTAGCAATTGCTGGTTCAGGGATCACATATGGTTGCACAC
CAGAAGCAGCAAGGGCGACACTTGGTGTGAATGCGGTGGCAGAAGGAGTC
AGAGTTGGACATGCATTCACACTGGAGATGCTCTTCACATTCATATTGGT
TTTCTTCGTTTTGTCTGTTACTGATCCTATCAAGAAAGTTGAACCATACG
GCCAAACGTTGGGTATTGGAATTTGCATCTGGGTTGCTCACGTTTGTTTG
GTAAGCTTTTTTTGCTGCTTTAACATTCCATTTTTCTTTATATGTAAAGC
CCCCATGAAGAGATTCGGTAGGAATATTCAACATTCTGAAGAAAAAGGAT
AATGGTTTTCTATCCTTAATGTTTAACTCCTAAATATTATTTACTAAATG
ACTGAGACAGTCTTTTTTTCATTTCTTTAAGATTCCATACACAAATTGCA
GTATCAATCCTGCTCGTTCATTTGGACCTGCAGTTATAATGGACTCATGG
AAGGATCACTGGGTAAGGAAACCACATAAGTATAATCTTGATGTCAGAAT
ACACCCCCTTCTCACAGACCCGGTAGCATTCTTTCAGCCAGTGGGGAGTG
GGGCTAAAAATAACGGACAGAAACTCGATAGGGACCGATATACCCATACA
TTTTATGACTGGGGATCTAAATTGTTTTATTTGATTGTTTTCAGTGGGGA
CAAAAATGTGAGCACAATTTTGCAACAGGGACGATATTTGGCTAATTTTT
TCCAGTGGGAAGTGGGTCTGTGAGAAGTTGGTGTCAAAATACTATATAGA
ATTAAATTTGCTTCACAAAGACACCCCTGTGTCACAAACTTTTTGGAAAA
TTTGATCGAATTCCACCCCTGTTCGGAAAAATGCCCAACAATTTCAGTTT
CGCTGGGAAATGGACTTTGTTTTTCTCCATTTGAAATTAAATAGGTAAAA
TTGCACTCCAAAATCATTCCAGTTGGACTTTTTGACGTGGGAACAATAGA
ATTTCTATCCCCATTGAGTTTTCGATAAAAGTTTTCATCTCCACTGTCGG
AAGAAGCTCCACCTGGGTTGAGATGTACAAATGGAAATGTATTAGGTGAT
TAGGAGGGGAGTTAGGATTCTCAAAGTTACGGGTCTATTTCACTTCCATC
CAATGTCCAATAAAGAAAAATTAACCACCTTGAAATTGGTACCGTGAATA
GCACAGGTCAAAATCATGCTGTGCCGACGAATCGAGATTCTATTCAGCGC
GCAATCAACGAAGACAAAATTAACCATGATGACCATCCAAGATCTTGGAT
GAAGTTCAAAGTTGATATTTTTATTCCCGTCGTTGAAAACACAACTTAAG
AAAGTCATCAATGCTTTGTAAAAAGAGTCAGTGATAGAGAATCATAACAT
AAAGTCTGTCTATTATTTCGATTCAATTAAAGTGACATTTTCATAATTAA
AAGTTTAGTAATTACTGTTATACATTTGGGGATCATGTAAAAGATTTCTT
TCGAAATAAACTCATTTCAATTACACTTGGAGATTTCTGGGGAATTCGTA
AATAGTAAACTGCATACTGATACAATCTGCTAGACATTAATACAGGGTGT
CCCTAATTAAAGTATCGAGTTTGAACATGTGATTGAGTAGAAAAGTTTGT
GTGTGTTATCGCTAAAATATAAGAACGTTCTCCATCACACAGGCTTATTA
CAAAAGGTAGTTACAACGTATAAATTAATCGTAATTAATGACAAAGAAAA
AAGAGGGAGAGCTTAAAATACAATTTTGTGAACACGCACATAAAACTTTC
TACTCATAGTTGTGTTTCGACTCGATACTTTAATTAGGGACACCCTGTAT
GGTAATATTTGCTCCTTATCTTTGATTCTTTCTACAGTGATTATATTGAC
ACATGCGCGATAAAATTTCTATTATTGGTCTTCAGAGGTTAATATATTCT
TTGAAAACTTAACCTCTGATACTCAGGGTATGTATATGGAGCTTTTCGGA
ATTTGATAATTTTTTATCATTCTTTTTCAGATCTTTTGGATCGGTCCATT
CGTCGGGGGATTAGTGGCGGCGCTTTTGTACTCGTGCATTTTCTACGCTG
AAGAAGAAGAAAAATATGAAGTGGAACGACAAAGATCTGCAATTCCTCTT
CAAAATACTAAAGCTTCTGCTTAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000202_pilon:342157..348080- >XLOC_012730 ID=XLOC_012730|Name=XLOC_012730|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1566bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000202_pilon:342157..348080- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGCCATACGTTGAAATCAAGCTTGGAGCTAATGAGATTGGAACATGGAG
ATTCTGGAGAGCAGTTTTAGCTGAATTTCTCGGAATGCTTTTATTTTTGC
TTTGCGTCACTACTGTGGCCTTGCATGGTACCAAAGACAATCAATCGGCT
AATAACGTTGAAGCTGGTTTAGGTATTGCATTTGGTATCACAACATTAGC
ACAAGCGTTTGGCCACGTCAGTGGCGGTCATCTTAACCCAGCGGTTACGC
TTGGGCTTGTAGTTGGTGGACGAACACCTATTATTAGAGGATTCTTTTAT
ATTGCAGCTCAAATGGTCGGAGATGCCATACGTTGAAATCAAGCTTGGAG
CTAATGAGATTGGAACATGGAGATTCTGGAGAGCAGTTTTAGCTGAATTT
CTCGGAATGCTTTTATTTTTGCTTTGCGTCACTACTGTGGCCTTGCATGG
TACCAAAGACAATCAATCGGCTAATAACGTTGAAGCTGGTTTAGGTATTG
CATTTGGTATCACAACATTAGCACAAGCGTTTGGCCACGTCAGTGGCGGT
CATCTTAACCCAGCGGTTACGCTTGGGCTTGTAGTTGGTGGACGAACACC
TATTATTAGAGGATTCTTTTATATTGCAGCTCAAATGGTCGGAGCAATTG
CTGGTTCAGGGATCACATATGGTTGCACACCAGAAGCAGCAAGGGCGACA
CTTGGTGTGAATGCGGTGGCAGAAGGAGTCAGAGTTGGACATGCATTCAC
ACTGGAGATGCTCTTCACATTCATATTGGTTTTCTTCGTTTTGTCTGTTA
CTGATCCTATCAAGAAAGTTGAACCATACGGCCAAACGTTGGGTATTGGA
ATTTGCATCTGGGTTGCTCACGTTTGTTTGCAATTGCTGGTTCAGGGATC
ACATATGGTTGCACACCAGAAGCAGCAAGGGCGACACTTGGTGTGAATGC
GGTGGCAGAAGGAGTCAGAGTTGGACATGCATTCACACTGGAGATGCTCT
TCACATTCATATTGGTTTTCTTCGTTTTGTCTGTTACTGATCCTATCAAG
AAAGTTGAACCATACGGCCAAACGTTGGGTATTGGAATTTGCATCTGGGT
TGCTCACGTTTGTTTGATTCCATACACAAATTGCAGTATCAATCCTGCTC
GTTCATTTGGACCTGCAGTTATAATGGACTCATGGAAGGATCACTGGATT
CCATACACAAATTGCAGTATCAATCCTGCTCGTTCATTTGGACCTGCAGT
TATAATGGACTCATGGAAGGATCACTGGATCTTTTGGATCGGTCCATTCG
TCGGGGGATTAGTGGCGGCGCTTTTGTACTCGTGCATTTTCTACGCTGAA
GAAGAAGAAAAATATGAAGTGGAACGACAAAGATCTGCAATTCCTCTTCA
AAATACTAAAGCTTCTGCTTAAATCTTTTGGATCGGTCCATTCGTCGGGG
GATTAGTGGCGGCGCTTTTGTACTCGTGCATTTTCTACGCTGAAGAAGAA
GAAAAATATGAAGTGGAACGACAAAGATCTGCAATTCCTCTTCAAAATAC
TAAAGCTTCTGCTTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000202_pilon | genome | sc0000202_pilon:342157..348080 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 640-783:145 |
| Aaloc | 559-639:1744 |
| Aaloc | 325-558:2159 |
| Aaloc | 1-321:5925 |
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