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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000202_pilon:352294..359260- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_012729 ID=XLOC_012729|Name=XLOC_012729|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=6967bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000202_pilon:352294..359260- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTGCAACAATCGGAGAGTCCAACTTAAGTTTGGAGCAGACGAGCTCAG
TAAATGGAAATTATGGAGAGCTGTCTTGGCGGAATTCGTTGGGACAATGT
TATTTCTTTTATGCGTGACCACGGTTGCATTATTCAACGCTGGGAGTGGT
TCATCATCTGTCAATGTCGAGGTAAACTTTACTTTATTGCTTTTTTTAAG
TGTACACATTTTTCAAAAGAACAATTTTGTAAGAACATCAGAGCAAGTAC
TCATTATGGAGCGATGGCCAAGTGGTCAAAGACGTCAGCGTCTCAATGCA
AGGATTCCCGGTTCGAATCCCCTCTCATTCCAATATTTCGTTCAGTTCAT
AAATAACCGAGCCGGCTGGCCGTAGACCTGTGAAAACAATCGAAAAACTG
TCCTAAACTCCTAGATTACTGGGTTATTCACGTAAAAATATCGACTCTAC
TTTAGTAAGTCAGATACATGCGAAGGATTGCAGCGCTCGTTAAAAGACAA
TGAAATTACAATTACAAATCTCTTCCTCTGATAATTTCGATATGGTCTAA
AACCACCTATGCCATCAGGCTAAAACCTGTAGAACCAATTATAAACAACC
TGGGAAACATGTGTTACAGGCCTGGCAGGACTTAACTCTACTGGGAAATT
TCAGTCCCGCTGGGAAATTGACTTCGACTTTTCCCAATCTGAAATTCAGT
GGAAAAATATTACACTAAATGTTTCTGACCCTTTTAGAATTTGGTTAGAA
ACCGGTGGAAAAAAACTCCACAACTGAGACAGGCGTGTGATATGTGCTTC
AGATTTCAAAAATTCTCAAGAACACTGAATTTAAACTACTTTCAGCTTGT
CGACGAAGGAATTTGAACATTTTTGTGAACAAGAAATACCACCTTAAAAA
AATATATTGATAGAAGAAATTTTGTCGAGAAAAAAAGTTATGAATAATGG
GAAAATTCGCCAATACACCGTTTAGGAGTGTCGACTGCGCACGCGTCAAT
CCAATTTTCCATTGTTTTGATTTTAGCGATCACGGAAAATTCACTCTCCT
CCGTAAAAAAACGGTAGGTAGACATCTGGTTCTCATAAGGAAACATAGCA
GAAAAACGGTAGGTAAAGAACTCCTTTTAATCATAACTTCTTTTCCTCTT
GATGAATTTTGTGAAATTTTCAGGAGAGACTTATAAAATTATCATTGATA
TCATGTTCAAATATCTAAATCATTCTCTTTAAAGAAGAGACAAAAATTCA
CAATGTTTACATTCCTCTAACCTTTCACAGTACTAAAGTGCGCATTTTTA
CCTACCATTTTTACCGAACCTCTGCAATGGAGTACCGTGAAATGGTGAGA
CTCCTAAACGGTGTATTTTACATAAGTTAATTTTGACGAATGATCTGTTA
TTTGGTAGGAGTTTTAGCTGAGCCAGGAAGAAAAAACACGAATTTAGGAA
AATTTGAATCACGTTGAAAAATAATAAAATTTGGAGAAAATTAATTTCGG
CGAAAAATGGTAACCAAATAATCAAATTTAGGCAAAAATAAGTATGTACC
AAATTATTTAGAAAGTCTTATCAAGACCAAGAAGGCATCTCATTTACTCT
TGTCTCCCGAATAGACGGGGGGGGGGTCGGAATAAGCGGGGGGTGGTGGA
ATAAGCGGGGGGGGGGGGAGGTGGAATAAGATGGGGGGGGGGTAATTTGA
AGACAGAATTTTTTTAAACTGATATCAATTTTAACAACAAACAAGAAGCC
GAAGCGGCATGAAGGTCCAGCTGACGTGGCAATAACCAAATGTCGTTTGT
ATTGGGTATATACCTTAAGAGAACTAATGTTTGCGGAATCGTATTTTTGC
AATTTTAGGGTTTGAAAGAAAACATCGAATCTTAGAATCCTAATGCACAC
ATTTTCGGCAGAGATTGAAATACAGAACATTCAAATAGTTAAAAAAGTTC
GAAAATTGGCTGAATGAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAGCTGCCCTGGAAG
GTCAGTAATGATAAATGATACGCAATATATGTATATAATAGATTTACTTT
ATGTTTTTGTTACTAGTACGAAAGAAAAAATCGGTTTAAATAAATTCACA
AACTTCGAATGTCAAATGTTGACCGTCAAAGTCCAGAAATATCGATTTAA
CGCGTAGCATCATGAAAAACATTCCAAACTTATTCAAATTGACACTCGCA
TGAGCTGCATTTTAGTATCCTTTAATGAGTTACAGCAAAAGTTTACTTGG
GAAAATTCTCTGTCAGGTTTGAAAAATCCAGCCATCGTCCGTTTAGAGCG
ATAAATCCAAAATTAACCATTTTCACGGCGTAGCTACCCTGAGTATCGGA
GGTTAAGTTTTCAAAGAAAATAGTAACCTCTGAAGACAAATGATATAAAT
TTTATCGCGCATGTGTCAATCTAATCAATGTAGAAAAAATCAAAGATGAA
GAGCAAATATTACCATATTAATGTCTAGCAGACTGTATCAGTATGCAGTT
TACTATTTACGAATTCCCCAGAAACCTCCAAGTGTAGTTGAAATGAGTTT
ATTTCGAAAGAAATCTTTAACATGATCCCCAAATGTATAACAGTAATTAT
TAAACTTTTAATTATGGAAATGTCACTTTAATTGAATCGAAATAATAGAC
AGACTTTATGTTATGATTCTCTATCACTGACTCTTTTTACAAAGCATTGA
TGACTTTTTGTAAGTTGTGTTTTCAACGACGGGAATAAAAATATCGACTT
TGACGCTCATCCAAGATCTTGGATGGTCATCATGGTTACTTTTGTCTTCG
CTGATTGCGCGATGAATAGAATCTCGATTCGTCGGCACAGCGTAAATATA
TGATTTTGAGCTGTGCTTTTCACGGTACGGCGTAGCATCTTGAAAAACAT
CCCAAACTTATTGAAATTTACACATGAGCTGCATTTTAGTATCCTTTAAT
GAGTTACAGCATAAGTTTACTTGAAAAAATTCTCTGTCAGGTTTGAAAAA
TCCAACCACCGACCGTTTAGAGCGATATATCCAAAATTGACCATTTTCAC
GGGTAGCATCATGAAAAACATTCCAAACTTATTCAAATTTACACATGAGC
TGCATTTTAGTATCCTTTAATAACTTAAAACATAAGTTTACGTGGAAAAA
TTTTCTGTCAGGTTTGTTTAGAACGATAAATCCAAAATTGACCATCTTCA
CGGGTAGCATCATGAAAAACATTCCAAACTTATTCGAATTTACACATGAG
CTGCATTTTAGTATCCATTAATAACTTACAACATAAGTTTACGTGGAAAA
ATTCTCTGTCAGGTTTGAAAAATCCAGCCACCGACCGTGAAAATTGACCA
TCTTCACGGGTAGCATCATGAAAAACATTCCAAACTTATTCAAATTTACA
CATGAGCTGCATTTTAGTATCCTTAAATGACTTACAACATAAGTTTACTT
GAAAAAAGTCTCTGTCGAGCTGGAAATATAAAACTCCAACTAAAACATCC
AAATGCTCGACTCCATCCATCTTGAAAACATTAAAAAATACTTTGCCATG
AAGAGGATGAAATTTGACTTTACTACCAATTCAATCCAATATAAGAGTAG
GTCAAACATCGTGCGGGTAAGCGGGGCAAAAATTCTAAATCGGCCGCTGG
TTTAGCCTGGACTACTGGACTTGTTAATTTATTGCGCGCACAGGCTCCGA
CAAAGCCACAATCTTTTCGGTCAGTTGCTTTTTAAAGGCCCACTTGCGCT
GCGCGGCTGGGCCAAAAAGAAACTTTAACAAATAAACACGTAAAATAAGA
ACCACTACTAACAAAAAGGAAAATTTCAACAAGTTTAAGGTCTATCTACA
CTGTAATAAAATATTGAATTATTTTAATTTAATTAGCGGGGAGGGGGTTC
TTAATAAGAGCGGGGGGGGTGGACAATAAGCAGGAAGACGTCTATTCGAG
AGACAAGAGTATTTCCCACGATTTTCCCTTTTTTACAGGTTGGTATAGGA
ATCGGTTTGGGGATCGCTACATTATCATTTGCTTTCGGACATGTCAGTGG
TGGTCATTTAAATCCTGCTGTCACTTTTGGTATGATCATCGGTGGAAGAA
TCTCTTTTTTACGTGGATTGTTTTATACATTGGCTCAAGTTGTTGGAGGT
TAGTAACTTCTTTTATCACGGTTGACTCTCTCTAATTTGATTTTCAAGAG
GTAGATTATCTTCTTCGAATTATGGAAAGATTCGAATTACAGGGAAAATT
TAATGCCATTCCTCAGATAAAGTGACCGGTTCTATAATACAACAAAAGGA
TTCGAATTACATAGATGCTCGAATTAGAGAGAGTTGGTTGTATCTTTGTA
CCAACAACAACGAAAAGCTCCGAATTTGCACTGATTTTACTATTTCCAGA
TTTTTGATAGGAAAATGAGGTAATCTTGACTTAAACACATAAAACTGGGC
CAAAACGTCCAAACAACCTTCGTAGAACGTTAGAAAAATCTTGGCATACA
TCATCTAGGAGTAAATCATTCTAAATATGACACACTGAGATGAAGCTGAA
CTTCACCAGATAAAATGATTTTGGTACATAGTATAACCAACAAGTGCTAT
TGGTTACTGACTGACCTTGACAGGACGGTGATATACCGCTGGAATTCGAA
AAATTCATTTTGTCAGTCTGACAAAAGTTCGATAAAATATGGACCTTAAC
AGACAAGATTTGGACCCTGTCTGACGAAATTTCAATTTTTTTTCTGAAAC
CCATCCTAAAAAGTTGTGTGACTAACCAGAAGTCGGTCCTACCATATAAT
ATACTGTCCGAATCTAATGAACATACGAATCTGTCAGATATTTTCAGAGC
TTGAATAATTGGCCAAACAGTGGTACGTCCCTTATCTCCATTCTGCTTTA
GGTTTGCCCTATTTTTCAAACACTGCTTTGTTCAAAAGGGTTTCTTTAAA
CAACGAGCGATACAACTCAACAAGTTGATTGAGAATTCAAATTAGCACTC
TTTGAACATTTCCTTAACTTTTTCATCTCTTCATTCATTATACAGCTATT
GCTGGGTCAGCCATCACATACGCTTGTACTTCAACTTTGGAACAAGGCAT
TGGCAAAACAAGATTGGGACAGAATTTTGTCAAACGTGGTGACGAAATAG
AAGCTATTGCATTGGAAATGCTCTTCACTTTCATTTTGGTTTTTTTTGTT
TTCTCTGTTACCGATCCGAAGAAGAAAGTTGAACCTTATGCACAATCCTT
GGGTATTGGTGTTTGTATTTGGGTCTGCCATGTTTGCTTGGTAAGGAGTT
ATTCCATATTCCTTCACAGACCCAGATCAAAATACTATTGATACTCCAGA
GTTTTCAGCTTCATTTAAGAAACTAACTCAAGTTTACATCCCTTTCTCAC
AGACCCGGTGGGATTTTTTGAGCCAAAGGGAGTAAAAATTACGGACTAAA
ACTCGATTGGGGTTGTTATTACTATTTTTTTTCATGGCTTAGATAAATTT
CCATTGTTTTCGAGCCGGAAAATTAAATTTGGCGATGGAAAAAGTAGCAC
AATATTTTGCAGTGAGGATTTGCTTTACTGATTATTTTCAGTGGAGACAA
AAATTAGAGTATAATTCTCCAATGGGGACGGTATTTTGGCCAATTTCTCC
AGTGGGAAGGGGTCCTAGTGGGTCTGTGAGAAGGGGGTGTAATTTACTGC
GGAGCTCTTAAAATTAACATATCAACGCTGGTTACTGATTTTTCCTTTTT
TTCATAGATCCCATACACCAATTGTAGCATTAATCCAGCTCGATCCACAG
GACCAGCTATAGTTATCAGCGATTGGAATGGACAAGATGAATTCTGGGTA
AGTTAACAATGCATTCTGGCCCTTTTGAATAGAATAACTTGATATATACT
AGCGAGTACCTCACCAAAATCAGAATTTTTCATTCCGTTTCTTGGTGAGC
TTCATCAAATCTGGGCTCCAAACATCCGAAGAAGTTGCATAGTTGAACGG
ACATCACTGCATAGAAAATAGCCGTGACATCTATTAAAGGCTAAATACAT
ACTAAAAACTATTAAATATAAAGCCCGTTGACAAGACTCCGCTATAATTG
AGAAAAGTCACATCAAGTTAACCCTTTATGTGTCACGGCCATTTTTTCTA
ATTTTTTTAAAGAAAATCGCTAGTTCAAACTATAAAGGCTTATATCTCTG
GATCTAGAAGGAGTTAGGTCCAATTTTAGAGGTTTTTGAGTCACTTGTTG
ACCAAAAATGGTCAAAAAACGGTCAAAATTTTAAAAAAGTGGATTTTTGT
CAATTTTTTGCATTTCTTTTTGACTTTTTGGCTTAAAATCTTGCTGGAAA
GACTCGGAAAGATTTTGCCGACTCTGAAAGATTTTGCCGATAATTCCTTT
TTGACCATATACGTCGGCAAGTGTCTATTGTACGAAGAATCGACTTTAAC
ATTACATTAAGATTAAAGTTACAATATTTCCTTTTAAAGAGCGGCGCCTC
TAAAATAGAAATTAGTAAAAAGCGCTGCACCGCAAAATACGGTACTTAAT
AGAATTTCATTGGTTTACTAGCCATGATTACTCTTCAAATTATACGTAAC
AGTTTTACATATAAAAAGGTACTAAAACTTAAACTAAAAAGTTAATAAAA
TTTTGGTTCCTTTTCTTTACACCAAAAGGTCTTTTGAATTGGACAGTTCA
CATATTAAAAGGAGTGCTGCACTTTAAAAAGCACCGCACCCAAAATACTG
AAAATTTGAAGAGCGCTGCATCACATAGTCGCTTGAATGTAAGTAACTGT
AAATTCATGTTTATTTTCAGATCTTTTGGCTTGCACCAATGTTAGGAGGA
GCATTGGCAGCTGTTTTATACACGTTTGTTTTTTACGTTGACGATTCTGA
TGAAGACAAATATGAAGTGAGACATTCCTATGCTATGGAGACCACTACAA
CAACTATCCGATCGTGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000202_pilon:352294..359260- >XLOC_012729 ID=XLOC_012729|Name=XLOC_012729|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1626bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000202_pilon:352294..359260- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTGCAACAATCGGAGAGTCCAACTTAAGTTTGGAGCAGACGAGCTCAG
TAAATGGAAATTATGGAGAGCTGTCTTGGCGGAATTCGTTGGGACAATGT
TATTTCTTTTATGCGTGACCACGGTTGCATTATTCAACGCTGGGAGTGGT
TCATCATCTGTCAATGTCGAGATGTGCAACAATCGGAGAGTCCAACTTAA
GTTTGGAGCAGACGAGCTCAGTAAATGGAAATTATGGAGAGCTGTCTTGG
CGGAATTCGTTGGGACAATGTTATTTCTTTTATGCGTGACCACGGTTGCA
TTATTCAACGCTGGGAGTGGTTCATCATCTGTCAATGTCGAGGTTGGTAT
AGGAATCGGTTTGGGGATCGCTACATTATCATTTGCTTTCGGACATGTCA
GTGGTGGTCATTTAAATCCTGCTGTCACTTTTGGTATGATCATCGGTGGA
AGAATCTCTTTTTTACGTGGATTGTTTTATACATTGGCTCAAGTTGTTGG
AGGTTGGTATAGGAATCGGTTTGGGGATCGCTACATTATCATTTGCTTTC
GGACATGTCAGTGGTGGTCATTTAAATCCTGCTGTCACTTTTGGTATGAT
CATCGGTGGAAGAATCTCTTTTTTACGTGGATTGTTTTATACATTGGCTC
AAGTTGTTGGAGCTATTGCTGGGTCAGCCATCACATACGCTTGTACTTCA
ACTTTGGAACAAGGCATTGGCAAAACAAGATTGGGACAGAATTTTGTCAA
ACGTGGTGACGAAATAGAAGCTATTGCATTGGAAATGCTCTTCACTTTCA
TTTTGGTTTTTTTTGTTTTCTCTGTTACCGATCCGAAGAAGAAAGTTGAA
CCTTATGCACAATCCTTGGGTATTGGTGTTTGTATTTGGGTCTGCCATGT
TTGCTTGCTATTGCTGGGTCAGCCATCACATACGCTTGTACTTCAACTTT
GGAACAAGGCATTGGCAAAACAAGATTGGGACAGAATTTTGTCAAACGTG
GTGACGAAATAGAAGCTATTGCATTGGAAATGCTCTTCACTTTCATTTTG
GTTTTTTTTGTTTTCTCTGTTACCGATCCGAAGAAGAAAGTTGAACCTTA
TGCACAATCCTTGGGTATTGGTGTTTGTATTTGGGTCTGCCATGTTTGCT
TGATCCCATACACCAATTGTAGCATTAATCCAGCTCGATCCACAGGACCA
GCTATAGTTATCAGCGATTGGAATGGACAAGATGAATTCTGGATCCCATA
CACCAATTGTAGCATTAATCCAGCTCGATCCACAGGACCAGCTATAGTTA
TCAGCGATTGGAATGGACAAGATGAATTCTGGATCTTTTGGCTTGCACCA
ATGTTAGGAGGAGCATTGGCAGCTGTTTTATACACGTTTGTTTTTTACGT
TGACGATTCTGATGAAGACAAATATGAAGTGAGACATTCCTATGCTATGG
AGACCACTACAACAACTATCCGATCGTGAATCTTTTGGCTTGCACCAATG
TTAGGAGGAGCATTGGCAGCTGTTTTATACACGTTTGTTTTTTACGTTGA
CGATTCTGATGAAGACAAATATGAAGTGAGACATTCCTATGCTATGGAGA
CCACTACAACAACTATCCGATCGTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000202_pilon | genome | sc0000202_pilon:352294..359260 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 667-813:148 |
| Aaloc | 577-666:1211 |
| Aaloc | 334-576:1921 |
| Aaloc | 172-330:2980 |
| Aaloc | 1-171:6968 |
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