|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000471_pilon:131952..138519+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_012307 ID=XLOC_012307|Name=XLOC_012307|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=6568bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000471_pilon:131952..138519+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CAGTCCTTTTTGGAACCTTCATGTAACAGAGGTAAGctattcttcaaaaa
tttcaatgaattcTGAACAACAGATTCAAAAATCTCGTTTAATTATGGTC
GAACATCAGATAttcgattaaaaataaaaaggtcgtCGCCAGATGCTTCT
GTAAGCAACAAGAAGTAGATTTCACTTTATGTGTAATCTATCAAGACCCA
TGTATTAAAGCTGAATCTATCCGGTTAAATCAACTCTCTAACGACGAAAA
ATCCCACGGGGTACCTTGATGAAATTTCCTCTCATCAGACGGGccgaggg
gggggggagttgccagtaaaaattaatcaaaatttccacttttgtcattt
ttcatatccgcaatataatgttatgttttcatcttttttgtcttttatcG
ATTTGTATTAGATGTATCATGGACAGTCCAAAATTGTGCTGGATATTCTG
AAATTGGGTCAGTTTTGAGGTTGCAAGGTTCTCCAACAGGTTCTGGTGTA
ACACCATGTTTTGCAGTACCCAAAAACCAGGTCGATAAGCCAGCTAAGTT
GTACATAATGAAAATGaagtttaagaacattcaagCATGGCAGGGCATCA
ATTCCGGACATATTGGCTTAATCTTCAATATGAAGGACAACAGTAACTAT
GATTTTCTCTATGCAAGGTGAGAAGATCTATATTCATTGAGTTACTTTAT
AGGTTTTGTGCCCGAGTTTATAGTAGAAGGGAATTAGGTGAATAAACGGC
CTAACCggaaaaaaatacatataaagctgaaattttgcacagagttAGGG
GAAGGTCTTGGGAACCTCCCATTAAAACCCCCCACCTTCAGCACCTTGGC
GTCACGagctatgacgtcataatccatAATGGCTGCGATAAAACTTGTCC
AAATTTCAAGTTGTTCAAACATAGgaatattatataccgttggaaagctt
aTCGaattctgaacaacttttttgcttacgaaattttcttaaaatgtacT
GAATGTGAGTAAATTGGGCTTAAATGcctatgacgtcatcaggtcaAAAA
CTTCCGAAATCAAACTTCTTCAAACAtaggcatattatataccgttggaa
agcttgCAGAAAACTGAACAACATTTTCGCTTACAAAAAACCCTGTAAAT
GCACCGAATAGCAGTAAATTGAGCCTAAAGCTATGACGTCATTATGTCCT
AATTTCAAGAGAAATTTTGGTTGGTCCtttattttggttattttcaatAT
TAATTATCGAAGGGTATAGTCCAATAAATTCAGACAGCgttttagaattt
caaaacttttttcacttaaaaatatctttgaaGACGTTTCGGTTTTCATC
ATCGTCATGTTGGGGATTGGTTTCGTTTGTTTCACCCTCGTCATATTGAT
CCACCAGCTGAAGAAGTTAACGAAAGGAAAGAATAATATATATCTTCACT
ATTTATTTGTCTCGTGTAGATTGTCTAGTCTGAGATTTTAGTCGTAAATT
TCTGCAAGGTATATTACTTTGTCTTCTCTTTGATGGGTAtagttaatact
tacttttTTGTTAGCGCAATCCTCTCCATGACAATCAGCTCCTTCAATCC
ATTAAAACTTGAGCTGTAGAACTCCATGATCGGTATAGATGACCCTGAAA
GGTTATTTTGACTACGATGCTTCAAACGTCTGATTGCCTTTTGTTTCGAT
GTTTCGCCTGAACCAATTCTTATAATACCCATGCCATGAAAAGTTCCTTT
ACCAGTAAGAGTTCTTATATTGTTGTCCACATTATCTGCTACCCATTGGT
CGAATTTCGAACTGTTAGTTGGTGCGGCGTCTTTGGTTGACAAGCTGCTG
GTCGATGCGACGTCTTGGGTTGAAGGGATGCTGGCTGGTGCGACGTCTTG
GGTTGACGGGATGCTGGCTGGTGCGACGTCTTGGGTTGACGAGCTGCTGG
TCGATGCGACGTCTTGGGTTGACGGGATGCTGGCTGGTGCGACGTCTTGG
GTTGACGGGATGCTGGCTGGTGCGACGTCTTGGGTTGACGAGCTGCTGGT
CGATGCGACGTCTTGGGTTGACGGGATGCTGGCTGGTGCGACGTCTTGGG
TTGACGAGCTGCTGGTCGATGCGACGTCTTGGGTTGACGGGATACTGGCT
GGTGCGACGTCTTGGGTTGACGAACTATTAGTTGGTACGAATCTTTGAGT
TGACGAATTGTTGGTCGGTGGATCATTACTGTGTCTAACCGAGGCTATCG
CTGATTCTTTGAACAGTTTAACTTCATCTGATGTTACGGAGAAACCAAAC
TTTGCGAGATGATCGACGAACCATCTAGTAGCGAAAGACTTATCGAGGTC
TACACCAATTCCAAAGGGTATAGGTGATATCAAAGATCGTGGTCTCGAAG
CTTGGGTAATACATTGTCCAATGctgatttgttttagctttgaaGGAAAA
AGTTGGTCCAGGAACATCTGCAAACTTTCAGGAACCCAATCGCTTTGGTA
CTCTAAATTCCTCATCTCGAATAGCGATGGATAAAGTGTCTTATCAAGTG
GCATTTCTCTGATATcacttttgacaatttttgctGCAGCTACAATCATG
TCAATTGGAGTTcgctctttcattttcatgaatTCTTCCATGAAGAATTT
GCTCATATGTCTAAATCCGATGATGTCGCCACGTCCTTCAGATTGAAAGA
AATATATATGTTCCTTGTAGTTTTCgataagttttgtttttaaatacttt
ttatgATAACAGTCAGTCCCTTCACTCAGTTCAATTATCTTATCGTAAAT
CTCAGTCAGCGTATACAATTCCCCATCTCCTTCATCTAACCACTGGCACA
ctttcagaaaattttccatcaaagAGGTATCGACTGGTCTACCTGAGGAT
TTATCGTTAGTAGGCTTCATTAAACGGAATCGATTCATACAAACGATATG
GTAAACCGCTTCCTCAGCCGGTAAGTCGATTATGGAGTTTAAACGAGCCT
CTACCTTTCCTCCCCACTCATCATCTCTCTCTCGTGAACATTTCAACAAC
TGCTTCTTGATCGGTAGAGTTTCTATGGCAATAACGGTCGAATATTTACG
GTTAGCTTTTTCGTCGCATAGAAAGCAGTTTTTCTTCCAATTAAAAACAG
GTTTTGCAGCATACGATGATCGTAAGCGCTTTGGTTGTGGAGTTGGAAGG
TTATCTGGAACTGGAAGGGTACGCTTATCGATTGTCTTTTTCCTACATGA
TTCATGCACTGCGATACTAATGGACTCTGAATTCGATGCATCCTTCAGCT
CCCTTTACACAATaagtgaaatgaaaataaacttaaaatagAAATCAACA
ACAATCAAATATTTCTAGCAATTACAGTATCACAAACTCAACACCTATAA
GCTCCTATAGAACTTTAATTTAGATCAGACTTGGCTTTTAAACTTGTCAA
CATTCTTTCTAGCTTCTCTTCTAGTCCAATATTAAAAGGAAATACAGGTC
CACATTTAAACTAAAATTCTTAAGCTTACCCGAGCAAGGTATCCAAACCA
CGATCATTGCACGCTCTGATTAAAGTATTTAGACCTTTTCTTTTGACGGT
AACTTTCTTGGCATCACTGAAATCTTTCTTACATATAATGCAATATTCCa
taattttattttagtttttcataatttcatcACATATAATTTCTCCTTCT
TCTTACTCTAAATGAAAACGAAGTAAGACTATAATGATATTCCAATACTA
AATATAACCGAAACTCAATATCAAGAGTCTACTTTATACACCAAAAGCTT
TTTACTAACAACAAAGATCTAACAAAACTTCGTGTAGGAACTGGAATAAA
TTCAGATATTCGCACATGGCCtataattataaagaaaatacgaaaatcaa
acactattaattaatataagaaaaacaaaatgaaaatgttttattataat
tagaatataaaaacaaaagcagCTGACATAATAGTAGatttattgacttt
ttttcgACTTGCTATAAGCTCtagcttaagggctctgaccatagtgaatt
tttcataatagccgtgtttaaaatatgttttctgactgatgtaaccaaca
aaactatggcatgttatacattttctgttaaacaaactattcctgaatct
gaaaattcaaaaattgcattgaaaaaatttgatgaagaagaaaatgaaga
cttttgcgaggaagagtatttcaactttgaagagcttagtttcggcgaag
aaaaaacattttgaaaaaattttcgcagtagatggtttatcttttaccga
acaataaaaatttttgcggaaaatttttgtaaatgcttctttgtctcgaa
atcttcaaaatagtggtttttcatcaaTttttcatctggattttgcttaa
aaaacagtcataacttttgacacatctttttagaaaaattttccgcaaaa
ttttaaatagttcaattctttgcggacagtttgaagaaagttcgaaacaa
aaaggttaattacccattaaaacttagcactttttataaaagaaggtgat
gcaacatattattaacgtctttttaaagttcataacgtcatttttgcaat
taagttcttaattactcttaaggggtttgattaaaaagcaatctataaag
gcaattctttgttaaaagtgttaaagaatctaaaacataacttttatgtt
cagatactaaaatcaattttctgactatggtcagagcccttaatttaaTA
TGGAATTTTCTCATCATGACGCCATAGGTTTAGGCTCAATTTACTGTTAT
TCAGTGCATTTATAGGTTATTTTGTAAGCAAAAATGTTGTTCAGCTTTCT
GcaagctttccaacggtatataacatGCCTATGTTTGAAGAAGTTTGATT
TCGGAAGTTTTtgacttgatgacgtcatagacCTTTAAGCCCAATTTACT
CACATTCagtacatttttagaaaatttcgtaagcaaaaaagttgttcaga
attCGAtaagctttccaacggtatataatattcCTATGTTTGAACAactt
gaaatttggacaaatTTTATCGCAGCCATTatggattatgacgtcatagc
tCGTGACGCCAAGGTGCTGAAGGTGGGGGGTTTTAATTGGAGGTTCCCAA
GACCTTCCCCTaactctgtgcaaaatttcagctttatatgtatttttttc
cGGTCATAACCTAATTCCCTTCTACTATTAAGAGGTGTTGTTGTTCGAGa
attttccaatatttctctTCTAAATAGTTAGCAAATCGAAATTTGAGAAT
CACGATCAAGAACCATCATCCCTTATAATGATGTAACTGTTTCTTAAATT
CAGCaattaaaagttattttcacTCATTTTTTGCACTGCGAATTAAAATA
AGgatatacagtcaactctctctaaatTGCATCTATTATtatctttttgt
aattcgaactaaaatattttgtCCTCTGAAGTTCGAATTAAAAATTTCTA
GACGTGAGGTTAGcgtaggcggttttagaccttgtctgtacacaaaccca
tatctacggctaatttcaaaactcATTGCCATAGAGGGTATGTTGTGATT
GTcctttctcatttgagatttttcaaaccgaccgctgcgatggagggtta
gtgagagaggggagacgatgagaaaagtgttgctatttataaatcatact
tcatcgcagacgTCCCCGTACggtaattattttatcagacaGACAATGTT
Tatagagtgtactacgaagcgataaacgtgagacactctggtacagagta
tttTAGGCGAcaacttatcagaggaagagatgTGTGATTGTAATTTCATA
AACACAATTTGATATGTTTTCTTTTCCAATCTTCTAGATTGCATTCACCA
ACTGTCCAGTATGGGTTCGTGCAGAATGGTACACCAACGTTTGTGAGCAA
TCTGAACCTGTCGGGAAATCGATCTGGTGCAATTCCTCATTCGTTTCAAA
TCGATGTTTTGAAGGACAAGAGCGTTAAAGTAAGTGCttttatattgaag
aatttATTTCTTTTGTCAAGTTTACGGAAATACGCAAAATTCACCTTGAT
AGTTGGGTAGGATTTTGAATCAAACtgttaaatgttttgtttttaaataa
gagtgatatcgtttgcttactcatcaattttaattcacaagttttttaag
attggattgacacggatgtggagcaagattggtcaaaaagaggaaaagaa
atattttttttttgcttatatcagcataatataacaatagcaagacactg
tcctggtatgcaatatgtgtctgatataaaacaGAAACAATAacatgtaa
aaagaaaacctttcagCAATTCAACAAAGTTTTCATCCGCGCAAAGACTT
CCAAGGCAATGTTTGATAAATTTAACATTTATTTTTCAGGTTTATTACGA
TAATGCTTTGGTTGGTACTTTCACTGCAAAGTTTTCAACATTGGCTGCTG
GTGGAGTGTTGACCTGGAATCACTACAACAATATCATTGAATTCGGAAAT
TTTCAATTAATTGCATGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000471_pilon:131952..138519+ >XLOC_012307 ID=XLOC_012307|Name=XLOC_012307|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1116bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000471_pilon:131952..138519+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CAGTCCTTTTTGGAACCTTCATGTAACAGAGCAGTCCTTTTTGGAACCTT
CATGTAACAGAGATGTATCATGGACAGTCCAAAATTGTGCTGGATATTCT
GAAATTGGGTCAGTTTTGAGGTTGCAAGGTTCTCCAACAGGTTCTGGTGT
AACACCATGTTTTGCAGTACCCAAAAACCAGGTCGATAAGCCAGCTAAGT
TGTACATAATGAAAATGaagtttaagaacattcaagCATGGCAGGGCATC
AATTCCGGACATATTGGCTTAATCTTCAATATGAAGGACAACAGTAACTA
TGATTTTCTCTATGCAAGATGTATCATGGACAGTCCAAAATTGTGCTGGA
TATTCTGAAATTGGGTCAGTTTTGAGGTTGCAAGGTTCTCCAACAGGTTC
TGGTGTAACACCATGTTTTGCAGTACCCAAAAACCAGGTCGATAAGCCAG
CTAAGTTGTACATAATGAAAATGaagtttaagaacattcaagCATGGCAG
GGCATCAATTCCGGACATATTGGCTTAATCTTCAATATGAAGGACAACAG
TAACTATGATTTTCTCTATGCAAGATTGCATTCACCAACTGTCCAGTATG
GGTTCGTGCAGAATGGTACACCAACGTTTGTGAGCAATCTGAACCTGTCG
GGAAATCGATCTGGTGCAATTCCTCATTCGTTTCAAATCGATGTTTTGAA
GGACAAGAGCGTTAAAATTGCATTCACCAACTGTCCAGTATGGGTTCGTG
CAGAATGGTACACCAACGTTTGTGAGCAATCTGAACCTGTCGGGAAATCG
ATCTGGTGCAATTCCTCATTCGTTTCAAATCGATGTTTTGAAGGACAAGA
GCGTTAAAGTTTATTACGATAATGCTTTGGTTGGTACTTTCACTGCAAAG
TTTTCAACATTGGCTGCTGGTGGAGTGTTGACCTGGAATCACTACAACAA
TATCATTGAATTCGGAAATTTTCAATTAATTGCATGAGTTTATTACGATA
ATGCTTTGGTTGGTACTTTCACTGCAAAGTTTTCAACATTGGCTGCTGGT
GGAGTGTTGACCTGGAATCACTACAACAATATCATTGAATTCGGAAATTT
TCAATTAATTGCATGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000471_pilon | genome | sc0000471_pilon:131952..138519 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 430-558:6440 |
| Aaloc | 289-429:5889 |
| Aaloc | 34-285:414 |
| Aaloc | 1-30:1 |
|
