|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000182_pilon:468503..477706- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_012184 ID=XLOC_012184|Name=XLOC_012184|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=9204bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000182_pilon:468503..477706- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) GCGGACAACACGAGCTCGAAAATTTTGATCTCTGCATCTTCAGAATCTAC
AAGCAAAGAAAAGGAAACTGCTGCTTGTGATACAAATGTCAACGCCACAA
AGCTTACTTTAAGAGCTGTGAAGTCTGGTGATACATCTGCGTGGACACCG
ATTGCTGTCAGTGAAGAAATCTCCCCAGAGGAACAGTCGGTAAAAATTTA
TTGTTTATGTTTTGAGTTTTTCACAAAATTCTTTTGTCATACTTTGTAAT
TCTCAAACTACCACATTATAGTTACCGTCAACTGCTCTAACTTGTGACTA
TCTGACAAAACATGGTATGGCAATTCGGCCACCATTTCATTGAACAGTCT
CCAAAGTCATTTGATTTGATTTGGTGTGAAGGCTTCTTCATAAAAAAGAC
GAAAGACATGTATCTATTTTTCGGATCCGGTATGCGGGAATAGTGTCAGG
ACCTGCAGGCGACCAAGTAGGGTTGGGTATGGGTGTGGTTTAGGTGTGGT
TACGTATCAGATTGGCTAGGAATTGGCAGTGCAGCTGGAACCTCGATATT
CATTCCAGGATTAGAAAAAGCTATACCTGTTAGGGGCCGTCGACAAACGA
CTTTCCTTTTTTTTAACGGCCTGAGGCCGTTAAGGTTCAGACCCCCTCCC
CCCCTACGTCTTAGCGGCCAAGAAAATTCTGCAAAAGTAAATACTTTCAC
TGGTCCATGGCCGCCATGTTCTTTCGATTCGTAATCCTCAAAGTTCTTCT
TTTCGCATGGAAAAAACATGTGGTTTTGAGCCGTGACCTTTCAATTTTGA
AACTCCAAGCCCCGCAGCAAGTCAGGGCGGGATGGGTGGAGCAAGGAGTC
AACTGAGGTGGAGGGAAAAATTGCCAACTTTCGTCACGTGACCAGTCATT
TTTCTCGTCGCAGCATTAATTGTAGACTGGAGTCGTTTATAATGCGTGTA
ATACTAATAATACCAATACCAATACTAATAATAATAATACGGGATTTAGT
TTGTATAAACGACTGGAAGAATCTGGTGTTCCAGCCTTATAGATACAGGG
GCTAGCTACGCAGAAACTTGCGTAGCGAGAAAACAATTTATCAAGCAACA
ACAAACTCTCAAAACGAAATCAACTCAAATGAAAAACTTTCATTCAATAC
ACAAGTCCACACATATTTTTTTTCTCAAGAATTATTTTGAGCAGGAAAAA
ATTATAATTGCAATATTGACACTTTTCTTTTGTTTGGAGTTAGTGCACAA
AGGTTTCTAGACGACTAAAATTGTTCCACTCAATACTTTTTGCTTTATTT
CTACTAGTCGTCTAGCTTGCTAGACTACATTAATTGGTGACTGGGAATAA
GGTGAATGTCGTGTGGTTGCTTTGGTCTTAGCCTTTCTTCACATGTTTCT
ACTTTTTGGACTGATGAAATTTGTAAGTGAGACTTTCCTTTTTTTTAAAC
TTTTTTAACGGCATTGCAGTGACCCCCTCCCACCCCTTACGGCCAGAAGC
CGTTAAAAAAAAGGAAAATCGTTTGTCGACGGCCCCTTATCTTTTTTCTT
TAAAGAATCAACAAGCCCTGACAAGCCATCAACATCAATAAATTAGACAC
ATTTCCTCAGAAACTTTCAAAATTATCTGCCATTATGACTTTCTTAAAGC
CGTTCCGAGATTAACCAATCGGGTTGTGTATCGGAATTCCTATGGGAGTT
CTTTTTTTCCGAGATTTGTAAAATAGCTAAGTTGGCAAAAAACTTTTTCC
GGGGGGTTTGAGGAAAAAACAGAATAAGTGCTATCATTTGCTTTTTATTT
AACCGTGTATTTAAATTTGCGCTCAAAAATACTTAAATAAGTAAGTTAAT
AATATTCAATATACTATTTGTATCACTCAGAAAATAAATACTTACAGAAC
GACATTGTTTATCATTTGGAATACCCCTGTATTTGGACCATTCTATCGTG
GGCGCAAAATAGGGCGGAAACTAAGTAGCACCCTCAATGCAAGATTGCCG
CCTCATCTTTATTCGCCCGCGCGAGAACGCGAGCTAAAATCATTTTTTTC
TCACACGCTCAAGGGGAAAAGGAAAGTGATCGATATTCTTTGAAGGAAAA
ATGTCAGAAACAAACCCAAAGACCAAAAGATGTATTTTGTTGTTGAGAAT
CGATCCTGTGAAAATAAAAAAATTTCTGCTATGGGTTTTTTCGGAATGCT
AAAAAACTCGATTTTCGATCTTCCGTAAGGTAAAGAGGTTGCAAGATTTG
GGTTAGCGAGGCAAAAATCGCTAAAAAGCTGGTAAAATCGTAATCCTCAA
AAATCGAAGTTCCAGCTTCACTGATTGGGTTATTATCAGTTAGGGTTAGG
GTTGGAGCTCGAAACAAGCACTATTTTGTGATTTTCTCTTAATACAGTCT
GGTCTGCAGTTTGTACAATATAAATAGCCGTTAGAAGCGCTATCCTGGCA
TGAATCTGTGGCGTAGTGGATAAGGCAATGGGTTTCAAAACATCGGAACT
TTGTAGTGGGTTCGAATCCCACCGGTGGCGATCTGTCGGTAAGTCAATCG
GTAAGTTAGAAAACATAGAAAATAACTAACAAAGAACCAGAAAGTCAGAA
AAACTACGAACAAGAGACTGGAAAGTACGAAATAAGTCCAGATCTGTCTT
TCGTCTTTGTGAAGAAGCCACGACCATTTGATTTCAGGAACGGTGTAGTA
GGCGACAATCTAAAATATGTTCTGTTCGCGTCATAAAACATCTGCAAATC
CAGTCGGTCGGTCGGTCGGTAGTAAATTTTGTCAAGTTTTTTAAATCTAG
TAAATCACAAAGAATCAAGCGGCAATTAACAAAATCTATTGCCGCCATCT
TTGATTTGCCAAATTAGATGTGCGCGCGCATGTGTGAACCTTAAAAGCAG
ACCTTATTTTCGGCTCTCGGGGTATTGGCCCTACCGCGTCTCTGAATTTC
GACTTGAAAATTTCAATAAGGGTACATGAAAAAAACTCAGACAGGACTCA
ATGTGGGTTAAGTAAACAAAAACTCGTAGCAAATGATGATTCAAAGAAGT
GCTTAGCTATCAAAAACTTTTTCCGACATTTTTCCGACTTTTCCGACTTG
GGATTAATGTTTTGAAGGTGAGTCGGTCGGACGACGCGAACGGAACATAT
TTTAGCTTGCCGCCTATTAAAAAATACATGATTTCTCTTTCAATTTTACA
GTAAGTGCAGGTAAGTGAAAATACAGACCAGATATGCAACAGTCCCATTT
TTCGACCAATTGTCCCAAGTTAGAGCAGTTGATGGTAGGAGACTTATTTC
ATAATCTTAGCATCTTTTAAGACACAATAGACTTTTTCACATTTCATTTT
CATCACATGACCCTTGACGGACGGGTGTTTAACGAGAATGGAAATGCAGT
CCAGCCAGCTTTCTGTGTGATTTTGAGCTCGATATTTTGTAAATAAATTG
CCGTATGGAACAAGAAAAAATTAAGTTAAAGCTGTAATAAGTTTACTGTT
TACTGTTTTCCGGAGAGCAGCTTAAAAAAAAAGAACTATTTTTCGCTCTG
GAAAGTTTCAGAGCTCTTCCGGTGCTTTCAGAGCCAGTGATTTTTAGCAC
GTTCTAAAAACCATTTAAACATAGTTACACAAAAATATTTGTCCCCAGGT
AATGGACTTTGGTCAAATAAAATACTTACAGTCTTGATGGATTGATGTTT
TTGGCTCATTTGTGTTGTTAAATGGTGAGTTTATGAACACAAAAATACAA
GTGTGTGCCCAGCTGAAATGTGAATTGAATGTGAATTCTATGAACAATAC
ATTAGAAAAACTTTTGGATATTTGAGTTCCCCTAACATTGTAGAATACAT
ACCGTGAGTGGTCCTAAATCCGACAGCCCTGCTTAAATCCGACCCCCAAA
TAACTGCTATGAAAACTTTTTTATGTTTACAAACATTCCCTCTCCAAGTT
GAACAATAAACTATTGCAAGAACTCTCGAAACAAAACATCTAACAAGATG
ACTAAAATGTCAAGATGTCAATTAATGTGATCAAAAACGTGTGAATTGTA
AAAAAAAATTACCTCTATTATTGATTATTCTGAATCCGTTGCTTGTGTTT
AAAATGTTAACAATTTTGTAATAAAAAATTATATTTTGTATATAAGTAAG
AAGCAATTATTGTTATTTGGTTCAATTGGTTCAGTGTATCAATTCTCTCA
GTTTAGTTGAATCTGTGGTATCTTCATTGCGTCACAGAAAAAGAGTGAAT
TAAAACCTTTAAATCAACCAAATTCTTTCCGCCATTATCCATATAGTCAT
TTGGGAGAATGCGACAGTCTTTTGAATTAATAATACCCCATATTTCCCCT
ACTATCTATCTATCTATATATTTAAGTAGTAACAAAACATACATGTTCGT
TCTCCCTATATATAAAAACATTGAACAAAAAAATATAAATGAAAATGAGT
AAAAATAAAATGTTTGGTTCTTTATTCAAAAATAATTTATAATATAAAAT
TCCTAAAGAAAAAGCTCATATCGAACCGAGGATAAGTAGTAAAGTTGAGA
ATTAAAGGCTGAGAATATTGACACAAAGCTTAACATAATGGCTTGGTGCT
GAGAATACCAAAATGTGAAGGCAGGGCGGTATTGAAAACTAGGAGTTGAA
ATTAAGTTGAATCCTCAAACTGAAAATGTAAATTGGCGTGATGAGAAGTT
CAAGTCAAAAAAATAAATACTAAATGAGTTAAGATAAGATAGATTAGATA
AATAGCTATAAACATTTAAAATATTTTTATGGTTTCAGAGAGAAAGGTTT
CAAGATGAGTGATGTAAGAAAGAGTAAGGTGAACAAAGGCAAAGAATTTA
AAATTAGTGAGAATAAAAACATGGGTGAAGGCTAACCTAAACTTGCAACA
AAATAGGAAGTTTCATTAGCTTCATGCAAAATAAAAAGGTAAGATAAATT
AAATAAATAAAAATATATGTAAATAAATCACTAAAAGTTAGAAATGCTAG
AAATTATACTAGAAATTACTCCTTGTGTTAAGTAAGAGTTTAATTGGAAA
AGGCTTCAAGAACGTAAATTGATGCTGACCTGGGAATTAGTGTTAAACGA
GCTTGAACTAGGGCCAAGGCAACCTGGTGTTAGTGATTAAGAAAACACAA
GAGGCTGATACACAAGGGAAAAAAAAATAATAATACCATATGATCTAGTT
TCTGTCAAAATAAGACGAAATTTCGATTTTAAATTCATTTCTATTTTCAA
TATTCAATACTTCTTTTGGCAACTCATTCCACCATTTAACAGTTATACTA
CTGAACCAAATTTAAAGTAACAAATCAAAATTTAAGTACCTTCCTCTTTC
TTATTGTATTAAAATTCAAGTTCATATCTTGATCCTGATGGTATTGTGTT
TTTTGGACCACCAGGTATAAAGAAATCTTGAAAGGTCATTTTGTCATTTT
TTTGTCATTCTGGTCAGCTGAATGATTGACACATTTTTGCCTATTTGACC
GGGTGTTTTTGTAAGATAAGATGCTGAAGTTTTATTAAATTATGCCAAAC
ACAACTGTCCTAAGTTTTCCCAGATTTACATATTGCAGAAATTGTTGACA
CCAGACAAGTGTGATTTTTAAATGATTCAGGTTCAATGTTTGGATTGTCT
GGTTGTAAAAAGCAGTTGGGCACATTCTTACGATTGAATGTGGTGTGTAC
CGTGAGATCGGATAACTTGCATCAGTAGAGGCTAATATGCATAGCCCTCA
AATGAATGACCTGGCTGGTCATTAAAATACAAAATTAAATCAAACAAAAA
TGGTAGAGTAGAGCTGTGAGCGGAGCTGCAAAGTTCATTTGTTTTGAAAT
TTTGCTGCTTTGATGGGTCAGTCGTTTGAGGGCTATGCGTGTTTGCCTCC
ACTGATGCAAGTTACCCGATCTCACGGTACACACCACAATGTGAACAAAA
AAATTGTATCATACCATCGTATTTATATTTATATTGATAGGTCGATTTTT
GACGTTTTTGACCACTTTCTGAAAGTAAATATTTCATTCTTTTGATCATC
ACTTTAAAGATCCAGTGGTCAAAATAAGGTTTTTATCCTGTTCGGTTATT
TTAGTGAATCAGTCATGTTTAGTGTCACCCGAAGCCCGACCTGATGGGCA
GAAAATTTGTCCCTTCTAGATGCATGGCTTTAAAACCCTTTTTTTTTCAC
GTCCATTAGTTTTTCTAAATGGACTTGGAACAAAGAATGGCATCGAGTGC
TTTTCAAAGCTTTTTAAATTATCAAAACAAATATATACAAATCTCTCGAC
TTGAAATGCGGCGCCAATGTTTAAAAATTGACTTTAATGTTTTTTCTTAC
ATTTCTTTTGCATCGAACGTTTTAATTGCATTCGAAATTTATTTTGTGAG
AAAGAAAATCAATAAACAACAATAAAAGAAAGACATAAAGAGAAGAGAAA
AATATAAAACTCTCAGTGTAATTTCTGTAATTTACTTTCCTAACTGGGAA
AAAGTAGTGAAAGCCATTGTGCGATTAGCTCGTAATCACATACACGTTTT
TTTTCTTTAACCCTATTCGTACTAGGGGGGGGGGCTCTTTCTGTTCGGAA
GTCAAACTATTGGTAATAGCTCCTGAAATAATAGAGCTTTTGCCGTGAAA
TTTTCTGTAAATTCCTAACTTTTATTTTGCTTCAAAATAAAAAAAAATTT
GACACCTAAATATTTTCACACCTTGAGCATGATGACATTTCTGACAGTAA
GGTGTCACAAAAATTGACACTTTTCCAATACAAATTTATTTTTAATGTCA
AATATATCGTTTAAACCGTAATTTATTGAATATTTAGGATAAAATAAGCA
TTTTAAACTCAGGCAACTTTTTTCTAAAGCCTTTGTTAGAATACAATAGC
TATTTATAAGAACAATGGAAAATTTCGGTTTTTGCTCACTTTGTGCATGA
TGAGTGACGTCATCAGAAAAATATTTTGTTAAAAGTTACCTTACGTGACA
AGGATCTTGTGTGCCAAATTTCATCCAAAAAGACCCACTATATAAAAAGT
TAAGGGGTGGTACAGGAAAAGCCCCCCCCCCCCTAGTTCTGAACCGCCCC
TAAAAGCCTAGTTTGAATAGGGTTAAGAAACACACTTTTAAGAAACATGA
GGCTCAAAATGCCTAAAAACTAAGAAACATCTAAGAAACATGCTGAGGCT
GAGAATGAAAAAATAGCATTTTTTCCAATCAAGGTTCCAGAAATATACAT
ACATAACAGTTAGAAACACTTGAGAAAGTCAGAAAATCAATATAAAAGAT
AGGAAAGTACCGTAGATTAGTCTATTAGACTATTGTATTATCGACATGCG
TCCTTTAAGCTTGACAAAGTTTAGAAACATGTAAGAAACATTTAAGGCTC
AAAAGGCCAATTTCTTAAGAAACATCGAGGCTGCTGATTTTTTCGTTTCT
AATTAATAAAAAAAAATCACTCGTGCAATTATATTCGAATTGCACTCGTT
ATCATGTGATTACATATACTTATGCTTATGAAAAATTCCAGAAAATTCAT
GTATTTAACAAATTGCAAAAATTCTTCGTCGCTGTTTTTTCAATGGCGAC
ACGAGAACCTATTTTTTTAGCTTAGGAAACACACAATAGAAACTCGACTG
CTTAAATTTGAACCTACTTAAAGTCATCATACATTCTTGGGCCATGCCAT
TTTATATTCATACAGGAGGCGGACCAACATAAGAACGATTTTAGTTCACC
TAGCCTCCACCCTCACTTTATGGTATTAATAATTTTTTTCAAATTTTTGC
CATTTTCCAGGGGGTATACTCATATTTCTAAGAACCTTTTTTTGCCTTGA
AAAGGTTCGTCTATCCCCCCTGTATGGAAATTTAACGGAACAGCCTATTC
CATTTTTTAGGAAAAGCTGAAACGTGAAATGCAACAATTGGTGTTCTACA
ACCCTGGGCCGTCTACTCAAGACTTACTTGGTTTCAAACCTGAATTCAGT
AACCGTGAAAAGCGAAAGTTGAACCGTCTTCTTGAAGACAAGAATGGTGG
AAGTTCAGGGTATGTTTTATATTATTCATTTTATAAGTTTACATTAATTT
TAAGGCGTACCTATACAGTGTGTCCCAAAAAAAAGCGAACACATTTATAC
AAAGTAAAATCCTCAAAACTCATTATCTGAACTGGGCTTAGAATAATTGA
TTGAAGATATAACAATTCTCTGTTCAAATTTTAAGCCCAGTTTAGATAAT
GAGTTATGAGTAATTTACTTTATATAAAAATTTGTCCGTTTTTTGGGACA
ATTTTCTACGGATTAGTTCGTAGATTTGAAGTGATCTGAACAATGACATC
ATATAATGATATTAAAAAACTCCGGATATTTTGAAATGGTCAGGGTAATA
TTTTGGTGAAATGGGTTTGAAGTCTGAACAAATAGCCTGTTGAAAAAGGG
TTTTATCATTAATTTTGTTCACACCAAACGTACTGTGGCTAATTTTTCTG
GACCATATTTTTTTAATTCTGCCATAGAAAGACGAATAACTGTGATAGAG
TAATGTTCTATTAAGTGCAATATACGAGCAATAGACGATATCGGCTTTAC
ATGAAAACTCAGATTTGATCCCCGAGAATTCCCCACAATGCTTTGCGCGG
AAAAAAGTTCACGGTAAAATTTTTTCCGCACAAAGCATTGTGGGGAATTC
TCGGGGATCAAATCTGAGTTTTCATGTAAATCCGATATCGTCTATTATTA
TCCGTGTGAGAGGGCGATACTCGATATAAATAAAATGACCCAATCGATTT
GTAAAAATTTTGCAAATCAAAGTGACGATAAACTCGAGATATAATCTATA
TACTATCTCTCAAATTCGGGATTTTGGCTTCGGTCAATATTTTACCATAT
TGCCCTCTTAAACAGTCAATAGGGTTATTAATAAATGTAGAAGTAAATAA
AGAATAATTTAATAATAACACACAGGGACGAAGCACCGAAACGGTCTGGA
CGTAAACCTGCGAAGCAAGTCATAACACTACACGATGAAAAAGGTTGTGT
TCGTGAAACCGGCGAGGACGTTTGTGATTGTATGATCACTGACTGTCCGG
GTTGTCACTTCCCGTGCGGCAAGTGTGATTCGGAGAAGTGTGGCTCTGTT
TGCAGGAATAGTCGGCGATGGACGTACGATGTTGTGTATTATAATATCAA
ATGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000182_pilon:468503..477706- >XLOC_012184 ID=XLOC_012184|Name=XLOC_012184|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1134bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000182_pilon:468503..477706- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) GCGGACAACACGAGCTCGAAAATTTTGATCTCTGCATCTTCAGAATCTAC AAGCAAAGAAAAGGAAACTGCTGCTTGTGATACAAATGTCAACGCCACAA AGCTTACTTTAAGAGCTGTGAAGTCTGGTGATACATCTGCGTGGACACCG ATTGCTGTCAGTGAAGAAATCTCCCCAGAGGAACAGTCGGCGGACAACAC GAGCTCGAAAATTTTGATCTCTGCATCTTCAGAATCTACAAGCAAAGAAA AGGAAACTGCTGCTTGTGATACAAATGTCAACGCCACAAAGCTTACTTTA AGAGCTGTGAAGTCTGGTGATACATCTGCGTGGACACCGATTGCTGTCAG TGAAGAAATCTCCCCAGAGGAACAGTCGGAAAAGCTGAAACGTGAAATGC AACAATTGGTGTTCTACAACCCTGGGCCGTCTACTCAAGACTTACTTGGT TTCAAACCTGAATTCAGTAACCGTGAAAAGCGAAAGTTGAACCGTCTTCT TGAAGACAAGAATGGTGGAAGTTCAGGGAAAAGCTGAAACGTGAAATGCA ACAATTGGTGTTCTACAACCCTGGGCCGTCTACTCAAGACTTACTTGGTT TCAAACCTGAATTCAGTAACCGTGAAAAGCGAAAGTTGAACCGTCTTCTT GAAGACAAGAATGGTGGAAGTTCAGGGGACGAAGCACCGAAACGGTCTGG ACGTAAACCTGCGAAGCAAGTCATAACACTACACGATGAAAAAGGTTGTG TTCGTGAAACCGGCGAGGACGTTTGTGATTGTATGATCACTGACTGTCCG GGTTGTCACTTCCCGTGCGGCAAGTGTGATTCGGAGAAGTGTGGCTCTGT TTGCAGGAATAGTCGGCGATGGACGTACGATGTTGTGTATTATAATATCA AATGAGGACGAAGCACCGAAACGGTCTGGACGTAAACCTGCGAAGCAAGT CATAACACTACACGATGAAAAAGGTTGTGTTCGTGAAACCGGCGAGGACG TTTGTGATTGTATGATCACTGACTGTCCGGGTTGTCACTTCCCGTGCGGC AAGTGTGATTCGGAGAAGTGTGGCTCTGTTTGCAGGAATAGTCGGCGATG GACGTACGATGTTGTGTATTATAATATCAAATGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000182_pilon | genome | sc0000182_pilon:468503..477706 - |
Properties
| Property Name | Value |
| Aaloc | 442-669:229 |
| Aaloc | 292-438:1295 |
| Aaloc | 103-291:9205 |
|