XLOC_012184 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_012184
Unique NameXLOC_012184
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000182_pilon:468503..477706-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_012184 ID=XLOC_012184|Name=XLOC_012184|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=9204bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000182_pilon:468503..477706- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GCGGACAACACGAGCTCGAAAATTTTGATCTCTGCATCTTCAGAATCTAC AAGCAAAGAAAAGGAAACTGCTGCTTGTGATACAAATGTCAACGCCACAA AGCTTACTTTAAGAGCTGTGAAGTCTGGTGATACATCTGCGTGGACACCG ATTGCTGTCAGTGAAGAAATCTCCCCAGAGGAACAGTCGGTAAAAATTTA TTGTTTATGTTTTGAGTTTTTCACAAAATTCTTTTGTCATACTTTGTAAT TCTCAAACTACCACATTATAGTTACCGTCAACTGCTCTAACTTGTGACTA TCTGACAAAACATGGTATGGCAATTCGGCCACCATTTCATTGAACAGTCT CCAAAGTCATTTGATTTGATTTGGTGTGAAGGCTTCTTCATAAAAAAGAC GAAAGACATGTATCTATTTTTCGGATCCGGTATGCGGGAATAGTGTCAGG ACCTGCAGGCGACCAAGTAGGGTTGGGTATGGGTGTGGTTTAGGTGTGGT TACGTATCAGATTGGCTAGGAATTGGCAGTGCAGCTGGAACCTCGATATT CATTCCAGGATTAGAAAAAGCTATACCTGTTAGGGGCCGTCGACAAACGA CTTTCCTTTTTTTTAACGGCCTGAGGCCGTTAAGGTTCAGACCCCCTCCC CCCCTACGTCTTAGCGGCCAAGAAAATTCTGCAAAAGTAAATACTTTCAC TGGTCCATGGCCGCCATGTTCTTTCGATTCGTAATCCTCAAAGTTCTTCT TTTCGCATGGAAAAAACATGTGGTTTTGAGCCGTGACCTTTCAATTTTGA AACTCCAAGCCCCGCAGCAAGTCAGGGCGGGATGGGTGGAGCAAGGAGTC AACTGAGGTGGAGGGAAAAATTGCCAACTTTCGTCACGTGACCAGTCATT TTTCTCGTCGCAGCATTAATTGTAGACTGGAGTCGTTTATAATGCGTGTA 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TTGATTTGCCAAATTAGATGTGCGCGCGCATGTGTGAACCTTAAAAGCAG ACCTTATTTTCGGCTCTCGGGGTATTGGCCCTACCGCGTCTCTGAATTTC GACTTGAAAATTTCAATAAGGGTACATGAAAAAAACTCAGACAGGACTCA ATGTGGGTTAAGTAAACAAAAACTCGTAGCAAATGATGATTCAAAGAAGT GCTTAGCTATCAAAAACTTTTTCCGACATTTTTCCGACTTTTCCGACTTG GGATTAATGTTTTGAAGGTGAGTCGGTCGGACGACGCGAACGGAACATAT TTTAGCTTGCCGCCTATTAAAAAATACATGATTTCTCTTTCAATTTTACA GTAAGTGCAGGTAAGTGAAAATACAGACCAGATATGCAACAGTCCCATTT TTCGACCAATTGTCCCAAGTTAGAGCAGTTGATGGTAGGAGACTTATTTC ATAATCTTAGCATCTTTTAAGACACAATAGACTTTTTCACATTTCATTTT CATCACATGACCCTTGACGGACGGGTGTTTAACGAGAATGGAAATGCAGT CCAGCCAGCTTTCTGTGTGATTTTGAGCTCGATATTTTGTAAATAAATTG CCGTATGGAACAAGAAAAAATTAAGTTAAAGCTGTAATAAGTTTACTGTT TACTGTTTTCCGGAGAGCAGCTTAAAAAAAAAGAACTATTTTTCGCTCTG GAAAGTTTCAGAGCTCTTCCGGTGCTTTCAGAGCCAGTGATTTTTAGCAC GTTCTAAAAACCATTTAAACATAGTTACACAAAAATATTTGTCCCCAGGT AATGGACTTTGGTCAAATAAAATACTTACAGTCTTGATGGATTGATGTTT TTGGCTCATTTGTGTTGTTAAATGGTGAGTTTATGAACACAAAAATACAA GTGTGTGCCCAGCTGAAATGTGAATTGAATGTGAATTCTATGAACAATAC ATTAGAAAAACTTTTGGATATTTGAGTTCCCCTAACATTGTAGAATACAT ACCGTGAGTGGTCCTAAATCCGACAGCCCTGCTTAAATCCGACCCCCAAA TAACTGCTATGAAAACTTTTTTATGTTTACAAACATTCCCTCTCCAAGTT GAACAATAAACTATTGCAAGAACTCTCGAAACAAAACATCTAACAAGATG ACTAAAATGTCAAGATGTCAATTAATGTGATCAAAAACGTGTGAATTGTA AAAAAAAATTACCTCTATTATTGATTATTCTGAATCCGTTGCTTGTGTTT AAAATGTTAACAATTTTGTAATAAAAAATTATATTTTGTATATAAGTAAG AAGCAATTATTGTTATTTGGTTCAATTGGTTCAGTGTATCAATTCTCTCA GTTTAGTTGAATCTGTGGTATCTTCATTGCGTCACAGAAAAAGAGTGAAT TAAAACCTTTAAATCAACCAAATTCTTTCCGCCATTATCCATATAGTCAT TTGGGAGAATGCGACAGTCTTTTGAATTAATAATACCCCATATTTCCCCT ACTATCTATCTATCTATATATTTAAGTAGTAACAAAACATACATGTTCGT TCTCCCTATATATAAAAACATTGAACAAAAAAATATAAATGAAAATGAGT AAAAATAAAATGTTTGGTTCTTTATTCAAAAATAATTTATAATATAAAAT TCCTAAAGAAAAAGCTCATATCGAACCGAGGATAAGTAGTAAAGTTGAGA ATTAAAGGCTGAGAATATTGACACAAAGCTTAACATAATGGCTTGGTGCT GAGAATACCAAAATGTGAAGGCAGGGCGGTATTGAAAACTAGGAGTTGAA ATTAAGTTGAATCCTCAAACTGAAAATGTAAATTGGCGTGATGAGAAGTT CAAGTCAAAAAAATAAATACTAAATGAGTTAAGATAAGATAGATTAGATA AATAGCTATAAACATTTAAAATATTTTTATGGTTTCAGAGAGAAAGGTTT CAAGATGAGTGATGTAAGAAAGAGTAAGGTGAACAAAGGCAAAGAATTTA AAATTAGTGAGAATAAAAACATGGGTGAAGGCTAACCTAAACTTGCAACA AAATAGGAAGTTTCATTAGCTTCATGCAAAATAAAAAGGTAAGATAAATT AAATAAATAAAAATATATGTAAATAAATCACTAAAAGTTAGAAATGCTAG AAATTATACTAGAAATTACTCCTTGTGTTAAGTAAGAGTTTAATTGGAAA AGGCTTCAAGAACGTAAATTGATGCTGACCTGGGAATTAGTGTTAAACGA GCTTGAACTAGGGCCAAGGCAACCTGGTGTTAGTGATTAAGAAAACACAA GAGGCTGATACACAAGGGAAAAAAAAATAATAATACCATATGATCTAGTT TCTGTCAAAATAAGACGAAATTTCGATTTTAAATTCATTTCTATTTTCAA TATTCAATACTTCTTTTGGCAACTCATTCCACCATTTAACAGTTATACTA CTGAACCAAATTTAAAGTAACAAATCAAAATTTAAGTACCTTCCTCTTTC TTATTGTATTAAAATTCAAGTTCATATCTTGATCCTGATGGTATTGTGTT TTTTGGACCACCAGGTATAAAGAAATCTTGAAAGGTCATTTTGTCATTTT TTTGTCATTCTGGTCAGCTGAATGATTGACACATTTTTGCCTATTTGACC GGGTGTTTTTGTAAGATAAGATGCTGAAGTTTTATTAAATTATGCCAAAC ACAACTGTCCTAAGTTTTCCCAGATTTACATATTGCAGAAATTGTTGACA CCAGACAAGTGTGATTTTTAAATGATTCAGGTTCAATGTTTGGATTGTCT GGTTGTAAAAAGCAGTTGGGCACATTCTTACGATTGAATGTGGTGTGTAC CGTGAGATCGGATAACTTGCATCAGTAGAGGCTAATATGCATAGCCCTCA AATGAATGACCTGGCTGGTCATTAAAATACAAAATTAAATCAAACAAAAA TGGTAGAGTAGAGCTGTGAGCGGAGCTGCAAAGTTCATTTGTTTTGAAAT TTTGCTGCTTTGATGGGTCAGTCGTTTGAGGGCTATGCGTGTTTGCCTCC ACTGATGCAAGTTACCCGATCTCACGGTACACACCACAATGTGAACAAAA AAATTGTATCATACCATCGTATTTATATTTATATTGATAGGTCGATTTTT GACGTTTTTGACCACTTTCTGAAAGTAAATATTTCATTCTTTTGATCATC ACTTTAAAGATCCAGTGGTCAAAATAAGGTTTTTATCCTGTTCGGTTATT TTAGTGAATCAGTCATGTTTAGTGTCACCCGAAGCCCGACCTGATGGGCA GAAAATTTGTCCCTTCTAGATGCATGGCTTTAAAACCCTTTTTTTTTCAC GTCCATTAGTTTTTCTAAATGGACTTGGAACAAAGAATGGCATCGAGTGC TTTTCAAAGCTTTTTAAATTATCAAAACAAATATATACAAATCTCTCGAC TTGAAATGCGGCGCCAATGTTTAAAAATTGACTTTAATGTTTTTTCTTAC ATTTCTTTTGCATCGAACGTTTTAATTGCATTCGAAATTTATTTTGTGAG AAAGAAAATCAATAAACAACAATAAAAGAAAGACATAAAGAGAAGAGAAA AATATAAAACTCTCAGTGTAATTTCTGTAATTTACTTTCCTAACTGGGAA AAAGTAGTGAAAGCCATTGTGCGATTAGCTCGTAATCACATACACGTTTT TTTTCTTTAACCCTATTCGTACTAGGGGGGGGGGCTCTTTCTGTTCGGAA GTCAAACTATTGGTAATAGCTCCTGAAATAATAGAGCTTTTGCCGTGAAA TTTTCTGTAAATTCCTAACTTTTATTTTGCTTCAAAATAAAAAAAAATTT GACACCTAAATATTTTCACACCTTGAGCATGATGACATTTCTGACAGTAA GGTGTCACAAAAATTGACACTTTTCCAATACAAATTTATTTTTAATGTCA AATATATCGTTTAAACCGTAATTTATTGAATATTTAGGATAAAATAAGCA TTTTAAACTCAGGCAACTTTTTTCTAAAGCCTTTGTTAGAATACAATAGC TATTTATAAGAACAATGGAAAATTTCGGTTTTTGCTCACTTTGTGCATGA TGAGTGACGTCATCAGAAAAATATTTTGTTAAAAGTTACCTTACGTGACA AGGATCTTGTGTGCCAAATTTCATCCAAAAAGACCCACTATATAAAAAGT TAAGGGGTGGTACAGGAAAAGCCCCCCCCCCCCTAGTTCTGAACCGCCCC TAAAAGCCTAGTTTGAATAGGGTTAAGAAACACACTTTTAAGAAACATGA GGCTCAAAATGCCTAAAAACTAAGAAACATCTAAGAAACATGCTGAGGCT GAGAATGAAAAAATAGCATTTTTTCCAATCAAGGTTCCAGAAATATACAT ACATAACAGTTAGAAACACTTGAGAAAGTCAGAAAATCAATATAAAAGAT AGGAAAGTACCGTAGATTAGTCTATTAGACTATTGTATTATCGACATGCG TCCTTTAAGCTTGACAAAGTTTAGAAACATGTAAGAAACATTTAAGGCTC AAAAGGCCAATTTCTTAAGAAACATCGAGGCTGCTGATTTTTTCGTTTCT AATTAATAAAAAAAAATCACTCGTGCAATTATATTCGAATTGCACTCGTT ATCATGTGATTACATATACTTATGCTTATGAAAAATTCCAGAAAATTCAT GTATTTAACAAATTGCAAAAATTCTTCGTCGCTGTTTTTTCAATGGCGAC ACGAGAACCTATTTTTTTAGCTTAGGAAACACACAATAGAAACTCGACTG CTTAAATTTGAACCTACTTAAAGTCATCATACATTCTTGGGCCATGCCAT TTTATATTCATACAGGAGGCGGACCAACATAAGAACGATTTTAGTTCACC TAGCCTCCACCCTCACTTTATGGTATTAATAATTTTTTTCAAATTTTTGC CATTTTCCAGGGGGTATACTCATATTTCTAAGAACCTTTTTTTGCCTTGA AAAGGTTCGTCTATCCCCCCTGTATGGAAATTTAACGGAACAGCCTATTC CATTTTTTAGGAAAAGCTGAAACGTGAAATGCAACAATTGGTGTTCTACA ACCCTGGGCCGTCTACTCAAGACTTACTTGGTTTCAAACCTGAATTCAGT AACCGTGAAAAGCGAAAGTTGAACCGTCTTCTTGAAGACAAGAATGGTGG AAGTTCAGGGTATGTTTTATATTATTCATTTTATAAGTTTACATTAATTT TAAGGCGTACCTATACAGTGTGTCCCAAAAAAAAGCGAACACATTTATAC AAAGTAAAATCCTCAAAACTCATTATCTGAACTGGGCTTAGAATAATTGA TTGAAGATATAACAATTCTCTGTTCAAATTTTAAGCCCAGTTTAGATAAT GAGTTATGAGTAATTTACTTTATATAAAAATTTGTCCGTTTTTTGGGACA ATTTTCTACGGATTAGTTCGTAGATTTGAAGTGATCTGAACAATGACATC ATATAATGATATTAAAAAACTCCGGATATTTTGAAATGGTCAGGGTAATA TTTTGGTGAAATGGGTTTGAAGTCTGAACAAATAGCCTGTTGAAAAAGGG TTTTATCATTAATTTTGTTCACACCAAACGTACTGTGGCTAATTTTTCTG GACCATATTTTTTTAATTCTGCCATAGAAAGACGAATAACTGTGATAGAG TAATGTTCTATTAAGTGCAATATACGAGCAATAGACGATATCGGCTTTAC ATGAAAACTCAGATTTGATCCCCGAGAATTCCCCACAATGCTTTGCGCGG AAAAAAGTTCACGGTAAAATTTTTTCCGCACAAAGCATTGTGGGGAATTC TCGGGGATCAAATCTGAGTTTTCATGTAAATCCGATATCGTCTATTATTA TCCGTGTGAGAGGGCGATACTCGATATAAATAAAATGACCCAATCGATTT GTAAAAATTTTGCAAATCAAAGTGACGATAAACTCGAGATATAATCTATA TACTATCTCTCAAATTCGGGATTTTGGCTTCGGTCAATATTTTACCATAT TGCCCTCTTAAACAGTCAATAGGGTTATTAATAAATGTAGAAGTAAATAA AGAATAATTTAATAATAACACACAGGGACGAAGCACCGAAACGGTCTGGA CGTAAACCTGCGAAGCAAGTCATAACACTACACGATGAAAAAGGTTGTGT TCGTGAAACCGGCGAGGACGTTTGTGATTGTATGATCACTGACTGTCCGG GTTGTCACTTCCCGTGCGGCAAGTGTGATTCGGAGAAGTGTGGCTCTGTT TGCAGGAATAGTCGGCGATGGACGTACGATGTTGTGTATTATAATATCAA ATGA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000182_pilon:468503..477706-

>XLOC_012184 ID=XLOC_012184|Name=XLOC_012184|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1134bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000182_pilon:468503..477706- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GCGGACAACACGAGCTCGAAAATTTTGATCTCTGCATCTTCAGAATCTAC
AAGCAAAGAAAAGGAAACTGCTGCTTGTGATACAAATGTCAACGCCACAA
AGCTTACTTTAAGAGCTGTGAAGTCTGGTGATACATCTGCGTGGACACCG
ATTGCTGTCAGTGAAGAAATCTCCCCAGAGGAACAGTCGGCGGACAACAC
GAGCTCGAAAATTTTGATCTCTGCATCTTCAGAATCTACAAGCAAAGAAA
AGGAAACTGCTGCTTGTGATACAAATGTCAACGCCACAAAGCTTACTTTA
AGAGCTGTGAAGTCTGGTGATACATCTGCGTGGACACCGATTGCTGTCAG
TGAAGAAATCTCCCCAGAGGAACAGTCGGAAAAGCTGAAACGTGAAATGC
AACAATTGGTGTTCTACAACCCTGGGCCGTCTACTCAAGACTTACTTGGT
TTCAAACCTGAATTCAGTAACCGTGAAAAGCGAAAGTTGAACCGTCTTCT
TGAAGACAAGAATGGTGGAAGTTCAGGGAAAAGCTGAAACGTGAAATGCA
ACAATTGGTGTTCTACAACCCTGGGCCGTCTACTCAAGACTTACTTGGTT
TCAAACCTGAATTCAGTAACCGTGAAAAGCGAAAGTTGAACCGTCTTCTT
GAAGACAAGAATGGTGGAAGTTCAGGGGACGAAGCACCGAAACGGTCTGG
ACGTAAACCTGCGAAGCAAGTCATAACACTACACGATGAAAAAGGTTGTG
TTCGTGAAACCGGCGAGGACGTTTGTGATTGTATGATCACTGACTGTCCG
GGTTGTCACTTCCCGTGCGGCAAGTGTGATTCGGAGAAGTGTGGCTCTGT
TTGCAGGAATAGTCGGCGATGGACGTACGATGTTGTGTATTATAATATCA
AATGAGGACGAAGCACCGAAACGGTCTGGACGTAAACCTGCGAAGCAAGT
CATAACACTACACGATGAAAAAGGTTGTGTTCGTGAAACCGGCGAGGACG
TTTGTGATTGTATGATCACTGACTGTCCGGGTTGTCACTTCCCGTGCGGC
AAGTGTGATTCGGAGAAGTGTGGCTCTGTTTGCAGGAATAGTCGGCGATG
GACGTACGATGTTGTGTATTATAATATCAAATGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_012184XLOC_012184-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000182_pilongenomesc0000182_pilon:468503..477706 -
Properties
Property NameValue
Aaloc442-669:229
Aaloc292-438:1295
Aaloc103-291:9205