XLOC_012075 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_012075
Unique NameXLOC_012075
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000124_pilon:650248..662980-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_012075 ID=XLOC_012075|Name=XLOC_012075|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=12733bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000124_pilon:650248..662980- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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AGGAGCTTGAACCAGTGTGGTTCACACCATTCACAGGAAAAAATTTTCGA TTTCCAAGGTTGGAAACTTCAAGTTTTCTTAGTTGGAAAAAGATAAAATC CAATGGAAAATCCAACCTGAAAATGTGGGACATTCTCCAAGGTTGAAAAT TTTGCATTTTCCATGGCATGGAATTTTCGTAAATCCAGGTTGAAAAAAGC CAAAATCCAAAAAGTGATGTCAGAGATGTGGAAAAGAGATCTTAAACAAG GTTTTTGTTTTTGTGAACAGTCACTCGCTAGCCTAGGCTCGATGGCTCCC GGTCAATCTCTCGTTATTGTTCGCACAGATACGTGGTTGATCTTAGATCA CTCACACAGCTCAGCAGGGCGCTATTTGAAACTATGACACAAGTACCCTA TGTGCTTCACTGTGCGAACTCACTGCGATTGACCGAGGCCGCTCCGAAGA GACGCCTCACAAGGACATGCGCAGAAAATGGTTAGAAAAACGTAATTTCC ACATGGATTTTTAACGTTTTCCAAACTGTTTGGAAAAACACAAATTTCCA ACCCAAAAAGTCTAGTTTTCCAATCGAAAGAGTTTCAATTTCACAAAAAT GTGTTTTCCACATGGATTTAACGTTTTCCAAACTGTTTGGAGAAACACAA ATTTCAAACCCAAAAAGTCTAGTTTTCCTATCGAAAGAGTTTCAATTTCA CAAAAATGTATTTTCCACATGGATTTTTAACGTTTTCCAAACTGTTTGGA GAAACACAAATTTCCAACCCAAAAAGTCTATTTTTCCAAGAAAGGGTCTC AATCTTAGAAAAATGTAATTTCCACATGGATTTTTAACGATTTCCAAACT GTTTGGGAGAAACACAAATTTCCGACCCAAAAAGTCTAGTTTTTCAACTT GAGGTATCAAATTTACTAAAATATGTATTTTCACATCGATTTTTGACCTT TTTTTTCAATTCCCAAACTGTTTGGAAAATAAAAATTTCCCACCCAAAAA GTCATGTTTTCCAACCAGCCTTGGAAAATTGTCATTTCTACATGGGTTTT TTTCACTTGATTTTTCAAGGGCATTGGTTTATTCTACAAAACCTATGGGT AATTTACGTTTTCCAAATCAGCTTACAGTAAGGTAATCGCTCAAATTTCC AACCTTCAATTATAAAACCAAAATTTCCAACCCAAAAATATTGAATTTCC AACCTTGGAAATCGAAATTTTTTTCCTGTGATTGTGAATATCTAAAAACT GCCTGGATGTAACAAATCATATTTTTACTTTATCTTCTATCCAGAGAAGT GTTAAAGTTTCAACATATCAATCCAGAGGAAGCAGTGATGATTCACCAAG ATGTTCGATCCAAACAAAGTCTTGGGATGCATTGGGGAACCTTCGAATTG ACAAAAGAGGTAAAGATGAGATAGTGCTAAACGCTAAAGTATCTAATATT TAAAGGAATTAATTTTCGCGGAACTAATTTTCGCGGTGCGAGGGTACTAA ATTGGCGCATTCTGCGGAACTAAATTTTGACGCACAGCCTTATTTATTGA TTTTTAGCTCATTATTCTTGTGAGTCAGGAAGAAAAGACACATTTTTATT CTGCTACTGGCAGTTTCATGCCACTTTTGTGACAATCTTCAGGCACACAA AAGTGACATGAAACTGCCAGTAGCAGAATAAAAAAGTGTCTTTTCTTACT GACTGACATCGCTCAACATATGTATCGAGCACTGTAAAAGACTGAAGAAT TACTTACATTATTCTTGTGAGTAATTTTTCAAGAAATTTTTATCTCATAT CATTGCTATTGAATTTTGTTCTCTGACAACCCTGCCTTACGATTTTCATG TTTTTATTATACCACTCCACTCCTTTTCTTACAGCCATACCTTGAGCCTC 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TCCATAAGAGAGGAAAGAAATTTATCCTACATTGTATTTTTTGTGACCTC GTGCATGACTCTGACAGATAGTATTTTGAAATTTGAAACCTTGTTTTGAT TATATAAATTGTGAAAAGAAAACGAAAGGGTGAAATAAGGGCATTTTGAT TTGATAAGAATGACTGTCTAAACTAAACTTGCATTGATGAAGTTGTTATT TGCAAACGTCGAGTTAGAGATAAACTTTGGAGGATTACATTATATCTGTC TACCTACGATATAGCTAAAGGTATGTCTGTTTTTTTTTGCAATTACTTTT AAGTATAGGGGGGGGGGTAAATTAAAAGCCACTCTATAGTTAGGGAGCCC CCCTCTCGAAAAAATATTCAAATGCATTCTTCGAATCGGCCAAAATTATA TTCCACTCATAAAATTGACGTGGGAAGGAGTCCGAGAAATTGAGCTTGAT CTCTTTAGTATCGCATTTTTGGTTTCAATTATAGATGGTGTTTTCTTATT TCCCGCACCCTCTCTTTCAGGCAAATATCTTAGTGCAAGGTCCTTACGTT CGTTTTCGTTCGTTCTTGCAGTAGAGAGGTAGTATTAGTTGAAATTCTAG GGTTCGATTTGTTAGAACTGTCATATTGGGTGAGAACCTGAAATTATTTA ATGTAACATAATTTTACATATCAACCATTTTTCGTTATTATAGAAACATA AAAGGATGAATCGTTTTGCGAAGCTAGCCCGTTTTTCGATGAAAAATTTA CAGCATCGATGTTACGTCACATCTAATACACGAACAGTCGACTTACGCTC AGACACTTTGACGCGGCCAAGCGCTGAGATGAGGCGTGCTATGTTTGCAG CAGAAGTCGGAGATGACGTTTATAAAGAAGATGAAACTGTGAATGAGTTA GAGAGACTAGCTGCTCAGCTATTTGGAATGGAAAAGGCTTTGTTTGTGCC 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000124_pilon:650248..662980-

>XLOC_012075 ID=XLOC_012075|Name=XLOC_012075|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=4644bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000124_pilon:650248..662980- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTTCAAAACAGTCTGGAATTGTCGCAGTTTCTTTAAAGATGTGAATAC
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AACATTCAAGCTACATGGTTAGGCCACGCCAGCTATCTGATACAATTCGC
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GTGATACTATACACTGGTTTCTACCATTGAAATTTGATGACTGGATGAAC
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CTTTCGTTCCTGCTCAGCATTGGTGCTTAAGGGGGCTTACACGGAAAGGT
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ACTTCTTATGGGGTCGGACAAGCAAGATATCGGAAGTGCCCAGTGACGGA
CGTATCCGAGCTTCCACCGATTGATATTGTTTGTGTATCGCACGATCATT
ATGATCATTTAGACCGCACGACCGTCGAGCGGCTACAAGCGGTCCATGGT
GATACTATACACTGGTTTCTACCATTGAAATTTGATGACTGGATGAACAG
TCTAGGGCTAAAAAATGTGAACGTCAAAACCTTTAATTGGTGGGATGAGG
ACAATATTGAAATCAAGAATAAGTCGGGAGAAGTTAAGGCTACCATCGCT
TTCGTTCCTGCTCAGCATTGGTGCTTAAGGGGGCTTACACGGAAAGGTTT
ATTTCCTTCATCAGATGAAAACACCCGTCTTTGGGGTGGATGGATTGTTA
AATCAGGGGGTAAAACGATTTATCATGCAGGTGATACAGGATATTGTCAT
ATTTTCAAAAGCATTGGTGAACGATATGGTGAAATTGATTTATCTTTGTT
GCCGATTGGAGCATACACTCCAAGAGAAGTGTTAAAGTTTCAACATATCA
ATCCAGAGGAAGCAGTGATGATTCACCAAGATGTTCGATCCAAACAAAGT
CTTGGGATGCATTGGGGAACCTTCGAATTGACAAAAGAGAGAAGTGTTAA
AGTTTCAACATATCAATCCAGAGGAAGCAGTGATGATTCACCAAGATGTT
CGATCCAAACAAAGTCTTGGGATGCATTGGGGAACCTTCGAATTGACAAA
AGAGCCATACCTTGAGCCTCCTGACCGCTTGAAGAAAGCCATGGAAGAGA
AAGAACTCAACCCAGAACATTTTATAGCTTTAAAACATGGTGAAACGAAA
TTGATAGGAGATCCATACCTTGAGCCTCCTGACCGCTTGAAGAAAGCCAT
GGAAGAGAAAGAACTCAACCCAGAACATTTTATAGCTTTAAAACATGGTG
AAACGAAATTGATAGGAGATAAACATAAAAGGATGAATCGTTTTGCGAAG
CTAGCCCGTTTTTCGATGAAAAATTTACAGCATCGATGTTACGTCACATC
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CTGAGATGAGGCGTGCTATGTTTGCAGCAGAAGTCGGAGATGACGTTTAT
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TGGAATGGAAAAGGCTTTGTTTGTGCCGACTGAAACATAAAAGGATGAAT
CGTTTTGCGAAGCTAGCCCGTTTTTCGATGAAAAATTTACAGCATCGATG
TTACGTCACATCTAATACACGAACAGTCGACTTACGCTCAGACACTTTGA
CGCGGCCAAGCGCTGAGATGAGGCGTGCTATGTTTGCAGCAGAAGTCGGA
GATGACGTTTATAAAGAAGATGAAACTGTGAATGAGTTAGAGAGACTAGC
TGCTCAGCTATTTGGAATGGAAAAGGCTTTGTTTGTGCCGACTGGTACCA
TGGGCAATCTTTTATGTTTAATGTCTCATTGTTATGGGCGTGGCGAAGAG
CTCATCATTGGTTCGAACCAACATGTGTATTTGTATGAGCAAGGACATTT
CATGCGGTTGGCTGGAATCGGCGCACGTGTTCTACCTAACGAACCAGATG
GGACGATCAAACTAGAATCAATCAAACAAAACATAAGAAACGCTTCCGAT
TTTCACCAATCAGAAACTAAGTTAATTTGTTTGGAGAACACTCACATGAA
TTGTGGTGGGATCCCTCTTACCAATGATTATTTGAACCAAGTTGGCCAAT
TAGCACGTGAAAATGGGTTGCAGTTACATATTGATGGCGCTAGAGTGTTT
AATGCAGCTGTTGCAACTAACCAACCTTTATCTGATATTTTGGTAGAGGC
TAACTCGGTTTCTATGTGTTTATCAAAAGGACTTGGGTGCCCTATTGGCT
CAGTAATAGGTGGCAGTGAAGAGCTAATGAATAAGGCTATTCGCATTCGA
AAATCCTTGGGCGGTGGAATTAGACAGGCGGGATTTTTGGCGGCGGCTGG
TTTATACGCCCTCGAACATGGCCACATATGGATACAACGAGACCATTCAA
ATGCGAGAATGTTAGCAGAAGGAATACAAGAGTTGAAATTTCATGATTTA
ATTAAAGTTGATCTATCGAAAGTCAAAACGAATTTAGTTTTTACTGAAAC
GCCACCAGGAAAATCATACGAAATTCAAGACCGTTTGATAGAGAAAGGAA
TACTTTCCATTGCATTTTCGGACACCAAGTTAAGGTTTGTTTTACACCAT
GATGTGGGCGAAAGTGACGTTCATTATGCCCTTGATAAACTGAACGAAGT
TTTACAAGAAATGTCTTAAGTACCATGGGCAATCTTTTATGTTTAATGTC
TCATTGTTATGGGCGTGGCGAAGAGCTCATCATTGGTTCGAACCAACATG
TGTATTTGTATGAGCAAGGACATTTCATGCGGTTGGCTGGAATCGGCGCA
CGTGTTCTACCTAACGAACCAGATGGGACGATCAAACTAGAATCAATCAA
ACAAAACATAAGAAACGCTTCCGATTTTCACCAATCAGAAACTAAGTTAA
TTTGTTTGGAGAACACTCACATGAATTGTGGTGGGATCCCTCTTACCAAT
GATTATTTGAACCAAGTTGGCCAATTAGCACGTGAAAATGGGTTGCAGTT
ACATATTGATGGCGCTAGAGTGTTTAATGCAGCTGTTGCAACTAACCAAC
CTTTATCTGATATTTTGGTAGAGGCTAACTCGGTTTCTATGTGTTTATCA
AAAGGACTTGGGTGCCCTATTGGCTCAGTAATAGGTGGCAGTGAAGAGCT
AATGAATAAGGCTATTCGCATTCGAAAATCCTTGGGCGGTGGAATTAGAC
AGGCGGGATTTTTGGCGGCGGCTGGTTTATACGCCCTCGAACATGGCCAC
ATATGGATACAACGAGACCATTCAAATGCGAGAATGTTAGCAGAAGGAAT
ACAAGAGTTGAAATTTCATGATTTAATTAAAGTTGATCTATCGAAAGTCA
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CAAGTTAAGGTTTGTTTTACACCATGATGTGGGCGAAAGTGACGTTCATT
ATGCCCTTGATAAACTGAACGAAGTTTTACAAGAAATGTCTTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_012075XLOC_012075-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
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Properties
Property NameValue
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