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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000107_pilon:1042008..1049306+ Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_011928 ID=XLOC_011928|Name=XLOC_011928|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7299bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000107_pilon:1042008..1049306+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTCAGAATACAACTTTAGAGAAAGACGAAAGGAGAAAGGAGTAATGGC
TGACTACACAAGCGTTGAAAAACTTGATTATTCAAGCCAAGGTAAAATAT
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ACTACTACCGATTATTATGATCGTCGCCATTCTTATTGTCGTCGGTGTCA
TTATCACCGTCGTCATTTCTAATAAAGACGACGATGTCGTATCTTCTGGC
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ACCGTTGATTGATGGACATAATGATCTACCTTGGCAATTTCAACAAAGCT
ACCGAAATCAGATAGAAAAGGTGTGTAACTACCTTAtcgaccctttttac
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tgtaaaaagggccgataaggtatatatcTAACTTCATTATTAGGGAAAAC
AATTTTACTATAACCCCTTTAactataaaaatgtttttattgacAGGTCA
CTTTATCAATGTACCTTTGGGCGGTAACTTGTCAAATTCAATGTCCCCAA
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CGAAACGACTGTAGTATGATGTCCAAACTTGTACCGAGTCCCTTAATTCA
TCACGAACCCCTTAGACTTTATCACAGCCAAATTAGTGAAAGTTGCACTG
AGTACTGGATCGCGTTGATCGAACTCAATGGTGAagaccaacctcgttcc
ctgcgcattatcagcttttgatgcttactgatagcactagataataccct
ggcattggctggttttcgaacgcgtaagattacgtaactcaaaaacaaaa
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ATATTTAcatttatcttaaaaaaaaataaataataaaataaagcctggga
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AAAATCTTATCAAACTCAAACCCAGTCCCTTcgttcacttttttatgatt
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CGACTTTGGTACCATTGAAAAAACCGTCAGAtagtatttttgttaaaaag
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CTCTTGAGTATTACATTAGCATTATGGTACCAATCAAAAAGAGAACTCCG
ATCAAAAGTTTCGGTTGGCCGTTATTGAGCCGTTATTAGCTAGAACTAAC
CCTATCAAAGACGCATACATGACGTTCGTTACTTAAAATGCACGTTTAAT
TCTTTTTCAGGCATCGAAGGAGGGCATGCAATTGATTCATCCTTGTCATT
ATTACGACAATTTTATGAGCTTGGCGCCCGATACATGACATTAACGCATT
CTTGTAATACGCCATGGGCTGACAACTGGAAAGTTGATAACACACAGGTA
TTGATCTTGCAAAATGGATAACTATTATCTGTTCAACTTgtctttttttg
atttattcAGTTCCTTTCAATTATACCTCTCAATAGTTTGTCAAAGCAAC
GGATTGGTCAAAGCTTTGTTTAATCAACATCTATTTGTTTTTGACGGTCT
TCCTAGCTGGCTATTAACAAAATGATTCATTaaccattttttgaaagatg
tgaaaattttcaactttatttttaaatccaaaatttcaaactggcataaa
agcttgtagcttgaAAGCTAGTCAacggttttggtaccattgaaaaggta
tttttttaTATACCCTGTCTAAAAGCACTCGGTATATGCCCTTCTAAATC
AAGTTGTCAGAAGTTATATATAACTAATACTATAATTCTGGGACTCGGta
tattggcaattttagaTCGTGTATGCATCATCCATTTAACATCGAGCTTA
GCTTTTATTTTACCAGTGACAGGAAATTTGACATGAGAATCTTTTCCCTA
CCAGAAAATATTTCCCTAGAATTTCCTAGCATCGTTTTATCCCTGCTACT
ATCCCTGTTACAAACCTTATTTACCCACTTGGTCAcgaattcttaacttt
ttacaCAAAACGTTACCATTTAGAACGGCACTAAAGATGACTCAAGAAGC
AACGGACTCAGTACGTTTGGTGAAGACGTTATTCGTGAGATGAATCGACT
TGGTATGCTTATTGATCTTTCTCACGTCTCCAATAAGACAATGTCAGATG
CTTTGGATGTCACACAGGCACCTGTCATTTATAGTCATTCATCTGCTTAT
GCTGTCTGCAATCATAACAGAAATGTCAGGTAGGTATACTTTTAAACTTA
TTACTTTCAATATATTTAAGACTTTAAATTCAATACTCAGGCGGATCCAA
TTTATTCGAAATGCATTATTAAAAGCGATATTAGAATTGACAAAATTACA
AGTTTTTGAATAATttcgattcaaaattttcaatattgtgttaaaatgaa
atttcaaataatacACTACATATCTATATCAGATGCAATTCTCTGGAGCG
CATTTTTTAAGATTCATATCTTTTTGGGTCGCCAGTTTATTTAATCAGGC
GTTCAATTGAAATTACTGGCAATTGTCAAATATGAATATGACGGATACTG
AAATAATTGGATTGTCAGAATATTTTCATTAACTGAAAGAATATAAAGGA
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TCTAGAGATGAAGTCCTCCATAAAGTGAAAGCGAATCGTGGTATCGTCAT
GGTGAATTTCTACAACAAATACGTCAATTGTGATCCCGAACCAACCAATG
AAACTACGATAAACACCATTGTCAGCCATCTTGAATATATTAAGAATCTG
ATTGGCGTAGAATATGTCGGTATGGGTAGTGATTATGATGGAGTACCCGC
TGTTCCTAAAGGTATTCTTGCTATTAATGTTATGTAGACAAACGAAAACG
AAACGAgcgattctttgatcttagaacatcattaatgtgaaaaaaagatt
caaaaaagtcATTCCATCGAAAGACATAGTCCAAAGTTTATcaatgattg
acttcaaaaatcatcaaaaaacaataaaaaagagcCCCTTTTTATGTCAA
CCAGACAaatttttaagctgtattttttgattgaatgaatattttttaaa
tctttttttcgtatttATGACgtttaagattgaagagtttcttatacaaa
atgaagatcatagtactattttataagaagttgattttcttcttcttcat
ttttcatcttcgtatttccattttttgaattcttttcatttttgataata
ttccactccggattatctttttaacgagcacaaaaccgctaactaattca
aatttaatcaaaaggttttaaaaaacactgctagctaatttgaaataggc
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gaaatttttgcatgAACCTAACCTTGTCACTCTTGGAGACCAAATCTACA
AAATTAAGCAATTTAAACAAATAAAAGTCTCCATAAAATTTATATTCTTT
AGTGCTTGCGTATTGTATGACTTAGATGTTCagattttttttacctttta
cgGGGTCTACACAGTCAACCGGCTGCTATATATGAAGCTAACAGAACATG
ATAAAAGTGAGAGTTTGACTGGGGGTtcccatataacgttagatgaacgt
tggatTTGTTTatcgaaagaaaattccttttcataatagagcacccgtTG
TTACTtgtcgtacattacggtccgcaaaacatattgtcgaatattgctcg
ccaatatattgtgtagtctaagcaGGTCTTTAGACCACTCAGCTACTACT
CATTTTAATAAGGGCAAATGTTTTCGATCGAAAAcatgtcaaaaatattt
aaccAACAAGAACTCATAATAATATGTTTTCAGGTTTGGAGACAGTTGCA
CAATTTCCAGATTTATTCGAAGCACTTGCAAATAAAGGATGGTCTGACGA
TGATCTTGGCAAACTTGCCGGTAAAAATCTTTTACGAGTTTTTCGTGAAG
CTGAAACAGTTTCAAAAAGATTACGAAAAACAATGAAACCTATTGATAGT
TTGATGCCAGTTGATAAATTCATAGAAAAGGCGAGCAATAATACTTGTAG
AACTGGACTCCTGGAAGCCATTGAAACCAACATTTCTGGTGATGCGTGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000107_pilon:1042008..1049306+ >XLOC_011928 ID=XLOC_011928|Name=XLOC_011928|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2886bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000107_pilon:1042008..1049306+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTCAGAATACAACTTTAGAGAAAGACGAAAGGAGAAAGGAGTAATGGC
TGACTACACAAGCGTTGAAAAACTTGATTATTCAAGCCAAGATGTCAGAA
TACAACTTTAGAGAAAGACGAAAGGAGAAAGGAGTAATGGCTGACTACAC
AAGCGTTGAAAAACTTGATTATTCAAGCCAAGGCTCCAAAAGCAAGAATA
AAATCATGACGTCACGTAATAAACGACTACTACCGATTATTATGATCGTC
GCCATTCTTATTGTCGTCGGTGTCATTATCACCGTCGTCATTTCTAATAA
AGACGACGATGTCGTATCTTCTGGCAGTAAAGCAATGACGACTCGAGAAC
GTGTTTTGCAGGTCTTGGATGAAGTACCGTTGATTGATGGACATAATGAT
CTACCTTGGCAATTTCAACAAAGCTACCGAAATCAGATAGAAAAGGCTCC
AAAAGCAAGAATAAAATCATGACGTCACGTAATAAACGACTACTACCGAT
TATTATGATCGTCGCCATTCTTATTGTCGTCGGTGTCATTATCACCGTCG
TCATTTCTAATAAAGACGACGATGTCGTATCTTCTGGCAGTAAAGCAATG
ACGACTCGAGAACGTGTTTTGCAGGTCTTGGATGAAGTACCGTTGATTGA
TGGACATAATGATCTACCTTGGCAATTTCAACAAAGCTACCGAAATCAGA
TAGAAAAGGTTAATCTCAATACTGATAATATCACTGGCGTATTTCAAGAA
AACTATGGTCACACTACGATTCCATGgttaaaaaagggaaaagttGGTGG
TCAGTTCTGGGCTGCTTATACATCGTGCAAAACACAAGAGAAAACTTCAA
CACGTGAAACCATGGAGCAGATTGATGTTATTAGACGTTTCGTTGATCAG
TATCCAGATGTGTTTCAGTTTGCCAAGACTGTTGATGATATTGTGAGGAT
CcataaagcaaagaaaattgcATCTCTTATTGGTTAATCTCAATACTGAT
AATATCACTGGCGTATTTCAAGAAAACTATGGTCACACTACGATTCCATG
gttaaaaaagggaaaagttGGTGGTCAGTTCTGGGCTGCTTATACATCGT
GCAAAACACAAGAGAAAACTTCAACACGTGAAACCATGGAGCAGATTGAT
GTTATTAGACGTTTCGTTGATCAGTATCCAGATGTGTTTCAGTTTGCCAA
GACTGTTGATGATATTGTGAGGATCcataaagcaaagaaaattgcATCTC
TTATTGGCATCGAAGGAGGGCATGCAATTGATTCATCCTTGTCATTATTA
CGACAATTTTATGAGCTTGGCGCCCGATACATGACATTAACGCATTCTTG
TAATACGCCATGGGCTGACAACTGGAAAGTTGATAACACACAGGCATCGA
AGGAGGGCATGCAATTGATTCATCCTTGTCATTATTACGACAATTTTATG
AGCTTGGCGCCCGATACATGACATTAACGCATTCTTGTAATACGCCATGG
GCTGACAACTGGAAAGTTGATAACACACAGAACGGCACTAAAGATGACTC
AAGAAGCAACGGACTCAGTACGTTTGGTGAAGACGTTATTCGTGAGATGA
ATCGACTTGGTATGCTTATTGATCTTTCTCACGTCTCCAATAAGACAATG
TCAGATGCTTTGGATGTCACACAGGCACCTGTCATTTATAGTCATTCATC
TGCTTATGCTGTCTGCAATCATAACAGAAATGTCAGAACGGCACTAAAGA
TGACTCAAGAAGCAACGGACTCAGTACGTTTGGTGAAGACGTTATTCGTG
AGATGAATCGACTTGGTATGCTTATTGATCTTTCTCACGTCTCCAATAAG
ACAATGTCAGATGCTTTGGATGTCACACAGGCACCTGTCATTTATAGTCA
TTCATCTGCTTATGCTGTCTGCAATCATAACAGAAATGTCAGAGATGAAG
TCCTCCATAAAGTGAAAGCGAATCGTGGTATCGTCATGGTGAATTTCTAC
AACAAATACGTCAATTGTGATCCCGAACCAACCAATGAAACTACGATAAA
CACCATTGTCAGCCATCTTGAATATATTAAGAATCTGATTGGCGTAGAAT
ATGTCGGTATGGGTAGTGATTATGATGGAGTACCCGCTGTTCCTAAAGAG
ATGAAGTCCTCCATAAAGTGAAAGCGAATCGTGGTATCGTCATGGTGAAT
TTCTACAACAAATACGTCAATTGTGATCCCGAACCAACCAATGAAACTAC
GATAAACACCATTGTCAGCCATCTTGAATATATTAAGAATCTGATTGGCG
TAGAATATGTCGGTATGGGTAGTGATTATGATGGAGTACCCGCTGTTCCT
AAAGGTTTGGAGACAGTTGCACAATTTCCAGATTTATTCGAAGCACTTGC
AAATAAAGGATGGTCTGACGATGATCTTGGCAAACTTGCCGGTAAAAATC
TTTTACGAGTTTTTCGTGAAGCTGAAACAGTTTCAAAAAGATTACGAAAA
ACAATGAAACCTATTGATAGTTTGATGCCAGTTGATAAATTCATAGAAAA
GGCGAGCAATAATACTTGTAGAACTGGACTCCTGGAAGCCATTGAAACCA
ACATTTCTGGTGATGCGTGAGTTTGGAGACAGTTGCACAATTTCCAGATT
TATTCGAAGCACTTGCAAATAAAGGATGGTCTGACGATGATCTTGGCAAA
CTTGCCGGTAAAAATCTTTTACGAGTTTTTCGTGAAGCTGAAACAGTTTC
AAAAAGATTACGAAAAACAATGAAACCTATTGATAGTTTGATGCCAGTTG
ATAAATTCATAGAAAAGGCGAGCAATAATACTTGTAGAACTGGACTCCTG
GAAGCCATTGAAACCAACATTTCTGGTGATGCGTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000107_pilon | genome | sc0000107_pilon:1042008..1049306 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1180-1443:7036 |
| Aaloc | 973-1176:5807 |
| Aaloc | 766-969:5174 |
| Aaloc | 631-765:4413 |
| Aaloc | 355-627:3269 |
| Aaloc | 94-354:1960 |
| Aaloc | 1-90:1 |
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