|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000353_pilon:220977..222962- Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_011869 ID=XLOC_011869|Name=XLOC_011869|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=1986bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000353_pilon:220977..222962- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAATTTAAAGACTTTACTACTTTTAATAATCGCTGTTACTGAAATTTG
CCGGGCATCTAATTTCCCTGTAAATGATTTTTTGGAATATTTAAAAACGA
ACGATTGCGGAATCGATAAATTGGTCGATAATATAAACAGTACATTCGCG
AACGATTTTTTGTGTTCGGCTAGAAATGTTCATGTCGATTCGAATCGAAC
ATGCTCGTGTAATATAACCGAATGTGTTTATTTGAGAACGTGTTGTATCG
ATATTGTATGGGACAAACACAAGCCGATATCGTTGACCGATTACATCGAT
TACTTCATCGATAAAGTGTCGCTTGATGGAAGTTTGTCATGTGAATCGAT
TATACCACGGTCGGTGTTTTCAAAAGACGGGATTATTTCAATTACCGAAT
ATTTTATGGTTTCTGCATGTCCTGGACAAACTCACCAAAGTAAAAACGAT
GATTTCCAACCCGTGATTGATTCTCAAGAAACCTTATATAAATCTAGAGA
TACTGCTTTATGTAACGGCGTCACGAAATATCACCCAGCAACTATAGAAA
TACACTCATTAATGTCTGGAGACATATCAGAGATTAAGCGCGGTGGACTT
TATAATCTTACAATGGCTATGGTGAAACTTTCAGATCGTTCATTTAAACA
TAAATGTAAGAAAACAAGCAAACACGTTTGTAGTAATGATCTCCGTTATT
TGAAGTTCCGTCAATTATACAGGACGTTTTTGAAGGACCTACCCGGAGGC
CATATACGTTGGTCTCTTATGATTTCAGTTGTGAACAATCGACTTCAAAT
GGCTAACCTGATGGGGAGAACCATCACAAAGACTTGTCAATCAGGTCAAA
GCTTCAATCTTGGAAATTTGAAATGTACTCAAGACGCATGCATGAAACCG
TACCAGTATCATAACGGTAGCTGTATTCTTGATCTCGGTACCGTAACTAT
GGGCCATGATGGCGTTAGATTACCTTGGCAACGACAAGTTGATGACATTG
AAAAATACGTGACCATGTTTATTATGCCGTTAAGTATTTGTGGGTATATT
TGGTCTATTCTTGGGTTCTTGTATTTCAAAGAACTGCAGAATCTACCGAG
ATTAAATTCGATTTGCATGACATGTGCGTTATTTATCGGTGATACAATGT
TTTATGTCACTTTTCATTTGGGTGAAAATGCTGGTACTCATTTTTGTCAA
ATACATGCGATTATTGTTCAATGGGCTTTCCTATGTGCTATGATGTGGGC
CTTTCTAACGGCAACCGAACTAGCCTTAGTTTTCAACCAAAATGCGGTGA
TTCCTTCGAAAATCGATAAACGACGTTTTTCAGCGTATTTATTTTTTGCG
GTATCCGTTCCTTTGGTATTTGTTTTGCTGACTCATCTTTTGGACTCGTA
CGGAATTCTAAAATCGGGAATCGGGATTAACGGAATATGCTGGATGACCG
AATTTAAATCCCGGTTATATTTCTATATTATTCCGATTGGGATAGGATAT
GCTTTATCTATGTTTGCACTTGGTACCATCATATTGTCCCTAACCCGAAA
AATTGCTTCGATTCGTCCTGTCATGAAATCATCAGTTACGCATGGTCATA
AAATAACTCGATTTGTTTTAAATTTATGTCTCGTGTTGGGTTTTACAGAA
ATTGTAGGTTTCATTCAAATACAAAAAACTGTCGGTGATTATAGTCAAGC
TGAACTTACAGTTAATGCCATTTTTGGTTTATGTTACGCCATTTTGAGAA
GCTCACGTGGTATTTTCATTGTTTGTATTTACATTTTTAACAAAAGAACA
GCACGTGTCTTGAAGATGAGCATGCGTAAACGATTTCCGAAATGCTTTGG
TTGGAAGGGAAGGAAAAGTTCTTATTCGGCGAATACAACGAGTTTTGGAT
TCACACTGGCTACAAATTCTGGTGAGAGTAATTCTTCGTCACCTTATTTA
ACGAATGAATATCGCCAAAGTAAAACTAATTTTTAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000353_pilon:220977..222962- >XLOC_011869 ID=XLOC_011869|Name=XLOC_011869|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3972bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000353_pilon:220977..222962- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAATTTAAAGACTTTACTACTTTTAATAATCGCTGTTACTGAAATTTG
CCGGGCATCTAATTTCCCTGTAAATGATTTTTTGGAATATTTAAAAACGA
ACGATTGCGGAATCGATAAATTGGTCGATAATATAAACAGTACATTCGCG
AACGATTTTTTGTGTTCGGCTAGAAATGTTCATGTCGATTCGAATCGAAC
ATGCTCGTGTAATATAACCGAATGTGTTTATTTGAGAACGTGTTGTATCG
ATATTGTATGGGACAAACACAAGCCGATATCGTTGACCGATTACATCGAT
TACTTCATCGATAAAGTGTCGCTTGATGGAAGTTTGTCATGTGAATCGAT
TATACCACGGTCGGTGTTTTCAAAAGACGGGATTATTTCAATTACCGAAT
ATTTTATGGTTTCTGCATGTCCTGGACAAACTCACCAAAGTAAAAACGAT
GATTTCCAACCCGTGATTGATTCTCAAGAAACCTTATATAAATCTAGAGA
TACTGCTTTATGTAACGGCGTCACGAAATATCACCCAGCAACTATAGAAA
TACACTCATTAATGTCTGGAGACATATCAGAGATTAAGCGCGGTGGACTT
TATAATCTTACAATGGCTATGGTGAAACTTTCAGATCGTTCATTTAAACA
TAAATGTAAGAAAACAAGCAAACACGTTTGTAGTAATGATCTCCGTTATT
TGAAGTTCCGTCAATTATACAGGACGTTTTTGAAGGACCTACCCGGAGGC
CATATACGTTGGTCTCTTATGATTTCAGTTGTGAACAATCGACTTCAAAT
GGCTAACCTGATGGGGAGAACCATCACAAAGACTTGTCAATCAGGTCAAA
GCTTCAATCTTGGAAATTTGAAATGTACTCAAGACGCATGCATGAAACCG
TACCAGTATCATAACGGTAGCTGTATTCTTGATCTCGGTACCGTAACTAT
GGGCCATGATGGCGTTAGATTACCTTGGCAACGACAAGTTGATGACATTG
AAAAATACGTGACCATGTTTATTATGCCGTTAAGTATTTGTGGGTATATT
TGGTCTATTCTTGGGTTCTTGTATTTCAAAGAACTGCAGAATCTACCGAG
ATTAAATTCGATTTGCATGACATGTGCGTTATTTATCGGTGATACAATGT
TTTATGTCACTTTTCATTTGGGTGAAAATGCTGGTACTCATTTTTGTCAA
ATACATGCGATTATTGTTCAATGGGCTTTCCTATGTGCTATGATGTGGGC
CTTTCTAACGGCAACCGAACTAGCCTTAGTTTTCAACCAAAATGCGGTGA
TTCCTTCGAAAATCGATAAACGACGTTTTTCAGCGTATTTATTTTTTGCG
GTATCCGTTCCTTTGGTATTTGTTTTGCTGACTCATCTTTTGGACTCGTA
CGGAATTCTAAAATCGGGAATCGGGATTAACGGAATATGCTGGATGACCG
AATTTAAATCCCGGTTATATTTCTATATTATTCCGATTGGGATAGGATAT
GCTTTATCTATGTTTGCACTTGGTACCATCATATTGTCCCTAACCCGAAA
AATTGCTTCGATTCGTCCTGTCATGAAATCATCAGTTACGCATGGTCATA
AAATAACTCGATTTGTTTTAAATTTATGTCTCGTGTTGGGTTTTACAGAA
ATTGTAGGTTTCATTCAAATACAAAAAACTGTCGGTGATTATAGTCAAGC
TGAACTTACAGTTAATGCCATTTTTGGTTTATGTTACGCCATTTTGAGAA
GCTCACGTGGTATTTTCATTGTTTGTATTTACATTTTTAACAAAAGAACA
GCACGTGTCTTGAAGATGAGCATGCGTAAACGATTTCCGAAATGCTTTGG
TTGGAAGGGAAGGAAAAGTTCTTATTCGGCGAATACAACGAGTTTTGGAT
TCACACTGGCTACAAATTCTGGTGAGAGTAATTCTTCGTCACCTTATTTA
ACGAATGAATATCGCCAAAGTAAAACTAATTTTTAAATGAATTTAAAGAC
TTTACTACTTTTAATAATCGCTGTTACTGAAATTTGCCGGGCATCTAATT
TCCCTGTAAATGATTTTTTGGAATATTTAAAAACGAACGATTGCGGAATC
GATAAATTGGTCGATAATATAAACAGTACATTCGCGAACGATTTTTTGTG
TTCGGCTAGAAATGTTCATGTCGATTCGAATCGAACATGCTCGTGTAATA
TAACCGAATGTGTTTATTTGAGAACGTGTTGTATCGATATTGTATGGGAC
AAACACAAGCCGATATCGTTGACCGATTACATCGATTACTTCATCGATAA
AGTGTCGCTTGATGGAAGTTTGTCATGTGAATCGATTATACCACGGTCGG
TGTTTTCAAAAGACGGGATTATTTCAATTACCGAATATTTTATGGTTTCT
GCATGTCCTGGACAAACTCACCAAAGTAAAAACGATGATTTCCAACCCGT
GATTGATTCTCAAGAAACCTTATATAAATCTAGAGATACTGCTTTATGTA
ACGGCGTCACGAAATATCACCCAGCAACTATAGAAATACACTCATTAATG
TCTGGAGACATATCAGAGATTAAGCGCGGTGGACTTTATAATCTTACAAT
GGCTATGGTGAAACTTTCAGATCGTTCATTTAAACATAAATGTAAGAAAA
CAAGCAAACACGTTTGTAGTAATGATCTCCGTTATTTGAAGTTCCGTCAA
TTATACAGGACGTTTTTGAAGGACCTACCCGGAGGCCATATACGTTGGTC
TCTTATGATTTCAGTTGTGAACAATCGACTTCAAATGGCTAACCTGATGG
GGAGAACCATCACAAAGACTTGTCAATCAGGTCAAAGCTTCAATCTTGGA
AATTTGAAATGTACTCAAGACGCATGCATGAAACCGTACCAGTATCATAA
CGGTAGCTGTATTCTTGATCTCGGTACCGTAACTATGGGCCATGATGGCG
TTAGATTACCTTGGCAACGACAAGTTGATGACATTGAAAAATACGTGACC
ATGTTTATTATGCCGTTAAGTATTTGTGGGTATATTTGGTCTATTCTTGG
GTTCTTGTATTTCAAAGAACTGCAGAATCTACCGAGATTAAATTCGATTT
GCATGACATGTGCGTTATTTATCGGTGATACAATGTTTTATGTCACTTTT
CATTTGGGTGAAAATGCTGGTACTCATTTTTGTCAAATACATGCGATTAT
TGTTCAATGGGCTTTCCTATGTGCTATGATGTGGGCCTTTCTAACGGCAA
CCGAACTAGCCTTAGTTTTCAACCAAAATGCGGTGATTCCTTCGAAAATC
GATAAACGACGTTTTTCAGCGTATTTATTTTTTGCGGTATCCGTTCCTTT
GGTATTTGTTTTGCTGACTCATCTTTTGGACTCGTACGGAATTCTAAAAT
CGGGAATCGGGATTAACGGAATATGCTGGATGACCGAATTTAAATCCCGG
TTATATTTCTATATTATTCCGATTGGGATAGGATATGCTTTATCTATGTT
TGCACTTGGTACCATCATATTGTCCCTAACCCGAAAAATTGCTTCGATTC
GTCCTGTCATGAAATCATCAGTTACGCATGGTCATAAAATAACTCGATTT
GTTTTAAATTTATGTCTCGTGTTGGGTTTTACAGAAATTGTAGGTTTCAT
TCAAATACAAAAAACTGTCGGTGATTATAGTCAAGCTGAACTTACAGTTA
ATGCCATTTTTGGTTTATGTTACGCCATTTTGAGAAGCTCACGTGGTATT
TTCATTGTTTGTATTTACATTTTTAACAAAAGAACAGCACGTGTCTTGAA
GATGAGCATGCGTAAACGATTTCCGAAATGCTTTGGTTGGAAGGGAAGGA
AAAGTTCTTATTCGGCGAATACAACGAGTTTTGGATTCACACTGGCTACA
AATTCTGGTGAGAGTAATTCTTCGTCACCTTATTTAACGAATGAATATCG
CCAAAGTAAAACTAATTTTTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000353_pilon | genome | sc0000353_pilon:220977..222962 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1-1986:1987 |
|
